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脂肪量和肥胖相关蛋白FTO调控IFIT2促进肝细胞癌发生发展 被引量:2
1
作者 兰兰 宣自学 姜金颖 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第5期834-839,共6页
目的初步研究脂肪量和肥胖相关蛋白(FTO)调控肝细胞癌(HCC)的分子机制。方法构建FTO敲低的肝细胞癌细胞系HepG2细胞,收集FTO敲低的和未敲低的HepG2细胞,利用Illumina Hiseq平台进行高通量测序,筛选两组别间基因表达差异;通过对这些差异... 目的初步研究脂肪量和肥胖相关蛋白(FTO)调控肝细胞癌(HCC)的分子机制。方法构建FTO敲低的肝细胞癌细胞系HepG2细胞,收集FTO敲低的和未敲低的HepG2细胞,利用Illumina Hiseq平台进行高通量测序,筛选两组别间基因表达差异;通过对这些差异基因进行GO和KEGG富集分析,研究FTO调控通路及筛选FTO下游靶基因;利用生信分析和细胞实验揭示FTO下游靶基因在HCC中的作用。结果转录组测序结果显示,FTO敲低的和未敲低的HepG2细胞间有386个基因发生了差异性表达,它们参与对干扰素-γ的反应等生物过程;FTO敲低后IFIT2(响应性最强的干扰素刺激基因之一)表达上调;IFIT2多个位点会发生潜在的m^(6)A甲基化;IFIT2高表达HCC患者生存期显著延长,敲低IFIT2促进HCC生长和迁移。结论FTO可能通过介导m^(6)A调控IFIT2,进而促进HCC发生发展。 展开更多
关键词 FTO ifit2 肝细胞癌 转录组测序 HEPG2 m^(6)A
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IFITM和IFIT家族基因的抗病毒机制研究进展 被引量:4
2
作者 张贝 郝文文 +3 位作者 耿立英 彭永东 张传生 李祥龙 《中国家禽》 北大核心 2019年第14期55-59,共5页
干扰素诱导的跨膜(Interferon-induced transmembrane,IFITM)蛋白家族和干扰素诱导(Interferon-induced proteins with tetratricopeptide repeats,IFIT)蛋白家族作为受干扰素所诱导的,执行抗病功能的家族,在免疫反应中扮演着至关重要... 干扰素诱导的跨膜(Interferon-induced transmembrane,IFITM)蛋白家族和干扰素诱导(Interferon-induced proteins with tetratricopeptide repeats,IFIT)蛋白家族作为受干扰素所诱导的,执行抗病功能的家族,在免疫反应中扮演着至关重要的角色;特别是IFIT5是家禽体内存在唯一的IFIT家族成员。IFITM通过抑制病毒包膜与宿主细胞膜的融合,从而抑制病毒的入侵;而IFIT则是抑制病毒的转录与复制,阻断病毒繁殖,从而抑制病毒的感染。两者在生物体内协同发挥抗病毒功能,清除病毒,保护宿主细胞正常的生理活动。在数万年的进化中,病毒也进化出相应的机制来逃避免疫蛋白的抑制。文章就IFITM和IFIT基因家族抗病毒机制的研究进展进行总结,为之后的研究提供参考。 展开更多
关键词 ifitM ifit 抗病毒机制 免疫逃避
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IFIT家族基因抑制A型流感病毒WSN毒株的复制和转录 被引量:6
3
作者 侯力丹 李晶 +4 位作者 瞿洪仁 杨利敏 陈亚军 杜茜茜 刘文军 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期123-134,共12页
IFIT(Interferon induced proteins with tetratricopeptide repeats)家族基因是一组较早发现的干扰素刺激基因,它在抗病毒和免疫调节中发挥了重要作用。为研究IFIT家族基因抑制A型流感病毒复制的机理,利用高通量RNA深度测序(RNA-Seq)... IFIT(Interferon induced proteins with tetratricopeptide repeats)家族基因是一组较早发现的干扰素刺激基因,它在抗病毒和免疫调节中发挥了重要作用。为研究IFIT家族基因抑制A型流感病毒复制的机理,利用高通量RNA深度测序(RNA-Seq)技术发现A型流感病毒A/WSN/33(WSN)毒株感染293T细胞后,IFIT家族基因均出现明显上调。同时发现在IFIT2、IFIT3过表达后,流感病毒的复制和转录均有明显下调,并对v RNP聚合酶活性具有剂量依赖型的抑制作用。进一步研究证明在感染IFIT2、IFIT3编码蛋白与流感病毒非结构蛋白(NS1)存在细胞内共定位,证明二者存在相互作用的可能。综上所述,IFIT家族基因可以抑制A型流感病毒的复制和转录,有助于进一步阐明宿主因子对流感病毒感染的调节机制。 展开更多
