中间球海胆脂肪酸结合蛋白fabp1基因的克隆与表达

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作者 姚佳慧 王姮 +2 位作者 马晓芸 丁君 常亚青 《水产学杂志》 2025年第3期8-13,96,共7页

为探究海胆脂代谢机制,利用RACE方法克隆得到中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)脂肪酸结合蛋白家族中的fabp1基因的全序列,并利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术研究fabp1基因的组织分布和在胚胎发育过程中的表达水平。结果表明:f... 为探究海胆脂代谢机制,利用RACE方法克隆得到中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)脂肪酸结合蛋白家族中的fabp1基因的全序列,并利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术研究fabp1基因的组织分布和在胚胎发育过程中的表达水平。结果表明:fabp1基因的cDNA全长为1175 bp,开放阅读框(ORF)为390 bp,编码129个氨基酸,预测分子量为13.69 kDa。同源性检测和系统发育分析表明,中间球海胆fabp1基因与紫球海胆(S.purpuratus)fabp1基因序列同源性最高(98.44%)。fabp1基因在围口膜中的表达明显高于管足、体腔细胞和性腺。在胚胎发育过程中,fabp1基因的相对表达量从卵裂期开始呈上调趋势,在多细胞期达到峰值后开始下降。本结果为进一步阐明fabp1基因在海洋无脊椎动物中表达的分子机制提供基础,并为研究海胆的脂代谢和营养调控机制提供资料。 展开更多

关键词 中间球海胆 fabp1基因 荧光定量PCR 克隆 序列分析

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饲粮中添加不同水平花椒籽对育肥猪脂肪酸组成和FABP1基因组织表达的影响 被引量：6

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作者 尚学峰 李杰 +3 位作者 梁永飞 黄晓宇 马艳萍 滚双宝 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第1期1-9,共9页

【目的】探究饲粮中添加不同水平花椒籽对育肥猪脂肪酸组成和肝脏型脂肪酸结合蛋白基因(FABP1)组织表达水平的影响。【方法】试验选择288头3月龄体质量相当且健康的杜×长×大三元育肥猪,随机分为4组,分别用花椒籽代替基础饲粮... 【目的】探究饲粮中添加不同水平花椒籽对育肥猪脂肪酸组成和肝脏型脂肪酸结合蛋白基因(FABP1)组织表达水平的影响。【方法】试验选择288头3月龄体质量相当且健康的杜×长×大三元育肥猪,随机分为4组,分别用花椒籽代替基础饲粮中0%(对照组)、2.5%(Ⅰ组)、5%(Ⅱ组)和7.5%(Ⅲ组)玉米进行饲喂,试验期100 d,试验结束后采集育肥猪肝脏、背肌和肾周组织测定脂肪酸含量,利用荧光定量qPCR检测FABP1基因在育肥猪各组织中的表达特征。【结果】添加花椒籽显著改善育肥猪背肌和肝脏中SFAs、MUFAs和PUFAs水平,试验I组背肌和肝脏SFAs显著升高(P<0.05),试验Ⅱ组背肌、肝脏和肾周PUFAs显著升高(P<0.05);猪FABP1基因CDS全长383 bp,共编码127个氨基酸,与参考序列相比,其编码区第53位T突变为A;FABP1基因在花椒籽饲喂育肥猪的肝、脾、十二指肠、空肠、回肠、结肠、直肠、盲肠和背肌组织均显著上调表达(P<0.05),在肾脏中显著下调表达(P<0.05),试验Ⅱ组脾脏、空肠、直肠和背肌中FABP1基因的表达量显著高于其他组(P<0.05)。【结论】饲粮中添加花椒籽显著改善育肥猪脂肪酸组成,提高各组织FABP1基因的表达量,这有利于育肥猪的脂肪沉积和肉质改善。 展开更多

关键词 花椒籽 育肥猪 脂肪酸 fabp1基因 组织表达

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舍内氨气浓度对鸭肝脏PPARα、FABP1及LPL基因表达的影响 被引量：3

