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基于饭豆基因资源的小豆远缘杂交群体抗豆象QTL定位
1
作者 刘长友 王珅 +7 位作者 时会影 沈颖超 孙蕾 王彦 张志肖 苏秋竹 田静 范保杰 《作物学报》 北大核心 2026年第3期936-944,共9页
豆象是危害小豆(Vigna angularis)等食用豆类的主要仓储害虫,而栽培小豆缺乏抗豆象种质资源。近缘栽培种饭豆(Vigna umbellata)大多表现出抗豆象。本研究通过构建饭豆与小豆的远缘杂交群体,挖掘抗豆象基因资源,为小豆抗豆象育种提供理... 豆象是危害小豆(Vigna angularis)等食用豆类的主要仓储害虫,而栽培小豆缺乏抗豆象种质资源。近缘栽培种饭豆(Vigna umbellata)大多表现出抗豆象。本研究通过构建饭豆与小豆的远缘杂交群体,挖掘抗豆象基因资源,为小豆抗豆象育种提供理论支撑。以抗豆象饭豆F021和感豆象小豆白红2号为亲本,通过幼胚拯救获得F1植株,采用单粒传法构建包含178个株系的F8代重组自交系群体(RIL)。利用3095个SSR标记筛选亲本间多态性位点,构建遗传连锁图谱。结合2年人工接种绿豆象表型鉴定(以种子被害率为指标),采用区间作图法(IM)定位抗豆象QTL位点并分析其遗传效应。结果表明,亲本白红2号种子被害率均为100%(感豆象),饭豆F021种子被害率分别为19.2%和23.4%(抗豆象);RIL群体种子被害率呈连续分布,符合数量性状遗传特征。筛选获得503个多态性SSR标记(小豆来源标记多态性最高,达33.7%),构建的遗传连锁图谱包含262个标记,分布于11个连锁群,总长634.90 cM,标记间平均遗传距离3.43 cM,比较基因组分析显示与小豆基因组共线性良好。联合2年表型数据分析共检测到9个抗豆象QTL,其中3个为稳定QTL(QUmbr2.1/2.2、QUmbr4.1/4.2、QUmbr11.1/11.2), LOD值介于2.93~6.56,表型贡献率为8.3%~17.0%;所有QTL加性效应均为负值,表明饭豆等位基因显著降低种子被害率。本研究通过远缘杂交群体定位饭豆抗豆象QTL,证实饭豆可作为小豆抗豆象育种的优异基因供体,并为分子标记辅助选择提供了关键标记资源。 展开更多
关键词 饭豆 小豆 远缘杂交 抗豆象 qtl定位
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基于BSA技术的稗属牧草抽穗期QTL定位及候选基因分析
2
作者 张刚 许兴 朱林 《草业学报》 北大核心 2026年第3期210-222,共13页
抽穗期是影响作物产量形成和环境适应性的关键阶段,解析其分子调控机制对牧草种质资源创新和新品种培育具有重要意义。很多稗属植物是优良的耐盐碱牧草,然而目前稗属牧草抽穗期的分子调控机制尚不明确,制约了不同生态区适生品种的分子... 抽穗期是影响作物产量形成和环境适应性的关键阶段,解析其分子调控机制对牧草种质资源创新和新品种培育具有重要意义。很多稗属植物是优良的耐盐碱牧草,然而目前稗属牧草抽穗期的分子调控机制尚不明确,制约了不同生态区适生品种的分子设计育种和盐碱地的可持续利用。为了系统解析稗草抽穗期的遗传调控网络,本研究以稗的基因组作为参考基因组,采用BSA-Seq(bulked segregant analysis sequencing)技术对湖南稷子和宁夏无芒稗及其杂交F_(2:3)群体(共62份样本)进行分析。基于R 4.2.2,采用Index算法定位抽穗期相关QTL(quantitative trait locus),通过String数据库构建蛋白质互作网络筛选候选基因,并利用GO和KEGG数据库对候选基因进行功能注释。研究结果表明:共鉴定出11347个SNP和1992个Indel有效变异位点;定位到两个候选QTL:qHD-16-1(193.14 kb,包含17个基因)和qHD-6-1(11.05 kb,包含2个基因);筛选出EcRCS3、EcCYSK(错义突变)、EcP0710H01.9、EcAPG、EcCFAT、EcNBA1共6个关键候选基因。功能注释表明,这些基因主要通过调控硫代谢、半胱氨酸和蛋氨酸等代谢途径影响开花基因表达或直接影响花芽分化,从而调控稗草的抽穗期。本研究为稗草分子标记辅助育种提供了重要的基因资源和潜在的分子靶点,并为盐碱地适生牧草品种的精准选育奠定了理论基础,具有重要的科学价值和应用前景。 展开更多
关键词 稗属牧草 抽穗期 BSA-Seq qtl定位 候选基因分析
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基于SNP遗传图谱定位甘蓝型油菜氮肥高效吸收相关性状的QTLs
3
作者 邹小云 闫蕾 黄杨 《江西农业学报》 2026年第1期1-7,61,共8页