关键词 ifit家族蛋白 A型流感病毒 病毒复制 天然免疫
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小鼠IFIT1多克隆抗体的制备 被引量:7
4
作者 郭晓姝 李洪涛 +2 位作者 方海立 王军平 粟永萍 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第15期1462-1464,共3页
目的获取小鼠IFIT1(Interferon-induced protein with tetratricopetide repeats 1)特异性多克隆抗体。方法扩增培养高效表达IFIT1的重组子pMAL-C2X-IFIT1,超声破碎后的细胞上清过Amylose Pre-packed column亲和层析柱,将所得纯化的融... 目的获取小鼠IFIT1(Interferon-induced protein with tetratricopetide repeats 1)特异性多克隆抗体。方法扩增培养高效表达IFIT1的重组子pMAL-C2X-IFIT1,超声破碎后的细胞上清过Amylose Pre-packed column亲和层析柱,将所得纯化的融合蛋白MBP-IFIT1作为抗原,添加福氏佐机剂后免疫兔,收集抗血清,用Western blot和ELISA方法测定抗血清特异性反应和效价。结果纯化的MBP-IFIT1可诱导兔产生特异性免疫应答,所得抗体能够特异性识别融合蛋白中的IFIT1,ELISA结果显示其效价为1∶12800。结论MBP-IFIT1具有良好的抗原性,以该融合蛋白为抗原免疫兔成功制备出IFIT1特异性多克隆抗体。 展开更多
关键词 ifit1 多克隆抗体 融合蛋白 抗原性 免疫应答
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颈交感神经阻滞对烧伤早期小鼠肝脏干扰素诱导蛋白IFIT1表达的影响 被引量:9
5
作者 郭晓姝 方海立 +1 位作者 李军 粟永萍 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第17期1647-1649,共3页
目的检测干扰素诱导蛋白IFIT1(interferon-induced protein with tetratricopetide repeats1)在小鼠各器官组织的表达状况,并在此基础上探讨颈交感神经阻滞(SB)对烧伤后早期小鼠肝脏IFIT1表达的影响。方法雄性C57/129小鼠50只,分为对照... 目的检测干扰素诱导蛋白IFIT1(interferon-induced protein with tetratricopetide repeats1)在小鼠各器官组织的表达状况,并在此基础上探讨颈交感神经阻滞(SB)对烧伤后早期小鼠肝脏IFIT1表达的影响。方法雄性C57/129小鼠50只,分为对照组和SB治疗组,TBSA15%~20%Ⅲ度小鼠烧伤模型,分别于烧伤前、烧伤后1、6、12h和24h取肝组织,采用免疫印迹法(Western blot)观察IFIT1的蛋白表达情况,同时提取正常小鼠心、肝、脾、肺、肾、小肠、淋巴细胞和骨骼肌组织RNA,以RT-PCR检测IFIT1表达情况。结果RT-PCR结果显示IFIT1在正常小鼠各组织均有表达,但组织间的表达量存在差异。Western blot结果表明对照组烧伤后肝组织IFIT1表达显著增高(P<0.01),烧伤后SB治疗组IFIT1表达量较对照组相应时相点降低非常显著(P<0.01)。结论IFIT1在小鼠体内广泛表达。SB对严重创伤的治疗作用可能是通过抑制肝内IFIT1表达来实现的。 展开更多
关键词 ifit1 颈交感神经阻滞 烧伤
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颈交感阻滞对烧伤早期小鼠各器官IFIT1表达的影响 被引量:3
6
作者 巩继平 陈玉培 +1 位作者 郭晓姝 粟永萍 《第四军医大学学报》 北大核心 2009年第6期485-488,共4页