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作者 姜庆林 王志国 +5 位作者 徐文娟 章双杰 朱春红 宋卫涛 刘宏祥 陶志云 《扬州大学学报（农业与生命科学版）》 CAS 北大核心 2019年第6期82-85,共4页

为探究舍内不同氨气浓度对鸭肝脏过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)、脂肪酸结合蛋白1(FABP1)和脂蛋白脂肪酶(LPL)基因的表达影响,将36只43周龄山麻鸭随机分为2组,即舍内氨气浓度10 mg·L^-1组和75 mg·L^-1组,饲养至10、20... 为探究舍内不同氨气浓度对鸭肝脏过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)、脂肪酸结合蛋白1(FABP1)和脂蛋白脂肪酶(LPL)基因的表达影响,将36只43周龄山麻鸭随机分为2组,即舍内氨气浓度10 mg·L^-1组和75 mg·L^-1组,饲养至10、20和30 d时采用荧光定量PCR法检测氨气对鸭肝脏PPARα及其信号通路中脂代谢相关基因FABP1和LPL表达的变化。结果表明:与10 mg·L^-1氨气组相比,75 mg·L^-1氨气组饲养至10、20、30 d时,鸭肝脏中PPARα、FABP1和LPL表达量均显著下降。相关性分析表明,在氨气应激状态下,PPARα表达量上升伴随LPL表达量显著上升,同时FABP1表达量上升,LPL表达量极显著上升。这说明高浓度氨气对鸭肝脏中PPARα、FABP1和LPL表达有显著影响,且PPARα和FABP1表达量与LPL表达量均呈正相关关系,这一研究有助于阐明鸭PPARα信号途径在氨气应激状态下对脂代谢调节的作用。 展开更多

关键词 鸭 氨气 PPARα基因 fabp1基因 LPL基因 表达

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黔北麻羊不同组织中FABP1、FABP3基因表达水平的研究 被引量：12

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作者 艾锦新 龙安炬 +1 位作者 罗卫星 蔡惠芬 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第11期63-67,73,共6页

本实验旨在探究肝脏型脂肪酸结合蛋白(FABP1)和心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)基因在黔北麻羊不同组织中mRNA的表达水平。以6月龄、1周岁和1.5周岁黔北麻羊公、母羊为研究对象,采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊不同性别和不同生长时... 本实验旨在探究肝脏型脂肪酸结合蛋白(FABP1)和心脏型脂肪酸结合蛋白(FABP3)基因在黔北麻羊不同组织中mRNA的表达水平。以6月龄、1周岁和1.5周岁黔北麻羊公、母羊为研究对象,采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊不同性别和不同生长时期心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、胸腺、下丘脑、十二指肠、皮下脂肪及背最长肌等11个组织中FABP1和FABP3基因的mRNA相对表达量。结果显示:FABP1、FABP3基因mRNA在黔北麻羊的11个组织中广泛表达,FABP1基因在肝脏中表达量最高,其次是十二指肠和肺脏,FABP3基因在心脏中表达量最高,其次是背最长肌和肾脏,其余各组织表达量较低。黔北麻羊FABP1、FABP3基因mRNA的表达量受性别、生长时期的影响,且存在一定的显著性差异,不同性别FABP1、FABP3基因mRNA的表达量母羊普遍高于公羊,不同时期FABP1、FABP3基因mRNA的表达量随月龄的增加总体呈小幅上升趋势。本研究结果为进一步研究FABP1、FABP3基因调控山羊脂质代谢和肉质性状提供理论依据。 展开更多

关键词 黔北麻羊 fabp1基因 FABP3基因 组织表达

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关岭牛FABP1和FABP2基因克隆及其组织表达分析 被引量：4

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作者 石鹏飞 许家利 +1 位作者 孙金魁 许厚强 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期598-608,共11页

