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PCRRFLP单酶切法鉴别赫坎按蚊复合体的研究 被引量:3
1
作者 徐岁 周华云 +6 位作者 唐建霞 李菊林 朱国鼎 苏云普 黄光全 曹俊 高琪 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 2012年第4期435-439,共5页
目的建立一种新的赫坎按蚊复合体近缘种按蚊基因鉴别技术,应用于现场按蚊样本的鉴别。方法用分子生物学软件Vector NTI 9.0,对赫坎按蚊复合体的嗜人按蚊、雷氏按蚊、中华按蚊、八代按蚊4个近缘种按蚊rDNA基因的ITS2区段序列进行限制性... 目的建立一种新的赫坎按蚊复合体近缘种按蚊基因鉴别技术,应用于现场按蚊样本的鉴别。方法用分子生物学软件Vector NTI 9.0,对赫坎按蚊复合体的嗜人按蚊、雷氏按蚊、中华按蚊、八代按蚊4个近缘种按蚊rDNA基因的ITS2区段序列进行限制性内切酶酶切位点预测分析,选择特异性内切酶,建立一种能同时鉴别4种近缘种按蚊的聚合酶链反应限制性片段长度多态(PCR RFLP)单酶切法鉴别技术,并对现场捕获的452只按蚊样本进行基因鉴别。结果软件预测赫坎按蚊复合体近缘种4种按蚊的rDNA基因的ITS2区段可被限制性内切酶Dde I切成大小易于区分的不同片段,PCR RFLP单酶切实验结果和软件预测结果完全吻合。4个疟疾流行区捕获的452只按蚊样本经PCR RFLP Dde I单酶切法鉴定有20只嗜人按蚊、6只雷氏按蚊、391只中华按蚊、35只八代按蚊,与形态学鉴别结果符合率为93.4%,与PCR RFLP双酶切法结果符合率为100%。结论新建立的PCR RFLP Dde I单酶切法基因鉴别技术可准确鉴别赫坎按蚊复合体,比传统的形态学鉴别更为简便、可靠,适合用于复合媒介地区的媒介监测。 展开更多
关键词 赫坎按蚊复合体 pcrrflp 基因鉴别
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Genotyping of human platelet antigen (HPA) system 5 of Chinese Han population in Shanghai by PCR restriction fragment length polymorphism(PCRRFLP)
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《中国输血杂志》 CAS CSCD 2001年第S1期376-,共1页
关键词 pcrrflp LENGTH Genotyping of human platelet antigen system 5 of Chinese Han population in Shanghai by PCR restriction fragment length polymorphism HPA
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对市场上一种新的松贝伪品的比较研究 被引量:3
3
作者 张文娟 魏锋 马双成 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期659-663,共5页
目的:比较松贝与新出现伪品的不同特征,为鉴别检验提供依据。方法:综合性状、聚合酶链式反应-限制性内切酶多样性(PCR-RFLP)法、DNA序列比对、系统进化树以及遗传距离等方法,寻找松贝与新伪品的鉴别要点。结果:该贝母在性状上与松贝正... 目的:比较松贝与新出现伪品的不同特征,为鉴别检验提供依据。方法:综合性状、聚合酶链式反应-限制性内切酶多样性(PCR-RFLP)法、DNA序列比对、系统进化树以及遗传距离等方法,寻找松贝与新伪品的鉴别要点。结果:该贝母在性状上与松贝正品还是存在一定差异。按照《中华人民共和国药典》2015年版PCR-RFLP法检验,松贝PCR产物可以被完全酶切,而该伪品的PCR产物只能部分被酶切;测序分析可知,其部分酶切的原因是SmaⅠ酶切位点“CCCGGG”中第2位为C/T多态性位点。在内部转录间隔区(ITS区)266 bp范围内,该伪品与松贝比较有8个突变位点。系统进化树分析,该伪品与川贝母6个基原物种没有聚为一支。遗传距离分析,该伪品与川贝母6个基原物种的距离明显大于6个基原物种之间的距离。结论:该贝母的基原植物与松贝不同,应与松贝严格区分,以维护消费者经济利益,并为安全用药提供保障。 展开更多
关键词 川贝母 松贝 伪品 内部转录间隔区(ITS区) 聚合酶链式反应-限制性内切酶多样性(pcrrflp) DNA序列比对 系统进化树 遗传距离
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错配PCR—限制性片段长度多态性分析检测HBV前C区终止密码变异株技术的 …
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作者 周伯平 徐六妹 《深圳医学》 1997年第6期2-4,共3页
