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基于深腾7000系统的大规模CFD并行计算
被引量:
3
1
作者
周磊
谭伟伟
+1 位作者
张凯宁
韩俊杰
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第S1期87-90,共4页
从基本流动控制方程及数值离散、多重网格、并行算法等方面详细阐述了混合网格框架下计算流体力学软件的基本原理,提出了采用三重嵌套循环结构在时间推进格式中实现多重网格加速及并行计算技术的主流程设计方案;同时给出了高精度混合网...
从基本流动控制方程及数值离散、多重网格、并行算法等方面详细阐述了混合网格框架下计算流体力学软件的基本原理,提出了采用三重嵌套循环结构在时间推进格式中实现多重网格加速及并行计算技术的主流程设计方案;同时给出了高精度混合网格并行计算软件在深腾7000系统上的大规模并行测试结果以及在某型民用飞机高升力流场数值模拟中的应用.结果表明:此高精度混合网格并行计算软件在采用千万网格点规模的大型飞机高升力复杂流场计算时,不仅计算结果与实验结果符合较好,且在2 048核并行计算时仍具有很好的并行可扩展性,计算效率不低于80%.
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关键词
计算流体力学
并行计算
并行可扩展性
多重网格
深腾
7000
系统
原文传递
超级计算环境计算配额系统设计和实现
被引量:
6
2
作者
牛铁
朱鹏
+1 位作者
赵毅
曹宗雁
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2010年第12期8-9,39,共3页
在超级计算环境中,为避免计算资源滥用,确保每个用户有机会利用超级计算机求解生产、科研中的复杂问题,产出更多成果,在定期采集、解析作业日志的基础上,通过LSF API、shell编程,设计和实现了一套计算配额系统,用于对用户计算资源的配...
在超级计算环境中,为避免计算资源滥用,确保每个用户有机会利用超级计算机求解生产、科研中的复杂问题,产出更多成果,在定期采集、解析作业日志的基础上,通过LSF API、shell编程,设计和实现了一套计算配额系统,用于对用户计算资源的配额、限制及使用情况统计分析。该系统已运行于中国科学院超级计算环境百万亿次超级计算机深腾7000中,效果良好。
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关键词
超级计算环境
LSF
计算配额
计算机时
深腾
7000
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职称材料
天体大规模数值模拟软件性能优化
3
作者
孙相征
张云泉
+2 位作者
王婷
杨超
李力刚
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第S1期51-54,共4页
在百万亿次超级计算机深腾7000上进行了基于Aztec库和PETSc库的天体大规模数值模拟程序对比测试,并对性能测试结果进行了分析.实验结果表明,当8核/节点时,PETSc程序运行时间是Aztec程序的23.34%~41.10%,平均为29.31%;当4核/节点时,PETS...
在百万亿次超级计算机深腾7000上进行了基于Aztec库和PETSc库的天体大规模数值模拟程序对比测试,并对性能测试结果进行了分析.实验结果表明,当8核/节点时,PETSc程序运行时间是Aztec程序的23.34%~41.10%,平均为29.31%;当4核/节点时,PETSc程序运行时间是Aztec程序的19.72%~31.34%,平均为24.97%.在测试过程中,还观察到同样的问题规模和处理器核数,每节点采用4个处理器核比采用8个处理器核时的运行时间,在基于Aztec库的情况下平均下降29%,在基于PETSc软件包的情况下平均下降36%.此外,还给出了对PETSc程序进一步对角线存储优化的结果.实验结果体现了深腾7000提供的有效支持,对软件下一步的优化研究有指导意义.
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关键词
天体数值模拟
深腾
7000
性能测试
可扩展性
Aztec库
PETSc库
原文传递
三维低速机翼增升装置流动分离的雷诺数效应研究
被引量:
1
4
作者
李中武
梁益华
+1 位作者
周磊
张小莉
《科研信息化技术与应用》
2012年第5期42-47,共6页
利用中国科学院计算机网络信息中心的深腾7000超级计算机系统,在MPI环境下测试分析了32~384核并行计算的时间成本和并行效率,测试表明128核并行计算具有最佳“时间&效率”,并选择此计算加载状态开展计算研究。通过求解RANS方程,...
