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鸡传染性支气管炎病毒广西流行株3种主要结构蛋白基因的遗传变异分析 被引量:11
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作者 磨美兰 李孟 +6 位作者 韦平 范文胜 黄柏成 郎亚辉 陈秋英 侯金莲 韦天超 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期1138-1146,共9页
为了解鸡传染性支气管炎病毒(IBV)广西流行株的遗传变异情况,应用RT-PCR方法对2004-2007年的7株广西IBV分离株的纤突蛋白S1基因、核(N)蛋白和膜(M)蛋白基因进行扩增、克隆、测序和同源性比较及系统进化分析。结果显示广西IBV分离株S1基... 为了解鸡传染性支气管炎病毒(IBV)广西流行株的遗传变异情况,应用RT-PCR方法对2004-2007年的7株广西IBV分离株的纤突蛋白S1基因、核(N)蛋白和膜(M)蛋白基因进行扩增、克隆、测序和同源性比较及系统进化分析。结果显示广西IBV分离株S1基因存在广泛的基因点突变,部分毒株出现基因插入和缺失,分离株之间氨基酸同源性为74.2%~98.7%;N基因无插入和缺失,但存在基因点突变,分离株之间氨基酸同源性为91.7%~99.3%;M基因存在点突变和插入现象,分离株之间氨基酸同源性为90.7%~98.2%。以疫苗株H120为参照,广西IBV分离株的S1、N和M基因都出现了变异,其中S1基因变异程度最大。7株广西IBV在S1、N和M基因氨基酸序列系统进化树中分别集中在2、3和3个基因群中,其中4株的S1、N和M基因分型结果不一致。结果表明广西IBV分离株的S1、N和M基因已发生变异,广西IBV存在广泛的基因突变、缺失或插入现象。研究的结果提示流行株的遗传变异可能是目前影响疫苗免疫效果的主要原因。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 S1基因 N基因 M基因 系统进化分析 变异
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猪流行性腹泻病毒S、N和ORF3基因的遗传变异分析 被引量:30
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作者 王隆柏 林裕胜 +4 位作者 车勇良 吴学敏 陈如敬 邵良平 周伦江 《畜牧兽医学报》 CSCD 北大核心 2014年第11期1830-1836,共7页
为探明2012—2013年在福建省流行猪流行性腹泻病毒(PEDV)结构蛋白的遗传变异情况,对7株PEDV流行毒株的S、N及ORF3基因进行克隆、测序及分析。结果表明:7株PEDV S基因之间的核苷酸相似性为98.6%<sup>9</sup>9.4%,与attenua... 为探明2012—2013年在福建省流行猪流行性腹泻病毒(PEDV)结构蛋白的遗传变异情况,对7株PEDV流行毒株的S、N及ORF3基因进行克隆、测序及分析。结果表明:7株PEDV S基因之间的核苷酸相似性为98.6%<sup>9</sup>9.4%,与attenuated DR13弱毒株和CV777标准株的相似性分别为93.7%<sup>9</sup>4.1%和93.8%<sup>9</sup>4.1%;同CV777标准株比较,存在64个氨基酸突变,其中有3个氨基酸较以往国内外流行毒株的变异不一样,为新变异氨基酸,氨基酸的插入和缺失与2008年泰国NPPED2008<sub>2</sub>株相似;7株PEDV毒株的N基因和ORF3基因之间核苷酸的相似性分别为96.5%<sup>9</sup>9.7%和99.7%<sup>1</sup>00%,与CV777标准株的相似性分别为96.6%<sup>9</sup>8.0%和96.6%<sup>9</sup>6.9%。遗传进化树表明:7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因与泰国流行毒株的亲缘关系较近,N基因与CV777标准株亲缘关系较近。7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因变异程度较大,可能源于泰国及韩国的变异株。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S基因 N基因 ORF3基因 变异分析
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猪流行性腹泻病毒部分N基因的原核表达及表达产物反应原性分析 被引量:3
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作者 张博 李守军 +1 位作者 吕茂杰 杨保收 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第3期637-643,共7页
