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Establishment and Optimization of Rye-specific PCR Reaction System 被引量:3
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作者 任如意 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2011年第2期201-204,共4页
[Objective] The aim was to establish the optimal rye-specific PCR reaction system for rye.[Method] The ordinary wheat "Chinese Spring",S165,rye,octoploid triticale and hexaploid triticale were used as materials to c... [Objective] The aim was to establish the optimal rye-specific PCR reaction system for rye.[Method] The ordinary wheat "Chinese Spring",S165,rye,octoploid triticale and hexaploid triticale were used as materials to carry out study on the effect of the amount of template DNA,primers,dNTPs,Mg2+ concentrations,Taq DNA polymerase and annealing temperature on the rye-specific PCR reaction system of rye.[Result] The genomic DNA extracted by modified CTAB DNA extraction method showed high quality,which was satisfied for the PCR reaction template.The rye-specific PCR reaction system was 25 μl,including 10 × buffer solution,1.5 mmol/L MgCl2,200 μmol/L dNTP,40 ng primers,40-60 ng DNA template and 1 U Taq DNA polymerase.[Conclusion] The optimal rye-specific PCR reaction system was established,which provided basis for the identification of exogenous germplasm of rye in wheat background. 展开更多
关键词 RYE pcr reaction system OPTIMIZATION
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Optimization of ISSR-PCR System and Conditions for Portulaca oleracea L.
2
作者 Zhaoyun WANG Dongchen NA 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2017年第4期23-24,42,共3页
With Portulaca oleracea L. as an experimental material, its total DNA was extracted by the improved CTAB method, the ISSR-PCR primers were screened, and the ISSR-PCR reaction system and reaction conditions for P. oler... With Portulaca oleracea L. as an experimental material, its total DNA was extracted by the improved CTAB method, the ISSR-PCR primers were screened, and the ISSR-PCR reaction system and reaction conditions for P. oleracea were Optimized. The results showed that there were 8 primers suitable for ISSR-PCR of P. oleracea. The