牛LncRNA FABP3 AU基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究 被引量：1

1

作者 许晓改 樊冰冰 +3 位作者 余磊 孟聖博 李明 许会芬 《中国畜禽种业》 2025年第3期45-53,共9页

该实验旨在克隆夏南牛脂肪酸结合蛋白3反义非编码长链RNA(Fatty acid-binding protein 3 antisense upstream,lncRNA FABP3 AU)基因的全长序列,并进行生物信息学分析,以探究lncRNA FABP3 AU在不同月龄的夏南牛心脏、脾脏、肺脏、肾脏、... 该实验旨在克隆夏南牛脂肪酸结合蛋白3反义非编码长链RNA(Fatty acid-binding protein 3 antisense upstream,lncRNA FABP3 AU)基因的全长序列,并进行生物信息学分析,以探究lncRNA FABP3 AU在不同月龄的夏南牛心脏、脾脏、肺脏、肾脏、肝脏、回肠、背最长肌、皮下脂肪、瘤胃组织的表达规律。以夏南牛皮下脂肪组织中提取lncRNA FABP3 AU经反转录获得cDNA模板,PCR扩增lncRNA FABP3 AU的全长序列,运用在线软件对lncRNA FABP3 AU进行生物信息学分析;通过实时荧光定量PCR方法分别检测lncRNA FABP3 AU在初生、12月龄和24月龄夏南牛的不同组织中的表达情况。结果表明:lncRNA FABP3 AU全长序列1151 bp,生物信息学分析发现lncRNA FABP3 AU不具有编码能力,主要定位于细胞核中,二级结构中有多个茎环结构。实时荧光定量PCR显示,lncRNA FABP3 AU在新生牛、12月龄、24月龄夏南牛各组织中均有表达,在不同月龄的夏南牛组织中脾脏的表达量显著高于其他组织(P<0.05),24月龄夏南牛肝脏组织中lncRNA FABP3 AU的表达量显著低于新生牛(P<0.05)。可见,实验成功克隆了lncRNA FABP3 AU基因的全长序列,并发现其不具备编码能力,24月龄夏南牛肝脏组织中lncRNA FABP3 AU的表达量显著低于新生牛。 展开更多

关键词 夏南牛 LncRNA fabp3 AU 生物信息学分析 编码能力 组织表达

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安庆六白猪FABP3基因多态性与肉品质性状关联分析

2

作者 刘志成 程询 +2 位作者 沈鹏程 王重龙 胡倩倩 《安徽科技学院学报》 2025年第6期1-8,共8页

为探究脂肪酸结合蛋白-3(Fatty Acid Binding Protein 3,FABP3)基因的多态性及其与肉品质性状的关联,进而在分子水平上指导安庆六白猪的育种工作,本文以52头安庆六白猪为材料,收集肉品质性状数据并提取DNA和RNA,根据FABP3基因序列设计4... 为探究脂肪酸结合蛋白-3(Fatty Acid Binding Protein 3,FABP3)基因的多态性及其与肉品质性状的关联,进而在分子水平上指导安庆六白猪的育种工作,本文以52头安庆六白猪为材料,收集肉品质性状数据并提取DNA和RNA,根据FABP3基因序列设计4对引物进行PCR扩增及测序,运用SnapGene软件分析测序结果,对FABP3基因进行不同基因型与安庆六白猪肌内脂肪含量的关联分析并运用荧光定量PCR对其进行基因表达差异分析。结果表明,FABP3基因存在1个同义突变(c.1626C>G),3个错义突变(c.1781C>T、c.2056G>A、c.2366C>A),统计分析发现,FABP3基因错义突变位点c.2366C>A与肌内脂肪含量显著关联(P<0.05)。该错义突变导致FABP3蛋白第3754位氨基酸残基由丙氨酸(A)突变为谷氨酸(E)。利用荧光定量PCR对FABP3基因c.2366C>A 2种基因型(AA和AC)个体表达量差异分析,发现该突变位点2种基因型个体间基因表达量差异显著,表明该错义突变位点可能通过影响蛋白功能来调控肌内脂肪含量。由此可见,FABP3基因中有1个位点与肌内脂肪含量关联显著,可以作为肉品质性状的候选基因功能位点,为后期培育拥有优良肉品质的安庆六白猪提供了理论依据。 展开更多

