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PPR21 is involved in the splicing of nad2 introns via interacting with PPR-SMR1 and SPR2 and is essential to maize seed development 被引量:1
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作者 Yan-Zhuo Yang Xin-Yuan Liu +2 位作者 Song Gao Shu-Guang Zhang Bao-Cai Tan 《Journal of Genetics and Genomics》 2025年第3期379-387,共9页
Pentatricopeptide repeat(PPR)proteins are a large group of eukaryote-specific RNA-binding proteins that play pivotal roles in plant organelle gene expression.Here,we report the function of PPR21 in mitochondrial intro... Pentatricopeptide repeat(PPR)proteins are a large group of eukaryote-specific RNA-binding proteins that play pivotal roles in plant organelle gene expression.Here,we report the function of PPR21 in mitochondrial intron splicing and its role in maize kernel development.PPR21 is a typical P-type PPR protein targeted to mitochondria.The ppr21 mutants are arrested in embryogenesis and endosperm development,leading to embryo lethality.Null mutations of PPR21 reduce the splicing efficiency of nad2 intron 1,2,and 4 and impair the assembly and activity of mitochondrial complex I.Previous studies show that the P-type PPR protein EMP12 is required for the splicing of identical introns.However,our protein interaction analyses reveal that PPR21 does not interact with EMP12.Instead,both PPR21 and EMP12 interact with the small MutS-related(SMR)domain-containing PPR protein 1(PPR-SMR1)and the short P-type PPR protein 2(SPR2).PPR-SMR1 interacts with SPR2,and both proteins are required for the splicing of many introns in mitochondria,including nad2 intron 1,2,and 4.These results suggest that a PPR21-(PPR-SMR1/SPR2)-EMP12 complex is involved in the splicing of nad2 introns in maize mitochondria. 展开更多
关键词 Intron splicing Maize(Zea mays) MITOCHONDRION ppr21 Seed development Small MutS-related domain-containing ppr protein 1(ppr-SMR1) SPR2
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地方高校化工实验室“PPRS”决策树型安全管理体系探析 被引量:1
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作者 黄明琴 程俊伟 《化工管理》 2025年第9期98-103,共6页
为推进地方高校化工类实验室安全管理水平提升,构建适用于地方高校特色发展的科学、高效、稳定的实验室安全管理体系。以合肥师范学院在特色发展过程中的安全管理探索实践措施为基础,结合国内外先进的实验室安全管理模式经验,探讨了实... 为推进地方高校化工类实验室安全管理水平提升,构建适用于地方高校特色发展的科学、高效、稳定的实验室安全管理体系。以合肥师范学院在特色发展过程中的安全管理探索实践措施为基础,结合国内外先进的实验室安全管理模式经验,探讨了实验室安全意识、文化教育建设、实验室分级分区布局构建、积分管理模式、应急联动机制等方面的建设过程及成效。文章总结出具有地方高校发展特色的“PPRS”人为主体决策树型化工实验室安全管理模式,为助推地方高校实验室安全管理体系建设提供借鉴参考。 展开更多