目的:观察小鼠心、肝、脾、肺、肾等器官干扰素诱导蛋白IFIT1(Interferon—induced protein with tetratfieopetide repeats1)的表达情况,探讨颈交感神经阻滞(cervical sympathetic block,SB)对烧伤后早期小鼠各器官IFIT1表达状... 目的:观察小鼠心、肝、脾、肺、肾等器官干扰素诱导蛋白IFIT1(Interferon—induced protein with tetratfieopetide repeats1)的表达情况,探讨颈交感神经阻滞(cervical sympathetic block,SB)对烧伤后早期小鼠各器官IFIT1表达状况的影响.方法:将雄性昆明小鼠18只随机分为正常对照组、烧伤组和颈交感神经阻滞(SB)治疗组、烧伤组和SB治疗组采用体表总面积(Total body surface area,TBSA)15%-20%Ⅲ度小鼠烧伤模型,SB治疗组于烧伤后即刻进行双侧颈交感神经阻滞,各组分别于4h后取心、肝、脾、肺、肾组织,提取RNA,以RT—PCR检测IFIT1表达情况.结果:RT—PCR显示IFIT1在各组的各器官均有表达,并存在差异.烧伤组IFIT1在心、肝、脾表达低于正常组,同时在肺、肾表达高于正常组,差异显著(P〈0.01).SB治疗组IFIT1的表达均低于正常组(P〈0.01);同时,SB治疗组IFIT1在心、肝、肺、肾的表达也低于烧伤组(P〈0.01).另外,在各组内的不同器官的IFIT1表达量存在差异(P〈0.05).结论:烧伤后早期小鼠各器官IFIT1表达有不同的变化,可能与不同器官在烧伤应激反应过程中损伤程度不同有关.SB可显著降低各器官IFIT1的表达. 展开更多
关键词 ifit1 颈丛 自主神经传导阻滞 烧伤
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氯胺酮对烧伤早期小鼠肝应激相关蛋白IFIT1和JAB1表达的影响 被引量:3
7
作者 巩继平 陈玉培 +1 位作者 郭晓姝 粟永萍 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 2008年第11期1287-1290,共4页
目的:观察小鼠应激相关蛋白IFIT1(Interferon-induced protein with tetratricopetide repeats1)和JAB1(c-Jun平activation共处五项原则domain-binding protein 1)在肝脏的表达的细胞定位及氯胺酮对烧伤后早期肝脏IFIT1和JAB1表达... 目的:观察小鼠应激相关蛋白IFIT1(Interferon-induced protein with tetratricopetide repeats1)和JAB1(c-Jun平activation共处五项原则domain-binding protein 1)在肝脏的表达的细胞定位及氯胺酮对烧伤后早期肝脏IFIT1和JAB1表达的影响,初步探讨氯胺酮调节炎症反应的分子机制。方法:将15只健康C57/129小鼠随机分为3组(n=5),正常对照组、烧伤组、烧伤+氯胺酮组。采用TBSA 15~20%Ⅲ度小鼠烧伤模型;氯胺酮10mg/kg,肌肉注射,烧伤15min给予。分别于烧伤后4h脱臼处死,取肝。采用免疫印迹法(Western blot)察各组肝IFIT1和JAB1的表达情况。取正常对照组肝组织作病理切片,行免疫组织化学方法对IFIT1和JAB1的表达做细胞定位。结果:烧伤组IFIT1表达较正常对照组显著增高(P〈0.01).烧伤组JAB1表达较正常对照组显著降低(P〈0.01):氯胺酮治疗组IFIT1表达较正常对照组、烧伤对照组显著降低(P〈0.01).氯胺酮治疗组JAB1表达较正常对照组显著降低(P〈0.05)、较烧伤组显著升高(P〈0.05)。免疫组织化学方法显示.IFIT1在肝细胞胞浆表达为阳性.JAB1在肝细胞胞浆和胞核均表达为阳性。结论:烧伤早期小鼠肝组织IFIT1表达增高而JJAB1表达降低,氯胺酮可降低烧伤早期小鼠肝组织IFIT1的高表达,增高JAB1表达;氯胺酮可通过调控严重烧伤应激中IFIT1和JAB1的表达而在全身炎性反应综合症(Systemic inflammatory response syndrome SIRS)中发挥作用。 展开更多
关键词 应激相关蛋ifit1 应激相关蛋白JAB1 全身炎性反应综合症
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四个家鸭群体IFIT-5基因外显子2的遗传多态性分析 被引量:3
8
作者 苏燕辉 陈阳 +6 位作者 穆春宇 王彬 黄正洋 俞钦明 徐琪 常国斌 陈国宏 《中国家禽》 北大核心 2014年第18期10-13,共4页