关键词 安庆六白猪 fabp3 肉品质 关联分析

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黄淮肉羊FABP3基因组织表达及与肉质性状关系

3

作者 李君 宋梦柯 +5 位作者 冯雯雯 李佳琳 韩浩园 施会彬 刘昆 权凯 《河南农业大学学报》 北大核心 2025年第4期635-645,共11页

【目的】对黄淮肉羊FABP3基因克隆、序列分析、组织表达及与肉质性状相关性进行分析,旨在探究FABP3基因与黄淮肉羊肌内脂肪沉积和肉质的关系。【方法】选取3、9、18月龄的黄淮肉羊公羊各3只,采集半腱肌、臂三头肌、股四头肌、背最长肌... 【目的】对黄淮肉羊FABP3基因克隆、序列分析、组织表达及与肉质性状相关性进行分析,旨在探究FABP3基因与黄淮肉羊肌内脂肪沉积和肉质的关系。【方法】选取3、9、18月龄的黄淮肉羊公羊各3只,采集半腱肌、臂三头肌、股四头肌、背最长肌、瘤胃、皮下脂肪、肾脏、脾脏、肝脏、肺脏、睾丸、小肠等组织或器官样品,并测定其肌内脂肪、肌肉脂肪酸和肉品质指标等肉质性状,提取背最长肌RNA,扩增黄淮肉羊FABP3基因编码区序列并用在线软件预测其序列特征;实时荧光定量PCR检测FABP3基因在9月龄各组织或器官和3、9、18月龄背最长肌中的表达水平,通过皮尔逊相关系数分析其与肉质性状的相关性。【结果】黄淮肉羊FABP3基因具有402 bp的编码区序列,共编码133个氨基酸,与山羊的亲缘关系最近。FABP3蛋白无跨膜结构域和信号肽,是一种稳定的亲水性蛋白,有26个潜在磷酸化位点,蛋白结构主要以延伸链(36.48%)和无规卷曲(27.07%)为主,FABP3蛋白与ACSL1、PPARG、PLIN2、GPAM、DGAT1等蛋白存在互作关系。FABP3基因在黄淮肉羊多种组织或器官中均有表达,其中,在肾脏中最高,瘤胃中最低。FABP3基因在不同月龄背最长肌中的mRNA相对表达量在统计学意义上差异不显著。相关性分析结果表明,FABP3基因表达量与花生四烯酸、十三碳酸质量分数和肌肉嫩度呈显著正相关,与肌内脂肪质量分数等其他指标相关性不显著。【结论】FABP3基因在黄淮肉羊肉质调控方面具有重要作用,可作为黄淮肉羊肌内脂肪沉积和肉质调控的重要候选基因。 展开更多

关键词 黄淮肉羊 fabp3基因 肌内脂肪 肌肉脂肪酸 相关性分析

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不同物种FABP3基因编码区及蛋白生物信息学分析 被引量：10

4

作者 高红 彭静 +2 位作者 沈一飞 王颖 徐宁迎 《扬州大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期31-36,共6页

利用生物信息学和比较基因组学方法对猪、小家鼠、褐家鼠、人、黑猩猩、牛、羊、原鸡、热带爪蟾、非洲爪蟾、斑马鱼、粗尾婴猴、东非狒狒、家猫、狗、野马、普通狨等21个物种的FABP3基因编码区及蛋白质进行分析，探究该基因在种内及种... 利用生物信息学和比较基因组学方法对猪、小家鼠、褐家鼠、人、黑猩猩、牛、羊、原鸡、热带爪蟾、非洲爪蟾、斑马鱼、粗尾婴猴、东非狒狒、家猫、狗、野马、普通狨等21个物种的FABP3基因编码区及蛋白质进行分析，探究该基因在种内及种间的遗传分化关系，并全面了解不同物种FABP3蛋白的理化性质、结构、功能位点等。结果表明：21个物种47条编码区共检测到210个多态位点、28种单倍型，不同物种间的核苷酸歧义度、净遗传距离和遗传分化指数的变化范围很大，FABP3基因编码区在种内及种间均存在遗传变异。FABP3蛋白为酸性蛋白，具疏水性，较稳定，是一种定位于细胞质或细胞器（除内质网和线粒体）基质中的非分泌蛋白，其二级结构主要为伊折叠、α-螺旋和自由卷曲。野猪FABP3蛋白的主要结构为10条反平行伊折叠，且有一个重复的＋1拓扑结构包绕着一个配基结合位点，属于Calycin结构超家族。其功能保守区为第7～24位氨基酸，推测其主要功能为结合脂肪酸等疏水性分子或有机阴离子。 展开更多

关键词 不同物种 fabp3基因 编码区 蛋白质 生物信息学分析

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乙酸对奶牛乳腺上皮细胞活力及CD36和FABP3基因表达的影响 被引量：6

5

作者 齐利枝 闫素梅 +2 位作者 生冉 赵艳丽 金鹿 《饲料工业》 北大核心 2013年第11期49-52,共4页

试验旨在研究在奶牛乳腺上皮细胞培养液中添加不同浓度的乙酸对细胞活力及CD36和FABP3mRNA相对表达量的影响。将传第三代的乳腺上皮细胞悬液接种于细胞培养板上，每孔加入含10％FBS的DMEM／F12培养液，于37℃、5％CO2培养箱培养48h。将... 试验旨在研究在奶牛乳腺上皮细胞培养液中添加不同浓度的乙酸对细胞活力及CD36和FABP3mRNA相对表达量的影响。将传第三代的乳腺上皮细胞悬液接种于细胞培养板上，每孔加入含10％FBS的DMEM／F12培养液，于37℃、5％CO2培养箱培养48h。将培养48h的奶牛乳腺上皮细胞培养孔随机分为1个对照组和5个试验组。每组分别加入含0、4、6、8、10、12mmol／1乙酸的DMEM／F12培养液，并用1g／l无脂肪酸的BSA替代培养液中的FBS，其中0mmol／1为对照组．、结果表明，细胞相对增殖率随着乙酸浓度的增加呈显著的二次曲线增加（P=0．005），以4～8mmol／1乙酸处理组的细胞活力较高。随着乙酸添加浓度的增加，CD36的相对表达量呈显著的一次线性（P=0．011）和二次曲线（P=0．000）降低，以8～12mmol／1乙酸组较低；FABP3的表达量呈显著的一次线性（P=0．001）和二次曲线（P=0．010）增加，以10～12mmol／1乙酸组较高。乳腺上皮细胞活力与乙酸浓度呈显著的剂量依赖关系，低浓度的乙酸可促进奶牛乳腺上皮细胞活力，而高浓度则表现出抑制作用．不同浓度的乙酸处理组均下调了CD36mRNA相对表达量，上调了FABP3mRNA表达量。 展开更多