【目的】明确肝脏型脂肪酸结合蛋白(FABP1)和肠型脂肪酸结合蛋白(FABP2)基因的分子特征及其在不同年龄段和不同品种牛各组织中的表达情况,为后续研究FABP1和FABP2对牛脂肪酸的调控作用机制提供理论依据。【方法】采用RT-PCR扩增关岭牛FA... 【目的】明确肝脏型脂肪酸结合蛋白(FABP1)和肠型脂肪酸结合蛋白(FABP2)基因的分子特征及其在不同年龄段和不同品种牛各组织中的表达情况,为后续研究FABP1和FABP2对牛脂肪酸的调控作用机制提供理论依据。【方法】采用RT-PCR扩增关岭牛FABP1和FABP2基因编码区(CDS)序列,通过ProtParam、ProtScale、SOPMA、SWISSMODEL、TMHMM-2.0、SignalP-5.0和NetPhos-3.1等在线软件进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测FABP1和FABP2基因在3日龄关岭牛(犊牛)、24月龄关岭牛(成年牛)及24月龄杂交牛(关岭牛×利木赞牛)各组织中的表达情况。【结果】FABP1、FABP2基因CDS序列全长分别为384和399 bp,对应编码127和132个氨基酸残基,其编码蛋白二、三级结构均以无规则卷曲和延伸链为主,无跨膜结构域和信号肽剪切位点,且属于亲水性稳定蛋白。FABP1、FABP2氨基酸序列分别包含19和18个磷酸化位点,其中苏氨酸在2个氨基酸序列中均广泛分布。FABP1、FABP2氨基酸序列同源比对及系统发育进化分析结果均显示,关岭牛与马、绵羊和山羊的亲缘关系较近,而与鸡和鸭的亲缘关系较远,与其他物种的相似性都在75.0%以上。FABP1、FABP2基因在不同年龄段和不同品种牛的各组织中均有表达,其中,FABP1基因以在肝脏和小肠中的相对表达量较高,且犊牛和杂交牛多个组织中的FABP1基因相对表达量极显著高于成年关岭牛(P<0.01,下同);FABP2基因则主要在小肠中高表达,且成年关岭牛小肠中的FABP2基因相对表达量极显著高于犊牛、显著高于杂交牛(P<0.05)。【结论】FABP1和FABP2基因在关岭牛中保守性较高,且在不同年龄阶段及不同组织中均有表达,尤其在肝脏和小肠中的表达水平较高,故推测FABP1和FABP2基因协同调控关岭牛脂肪酸的合成代谢。 展开更多

关键词 关岭牛 fabp1基因 FABP2基因 表达特征 脂肪酸

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PNPLA3和FABP1基因甲基化与代谢相关脂肪性肝病相关性分析 被引量：2

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作者 朱凯 杨磊 +5 位作者 周青 马雪儿 李琴 何晓萱 杨雪霞 蔡雯 《肝脏》 2023年第2期207-213,共7页

目的 了解乌鲁木齐市代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)患病率情况及PNPLA3与FABP1基因甲基化对其发病的影响。方法 回顾性分析2022年1月—3月新疆医科大学第一附属医院进行体检人群的相关临床资料;从中招募15例MAFLD患者,匹配同期体检15名无... 目的 了解乌鲁木齐市代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)患病率情况及PNPLA3与FABP1基因甲基化对其发病的影响。方法 回顾性分析2022年1月—3月新疆医科大学第一附属医院进行体检人群的相关临床资料;从中招募15例MAFLD患者,匹配同期体检15名无肝病既往史健康人群采用甲基化特异PCR方法(MSP法)进行PNPLA3、FABP1基因甲基化检测。采用Point-biserial相关对临床资料及基因表达之间的相关性进行分析。结果 共纳入3 194名体检人群中1081例(33.84%)诊断为MAFLD,其中男性698例(64.57%)、女性383例(35.43%),40~50年龄段人数最多有424例(39.22%),差异均有统计学意义(P<0.001)。病例组PNPLA3基因高甲基化状态2例(13.33%),对照组10例(66.67%),差异具有统计学意义(χ^(2)=6.806,P=0.009);FABP1基因高甲基化状态5例(33.33%);对照组12例(80.00%),差异具有统计学意义(χ^(2)=4.887,P=0.027)。PNPLA3基因甲基化状态与空腹血糖(FPG)(r=-0.385,P<0.05)、甘油三酯(TG)(r=-0.584,P<0.05)呈负相关,高密度脂蛋白(HDL-C)(r=0.651,P<0.001)呈正相关;FABP1基因甲基化状态与尿素(UA)(r=-0.407,P<0.05)、FPG(r=-0.416,P<0.05)、TG(r=-0.565,P<0.05)、总胆固醇(TC)(r=-0.515,P<0.05)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)(r=-0.416,P<0.05)、丙氨酸氨基转移酶(ALT)(r=-0.473,P<0.05)呈负相关,与HDL-C(r=0.487,P<0.05)呈正相关。结论 乌鲁木齐市MAFLD患病率处于全国高位。MAFLD患者血浆中PNPLA3、FABP1基因启动子区甲基化状态均明显降低,且与FPG、TG、TC、UA、AST、ALT和HDL-C相关,是MAFLD发生、发展的重要机制之一。 展开更多