采用错配聚合酶链反应(mpPCR)对HBV前C区基因进行扩增,对PCR产物进行限制片段长度多态性分析(RFLP),鉴定前C区第83位核苷酸点突变。并对PCR产物进行核苷酸序列3分析以鉴定其特异性。通过对不同含量HBV ... 采用错配聚合酶链反应(mpPCR)对HBV前C区基因进行扩增,对PCR产物进行限制片段长度多态性分析(RFLP),鉴定前C区第83位核苷酸点突变。并对PCR产物进行核苷酸序列3分析以鉴定其特异性。通过对不同含量HBV DNA的阳性血清检测结果显示本法可检出10^5copies/ml的HBVDAN,预测结果证实PCR产物8为HBV前C区特异性序列,与RFLP分析结果相符。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 基因变异 pcrrflp 临床应用
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不同猪种中氟烷基因频率调查分析 被引量:25
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作者 方美英 姜志华 +4 位作者 刘红林 陈杰 吴彦宁 黄月英 李齐贤 《浙江农业学报》 CSCD 1999年第3期145-147,共3页
本文采用PCRRFLP方法对16个猪体382头送检猪的毛样DNA进行氟烷基因检测,发现我国地方猪种除枫泾猪带有0.100氟烷基因频率外,别的猪种中未发现氟烷基因;而枫泾猪中氟烷基因的较高频率可能与送检样品数较少有关... 本文采用PCRRFLP方法对16个猪体382头送检猪的毛样DNA进行氟烷基因检测,发现我国地方猪种除枫泾猪带有0.100氟烷基因频率外,别的猪种中未发现氟烷基因;而枫泾猪中氟烷基因的较高频率可能与送检样品数较少有关。国外猪种大约克猪氟烷基因频率为0.222,这可能与大约克猪品系的起源有关;而杜洛克猪中未发现氟烷基因。在所调查的杂种猪群中存在程度不同的氟烷基因频率,其中大约克×长白猪氟烷基因频率为0.190;皮枫和皮杜×长上在杂种猪群中氟烷基因频率较高,各为0.619和0.610。以上杂种猪的氟烷基因频率高低与杂交亲本猪种的该基因频率高低有关。本文还对氟烷基因在猪生产中的应用作了一些讨论,并提出了相应的对策。 展开更多
关键词 猪种 MH 基因频率 氟烷基因 应激综合症
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马DRD4基因部分序列克隆和PCR-RFLP分析 被引量:1
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作者 范彩云 芒来 +1 位作者 程建波 森裕司 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期12-15,共4页
克隆了马DRD4基因完整第1内含子及部分第1、2外显子序列,并用StuI限制性内切酶通过PCR-RFLP技术检测了包括引入品种、培育品种和地方品种6个类型共270匹马的DRD4基因部分序列多态性。用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将酶切产物分离,并用... 克隆了马DRD4基因完整第1内含子及部分第1、2外显子序列,并用StuI限制性内切酶通过PCR-RFLP技术检测了包括引入品种、培育品种和地方品种6个类型共270匹马的DRD4基因部分序列多态性。用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将酶切产物分离,并用银染法显色。结果经StuI内切酶消化表现出多态,由3种共显性等位基因控制,出现了6种基因型;经Hardy-Weinberg平衡检验,乌审马(WS)、巴而虎马(BH)和乌珠穆沁马(WZ)(P>0.05)达到平衡,而其余均未达到平衡(P<0.05)。 展开更多
关键词 DRD4基因 克隆 多态性 PCR-RFLP
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现代生物技术在分子微生物生态学中的应用 被引量:6
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作者 邓小宽 张新宜 田敏 《国外医药(抗生素分册)》 CAS 2006年第4期164-170,共7页
微生物生态学研究中采用的分子生物学方法主要有标记核酸探针技术、基于PCR的分析方法、梯度凝胶电泳方法、磷脂脂肪酸谱图分析方法r、RNA序列同源性分析方法以及质粒、编码特殊蛋白质和低分子量RNA基因分析等。这些技术方法的采用在微... 微生物生态学研究中采用的分子生物学方法主要有标记核酸探针技术、基于PCR的分析方法、梯度凝胶电泳方法、磷脂脂肪酸谱图分析方法r、RNA序列同源性分析方法以及质粒、编码特殊蛋白质和低分子量RNA基因分析等。这些技术方法的采用在微生物生态学研究中取得了重大的突破,使得对某些微生物的研究成为可能,并在分子水平上阐述了其生态机制。 展开更多
