参考黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)近缘种PPARβ的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到黑线仓鼠PPARβ部分序列,并翻译成氨基酸.利用该结果与其他物种核苷酸及氨基酸序列进行相似性比较、构建系统进化树、一级结构分析、二级结构...参考黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)近缘种PPARβ的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到黑线仓鼠PPARβ部分序列,并翻译成氨基酸.利用该结果与其他物种核苷酸及氨基酸序列进行相似性比较、构建系统进化树、一级结构分析、二级结构和空间结构预测.结果表明:得到的480 bp PPARβ序列包括部分外显子4,全部外显子5、6及部分外显子7;共编码159个氨基酸;除人之外,黑线仓鼠PPARβ基因与其他物种的核苷酸相似性均在88%-94%之间,氨基酸相似性均在90%以上;构建进化树得出,黑线仓鼠与鼠类亲缘关系最近,与人的亲缘关系最远;疏水性分析、二级结构预显示该编码区亲水性较强;二级结构、空间结构预测显示该序列含α螺旋较多;空间结构预测看出该段区域含两个典型的锌指结构.展开更多
文摘参考黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)近缘种PPARβ的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到黑线仓鼠PPARβ部分序列,并翻译成氨基酸.利用该结果与其他物种核苷酸及氨基酸序列进行相似性比较、构建系统进化树、一级结构分析、二级结构和空间结构预测.结果表明:得到的480 bp PPARβ序列包括部分外显子4,全部外显子5、6及部分外显子7;共编码159个氨基酸;除人之外,黑线仓鼠PPARβ基因与其他物种的核苷酸相似性均在88%-94%之间,氨基酸相似性均在90%以上;构建进化树得出,黑线仓鼠与鼠类亲缘关系最近,与人的亲缘关系最远;疏水性分析、二级结构预显示该编码区亲水性较强;二级结构、空间结构预测显示该序列含α螺旋较多;空间结构预测看出该段区域含两个典型的锌指结构.
文摘过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptors,PPAR)是核激素受体家族中的配体激活的转录因子,有PPARα、PPARβ/δ及PPARγ3种亚型,其中PPARβ/δ控制许多细胞内的代谢过程,包括长链脂肪酸、胆固醇和鞘脂的代谢等。PPARβ/δ作为一种转录因子,易被膳食脂质和内源性配体(如长链饱和脂肪酸和多不饱和脂肪酸)以及某些脂质代谢产物激活,通过与视黄醇X受体α(retinoid X receptorα,RXRα)的相互作用显示转录活性,显著调节糖、脂代谢、线粒体功能和细胞发育。尽管它在脑细胞及大脑的不同区域中含量较丰富,但关于其在神经退化以及神经炎症中的作用仍知之甚少。近年来PPARβ/δ在神经退行性疾病中的作用及其调控机制日益受到人们的关注,该文对PPARβ/δ的结构、功能以及其在阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病以及多发性硬化症等神经退行性疾病中的作用进行综述。
