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瘢痕疙瘩发病与成纤维细胞异质性基因相关:基于GEO数据库单细胞转录组分析
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作者 郭涛 刘昱昕 +1 位作者 闫美荣 王晓妮 《中国组织工程研究》 北大核心 2026年第24期6390-6399,共10页
背景:瘢痕疙瘩是一种由成纤维细胞异常活化和免疫调控失衡共同驱动的慢性皮肤纤维化疾病,其分子机制仍未完全阐明。随着单细胞转录组技术的发展,利用公开数据库进行系统生物信息学分析,有助于识别新的诊断标志物与治疗靶点。目的:探讨... 背景:瘢痕疙瘩是一种由成纤维细胞异常活化和免疫调控失衡共同驱动的慢性皮肤纤维化疾病,其分子机制仍未完全阐明。随着单细胞转录组技术的发展,利用公开数据库进行系统生物信息学分析,有助于识别新的诊断标志物与治疗靶点。目的:探讨瘢痕疙瘩发病机制中与成纤维细胞异质性及免疫调控相关的关键标志物。方法:从GEO公共数据库获取瘢痕疙瘩成纤维细胞的单细胞转录组数据集GSE181297、GSE14572进行系统生物信息学分析。首先对细胞亚群进行注释,并分析各细胞类型的频率变化,结合拟时序分析推测不同细胞的分化轨迹。基于转录组数据,构建加权基因共表达网络并筛选差异表达基因,进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,明确其参与的关键生物过程和信号通路。利用蛋白质互作网络识别候选核心基因,进一步联合3种机器学习算法筛选潜在关键标志物,并通过受试者工作特征曲线评估其诊断效能。同时,评估核心基因在免疫细胞中的表达模式及相关性。结果与结论:①单细胞转录组分析揭示瘢痕疙瘩组织中内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞、T细胞、肥大细胞、巨噬细胞及淋巴管内皮细胞的比例显著升高,其中成纤维细胞为主要细胞类型;②拟时序分析显示成纤维细胞主要分布于状态1、状态2及状态3,处于分化起始阶段,具有较高的发育潜力;③通过差异分析共获得80个与成纤维细胞相关的差异表达基因,主要富集于区域化、骨骼系统形态发生及胚胎骨骼发育等通路;④整合蛋白质互作网络与多种机器学习模型,最终筛选出HOXC4作为关键标志物;受试者工作特征曲线分析表明HOXC4具有良好的诊断性能,且在瘢痕疙瘩患者组织中高表达;⑤相关性分析显示HOXC4与静息自然杀伤细胞呈显著正相关,而与活化树突状细胞和活化自然杀伤细胞呈显著负相关。此研究系统性地揭示了瘢痕疙瘩成纤维细胞的异质性特征及其与免疫微环境的关联,HOXC4被确定为与成纤维细胞功能状态及免疫调控相关的关键标志物,为瘢痕疙瘩的早期诊断和靶向治疗提供了潜在的新靶点。 展开更多
关键词 瘢痕疙瘩 单细胞转录组 成纤维细胞 HOXC4 诊断标志物 免疫调控
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长链非编码RNA HOXC13-AS在头颈鳞状细胞癌中的表达及对增殖和迁移的影响
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作者 王丹 马小丫 +1 位作者 赵佳宁 赵明 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 2025年第9期551-556,共6页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)HOXC13-AS在头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)组织中的表达,并在头颈肿瘤细胞系中探讨其对肿瘤细胞增殖和迁移的影响。方法收集2024年3~12月于吉林大学第二医院收治并进行手... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)HOXC13-AS在头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)组织中的表达,并在头颈肿瘤细胞系中探讨其对肿瘤细胞增殖和迁移的影响。方法收集2024年3~12月于吉林大学第二医院收治并进行手术治疗的26例喉鳞状细胞癌和4例下咽鳞状细胞癌患者的临床样本作为研究对象。选取HNSCC及对应癌旁组织标本,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测HOXC13-AS在30例HNSCC组织及对应癌旁组织中的表达;收集临床资料,分析HOXC13-AS表达与各种临床病理的相关性;利用siRNA技术干扰HOXC13-AS在喉癌细胞系TU212及咽鳞状细胞癌细胞系FaDu中的表达,采用细胞计数试剂盒(CCK-8)实验检测细胞增殖能力,细胞划痕实验检测细胞迁移能力。结果HNSCC组织中lncRNA HOXC13-AS表达量(12.60±11.26)显著高于对应癌旁组织(1.40±0.61),差异有统计学意义(t=5.485,P<0.001)。