关键词 地方高校 化工类实验室 安全管理体系 人为主体 pprS决策树
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Spherizone工艺聚丙烯装置PPR管材的开发及应用
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作者 李秀军 董若浩 《石化技术》 2025年第10期186-188,128,共4页
主要探讨了镇海炼化公司Spherizone工艺聚丙烯装置在PPR管材料生产过程中的控制难点及重点,分析并研究了该装置生产的PPR管材料的分子量分布、乙烯含量等关键性能指标及与应用性能的关系,并经下游客户应用验证,说明了Spherizone工艺聚... 主要探讨了镇海炼化公司Spherizone工艺聚丙烯装置在PPR管材料生产过程中的控制难点及重点,分析并研究了该装置生产的PPR管材料的分子量分布、乙烯含量等关键性能指标及与应用性能的关系,并经下游客户应用验证,说明了Spherizone工艺聚丙烯装置生产PPR管材料是可行性的,为同行业PPR管材的生产提供借鉴。 展开更多
关键词 聚丙烯 ppr管材 SPHERIZONE工艺
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PPR蛋白调控叶绿体RNA编辑分子机制研究进展
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作者 李新颖 孙晶 +4 位作者 吕若彤 任亚娟 罗蕾 艾鹏飞 王雁伟 《生物技术通报》 北大核心 2025年第10期32-42,共11页
作为半自主性细胞器,叶绿体自身含有基因组,其转录的部分RNA需要通过实行C→U碱基变化才能保证基因的正确表达。PPR(pentatricopeptide repeat protein)蛋白是控制叶绿体RNA编辑的核心调控因子,其家族庞大,分为P型和PLS型两个亚家族,根... 作为半自主性细胞器,叶绿体自身含有基因组,其转录的部分RNA需要通过实行C→U碱基变化才能保证基因的正确表达。PPR(pentatricopeptide repeat protein)蛋白是控制叶绿体RNA编辑的核心调控因子,其家族庞大,分为P型和PLS型两个亚家族,根据它们不同的C端结构域,PLS类亚家族蛋白可以进一步分为PLS-E、PLS-E+和PLS-DYW,其中,PLS-DYW型中的DYW结构域具有脱氨酶活性能直接参与RNA编辑。PPR蛋白特有的PPR基序以N端到C端的取向第6和第1位的氨基酸组合能识别编辑位点上游5′-3′方向的RNA序列,这种模块化的识别机制使得PPR蛋白能够以单PPR基序对应单核苷酸的方式筛选编辑位点,并募集和组装编辑复合体,实施编辑过程。相关PPR蛋白调控的基因发生编辑缺陷会导致叶绿体发育异常,引发植株萎蔫或致死。本文对现阶段相关研究进展进行综述,重点介绍了不同植物中PPR蛋白是如何调控叶绿体基因进行RNA编辑的分子机制,并对RNA编辑复合体动态组装过程进行了展望,为未来深入探索PPR蛋白的靶向机制及其在农业中的应用提供借鉴。 展开更多
关键词 叶绿体 ppr蛋白 RNA编辑 光合作用
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植物PPR蛋白的功能及其作用机制
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作者 王一凡 朱鸿亮 《生物技术通报》 北大核心 2025年第6期27-37,共11页
RNA编辑是一种转录后水平的加工修饰过程,通过碱基插入、缺失或替换使成熟的RNA不同于其DNA模板链,这是植物一种通用的修正机制,以恢复因DNA突变而发生改变的保守氨基酸。PPR蛋白(pentatricopeptide repeat protein)是一类重要的RNA编... RNA编辑是一种转录后水平的加工修饰过程,通过碱基插入、缺失或替换使成熟的RNA不同于其DNA模板链,这是植物一种通用的修正机制,以恢复因DNA突变而发生改变的保守氨基酸。PPR蛋白(pentatricopeptide repeat protein)是一类重要的RNA编辑因子,在植物中广泛分布,是高等植物最大的家族之一。目前已有很多研究表明其在植物生长发育中发挥重要作用,主要功能是通过参与RNA前体的加工,如实现RNA C-U的转变、参与内含子剪接、影响mRNA稳定和翻译等影响细胞器基因的表达,从而影响光合作用、呼吸作用、植物发育和环境响应。本文对PPR蛋白分类、定位、功能及其作用机制进行综述,并展望了PPR蛋白的应用前景,旨在为后续PPR蛋白功能的研究解析及其应用提供理论基础。 展开更多
关键词 ppr蛋白 RNA编辑 RNA加工 作用机制
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去磷脂PPR固相萃取柱净化-高效液相色谱-串联质谱法测定多种动物源性食品中5种咪唑啉酮类农药的残留量
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作者 吴舒悦 李菊 +2 位作者 陈姿竹 王岚 陈泳 《理化检验(化学分册)》 北大核心 2025年第7期788-794,共7页