利用中国科学院计算机网络信息中心的深腾7000超级计算机系统,在MPI环境下测试分析了32~384核并行计算的时间成本和并行效率,测试表明128核并行计算具有最佳“时间&效率”,并选择此计算加载状态开展计算研究。通过求解RANS方程,研究了雷诺数对三维机翼增升装置流场特性与流动分离特性的影响,计算雷诺数范围1.75×10620.0×10^6,分析表明,随着雷诺数的增大,外襟翼上分离位置逐渐向后缘移动,吸力峰值变大。与此现象相对应的升力系数逐渐增大,力矩系数变小。在雷诺数达到10^7量级时,升力系数及力矩系数的变化趋于平缓,而在雷诺数为5.0×10^6之前,增升装置的气动力对雷诺数影响十分敏感。
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关键词
流动分离
雷诺数效应
增升装置
深腾
7000
原文传递
NWCHEM软件在生物体系中的应用
5
作者
张宝花
李国辉
+3 位作者
魏帆
刘倩
金钟
迟学斌
《科研信息化技术与应用》
2011年第6期113-119,共7页
生物体系结构和功能比较复杂,对其进行简单的振动柔性分析,研究构象变化以及原子分子之间相互作用势的精确度问题等都非常费时费力。我们可以将研究体系分割成合适的小片段后,使用量子化学程序进行精确计算,再采用MFCC结合REMD技术来研...
生物体系结构和功能比较复杂,对其进行简单的振动柔性分析,研究构象变化以及原子分子之间相互作用势的精确度问题等都非常费时费力。我们可以将研究体系分割成合适的小片段后,使用量子化学程序进行精确计算,再采用MFCC结合REMD技术来研究生物体系精确作用问题。本文使用NWCHEM软件计算不同规模大小的"多肽"体系在深腾7000的不同架构节点上随处理器核数的加速效率,以确定大生物体系分割研究片段的大小和计算采取的处理器核数,并以此分析NWCHEM软件在生物体系研究中的适用性。
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关键词
NWCHEM
并行计算
深腾
7000
多肽
原文传递
题名
基于深腾7000系统的大规模CFD并行计算
被引量:
3
1
作者
周磊
谭伟伟
张凯宁
韩俊杰
机构
中国航空计算技术研究所
出处
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第S1期87-90,共4页
基金
国家高技术研究发展计划资助项目(2009AA01A139)
航空基金资助项目(20081431003)
文摘
从基本流动控制方程及数值离散、多重网格、并行算法等方面详细阐述了混合网格框架下计算流体力学软件的基本原理,提出了采用三重嵌套循环结构在时间推进格式中实现多重网格加速及并行计算技术的主流程设计方案;同时给出了高精度混合网格并行计算软件在深腾7000系统上的大规模并行测试结果以及在某型民用飞机高升力流场数值模拟中的应用.结果表明:此高精度混合网格并行计算软件在采用千万网格点规模的大型飞机高升力复杂流场计算时,不仅计算结果与实验结果符合较好,且在2 048核并行计算时仍具有很好的并行可扩展性,计算效率不低于80%.
关键词
计算流体力学
并行计算
并行可扩展性
多重网格
深腾
7000
系统
Keywords
computational fluid dynamics
parallel computing
parallel scalability
multigrid
deepcomp 7000
system
分类号
N55 [自然科学总论]
原文传递
题名
超级计算环境计算配额系统设计和实现
被引量:
6
2
作者
牛铁
朱鹏
赵毅
曹宗雁
机构
中国科学院计算机网络信息中心
出处
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2010年第12期8-9,39,共3页
基金
国家863计划项目(2006AA01A116)
中国科学院信息化专项(INFO-115-B01)
文摘
在超级计算环境中,为避免计算资源滥用,确保每个用户有机会利用超级计算机求解生产、科研中的复杂问题,产出更多成果,在定期采集、解析作业日志的基础上,通过LSF API、shell编程,设计和实现了一套计算配额系统,用于对用户计算资源的配额、限制及使用情况统计分析。该系统已运行于中国科学院超级计算环境百万亿次超级计算机深腾7000中,效果良好。
关键词
超级计算环境
LSF
计算配额
计算机时
深腾
7000
Keywords
supercomputing environment
LSF
computation quota
computing time
deepcomp 7000
分类号
TP338 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
天体大规模数值模拟软件性能优化
3
作者
孙相征
张云泉
王婷
杨超
李力刚
机构
中国科学院软件研究所
中国科学院计算机科学国家重点实验室
中国科学院研究生院
中国科学院上海天文台
出处
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第S1期51-54,共4页
基金
国家高技术研究发展计划资助项目(2006AA01A125
2009AA01A134
+2 种基金
2009AA01A129)
国家科技重大专项资助项目(2009ZX01036-001-002)
中国科学院知识创新工程领域前沿资助项目(ISCAS2009-DR05)
文摘
在百万亿次超级计算机深腾7000上进行了基于Aztec库和PETSc库的天体大规模数值模拟程序对比测试,并对性能测试结果进行了分析.实验结果表明,当8核/节点时,PETSc程序运行时间是Aztec程序的23.34%~41.10%,平均为29.31%;当4核/节点时,PETSc程序运行时间是Aztec程序的19.72%~31.34%,平均为24.97%.在测试过程中,还观察到同样的问题规模和处理器核数,每节点采用4个处理器核比采用8个处理器核时的运行时间,在基于Aztec库的情况下平均下降29%,在基于PETSc软件包的情况下平均下降36%.此外,还给出了对PETSc程序进一步对角线存储优化的结果.实验结果体现了深腾7000提供的有效支持,对软件下一步的优化研究有指导意义.