optimal reaction system had a volume of 25 μl, including 2 x Taq Platinum PCR Master Mix 12.5 μl, primer 2 μl, ddH20 9.5 μl, and DNA template 1μl. The optimized ISSR-PCR of P. oleracea was started with pre-denaturation at 94 ℃ for 360 s, followed by 30 cycles of denaturation at 94 ℃ for 60 s, annealing at 54 ℃ for 60 s and extension at 72 ℃ for 90 s, and completed by extension at 72 ℃ for 300 s. 展开更多
关键词 Portulaca oleracea L. ISSR-pcr reaction system reaction conditions
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金莲花ISSR-PCR反应体系优化及引物筛选
3
作者 董梦涵 马蒙璐 +1 位作者 王瑞康 张芹 《北方园艺》 北大核心 2025年第17期10-18,共9页
以金莲花为试材,采用单因素水平筛选和正交实验方法,组合出最佳反应体系,系统分析了4个关键因素对体系的影响,包括DNA浓度、Mix酶用量、引物浓度、反应循环次数,并进行引物及其退火温度的确定,建立金莲花的ISSR-PCR反应体系,以期为金莲... 以金莲花为试材,采用单因素水平筛选和正交实验方法,组合出最佳反应体系,系统分析了4个关键因素对体系的影响,包括DNA浓度、Mix酶用量、引物浓度、反应循环次数,并进行引物及其退火温度的确定,建立金莲花的ISSR-PCR反应体系,以期为金莲花种质资源创新和遗传多样性分析提供参考依据。结果表明:四因素对反应体系的影响依次为PCR循环次数>DNA浓度>Mix酶用量>引物浓度。最佳反应体系为DNA浓度35 ng·μL^(-1),引物浓度9μmol·L^(-1),Mix酶用量9μL。反应程序为94℃预变性5 min,94℃变性30 s,退火时间45 s,72℃延伸45 s,33个循环,72℃终延伸7 min,4℃保存。建立了金莲花ISSR分子标记最佳反应体系并筛选出26条ISSR引物,可应用于后续的种质资源研究工作。 展开更多
关键词 金莲花 ISSR-pcr 引物筛选 反应体系
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金花菌ISSR-PCR反应体系的建立与优化
4
作者 吴凤 张莉娟 +5 位作者 李冬桂 秦玉燕 罗义灿 陈羽烨 李鸿 吕丽兰 《农业研究与应用》 2025年第1期9-18,共10页
【目的】金花菌是黑茶中的一类潜在益生真菌,能赋予茶叶独特的味道,并具备补充人体所需维生素和矿物质、生津止渴、分解油腻、降脂减肥等多种保健作用,是评价茯砖茶和六堡茶品质的重要指标之一。本研究分析了金花菌的遗传多样性及遗传结... 【目的】金花菌是黑茶中的一类潜在益生真菌,能赋予茶叶独特的味道,并具备补充人体所需维生素和矿物质、生津止渴、分解油腻、降脂减肥等多种保健作用,是评价茯砖茶和六堡茶品质的重要指标之一。本研究分析了金花菌的遗传多样性及遗传结构,建立并优化金花菌ISSR-PCR反应体系,旨在为进一步利用ISSR分子标记技术系统研究金花菌遗传多样性及其种内种间亲缘关系提供方法。【方法】以冠突曲霉(Aspergillus cristatum)的DNA作为模板,采用单因素实验对影响ISSR-PCR反应体系的模板DNA用量、引物用量、PCR Mix用量以及ISSR-PCR循环次数等4个因素进行优化,结果用4个金花菌种A.cristatum、谢瓦氏曲霉(Aspergillus chevalieri)、假灰绿曲霉(Aspergillus pseudoglaucus)、Aspergillus cibarius的菌株对反应体系进行稳定性验证。【结果】建立了金花菌ISSR-PCR最优反应体系,其组成包括50 ng/μL的模板DNA 0.3μL、10μmol/μL的引物0.8μL、2×SanTaq PCR Mix用量9.0μL,ddH_(2)O 9.9μL,总体积20μL。ISSR-PCR反应条件:94.0℃预变性5 min;94.0℃变性30 s,退火30 s,72.0℃延伸2 min,循环次数为35次;72.0℃终延伸10 min。使用4株不同的金花菌对所获ISSR-PCR最优反应体系进行稳定性验证,表明其具有高多态性和可重复性。采用此最优反应体系筛选出11条多态性和重复性高可适用于金花菌遗传多样性分析的ISSR引物并确定其退火温度。【结论】本研究建立并优化了金花菌的ISSR-PCR反应体系,结果具有高多态性和可重复性,为后续金花菌遗传多样性分析提供了新方法。 展开更多
关键词 金花菌 ISSR-pcr 单因素实验 反应体系