研究旨在分析家鸭IFIT-5基因外显子2的多态性,以期为进一步研究家鸭IFIT-5基因与疾病抗性的相关性提供理论依据。根据GenBank上收录的IFIT-5基因序列设计特异性引物,采用PCR-SSCP方法对苏牧麻鸭、金定鸭、樱桃谷鸭与白羽番鸭这4个家鸭群... 研究旨在分析家鸭IFIT-5基因外显子2的多态性,以期为进一步研究家鸭IFIT-5基因与疾病抗性的相关性提供理论依据。根据GenBank上收录的IFIT-5基因序列设计特异性引物,采用PCR-SSCP方法对苏牧麻鸭、金定鸭、樱桃谷鸭与白羽番鸭这4个家鸭群体IFIT-5基因外显子2进行多态性分析。结果表明:在IFIT-5基因外显子2上检测到2种等位基因、2种基因型,存在1个SNP位点;在4个群体中均未检测到BB基因型个体,4个群体均不处于哈代-温伯格平衡,苏牧麻鸭跟金定鸭不同基因型分布差异不显著(P>0.05),而其余群体彼此不同基因型分布存在极显著性差异(P<0.01)。提示4个家鸭群体IFIT-5基因外显子2存在遗传多态性,不同家鸭群体在遗传基础上存在着一定的差异。 展开更多
关键词 家鸭 ifit-5基因 多态性
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鸡源IFIT5蛋白的体外表达及单克隆抗体的制备
9
作者 高向向 贾璐 +3 位作者 胡伯里 邓婷娟 郑肖娟 周继勇 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1087-1093,共7页
鸡IFIT5(chIFIT5)蛋白在抗病毒免疫中具有重要作用。为了阐明其具体作用机制,本研究将禽传染性法氏囊病病毒(infectious bursal disease virus,IBDV)感染DF-1细胞后,通过RT-PCR方法扩增chIFIT5基因,将其构建到pET-28a(+)原核表达载体上... 鸡IFIT5(chIFIT5)蛋白在抗病毒免疫中具有重要作用。为了阐明其具体作用机制,本研究将禽传染性法氏囊病病毒(infectious bursal disease virus,IBDV)感染DF-1细胞后,通过RT-PCR方法扩增chIFIT5基因,将其构建到pET-28a(+)原核表达载体上进行表达,然后用纯化的重组chIFIT5蛋白免疫小鼠后通过细胞融合技术筛选能稳定分泌抗chIFIT5蛋白的单克隆抗体细胞株。结果显示,扩增获得的chIFIT5基因的大小为1 440 bp,在原核细胞中成功表达的重组chIFIT5蛋白约58 ku。Western-blot检测显示,有4株单抗与重组chIFIT5蛋白、IBDV感染的细胞中chIFIT5蛋白以及Myc-chIFIT5真核转染蛋白均能发生免疫反应,但间接免疫荧光(IFA)检测反应却均呈阴性。抗体亚类分析结果显示,四株细胞株所分泌的单克隆抗体均为Ig G 2a亚类,轻链均为κ链。这为鸡源IFIT蛋白的生物学特性研究奠定了基础。 展开更多
关键词 ifit家族蛋白 chifit5 单克隆抗体 抗体亚型
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鸡IFIT5基因编码区多态性及生物信息学分析 被引量:1
10
作者 张贝 孟婕 +5 位作者 任一帆 杨晴 巩静 张传生 耿立英 李祥龙 《中国家禽》 北大核心 2021年第10期17-24,共8页
为探究鸡IFIT5基因多态性,预测其蛋白质的结构并分析功能特征,采用PCR技术对IFIT5的CDS进行扩增,并结合多种生物信息学等方法对蛋白的理化性质及蛋白结构功能进行系统性预测分析。结果显示:通过PCR成功克隆了IFIT5外显子2的CDS区域,测... 为探究鸡IFIT5基因多态性,预测其蛋白质的结构并分析功能特征,采用PCR技术对IFIT5的CDS进行扩增,并结合多种生物信息学等方法对蛋白的理化性质及蛋白结构功能进行系统性预测分析。结果显示:通过PCR成功克隆了IFIT5外显子2的CDS区域,测序结果为1 411 bp;经分析得到完整的IFIT5 CDS区为1 440 bp,共编码479个氨基酸,测序比对结果准确。IFIT5蛋白为不稳定的、小分子的、非分泌型的亲水蛋白,且具有磷酸化和糖基化位点;二级结构主要以α-螺旋为主,结构域以TPR结构域为主。研究发现了12个SNP,其中SNP1(g.405 G>A)和SNP9(g.1 124 G>A)在原鸡为A,在家鸡中已固定为G;只有SNP8(g.110 8 A>G)和SNP12(g.1 273 A>G)位点具有中度多态性,其他位点是低度。12个SNP位点中存在4个nsSNP位点(D370N、Y375C、N402K和G425R)。其中D370N、Y375C和N402K位点被预测为有害性位点;并且D370N和N402K突变可能改变相关氨基酸的氢键数目和蛋白的高级结构,进而影响蛋白的结构和功能。这些nsSNP位点,特别是D370N和N402K可尝试作为鸡先天免疫的候选分子标记,为遗传资源的保护及抗病性分子育种提供理论依据。 展开更多
关键词 ifit5基因 多态性 蛋白质结构 生物信息学分析
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IFIT1在放射损伤与感染应激中表达的特点和意义 被引量:1