选用氮肥吸收效率存在显著差异的甘蓝型油菜品种湘油15号(高氮肥吸收效率)和R210(低氮肥吸收效率)杂交获得F1,通过小孢子培养获得含180份株系的DH群体。对两个施氮肥水平下与油菜氮肥吸收效率密切相关的茎基粗、单株角果数、单株地上部... 选用氮肥吸收效率存在显著差异的甘蓝型油菜品种湘油15号(高氮肥吸收效率)和R210(低氮肥吸收效率)杂交获得F1,通过小孢子培养获得含180份株系的DH群体。对两个施氮肥水平下与油菜氮肥吸收效率密切相关的茎基粗、单株角果数、单株地上部干物质量及氮肥吸收效率进行表型调查和QTL分析。结果表明,构建的高密度遗传图谱覆盖甘蓝型油菜19条染色体,包含42751个多态性SNP标记,4302个簇(bin),覆盖基因组长度为2959.89 cM,相邻簇之间平均距离为0.69 cM。采用复合区间作图法(CIM)在两个施氮水平下共检测到14个QTLs,单个QTL可解释的表型变异为5.24%~18.22%。筛选到7个可能与油菜氮肥高效吸收相关性状的候选基因和1个类似于叶绿体的含有核苷三磷酸水解酶的p环超家族蛋白。此QTLs和候选基因将为油菜氮高效吸收的遗传改良提供有用的信息。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 氮肥吸收效率 qtl位点 候选基因
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观赏植物遗传图谱构建及QTL定位研究进展
4
作者 徐佳 周明芹 +5 位作者 李华阳 贾瑞冬 赵鑫 葛红 寇亚平 杨树华 《植物遗传资源学报》 北大核心 2026年第1期1-20,共20页
观赏植物作为重要的园艺作物,其花型、花色、花香、开花习性、株型、皮刺等观赏性状直接决定其观赏效果和市场价值。现代分子育种技术是快速培育植物新品种的有效手段,但重要性状关键基因的定位与挖掘的缺乏,限制了现代分子育种技术在... 观赏植物作为重要的园艺作物,其花型、花色、花香、开花习性、株型、皮刺等观赏性状直接决定其观赏效果和市场价值。现代分子育种技术是快速培育植物新品种的有效手段,但重要性状关键基因的定位与挖掘的缺乏,限制了现代分子育种技术在观赏植物中的应用。遗传图谱是以遗传标记间重组频率为基础的染色体或基因组内位点相对位置的线性排列图,是研究生物复杂性状遗传规律和分子机制的关键工具,可为性状关键基因的定位、识别和遗传机制解析提供基础,为分子育种提供理论和实践指导。近年来,随着测序和分子生物学技术的发展,观赏植物的遗传图谱构建和数量性状位点(QTL)定位研究取得了一些进展,但缺乏系统的归纳与总结。本文对月季、兰花、菊花等主要观赏植物遗传图谱的构建和重要性状(株型、花色、花香、花瓣数量、抗性等相关性状)QTL定位的研究进展进行了归纳总结,并对观赏植物遗传图谱构建与应用中存在的问题、解决方案和未来的发展方向提出展望,以期为观赏植物分子育种提供参考和理论指导。 展开更多
关键词 观赏植物 遗传图谱 分子标记 qtl定位
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花生遗传图谱构建及抗病相关QTL定位研究进展
5
作者 郭敬坤 韩锁义 +7 位作者 许湘茹 吴征 陈琳杰 王长在 黄冰艳 董文召 崔梦杰 张新友 《植物遗传资源学报》 北大核心 2026年第2期241-253,共13页
花生(Arachis hypogaea L.)作为我国重要的油料和经济作物,在生长发育和储藏过程中易受到多种病原菌的侵害,导致其产量和品质受到严重威胁。随着花生野生种和栽培种全基因组序列的组装和解析,抗病相关QTL的定位及分子辅助育种技术取得... 花生(Arachis hypogaea L.)作为我国重要的油料和经济作物,在生长发育和储藏过程中易受到多种病原菌的侵害,导致其产量和品质受到严重威胁。随着花生野生种和栽培种全基因组序列的组装和解析,抗病相关QTL的定位及分子辅助育种技术取得了飞速发展,为花生抗性种质的遗传改良提供了全新且极具潜力的技术支撑。本文综述了花生遗传图谱的构建进展,重点总结了叶斑病、青枯病、茎腐病和黄曲霉等花生主要病害的抗性QTL鉴定与定位研究,并分析了花生当前抗性育种存在的问题,以期为花生优良抗性品种的培育提供参考。为进一步推动花生抗性遗传改良,实现育种技术的突破性发展,未来应通过多组学整合分析、分子标记辅助选择与基因编辑技术的深度融合等途径,推动花生育种实现突破性发展。 展开更多
关键词 花生 遗传图谱 qtl定位 分子标记辅助育种
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基于黄褐棉导入系群体定位棉花纤维品质和产量性状QTLs
6
作者 拓明喆 常鑫燚 +9 位作者 卫雅亭 张子昕 阿布都克尤木·阿不都热孜克 徐麟 尤春源 李志博 林海荣 徐建伟 吴元龙 聂新辉 《植物遗传资源学报》 北大核心 2026年第2期407-423,共17页
