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基于PCR扩增的短串联重复序列多态性分析方法
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作者 封昊彤 《计算机应用文摘》 2025年第12期249-250,253,共3页
为提高短串联重复序列(STR)特征提取的准确性与可靠性,文章提出一种基于PCR扩增的短串联重复序列多态性分析方法。首先对短串联重复序列进行非线性降维处理,随后利用序列信息构建自相关函数,并基于该函数提取多态性特征。实验结果表明,... 为提高短串联重复序列(STR)特征提取的准确性与可靠性,文章提出一种基于PCR扩增的短串联重复序列多态性分析方法。首先对短串联重复序列进行非线性降维处理,随后利用序列信息构建自相关函数,并基于该函数提取多态性特征。实验结果表明,该方法不仅能准确识别STR位点数量并提取相应特征,还能实现对等位序列重复单元数量的精确辨识。 展开更多
关键词 pcr扩增 特征提取 自相关函数 非线性降维 多态性分析 短串联重复序列
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弓形虫ITS及5.8S序列的PCR扩增、克隆及分析 被引量:16
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作者 翁亚彪 谢德华 +4 位作者 林瑞庆 李华文 张德林 吴绍强 朱兴全 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期70-73,共4页
通过对国内来源于不同宿主的ZS人株、SH人株、CN猪株、QH绵羊株4个弓形虫虫株,以及国际标准强毒株RH株的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)及5 8SDNA序列进行PCR扩增、克隆、测序和序列分析,旨在对国内不同宿主间弓形虫虫株的遗传变异情况进... 通过对国内来源于不同宿主的ZS人株、SH人株、CN猪株、QH绵羊株4个弓形虫虫株,以及国际标准强毒株RH株的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)及5 8SDNA序列进行PCR扩增、克隆、测序和序列分析,旨在对国内不同宿主间弓形虫虫株的遗传变异情况进行分析和验证,为分子遗传学和分子诊断学研究提供资料。结果显示:QH绵羊株、ZS人株、SH人株、CN猪株的ITS及5 8S序列完全一致,且与GenBank上注册RH株的ITS及5 8S序列也一致;仅实验室传代保存的RH株的ITS2序列与其它4株的ITS2有2个碱基的差异。结果表明ITS可作为分子标记用于弓形虫与其它原虫的种间鉴定,但不适合用于弓形虫种内遗传变异的研究。 展开更多
关键词 弓形虫 SH 序列 RH 克隆 宿主 CN 绵羊 pcr扩增 强毒株
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小麦Glu-D3和Glu-B3位点LMW-GS基因特异引物设计与PCR扩增 被引量:16
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作者 赵惠贤 郭蔼光 +4 位作者 胡胜武 范三红 张大鹏 任思霖 王瑞娟 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期126-130,共5页
用CTAB法提取小麦基因组DNA ,根据GenBank中公布的已知LMW GS基因序列 ,设计并合成染色体位点特异PCR引物 1~ 7;利用特殊小麦材料———六倍体普通小麦阿勃二体、1A、1B和 1D缺体 ,四倍体小麦及二倍体的一粒小麦和节节麦的基因组DNA为... 用CTAB法提取小麦基因组DNA ,根据GenBank中公布的已知LMW GS基因序列 ,设计并合成染色体位点特异PCR引物 1~ 7;利用特殊小麦材料———六倍体普通小麦阿勃二体、1A、1B和 1D缺体 ,四倍体小麦及二倍体的一粒小麦和节节麦的基因组DNA为模板 ,在优化的PCR体系下进行特异性扩增和引物验证。结果表明 :引物 3和引物 4为小麦谷蛋白Glu D3位点LMW GS基因特异PCR引物 ,用其进行扩增时 ,循环反应条件为 :94℃变性 1min ,6 2℃退火 1min ,72℃延伸 2min。扩增产物大小约 1.6 0kb ,包括了启动子和完整编码区。引物 5和 7为小麦谷蛋白Glu B3位点LMW GS基因特异PCR引物 ,用其进行扩增时 ,循环条件为 :94℃变性 1min ,6 4℃退火 1min ,72℃延伸 2min。扩增产物大小约 1.4 5kb左右 ,包括了启动子和完整编码区。此外 ,用引物 3和 4通过PCR技术克隆到小偃 6号小麦Glu D3位点LMW GS基因(登录号为AY2 6 336 9) ;该基因编码的LMW GS含 9个Cys残基。这是首次发现含 9个Cys残基的LMW GS基因。它可能是小偃 6号加工品质优良的主要原因之一。 展开更多