为研究猪流行性腹泻病毒(PEDV)部分N蛋白的原核表达产物是否具有抗原性,并为建立PEDV的间接ELISA方法奠定基础,本试验应用RT-PCR技术扩增N基因的部分核酸序列,经克隆后将目的片段连接到原核表达载体pET-30a(+)中。重组菌于37℃、0.5 mmo... 为研究猪流行性腹泻病毒(PEDV)部分N蛋白的原核表达产物是否具有抗原性,并为建立PEDV的间接ELISA方法奠定基础,本试验应用RT-PCR技术扩增N基因的部分核酸序列,经克隆后将目的片段连接到原核表达载体pET-30a(+)中。重组菌于37℃、0.5 mmol/L IPTG诱导4h后进行SDS-PAGE分析,并进行Western blotting鉴定。结果显示,构建的原核表达重组质粒测序正确,且该蛋白与抗血清(PEDV高免血清)具有良好的反应活性。本试验成功构建了PEDV部分N基因原核表达载体,为后续PEDV感染的血清学诊断方法的建立提供依据。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 N基因片段 原核表达 反应原性
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脂滴包被蛋白PLIN基因多态性与代谢综合征易感性的关联性研究 被引量:1
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作者 刘改珍 宋卫华 +7 位作者 陈敬洲 余晖 娄可佳 宋燕 王晓健 李俊男 惠汝太 肖传实 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2007年第3期155-158,共4页
目的研究脂滴包被蛋白PLIN基因多态性与代谢综合征的关系。方法从河南省信阳市选取代谢综合征及对照共2068例,病例组1021例,对照组1047例。所有研究对象记录其病史、体检等临床资料及吸烟、饮酒等流行病学资料,采用聚合酶链式反应-限制... 目的研究脂滴包被蛋白PLIN基因多态性与代谢综合征的关系。方法从河南省信阳市选取代谢综合征及对照共2068例,病例组1021例,对照组1047例。所有研究对象记录其病史、体检等临床资料及吸烟、饮酒等流行病学资料,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR- RFLP)技术检测各组PLIN基因rs8179078和rs6496589两个SNPs位点的多态基因型并统计各组的多态性频率。结果rs6496589在女性中CC基因型的频率病例组明显高于对照组(P<0.01)。与对照组比较,代谢综合征组rs6496589 CC基因型的频率显著高于对照组(代谢综合征组:rs6496589CC为56.6%;对照组rs6496589CC为48.8%;P=0.002)。校正了年龄、性别、高血压史、糖尿病史和高脂血症史等传统危险因素的影响后,这种相关性仍然存在。rs8179078的等位基因和基因型频率在病例组和对照组的分布无显著的统计学差异。结论PLIN基因rs6496589多态性中CC基因型是中国汉族人群代谢综合征发病的独立危险因素之一,rs8179078多态性与中国汉族人群的代谢综合征发病无显著相关性。 展开更多
关键词 PUN基因 PERILIPIN 基因多态性 代谢综合征
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鸡腺胃型传染性支气管炎病毒金坛分离株核蛋白基因的克隆和测序
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作者 凌雯 钱建飞 +3 位作者 张则斌 李银 唐余华 罗涵禄 《中国家禽》 北大核心 2001年第8期56-57,共2页
应用逆转录多聚酶链反应技术,参照 Boursnell等发表的鸡传染性支气管炎病毒核蛋白基因序列,自行设计并合成1对引物,应用该引物,从感染IBV金坛株的第五代SPF鸡胚尿囊液中扩增出片段大小为828hp的JT株 N基因... 应用逆转录多聚酶链反应技术,参照 Boursnell等发表的鸡传染性支气管炎病毒核蛋白基因序列,自行设计并合成1对引物,应用该引物,从感染IBV金坛株的第五代SPF鸡胚尿囊液中扩增出片段大小为828hp的JT株 N基因,与设计相符,表明扩增片段为 IBV JT株 N基因。将扩增片段与 pGEM- T Easy载体连接,经核酸序列测定,与Genebank中报道的IBV其它株N基因同源性较高。 展开更多
关键词 腺胃型传染性支气管炎病毒 金坛株 核蛋白基因 基因克隆 序列分析
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2016-2019年间广西部分地区犬瘟热流行病学调查及遗传演化分析 被引量:3
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作者 黄馨 唐盈 +9 位作者 戚永乐 周华波 龙剑明 劳月琪 魏知非 石瀚瑜 韦祖樟 欧阳康 黄伟坚 陈樱 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2023年第6期155-163,共9页