为实现动物源性食品中多种咪唑啉酮类农药的同时测定,提出了题示方法。取鸡蛋、鸡肉、鸡肝、肠衣、罗非鱼、牛肉或牛奶样品5.00 g,加入10 mL含1%(体积分数,下同)乙酸的乙腈溶液(鸡肉、牛肉和罗非鱼等肉类样品需要均质20~30 s,用10 mL含1... 为实现动物源性食品中多种咪唑啉酮类农药的同时测定,提出了题示方法。取鸡蛋、鸡肉、鸡肝、肠衣、罗非鱼、牛肉或牛奶样品5.00 g,加入10 mL含1%(体积分数,下同)乙酸的乙腈溶液(鸡肉、牛肉和罗非鱼等肉类样品需要均质20~30 s,用10 mL含1%乙酸的乙腈溶液清洗残渣并将洗涤液与样品溶液合并),涡旋20 s,加入含4.0 g无水硫酸镁、1.0 g氯化钠、1.0 g二水合柠檬酸钠、0.5 g倍半水合柠檬酸二钠的QuEChERS萃取盐包,迅速混匀后振荡10 min,离心5 min。鸡肉、牛肉和罗非鱼样品需于−18℃冷冻2 h,其余样品无需冷冻直接分取2 mL上层酸性乙腈相过去磷脂PPR固相萃取柱,收集流出液,混匀后过0.22μm有机滤膜,滤液采用高效液相色谱-串联质谱法测定。5种咪唑啉酮类农药(甲氧咪草烟、甲咪唑烟酸、咪唑烟酸、咪唑喹啉酸、咪唑乙烟酸)在Accucore aQ色谱柱上以不同体积比的甲醇和含0.1%(体积分数)甲酸的5 mmol·L^(−1)甲酸铵溶液的混合溶液为流动相进行梯度洗脱分离,以加热电喷雾离子源正离子模式电离,多反应监测模式检测,标准曲线法(鸡蛋和肠衣基质)联合基质匹配工作曲线法(鸡肉、鸡肝、罗非鱼、牛肉和牛奶基质)定量。结果显示,5种咪唑啉酮类农药的质量浓度均在1~100μg·L^(−1)和对应的峰面积呈线性关系,检出限(3S/N)为0.045~0.332μg·kg^(−1)。按照标准加入法对上述7种空白基质进行回收试验,回收率为67.8%~120%,测定值的相对标准偏差(n=6)为1.0%~10%。方法用于分析多批进口牛肉、鱼肉,5种咪唑啉酮类农药均未检出。 展开更多
关键词 高效液相色谱-串联质谱法 去磷脂ppr固相萃取柱 净化 动物源性食品 咪唑啉酮类农药
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冷热水管道用PPR材料结构与性能的研究
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作者 余华林 李艳芳 郑先伟 《合成材料老化与应用》 2025年第2期4-7,共4页
对市售不同牌号的四种管道专用料无规共聚聚丙烯(PPR-1、PPR-2、PPR-3、PPR-4)进行结构表征,研究其加工性能的差异,并对其力学性能进行了测试。结果表明,PPR-1具有最小的相对分子量与最窄的分子量分布,其管材的抗冲击性能最差;PPR-4相... 对市售不同牌号的四种管道专用料无规共聚聚丙烯(PPR-1、PPR-2、PPR-3、PPR-4)进行结构表征,研究其加工性能的差异,并对其力学性能进行了测试。结果表明,PPR-1具有最小的相对分子量与最窄的分子量分布,其管材的抗冲击性能最差;PPR-4相对分子量最大,分子量分布较宽,展现出较好的加工性能和力学性能;PPR-3分子量分布相对较窄,加工性能较差,且其耐热氧老化性能较差,不适合作为管道材料使用。 展开更多
关键词 ppr 管材专用料 结构 性能
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POSS改性POE及其在PPR管中的应用研究
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作者 余华林 王松钊 《合成材料老化与应用》 2025年第3期1-4,共4页
采用硅烷水解法合成了NH2-propyl-POSS,再通过与POE-g-MAH的酰胺化反应制备了POE-g-POSS,通过IR和1H NMR分析对合成反应进行了证实。研究了POE-g-POSS与POE对PPR注塑标准样条及管材的的性能影响,结果显示,POE-g-POSS与POE相比,当添加量... 采用硅烷水解法合成了NH2-propyl-POSS,再通过与POE-g-MAH的酰胺化反应制备了POE-g-POSS,通过IR和1H NMR分析对合成反应进行了证实。研究了POE-g-POSS与POE对PPR注塑标准样条及管材的的性能影响,结果显示,POE-g-POSS与POE相比,当添加量为7.5%时,标准样条的拉伸强度、弯曲强度、维卡软化温度分别提高了23.2%、17.5%、2.2℃。管材性能显示,POE-g-POSS和POE均明显提高了PPR管材的100%无破时的最大落锤高度,而POE-g-POSS和POE两者相比,POE-g-POSS具有更优异的耐压时间,说明POE-g-POSS对PPR管材具有更为出色的改性作用。 展开更多
关键词 ppr POE-g-POSS 力学性能 落锤性能 耐压时间
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新型抗菌PPR管材在建筑给水系统中的性能分析与应用
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作者 孙航 《江苏建材》 2025年第4期27-29,共3页