关键词 代谢相关脂肪性肝病 甲基化 PNPLA3基因 fabp1基因 相关性分析

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猪FABP1和FABP2基因的分子特征及组织表达分析 被引量：8

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作者 熊讯 李永 +5 位作者 阮涌 陈晨 宋林锦 石鹏飞 孙金魁 许厚强 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期935-945,共11页

【目的】明确脂肪酸结合蛋白(FABPs)对香苏杂交猪脂肪沉积的影响,为后续进一步探究猪脂肪细胞内FABP1和FABP2基因对脂肪酸代谢的调控作用打下基础。【方法】采集香苏杂交猪和柯乐猪的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、大肠、小肠、背最长... 【目的】明确脂肪酸结合蛋白(FABPs)对香苏杂交猪脂肪沉积的影响,为后续进一步探究猪脂肪细胞内FABP1和FABP2基因对脂肪酸代谢的调控作用打下基础。【方法】采集香苏杂交猪和柯乐猪的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、大肠、小肠、背最长肌及脂肪等组织样品提取总RNA,利用PCR克隆香苏杂交猪FABP1和FABP2基因编码区(CDS)序列,通过ProtParam、ProtScale、SOPMA、SWISS-MODEL、PSORTⅡPreadict及SignalP-5.0等在线软件进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR检测FABP1和FABP2基因在香苏杂交猪和柯乐猪各组织中的表达情况。【结果】香苏杂交猪FABP1和FABP2基因CDS序列分别为384和399 bp,分别编码127和132个氨基酸残基,对应的编码蛋白相对分子量为14107.23和15217.34 Da,均为亲水性蛋白;其二、三级结构均以β-折叠和无规则卷曲为主,无信号肽剪切位点,主要定位于细胞质。香苏杂交猪FABP1和FABP2氨基酸序列表现为与人类、牛、山羊的FABP1和FABP2氨基酸序列高度同源,对应的相似性均在80.0%以上,除斑马鱼外,与其他参考物种的相似性也在74.0%以上,故推测FABP1和FABP2基因序列的保守性较高;STRING预测结果显示,与这2个蛋白可能互作的蛋白有FABP5、FABP7、过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)、猪载脂蛋白A4(APOA4)、APOA1及脂酰辅酶A氧化酶1(ACOX1)等。FABP1和FABP2基因在香苏杂交猪和柯乐猪的各组织中均有表达,且以在肝脏、小肠和脂肪中的相对表达量较高,而背最长肌中的相对表达量最低;此外,FABP1和FABP2基因在香苏杂交猪肝脏和小肠中的相对表达量极显著高于其在柯乐猪对应组织中的相对表达量(P<0.01)。【结论】FABP1和FABP2基因在猪的各组织中均有表达,且以在甘油三酯和脂肪酸合成代谢的相关组织(肝脏、小肠和脂肪)中特异性高表达,可能对脂肪的合成代谢起重要调控作用。 展开更多

关键词 猪 fabp1基因 FABP2基因 分子特征 脂肪酸代谢

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基于转录组分析干扰FABP1基因对猪肌内脂肪沉积的影响 被引量：5

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作者 熊讯 阮涌 许厚强 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期724-734,共11页