HNSCC组织中HOXC13-AS的表达与患者T分级、淋巴结转移及临床分期密切相关;CCK-8结果显示,TU212细胞系各组在24、48、72 h的吸光度值分别为si-NC组(0.373±0.010、0.738±0.026、1.003±0.124),si-HOXC13-AS-1组(0.365±0.015、0.686±0.019、0.935±0.028)和si-HOXC13-AS-2组(0.364±0.024、0.700±0.026、0.943±0.053),差异有统计学意义(F_(24 h)=0.484、F_(48 h)=7.893、F 72 h=1.345,P<0.01);FaDu细胞系各组在24、48、72 h的吸光度值分别为si-NC组(0.727±0.054、0.834±0.072、1.224±0.127),si-HOXC13-AS-1组(0.532±0.005、0.650±0.079、1.021±0.044)和si-HOXC13-AS-2组(0.647±0.088、0.687±0.025、1.074±0.055),差异有统计学意义(F_(24 h)=16.143,F_(48 h)=14.259,F 72 h=9.409,P均<0.001)。细胞划痕实验结果显示,TU212细胞系各组在12、24 h的迁移率分别为si-NC组(38.971%±3.824%、69.185%±0.469%),si-HOXC13-AS-1组(18.182%±2.580%、33.378%±2.302%)和si-HOXC13-AS-2组(25.017%±0.288%、48.413%±0.805%),差异有统计学意义(F_(12 h)=47.295,F_(24 h)=471.745,P均<0.0001);FaDu细胞系各组在12、24 h的迁移率分别为si-NC组(39.067%±3.196%、58.222%±0.448%),si-HOXC13-AS-1组(13.689%±0.132%、39.358%±3.985%)和si-HOXC13-AS-2组(23.335%±0.680%、35.526%±0.758%),差异有统计学意义(F_(12 h)=138.1,F_(24 h)=101.749,P均<0.0001)。结论HOXC13-AS在HNSCC组织和细胞中表达显著上调,且与患者的临床病理特征相关。沉默HOXC13-AS可显著抑制头颈肿瘤细胞的增殖和迁移。 展开更多
关键词 头颈部肿瘤 鳞状细胞 细胞增殖 细胞迁移分析 长链非编码RNA HOXC13-AS
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HOXC6对乳腺癌细胞他莫昔芬敏感性及增殖的影响 被引量:1
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作者 周雅卿 王玄烨 +3 位作者 杨雪灯 王淑慧 赵永林 管海涛 《临床医学研究与实践》 2025年第23期17-20,共4页
目的探讨HOXC6对乳腺癌细胞他莫昔芬(TAM)敏感性及增殖的影响。方法通过梯度浓度短时间诱导法建立对他莫昔芬耐药(TAMR)乳腺癌细胞株,检测TAMR细胞中HOXC6的表达情况,采用小干扰RNA(shRNA)技术敲低HOXC6表达,检测敲低HOXC6后TAMR细胞增... 目的探讨HOXC6对乳腺癌细胞他莫昔芬(TAM)敏感性及增殖的影响。方法通过梯度浓度短时间诱导法建立对他莫昔芬耐药(TAMR)乳腺癌细胞株,检测TAMR细胞中HOXC6的表达情况,采用小干扰RNA(shRNA)技术敲低HOXC6表达,检测敲低HOXC6后TAMR细胞增殖、雌激素受体(ER)表达及其对TAM敏感性的变化。结果TAMR细胞中HOXC6表达显著升高,敲低HOXC6表达可抑制TAMR细胞增殖的同时上调ER表达使TAMR细胞恢复对TAM的敏感性。结论乳腺癌细胞对TAM的耐药与HOXC6表达上调相关,HOXC6表达上调可以促进TAMR细胞的增殖,HOXC6可能是一个乳腺癌TAM治疗耐药后的潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 乳腺癌 他莫昔芬 HOXC6
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HOXC6在前列腺癌中表达及意义的临床病理分析
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作者 胡小雪 王磊 +4 位作者 徐晓 蒋梦凡 张亚平 蒋政廷 杨家佳 《诊断病理学杂志》 2025年第7期838-843,共6页
目的本研究旨在探讨同源框C6(HOXC6)在前列腺癌中的表达水平及其与患者临床病理特征的关系。方法运用GEPIA数据库预测HOXC6在前列腺癌组织和正常前列腺组织中的表达水平差异,并探讨了差异对患者预后的影响。收集扬州大学附属医院2021年... 目的本研究旨在探讨同源框C6(HOXC6)在前列腺癌中的表达水平及其与患者临床病理特征的关系。方法运用GEPIA数据库预测HOXC6在前列腺癌组织和正常前列腺组织中的表达水平差异,并探讨了差异对患者预后的影响。收集扬州大学附属医院2021年1月至2023年9月行前列腺癌根治术治疗的83例前列腺癌患者的癌组织及对应的癌旁组织标本,通过免疫组织化学染色技术(IHC)检测了HOXC6蛋白在前列腺癌组织和癌旁组织的表达水平,并探讨HOXC6的表达水平与前列腺癌患者临床病理特征之间的相关性。结果数据库预测结果显示,HOXC6在前列腺癌组织中的表达水平较正常前列腺组织显著升高,且HOXC6高表达组的患者生存率较低于低表达组的患者(P<0.05)。免疫组化染色结果提示,HOXC6在前列腺癌细胞中主要表达于细胞质,在前列腺癌组织中,HOXC6的表达水平显著高于癌旁组织,且差异有统计学意义(P<0.001);在对不同年龄组、是否存在排尿疼痛、脉管侵犯、神经侵犯以及TNM分期的前列腺癌患者中HOXC6表达水平比较后发现,差异无统计学意义(P>0.05);不同肿瘤体积、分化程度、pT分期、淋巴结转移情况、PSA水平及Gleason分级的患者HOXC6表达比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论HOXC6在前列腺癌患者肿瘤组织中呈高表达,且HOXC6高表达的患者总体预后较差,提示HOXC6可作为前列腺癌诊疗的一项潜在生物标志物。 展开更多