文章聚焦新型抗菌PPR管材在建筑给水系统中的应用。该管材通过添加抗菌剂实现抗菌,兼具广谱抗菌、稳定性强等特性,物理性能优良。在应用上,适用于多种建筑类型,安装需遵循规范,与系统组件兼容性良好,维护保养有明确要点。其在保障水质... 文章聚焦新型抗菌PPR管材在建筑给水系统中的应用。该管材通过添加抗菌剂实现抗菌,兼具广谱抗菌、稳定性强等特性,物理性能优良。在应用上,适用于多种建筑类型,安装需遵循规范,与系统组件兼容性良好,维护保养有明确要点。其在保障水质安全、提升系统稳定性方面优势显著,为建筑给水系统升级提供重要支撑。 展开更多
关键词 新型抗菌ppr管材 建筑给水系统 性能分析
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大豆PPR基因功能的研究进展
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作者 何江梅 刘素芳 陈伟玲 《特种经济动植物》 2024年第7期107-110,共4页
PPR基因家族是由35个氨基酸组成的序列单元经串联重复排列而成[1],其在大豆生长发育的不同阶段起到举足轻重的作用,主要参与调节大豆植株线粒体、叶绿体等细胞器的基因表达水平,通过影响光合作用,造成干物质积累、生物农艺性状、生育期... PPR基因家族是由35个氨基酸组成的序列单元经串联重复排列而成[1],其在大豆生长发育的不同阶段起到举足轻重的作用,主要参与调节大豆植株线粒体、叶绿体等细胞器的基因表达水平,通过影响光合作用,造成干物质积累、生物农艺性状、生育期异常,最终影响大豆的产量、籽粒品质等。对PPR基因结构特征、表达特点等方面及PPR基因在大豆生长发育过程中的作用机理进行较全面的综述,对提高我国大豆产量及品质有重大意义,也为进一步深入研究大豆PPR基因家族的功能提供理论基础。 展开更多
关键词 大豆 ppr基因家族 ppr基因家族作用机理 进展
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基于FA-ISSA-PPR模型的旋风分离器分离效率预测 被引量:2
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作者 汤鸿宇 仲谦 邹明 《北京化工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期101-109,共9页
旋风分离器是气田开发中常用的气固分离设备,准确预测旋风分离器的分离效率对于指导其结构设计和方法优化具有重要意义。在对数据集进行相关性分析的基础上,采用因子分析(factor analysis, FA)简化变量,降低预测模型的复杂程度,利用改... 旋风分离器是气田开发中常用的气固分离设备,准确预测旋风分离器的分离效率对于指导其结构设计和方法优化具有重要意义。在对数据集进行相关性分析的基础上,采用因子分析(factor analysis, FA)简化变量,降低预测模型的复杂程度,利用改进的樽海鞘群算法(improved salp swarm algorithm, ISSA)对投影寻踪(projection pursuit regression, PPR)的模型参数进行优化,形成FA-ISSA-PPR组合模型。结果表明,利用FA模型,原数据集的10个变量可以简化合并为4个公因子,分别代表尺寸参数、颗粒沉降特性、粒子运行轨迹和等效分割粒径对分离效率的影响;与半经验模型和其余机器学习模型相比,组合模型在预测精度和训练时间上具有一定的优越性,在测试样本上的平均绝对误差(MAE)为0.005 91,R^(2)可达0.995,证明了其在小样本、非线性数据分析上的准确性、鲁棒性和泛化性。 展开更多
关键词 因子分析(FA) 樽海鞘群算法(SSA) 投影寻踪(ppr) 旋风分离器 分离效率
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基于PPR建模的固废材料固化戈壁土抗压强度计算模型
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作者 宋紫裕 高鹏展 +4 位作者 谢菡科 何季隆 何建新 王杰 陈昱祥 《粉煤灰综合利用》 CAS 2024年第1期70-76,共7页
为实现固废材料在戈壁土固化中的资源利用,选用工业矿渣粉和粉煤灰组成一种戈壁土固化掺合料,加入碱激发剂激发活性,对其固化戈壁土的抗压强度进行试验研究,采用投影寻踪回归对试验高维数据进行分析,建立固化戈壁土抗压强度PPR计算模型... 为实现固废材料在戈壁土固化中的资源利用,选用工业矿渣粉和粉煤灰组成一种戈壁土固化掺合料,加入碱激发剂激发活性,对其固化戈壁土的抗压强度进行试验研究,采用投影寻踪回归对试验高维数据进行分析,建立固化戈壁土抗压强度PPR计算模型,验证了模型的精度和稳定性,最后采用该模型进行仿真计算,分析各影响因素与固化戈壁土抗压强度的关系。研究结果表明:该PPR计算模型具有可靠性,各影响因子对抗压强度贡献权重系数顺序为:固化剂掺量>龄期>粉煤灰掺量>碱掺量;仿真计算结果定量描述了各影响因素与固化戈壁土抗压强度的关系;PPR模型较深入地挖掘了固化戈壁土抗压强度高维数据的内在结构,为固废材料固化戈壁土的力学性能研究提供参考。 展开更多
关键词 固废材料 固化戈壁土 抗压强度 ppr模型
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化学介质对PPR管材性能的影响 被引量:1