11
作者 郭晓姝 郝玉徽 +3 位作者 粟永萍 王军平 王崧 许杨 《局解手术学杂志》 2016年第5期323-326,共4页
目的探讨IFIT1(interferon-induced protein with tetratricopetide repeats 1)在放射损伤与感染应激中表达的特点和意义。方法采用5μg/mL的脂多糖(LPS)刺激Raw264.7、3T3和10T1/2细胞株5 h后,收集细胞,提取RNA,行RT-PCR观察IFIT1的表... 目的探讨IFIT1(interferon-induced protein with tetratricopetide repeats 1)在放射损伤与感染应激中表达的特点和意义。方法采用5μg/mL的脂多糖(LPS)刺激Raw264.7、3T3和10T1/2细胞株5 h后,收集细胞,提取RNA,行RT-PCR观察IFIT1的表达情况,同时设定空白对照组。另外,将20只C57/BL6小鼠随机分为4组,采用12 Gray60Co一次性全身照射,分别于0 h、1 h、4 h和12 h脱颈处死取肝组织,用Western blot测定肝组织IFIT1表达变化。结果 Raw264.7、3T3和10T1/2细胞株经LPS刺激5 h后,均能诱导IFIT1表达,空白对照组表达为阴性。C57/BL6小鼠放射性损伤后,1 h IFIT1/Actin开始增高,12 h达最高,呈上升趋势,差异有极显著性统计学意义(P<0.01)。结论 LPS可刺激多种细胞株表达IFIT1,提示IFIT1可能参与创伤后毒血症的发生和发展;放射损伤早期能引起小鼠肝组织IFIT1的显著增高。 展开更多
关键词 放射性损伤 脂多糖 ifit1 糖皮质激素受体 毒血症
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斑马鱼一个IFIT家族基因的鉴定及启动子分析 被引量:4
12
作者 刘颖 张义兵 +1 位作者 刘庭凯 桂建芳 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期1-8,共8页
IFIT家族由一类受干扰素诱导表达并具有TPR结构域的蛋白组成,但是在鱼类关于IFIT基因的研究还很少。研究利用哺乳类IFIT家族基因IFI56的序列搜索斑马鱼基因组数据库鉴定出一个未知基因,该基因具有哺乳类IFIT家族保守的基因组结构,编码... IFIT家族由一类受干扰素诱导表达并具有TPR结构域的蛋白组成,但是在鱼类关于IFIT基因的研究还很少。研究利用哺乳类IFIT家族基因IFI56的序列搜索斑马鱼基因组数据库鉴定出一个未知基因,该基因具有哺乳类IFIT家族保守的基因组结构,编码蛋白具有保守的TPR结构域,暂命名为IFIT-A。RT-PCR分析表明,Poly I:C能够诱导IFIT-A基因转录水平上调。与哺乳类IFIT家族基因相似,斑马鱼IFIT-A启动子存在ISG基因特有的典型ISRE结构域。荧光素酶活性实验揭示Poly I:C和重组IFN蛋白能激活斑马鱼IFIT-A启动子活性。此外,过量表达IFN调控因子IRF3和IRF7能诱导斑马鱼IFIT-A启动子活性。实验结果证明IFIT-A基因是斑马鱼IFIT家族成员,IRF3和IRF7在其诱导表中具有重要调控作用。 展开更多
关键词 斑马鱼 ifit家族 干扰素 启动子 表达调控
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猪IFIT1基因的克隆、生物信息学和组织表达分析 被引量:5
13
作者 董然然 李顺 蒋曹德 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期79-84,共6页
采用cDNA末端快速扩增(RACE)方法,对荣昌猪IFIT1基因进行克隆测序,利用生物信息学方法分析其结够和功能,并用Real-ti me PCR方法分析初生个体和1月龄个体11个不同组织(肺、心、肾、舌头、膀胱、卵巢、脾、肝、肌肉、胃和小肠)的表达情况... 采用cDNA末端快速扩增(RACE)方法,对荣昌猪IFIT1基因进行克隆测序,利用生物信息学方法分析其结够和功能,并用Real-ti me PCR方法分析初生个体和1月龄个体11个不同组织(肺、心、肾、舌头、膀胱、卵巢、脾、肝、肌肉、胃和小肠)的表达情况.结果表明:IFIT1基因cDNA序列为1971 bp(GenBank登录号:HQ679904),包含5 UTR48 bp,全部CDS序列1437 bp和3 UTR487 bp,编码478个氨基酸,相对分子质量为55 232.9×103,等电点为6.18.其二级结构以α-螺旋和无归卷曲为主,三级结构具有典型的三角四肽和螺旋转角螺旋重复结构.荧光定量结果显示IFIT1表达量在初生个体和1月龄个体各组织间均存在着显著性差异(p<0.01),初生个体在脾脏中的表达量高于其它各组织(p<0.01),1月龄个体在肌肉中的表达量高于其它组织(p<0.01). 展开更多