为挖掘黄褐棉优异基因资源并将其用于陆地棉的遗传改良,以陆地棉B0011为轮回亲本、黄褐棉为供体亲本构建的包含71个株系的BC_(5)S_(5)导入系群体为材料,对纤维长度、纤维比强度、马克隆值、成熟度、纤维整齐度、短纤维率、纤维伸长率、... 为挖掘黄褐棉优异基因资源并将其用于陆地棉的遗传改良,以陆地棉B0011为轮回亲本、黄褐棉为供体亲本构建的包含71个株系的BC_(5)S_(5)导入系群体为材料,对纤维长度、纤维比强度、马克隆值、成熟度、纤维整齐度、短纤维率、纤维伸长率、含水率8个纤维品质性状和单铃皮棉重、单铃籽棉重、衣分3个产量性状进行表型测定与QTL定位分析。研究表明,单铃皮棉重和短纤维率受基因型影响较强,纤维长度、纤维比强度、纤维整齐度、纤维伸长率、马克隆值和衣分受环境条件的影响较为明显,成熟度和含水率受到基因型×环境互作的影响高于基因型的影响。大部分产量性状与纤维品质性状关联较弱,但单铃籽棉重和衣分仍会受到纤维品质性状的显著影响,其中单铃籽棉重与马克隆值、纤维伸长率呈显著相关,衣分与含水率呈显著相关。共定位到80个QTLs,包括63个与纤维品质相关的QTLs,17个与产量性状相关的QTLs,分布在21条染色体上,贡献率高且LOD值大于3.00的QTLs达到80%以上,连锁重组率高。其中qLW-A06-1、qMCF-A12-1、qFS-A13-1、qSW-A10-1和qSW-D06-1在多个环境中被稳定检测到。鉴定到4个调控多个性状的多效性位点A10:88383565、D06:36287101、D06:55819963和D13:60179605,4个位点均定位到了与短纤维率相关的QTL。在A01(2个)、A10(2个)、A13(1个)、D04(1个)和D06(2个)染色体上定位到了8个QTL簇,调控多个纤维品质性状和产量性状。本研究结果为棉花分子育种实践提供了潜在的应用价值。 展开更多
关键词 棉花 纤维品质 产量 多效性位点 qtl簇
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普通小麦矮秆突变体20DH2-2遗传分析及株高QTL定位
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作者 李丽敏 刘雯 +6 位作者 朱娜 郑佳乐 母学荣 刘洋 田业松 张小红 闵东红 《麦类作物学报》 北大核心 2026年第1期44-50,共7页
株高对小麦产量有重要影响。为进一步挖掘小麦株高的数量性状位点(QTL),以矮秆突变体20DH2-2和高秆材料21Hs-7构建的F2群体为材料,用主基因+多基因混合遗传模型对株高进行遗传分析;利用620对简单重复序列(SSR)分子标记筛选结果构建遗传... 株高对小麦产量有重要影响。为进一步挖掘小麦株高的数量性状位点(QTL),以矮秆突变体20DH2-2和高秆材料21Hs-7构建的F2群体为材料,用主基因+多基因混合遗传模型对株高进行遗传分析;利用620对简单重复序列(SSR)分子标记筛选结果构建遗传连锁图谱,结合F2群体株高表型数据进行QTL定位分析。结果表明,株高的最适遗传模型为2MG-EA(两对等加性主基因)。通过分离群体分组分析法(BSA法)筛选到26对具有多态性的SSR分子标记,构建了全长为531.62 cM遗传连锁图谱。共检测到5个株高相关QTL,分布在2A(2个)、4A、5A及6A染色体上,对数优势比(LOD值)为2.60~8.19,可解释7.97%~22.88%的表型变异。QPH-nwafu-2A.2、QPH-nwafu-4A、QPH-nwafu-5A及QPH-nwafu-6A分别与分子标记BQ838266(距离为4.01 cM)、Xwmc262(距离为3.00 cM)、Xwmc524(距离为3.94 cM)及Xbarc107(距离为0.69 cM)紧密连锁。 展开更多
关键词 普通小麦 遗传分析 株高 qtl
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高粱RIL群体高密度遗传图谱的构建及株高QTL定位
8
作者 杨沛东 程斌 +5 位作者 高旭 徐建霞 曹宁 李文贞 丁延庆 张立异 《种子》 北大核心 2026年第2期41-48,共8页
株高是影响高粱抗倒伏性与机械化收获效率的关键农艺性状。为解析其遗传基础,以矮秆品种‘河农16’与高秆酒用高粱‘红缨子’构建的235个重组自交系(RIL)群体为材料,利用全基因组重测序技术构建了一张包含2822个Bin标记的高密度遗传图谱... 株高是影响高粱抗倒伏性与机械化收获效率的关键农艺性状。为解析其遗传基础,以矮秆品种‘河农16’与高秆酒用高粱‘红缨子’构建的235个重组自交系(RIL)群体为材料,利用全基因组重测序技术构建了一张包含2822个Bin标记的高密度遗传图谱,平均遗传距离为0.87 cM。通过2年4点的表型鉴定,在1、3、4、5、6、7号和9号染色体上共检测到18个株高相关QTL。其中,6个QTL在至少2个环境中稳定表达,qPH9.1的贡献率最高,达38.89%。共定位分析表明,qPH7.1和qPH9.1分别与已知主效基因Dw3和Dw1重叠或紧密连锁。此外,在其余稳定QTL区间内预测到6个新的候选基因,包括与水稻酪蛋白激酶CKI同源的SbiHYZ.01G060500,与bZIP转录因子OsABF1同源的SbiHYZ.03G385400等,这些基因主要参与赤霉素等激素信号及生育期调控通路。 展开更多
关键词 高粱 株高 SNP标记 qtl定位 遗传图谱