关键词 乙酸 乳腺上皮细胞 细胞活力 fabp3 CD36 奶牛

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营养水平对杂交肉牛FABP3基因表达及IMF的影响 被引量：3

6

作者 朱晓岩 王建国 +4 位作者 杨连玉 秦贵信 张辉 王哲 刘国文 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1781-1786,共6页

为研究营养水平对杂交肉牛心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)基因表达及肌内脂肪含量(IMF)的影响,以西门塔尔、利木赞和夏洛莱杂交肉牛为研究对象,利用实时荧光定量PCR技术,分别测定高、中、低营养水平的3种杂交肉牛背部脂肪中FABP3mRNA表达... 为研究营养水平对杂交肉牛心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)基因表达及肌内脂肪含量(IMF)的影响,以西门塔尔、利木赞和夏洛莱杂交肉牛为研究对象,利用实时荧光定量PCR技术,分别测定高、中、低营养水平的3种杂交肉牛背部脂肪中FABP3mRNA表达水平,并测定其背最长肌IMF。结果:(1)高营养组中夏洛莱牛IMF高于同营养组其他2种肉牛,其背部脂肪中FABP3mRNA水平也显著高于另外2种杂交肉牛(P<0.01);中营养组中西门塔尔和利木赞牛IMF均高于同营养组的夏洛莱牛,但FABP3mRNA的水平无显著差异(P>0.05);低营养组中夏洛莱牛IMF和FABP3mRNA水平均显著低于另外2种肉牛(P<0.01);(2)夏洛莱杂交肉牛背部脂肪中FABP3mRNA水平与IMF具有显著的相关性(P<0.05),而西门塔尔和利木赞牛中FABP3mRNA水平与IMF无显著相关性(P>0.05)。该结果表明提高营养水平影响FABP3mRNA表达并在一定程度上影响IMF,但影响显著与否存在品种差异,在肉牛育种和牛肉生产中应当同时考虑营养因素和遗传因素。 展开更多

关键词 杂交牛 fabp3基因 肌内脂肪

原文传递

奶山羊心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)基因启动子的克隆及活性分析 被引量：3

7

作者 姚大为 赵欣 +3 位作者 赵淑颖 杨春蕾 李玉鹏 马毅 《中国饲料》 北大核心 2021年第17期10-15,共6页

心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)是一种15 kDa的蛋白,涉及信号转导途径,参与长链脂肪酸的摄取及利用。本研究采用PCR技术扩增FABP3启动子序列,通过缺失分析构建了5个不同缺失片段荧光素酶报告基因载体,并转染奶山羊乳腺上皮细胞,通过双荧... 心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)是一种15 kDa的蛋白,涉及信号转导途径,参与长链脂肪酸的摄取及利用。本研究采用PCR技术扩增FABP3启动子序列,通过缺失分析构建了5个不同缺失片段荧光素酶报告基因载体,并转染奶山羊乳腺上皮细胞,通过双荧光素酶报告基因系统检测FABP3缺失片段启动子活性。结果表明:从奶山羊基因组中克隆得到2109 bp FABP3基因启动子序列(包括转录起始位点上游1985 bp),与牛(KJ649748.1)、猪(HM591296.1)和人(NG047049.1)的基因组序列同源性分别为90%、80%、75.08%。经转录因子在线软件预测分析发现,该启动子含有潜在的TATA框(TATA-box)、过氧化物酶增殖物激活受体反应元件(PPRE)、肝X受体反应元件(LXRE)、雌激素受体(ER)及两个环磷腺苷效应元件结合蛋白(CREB)的结合位点,分别位于-1632 bp和-189 bp。缺失突变研究发现,启动子片段-1801~+124活性最高,同时这一片段含有两个CREB结合位点,而当缺失至-80位点时,活性显著下降(P<0.05),且这一片段不包含CREB结合位点。表明CREB可能参与调控FABP3基因启动子的活性,为FABP3基因的转录调控研究提供理论依据。 展开更多

关键词 心脏型脂肪酸结合蛋白(fabp3) 启动子 基因克隆 西农萨能奶山羊

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牛fabp3和fabp4基因真核表达载体的构建及在小鼠成肌细胞中的表达 被引量：1

8

作者 王杰 奥旭东 +3 位作者 李文斌 白海栋 岳永莉 于海泉 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期136-145,共10页

