期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到2,893篇文章
< 1 2 … 145 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
热带珊瑚岛有害植物入侵对丛枝菌根真菌和固氮菌群落结构的影响
1
作者 张静 王俊 +6 位作者 黄良焕 吴文佳 张玲玲 王佩越 倪广艳 任海 刘占锋 《生态学报》 北大核心 2026年第4期2135-2148,共14页
生物入侵显著改变了土壤中功能微生物群落的组成,进而影响本土植物的养分吸收及其群落结构。热带珊瑚岛由于植物群落结构简单且存在养分限制,极易受到植物入侵的影响,进而影响功能微生物发挥作用。以我国热带珊瑚岛生态系统为研究对象,... 生物入侵显著改变了土壤中功能微生物群落的组成,进而影响本土植物的养分吸收及其群落结构。热带珊瑚岛由于植物群落结构简单且存在养分限制,极易受到植物入侵的影响,进而影响功能微生物发挥作用。以我国热带珊瑚岛生态系统为研究对象,以未有植物定植的光裸地作为对照,并采集8种入侵的有害植物和2种本土植物的根际土壤,采用高通量测序的方法,探讨了植物入侵对珊瑚岛植物根际功能微生物(丛枝菌根真菌(arbuscular mycorrhizal fungi,AMF)和固氮菌(nifH))群落的影响及其驱动因素。研究结果表明:1)有害植物和本土植物在珊瑚岛的定植显著影响了功能微生物的α多样性。具体而言,AMF丰富度指数在乡土植物根际土壤显著高于入侵植物根际土壤和光裸地(P<0.05),而Shannon-Wiener指数(Shannon-wiener index)呈现本土植物>光裸地(P<0.05),但与有害植物根际无显著差异;nifH的丰富度指数和Shannon-Wiener指数呈现有害植物>对照≈本土植物(P<0.05);8种入侵植物根际土壤之间的AMF和nifH的α多样性指数具有显著差异;2)AMF和nifH的β多样性在不同入侵植物物种之间具有显著差异,有害和本土植物定植显著改变了其β多样性(P<0.05),并显著改变了AMF、nifH和AMF+nifH的共发生网络的子网络拓扑参数度和平均路径长度(P<0.05),但对介数中心性无显著影响;3)冗余分析表明,AMF和固氮菌的物种多样性和群落结构主要受土壤有效氮、磷和植物叶片氮、磷含量的影响,而子网络拓扑参数则主要受叶片碳、土壤有机碳和铵态氮的驱动。综上所述,在热带珊瑚岛养分限制条件下,有害植物的快速入侵对功能微生物α多样性的影响在AMF和固氮菌群落具有相反趋势,但都显著改变了群落结构和共发生网络的子网络拓扑参数。本研究为热带珊瑚岛地上-地下群落的快速构建、土壤恢复及有害植物防控提供了重要的理论依据和实践参考。 展开更多
关键词 丛枝菌根真菌 固氮微生物 热带珊瑚岛 微生物共发生网络 微生物多样性
在线阅读 下载PDF
襄阳地区高温大曲发酵过程中细菌群落演替与功能预测分析
2
作者 赵慧君 易宗伟 +4 位作者 王玉荣 倪慧 叶明波 郭壮 侯强川 《现代食品科技》 北大核心 2026年第2期86-95,共10页
本研究以采集的32份不同发酵时期高温大曲作为研究对象,采用16S rRNA测序技术对高温大曲发酵过程中细菌群落多样性进行了解析,并结合PICRUSt软件对细菌基因功能进行了预测。研究结果显示,不同发酵时期高温大曲细菌丰富度和群落结构差异... 本研究以采集的32份不同发酵时期高温大曲作为研究对象,采用16S rRNA测序技术对高温大曲发酵过程中细菌群落多样性进行了解析,并结合PICRUSt软件对细菌基因功能进行了预测。研究结果显示,不同发酵时期高温大曲细菌丰富度和群落结构差异显著(P<0.05),且随着发酵的进行,细菌丰富度呈现先上升后下降的趋势,在一次翻曲时达到最高。高温大曲发酵过程中共检测到3个优势细菌门和10个优势细菌属,在不同发酵时期样品中具有明显的群落演替,同时从所有样品中共检测到10个核心OTU,主要隶属于糖多孢菌属(Saccharopolyspora)、高温放线菌属(Thermoactinomyces)、芽孢杆菌属(Bacillus)、克罗彭斯特菌属(Kroppenstedtia)和慢生芽孢杆菌属(Lentibacillus),累积平均相对含量为52.62%。不同发酵时期高温大曲之间细菌微生物网络存在明显差异,其中一次翻曲样品的细菌群落复杂性较高且连通性较好,且岩石芽孢杆菌属(Scopulibacillus)和Bacillus是维持高温大曲发酵过程中微生物群落结构稳定的关键细菌属。新陈代谢是高温大曲发酵过程中的重要功能通路,包括能源生产和转化以及氨基酸、碳水化合物、脂质等生物大分子运输和代谢。该研究强化了人们对高温大曲发酵过程中细菌群落演替的认识,同时为相关企业制曲工艺的优化和产品品质的改善提供了有益参考。 展开更多