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冬小麦RIL群体分蘖相关性状QTL定位
9
作者 郭小玲 俞天胜 +4 位作者 汪永法 程宇坤 任毅 张晓玉 耿洪伟 《麦类作物学报》 北大核心 2026年第1期58-67,共10页
为进一步挖掘小麦分蘖相关性状的数量性状位点(QTL),探索分蘖性状之间的遗传关系,以分蘖性状差异较大的小麦品种Apache和新冬36号构建的255份重组自交系群体(RIL)为材料,分别测定其在4个环境下的冬前分蘖数、单株分蘖数、单株有效分蘖... 为进一步挖掘小麦分蘖相关性状的数量性状位点(QTL),探索分蘖性状之间的遗传关系,以分蘖性状差异较大的小麦品种Apache和新冬36号构建的255份重组自交系群体(RIL)为材料,分别测定其在4个环境下的冬前分蘖数、单株分蘖数、单株有效分蘖数、单位面积有效分蘖数、分蘖角度、成穗率表型值,并基于RIL群体的超低深度测序数据进行分蘖相关性状QTL定位。结果表明,除1D、2D、3B、4D、7A和7B染色体外,在其他15条染色体上共检测到53个分蘖性状相关的QTL,包括13个冬前分蘖数QTL、10个单株分蘖数QTL、8个单株有效分蘖数QTL、11个单位面积有效分蘖数QTL、4个分蘖角度QTL、2个成穗率QTL和5个一因多效的QTL,单个QTL的表型解释率为2.66%~28.76%。其中,QTn.xjau-4B在3个环境下均被检测到,对单株有效分蘖数表型贡献率为28.76%,为稳定主效QTL,同时也是R-E-Z位点,后续可作为研究分蘖及株型的重要位点。 展开更多
关键词 小麦 分蘖性状 超低深度测序 qtl分析
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辣椒重要农艺性状QTL/基因定位研究进展
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作者 龚成胜 刘金兵 +5 位作者 潘宝贵 王述彬 郭广君 高长洲 华艳花 刁卫平 《江苏农业科学》 北大核心 2026年第3期27-33,共7页
辣椒作为全球重要的蔬菜和经济作物,其重要农艺性状的遗传解析对品种改良具有重要意义。随着高通量测序技术和分子标记技术的发展,辣椒数量性状位点(QTL)定位与基因克隆研究取得了显著进展。本文系统总结不同定位群体类型(如F 2群体、... 辣椒作为全球重要的蔬菜和经济作物,其重要农艺性状的遗传解析对品种改良具有重要意义。随着高通量测序技术和分子标记技术的发展,辣椒数量性状位点(QTL)定位与基因克隆研究取得了显著进展。本文系统总结不同定位群体类型(如F 2群体、重组自交系、自然群体)及定位方法(如GWAS、BSA-Seq、SLAF-Seq)的应用及其优缺点,重点综述辣椒重要农艺性状(包括产量、品质、抗逆性等)的QTL/基因定位研究进展;探讨候选基因挖掘的成果及其在分子标记辅助育种与基因编辑中的应用,并分析当前研究在标记密度、定位精度、功能验证等方面存在的技术瓶颈;展望多组学整合及人工智能等新技术在辣椒遗传研究与精准育种中的潜在应用,旨在为辣椒重要性状的遗传解析与分子设计育种提供理论参考和技术支撑。 展开更多
关键词 辣椒 农艺性状 qtl定位 基因克隆 分子育种
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粒厚与稻米品质性状的关系及主效QTLs发掘
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作者 姚晓云 杨平 +5 位作者 张志英 刘启明 熊运华 刘进 彭志勤 尹建华 《江西农业学报》 2026年第1期8-14,共7页
粒厚是籽粒大小的重要决定因子,也是影响水稻产量与品质的重要因素。发掘调控粒厚、产量及品质性状的多效性主效QTL,进而精准筛选基因型,是协同改良水稻产量与品质的关键途径。以优质粳稻屉锦(Sasanisiki)和高产籼稻北陆129(Habataki)... 粒厚是籽粒大小的重要决定因子,也是影响水稻产量与品质的重要因素。发掘调控粒厚、产量及品质性状的多效性主效QTL,进而精准筛选基因型,是协同改良水稻产量与品质的关键途径。以优质粳稻屉锦(Sasanisiki)和高产籼稻北陆129(Habataki)杂交—回交构建的回交重组自交群体(BILs)为试验材料,系统探究粒厚与品质性状的关联,发掘多效性QTL簇。结果表明:粒厚、长厚比和宽厚比与品质性状存在显著相关性,不同粒厚株系的品质性状存在明显差异,薄粒型与中粒型、厚粒型株系的糙米率和整精米存在显著差异,中粒型与厚粒型株系的糙米率和整精米无显著差异,薄粒型株系的食味值、米饭外观、米饭口感和综合评分显著低于中粒型、厚粒型株系,适度增加粒厚可协同优化提升水稻产量与品质。共检测到60个与粒厚及品质性状相关的QTL,粒厚与品质性状QTL分别为12、48个,这些QTL成簇分布在1、2、4、7、8、9和10号染色体上,其中7号染色体RM7~RM1279和10号染色体STS10.1~RM5689染色体区段主效QTL簇对粒厚、加工品质、外观品质和蒸煮食味品质存在明显的多效性。研究结果初步探明了粒厚对品质性状的影响及作用效应,发掘出2个调控粒厚与品质性状的多效性位点,为培育谷粒长且厚的水稻品种提供理论依据和数据支撑。 展开更多