关键词 小麦 Glu-D3 Glu-B3位点 LMW-GS基因 引物设计 pcr扩增
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有齿食道口线虫ITS及5.8S DNA片段的PCR扩增、克隆及序列分析 被引量:14
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作者 林瑞庆 陈丽莎 +5 位作者 翁亚彪 吴绍强 邹丰才 李明伟 宋慧群 朱兴全 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期639-642,共4页
运用 PCR 方法以保守引物 NC5 及 NC2 扩增了从广东阳江地区猪体分离的食道口线虫 rDNA 的内转录间隔区(ITS)及 5.8S 序列。将 PCR 扩增出的片段纯化后克隆至 pGEM-T Easy 载体,用 PCR 技术及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落质粒 DNA 进行... 运用 PCR 方法以保守引物 NC5 及 NC2 扩增了从广东阳江地区猪体分离的食道口线虫 rDNA 的内转录间隔区(ITS)及 5.8S 序列。将 PCR 扩增出的片段纯化后克隆至 pGEM-T Easy 载体,用 PCR 技术及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落质粒 DNA 进行测序。结果表明,扩增的片段大小为 828 bp,包含部分的 18S、28S 及全部的 ITS-1(362 bp)、5.8S(153 bp)及 ITS-2(217 bp)序列。序列比较表明,该食道口线虫为有齿食道口线虫。本研究在国际上首次报道了中国猪有齿食道口线虫的 ITS 及 5.8S 序列,为食道口线虫的分子生物学的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 阳性 菌落 pcr扩增 克隆 阳江地区 首次 DNA片段 食道口线虫 中国猪 猪体
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一种采用微波炉加热快速提取细菌DNA用于PCR扩增的方法 被引量:31
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作者 王琼 唐俊妮 +3 位作者 汤承 陈娟 刘骥 陈炼红 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2015年第2期150-155,共6页
利用微波加热原理,探索一种快速、简单、高效提取细菌DNA用于常规PCR快速检测的方法.在微波炉额定功率800 W条件下分别对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、单增李斯特氏菌、副溶血弧菌、沙门氏菌以及志贺氏菌6种常见食源性病原菌进行微波处理... 利用微波加热原理,探索一种快速、简单、高效提取细菌DNA用于常规PCR快速检测的方法.在微波炉额定功率800 W条件下分别对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、单增李斯特氏菌、副溶血弧菌、沙门氏菌以及志贺氏菌6种常见食源性病原菌进行微波处理,离心取上清,获取细菌DNA,将样本DNA进行PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳进行验证.并进一步采用微波加热方法针对6种病原菌最低检出浓度和混合提取6种病原菌DNA的PCR检测进行分析.6种病原菌在微波炉中加热40-130 s的上清DNA样本均能用于常规PCR扩增.针对检出浓度的分析表明,副溶血弧菌的最低检出浓度为103cfu/ml,金黄色葡萄球菌为104cfu/ml,肠出血性大肠杆菌为105cfu/ml,肠炎沙门氏菌和福氏志贺氏菌的最低检出浓度为106cfu/ml,针对单核细胞增生李斯特氏杆菌的的最低检出浓度为107cfu/ml.进行6种混合菌微波共提取时,其中5种病原菌的特异性基因都能扩出,并且条带很亮.该微波提取方法具有快速,简单,高效的特点,能满足大部分食源性病原菌的常规PCR检测需求,大大节约了时间和成本,具有广泛的适用性,为细菌快速分子检测提供了简便手段. 展开更多