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油茶SRAP-PCR反应体系的建立和优化 被引量:16
5
作者 孙佩光 奚如春 +2 位作者 钮世辉 骈瑞琪 陈晓阳 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1192-1199,共8页
为了建立油茶SRAP-PCR扩增体系,本研究使用单因素试验设计,对反应体系的Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP和引物浓度5个主要影响因子各设10个不同的水平梯度,筛选出适宜的因子范围;在此基础上,进一步采用L16(45)正交设计,对影响油茶SRAP-PCR... 为了建立油茶SRAP-PCR扩增体系,本研究使用单因素试验设计,对反应体系的Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP和引物浓度5个主要影响因子各设10个不同的水平梯度,筛选出适宜的因子范围;在此基础上,进一步采用L16(45)正交设计,对影响油茶SRAP-PCR反应体系的5个因素在4水平上进行优化,建立了油茶SRAP-PCR最佳反应体系,即25μL体积中包含模板DNA30ng,Mg2+2.8mmol/L,引物0.44μmol/L,dNTP0.2mmol/L和Taq酶1.0U。该SRAP-PCR体系的建立为油茶种质资源遗传多样性分析、品种鉴定及指纹图谱构建等研究提供了一个标准化的程序。 展开更多
关键词 油茶 SRAP-pcr 反应体系 正交设计
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快速PCR法鉴别鱼腥草与百部还魂的方法研究 被引量:12
6
作者 魏艺聪 袁媛 +3 位作者 陈建雄 车苏容 赵玉洋 梁一池 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2163-2166,共4页
目的建立鉴别鱼腥草Houttuynia cordata与百部还魂Gymnotheca chinensis的特异性PCR方法。方法采集不同产地的鱼腥草与百部还魂样品各8份,所有样品提取总DNA。通过对其mat K片段进行扩增、测序,进行同源比对后根据其变异位点设计特异鉴... 目的建立鉴别鱼腥草Houttuynia cordata与百部还魂Gymnotheca chinensis的特异性PCR方法。方法采集不同产地的鱼腥草与百部还魂样品各8份,所有样品提取总DNA。通过对其mat K片段进行扩增、测序,进行同源比对后根据其变异位点设计特异鉴别引物,建立特异PCR鉴别方法,并通过加入SYBR Green I染料法对2种中药进行快速检测。另外,构建多重PCR体系,只经一个PCR反应,就能对鱼腥草与百部还魂进行快速分子鉴定。结果所构建特异PCR与多重PCR体系均能产生鱼腥草185 bp的特异鉴别条带,百部还魂389 bp的特异鉴别条带,SYBR Green I染料可进行快速检测方法。结论建立的鱼腥草与百部还魂2种中药的快速PCR鉴别方法简便、可靠。 展开更多
关键词 鱼腥草 百部还魂 特异性pcr 多重pcr体系 MATK
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链球菌通用PCR检测方法的建立及应用 被引量:11
7
作者 杜海燕 李基棕 +4 位作者 周碧君 王开功 杨颖 殷俊磊 文明 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2009年第12期152-154,共3页
为建立链球菌快速检测方法,根据链球菌延伸因子ERTu基因设计合成1对通用引物,对链球菌属及其他属细菌进行PCR检测。结果表明,所设计的通用引物对猪链球菌2型和无乳链球菌均能扩增出1条大小为197bp的特异性DNA条带,而对金黄色葡萄球... 为建立链球菌快速检测方法,根据链球菌延伸因子ERTu基因设计合成1对通用引物,对链球菌属及其他属细菌进行PCR检测。结果表明,所设计的通用引物对猪链球菌2型和无乳链球菌均能扩增出1条大小为197bp的特异性DNA条带,而对金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、粪肠球菌、大肠埃希氏菌、枯草芽孢杆菌、绿脓杆菌、都柏林沙门氏菌和多杀性巴氏杆菌均呈阴性反应;经对PCR产物进行测序分析表明,扩增片段与GenBank上链球菌相应序列的同源性达90%~98%;对链球菌DNA样本不同稀释度的检测显示,该PCR的最低检出量可达0.1ng/mL;利用PCR检测方法对11株链球菌分离物进行检测,结果均能扩增出与预期大小相一致的目的条带,与传统生化鉴定结果符合率达到100%。这些结果表明,已成功建立了链球菌PCR检测方法,并可应用于临床链球菌的鉴定。 展开更多
关键词 链球菌 pcr 反应体系