关键词 ifit1 基因克隆 生物信息学 组织表达
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系统性红斑狼疮与Th1、Th2细胞因子及IFIT4相关性研究
14
作者 贺仆 林浩杰 《预防医学论坛》 2008年第5期398-400,共3页
[目的]探讨系统性红斑狼疮(SLE)患者干扰素诱导蛋白4(IFIT4)与细胞因子Th1、Th2的相关性。[方法]对2006年8月至2007年12月山东省千佛山医院风湿免疫科门诊与病房的59例SLE患者进行检测,并与32名正常体检者对比。[结果]IFIT4 mRNA含量,SL... [目的]探讨系统性红斑狼疮(SLE)患者干扰素诱导蛋白4(IFIT4)与细胞因子Th1、Th2的相关性。[方法]对2006年8月至2007年12月山东省千佛山医院风湿免疫科门诊与病房的59例SLE患者进行检测,并与32名正常体检者对比。[结果]IFIT4 mRNA含量,SLE患者组高于对照组,SLE患者活动组高于非活动组(P<0.01);Th1(IFN-γ)细胞百分率和Th1/Th2型细胞比值,SLE患者组低于对照组,SLE患者活动组低于非活动组(P<0.01);SLE患者组的IFIT4 mRNA含量与SLEDAI积分呈显著正相关(P<0.01),与Th1/Th2比值呈负相关(P<0.01)。[结论]SLE患者的IFN诱导蛋白IFIT4可影响细胞因子的表达,IFIT4的表达水平和Th1/Th2比值均影响SLE发病和活动性。 展开更多
关键词 红斑狼疮 TH1 TH2 ifit4 相关性
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干扰素刺激基因IFIT1抑制蓝舌病病毒的复制 被引量:2
15
作者 张国芮 康棣 +7 位作者 王轩莹 田占成 高闪电 关贵全 常惠芸 薛慧文 殷宏 独军政 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1660-1669,共10页
为了研究干扰素刺激基因1(Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1,IFIT1)在蓝舌病病毒1型(Bluetongue virus serotype 1,BTV1)感染复制过程中的作用,首先利用实时定量PCR检测到BTV1感染绵羊睾丸细胞后IFIT1基因... 为了研究干扰素刺激基因1(Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1,IFIT1)在蓝舌病病毒1型(Bluetongue virus serotype 1,BTV1)感染复制过程中的作用,首先利用实时定量PCR检测到BTV1感染绵羊睾丸细胞后IFIT1基因的转录水平明显升高,利用RT-PCR方法扩增获得羊IFIT1基因,测序后进行生物信息学分析,将其克隆到质粒载体pcDNA3.1/(+)上,构建重组表达质粒pcDNA3.1-OV-IFIT1,将其转染BHK-21细胞,观察到IFIT1基因在细胞内的成功表达,然后利用BTV1感染质粒pcDNA3.1-OV-IFIT1转染的细胞,从病毒的mRNA转录、蛋白表达和病毒滴度的变化评价IFIT1对BTV1复制的影响。结果显示,IFIT1在细胞中的过表达可显著抑制BTV1复制,相反,敲低IFIT1的表达可促进BTV1的复制。本研究首次报道了干扰素刺激基因IFIT1在BTV1感染复制过程中的作用,这将有助于揭示BTV1和宿主细胞IFIT1的相互作用机制,同时也为抗病毒药物研发提供了理论指导。 展开更多
关键词 ifit1 蓝舌病病毒 病毒复制 抗病毒免疫
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IFIT5在肝细胞癌中表达上调并促进肝癌细胞侵袭和迁移 被引量:3
16
作者 杨楠 陈天翔 +4 位作者 刘润坤 牛永申 王亮 姚博文 刘志奎 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第21期2093-2099,共7页