关键词 微波炉加热 DNA提取 pcr扩增 食源性病原细菌
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特异性等位基因PCR扩增技术检测家蝇击倒抗性相关钠通道的基因突变 被引量:14
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作者 李春晓 张晓龙 +2 位作者 曹晓梅 董言德 赵彤言 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期255-256,共2页
关键词 击倒抗性 pcr扩增 拟除虫菊酯类杀虫剂 家蝇 基因突变 技术检测 等位基因 钠通道
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流动型微流控PCR扩增芯片的研究 被引量:10
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作者 刘金华 殷学锋 +2 位作者 徐光明 方肇伦 陈怀增 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2003年第2期232-235,共4页
组装了由注射泵进样系统、微流控芯片和三温区加热器组成的流动型 PCR扩增系统 ,该系统具有扩增速度快、交叉污染小、芯片可重复使用和操作方便等特点 .优化了芯片厚度、隔热材料和流速等影响 PCR扩增的因素 .在 4 .9min内经 2 4个循环... 组装了由注射泵进样系统、微流控芯片和三温区加热器组成的流动型 PCR扩增系统 ,该系统具有扩增速度快、交叉污染小、芯片可重复使用和操作方便等特点 .优化了芯片厚度、隔热材料和流速等影响 PCR扩增的因素 .在 4 .9min内经 2 4个循环成功地扩增了浓度为 1 ng/1 0 0μL的λ-DNA( 5 0 0 bp) . 展开更多
关键词 pcr扩增 微流控芯片 DNA 体外 聚合酶链反应 DNA片段
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海带栽培品系和长海带ITS区的PCR扩增及序列分析 被引量:11
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作者 汪文俊 王广策 +2 位作者 张宝玉 蒋本禹 曾呈奎 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期95-101,共7页
对遗传背景清晰且具有显著表型差异的海带6个栽培品系(CUL002,CUL860,CUL1170,CUL017,CUL018,CUL901)和长海带(L.longissia)的ITS区进行了PCR扩增和序列测定,并分析了8个种17个品系(其中7种共10株从GenBank中获得)海带之间的系统进化关... 对遗传背景清晰且具有显著表型差异的海带6个栽培品系(CUL002,CUL860,CUL1170,CUL017,CUL018,CUL901)和长海带(L.longissia)的ITS区进行了PCR扩增和序列测定,并分析了8个种17个品系(其中7种共10株从GenBank中获得)海带之间的系统进化关系.结果表明:表型各异的6个海带栽培品系ITS区差别很小,其中ITS1+5.8 S rDNA序列完全相同,部分品系间ITS2序列有个别碱基差异;进化树显示与日本海带(L.japonica,AF319018)聚在一起,相似性大于98%,其中CUL901、CUL860和CUL1170的ITS序列完全相同.长海带(L. longissia)的ITS+5.8 S rDNA和日本海带(L.japonica,AF319018)的完全相同.以Undaria peterseniana为外类群,根据ITS+5.8 S rDNA序列构建进化树,6栽培品系及长海带与日本海带聚在一起;17株海带基本构成两个大的进化枝.研究结果揭示了我国海域栽培的长海带可能与日本海带(L.japonica,AF319018)为同一个种. 展开更多
关键词 pcr扩增 栽培品系 ITS区 长海带 序列分析 RDNA序列 GENBANK 系统进化关系 ITS序列 表型差异 遗传背景 序列测定 ITS2 基本构成 研究结果 进化树 日本 全相 相似性 外类群 碱基
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鸡蛔虫ITS rDNA的PCR扩增克隆及序列分析 被引量:15
9
作者 林瑞庆 蔡天城 +2 位作者 吴桂英 宋慧群 朱兴全 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2008年第3期24-25,共2页