关键词 前列腺癌 HOXC6 临床病理特征 表达意义
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HOXC6-TIMELESS axis:Unveiling novel therapeutic strategies in bladder cancer
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作者 Meng-Meng Shi Ming-Yue Guan +4 位作者 Shi Li Jie-Yu Guo Xing-Zhen Chen Jing-Feng Tang Ce-Fan Zhou 《World Journal of Clinical Oncology》 2025年第7期292-295,共4页
Bladder cancer(BLCA)is a highly invasive malignancy with limited targeted therapies.Lu et al reveal the oncogenic role of HOXC6 in BLCA by showing its elevated mRNA and protein levels in cancerous tissues.Silencing HO... Bladder cancer(BLCA)is a highly invasive malignancy with limited targeted therapies.Lu et al reveal the oncogenic role of HOXC6 in BLCA by showing its elevated mRNA and protein levels in cancerous tissues.Silencing HOXC6 sig-nificantly inhibits BLCA cell proliferation,migration and invasion,induces apo-ptosis and arrests the cell cycle at G0/G1.In addition,HOXC6 also regulates pa-thways related to chemical carcinogenesis and reactive oxygen species,with a strong association with the target gene TIMELESS,supported by binding signals in its promoter region.Here,we discuss the role of HOXC6 as a potential bio-marker and therapeutic target,contributing to a deeper understanding of the HOXC6-TIMELESS axis and its implications for advancing BLCA research and therapy. 展开更多
关键词 Bladder cancer HOXC6 Gene regulation TIMELESS Targeted therapy Molecular oncology
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血清HOXC9和甲胎蛋白在早期肝癌中表达及临床意义
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作者 孙正路 王航宇 张艳停 《山西卫生健康职业学院学报》 2025年第5期11-13,共3页
目的:探讨血清HOXC9和甲胎蛋白(AFP)在早期肝癌中表达与临床病理特征及预后的关系。方法:选取早期肝癌患者64例纳入研究组,选取同时期在某院进行体检的健康志愿者30例纳入对照组,采用酶联免疫吸附法检测血清HOXC9、AFP水平,统计2组血清H... 目的:探讨血清HOXC9和甲胎蛋白(AFP)在早期肝癌中表达与临床病理特征及预后的关系。方法:选取早期肝癌患者64例纳入研究组,选取同时期在某院进行体检的健康志愿者30例纳入对照组,采用酶联免疫吸附法检测血清HOXC9、AFP水平,统计2组血清HOXC9和AFP水平,并分析血清HOXC9和AFP水平与临床病理特征及预后的关系。结果:研究组血清HOXC9和AFP水平均高于对照组;血清HOXC9和AFP水平与早期肝癌患者肿瘤个数、Child-Pugh分级、肿瘤直径、门静脉癌栓、淋巴结转移有关;HOXC9高表达组生存率低于HOXC9低表达组,AFP高表达组生存率低于AFP低表达组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:高血清HOXC9和AFP水平与肿瘤个数多、Child-Pugh分级B级、肿瘤直径大、门静脉癌栓、淋巴结转移等不良预后因素紧密相关,可作为早期肝癌患者预后评估和个体化治疗的重要参考指标。 展开更多
关键词 早期肝癌 HOXC9 甲胎蛋白 临床病理特征 预后
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lncRNA XIST通过调控miR-337-3p/HOXC8轴促进胃癌的发展进程 被引量:15
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作者 徐龙健 高建超 +4 位作者 郑景珍 赵志娟 钟轩 孙敬国 李东坤 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1134-1141,共8页