【目的】探究FABP1基因对猪肌内脂肪细胞生物学功能的影响机制,为进一步研究FABP1对猪肌内脂肪沉积和脂质代谢的调控作用提供参考依据。【方法】将sh-FABP1干扰载体和空载体sh-NC分别转染至香苏杂交猪肌内脂肪细胞中,36 h后收集转染后... 【目的】探究FABP1基因对猪肌内脂肪细胞生物学功能的影响机制,为进一步研究FABP1对猪肌内脂肪沉积和脂质代谢的调控作用提供参考依据。【方法】将sh-FABP1干扰载体和空载体sh-NC分别转染至香苏杂交猪肌内脂肪细胞中,36 h后收集转染后的肌内脂肪细胞,采用TRIzol^(®)Reagent总RNA提取试剂盒提取总RNA,待样本质检合格后,每个样品制备1µg的RNA总量用于测序。运用生物信息学进行基因表达水平分析(基因表达水平计算、样本间相关性评估)、基因差异表达分析[差异表达基因(DEGs)筛选和统计、DEGs火山图]和功能富集分析(GO富集分析、KEGG富集分析)。最后分别挑选4个上调基因和4个下调基因运用实时荧光定量PCR验证转录组测序数据。【结果】sh-FABP1与sh-NC之间总共筛选出1129个DEGs,与sh-NC组相比,sh-FABP1上调基因有624个,包括PRKAR2A、ACSL5、ELOVL5和MAPK1等;下调基因有505个,包括LPL、FABP3、IGFBP4和OLR1等。对sh-FABP1与sh-NC之间的DEGs进行功能富集分析,KEGG富集发现上调基因主要在细胞周期(Cell cycle)、肿瘤抑制蛋白(p53)和Notch信号通路中富集,下调基因主要富集在过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路中。GO注释表明,有22个、15个和9个GO术语分别在生物过程(BP)、细胞成分(CC)和分子功能(MF)中显著富集(P<0.05,下同),显示与脂肪沉积相关具有显著差异的GO术语包括生物粘附(Biological adhesion)、生物调节(Biological regulation)、生物过程调节(Regulation of biological process)和代谢过程(Metabolic process)。【结论】FABP1基因可能通过调节LPL、FABP3、IGFBP4和OLR1等相关基因的表达、脂肪沉积和脂质代谢相关通路,从而调节脂质生成和代谢。 展开更多

关键词 猪 fabp1基因 脂肪沉积 脂质代谢 转录组测序分析

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干扰FABP1基因对猪肌内脂肪沉积的影响 被引量：2

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作者 熊讯 李永 +1 位作者 阮涌 许厚强 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期2454-2464,共11页

【目的】明确FABP1基因对猪肌内脂肪细胞脂肪酸和脂肪合成的影响,为进一步解析FABP1基因对猪肌内脂肪沉积和脂质代谢的调控作用提供依据。【方法】设计香苏杂交猪FABP1基因干扰载体的靶序列并合成,通过载体连接构建shRNA-FABP1干扰载体... 【目的】明确FABP1基因对猪肌内脂肪细胞脂肪酸和脂肪合成的影响,为进一步解析FABP1基因对猪肌内脂肪沉积和脂质代谢的调控作用提供依据。【方法】设计香苏杂交猪FABP1基因干扰载体的靶序列并合成,通过载体连接构建shRNA-FABP1干扰载体并测序验证;将正确的干扰靶序列转染猪肌内脂肪细胞,通过转染效果和实时荧光定量PCR筛选干扰效率最高的靶序列进行后续试验。采用TRIzol®Reagent总RNA提取试剂盒提取转染shRNA-FABP1干扰载体后的猪肌内脂肪细胞的总RNA,以cDNA为模板进行实时荧光定量PCR检测脂肪沉积相关基因的相对表达量。运用气相色谱—质谱联用仪靶向检测猪肌内脂肪细胞内中长链脂肪酸(LCFA)的含量;采用GPO-PAP酶法检测猪肌内脂肪细胞甘油三酯(Triglyceride,TG)和胆固醇的含量。【结果】成功构建了shRNA-FABP1干扰载体并筛选出最佳干扰效率片段。FABP1基因干扰显著(P<0.05,下同)或极显著(P<0.01,下同)降低了脂肪沉积相关基因的相对表达量,包括LPL、FABP3、IGFBP4和OLR1。在FABP1基因干扰后的猪肌内脂肪细胞中共检测出38种脂肪酸,29种脂肪酸有差异;其中,FABP1基因干扰上调包括棕榈酸(C16:0)、硬脂酸(C18:0)和油酸(C18:1N9)等17种脂肪酸的比例,下调包括二十碳五烯(C20:5N3)、十七碳烯酸(C17:1N7)和十三烷酸(C13:0)等12种脂肪酸的比例。FABP1基因干扰显著或极显著降低了香苏杂交猪肌内脂肪细胞内TG和胆固醇的含量。【结论】干扰FABP1基因通过抑制与脂肪酸转运和TG合成相关基因的表达,从而改变脂肪酸的组成比例,降低TG和胆固醇的含量。 展开更多