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荔枝SRAP-PCR反应体系的优化 被引量:11
8
作者 昝逢刚 吴转娣 +3 位作者 曾淇 张惠云 李明芳 郑学勤 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期132-136,共5页
SRAP(sequence-related amplified polymorphism)是基于基因的内含子和外显子区域进行检测的新型分子标记技术,具有多态性高、重复性好、易测序、便于克隆目标片段等特点,在荔枝(Litchi chinensis Sonn)中还没有相关的研究报道。为了建... SRAP(sequence-related amplified polymorphism)是基于基因的内含子和外显子区域进行检测的新型分子标记技术,具有多态性高、重复性好、易测序、便于克隆目标片段等特点,在荔枝(Litchi chinensis Sonn)中还没有相关的研究报道。为了建立适合荔枝的SRAP反应体系,对反应体系中的DNA模板、Mg2+、dNTP、引物、Taq DNA聚合酶诸因子的用量进行了探索,确立了适合荔枝的SRAP反应体系为:在20μL反应体系中,模板DNA为40ng,Mg2+浓度2.5mmol/L,dNTP0.3mmol/L,引物5mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0U。扩增程序为:94℃预变性3min,反应前5个循环在94℃ 1 min、35℃ 1 min、72℃ 1 min的条件下运行;随后的35个循环退火温度提高到50℃;最后72℃延伸10min。利用该反应体系对荔枝10个不同品系进行SRAP反应,用5%的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,结果显示:不同品系间DNA谱带多态性丰富。证实该体系稳定可靠,可以用于荔枝的分子标记研究。 展开更多
关键词 荔枝 SRAP-pcr反应体系 优化
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利用正交设计优化黄瓜的SSR-PCR反应体系 被引量:21
9
作者 李亚利 陈书霞 +2 位作者 孟焕文 程智慧 柴丹丹 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期280-284,共5页
以白皮黄瓜B-2-2为试材,采用正交设计L16(45)在4个水平上对影响黄瓜SSR-PCR反应体系的Taq酶浓度、Mg^2+含量、模板DNA用量、dNTP浓度及引物用量等5个因素进行了试验优化,并用单因素完全随机试验筛选各反应因素的最佳水平,建立了黄瓜S... 以白皮黄瓜B-2-2为试材,采用正交设计L16(45)在4个水平上对影响黄瓜SSR-PCR反应体系的Taq酶浓度、Mg^2+含量、模板DNA用量、dNTP浓度及引物用量等5个因素进行了试验优化,并用单因素完全随机试验筛选各反应因素的最佳水平,建立了黄瓜SSR-PCR反应的最佳体系。结果表明:在20μL反应体系中,Taq酶最适浓度为0.5U,Mg^2+最适浓度为2.0 mmol/L,模板DNA最适用量为5 ng/μL,dNTP最适用量为0.2 mmol/L,引物最适浓度为0.6μmol/L;引物最佳退火温度为50.0℃。利用20个黄瓜材料验证此反应体系,6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果显示,扩增产物在100-300 bp之间多态性高,且反应体系的稳定性和重复性好。 展开更多
关键词 白黄瓜 SSR-pcr 体系优化
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茶树ISSR-PCR反应体系的正交优化 被引量:10
10
作者 宁静 黄建安 +2 位作者 李娟 钟兴刚 朱旗 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期414-417,共4页
对茶树ISSR-PCR反应体系中的5因素(Taq酶浓度(U/(20μL))、Mg2+浓度(mmol/L)、模板DNA质量浓度(ng/(20μL))、dNTP浓度(mmol/L)、引物浓度(μmol/L))在4水平上进行正交优化试验,筛选出各因素的最佳水平,建立茶树最佳ISSR-PCR反应体系,... 对茶树ISSR-PCR反应体系中的5因素(Taq酶浓度(U/(20μL))、Mg2+浓度(mmol/L)、模板DNA质量浓度(ng/(20μL))、dNTP浓度(mmol/L)、引物浓度(μmol/L))在4水平上进行正交优化试验,筛选出各因素的最佳水平,建立茶树最佳ISSR-PCR反应体系,即20μL反应体系中,TaqDNA聚合酶为1.0U/(20μL),Mg2+为2.0mmol/L,模板为40ng/(20μL),dNTP为0.20mmol/L,引物为0.25μmol/L.对茶树ISSR-PCR最佳反应体系进行梯度退火试验,确定引物ISSR1、UBC881的最适退火温度分别为52.4、59.0℃. 展开更多