关键词
天体数值模拟
深腾
7000
性能测试
可扩展性
Aztec库
PETSc库
Keywords
celestial body simulation
deepcomp 7000
performance evaluation
scalability
Aztec package
PETSc package
分类号
TP319 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
P1 [天文地球—天文学]
原文传递
题名
三维低速机翼增升装置流动分离的雷诺数效应研究
被引量:
1
4
作者
李中武
梁益华
周磊
张小莉
机构
中国航空工业集团公司第六三一研究所气动数值模拟航空科技重点实验室
出处
《科研信息化技术与应用》
2012年第5期42-47,共6页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)(2012AA01A304)
文摘
利用中国科学院计算机网络信息中心的深腾7000超级计算机系统,在MPI环境下测试分析了32~384核并行计算的时间成本和并行效率,测试表明128核并行计算具有最佳“时间&效率”,并选择此计算加载状态开展计算研究。通过求解RANS方程,研究了雷诺数对三维机翼增升装置流场特性与流动分离特性的影响,计算雷诺数范围1.75×10620.0×10^6,分析表明,随着雷诺数的增大,外襟翼上分离位置逐渐向后缘移动,吸力峰值变大。与此现象相对应的升力系数逐渐增大,力矩系数变小。在雷诺数达到10^7量级时,升力系数及力矩系数的变化趋于平缓,而在雷诺数为5.0×10^6之前,增升装置的气动力对雷诺数影响十分敏感。
关键词
流动分离
雷诺数效应
增升装置
深腾
7000
Keywords
Flow Separtation
Reynolds number effect
High_lift device
deepcomp 7000
分类号
TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
原文传递
题名
NWCHEM软件在生物体系中的应用
5
作者
张宝花
李国辉
魏帆
刘倩
金钟
迟学斌
机构
中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心
中国科学院大连化学物理研究所分子反应动力学国家重点实验室
出处
《科研信息化技术与应用》
2011年第6期113-119,共7页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)(2009AA01A130)
(2009AA01A137)
文摘
生物体系结构和功能比较复杂,对其进行简单的振动柔性分析,研究构象变化以及原子分子之间相互作用势的精确度问题等都非常费时费力。我们可以将研究体系分割成合适的小片段后,使用量子化学程序进行精确计算,再采用MFCC结合REMD技术来研究生物体系精确作用问题。本文使用NWCHEM软件计算不同规模大小的"多肽"体系在深腾7000的不同架构节点上随处理器核数的加速效率,以确定大生物体系分割研究片段的大小和计算采取的处理器核数,并以此分析NWCHEM软件在生物体系研究中的适用性。
关键词
NWCHEM
并行计算
深腾
7000
多肽
Keywords
NWCHEM
Parallel computation
deepcomp 7000
Peptide
分类号
TP31 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于深腾7000系统的大规模CFD并行计算
周磊
谭伟伟
张凯宁
韩俊杰
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011
3
原文传递
2
超级计算环境计算配额系统设计和实现
牛铁
朱鹏
赵毅
曹宗雁
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2010
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
天体大规模数值模拟软件性能优化
孙相征
张云泉
王婷
杨超
李力刚
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
原文传递
4
三维低速机翼增升装置流动分离的雷诺数效应研究
李中武
梁益华
周磊
张小莉
《科研信息化技术与应用》
2012
1
原文传递
5
NWCHEM软件在生物体系中的应用
张宝花
李国辉
魏帆
刘倩
金钟
迟学斌
《科研信息化技术与应用》
2011
0
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