关键词 猪 fabp1基因 脂肪酸 甘油三酯 脂肪沉积

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长江刀鲚FABP1基因遗传多态性及其与生长性状的相关性分析

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作者 于爱清 施永海 +2 位作者 徐嘉波 严银龙 邓平平 《水产科技情报》 2023年第5期273-283,共11页

为选育出具有优良生长性状的长江刀鲚(Coilia ectenes)新品系,通过对长江刀鲚FABP1基因cDNA和DNA序列进行克隆、扩增和多态性SNP位点的筛选,初步分析这些位点与其生长性状的相关性。基于长江刀鲚的转录组数据,利用基因克隆技术获取长江... 为选育出具有优良生长性状的长江刀鲚(Coilia ectenes)新品系,通过对长江刀鲚FABP1基因cDNA和DNA序列进行克隆、扩增和多态性SNP位点的筛选,初步分析这些位点与其生长性状的相关性。基于长江刀鲚的转录组数据,利用基因克隆技术获取长江刀鲚FABP1基因的cDNA和DNA序列,然后利用直接测序法筛选获得该基因上的SNP位点并进行基因分型,最后利用最小二乘法分析基因多态性及其与刀鲚生长性状的相关性。结果显示,该基因cDNA全长525 bp,开放式阅读框(ORF)由384个核苷酸组成,编码127个氨基酸;基因组DNA全长1 285 bp,包括4个外显子和3个内含子;共检测到14个SNP位点,分布于第1、2、3内含子和第3外显子上;14个位点的不同基因型与长江刀鲚的体长、体高和体质量性状没有显著的相关性(P>0.05);14个位点对长江刀鲚养殖群体遗传分析显示,刀鲚养殖群体的平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)和平均多态信息含量(PIC)分别为0.476、0.436和0.348。结果表明,长江刀鲚FABP1基因上的14个SNP位点虽然与其生长性状没有显著相关性,但是能够应用于长江刀鲚养殖群体的种质资源评估和分子标记辅助育种研究。 展开更多

关键词 长江刀鲚 fabp1 生长性状 单核苷酸多态性 关联分析

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藏猪和大约克猪FABP1基因多态性及差异表达分析

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作者 杨绍康 常振宇 +2 位作者 严飞飞 商鹏 强巴央宗 《高原农业》 2023年第4期400-408,共9页

本文旨在探究FABP1基因在猪脂肪沉积性状中所发挥的作用,试验选用180日龄藏猪与大约克猪,对藏猪和大约克猪FABP1基因5’侧翼区(起始密码子上游3000 bp左右序列)进行了单核苷酸多态性(SNPs)位点筛选,并分析其对FABP1基因转录的影响。采用... 本文旨在探究FABP1基因在猪脂肪沉积性状中所发挥的作用,试验选用180日龄藏猪与大约克猪,对藏猪和大约克猪FABP1基因5’侧翼区(起始密码子上游3000 bp左右序列)进行了单核苷酸多态性(SNPs)位点筛选,并分析其对FABP1基因转录的影响。采用RT-qPCR检测两试验猪种在肝脏、背最长肌和背脂组织中的FABP1基因的mRNA相对表达量。结果显示,在FABP1基因5’侧翼区存在A-1717G、G-1701A、C-1547T、T-1523C、C-1484A、C-1453A、G-1377A、T-1331G共8个突变位点。在藏猪和大约克猪背最长肌、背脂和肝脏组织中FABP1基因的mRNA相对表达量趋势基本一致,FABP1基因在两品种肝脏组织中的表达量最高。FABP1基因在两品种间8个突变的位点的P值均为极显著差异,通过转录因子预测发现在A-1717G、C-1484A、C-1453A以及G-1377A四个位点中均存在与脂肪相关的转录因子出现或消失。综上,FABP1基因可能为调控脂肪沉积的关键基因。 展开更多