关键词 茶树 ISSR-pcr 反应体系 正交设计
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思茅松SSR-PCR反应体系优化研究 被引量:10
11
作者 王大玮 保云莹 +5 位作者 唐红燕 段安安 蔡年辉 许玉兰 周军 李思广 《西南林业大学学报(自然科学)》 CAS 北大核心 2018年第5期34-37,共4页
以思茅松杂交亲本JG1号基因组DNA为模板,利用正交设计实验对影响SSR-PCR反应体系的主要因子进行了优化,建立了一套最佳思茅松SSR-PCR反应体系。结果表明:在25μL最佳反应体系中,各组分最佳含量分别为Mg^(2+) 2.0 mmol/L、DNA 60 ng、引... 以思茅松杂交亲本JG1号基因组DNA为模板,利用正交设计实验对影响SSR-PCR反应体系的主要因子进行了优化,建立了一套最佳思茅松SSR-PCR反应体系。结果表明:在25μL最佳反应体系中,各组分最佳含量分别为Mg^(2+) 2.0 mmol/L、DNA 60 ng、引物0.50μmol/L、Taq DNA聚合酶0.25U、dNTP 0.20 mmol/L。利用11份个体对此SSR反应体系进行验证,获得扩增谱带清晰且多态性较好,证明该体系稳定可靠。 展开更多
关键词 思茅松 SSR-pcr 反应体系 优化
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杜仲SSR-PCR反应体系建立及引物筛选 被引量:9
12
作者 朱晓敏 王弦云 +5 位作者 陈龙灿 康向阳 王勤 束庆龙 张良富 曹翠萍 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期387-392,共6页
为了对杜仲种质资源的遗传多样性研究奠定理论和技术基础,采用正交试验设计和单因素分析,建立并优化了杜仲的SSR-PCR反应体系。结果表明,杜仲SSR-PCR最适反应体系为正反向引物(10μmol.L-1)各0.2μL,Taq DNA聚合酶(5 U.μL-1)0.1μL,dNT... 为了对杜仲种质资源的遗传多样性研究奠定理论和技术基础,采用正交试验设计和单因素分析,建立并优化了杜仲的SSR-PCR反应体系。结果表明,杜仲SSR-PCR最适反应体系为正反向引物(10μmol.L-1)各0.2μL,Taq DNA聚合酶(5 U.μL-1)0.1μL,dNTP(10 mmol.L-1)0.2μL,模板DNA(5~10 ng.μL-1)1.0μL,Mg2+(25 mmol.L-1)0.6μL,10×PCR缓冲液1.0μL,HPLC超纯水6.7μL,总体积10.0μL。同时筛选出了3对多态性有效引物,研究结果证明了微卫星引物在不同物种间的通用性受物种间亲缘关系远近的影响,并初步揭示了杜仲的遗传多样性,表明了微卫星标记在遗传多样性研究上的优越性。 展开更多
关键词 杜仲 微卫星标记 pcr反应体系 引物筛选 遗传多样性
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博白大果油茶ISSR-PCR反应体系的建立与优化 被引量:20
13
作者 范海艳 曹福祥 +3 位作者 彭继庆 龙绛雪 邓明 司书斌 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期97-103,共7页
以博白大果油茶Camellia gigantocarpa Hu et Huang为材料,通过单因素实验设计和正交设计L18(35)对影响PCR反应体系的主要成分及PCR扩增程序进行优化。建立了稳定的、可重复的博白大果油茶ISSR-PCR扩增反应体系。在20μL的反应体系中,M... 以博白大果油茶Camellia gigantocarpa Hu et Huang为材料,通过单因素实验设计和正交设计L18(35)对影响PCR反应体系的主要成分及PCR扩增程序进行优化。建立了稳定的、可重复的博白大果油茶ISSR-PCR扩增反应体系。在20μL的反应体系中,Mg2+浓度为2.5mmol/L,模板DNA用量为20ng,Taq DNA聚合酶为1.75U,dNTPs浓度为0.25mmol/L,引物浓度为0.6mmol/L。反应程序为:94℃预变性4min,94℃变性30s,50℃退火45s,72℃延伸90s,35个循环,72℃延伸7min,4℃保存。 展开更多
关键词 博白大果油茶 单因素设计 ISSR-pcr 反应体系优化
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乌塌菜ISSR-PCR反应体系的建立及优化 被引量:9
14
作者 宋江华 赵颖 +2 位作者 汪承刚 张灵凤 张慧 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期238-242,共5页