关键词 pcr扩增克隆 鸡蛔虫 ITS 序列分析 RDNA 内转录间隔区 生物进化过程 感染强度
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华夏^(TM)白金PCR扩增试剂盒的法医学应用评估 被引量:9
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作者 王亚丽 盛翔 +3 位作者 李敏 陈玉玲 林源 陈丽琴 《法医学杂志》 CAS CSCD 2017年第2期129-135,共7页
目的调查华夏^(TM)白金PCR扩增试剂盒所包含的23个常染色体STR基因座在中国汉族人群中的遗传多态性,评估其在法医遗传学中的应用价值。方法应用华夏^(TM)白金PCR扩增试剂盒对500名汉族无关健康个体进行分型检测,统计分析所含STR基因座... 目的调查华夏^(TM)白金PCR扩增试剂盒所包含的23个常染色体STR基因座在中国汉族人群中的遗传多态性,评估其在法医遗传学中的应用价值。方法应用华夏^(TM)白金PCR扩增试剂盒对500名汉族无关健康个体进行分型检测,统计分析所含STR基因座的频率分布及群体遗传学参数,与目前国内外常用的7种商品化试剂盒在STR基因座个数、内标、荧光标记、Ladder中等位基因总数以及系统效能上进行比较。结果 23个常染色体STR基因座均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),个体识别率为0.791 5~0.986 2,多态信息含量为0.559 0~0.914 0。系统累积个体识别率高达1-4.1×10-28,三联体累积非父排除率为1-4.1×10^(-10),二联体累积非父排除率为1-8.4×10^(-7)。通过与7种试剂盒比较,华夏^(TM)白金PCR扩增试剂盒含有的等位基因分型标准品(Ladder)中的等位基因数最多。结论 23个常染色体STR基因座在汉族人群中有良好的遗传多态性,可用于法医遗传学亲权鉴定及个体识别。通过与其他常见的7种商业化STR检测试剂盒比较,华夏^(TM)白金PCR扩增试剂盒可进一步提供更为丰富的遗传信息。 展开更多
关键词 法医遗传学 短串联重复序列 多态现象 遗传 华夏TM白金pcr扩增试剂盒 汉族
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斯卑尔脱小麦1B染色体的显微分离及其DNA的PCR扩增 被引量:8
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作者 郭东林 王同昌 +2 位作者 王宁 徐淑红 李集临 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期487-491,共5页
以斯卑尔脱小麦的一个变种及其近等基因系为材料 ,玻璃针法进行显微操作在减数分裂中期I分裂相中获得G型细胞质雄性不育的育性恢复基因Rf3所在的 1B染色体DNA。LA -PCR方法扩增DNA ,斑点杂交的方法检测证明扩增产物来源于斯卑尔脱小麦... 以斯卑尔脱小麦的一个变种及其近等基因系为材料 ,玻璃针法进行显微操作在减数分裂中期I分裂相中获得G型细胞质雄性不育的育性恢复基因Rf3所在的 1B染色体DNA。LA -PCR方法扩增DNA ,斑点杂交的方法检测证明扩增产物来源于斯卑尔脱小麦基因组的 展开更多
关键词 斯卑尔脱小麦 1B染色体 显微分离 DNA pcr扩增 G型细胞质雄性不育 Rf3基因
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用PCR扩增tim基因检测蓝氏贾第鞭毛虫 被引量:9
12
作者 丁慧萍 卢思奇 +2 位作者 戎煜 李凤舞 王凤云 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2002年第2期65-69,共5页
采用聚合酶链反应 (PCR)对蓝氏贾第鞭毛虫 (Giardialamblia)的磷酸丙糖异构酶 (triosephosphateisomerase ,缩写为tim)基因进行特异性扩增 ,结果扩增出 1条 6 83bp的DNA片段。此方法的特异性可高达10 0 % ,而其它DNA样本 ,如日本血吸虫 ... 采用聚合酶链反应 (PCR)对蓝氏贾第鞭毛虫 (Giardialamblia)的磷酸丙糖异构酶 (triosephosphateisomerase ,缩写为tim)基因进行特异性扩增 ,结果扩增出 1条 6 83bp的DNA片段。此方法的特异性可高达10 0 % ,而其它DNA样本 ,如日本血吸虫 (Schistosomajaponicum)、刚地弓形虫 (Toxoplasmagondii)、微小隐孢子虫 (Cryptosporidiumparvum)、溶组织内阿米巴 (Entamoebahistolytica)、旋毛虫 (Trichinellaspiralis)和阴道毛滴虫 (Trichomonasvaginalis) ,以及人体血细胞等均未出现扩增反应。本法的敏感性也很高 ,可检测到0 4pg贾第虫包囊的DNA。 13株来自不同地理位置和 或宿主的贾第虫DNA样本在PCR中均各产生 1条长为 6 83bp的目的片段。 展开更多