关键词 藏猪 fabp1基因 脂肪沉积 SNPS

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肝硬化并门静脉血栓脂代谢相关差异蛋白的研究

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作者 熊静平 范晓棠 张跃新 《肝脏》 2019年第6期645-648,共4页

目的 筛选肝硬化合并门静脉血栓(Portal vein thrombosis,PVT)患者的血清差异表达蛋白,对脂代谢相关差异表达蛋白进行分析。方法 收集2015年11月至2016年11月在新疆医科大学第一附属医院感染疾病中心诊治的肝硬化合并PVT患者的血清标本2... 目的 筛选肝硬化合并门静脉血栓(Portal vein thrombosis,PVT)患者的血清差异表达蛋白,对脂代谢相关差异表达蛋白进行分析。方法 收集2015年11月至2016年11月在新疆医科大学第一附属医院感染疾病中心诊治的肝硬化合并PVT患者的血清标本22份,肝硬化未合并PVT患者的血清标本23份。采用相对和绝对同位素定量标记(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)联合色谱质谱技术筛选两组间的血清差异表达蛋白,对脂代谢相关差异表达蛋白进行生物信息学分析。结果 两组间共检测出800个蛋白,与脂肪代谢相关的蛋白共有17个,其中7个蛋白在两组间有差异,3个差异表达蛋白(APOA1,FABP1,APOB)在脂肪消化和吸收通路中显著富集。结论 APOA1、FABP1、APOB可能为肝硬化发生PVT的潜在生物标志物,值得进一步研究。 展开更多

关键词 肝硬化 门静脉血栓 APOA1 fabp1 APOB

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FABPs基因表达量与高黎贡山猪脂肪酸含量的相关分析

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作者 周戚斌 富国文 +5 位作者 吴玲想 杨世婷 刘珈纶 李文君 吴正明 赵桂英 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期169-173,178,共6页

为探究FABP1、FABP3基因在高黎贡山猪肝脏、背脂和背最长肌3个组织中的相对表达量和脂肪酸含量的关系,本研究以高黎贡山猪为研究对象,采用气相色谱法测定其背最长肌脂肪酸含量,利用RT-qPCR技术检测FABP1、FABP3基因在高黎贡山猪背脂、... 为探究FABP1、FABP3基因在高黎贡山猪肝脏、背脂和背最长肌3个组织中的相对表达量和脂肪酸含量的关系,本研究以高黎贡山猪为研究对象,采用气相色谱法测定其背最长肌脂肪酸含量,利用RT-qPCR技术检测FABP1、FABP3基因在高黎贡山猪背脂、背最长肌和肝脏中的相对表达量,并与脂肪酸含量进行相关分析。高黎贡山猪FABP1基因的表达趋势为:肝脏>背脂>背最长肌,FABP3基因的表达趋势为:背最长肌>肝脏>背脂;经与脂肪酸含量进行相关性分析,发现在肝脏组织中FABP1基因与十九酸的含量呈显著负相关;在背最长肌组织中FABP3基因与二十二碳一烯酸含量呈显著正相关,与二十碳五烯酸呈极显著正相关。结果表明,FABP3基因与高黎贡山猪多不饱和脂肪酸中的二十二碳一烯酸和二十碳五烯酸含量有相关性,但FABP1、FABP3能否作为影响高黎贡山猪脂肪酸含量的关键基因还需进一步探究。 展开更多