为获得乌塌菜ISSR-PCR的最佳反应体系,采用单因素浓度梯度试验和正交优化设计相结合的方法,研究了引物浓度、dNTP浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶用量对PCR反应的影响。并在此基础上对退火温度和循环数进一步优化,最终确立了适合乌塌菜IS... 为获得乌塌菜ISSR-PCR的最佳反应体系,采用单因素浓度梯度试验和正交优化设计相结合的方法,研究了引物浓度、dNTP浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶用量对PCR反应的影响。并在此基础上对退火温度和循环数进一步优化,最终确立了适合乌塌菜ISSR-PCR反应的最佳体系和程序。即20μL PCR反应体系含:30 ng模板DNA,0.50μmol.L-1引物,0.25 mmol.L-1 dNTP,1 mmol.L-1 Mg2+,1.0 U Taq DNA聚合酶。PCR扩增程序为:94℃预变性3 min;94℃变性30 s,50℃退火1 min,72℃延伸90 s,35个循环;72℃延伸7 min,4℃保存。这一优化的ISSR-PCR反应体系的建立为今后利用ISSR技术对乌塌菜进行种质资源的分类鉴定奠定了基础。 展开更多
关键词 乌塌菜 ISSR-pcr 反应体系 正交设计
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正交设计优化落叶松ISSR-PCR反应体系 被引量:46
15
作者 林萍 张含国 谢运海 《生物技术》 CAS CSCD 2005年第5期34-37,共4页
该文利用正交试验设计的方法,对落叶松ISSR-PCR反应的5因素4水平进行试验,试验结果运用MINITAB软件进行分析,建立了落叶松ISSR-PCR反应的最佳体系,即在20μl反应体系中,模板50-200 ng,0.5μmol/L的引物,1×反应缓冲液,dNTP为0.15mmo... 该文利用正交试验设计的方法,对落叶松ISSR-PCR反应的5因素4水平进行试验,试验结果运用MINITAB软件进行分析,建立了落叶松ISSR-PCR反应的最佳体系,即在20μl反应体系中,模板50-200 ng,0.5μmol/L的引物,1×反应缓冲液,dNTP为0.15mmol/L-0.2mmol/L,1U的TaqDNA聚合酶,Mg2+2.0mmol/L-2.5 mmol/L。并进一步进行梯度退火试验,找到了最适的落叶松ISSR退火温度为56.4℃。 展开更多
关键词 落叶松 ISSR-pcr 正交设计 反应体系
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用正交设计法优化枣树ISSR-PCR反应体系 被引量:12
16
作者 原勤勤 文亚峰 +1 位作者 何钢 刘儒 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期70-74,共5页
采用正交设计的方法对枣ISSR-PCR反应体系的5因素(Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTPs、引物的浓度)在4水平上进行优化试验,PCR结果用DPS数据处理软件分析。实验结果表明:各因素的不同水平对PCR反应结果都有显著的影响,其中Mg2+影响最大;筛选... 采用正交设计的方法对枣ISSR-PCR反应体系的5因素(Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTPs、引物的浓度)在4水平上进行优化试验,PCR结果用DPS数据处理软件分析。实验结果表明:各因素的不同水平对PCR反应结果都有显著的影响,其中Mg2+影响最大;筛选出了各反应因素的最佳水平,建立枣ISSR-PCR的最佳反应体系(25μL)为:Taq酶1.0 U、Mg2+1.0 mmol/L模板DNA 1.0μL、dNTPs 0.25 mmol/L、引物0.3μmol/L。 展开更多
关键词 枣树 分子标记 ISSR-pcr 反应体系 正交设计
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杜仲ISSR-PCR反应体系的建立与引物筛选及其在遗传多样性研究中的应用 被引量:20
17
作者 王弦云 朱晓敏 +6 位作者 王勤 束庆龙 康向阳 吴山忠 周明善 张良富 曹翠萍 《经济林研究》 北大核心 2013年第1期30-34,共5页
为了探究杜仲多居群的遗传多样性,通过开展正交试验,建立了适合杜仲的ISSR-PCR反应体系,筛选出了14条多态性较高的有效引物,分析了杜仲的遗传多样性;共扩增出108个多态性位点,多态性位点的百分率为100%,有效等位基因数ne为1.505,Nei’s... 为了探究杜仲多居群的遗传多样性,通过开展正交试验,建立了适合杜仲的ISSR-PCR反应体系,筛选出了14条多态性较高的有效引物,分析了杜仲的遗传多样性;共扩增出108个多态性位点,多态性位点的百分率为100%,有效等位基因数ne为1.505,Nei’s期望杂合度He为0.308,Shannon多态性的信息指数I为0.472。文中初步揭示出杜仲具有较高的遗传多样性,试验结果表明了ISSRs标记技术适用于杜仲的遗传多样性研究。 展开更多