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作者 王英杰 张天文 +3 位作者 吴光军 钱佳乐 孙俊杰 刘超 《新型建筑材料》 2024年第7期136-138,148,共4页
在(23±2)℃、相对湿度(50±5)%条件下,用化学介质酸、碱、盐对采用不同配方、相同工艺生产的3种PPR管材进行处理,并通过红外光谱分析、冲击强度试验、氧化诱导时间和熔体质量流动速率试验分析微观结构和管材性能的变化。结果表... 在(23±2)℃、相对湿度(50±5)%条件下,用化学介质酸、碱、盐对采用不同配方、相同工艺生产的3种PPR管材进行处理,并通过红外光谱分析、冲击强度试验、氧化诱导时间和熔体质量流动速率试验分析微观结构和管材性能的变化。结果表明,酸、碱、盐导致PPR管材分子规整性及分子结晶度降低,冲击强度提高,熔体质量流动速率降低,发生了不同程度的氧化,氧化诱导时间缩短。酸、碱、盐对1#管材冲击强度和氧化诱导时间影响最大,对3#管材熔体质量流动速率影响最大。 展开更多
关键词 ppr管材 化学介质 管材性能 微观结构
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PPR给水管道热熔操作技术探讨 被引量:1
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作者 王仕杰 《中国设备工程》 2024年第6期224-226,共3页
本文介绍了国内住宅室内给水PPR管道热熔操作技术的工法特点和施工特点、安装的工艺流程及操作要点,对质量控制要点进行了分析,结合实例阐述了PPR给水管道热熔操作技术的推广价值点,为热熔操作技术的进一步扩大应用提供了参考。
关键词 高层住宅 ppr给水管道 热熔技术 管道连接
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The Effect of Blending Ratio on the Structure and Properties of the PPR/PS In situ Fiber Reinforced System Prepared by Multi-Flow Vibration Injection Molding
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作者 Yan-Jiang Li Meng-Long Hu +2 位作者 Jun-Wen Zhang Qiang Fu Jie Zhang 《Chinese Journal of Polymer Science》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第6期851-863,共13页
To enhance the mechanical properties of polypropylene random copolymer(PPR),polystyrene(PS)with four different contents were added to the PPR matrix through melt blending.Subsequently,using the Multi-Flow Vibration In... To enhance the mechanical properties of polypropylene random copolymer(PPR),polystyrene(PS)with four different contents were added to the PPR matrix through melt blending.Subsequently,using the Multi-Flow Vibration Injection Molding(MFVIM)technology,PPR/PS in situ microfiber composites(MFC)with different blending ratios were prepared.The results indicated that blending ratio had a great impact on the phase morphology and crystal structure of MFVIM samples,which was different from those of conventional injection molding(CIM)samples.PS ultrafine fibers could be formed under the shear field and could absorb the PPR molecular chains to form hybrid shish-kebab structures.Meanwhile,the PPR matrix could also form shish-kebab structures under the effect of strong shear.When the PS content reached 20%,under the combined action of PS in situ microfibers and highly oriented crystal