目的:探讨lncRNA XIST(XIST)通过调控miR-337-3p/HOXC8分子轴介导胃癌发展进程的分子机制。方法:选取2013年3月至2018年1月河北省唐山市开滦总医院普通外科手术切除的58例胃癌组织和对应的癌旁组织标本,以及人胃癌细胞系AGS、MGC803、HG... 目的:探讨lncRNA XIST(XIST)通过调控miR-337-3p/HOXC8分子轴介导胃癌发展进程的分子机制。方法:选取2013年3月至2018年1月河北省唐山市开滦总医院普通外科手术切除的58例胃癌组织和对应的癌旁组织标本,以及人胃癌细胞系AGS、MGC803、HGC27和人胃黏膜细胞GES-1,用qPCR检测胃癌组织和细胞系中XIST和miR-337-3p的表达水平。将XIST敲降载体、miR-337-3p mimics/inhibitor和HOXC8过表达载体转染进AGS细胞,用CCK-8、Transwell实验检测AGS细胞的增殖及侵袭能力,用WB检测HOXC8及上皮钙黏蛋白(E-cadherin)、神经钙黏蛋白(N-cadherin)和波形蛋白(vimentin)的表达水平。用双荧光素酶报告基因验证XIST、miR-337-3p和HOXC8的靶向关系。结果:XIST在胃癌组织和细胞系中高表达(均P<0.01)。敲降XIST显著抑制AGS细胞的增殖、侵袭和EMT(P<0.05或P<0.01)。XIST靶向作用miR-337-3p并下调其表达,HOXC8是miR-337-3p的靶基因。敲降XIST通过靶向上调miR-337-3p对HOXC8表达的抑制作用,从而抑制AGS细胞增殖、侵袭和EMT(P<0.05或P<0.01)。结论:敲降XIST可抑制AGS细胞增殖、侵袭和EMT,其作用机制是通过靶向miR-337-3p并下调HOXC8的表达。 展开更多
关键词 胃癌 AGS细胞 增殖 上皮间质转化 lncRNAXIST miR-337-3p HOXC8
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Hoxc13在毛囊发育中的作用 被引量:13
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作者 吴江鸿 闫祖威 +2 位作者 胡斯乐 张文广 李金泉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期656-662,共7页
Hoxc13属于Hox(Homobox)基因家族Abd-B类成员之一,与毛囊形成和毛发生长密切相关。毛发结构蛋白KP(角蛋白)和KAP(角蛋白关联蛋白)的表达都受Hoxc13的严格调控,Hoxc13表达水平会直接影响毛发的特性,对维持毛囊的正常形态也至关重要。文章... Hoxc13属于Hox(Homobox)基因家族Abd-B类成员之一,与毛囊形成和毛发生长密切相关。毛发结构蛋白KP(角蛋白)和KAP(角蛋白关联蛋白)的表达都受Hoxc13的严格调控,Hoxc13表达水平会直接影响毛发的特性,对维持毛囊的正常形态也至关重要。文章就Hoxc13的表达水平对毛囊发育和毛发生长的影响及Hoxc13与相关基因的调控进行了综述。 展开更多
关键词 Hoxc13 毛囊 角蛋白/角蛋白关联蛋白 基因通路
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羊绒生长期、休止期陕北白绒山羊皮肤组织中KAP9.2和Hoxc13基因的表达 被引量:12
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作者 赵志东 徐华荣 +2 位作者 屈雷 杨莹 王昕 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2012年第9期24-28,共5页
【目的】研究角蛋白相关蛋白9.2基因(KAP9.2)和Hoxc13基因在羊绒生长不同阶段皮肤组织中的表达量对产绒量的影响,为羊绒生长的调控机理研究奠定基础。【方法】以陕北白绒山羊为研究对象,以奶山羊作为对照,利用qRT-PCR方法,检测羊绒生长... 【目的】研究角蛋白相关蛋白9.2基因(KAP9.2)和Hoxc13基因在羊绒生长不同阶段皮肤组织中的表达量对产绒量的影响,为羊绒生长的调控机理研究奠定基础。【方法】以陕北白绒山羊为研究对象,以奶山羊作为对照,利用qRT-PCR方法,检测羊绒生长期和休止期高产、低产绒量陕北白绒山羊皮肤组织中KAP9.2和Hoxc13基因的表达量。【结果】对于KAP9.2基因,在羊绒生长期高产绒量陕北白绒山羊的相对表达量极显著低于低产绒量陕北白绒山羊(P<0.01),而在羊绒休止期高产绒量陕北白绒山羊的相对表达量却显著高于低产绒量陕北白绒山羊和奶山羊(P<0.05);对于Hoxc13基因,在羊绒休止期高产和低产绒量陕北白绒山羊的相对表达量极显著高于奶山羊(P<0.01)。高产和低产绒量陕北白绒山羊皮肤组织中KAP9.2和Hoxc13基因在生长期、休止期平均相对表达量的变化趋势相似,均表现为生长期极显著低于休止期(P<0.01)。【结论】KAP9.2对绒毛生长有抑制作用;Hoxc13对KAP9.2基因的表达可能具有调控作用。 展开更多
关键词 羊绒 KAP9.2 Hoxc13 生长期 休止期 陕北白绒山羊
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人类巨细胞病毒感染对淋巴系祖细胞增殖过程中Hoxc4及Hoxc6基因表达的影响 被引量:6
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作者 冯静乔 刘文君 +3 位作者 陈红英 郭渠莲 陈艾 陈书琴 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2009年第1期141-145,共5页