关键词 杜仲 ISSR pcr反应体系 遗传多样性 分子标记
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马蔺ISSR-PCR反应体系的建立与优化 被引量:11
18
作者 王康 董宽虎 +3 位作者 孙彦 康俊梅 董洁 孟林 《草地学报》 CAS CSCD 2008年第6期580-584,589,共6页
根据正交试验设计原理,设计探索正交试验和细调正交试验以确定马蔺(Iris lactealPall.var.chinensis(Fisch.)Koidz)ISSR-PCR反应体系中各成分的浓度,从dNTP、Taq酶、Pri mers、Mg2+4种因素对马蔺ISSR反应体系进行了优化,得到适合马蔺的I... 根据正交试验设计原理,设计探索正交试验和细调正交试验以确定马蔺(Iris lactealPall.var.chinensis(Fisch.)Koidz)ISSR-PCR反应体系中各成分的浓度,从dNTP、Taq酶、Pri mers、Mg2+4种因素对马蔺ISSR反应体系进行了优化,得到适合马蔺的ISSR-PCR最佳反应体系,即25μl的反应体系中含有dNTP 0.3 mmol/L、Taq酶1.5 U、Pri mers 0.4μmol/L、Mg2+2.5 mmol/L以及1×buffer和50 ng模板DNA。通过对马蔺ISSR-PCR最佳反应体系进行梯度退火试验,得到这条引物的最佳退火温度为52℃。这一体系的建立为今后利用ISSR标记技术研究马蔺遗传多样性奠定了基础。 展开更多
关键词 马蔺 ISSR-pcr 反应体系 正交优化
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利用正交设计建立与优化北美驼绒藜ISSR-PCR反应体系 被引量:14
19
作者 雷雪峰 易津 侯丽丽 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期693-697,共5页
利用正交试验设计的方法,对北美驼绒藜ISSR-PCR反应的5因素(Taq酶、dNTP、引物、Mg2+和模板DNA)4水平进行试验,试验结果运用MINITAB软件进行分析,建立了适合北美驼绒藜的既稳定又谱带多的ISSR-PCR最佳反应体系,即20μL的反应体系中含有1... 利用正交试验设计的方法,对北美驼绒藜ISSR-PCR反应的5因素(Taq酶、dNTP、引物、Mg2+和模板DNA)4水平进行试验,试验结果运用MINITAB软件进行分析,建立了适合北美驼绒藜的既稳定又谱带多的ISSR-PCR最佳反应体系,即20μL的反应体系中含有1×buffer,1.5UTaq酶,0.2mmol.L-1dNTP,0.5μmol.L-1引物,2.5mmol.L-1Mg2+和10ng模板DNA。这一优化的ISSR-PCR反应体系的建立,为今后利用ISSR技术进行驼绒藜属植物种质资源分类、遗传图谱构建和遗传变异奠定了技术基础。 展开更多
关键词 正交设计 北美驼绒藜 ISSR-pcr 反应体系
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银杏ISSR-PCR扩增反应体系的优化 被引量:14
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作者 曹福亮 王国霞 +1 位作者 李广平 花喆斌 《浙江林学院学报》 CSCD 北大核心 2008年第2期186-190,共5页
为了对影响银杏戗ngkobiloba简单序列重复区间扩增-聚合酶链式反应(ISSR-PCR)扩增反应体系的因素进行优化,采用[SSR-PCR扩增技术和UVP凝胶电泳成像技术对模扳DNA浓度、Taq酶用量、引物用量、dNTP的用量以及退火温度等因素进行筛选和... 为了对影响银杏戗ngkobiloba简单序列重复区间扩增-聚合酶链式反应(ISSR-PCR)扩增反应体系的因素进行优化,采用[SSR-PCR扩增技术和UVP凝胶电泳成像技术对模扳DNA浓度、Taq酶用量、引物用量、dNTP的用量以及退火温度等因素进行筛选和优化筛选优化后的反应条件:Taq酶0.3μg,2μL10×Buffer(含15mmol·L^-1 MgCl2),模板DNA40ng,dNTP0.2mmol·L^-1,引物0.5μmol·L^-1,Mg^2+,5nmol·L^-1。PCR扩增程序:94℃变性5min,然后进行38个循环:94℃变性30S,48~53℃(根据引物而定)退火30s,72℃延伸1min;最后72℃延伸10min,4℃终止反应。上述反应条件可广泛应用于银杏的遗传多样性分析、遗传育种和转基因等方面的研究。 展开更多
关键词 林木育种学 银杏 ISSR-pcr 反应体系
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