structure,the tensile strength and Young’s modulus of the sample were obviously improved and the impact strength remained at a relatively high level.So a strong and tough balanced PPR based material was obtained.These results provide valuable insights for expanding the industrial and daily-life applications of PPR and show promising development prospects. 展开更多
关键词 ppr MFVIM In situ microfibers Shearfield Hybrid shish-kebab structures
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利用PPR新方法建立草地产量增长模型及生态成因机理研究 被引量:9
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作者 李建龙 蒋平 +2 位作者 朱明 宋子健 赵德华 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第7期973-981,共9页
利用新型的投影寻踪回归 ( PPR)统计方法 ,对新疆天山北坡蒿属荒漠草地上观测的 3a草地产量和其它 6个相关生态因子数据 ,进行了多元回归统计分析和 PPR分析 ,建立了 PPR新型牧草增长模型 ,并进而做了产量生态成因机理分析和理论解释。... 利用新型的投影寻踪回归 ( PPR)统计方法 ,对新疆天山北坡蒿属荒漠草地上观测的 3a草地产量和其它 6个相关生态因子数据 ,进行了多元回归统计分析和 PPR分析 ,建立了 PPR新型牧草增长模型 ,并进而做了产量生态成因机理分析和理论解释。研究结果表明 ,在一般年份下 ,干草产量在不同年代不同季节均随降水量的分配状况而发生有规律的变化 ,产量分配呈现双峰模式 ;在降水量、积温和光照时数 3个影响产量形成和高低的生态因子中 ,尤以降水量影响最明显 ,是主导生态因子 ,但牧草生长发育状况和增长类型则是水热因子、质地、牧草生态习性和种类组成共同作用的结果 ;在建立草地产量增长模型和成因机理分析过程中 ,充分运用 PPR统计方法成功地克服了非正态非线性高维数据点稀疏所造成的“维数祸根”和自动排除了无关因子及人为因素的干扰 ,提高了建模的精度和效能 ,并给出各自变量因子对建模贡献率大小的效果 ,科学地揭示了用其它多元回归统计方法 ,所难以发现的数据内在的结构特征和规律性。进而 ,运用建立的PPR模型 ,较好地估测和拟合实测产量值 ,使模型估产精度达 90 %以上 ,并通过了效果检验和给出了贡献率统计分析。在6个自变量因子中 ,对牧草产量增长量贡献值最大的是生长时期 ( T) ,其次为土壤含水量 ( 展开更多
关键词 ppr新方法 草地 产量增长模型 天山 ppr模型 生态成因 机理分析
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PPR蛋白APPR6参与ABA调控拟南芥种子萌发与幼苗生长
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作者 姜上川 梅超 +1 位作者 王小芳 张大鹏 《江苏农业科学》 北大核心 2016年第4期53-57,共5页
植物激素脱落酸(ABA)参与调控植物生长发育各个阶段,并在植物对多种胁迫的抗逆反应中起着重要作用。PPR基因家族是拟南芥最大的基因家族之一,PPR蛋白在调控植物生长发育与响应逆境胁迫过程中发挥重要作用,然而参与ABA信号转导的线粒体PP... 植物激素脱落酸(ABA)参与调控植物生长发育各个阶段,并在植物对多种胁迫的抗逆反应中起着重要作用。PPR基因家族是拟南芥最大的基因家族之一,PPR蛋白在调控植物生长发育与响应逆境胁迫过程中发挥重要作用,然而参与ABA信号转导的线粒体PPR蛋白仍有待进一步研究。本研究发现拟南芥线粒体PPR蛋白APPR6的2个T-DNA插入突变体在萌发与萌发后幼苗早期生长过程中对外源ABA超敏,报道APPR6参与ABA信号转导为进一步阐明线粒体PPR蛋白的作用机制以及复杂的ABA信号网络提供了新的信息。 展开更多
关键词 脱落酸(ABA) Appr6 ppr蛋白 种子萌发 幼苗生长 拟南芥
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PPR基因家族的研究进展 被引量:10
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作者 徐相波 邱登林 +3 位作者 孙永堂 王守经 孙桂芝 李新华 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期726-730,共5页