关键词 水稻 粒厚 品质性状 多效性 主效qtl
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小麦穗密度主效QTL的鉴定、验证及其遗传效应分析
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作者 叶美金 陈家婷 +9 位作者 周界光 尹丽 胡欣荣 兰雨昕 陈斌 苏龙兴 刘家君 刘天超 李小雨 马建 《中国农业科学》 北大核心 2026年第1期17-28,共12页
【目的】穗密度(spike density,SD)是小麦重要的农艺性状之一,其遗传调控机制解析对构建理想穗型结构、实现产量突破具有重要意义。挖掘和遗传评价调控穗密度的关键遗传位点,为小麦穗型分子设计育种提供理论依据。【方法】利用自然突变... 【目的】穗密度(spike density,SD)是小麦重要的农艺性状之一,其遗传调控机制解析对构建理想穗型结构、实现产量突破具有重要意义。挖掘和遗传评价调控穗密度的关键遗传位点,为小麦穗型分子设计育种提供理论依据。【方法】利用自然突变体msf和川农16构建的198个F6代重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体,结合基于小麦16K SNP芯片的遗传连锁图谱,通过4个环境下的表型数据系统鉴定穗密度相关数量性状位点(QTL)。进一步利用2个不同遗传背景群体对主效且稳定表达的QTL进行验证,分析稳定表达位点对产量相关性状的遗传效应,评估其对产量提升的潜力。【结果】RIL群体穗密度表型值范围为0.62—2.35,穗密度遗传力为0.71。穗密度与有效分蘖数和小穗数之间存在显著正相关,而与穗粒数、穗粒重、穗长存在极显著负相关。基于4个环境共鉴定到9个控制穗密度的QTL,主要分布在1A、1D、5A(2个)、5B、7A(3个)和7B染色体上。其中,QSd.sicau-MC-1A定位于1A染色体侧翼标记1A_1208254和1A_3911208之间,在2个环境及最佳线性无偏预测(best linear unbiased prediction,BLUP)值中被检测到,可解释9.05%—15.84%的表型变异率,为主效且稳定表达的QTL,其正效应位点来源于亲本川农16,并且该位点的效应在2个具有不同遗传背景的验证群体中得到进一步验证。QSd.sicau-MC-7A.1定位于7A染色体侧翼标记7A_671413788和7A_672390144之间,也在2个环境及BLUP值中被检测到,为稳定表达位点,其正效应位点来源于msf,但其效应较小,可解释7.06%—10.39%的表型变异率。剩余7个QTL均为微效QTL。遗传效应分析表明,QSd.sicau-MC-1A的正效应位点对主要产量性状具有负效应,而QSd.sicau-MC-7A.1的正效应位点起正效应作用。加性效应分析表明,同时携带QSd.sicau-MC-1A和QSd.sicau-MC-7A.1正效应位点的株系的穗密度显著高于仅携带单一位点或没有携带任何正效应位点的株系,穗密度增幅达到9.01%,而仅携带QSd.sicau-MC-1A或者QSd.sicau-MC-7A.1正效应位点的株系的穗密度均显著高于没有携带任何正效应位点的株系,增幅分别为5.03%和4.19%。与前人报道的穗密度位点进行比对,发现QSd.sicau-MC-1A可能为新位点。【结论】在小麦1A和7A染色体各定位到一个稳定表达的穗密度位点,分别为QSd.sicau-MC-1A和QSd.sicau-MC-7A.1,后者更具有育种利用潜力。 展开更多
关键词 小麦 qtl 穗密度 遗传效应 产量
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Kenya Kudu/郑州5389 F_(2:3)群体成株期抗叶锈基因QTL定位
13
作者 张娇梦 刘源 +3 位作者 高璞 王新海 张培培 李在峰 《麦类作物学报》 北大核心 2026年第1期51-57,共7页
肯尼亚小麦品种Kenya Kudu在田间表现良好的成株期抗叶锈性。为解析Kenya Kudu的叶锈病抗性遗传基础,以Kenya Kudu与感病品种郑州5389杂交、自交获得的195个F2∶3家系为材料,于2017—2018和2018—2019年度分别在河北保定和河南周口试验... 肯尼亚小麦品种Kenya Kudu在田间表现良好的成株期抗叶锈性。为解析Kenya Kudu的叶锈病抗性遗传基础,以Kenya Kudu与感病品种郑州5389杂交、自交获得的195个F2∶3家系为材料,于2017—2018和2018—2019年度分别在河北保定和河南周口试验田种植,并接种强毒力叶锈菌混合小种进行成株期抗叶锈病鉴定;利用660K SNP芯片数据结合SSR标记和田间表型数据进行QTL分析及定位。结果表明,在小麦2B和5B染色体上共鉴定到3个成株期抗叶锈QTL;其中2个QTL位于5B染色体,暂命名为QLr.hbau-5B.1和QLr.hbau-5B.2,分别解释了8.3%~10.5%和6.9%~8.6%的表型变异;1个QTL位于2B染色体,暂命名为QLr.hbau-2B,解释了7.2%~10.6%的表型变异。3个位点均为微效成株期抗叶锈QTL,说明Kenya Kudu的叶锈病抗性是多个QTLs的累加效应。所鉴定到的QTL可为小麦抗叶锈病育种提供基因资源,与抗病基因紧密连锁的分子标记可辅助选择抗病品种。 展开更多