本研究探讨人类脐血造血干细胞(HSC)向淋巴系祖细胞(CFU-TL)分化过程中hoxc4、hoxc6基因表达的情况,并且用人类巨细胞病毒(HCMV)和/或全反式维甲酸(ATRA)进行干扰,在基因水平探讨HCMV感染导致脐血CFU-TL损伤的机制。采用体外定向培养CFU... 本研究探讨人类脐血造血干细胞(HSC)向淋巴系祖细胞(CFU-TL)分化过程中hoxc4、hoxc6基因表达的情况,并且用人类巨细胞病毒(HCMV)和/或全反式维甲酸(ATRA)进行干扰,在基因水平探讨HCMV感染导致脐血CFU-TL损伤的机制。采用体外定向培养CFU-TL,经MTT法检测后,应用荧光定量RT-PCR技术检测经人HCMV和/或ATRA处理的人脐血CFU-TL中hoxc4、hoxc6基因的mRNA表达水平。HCMV-AD169滴度为106蚀斑形成单位(PFU)/ml,按0.1ml105PFU/ml接种培养体系。结果表明:正常对照组、病毒处理组、维甲酸处理组hoxc4、hoxc6基因均在增殖分化的第3天少量表达,第7天表达最强烈(p<0.05),第12天表达明显下降。各组中hoxc4基因表达量高于hoxc6组(p<0.05)。与正常对照组比较,维甲酸组(6×10-8mol/L)的hoxc4、hoxc6基因表达上调(p<0.05),而病毒处理组hoxc4、hoxc6基因表达下调(p<0.05)。结论:hoxc4与hoxc6基因在脐血CFU-TL中各组呈现规律的表达,提示hoxc4、hoxc6均与淋巴系造血有密切的相关性。HCMV能使hoxc4、hoxc6基因表达下调,提示HCMV致造血细胞损害可能与hoxc4、hoxc6基因表达异常有关。ATRA能显著上调hoxc4、hoxc6基因的表达。 展开更多
关键词 巨细胞病毒 淋巴系祖细胞 全反式维甲酸 HOX基因 hoxc4基因 hoxc6基因
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HOXC6、HOXC8基因对食管鳞癌细胞凋亡的影响及在接受手术切除食管鳞癌患者中的临床意义 被引量:4
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作者 杜雅冰 靳水玲 +7 位作者 崔抗 罗真真 闫书妹 李莉 朱旭超 王帅 张腾飞 马望 《中国肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期535-542,共8页
[目的]通过靶向敲低HOXC6和HOXC8基因,研究HOXC6和HOXC8表达对食管鳞癌细胞增殖水平、克隆形成能力、细胞周期分布及细胞凋亡等生物学特性的影响,探讨HOXC6和HOXC8对食管鳞癌细胞凋亡的调控以及HOXC6和HOXC8表达在手术切除的食管鳞癌患... [目的]通过靶向敲低HOXC6和HOXC8基因,研究HOXC6和HOXC8表达对食管鳞癌细胞增殖水平、克隆形成能力、细胞周期分布及细胞凋亡等生物学特性的影响,探讨HOXC6和HOXC8对食管鳞癌细胞凋亡的调控以及HOXC6和HOXC8表达在手术切除的食管鳞癌患者中的临床意义。[方法]收集145例接受手术切除的食管鳞癌患者的癌组织标本进行HOXC6和HOXC8表达免疫组化检测,并和患者的总生存期(overall survival,OS)进行相关性分析。细胞实验中,构建敲低HOXC6和HOXC8的慢病毒表达载体(pGLV3-shHOXC6和pGLV3-shHOXC8),转染食管鳞癌细胞株ECA109,分别采用Real-time PCR和Western blot方法检测HOXC6和HOXC8基因的敲低效率。分别采用CCK8法和软琼脂克隆形成实验检测敲低HOXC6和HOXC8基因表达后对ECA109细胞增殖的影响。采用流式细胞仪检测敲低HOXC6和HOXC8基因表达后对ECA109细胞周期分布及细胞凋亡的影响。[结果] HOXC6和HOXC8高表达和低表达患者的预后具有显著差异。HOXC6高表达和低表达患者的中位OS分别为38.5和81.3个月,差异具有显著的统计学意义(P=0.001)。HOXC8高表达和低表达患者的中位OS分别为34.6和114.4个月,差异同样具有显著的统计学意义(P<0.001)。另外,细胞实验表明:转染shRNA可显著下调ECA109细胞中HOXC6和HOXC8 mRNA和蛋白表达水平。CCK8结果显示干扰组(HOXC6 shRNA或HOXC8 shRNA)的细胞生存率较对照组明显下降(P<0.05);克隆形成实验显示干扰组细胞克隆形成能力较对照组明显降低;流式细胞仪检测结果显示干扰组出现明显的G1细胞周期阻滞,且干扰组细胞凋亡率明显高于对照组。[结论] HOXC6和HOXC8高表达对食管鳞癌患者预后有不良影响。敲低HOXC6和HOXC8基因可促进食管鳞癌细胞株ECA109凋亡。靶向调控HOXC6和HOXC8可能抑制食管鳞癌的发生与发展。 展开更多
关键词 食管鳞癌 HOXC6 HOXC8 预后 凋亡
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西藏绒山羊WNT4和HOXC13基因对绒毛纤维直径性状的遗传效应分析 被引量:8
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作者 吴玉江 付雪峰 +5 位作者 索朗达 巴贵 德吉 次仁德吉 宋天增 田可川 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第2期497-505,共9页