目的探讨干扰素诱导蛋白5(interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5,IFIT5)在肝癌组织中的表达、临床意义及可能的分子机制。方法收集2013年在西安交通大学第一附属医院确诊的97例肝癌患者的肿瘤组织和癌旁组织。... 目的探讨干扰素诱导蛋白5(interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5,IFIT5)在肝癌组织中的表达、临床意义及可能的分子机制。方法收集2013年在西安交通大学第一附属医院确诊的97例肝癌患者的肿瘤组织和癌旁组织。实时定量PCR、Western blot及免疫组化检测IFIT5在肝癌及癌旁组织中的表达水平,并分析IFIT5表达水平与临床病理指标的关系及生存率。Transwell实验检测IFIT5对HCC细胞的侵袭及迁移作用,Western blot法检测IFIT5对HCC细胞EMT的影响。结果IFIT5在肝癌组织中表达水平显著高于相应癌旁组织(P<0.05);肝癌组织IFIT5高表达与TNM分期(P=0.018)及血管侵犯(P=0.009)显著相关;高表达IFIT5患者5年生存率明显高于低表达组(P<0.05);IFIT5可显著促进HCC细胞的侵袭及迁移(P<0.05);IFIT5促进HCC细胞EMT的发生(P<0.05)。结论IFIT5在肝癌组织中表达升高,其高表达与肝癌恶性临床病理特征有关,IFIT5能够通过调控HCC细胞EMT促进其侵袭和迁移。 展开更多
关键词 ifit5 肝细胞癌 侵袭 迁移 上皮间质转化
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鸡IFIT5基因单核苷酸多态性的生物信息学分析 被引量:6
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作者 张贝 郝文文 +3 位作者 耿立英 彭永东 张传生 李祥龙 《河北科技师范学院学报》 CAS 2019年第1期33-38,47,共7页
为了筛选鸡IFIT5基因潜在的、具有生物学功能的nsSNPs(nonsense Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点和UTR-SNPs(untranslated regions-SNPs)位点。利用5种SNPs在线工具对nsSNPs进行分析预测有害位点;使用SWISS-MODEL,Pymol,Cons... 为了筛选鸡IFIT5基因潜在的、具有生物学功能的nsSNPs(nonsense Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点和UTR-SNPs(untranslated regions-SNPs)位点。利用5种SNPs在线工具对nsSNPs进行分析预测有害位点;使用SWISS-MODEL,Pymol,Consurf server等软件对有害nsSNPs位点进行蛋白质的空间结构,氨基酸的氢键变化,及保守型等进行相关分析。此外,对UTR-SNPs位点使用UTRScan分析预测其结合模式元件是否改变。结果表明:从IFIT5基因的nsSNPs位点筛选出来的6个有害nsSNPs位点(L220I,L223M,L223V,Y375C,E391G和Y414D)都为潜在性功能位点,其中E391G位点最可能影响蛋白的结构和功能。从UTR-SNPs筛选出9个位于uORF的位点可能影响IFIT5基因的转录模式。 展开更多
关键词 ifit5基因 非同义SNPs(nsSNPs) UTR-SNPs 同源建模 保守性分析
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犬源干扰素刺激基因ISG15和IFIT2荧光定量PCR检测方法的建立及应用 被引量:1
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作者 王改丽 程悦宁 +5 位作者 张淑琴 王建科 王超 孙娜 易立 程世鹏 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1119-1123,1135,共6页
干扰素刺激基因在抗病毒及调节IFN信号通路的过程中具有重要作用。本课题组前期对犬瘟热病毒(CDV)感染宿主前后全转录组进行测序分析,发现干扰素刺激基因ISG15和IFIT2明显上调,为了进一步探究ISG15和IFIT2对CDV感染的影响,本研究设计合... 干扰素刺激基因在抗病毒及调节IFN信号通路的过程中具有重要作用。本课题组前期对犬瘟热病毒(CDV)感染宿主前后全转录组进行测序分析,发现干扰素刺激基因ISG15和IFIT2明显上调,为了进一步探究ISG15和IFIT2对CDV感染的影响,本研究设计合成了犬源ISG15、IFIT2和持家基因GAPDH的特异性引物,分别进行PCR扩增,构建质粒标准品,建立荧光定量PCR检测方法,并对该方法的特异性、灵敏性和重复性进行检验。结果表明,犬源ISG15、IFIT2和GAPDH的荧光定量PCR标准曲线的相关性R^2均大于0.98,表明线性关系良好。ISG15、IFIT2和GAPDH的融解曲线均为单峰,扩增产物单一,且峰值一致,表明建立的荧光定量PCR方法特异性良好。组内与组间的变异系数均小于0.2%,表明该方法重复性较好。对CDV感染宿主细胞前后的ISG15和IFIT2 mRNA表达水平进行检测,发现CDV感染后ISG15和IFIT2的表达量升高,表明ISG15和IFIT2在CDV感染过程中发挥重要作用。该结果为针对CDV与干扰素抗病毒研究的开展提供重要的技术手段,并为进一步揭示CDV致病的分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 犬瘟热病毒 干扰素刺激基因 ISG15 ifit2 荧光定量PCR