关键词 小麦 叶锈病 成株期抗性 qtl定位
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粳稻花时性状QTL定位与聚合效应分析
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作者 张城 邵国军 +7 位作者 张雪 田书军 孙驰 郭艳颖 周燃 韩勇 郑文静 孙廉平 《中国水稻科学》 北大核心 2026年第1期106-117,共12页
【目的】水稻日开花时间是影响粳稻不育系异交率及制繁种产量的重要性状。本研究旨在定位粳稻花时调控相关的QTL并对其聚合效应加以分析,明确早花时QTL的主效位点。【方法】利用早花时粳稻保持系粳65B(J65B)和晚花时粳稻保持系粳139B(J1... 【目的】水稻日开花时间是影响粳稻不育系异交率及制繁种产量的重要性状。本研究旨在定位粳稻花时调控相关的QTL并对其聚合效应加以分析,明确早花时QTL的主效位点。【方法】利用早花时粳稻保持系粳65B(J65B)和晚花时粳稻保持系粳139B(J139B)构建包含221个家系的重组自交系群体。连续3年调查群体花时性状,采用遗传图谱和BSA-seq两种方法进行花时QTL定位分析。【结果】利用完备区间作图法共检测到30个花时性状QTL,分布于2~12号染色体上,其中qFT5.2、qFT5.3、qFT5.5、qFT10.2、qFT10.3在8个以上环境中被同时检测到,加性效应范围13.04~50.93,是稳定表达的主效位点;选取花时极端早和极端晚家系构建混池,利用BSA-seq方法在qFT5.3、qFT5.5、qFT6.2、qFT10.2位点检测到花时关联区域;选取两种方法共同定位到的稳定表达位点进行QTL聚合分析,J65B类型的QTL均会提早花时,qFT5.3和qFT6.2是早花时改良的基础位点,qFT5.5、q FT10.2是进一步提早花时的重要位点。【结论】采用两种方法定位到4个稳定表达主效花时QTL qFT5.3、qFT5.5、qFT6.2和q FT10.2,为早花时基因进一步精细定位、基因克隆和粳稻花时性状改良奠定了基础。 展开更多
关键词 粳稻 花时 重组自交系 BSA-seq qtl定位
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高产优质香稻万香丝苗穗部性状QTLs鉴定分析
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作者 涂夯 孟冰欣 +6 位作者 刘进 黎毛毛 周慧颖 胡佳晓 余前 韩君 余丽琴 《江西农业学报》 2026年第2期1-7,共7页
以高产优质香稻万香丝苗和北方典型高产粳稻沈农9816为亲本杂交衍生的F_(2)、F_(2:3)群体为试验材料,鉴定穗长、穗粒数、结实率和千粒重等穗部性状并进行QTL定位。结果表明:(1)双亲穗部性状存在显著差异,F_(2)、F_(2:3)群体各家系穗部... 以高产优质香稻万香丝苗和北方典型高产粳稻沈农9816为亲本杂交衍生的F_(2)、F_(2:3)群体为试验材料,鉴定穗长、穗粒数、结实率和千粒重等穗部性状并进行QTL定位。结果表明:(1)双亲穗部性状存在显著差异,F_(2)、F_(2:3)群体各家系穗部表型性状存在明显差异且呈现双向超亲分离,表现为近似正态分布。(2)检测到32个QTLs,分布于1~3、5和7~12号染色体上,表型贡献率在3.30%~36.91%之间,贡献率超过10.00%的主效QTLs有12个,有10个QTLs在连续2年试验中被重复定位到。(3)穗部性状QTL在染色体上呈现簇状分布,4个主效QTL簇分别为qGNP2、qGNP5、qGNP8和qGNP9,其中qGNP5和qGNP9所在染色体区域存在多个稳定表达的主效QTLs。研究鉴定发掘了多个稳定表达的主效QTL簇,这可为相关QTL精细定位和功能挖掘奠定基础,也为分子标记辅助选择培育高产水稻提供新的基因元件。 展开更多
关键词 水稻 万香丝苗 沈农9816 穗部性状 qtl定位
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调控大豆籽粒百粒重、油分及蛋白含量的QTL聚合分析
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作者 黄祉毓 于雨 +3 位作者 胡贤燚 占思露 杜欢 葛良法 《大豆科学》 北大核心 2026年第1期26-37,共12页