试验旨在探索WNT 4和HOXC13基因多态性及其对西藏绒山羊绒毛纤维直径性状的影响,寻找与西藏绒山羊绒毛纤维直径性状相关的分子标记。以380只1岁西藏绒山羊群体为研究对象,利用混池DNA直接测序法检测WNT 4和HOXC 13基因的SNP,利用飞行时... 试验旨在探索WNT 4和HOXC13基因多态性及其对西藏绒山羊绒毛纤维直径性状的影响,寻找与西藏绒山羊绒毛纤维直径性状相关的分子标记。以380只1岁西藏绒山羊群体为研究对象,利用混池DNA直接测序法检测WNT 4和HOXC 13基因的SNP,利用飞行时间质谱技术对SNP分型,利用SAS 9.1软件中最小二乘方差模型对SNP位点与绒毛平均纤维直径、纤维直径标准差、纤维直径变异系数进行关联分析。结果表明,WNT 4基因第3外显子区域检测到2个SNPs位点(SNP1和SNP2),HOXC 13基因第2外显子区域检测到2个SNPs位点(SNP3和SNP4),均处于中度多态(0.25<PIC<0.50)。χ2检验表明,群体中WNT 4基因的SNP1和SNP2位点均处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。关联分析结果表明,4个SNPs位点均与平均纤维直径呈极显著相关(P<0.01),SNP2和SNP3与纤维直径标准差呈极显著相关(P<0.01),SNP2与纤维直径变异系数呈极显著相关(P<0.01)。综上,WNT 4和HOXC 13基因对西藏绒山羊绒毛纤维直径有显著影响,可以尝试将其SNPs位点作为影响西藏绒山羊绒毛纤维直径的分子标记之一,为超细型西藏绒山羊选育工作提供理论依据。 展开更多
关键词 西藏绒山羊 WNT4基因 HOXC13基因 纤维直径 SNP 遗传效应
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多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1甲基化分析 被引量:11
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作者 陈琦 赵静 +1 位作者 张立岭 马月辉 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2009年第23期10-14,共5页
研究旨在探索多脊椎蒙古羊多脊椎性状与Hoxc8 exon-1的甲基化比例是否可以成为多脊椎蒙古羊早期选种的DNA分子标记。克隆多脊椎蒙古羊(14个胸椎)和正常蒙古羊(13个胸椎)的Hoxc8 exon-1,超声波破碎基因组DNA并变性。用5-甲基胞嘧啶抗体... 研究旨在探索多脊椎蒙古羊多脊椎性状与Hoxc8 exon-1的甲基化比例是否可以成为多脊椎蒙古羊早期选种的DNA分子标记。克隆多脊椎蒙古羊(14个胸椎)和正常蒙古羊(13个胸椎)的Hoxc8 exon-1,超声波破碎基因组DNA并变性。用5-甲基胞嘧啶抗体做选择性免疫反应,经抗体结合磁珠免疫沉淀,分离纯化甲基化DNA。设计2对多脊椎蒙古羊Hoxc8exon-1引物进行实时定量PCR,分别分析免疫沉淀后的甲基化DNA浓度。引物P2扩增,6只多脊椎蒙古羊和4只正常蒙古羊样本校正后的甲基化DNA浓度分别为11.50%、11.00%、5.28%、4.49%、2.89%、2.41%和1.20%、0.60%、0.35%、0.03%,两实验组差异显著(P<0.05)。引物P1扩增,两实验组甲基化DNA浓度差异不显著(P>0.05)。P2引物扩增Hoxc8exon-1的甲基化DNA浓度可以作为多脊椎蒙古羊早期选种的DNA分子标记。 展开更多
关键词 Hoxc8 exon-1 MeDIP—qPCR DNA甲基化 多脊椎蒙古羊
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实时荧光PCR检测动物源性基因鉴定地沟油 被引量:14
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作者 杨永存 杨冬燕 +3 位作者 李浩 张倩 吴双 邓平建 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2013年第18期3514-3517,共4页
目的寻找一个多种动物基因组共有的基因片段作为地沟油鉴定的特异性指标,建立准确、特异、快速的地沟油鉴定方法。方法通过多个数据库的比对分析筛选出靶标基因片段,采用实时荧光PCR方法,以常见动植物组织、正常食用植物油以及6份地沟... 目的寻找一个多种动物基因组共有的基因片段作为地沟油鉴定的特异性指标,建立准确、特异、快速的地沟油鉴定方法。方法通过多个数据库的比对分析筛选出靶标基因片段,采用实时荧光PCR方法,以常见动植物组织、正常食用植物油以及6份地沟油作为验证样品对新建方法的特异性、灵敏度以及在地沟油鉴定中的适用性进行验证。结果筛选得到的HOXC5基因片段在7种动物组织中均有扩增,而在11种植物组织中均没有扩增;此外,8份正常食用植物油样品中均被鉴定为阴性,而6份地沟油样品均被鉴定为阳性。结论筛选出的基因片段具有动物组织特异性,新建方法能够正确区分正常食用植物油和地沟油样品,其检测灵敏度与使用物种特异性动物基因作为检测靶标的方法相当。 展开更多
关键词 地沟油 HOXC5基因 实时荧光PCR
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胃癌组织中HOXC10表达与临床病理特征及预后关系的研究 被引量:3
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作者 李竟长 罗运生 +6 位作者 张志红 李敏 卫青青 黄成 石周 黄文强 倪秉强 《国际消化病杂志》 CAS 2020年第2期119-124,共6页