关键词 分子微生物生态学 现代生物技术 核酸杂交 pcrrflp PCR-SSCP PCR-DGGE PLFA 核糖体 RNA基因
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四川美系长白猪的氟烷基因分析 被引量:1
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作者 帅素容 罗安治 +1 位作者 巨新义 杨明楷 《四川畜牧兽医》 1999年第7期18-18,共1页
本文采用PCR—RFLP技术检测了南充市种畜场长白猪选育基础群的氟烷基因型,摸清了Haln基因在该群体中的分布,Haln基因频率为1042%。检测结果为该场建立长白猪应激抵抗群提供了科学依据。
关键词 PCR-RFLP技术 氟烷基因型 长白猪
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东太平洋海隆深海热液区沉积物古菌多样性分析 被引量:8
9
作者 刘青 谢运标 +1 位作者 陈逍遥 周梅先 《应用海洋学学报》 CAS CSCD 2014年第4期516-524,共9页
采用PCR-RFLP方法对东太平洋海隆深海热液区3个站位沉积物中的古菌多样性进行了初步研究.结果显示,从古菌16S rRNA基因文库中随机挑取的296个阳性克隆分属奇古菌门(Thaumarchaeota,47.64%)、广古菌门(Euryarchaeota,44.93%)、泉古菌门(C... 采用PCR-RFLP方法对东太平洋海隆深海热液区3个站位沉积物中的古菌多样性进行了初步研究.结果显示,从古菌16S rRNA基因文库中随机挑取的296个阳性克隆分属奇古菌门(Thaumarchaeota,47.64%)、广古菌门(Euryarchaeota,44.93%)、泉古菌门(Crenarchaeota,6.77%)和未分类古菌(0.68%),其中优势菌群为奇古菌门的亚硝化侏儒菌属(Nitrosopumilus,35.47%)和广古菌门的热原体纲(Thermoplasmata,27.03%),DHVE3、DHVE5、DHVE6、MBGB和MBGE类群在沉积物样品中也均有发现.另外,3个站位沉积物中古菌类群组成存在差异,S5-TVG1站位样品文库的97个古菌克隆分属奇古菌门(49.48%)、广古菌门(49.48%)和泉古菌门(1.03%),S14-TVG10站位样品文库的103个古菌克隆由奇古菌门(84.47%)和广古菌门(15.53%)组成,S16-TVG12站位样品文库的96个古菌克隆包括广古菌门(71.88%)、泉古菌门(19.79%)、奇古菌门(6.25%)和未分类古菌(2.08%).研究结果表明,东太平洋海隆深海热液区沉积物中古菌多样性丰富,存在着许多新的古菌菌群;不同站位古菌菌群结构以及多样性存在差异,这与其所处环境的热液活动密切相关. 展开更多
关键词 海洋生物学 东太平洋海隆 深海热液区 沉积物 古菌多样性 PCR-RFLP分析
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Interleukin-1 and TNF-α polymorphisms and Helicobacter pylori in a Brazilian Amazon population 被引量:17
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作者 Hivana Patricia Melo Barbosa Luisa Caricio Martins +4 位作者 Sidney Emanuel Batista dos Santos Samia Demachki Mnica Baraúna Assumpo Charliana Damasceno Arago Tereza Cristina de Oliveira Corvelo 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2009年第12期1465-1471,共7页
AIM: To study the association between Interleukin-1 (IL-1) and tumor necrosis factor (TNF)-α polymorphisms, infection by Helicobacter pylori (H pylori) and the development of gastrointestinal diseases.METHODS... AIM: To study the association between Interleukin-1 (IL-1) and tumor necrosis factor (TNF)-α polymorphisms, infection by Helicobacter pylori (H pylori) and the development of gastrointestinal diseases.METHODS: Genomic DNA was extracted