关键词 pcr扩增 tim基因 检测 蓝氏贾第鞭毛虫 聚酶链反应 磷酸丙糖异构酶
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固定标本的DNA提取及PCR扩增 被引量:13
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作者 高天翔 张秀梅 +1 位作者 曾晓起 渡边精一 《青岛海洋大学学报(自然科学版)》 CSCD 2000年第2期244-248,共5页
报道福尔马林、酒精固定的日本绒螯蟹标本的 DNA提取及 PCR扩增 ,并与冷冻、煮沸标本进行了比较。结果表明 ,福尔马林固定标本与酒精固定标本一样可以提取 DNA,加入的蛋白酶 K量越多 ,DNA的回收率越高。以提取的 DNA为模板 ,进行了线粒... 报道福尔马林、酒精固定的日本绒螯蟹标本的 DNA提取及 PCR扩增 ,并与冷冻、煮沸标本进行了比较。结果表明 ,福尔马林固定标本与酒精固定标本一样可以提取 DNA,加入的蛋白酶 K量越多 ,DNA的回收率越高。以提取的 DNA为模板 ,进行了线粒体 DNA12 S r RNA和 D- loop基因片段的 PCR扩增 ,经琼脂糖凝胶电泳 PCR扩增产物后均得到了与期待的碱基长度相一致的清晰谱带。 展开更多
关键词 固定标本 DNA提取 pcr扩增 日本绒螯蟹 绒螯蟹
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31个SNP位点多重PCR扩增和芯片分型技术的建立及其法医学应用 被引量:10
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作者 李莉 李荣宇 +5 位作者 李成涛 柳燕 林源 阙庭志 孙美倩 李瑶 《法医学杂志》 CAS CSCD 2005年第2期90-95,共6页
目的对SNP基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据SNP不同等位基因的序列设计探针,制成分型芯片。采用4个复合PCR体系,用末端标记了Cy5的引物进行复合PCR扩增,产物与寡核苷酸探针进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确定... 目的对SNP基因分型芯片在个体识别中的应用价值进行研究。方法根据SNP不同等位基因的序列设计探针,制成分型芯片。采用4个复合PCR体系,用末端标记了Cy5的引物进行复合PCR扩增,产物与寡核苷酸探针进行杂交,根据杂交产生的荧光信号值确定样品在各SNP位点的基因型。将这一方法应用于109份样本的分型,根据基因型分布统计分析31个SNP位点的法医学应用价值。同时,进行家系调查和方法灵敏度分析。结果方法的灵敏度为1ng;所检测的31个SNP位点的累积个体识别率为0.9999999999979(偶合率为2.13×10-12),二联体亲子鉴定中累积非父排除率为0.9609,三联体亲子鉴定中累积非父排除率为0.9970。家系调查的结果表明,这些位点等位基因由亲代向子代的传递符合孟德尔遗传定律。结论上述31个SNP位点为中高信息量位点,适用于法医学个体识别,可作为当前STR系统的补充。 展开更多
关键词 SNP位点 pcr扩增 法医学应用 分型技术 芯片 非父排除率 多重 寡核苷酸探针 等位基因 应用价值 个体识别 家系调查 亲子鉴定 复合pcr 灵敏度分析 基因型分布 序列设计 基因分型 末端标记 统计分析 方法应用 光信号 lng
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一种适于PCR扩增的快速提取猪基因组DNA的碱裂解法 被引量:5
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作者 赵金艳 刘榜 +2 位作者 王文君 张宇 张庆德 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期90-94,共5页