目的探讨胃癌组织中HOXC10表达水平与患者临床病理特征及预后的关系。方法采用荧光定量PCR和免疫组织化学法分别检测20对胃癌组织及相应癌旁组织和264例患者胃癌病理切片中HOXC10的表达水平,采用χ^2检验分析胃癌组织中HOXC10的表达水... 目的探讨胃癌组织中HOXC10表达水平与患者临床病理特征及预后的关系。方法采用荧光定量PCR和免疫组织化学法分别检测20对胃癌组织及相应癌旁组织和264例患者胃癌病理切片中HOXC10的表达水平,采用χ^2检验分析胃癌组织中HOXC10的表达水平与患者临床病理特征的关系。采用单因素、多因素Cox回归分析评估HOXC10表达水平与无复发生存期(RFS)、总生存期(OS)的关系。用二元Logistic回归分析建立预测患者5年内复发或死亡风险的模型。结果与HOXC10高表达组相比,HOXC10低表达组的RFS和OS更长(P<0.05),病理分化程度更好(P=0.001),淋巴结转移更少(P=0.001),TNM分期更早(P=0.001)。单因素Cox回归分析显示,病理分级、Lauren分型、TNM分期、T分期、N分期及HOXC10表达水平均与RFS及OS显著相关(P<0.05);多因素Cox回归分析显示,病理分级、Lauren分型、TNM分期、T分期、N分期及HOXC10表达水平均与RFS及OS显著相关(P<0.05)。基于传统临床病理特征参数的Logistic回归模型与基于HOXC10参数的Logistic回归模型对胃癌患者术后5年内复发或死亡风险的预测效果差异无统计学意义(P>0.05)。结论HOXC10低表达的胃癌患者的Lauren分型以肠型为主,分化程度较好,TNM分期较早,淋巴结转移较少,预后较好。HOXC10可作为胃癌患者预后的预测指标。在淋巴结转移情况不明时,以HOXC10为参数的Logistic回归模型可辅助预测预后。 展开更多
关键词 胃癌 HOXC10 临床病理特征 预后
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蒙古羊Hoxc8基因甲基化与胸椎数量的关系 被引量:8
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作者 赵静 张立岭 +1 位作者 陈琦 巴图 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第3期5-8,共4页
为了研究蒙古羊Hoxc8基因的甲基化与胸椎数的关系,试验采用亚硫酸氢盐测序PCR方法进行检测。结果表明:蒙古羊的14枚胸椎个体(T14)占26.1%,7枚腰椎个体(L7)占69.5%,其中Hoxc8 exon-1含27个CpG。T13型个体的甲基化CpG分别为6,3,6;T14型个... 为了研究蒙古羊Hoxc8基因的甲基化与胸椎数的关系,试验采用亚硫酸氢盐测序PCR方法进行检测。结果表明:蒙古羊的14枚胸椎个体(T14)占26.1%,7枚腰椎个体(L7)占69.5%,其中Hoxc8 exon-1含27个CpG。T13型个体的甲基化CpG分别为6,3,6;T14型个体的甲基化CpG分别为23,20,21。T13和T14的甲基化比例平均值分别为(18.500±0.064)%和(79.030±0.056)%(P=0.002)。T14蒙古羊Hoxc8 exon-1的甲基化功能区(120~142个碱基)的CpG胞嘧啶全部甲基化,而T13则相反。说明蒙古羊Hoxc8 exon-1甲基化CpG的密度和数量影响Hoxc8基因的表达,并且调控胸椎的发育。 展开更多
关键词 蒙古羊 Hoxc8 exon-1 CpG甲基化 亚硫酸氢盐测序PCR
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同源盒基因HOXC13在牙源性肿瘤中的表达 被引量:2
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作者 洪岩松 王洁 +3 位作者 刘洁 张波 侯琳 钟鸣 《上海口腔医学》 CAS CSCD 2007年第6期587-591,共5页
目的:检测同源盒基因HOXC13 mRNA在牙源性肿瘤中的表达,探讨其发生的意义。方法:采用原位杂交法检测47例成釉细胞瘤(ameloblastoma,AB)(原发29例,复发14例,恶变4例)、3例牙源性钙化囊性瘤(CCOT)、3例成釉细胞纤维瘤(AF)、2例牙源性钙化... 目的:检测同源盒基因HOXC13 mRNA在牙源性肿瘤中的表达,探讨其发生的意义。方法:采用原位杂交法检测47例成釉细胞瘤(ameloblastoma,AB)(原发29例,复发14例,恶变4例)、3例牙源性钙化囊性瘤(CCOT)、3例成釉细胞纤维瘤(AF)、2例牙源性钙化上皮瘤(CEOT)、10例牙源性角化囊性瘤(KCOT)的HOXC13 mRNA水平,同时选取7例正常口腔黏膜上皮作为对照。采用SPSS10.0软件包对数据进行χ2检验。结果:HOXC13 mRNA在AB中的阳性率为97.9%(46/47),CCOT中为100%(3/3),CEOT中为100%(2/2),KCOT上皮中为70.0%(7/10),正常口腔黏膜细胞中为42.9%(3/7),AB、KCOT、正常黏膜3组间差异显著(Ρ=0.001),但角化及颗粒样变退化细胞却为阴性。3例AF均为阴性。结论:牙源性肿瘤的发生、发展与HOXC13的高表达有关,且受其调控。HOXC13 mRNA在牙源性病损上皮中表达有异质性,该基因可促进上皮增殖,阻抑成釉细胞的终末分化,其丢失可导致上皮细胞角化和退变。 展开更多
关键词 牙源性肿瘤 成釉细胞瘤 HOXC13 原位杂交