from the peripheral blood of 177 patients with various gastrointestinal diseases and from 100 healthy volunteers. The polymorphisms in IL-1β and TNF-α genes were analyzed using the polymerase chain reactionrestriction fragment length polymorphism method (PCRRFLP) and those from IL-1RN with PCR. The presence of infection due to H pylori and the presence of the CagA toxin were detected by serology. The histopathological parameters in the gastric biopsies of the patients were according to the Sydney classification.RESULTS: A comparison of the frequencies of the different polymorphisms studied among the patients and the control group demonstrated that the allele IL- 1RN*2 was more frequent among patients with gastric ulcers and adenocarcinoma. Carriers of the allele IL- RN*2 and those with reactive serology for anti-CagA IgG had a greater risk of developing peptic ulcer and gastric adenocarcinoma, as well as a higher degree of inflammation and neutrophilic activity in the gastricCONCLUSION: Our results indicate a positive association between IL-1RN gene polymorphism and infection by positive H pylori CagA strains and the development of gastric ulcers and adenocarcinoma. 展开更多
关键词 Helicobacter pylori Interleukin gene Interleukin-1 receptor antagonist gene TNF-α gene Cag pathogenicity island
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载脂蛋白E基因多态性与颈动脉粥样硬化的相关性研究
11
作者 谭兰 于笑峰 +3 位作者 宋敬卉 于杨 孙妍萍 欧江荣 《中国临床神经科学》 2007年第5期466-471,共6页
目的:研究载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与颈动脉粥样硬化的相关性。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,对25例B超检测颈动脉内中膜厚度(IMT)增厚患者(增厚组)和25例同期健康体检者(对照组)的ApoE基因多态性进行... 目的:研究载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与颈动脉粥样硬化的相关性。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,对25例B超检测颈动脉内中膜厚度(IMT)增厚患者(增厚组)和25例同期健康体检者(对照组)的ApoE基因多态性进行分析。结果:IMT增厚组ε3等位基因频率较对照组降低(P<0.05),ε4等位基因频率较对照组升高(P<0.01)。IMT增厚组的ε3/ε4基因型频率显著要高于对照组。对以上两组再按ApoE基因型分别分为3组:ApoE2(ε2/2+ε2/3),ApoE3(ε3/3)和ApoE4(ε3/4+ε4/4)。结果显示颈动脉IMT在不同基因型间差异显著,ApoE4组显著增加,颈动脉多发斑块率在此组也显著增加。结论:ApoE基因多态性与颈动脉粥样硬化形成有相关性,ε4基因是颈动脉粥样硬化形成的危险因子。 展开更多
关键词 载脂蛋白E 基因多态性 颈动脉 粥样硬化 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性 B型超声波
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