以大白猪背最长肌、脾脏、耳组织为材料,用碱裂解法和酚-氯仿法分别提取猪基因组DNA,用紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增检测DNA的产量和质量,结果发现2种方法提取的DNA产量没有明显差异。通过猪MC4R、TEF-1基因特异引物进行PC... 以大白猪背最长肌、脾脏、耳组织为材料,用碱裂解法和酚-氯仿法分别提取猪基因组DNA,用紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增检测DNA的产量和质量,结果发现2种方法提取的DNA产量没有明显差异。通过猪MC4R、TEF-1基因特异引物进行PCR扩增均能得到目的条带。碱裂解法提取的DNA原液稀释5倍、10倍后作为模板均获得了较为稳定的扩增产物。该结果表明,简单、快速、无毒的碱裂解法适用于动物定性PCR检测时DNA的提取。 展开更多
关键词 猪基因组DNA 碱裂解法 酚-氯仿法 pcr扩增
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3种常用PCR扩增试剂盒检验血样DNA的结果比较 被引量:6
16
作者 吴微微 刘振平 +3 位作者 傅汀 高瀚 郝宏蕾 郑小婷 《中国法医学杂志》 CSCD 2006年第4期203-207,共5页
目的探讨常用的ProfilerPlusTM、IdentifilerTM与Powerplex(16试剂盒检验血样DNA的差异。方法510名无关中国汉族个体血样,分别用ProfilerPlusTM与Powerplex(16试剂盒进行DNA检验,然后对有不同检验结果的同一样本,再用ProfilerPlusTM、Id... 目的探讨常用的ProfilerPlusTM、IdentifilerTM与Powerplex(16试剂盒检验血样DNA的差异。方法510名无关中国汉族个体血样,分别用ProfilerPlusTM与Powerplex(16试剂盒进行DNA检验,然后对有不同检验结果的同一样本,再用ProfilerPlusTM、IdentifilerTM与Powerplex(16等三种试剂盒进行检验,并比较其结果。结果在510名个体血样的DNA检测结果中,发现同一样本有不同结果的有7例,其差异率为1.3725%;ProfilerPlusTM、IdentifilerTM与Powerplex(16各有1例在D13S317或FGA基因座上出现等位基因缺失现象,缺失率为0.1961%;ProfilerPlusTM有5例在D8S1179基因座上出现扩增严重不平衡现象,相应的IdentifilerTM与Powerplex(16试剂盒的检验结果为正常杂合子。结论ProfilerPlusTM、IdentifilerTM与Powerplex(16试剂盒检验血样DNA均会出现扩增不平衡和/或基因丢失现象,其发生几率IdentifilerTM与Powerplex(16试剂盒较ProfilerPlusTM少。 展开更多
关键词 法医物证学 STR基因座 pcr扩增试剂盒 等位基因丢失
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棕熊蛔虫ITS rDNA的PCR扩增与序列分析 被引量:16
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作者 彭仕明 黄勉 +5 位作者 陈武 唐剑栋 蔡勤辉 梁玉珍 林瑞庆 朱兴全 《中国兽医寄生虫病》 CAS 2008年第3期1-5,共5页
目的以核糖体DNA(rDNA)的第一与第二内转录间隔区序列(ITS-1及ITS-2)鉴定从广州动物园棕熊分离的蛔虫种类。方法应用PCR方法以保守引物NC5和NC2扩增蛔虫样本的ITS及5.8SrDNA序列,将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEsay载体,... 目的以核糖体DNA(rDNA)的第一与第二内转录间隔区序列(ITS-1及ITS-2)鉴定从广州动物园棕熊分离的蛔虫种类。方法应用PCR方法以保守引物NC5和NC2扩增蛔虫样本的ITS及5.8SrDNA序列,将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEsay载体,用菌落PCR及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落进行测序,并与Gen.Bank“公布的人蛔虫(Ascaris lumbricoides)、猪蛔虫(Ascariis suum)、浣熊贝利斯蛔虫(Baylisascaris procyonh)及狮弓蛔虫(Toxascaris leonina)ITS序列比较。结果从棕熊分离的2个蛔虫样本的ITS及5.8SrDNA总长为859—861bp,种内相似性为99.7%,与GenBank^TM公布的人蛔虫、猪蛔虫、浣熊贝利斯蛔虫及狮弓蛔虫的相似性分别为84.6%、84.5%、89.3%及72.3%,序列差异明显。结论棕熊蛔虫不同于上述种类蛔虫,可能为Baylisacaris transfuga. 展开更多