【目的】分别构建牛fabp3和fabp4基因真核表达载体,并观察载体转染小鼠成肌细胞后基因的表达以及对内源fabp3和fabp4基因表达的影响,检测肉质性状形成相关基因在转基因细胞中的表达及对内源功能基因的影响。【方法】以pDsRED质粒为骨架... 【目的】分别构建牛fabp3和fabp4基因真核表达载体,并观察载体转染小鼠成肌细胞后基因的表达以及对内源fabp3和fabp4基因表达的影响,检测肉质性状形成相关基因在转基因细胞中的表达及对内源功能基因的影响。【方法】以pDsRED质粒为骨架载体,分别将人肌红蛋白启动子与目的基因相连、CMV启动子与红色荧光蛋白报告基因相连构建肌肉特异性表达fabp3基因的载体pDsHF3和表达fabp4基因的载体pDsHF4;用脂质体瞬时转染小鼠成肌细胞,72 h后用2%孕马血清诱导成肌细胞向肌管的分化;利用real-time PCR技术检测转染前后成肌细胞中外源牛fabp3和fabp4基因和内源小鼠fabp3和fabp4基因的表达量。【结果】与对照组相比,小鼠成肌细胞分别转染pDsHF3和pDsHF4表达载体,24 h后外源牛fabp3和fabp4基因均获得高水平的表达,48 h后有所回落;而内源小鼠fabp3和fabp4基因在成肌细胞和诱导分化的肌管细胞中的表达均受到不同程度的影响。【结论】构建的真核表达载体能在成肌细胞中高效表达,外源牛fabp3或fabp4基因的转入能够影响小鼠成肌细胞及肌管中内源fabp3和fabp4基因的表达。 展开更多

关键词 牛fabp3基因 牛fabp4基因 成肌细胞 肌管

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FABP3基因对心肌细胞凋亡的影响 被引量：2

9

作者 杨洋 徐娅 +3 位作者 刘杨安 鲍媛 杜鸿丽 杨名 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2017年第19期4734-4736,共3页

目的脂肪酸结合蛋白(FABP)3基因对心肌细胞凋亡的影响及机制。方法将H9C2心肌细胞分为空白对照组、阴性对照组、FABP3沉默组、FABP3沉默+空质粒组及FABP3沉默+过表达人FABP3组,转染72 h后Western印迹检测各组细胞中FABP3的蛋白表达;流... 目的脂肪酸结合蛋白(FABP)3基因对心肌细胞凋亡的影响及机制。方法将H9C2心肌细胞分为空白对照组、阴性对照组、FABP3沉默组、FABP3沉默+空质粒组及FABP3沉默+过表达人FABP3组,转染72 h后Western印迹检测各组细胞中FABP3的蛋白表达;流式细胞仪检测细胞凋亡;Western印迹检测Cleaved caspase3、Bcl-2蛋白表达。结果空白对照组与阴性对照组及FABP3沉默组和FABP3沉默+空质粒组之间FABP3蛋白表达差异无统计学意义(P>0.05),FABP3沉默组和FABP3沉默+空质粒组FABP3的蛋白表达显著低于空白对照组与阴性对照组,FABP3沉默+过表达人FABP3组FABP3的蛋白表达显著高于FABP3沉默组和FABP3沉默+空质粒组(P<0.01);FABP3沉默组和FABP3沉默+空质粒组细胞凋亡率及Cleaved caspase3蛋白表达显著高于空白对照组与阴性对照组,Bcl-2蛋白表达显著低于空白对照组与阴性对照组FABP3(P<0.01);沉默+过表达人FABP3组细胞凋亡率及Cleaved caspase3蛋白表达显著低于FABP3沉默组和FABP3沉默+空质粒组,Bcl-2蛋白表达显著高于FABP3沉默组和FABP3沉默+空质粒组(P<0.01)。结论沉默FABP3的表达可促进H9C2心肌细胞凋亡,过表达则抑制细胞凋亡,其机制与调节Cleaved caspase3及Bcl-2蛋白表达有关。 展开更多

关键词 fabp3 心肌细胞 凋亡

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关岭牛FABP3和FABP4基因的分子特征及其组织表达分析 被引量：9

10

作者 石鹏飞 阮涌 +4 位作者 刘文娇 许家利 孙金魁 熊讯 许厚强 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期2281-2293,共13页

【目的】探究关岭牛心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)和脂肪型脂肪酸结合蛋白(FABP4)基因的分子特征及其在不同年龄段和不同组织中的表达差异,为揭示牛FABP3和FABP4基因对脂肪酸的调控作用机制提供理论依据。【方法】通过RT-PCR扩增关岭牛FA... 【目的】探究关岭牛心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)和脂肪型脂肪酸结合蛋白(FABP4)基因的分子特征及其在不同年龄段和不同组织中的表达差异,为揭示牛FABP3和FABP4基因对脂肪酸的调控作用机制提供理论依据。【方法】通过RT-PCR扩增关岭牛FABP3和FABP4基因蛋白编码区(CDS)序列,采用ProtScale、ProtParam、SOPMA、SWISS-MODEL、TMHMM-2.0、SignalP-5.0及NetPhos-3.1等在线软件进行生物信息学分析,同时以实时荧光定量PCR检测FABP3和FABP4基因在3日龄关岭犊牛、24月龄关岭牛(成年)及24月龄杂交牛(关岭牛×利木赞牛)各组织中的表达情况。【结果】关岭牛FABP3、FABP4基因CDS序列全长分别为402和399 bp,对应编码133和132个氨基酸残基,其蛋白二、三级结构以无规则卷曲和延伸链为主,均无跨膜结构域和信号肽,且为稳定的亲水性蛋白。关岭牛FABP3、FABP4氨基酸序列分别存在26和21个磷酸化位点,其中又以苏氨酸磷酸化位点为主;关岭牛FABP3和FABP4蛋白与FABP1、FABP6、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、脂蛋白脂肪酶(LPL)及激素敏感脂肪酶(LIPE)等存在互作关系。基于FABP3和FABP4氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树均显示,关岭牛与牦牛的亲缘关系最近,其次是绵羊,与鸡和斑马鱼的亲缘关系较远。FABP3和FABP4基因在关岭牛和杂交牛各组织中均有不同程度的表达,其中,FABP3基因以在心脏中的相对表达量最高,且在成年牛中的相对表达量极显著高于犊牛和杂交牛(P<0.01,下同);FABP4基因以在脂肪中的相对表达最高,且在犊牛中的相对表达量极显著高于成年牛。【结论】关岭牛FABP3和FABP4基因具有较高的遗传保守性,且以在心脏和脂肪中的表达水平较高,与脂肪酸代谢密切相关。 展开更多