大豆籽粒百粒重、油分及蛋白含量是由数量性状基因座位(Quantitative Trait Locus, QTL)调控的复杂农艺性状。为阐明不同QTL对3个性状的协同调控效应,以基因型已知的1 769份大豆资源(野生大豆、农家种和栽培品种)的自然群体为研究对象,... 大豆籽粒百粒重、油分及蛋白含量是由数量性状基因座位(Quantitative Trait Locus, QTL)调控的复杂农艺性状。为阐明不同QTL对3个性状的协同调控效应,以基因型已知的1 769份大豆资源(野生大豆、农家种和栽培品种)的自然群体为研究对象,结合其籽粒百粒重、油分及蛋白含量数据组成数据集,采用表型统计分析、基因型和表型联合分析、基因型连锁不平衡分析等方法,基于该数据集对控制大豆籽粒性状的QTL区域内的关键功能基因GmSWEET10a/GmSWEET39、GmMFT/GmST05和POWR1的聚合效应进行研究。结果显示:根据不同单倍型对籽粒性状偏好性不同,将GmSWEET10a/GmSWEET39、GmMFT/GmST05和POWR1的单倍型划分为高油大粒型和高蛋白型。统计分型结果表明,虽然不同大豆资源的性状变异很大,但高油大粒型单倍型聚合能显著提高籽粒百粒重与含油量,同时降低蛋白含量;高蛋白型的聚合则能显著提高蛋白含量,但百粒重和油分含量出现下降;高油大粒型和高蛋白型的聚合则会使得相关性状偏向中性。从野生大豆到农家种再到栽培品种的驯化过程中,籽粒油分含量与百粒重显著增加,蛋白含量呈下降趋势,且GmSWEET10a/GmSWEET39和POWR1的高油大粒型单倍型在栽培品种中极端富集,GmMFT/GmST05也表现出明显的人工选择痕迹。连锁不平衡分析表明,3个基因在栽培品种中呈强连锁效应,进一步印证了人工选择对基因聚合的影响。本研究评估了3个控制大豆籽粒性状基因的不同单倍型在大豆自然群体中的聚合效应,证实同效应单倍型的聚合能显著改善大豆籽粒性状的特征,可为高油高产大豆分子设计育种提供理论依据与重要参考。 展开更多
关键词 大豆 qtl聚合 百粒重 油分含量 蛋白含量
原文传递
玉米种子耐低温萌发QTL位点的初定位
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作者 田博睿 赵梁婧 +5 位作者 李旭辉 李莉 陈全全 王建华 顾日良 杜雪梅 《中国农业大学学报》 北大核心 2026年第3期1-12,共12页
早春低温胁迫严重制约我国北方及高海拔地区玉米生产,挖掘耐低温萌发遗传位点是培育抗逆品种的重要基础。本研究以我国河北省承德地区特有的耐低温萌发自交系‘C181’和骨干系‘PH6WC’为亲本,构建了包含209个家系的F4分离群体。对群体... 早春低温胁迫严重制约我国北方及高海拔地区玉米生产,挖掘耐低温萌发遗传位点是培育抗逆品种的重要基础。本研究以我国河北省承德地区特有的耐低温萌发自交系‘C181’和骨干系‘PH6WC’为亲本,构建了包含209个家系的F4分离群体。对群体进行冷浸发芽试验,选取冷浸发芽率、苗长和根长作为玉米种子耐低温萌发能力的评价指标。利用3.5K液相芯片进行全基因组基因分型检测,构建遗传连锁图谱,利用完备区间作图法(ICIM)检测低温萌发相关QTL位点。结果表明:利用耐低温萌发自交系‘C181’和骨干系‘PH6WC’的911个多态性SNP标记构建的遗传连锁图谱总长为3772.25 cM,标记间的平均遗传距离约为4.14 cM。共检测到调控冷浸发芽率的QTL位点11个、调控苗长的QTL位点1个和调控根长的QTL位点2个,各QTL表型贡献率在2.33%至8.27%之间。在表型贡献率最高的2个QTL区间内,初步筛选出与苗长相关的候选基因Zm00001d007153(编码缺氧响应蛋白)和与发芽率相关的候选基因Zm00001d049926(编码赤霉素代谢相关酶)。综上,冷浸发芽法是鉴定玉米种子耐低温萌发QTL位点的有效方法,利用我国特有的耐低温种质‘C181’能够发掘新的遗传位点,为后续基因克隆与耐低温遗传改良提供了重要位点信息。 展开更多
关键词 玉米 种子萌发 耐低温 qtl定位
原文传递
花生红色种皮性状遗传特性及QTL定位研究
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作者 刘华 齐飞艳 +10 位作者 秦利 孙子淇 王娟 郑玉珍 莫自强 徐静 张忠信 董文召 代小冬 郑峥 张新友 《植物遗传资源学报》 北大核心 2026年第1期152-161,共10页