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抗伪狂犬病病毒干扰素刺激基因的筛选及IFIT3抗病毒活性的鉴定 被引量:1
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作者 张华伟 李连峰 +2 位作者 周末 杨玉莹 仇华吉 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期338-344,共7页
为研究抗伪狂犬病病毒(PRV)特异性的干扰素刺激基因(ISGs),本研究采用与表达增强型绿色荧光蛋白报告病毒相结合的高内涵筛选系统对具有抗病毒功能的10种ISGs进行筛选,之后利用过表达细胞系、间接免疫荧光(IFA)和qRT-PCR试验对显著抑制PR... 为研究抗伪狂犬病病毒(PRV)特异性的干扰素刺激基因(ISGs),本研究采用与表达增强型绿色荧光蛋白报告病毒相结合的高内涵筛选系统对具有抗病毒功能的10种ISGs进行筛选,之后利用过表达细胞系、间接免疫荧光(IFA)和qRT-PCR试验对显著抑制PRV复制的IFIT3(<0.01)进行抗病毒活性验证,通过qRT-PCR检测了PRV感染的猪肺泡巨噬细胞(PAM)和PRV感染猪的外周血单核细胞(PBMC)中IFIT3mRNA的转录水平。高内涵筛选结果显示,5种潜在的抗PRVISGs分子(IFIT3、ISG15、GBP2、Mx1和ISG20)对PRV的复制具有显著的抑制作用,其中IFIT3效果最显著;IFA和qRT-PCR试验结果显示,在PK-15细胞和PAM中,过表达IFIT3均可以显著降低PRV-TJ株的病毒滴度和基因组拷贝数;qRT-PCR试验结果显示,在PRV感染的PAM和PBMC中,IFIT3mRNA的转录水平均显著上调。流式细胞术试验表明过表达IFIT3不影响PK-15细胞凋亡,推测IFIT3可能存在其它的抗病毒机制。本研究筛选到5种潜在的抗PRVISGs并证实IFIT3是一种抗PRV的ISG,为抗PRVISGs的相关研究,特别是猪源IFIT3抗病毒机制的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 ISGs ifit3 抗病毒效应
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干扰素诱导的四肽重复序列(IFIT)基因家族蛋白抗病毒作用机制研究进展 被引量:4
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作者 许凡 党文 +1 位作者 田宏 郑海学 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1666-1672,共7页
机体在病毒感染后激活自身先天性免疫反应,表达大量干扰素(interferon, IFN),这些干扰素进一步激活JAK-STAT通路,从而诱导表达一类干扰素刺激基因(IFN stimulated genes, ISGs),干扰素诱导的四肽重复序列(interferon-induced proteins w... 机体在病毒感染后激活自身先天性免疫反应,表达大量干扰素(interferon, IFN),这些干扰素进一步激活JAK-STAT通路,从而诱导表达一类干扰素刺激基因(IFN stimulated genes, ISGs),干扰素诱导的四肽重复序列(interferon-induced proteins with tetratricopeptide repeats, IFIT)基因家族就是其中之一。IFIT基因家族蛋白可通过抑制病毒基因组复制和蛋白转录来发挥抗病毒活性,在保护宿主细胞正常生长、发育、代谢和繁殖方面发挥重要功能。本研究就目前IFIT基因家族的基因结构、蛋白特征和抗病毒作用机制的研究进展进行总结,为后续深入研究IFIT基因家族天然免疫机制,制定更加科学有效的思路提供参考。 展开更多
关键词 天然免疫 干扰素 ifit基因家族
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