关键词 关岭牛 fabp3基因 FABP4基因 分子特征 组织表达 脂肪酸代谢

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黔北麻羊不同组织中FABP1、FABP3基因表达水平的研究 被引量：12

11

作者 艾锦新 龙安炬 +1 位作者 罗卫星 蔡惠芬 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第11期63-67,73,共6页

本实验旨在探究肝脏型脂肪酸结合蛋白(FABP1)和心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)基因在黔北麻羊不同组织中mRNA的表达水平。以6月龄、1周岁和1.5周岁黔北麻羊公、母羊为研究对象,采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊不同性别和不同生长时... 本实验旨在探究肝脏型脂肪酸结合蛋白(FABP1)和心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)基因在黔北麻羊不同组织中mRNA的表达水平。以6月龄、1周岁和1.5周岁黔北麻羊公、母羊为研究对象,采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊不同性别和不同生长时期心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、胸腺、下丘脑、十二指肠、皮下脂肪及背最长肌等11个组织中FABP1和FABP3基因的mRNA相对表达量。结果显示:FABP1、FABP3基因mRNA在黔北麻羊的11个组织中广泛表达,FABP1基因在肝脏中表达量最高,其次是十二指肠和肺脏,FABP3基因在心脏中表达量最高,其次是背最长肌和肾脏,其余各组织表达量较低。黔北麻羊FABP1、FABP3基因mRNA的表达量受性别、生长时期的影响,且存在一定的显著性差异,不同性别FABP1、FABP3基因mRNA的表达量母羊普遍高于公羊,不同时期FABP1、FABP3基因mRNA的表达量随月龄的增加总体呈小幅上升趋势。本研究结果为进一步研究FABP1、FABP3基因调控山羊脂质代谢和肉质性状提供理论依据。 展开更多

关键词 黔北麻羊 FABP1基因 fabp3基因 组织表达

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秦川肉牛FABP3及FABP4基因SNP与肉质性状的关联性 被引量：7

12

作者 余横伟 桂林生 +1 位作者 胡言 昝林森 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2018年第3期1-7,15,共8页

【目的】探索脂肪酸结合蛋白3(Fat acid binding proteins 3,FABP3)及脂肪酸结合蛋白4(FABP4)基因对秦川牛肉用新品系肉用性状的影响,为秦川肉牛的选育提供理论基础。【方法】随机选择18~24月龄健康的秦川肉牛571头,尾静脉采血10mL/头,... 【目的】探索脂肪酸结合蛋白3(Fat acid binding proteins 3,FABP3)及脂肪酸结合蛋白4(FABP4)基因对秦川牛肉用新品系肉用性状的影响,为秦川肉牛的选育提供理论基础。【方法】随机选择18~24月龄健康的秦川肉牛571头,尾静脉采血10mL/头,提取血液DNA,PCR扩增FABP3及FABP4基因,检测其单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析SNP位点基因型和单倍型组合对肉牛肉用性状(背膘厚、眼肌面积、肌间脂肪含量)的影响。【结果】测序发现,在FABP3基因第3个内含子上检测出1个SNP位点:g.60298C>T。在FABP4基因第1个内含子上检测出2个SNP位点:g.2686A>T和g.2834C>G;在第4外显子上检测出1个SNP位点:g.4220A>G。FABP3基因g.60298C>T位点不同基因型的肌内脂肪含量差异显著(P<0.05),TT基因型显著高于CT和CC基因型。对FABP4基因而言,g.2834C>G位点上的CC基因型肉用性状表现较优,其眼肌面积极显著高于GG和CT基因型(P<0.01),肌内脂肪含量显著高于GG和CG基因型(P<0.05);g.4220A>G位点上的TT基因型的肉用性状较优,其背膘厚显著高于CC和CT基因型(P<0.05)。H1H1是最优秀的单倍型组合,其眼肌面积和肌内脂肪含量分别极显著高于单倍型组合H3H3和H3H7(P<0.01)。【结论】FABP3及FABP4基因与秦川牛肉用新品系肉用性状关联紧密。 展开更多