研究通过收集2016年9月至2019年9月广西部分地区917例犬瘟热(CD)阳性的病例,从地区、季节、年龄、免疫情况等方面进行了回顾性研究,结果发现:CD在广西冬季(12~2月)发病率最高,为33.48%;2到12个月龄幼犬发病率最高,为81.89%,不同年龄、... 研究通过收集2016年9月至2019年9月广西部分地区917例犬瘟热(CD)阳性的病例,从地区、季节、年龄、免疫情况等方面进行了回顾性研究,结果发现:CD在广西冬季(12~2月)发病率最高,为33.48%;2到12个月龄幼犬发病率最高,为81.89%,不同年龄、性别、品种和体型的犬均可发病。采用RT-PCR方法对5份阳性样品的N和H基因进行扩增和遗传进化分析,结果发现:GXLZ20190729和GXNN20160207两株野毒株与东北株的亲缘关系密切,N基因同源性分别为98.8%、99.3%;而GXNN20170528和GXNN20160513与辽宁毒株、北京毒株和黑龙江省毒株在一个小分支,GXNN20160508与长春毒株同在另一个小分支,N基因核苷酸同源性高达98.9%~100.0%;其中GXNN20160528毒株的N基因和H基因与中国辽宁省狐狸源的毒株(LN(10)1)核苷酸同源性均高达100%,H基因氨基酸突变位点一致,并在309位增加了1个糖基化位点。研究表明,本次研究的毒株均为亚洲1型(Asia-1)的强毒谱系,不同毒株间存在遗传多样性。 展开更多
关键词 犬瘟热 回顾性研究 N基因 H基因 遗传进化分析
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尼帕病毒TaqMan探针荧光定量PCR检测方法建立 被引量:1
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作者 孙彤 孙竹筠 +3 位作者 刘静宜 王培培 苏苌 陈鸿军 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第1期122-128,共7页
尼帕病毒病是一种人畜共患烈性传染病,为能够快速特异检测该病毒,本研究根据尼帕病毒(NiV)N基因序列保守区设计特异性引物和探针,建立一种针对NiV的TaqMan探针荧光定量PCR(qPCR)检测方法,该方法特异性好、敏感性高、稳定性强,可鉴别NiV... 尼帕病毒病是一种人畜共患烈性传染病,为能够快速特异检测该病毒,本研究根据尼帕病毒(NiV)N基因序列保守区设计特异性引物和探针,建立一种针对NiV的TaqMan探针荧光定量PCR(qPCR)检测方法,该方法特异性好、敏感性高、稳定性强,可鉴别NiV与其他猪病病毒,扩增效率为102%,最低检测限14.8 copies/μL,敏感性高于常规PCR 10倍,该检测方法的建立可为NiV的快速检测提供技术手段,对促进猪类养殖业的健康发展具有重要意义。 展开更多
关键词 尼帕病毒 N基因 TAQMAN探针 实时荧光定量PCR
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鸡传染性支气管炎病毒SD03株N基因的克隆、序列分析及N蛋白理化性质分析 被引量:1
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作者 邢婧珉 陈冰 +5 位作者 李云霞 付立辉 张立霞 李亚杰 郁宏伟 杨保收 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第12期67-73,共7页
试验旨在确定国内鸡肾型传染性支气管炎病毒(IBV)流行毒株核蛋白N与市场上现用疫苗株、近年国内外分离株的差异性。本研究利用自山东某鸡场病鸡肾脏组织分离获得、经PCR鉴定为IBV阳性的毒株(命名为SD03株),参考NCBI上部分IBV毒株N基因... 试验旨在确定国内鸡肾型传染性支气管炎病毒(IBV)流行毒株核蛋白N与市场上现用疫苗株、近年国内外分离株的差异性。本研究利用自山东某鸡场病鸡肾脏组织分离获得、经PCR鉴定为IBV阳性的毒株(命名为SD03株),参考NCBI上部分IBV毒株N基因的保守区域设计引物,进行RT-PCR扩增,构建重组pMD18-T-N/DH5α菌,测序获得N基因序列。与参考株进行了核苷酸及氨基酸同源性分析,结合DNAStar软件与http://www.expasy.org/网站对该基因编码的蛋白进行理化性质分析。结果显示,SD03株为IBV肾型毒株,与LDT3、partridge/GD/S14/2003毒株(肾型)核苷酸及氨基酸同源性均在99.0%以上。与其他国内外肾型经典毒株Ma5、W93、Gray、Holte株氨基酸同源性为90.0%~94.6%,与国内外呼吸型疫苗株H120、H52、M41氨基酸同源性为89.7%~91.0%。本研究深入分析了当前流行株SD03株N蛋白的理化特性,为N蛋白亚单位疫苗在不同系统中表达及蛋白纯化提供了理论依据,为中国现阶段IBV的防控奠定了一定的理论基础。 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒 RT-PCR N基因 N蛋白 同源性 系统发生树 N蛋白理化性质
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