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京海黄鸡中HOXC10基因表达规律及其生物信息学分析 被引量:2
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作者 张向前 董新龙 +4 位作者 凌姣姣 韩昆鹏 张涛 王金玉 王永娟 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第7期1702-1708,共7页
同源异型盒基因(homeobox genes,HOX)是在酵母乃至人类等几乎所有的真核细胞中均表达的一类基因。为了探究HOXC10基因表达规律及其生物信息学,采用qRT-PCR方法研究HOXC10基因在8周龄京海黄鸡心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌、腿... 同源异型盒基因(homeobox genes,HOX)是在酵母乃至人类等几乎所有的真核细胞中均表达的一类基因。为了探究HOXC10基因表达规律及其生物信息学,采用qRT-PCR方法研究HOXC10基因在8周龄京海黄鸡心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌、腿肌、下丘脑和卵巢组织中的表达规律,检测其在300日龄高、低产组卵巢组织的表达差异,并通过多种在线软件对原鸡HOXC10基因进行生物信息学分析。结果显示,HOXC10基因在京海黄鸡腿肌中表达丰度极显著高于其他组织(P〈0.01),且300日龄高产组中HOXC10基因表达丰度显著低于低产组(P〈0.05)。原鸡HOXC10基因序列与火鸡、野鸽、绿头鸭、人、小鼠、牛、猪、山羊及非洲爪蟾的同源性分别为77.4%、94.8%、98.6%、68.3%、67.9%、66.0%、59.0%、68.1%和79.4%;HOXC10基因共编码354个氨基酸,其中丝氨酸的含量最高,潜在的磷酸化位点有24个,在280~342的氨基酸序列内存在一个同源结构域,蛋白质亚细胞主要定位在细胞核中,且不包含跨膜结构。HOXC10基因在京海黄鸡生长和繁殖的基因调控网络中发挥了重要作用。 展开更多
关键词 HOXC10基因 京海黄鸡 组织表达分析 生物信息学
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胃腺癌中ceRNA网络的构建和miR-204-5p、HOXC8基因的表达及其相关性检测 被引量:3
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作者 王蕾 任凯凯 +5 位作者 马佳康 陈小华 张萌迪 李丹丹 李晓娜 马军 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2019年第5期737-740,共4页
目的:构建胃腺癌竞争性内源RNA(ceRNA)网络,并观察miR-204-5p和HOXC8 mRNA之间的相关性。方法:利用生物信息学方法和TCGA转录组数据库筛选胃腺癌差异基因,构建ceRNA网络,检测了miR-204-5p和HOXC8 mRNA在胃腺癌组织和SGC7901细胞株中的表... 目的:构建胃腺癌竞争性内源RNA(ceRNA)网络,并观察miR-204-5p和HOXC8 mRNA之间的相关性。方法:利用生物信息学方法和TCGA转录组数据库筛选胃腺癌差异基因,构建ceRNA网络,检测了miR-204-5p和HOXC8 mRNA在胃腺癌组织和SGC7901细胞株中的表达,并分析了两基因间的相互关系。结果:成功构建胃腺癌ceRNA网络,miR-204-5p是重要节点基因,并预测到其靶基因HOXC8;在32例胃腺癌中检测到miR-204-5p低表达,HOXC8高表达,两者呈负相关关系;上调胃腺癌SGC7901细胞中miR-204-5p的表达可以抑制HOXC8 mRNA的表达。结论:miR-204-5p和HOXC8可能是潜在的胃腺癌诊断指标,两者可能存在ceRNA调控关系。 展开更多
关键词 胃腺癌 竞争性内源RNA网络 miR-204-5p HOXC8
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内蒙古绒山羊Hoxc9基因克隆与序列分析 被引量:2
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作者 张燕军 李金泉 +6 位作者 尹俊 张文广 王志新 赵艳红 苏蕊 刘志红 王瑞军 《内蒙古农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2014年第1期1-5,共5页
根据GenBank上已发表的Hoxc9基因序列和本实验室前期构建绒山羊cDNA文库中Hoxc9基因部分序列设计引物。利用PCR技术从内蒙古绒山羊血液基因组DNA中扩增了Hoxc9基因,目的基因片段纯化后连接到PMD19-T载体,将鉴定的重组质粒进行测序,测序... 根据GenBank上已发表的Hoxc9基因序列和本实验室前期构建绒山羊cDNA文库中Hoxc9基因部分序列设计引物。利用PCR技术从内蒙古绒山羊血液基因组DNA中扩增了Hoxc9基因,目的基因片段纯化后连接到PMD19-T载体,将鉴定的重组质粒进行测序,测序结果通过与GenBank中序列比对分析,确定扩增序列为Hoxc9基因,将该基因DNA序列提交至GenBank,登录号为DQ873298,DNA序列长为3308bp,cDNA序列长783bp,编码260个氨基酸。在此基础上利用生物信息软件对该序列结构特征进行分析。 展开更多
关键词 绒山羊 Hoxc9 克隆 序列分析
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