关键词 秦川牛肉用新品系 fabp3基因 FABP4基因 多态性 关联分析

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口腔鳞状细胞癌中FABP3的表达及临床病理意义 被引量：3

13

作者 王亚 祖木热提古丽·阿不来提 +2 位作者 代海涛 徐江 仵楠 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第4期427-432,共6页

目的探讨口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中脂肪酸结合蛋白3(fatty acid binding proteins 3,FABP3)的表达及临床病理意义。方法采用生物信息学及免疫组化EnVision两步法分析OSCC中FABP3的表达水平,及其与临床病理... 目的探讨口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中脂肪酸结合蛋白3(fatty acid binding proteins 3,FABP3)的表达及临床病理意义。方法采用生物信息学及免疫组化EnVision两步法分析OSCC中FABP3的表达水平,及其与临床病理学特征、预后和免疫细胞浸润水平的关系。结果TCGA及GEO数据库分析显示,FABP3在OSCC中的表达低于癌旁组织,差异有统计学意义(P均<0.001);免疫组化结果显示,OSCC组织及癌旁组织中FABP3的阳性率分别为23.72%(37/156)、58.33%(35/60)。FABP3表达与OSCC的T分期相关(χ^(2)=5.41,P=0.02)。免疫浸润结果显示:FABP3高表达与自然杀伤细胞(r=0.561,P<0.001)、巨噬细胞(r=0.429,P<0.001)、未成熟树突状细胞(r=0.393,P<0.001)等浸润水平呈正相关。Log-rank检验分析显示,FABP3蛋白高表达组OSCC患者的生存时间明显短于FABP3蛋白低表达组(HR=2.04,P=0.008)。Cox生存分析显示,FABP3蛋白高表达和病理学分级是预后不良的独立影响因素(P均<0.05)。结论FABP3高表达OSCC患者预后不佳,并通过影响肿瘤微环境中免疫细胞的浸润水平调控OSCC。 展开更多

关键词 口腔肿瘤 鳞状细胞癌 免疫浸润 fabp3 免疫组织化学

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北川白山羊FABP3基因cDNA的克隆及表达研究 被引量：2

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作者 姚毅 马红艳 +1 位作者 吕学斌 杨跃奎 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2017年第6期54-57,共4页

脂肪酸结合蛋白(Fatty aicd Binding Protein 3,FABP3)是细胞内脂类伴侣。本研究采用RT-PCR和RACE技术,分离并克隆山羊FABP3基因的cDNA序列,结合实时定量分析山羊FABP3在10个不同组织和5个不同泌乳时期的相对表达。结果表明:FABP3基因的... 脂肪酸结合蛋白(Fatty aicd Binding Protein 3,FABP3)是细胞内脂类伴侣。本研究采用RT-PCR和RACE技术,分离并克隆山羊FABP3基因的cDNA序列,结合实时定量分析山羊FABP3在10个不同组织和5个不同泌乳时期的相对表达。结果表明:FABP3基因的m RNA序列全长为714 bp,包括5'非翻译区64 bp,CDS区402 bp和3'非翻译区248 bp,共计翻译为133个氨基酸,山羊FABP3与Gen Bank中牛(Bos taurus)、小鼠(Mus musculus)和人(Homo sapiens)的核苷酸同源性较高,分别为96%、89%、87%;蛋白质结构分析显示,FABP3蛋白分子量为14.76 ku,等电点为6.11,不具有信号肽序列,没有跨膜结构;组织表达分析表明,FABP3基因在山羊的心脏组织中表达量最高,小肠次之,表达量最少的为肌肉组织;山羊5个不同泌乳时期乳腺组织FABP3的表达量分析表明,泌乳盛期的表达量最高,约为干奶期的130倍。 展开更多

关键词 山羊 fabp3 克隆 组织表达

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牦牛FABP3基因克隆及组织表达谱分析 被引量：3

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作者 戴荣凤 黄纯 +3 位作者 扎老 路建卫 唐月琴 梁春年 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2024年第1期1-8,共8页

【目的】分析牦牛心肌脂肪酸结合蛋白3(FABP3)基因的结构和功能,并检测其在成年牦牛和胎牛中的表达水平,为探究该基因在牦牛育种中的生物学功能提供理论参考。【方法】以美仁牦牛的心脏组织为试验材料,PCR扩增FABP3基因,对得到的编码区... 【目的】分析牦牛心肌脂肪酸结合蛋白3(FABP3)基因的结构和功能,并检测其在成年牦牛和胎牛中的表达水平,为探究该基因在牦牛育种中的生物学功能提供理论参考。【方法】以美仁牦牛的心脏组织为试验材料,PCR扩增FABP3基因,对得到的编码区序列(CDS)进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR),检测FABP3基因在成年牦牛和胎牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏及肌肉组织的表达水平。【结果】牦牛FABP3基因编码区序列长度为402 bp,编码133个氨基酸;蛋白质的高级结构主要是β-转角和延伸链;牦牛FABP3蛋白不存在跨膜区域和信号肽,属于具有一定亲水性的稳定蛋白;牦牛FABP3基因CDS区核苷酸及其编码氨基酸序列的同源性分析显示,FABP3基因在牛属动物中具有一定的保守性;系统进化树分析表明,牦牛与野牦牛和瘤牛的亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远。RT-qPCR结果显示,FABP3基因在成年牦牛和胎牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏及肌肉组织中均有表达,但在胎牛肝脏、脾脏、肾脏和肌肉中的表达水平显著或极显著高于成年牦牛,在成年牦牛肺脏中的表达水平极显著高于胎牛。【结论】克隆了牦牛FABP3基因,探究了FABP3基因在牦牛中的组织表达规律,为进一步研究该基因在牦牛脂肪沉积中的作用提供了基础数据。 展开更多