花生是重要的经济和油料作物,花生红色种皮的花青素含量较高,具有抗氧化和抗炎活性,选育红色种皮的花生新品种具有更高的经济价值和更广阔的市场前景。本研究通过2个红色种皮品种珍珠红1号(ZZH1)、湛红2号(ZH2)和1个粉红色种皮品种豫花1... 花生是重要的经济和油料作物,花生红色种皮的花青素含量较高,具有抗氧化和抗炎活性,选育红色种皮的花生新品种具有更高的经济价值和更广阔的市场前景。本研究通过2个红色种皮品种珍珠红1号(ZZH1)、湛红2号(ZH2)和1个粉红色种皮品种豫花15号(YH15)构建的3个遗传分离群体对红色种皮性状的遗传特性进行研究。YH15×ZZH1的F_(1)种皮为红色,ZH2×YH15的F_(1)种皮为粉红色,ZH2×ZZH1的F_(1)种皮为红色,说明ZZH1的红色种皮为显性性状,而ZH2的红色种皮为隐性性状。YH15×ZZH1和ZH2×YH15的F_(2)种皮颜色分离比经卡方检测分别符合1对显性基因调控的假设和1对隐性基因调控的假设,而ZH2×ZZH1的F_(2)种皮颜色分离比经卡方检测符合2对基因调控的假设,即红色种皮性状可分显性性状和隐性性状,其各受1对基因调控。选取YH15×ZZH1群体中红色不分离家系和粉红色不分离家系构建混池进行BSA-seq分析,将调控显性红色种皮性状的1个主效QTL定位在3号染色体上的一个0.898 Mb的区间,LOD值为113.18~139.16,遗传贡献率为95.2%~97.6%。基于前人报道的2个与红色种皮连锁的重新设计的标记和本研究中开发的1个标记在3个遗传群体中验证其连锁性,发现标记Tif2.A03.126107404与显性红色种皮性状完全连锁,标记Tif1.A03.125867405与显性红色种皮性状高度连锁,而标记Tif1.A12.117190528与隐性红色种皮性状完全连锁,这些标记为红色种皮性状分子标记辅助选择提供技术支撑。 展开更多
关键词 花生 红色种皮 遗传特性 BSA-seq qtl定位
原文传递
控制玉米叶片数的QTL定位及基因功能注释
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作者 薛春雷 张旭婷 +11 位作者 张海龙 付增娟 刘亚楠 吴海燕 张子玉 张赛楠 余忠浩 吴慧 韩平安 马岩 王永行 孙峰成 《华北农学报》 北大核心 2026年第1期49-55,共7页
为明确玉米总叶片数与穗上叶片数的遗传特性,揭示其对玉米产量潜力、生物量积累及抗倒伏性的调控作用,开展控制玉米叶片数的QTL定位及基因挖掘的试验。利用SLAF-seq技术对昌7-2和PHB1M及其138份F_(2∶3)家系进行高通量测序,结合60000(E1... 为明确玉米总叶片数与穗上叶片数的遗传特性,揭示其对玉米产量潜力、生物量积累及抗倒伏性的调控作用,开展控制玉米叶片数的QTL定位及基因挖掘的试验。利用SLAF-seq技术对昌7-2和PHB1M及其138份F_(2∶3)家系进行高通量测序,结合60000(E1),120000(E2)株/hm^(2)2个种植密度处理下的叶片数表型数据进行QTL定位,并对定位结果进行基因挖掘。结果表明,分布在8号染色体上的2个总叶片数QTL为主效QTL,贡献率分别为16.96%和23.08%,加性效应值为负值;3个穗上叶片数的QTL分布在2号和4号染色体,加性效应值为正值,分布在4号染色体的2个QTL为主效QTL,贡献率分别为10.18%和14.75%;总叶片数和穗上叶片数的QTL分布在不同染色体区域,可能受到相对独立的遗传调控。基因功能分析发现,筛选到的基因参与碳水化合物代谢和植物激素信号转导途径等,同时筛选到部分转录因子。本研究结果为进一步揭示玉米叶片数的遗传基础提供更丰富的理论支持,为分子标记辅助育种提供靶点。 展开更多
关键词 玉米 总叶片数 穗上叶片数 qtl 基因挖掘
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基于高密度遗传图谱的高粱分蘖数QTL定位与分析
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作者 曹宁 丁延庆 +5 位作者 姜昱雯 徐建霞 高旭 程斌 李文贞 张立异 《山东农业科学》 北大核心 2026年第2期34-40,共7页
分蘖数是影响高粱株型和产量的关键因素,定位影响该性状的主效数量性状基因座(QTL)可为高粱的分子遗传改良提供依据。本研究以美国高粱品种BTx623与贵州酒用高粱品种红缨子杂交构建的包含205个家系的重组自交系(RIL)群体为材料,在2020年... 分蘖数是影响高粱株型和产量的关键因素,定位影响该性状的主效数量性状基因座(QTL)可为高粱的分子遗传改良提供依据。本研究以美国高粱品种BTx623与贵州酒用高粱品种红缨子杂交构建的包含205个家系的重组自交系(RIL)群体为材料,在2020年和2021年贵阳(2020GY、2021GY)、2020年安顺(2020AS)3个环境条件下调查分蘖数,并利用构建的高密度遗传图谱,采用完备区间作图法(ICIM)开展QTL定位。结果表明,在第1、2、5号染色体上共检测到5个与高粱分蘖数密切相关的QTL,涉及5个染色体区段。其中有2个主效QTL在2个环境中被重复检测到,分别为qTN3.2和qTN5.1,前者与已知的分蘖数基因OsASI1一致,而后者所在区间与水稻DHT1基因同源。同时分析了两个候选基因在高粱不同生育时期各组织中的表达模式以及在242份高粱种质中的单倍型变异情况,结果表明两个候选基因的表达呈现不同的时空特性,其序列变异与分蘖数表型显著相关。本研究结果可为后续高粱分蘖数基因的克隆和功能验证提供理论依据。 展开更多
关键词 高粱 分蘖数 高密度遗传图谱 qtl定位
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