PPR(pentatricopeptide repeats)基因家族是在植物中发现的最大家族之一,它是以35个氨基酸为重复单位连续排列在一起为主要特征的,它可能通过与细胞器转录本的结合,在线粒体或叶绿体中起着至关重要的作用。文章对PPR基因的结构特征、在... PPR(pentatricopeptide repeats)基因家族是在植物中发现的最大家族之一,它是以35个氨基酸为重复单位连续排列在一起为主要特征的,它可能通过与细胞器转录本的结合,在线粒体或叶绿体中起着至关重要的作用。文章对PPR基因的结构特征、在不同染色体及生物体内的分布及其生物学功能的研究现状进行综述。 展开更多
关键词 ppr TPR 线粒体 叶绿体
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番茄PPR基因家族的鉴定与生物信息学分析 被引量:12
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作者 丁安明 李凌 +6 位作者 屈旭 孙亭亭 陈雅琼 宗鹏 李尊强 龚达平 孙玉合 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期77-84,共8页
PPR(Pentatricopeptide repeats)基因家族在植物中广泛存在,其在植物生长发育过程中至关重要。文章采用生物信息学方法,利用Pfam已鉴定的PPR保守结构域序列检索番茄(Solanum lycopersicum L.)基因组计划注释的蛋白序列,最终确定了番茄... PPR(Pentatricopeptide repeats)基因家族在植物中广泛存在,其在植物生长发育过程中至关重要。文章采用生物信息学方法,利用Pfam已鉴定的PPR保守结构域序列检索番茄(Solanum lycopersicum L.)基因组计划注释的蛋白序列,最终确定了番茄中可能存在的471个PPR编码基因;根据拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)中鉴定的各个结构域的特点对其进行了蛋白结构分析、分类和保守序列分析,并对番茄PPR基因家族进行了系统进化树构建、染色体定位、亚细胞定位预测、表达和GO分析等。结果表明:番茄PPR基因家族分为P和PLS两个亚家族,各占序列数目的一半,PLS亚家族又分为PLS、E、E+和DYW四类,且在进化树中形成不同的分支;各个结构域在植物中非常保守;PPR基因家族分布在番茄12条染色体上,且多数无内含子结构;大部分PPR蛋白具有线粒体或叶绿体定位序列,GO分析表明PPR蛋白参与RNA相关的生物学过程。 展开更多
关键词 番茄 ppr基因家族 生物信息学
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马铃薯PPR蛋白家族基因SoDIPPR的克隆及其在干旱条件下的表达特征分析 被引量:8
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作者 范敏 金黎平 +1 位作者 刘庆昌 屈冬玉 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期2249-2257,共9页
【目的】PPR(pentatricope ptide repeat)蛋白家族在植物的生长发育、细胞器形成、细胞质雄性不育的育性恢复、RNA的编辑加工、细胞核与细胞器之间信号传递、逆境防御等方面具有重要作用。研究旨在了解PPR蛋白家族SoDIPPR基因在马铃薯... 【目的】PPR(pentatricope ptide repeat)蛋白家族在植物的生长发育、细胞器形成、细胞质雄性不育的育性恢复、RNA的编辑加工、细胞核与细胞器之间信号传递、逆境防御等方面具有重要作用。研究旨在了解PPR蛋白家族SoDIPPR基因在马铃薯中的表达情况及其在干旱胁迫下的作用【。方法】以抗旱马铃薯二倍体品系H145为材料,利用cDNA-AFLP技术寻找与抗旱性密切相关的基因cDNA片段,利用RACE技术克隆其基因全长cDNA,并利用半定量RT-PCR和Northern杂交法研究其在干旱条件下的表达情况。【结果】从抗旱马铃薯二倍体品系H145中克隆了一个836bp全长cDNA序列,命名为SoDIPPR,该序列开放阅读框长为588bp,编码195个氨基酸序列。序列分析表明,SoDIPPR蛋白存在PPR结构域、激酶结合区、和C端SMR(small MutS related protein)区域。SoDIPPR蛋白序列与GenBank数据库中的其它PPR蛋白进行同源序列比对,构建系统进化树,发现SoDIPPR与其它14个高等植物的PPR蛋白同源性为57%~82%,与苜蓿DNA错配修复蛋白MuTs2、水稻盐诱导蛋白(Q9LS25)和叶绿体RNA结合蛋白(Q75IP8)的同源性达69%~82%。半定量RT-PCR和Northern杂交结果表明,SoDIPPR基因在干旱胁迫下叶片和根系里的表达量明显增加,说明SoDIPPR基因在马铃薯抗旱中起一定作用。在持续干旱条件下,SoDIPPR基因在抗旱品系H145与干旱敏感品系H214中表达模式不同。【结论】马铃薯SoDIPPR基因编码的蛋白与其它植物PPR家族蛋白同源性较高,SoDIPPR基因参与马铃薯对干旱胁迫的应答反应,可能对抵抗干旱胁迫有一定作用。 展开更多
关键词 马铃薯(Solarium TUBEROSUM L.) 抗旱性 全长CDNA ppr(pentat ricopeptide repeat)蛋白 克隆 表达
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