关键词 美仁牦牛 fabp3 基因克隆 生物信息学 组织表达谱

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北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状关联分析 被引量：8

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作者 苏艳芳 杨曼 +2 位作者 牛乃琪 侯欣华 张龙超 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期966-975,共10页

旨在研究脂肪酸结合蛋白-3(fatty acid binding protein 3,FABP3)和硬脂酰基辅酶A脱氢酶(stearoyl-CoA desaturase,SCD)基因的多态性及其与肉品质性状的关联,从而能够在分子水平上指导北京黑猪的育种工作。本研究以413头北京黑猪为材料... 旨在研究脂肪酸结合蛋白-3(fatty acid binding protein 3,FABP3)和硬脂酰基辅酶A脱氢酶(stearoyl-CoA desaturase,SCD)基因的多态性及其与肉品质性状的关联,从而能够在分子水平上指导北京黑猪的育种工作。本研究以413头北京黑猪为材料,收集肉品质性状数据并提取DNA和RNA,根据FABP3和SCD基因序列设计20对引物进行PCR扩增及测序,运用DNAStar软件分析测序结果,对FABP3和SCD基因进行不同基因型与北京黑猪肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量的关联分析并运用荧光定量PCR对其进行基因表达差异分析。结果发现,FABP3基因存在1个错义突变(c.681A>G),SCD基因存在1个错义突变、2个同义突变以及2个3′UTR区突变。使用Duncan’s多重检验统计分析发现,SCD基因内的SNPs与肉品质性状关联均不显著;FABP3基因错义突变位点c.681A>G与肉色L*和IMF含量显著关联(P<0.05)。该错义突变导致FABP3蛋白第51位氨基酸残基由异亮氨酸(I)突变为苏氨酸(T)。利用qPCR开展FABP3 c.681A>G两种纯合基因型(AA和GG)个体表达量差异分析,发现该突变位点两种纯合基因型个体间基因表达量差异不显著,说明FABP3 c.681A>G错义突变位点可能通过影响蛋白功能来调控肌内脂肪含量和肉色L*性状。上述两个基因中只有1个位点与肉色L*和IMF含量关联显著,可以作为北京黑猪肉品质性状的候选基因功能位点,也能为北京黑猪肉品质育种提供了新的分子标记。 展开更多

关键词 北京黑猪 fabp3 SCD 肉品质 关联分析

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牛FABP3转基因小鼠的遗传及表达特性研究 被引量：1

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作者 李娟 杜新华 +3 位作者 陈燕 高雪 李俊雅 许尚忠 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1750-1758,共9页

旨在研究和分析牛FABP3基因在小鼠体内遗传和表达特性,对培育优质高产转基因肉牛新品种具有重要意义。本研究利用前期获得的4只FABP3转基因小鼠,通过制定的4组交配方案获得子代小鼠,并利用PCR、实时荧光定量PCR和组织原位表达技术对转... 旨在研究和分析牛FABP3基因在小鼠体内遗传和表达特性,对培育优质高产转基因肉牛新品种具有重要意义。本研究利用前期获得的4只FABP3转基因小鼠,通过制定的4组交配方案获得子代小鼠,并利用PCR、实时荧光定量PCR和组织原位表达技术对转基因牛FABP3基因小鼠的子代遗传特征,以及FABP3基因在G0代和G1代小鼠心、肝、肾、骨骼肌组织的表达情况进行了检测。RT-PCR检测结果表明,在G0代转基因小鼠中,牛FABP3基因能够表达;牛FABP3基因在转基因小鼠中可以遗传,G1代转基因小鼠平均阳性率达68.4%;相对定量PCR结果表明,转基因小鼠总FABP3基因在G1代小鼠心肌和骨骼肌中表达量相对于阴性个体有不同程度的增加;组织原位检测表明,在G0代个体中表达量较高,G1代个体中虽能看到绿色荧光,但略有降低。本研究表明,牛FABP3基因存在于小鼠基因组中,并能够被表达,且可以遗传给后代,这为后期进一步研究牛FABP3基因对小鼠骨骼肌脂肪含量的影响奠定坚实基础。 展开更多

关键词 牛 脂肪酸结合蛋白3 转基因 小鼠 脂肪

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藏猪和大约克猪FABP3基因多态性及差异表达分析 被引量：1

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作者 杨绍康 薄素雪 +3 位作者 韩雨晴 叶幼荣 商鹏 强巴央宗 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期639-645,共7页