关键词 fabp1 FABP3 高黎贡山猪 基因表达量 脂肪酸

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基于生物信息学方法筛选精原细胞瘤进展中的脂代谢关键基因

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作者 闫墨 刘帅兵 +2 位作者 王楷斌 陈铭哲 杨阔 《天津医科大学学报》 2022年第6期585-590,597,共7页

目的:通过生物信息学方法筛选精原细胞瘤进展中的与脂代谢相关的关键基因,分析脂肪酸结合蛋白1(FABP1)在其中可能发挥的作用机制。方法:于TCGA下载精原细胞瘤测序及临床数据,同GSEA网站下载脂代谢相关基因集共同分析,筛选出Ⅱ期、Ⅲ期... 目的:通过生物信息学方法筛选精原细胞瘤进展中的与脂代谢相关的关键基因,分析脂肪酸结合蛋白1(FABP1)在其中可能发挥的作用机制。方法:于TCGA下载精原细胞瘤测序及临床数据,同GSEA网站下载脂代谢相关基因集共同分析,筛选出Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅰ期之间的与脂代谢相关的差异基因(MRGs)及关键基因FABP1,利用免疫组化对其表达进行验证,分析其与MRGs表达的相关性、甲基化水平、免疫浸润程度及对预后的影响。结果:Ⅱ期、Ⅲ期精原细胞瘤存在61个上调、4个下调的MRGs。FABP1与差异显著的MRGs有较强的相关性(P<0.01),GK2、AWAT2、DGAT2L6、ELOVL3在多个甲基化探针均表现明显的甲基化(r=-0.744--0.489,均P<0.001)。FABP1与自然杀伤细胞(NK细胞)、中央记忆型T细胞(Tcm细胞)、辅助性T细胞(Th细胞)均存在显著的相关关系(均P<0.01);不同FABP1表达的样本中具有明显的免疫浸润(P<0.001)及基质成分(P<0.01)差异。高表达FABP1则能显著降低患者无进展生存期。结论:FABP1作为脂代谢关键基因,可能与其他MRGs通过共表达,改变自身甲基化及组织免疫浸润水平,共同促进精原细胞瘤的进展。 展开更多

关键词 精原细胞瘤 TCGA 脂质代谢 fabp1 免疫浸润

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肝性脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性表达与NAFLD的相关性 被引量：6

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作者 姜华 高建鹏 +3 位作者 胡阳 张志波 宋丹 王鑫 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第1期84-88,共5页

目的分析肝性脂肪酸结合蛋白(liver fatty acid-binding protein,FABP1)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与非酒精性脂肪肝病(non⁃alcoholic fatty liver disease,NAFLD)的关联。探讨其对NAFLD易患性早期预防的... 目的分析肝性脂肪酸结合蛋白(liver fatty acid-binding protein,FABP1)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与非酒精性脂肪肝病(non⁃alcoholic fatty liver disease,NAFLD)的关联。探讨其对NAFLD易患性早期预防的可能性。方法选择2015年9月至2018年9月在本院就诊的80例NAFLD患者及正常体检者80例为对照组。研究FABP 1(rs2241883 T/C和rs 1545224G/A)的基因型和单倍型。结果与对照组相比,NAFLD患者中FABP1(rs2241883T/C和rs1545224G/A)的基因型和单倍型存在显着差异。具有至少一个rs2241883 C等位基因(TC或CC基因型)拷贝的个体发生NAFLD的风险升高(OR=1.32,95%CI:1.01~1.71),并且具有rs1545224 A等位基因(GA或AA基因型)的个体也具有显著增加的NAFLD风险(OR=1.52,95%CI:1.14~2.02)。两个SNP的累积效应分析显示,具有两种风险基因型的个体比没有风险基因型的个体具有显着更高的NAFLD风险,并且随着风险基因型数量的增加,观察到风险增加的显着趋势。分层分析显示,rs2241883 C等位基因携带者的LDL-C水平较高,而rs1545224 A等位基因携带者的FPG水平高于没有该等位基因的人群。结论FABP1是肝脏脂质代谢的关键调节因子,FABP1基因多态性与NAFLD之间显著相关。 展开更多

关键词 肝性脂肪酸结合蛋白 单核苷酸多态性 非酒精性脂肪肝病

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