关键词 棕熊 蛔虫 内转录间隔区(ITS) pcr扩增 序列比较
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PCR扩增TK基因检测鸡传染性喉气管炎病毒的研究 被引量:5
18
作者 彭大新 甘军纪 +2 位作者 高崧 吴艳涛 刘金彪 《动物医学进展》 CSCD 2001年第3期59-61,共3页
根据已发表序列设计一对包含鸡传染性喉气管炎病毒 ( ILTV) TK基因全长核苷酸的 1 2 5 9bp引物 ,对 2株 IL TV强毒和1株 ILTV疫苗毒进行 PCR扩增 ,均能扩增出预期大小的目的片段 ,酶切分析证实了目的片段的特异性 ,而其它禽病原体的扩... 根据已发表序列设计一对包含鸡传染性喉气管炎病毒 ( ILTV) TK基因全长核苷酸的 1 2 5 9bp引物 ,对 2株 IL TV强毒和1株 ILTV疫苗毒进行 PCR扩增 ,均能扩增出预期大小的目的片段 ,酶切分析证实了目的片段的特异性 ,而其它禽病原体的扩增均为阴性。 PCR检测 IL TV DNA的最小检测量为 75 pg。此方法检测人工接种鸡的气管棉拭样品 ,均能检测到 IL TV。 展开更多
关键词 传染性喉气管炎病毒 TK基因 检测 pcr扩增
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5S及16S rDNA序列PCR扩增用于环境军团菌检测 被引量:3
19
作者 周世宁 陆勇军 +2 位作者 陈维田 Burnet John 邓柏澧 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1998年第6期127-128,共2页
军团菌病(Legionnaires’disease)是一种严重的空气传播疾病,在世界各地都常有报道,是由军团菌(Legionela)引起,该菌迄今已鉴定出了44个种,其中18种具致病性,最常见的导致严重病症的种有嗜肺... 军团菌病(Legionnaires’disease)是一种严重的空气传播疾病,在世界各地都常有报道,是由军团菌(Legionela)引起,该菌迄今已鉴定出了44个种,其中18种具致病性,最常见的导致严重病症的种有嗜肺军团菌(L.pneumophila... 展开更多
关键词 RRNA基因 检测 军团菌 环境 pcr扩增
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猪胸膜肺炎放线杆菌江西分离株ApxIVA基因PCR扩增及基因分析 被引量:4
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作者 刘琬婧 陶明江 +6 位作者 郑教雀 孙明 张祥华 邓舜州 王萍 何后军 邬向东 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期378-382,394,共6页
猪胸膜肺炎是引起保育到育肥阶段猪生产性能下降的一种重要传染病,该病的发生往往与猪瘟、猪繁殖与呼吸综合征等病毒混合感染,引起猪群大批死亡,严重危害养猪生产。该病的病原为胸膜肺炎放线菌(APP),为促进江西省养猪业的发展,控制猪胸... 猪胸膜肺炎是引起保育到育肥阶段猪生产性能下降的一种重要传染病,该病的发生往往与猪瘟、猪繁殖与呼吸综合征等病毒混合感染,引起猪群大批死亡,严重危害养猪生产。该病的病原为胸膜肺炎放线菌(APP),为促进江西省养猪业的发展,控制猪胸膜肺炎的流行,项目组从病原入手进行研究,前期已经分离到多株APP,并已经初步鉴定血清型。试验针对其毒素ApxIVA基因进行研究,参考NCBI上登录号为AX002405的ApxIVA毒素基因,设计目的基因大小为1 284 bp的特异性引物1对,并在上下游引物内加入酶切位点EcoRⅠ与SalⅠ进行毒素基因克隆。结果表明江西源APP应用PCR方法扩增ApxIVA基因,产物插入克隆载体,测序后与NCBI发表的APP ApxIVA基因序列对比分析,同源在98%以上,表明成功克隆到APP的ApxIVA基因。通过与10个国内外APP基因序列对比,发现本菌株与CP000569、FJ848575、FJ848573、GQ332268同源性较高,其中FJ848575、FJ848573、GQ332268均为中国分离株,CP000569为加拿大分离株。 展开更多
关键词 APP ApxIVA基因 pcr扩增
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