【目的】脂肪酸结合蛋白3(FABP3)参与长链脂肪酸的摄取及利用,在脂肪沉积中发挥重要作用。探究FABP3基因在藏猪和大约克猪间的基因多态性和表达差异可为藏猪品质改良提供分子机制参考。【方法】选取180日龄藏猪和大约克猪为研究对象,对... 【目的】脂肪酸结合蛋白3(FABP3)参与长链脂肪酸的摄取及利用,在脂肪沉积中发挥重要作用。探究FABP3基因在藏猪和大约克猪间的基因多态性和表达差异可为藏猪品质改良提供分子机制参考。【方法】选取180日龄藏猪和大约克猪为研究对象,对两猪种FABP3基因5'侧翼区和CDS区进行单核苷酸多态性(SNPs)筛选,使用实时荧光定量检测FABP3基因在肝脏、背最长肌和背脂3个组织中的表达量。【结果】在FABP3基因5'侧翼区筛选到T-114C和C-635A等2个SNPs位点,且SNPs位点基因型频率在藏猪与大约克猪群体间均呈极显著差异(P<0.01);经转录因子预测发现这2个SNPs位点与前脂肪细胞的更新、分化以及脂肪沉积相关,推测这两个多态性位点是参与调控FABP3基因表达的重要功能位点。FABP3基因在藏猪肝脏、背最长肌中的表达量极显著高于大约克猪(P<0.01),在背脂中的表达量显著高于大约克猪(P<0.05)。【结论】推测FABP3基因可能为调控藏猪脂肪代谢的重要候选基因,在藏猪脂肪沉积中呈正向调控作用。 展开更多

关键词 藏猪 fabp3基因 脂肪沉积 多态性位点

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FABP3和LEPR基因多态性及其表达水平对猪肌内脂肪(IMF)含量和脂肪覆盖度的影响

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作者 Tyra M. 晋大鹏 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第1期81-81,共1页

育种计划的完善对于提高猪瘦肉率,增加产肉量,降低肌内脂肪(IMF)含量,影响猪肉品质具有重要的意义。FABP3和LEPR基因与脂肪酸代谢间存在一定的相关性,可作为猪肥度性状的候选基因。试验旨在分析FABP3和LEPR基因多态性及其表达水平对猪... 育种计划的完善对于提高猪瘦肉率,增加产肉量,降低肌内脂肪(IMF)含量,影响猪肉品质具有重要的意义。FABP3和LEPR基因与脂肪酸代谢间存在一定的相关性,可作为猪肥度性状的候选基因。试验旨在分析FABP3和LEPR基因多态性及其表达水平对猪肥度参数和IMF含量的影响。结果表明,FABP3基因在腿肌的表达量显著高于腰部(P<0.001),而LEPR基因在腰部表达量较高(P<0.001)。FABP3基因c.103C>T和c.1811G>C多态性对腿肌IMF水平有显著影响(P<0.05),c.103C>T多态性对腰部IMF水平有显著影响(P<0.01)。此外,c.1811G>C多态性与腰部、胴体的肥度性状显著相关(P<0.05)。胴体脂肪含量与LEPR基因mRNA表达量显著相关(P<0.01)。因此,FABP3基因表达对试验肌肉样中IMF水平有显著影响(P<0.01)。 展开更多

关键词 肥度性状 fabp3 LEPR 肌内脂肪 基因表达 猪

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SREBP1c-ACCα/FAS和SREBP1c-FABP3轴向调控HepG2胞内脂质合成与转运 被引量：2

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作者 付常振 郑颖 +2 位作者 路遥 王仁军 刘庆平 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期9-13,26,共6页

SREBP1c是长链脂肪酸(LCFAs)从头合成及胞内转运的关键调控因子,探讨SREBP1c-ACCα/FAS和SREBP1c-FABPs轴向调控LCFAs合成与转运紊乱诱发NAFLD的分子机制。制备介导SREBP1c过表达腺病毒Ad-SREBP1c,侵染HepG2细胞后酶法测定胞内TG含量,RT... SREBP1c是长链脂肪酸(LCFAs)从头合成及胞内转运的关键调控因子,探讨SREBP1c-ACCα/FAS和SREBP1c-FABPs轴向调控LCFAs合成与转运紊乱诱发NAFLD的分子机制。制备介导SREBP1c过表达腺病毒Ad-SREBP1c,侵染HepG2细胞后酶法测定胞内TG含量,RT-PCR及Western Blot法检测ACCα、FAS、FABP3和FABP4的表达量。结果显示:Ad-SREBP1c病毒滴度为1.6×10^(9)GFU/mL;侵染HepG2细胞24 h后介导SREBP1c mRNA及蛋白的表达量分别升高89.73倍和7.27倍(P<0.01),促进下游LCFAs合成基因ACCα和FAS分别升高1.55倍和3.42倍(P<0.01),蛋白表达量分别升高1.23倍(P<0.05)和1.43倍(P<0.01);FABP3 mRNA和蛋白表达量分别升高4.03和2.06倍(P<0.01),FABP4无显著变化;Ad-SREBP1c侵染HepG2细胞24 h和48 h胞内TG含量分别升高1.24倍(P<0.05)和2.41倍(P<0.01);SREBP1c-ACCα/FAS轴向调控LCFAs从头合成及SREBP1c-FABP3轴向介导胞内转运,可能是促使胞脂异位沉积导致NAFLD发生的关键机制之一。 展开更多

关键词 非酒精性脂肪性肝病 固醇调节元件结合蛋白1C 乙酰辅酶A羧化酶α/脂肪酸合成酶 脂肪酸结合蛋白3

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