关键词 不同发酵时期 高温大曲 细菌群落 共现性网络 基因功能预测
在线阅读 下载PDF
对接、转化与共创:产教融合网络建构的多重嵌入逻辑
3
作者 李冲 张丹 王良 《教育学术月刊》 北大核心 2026年第1期51-60,共10页
产教融合是教育、科技、人才一体推进的突破口,面对“两张皮、三热三不热”等堵点问题,构建稳定高效的产教融合网络尤为必要,而这背后的逻辑与路径还缺乏理论探讨。以我国产教融合典型案例为样本,采用程序化扎根理论方法,探讨了产教融... 产教融合是教育、科技、人才一体推进的突破口,面对“两张皮、三热三不热”等堵点问题,构建稳定高效的产教融合网络尤为必要,而这背后的逻辑与路径还缺乏理论探讨。以我国产教融合典型案例为样本,采用程序化扎根理论方法,探讨了产教融合网络建构的逻辑与路径。研究发现,产教融合网络建构本质是基于“供需对接—资源转化—价值共创”的价值创造过程,建构路径是包含业务—技术嵌入、关系—结构嵌入、制度—认知嵌入多层嵌套性的嵌入过程。研究拓展了产教融合网络建构的理论研究,丰富了供需对接、资源转化与价值共创在网络构建中的作用机理,对促进产教融合走深走实具有实践启示。 展开更多
关键词 产教融合 供需对接 资源转化 价值共创 网络建构
原文传递
根植性视角下生态产品价值共创网络的形成机制研究
4
作者 姬志恒 张仲杰 +1 位作者 吕长鑫 于伟 《宏观经济研究》 北大核心 2026年第1期96-110,共15页
深入理解价值共创网络的形成是建立健全生态产品价值实现机制的前提之一。本文基于根植性视角,以生态产品价值实现典型案例为研究对象,利用文本挖掘数据构建价值共创网络,进而运用指数随机图模型揭示内生和外生因素对价值共创网络形成... 深入理解价值共创网络的形成是建立健全生态产品价值实现机制的前提之一。本文基于根植性视角,以生态产品价值实现典型案例为研究对象,利用文本挖掘数据构建价值共创网络,进而运用指数随机图模型揭示内生和外生因素对价值共创网络形成的影响。研究发现:(1)各典型路径的价值共创网络均呈现局部密集特征和极化现象。“外溢共享型”网络和“赋能增值型”网络密度偏小,前者受中介性的正向驱动和传递性的负向影响,后者受中介性和传递性的促进作用,二者均倾向于深耕合作关系;“配额交易型”网络和“综合治理型”网络密度偏大,中介性产生抑制效应而传递性具有正向影响,二者均倾向于广泛建立合作。(2)四类网络中政府、市场与社会主体间的合作侧重有所不同,呈现“政府扶持—市场联动”“政府主导—社会参与”“政企协同—社会深化”三种驱动模式。(3)“外溢共享型”网络和“配额交易型”网络受制度根植性正向驱动,文化根植性促进“赋能增值型”网络和“综合治理型”网络的形成,认知根植性正向影响“配额交易型”网络并抑制“赋能增值型”网络的形成。本文基于根植性视角剖析和检验探究价值共创网络形成机制,为生态产品价值共创网络成长提供政策启示。 展开更多
关键词 根植性 生态产品 价值共创网络 指数随机图模型
原文传递
加权基因共表达网络分析结合机器学习筛选及验证骨关节炎生物标记物
5
作者 张倩 黄东锋 《中国组织工程研究》 北大核心 2026年第5期1096-1105,共10页
背景:脂质代谢异常影响软骨细胞代谢,在骨关节炎的发生和进展中有着重要的作用,但目前其机制尚不明确。目的:采用加权基因共表达网络分析结合机器学习算法鉴定骨关节炎软骨细胞脂质代谢特征基因,并进行初步验证。方法:采用加权基因共表... 背景:脂质代谢异常影响软骨细胞代谢,在骨关节炎的发生和进展中有着重要的作用,但目前其机制尚不明确。目的:采用加权基因共表达网络分析结合机器学习算法鉴定骨关节炎软骨细胞脂质代谢特征基因,并进行初步验证。方法:采用加权基因共表达网络分析和微阵列数据的线性模型获得差异共表达基因,结合机器学习方法,最终筛选得到脂质代谢相关的特征基因。通过蛋白质互作网络分析,探究差异共表达基因的蛋白质互作网络关系;采用基因本体论和京都基因与基因组百科全书富集分析探索差异共表达基因所在信号通路;运用免疫相关性分析鉴定特征基因与免疫细胞浸润模式;体外分子实验验证特征基因的mRNA和蛋白表达水平。结果与结论:①经数据标准化处理和主成分分析、加权基因共表达网络分析和微阵列数据的线性模型获得高/低表达的差异共表达基因123和110个;②运用逻辑回归、随机森林和支持向量机3种机器学习算法筛选得到特征基因37个,最终得到2个脂质代谢相关的特征基因SMPD3和CYP4F3;③蛋白质互作网络分析显示SMPD3和CYP4F3蛋白相互作用均较低;④基因本体论结果显示差异共表达基因主要富集在中性粒细胞脱颗粒、中性粒细胞免疫反应和应答、中性粒细胞激活和白细胞脱颗粒等;而京都基因与基因组百科全书富集分析提示差异共表达基因主要涉及细胞外基质受体的作用和黏附等关键通路;⑤基于基因表达数据的细胞类型亚型鉴定分析显示8种免疫细胞在骨关节炎中具有显著差异;相关性分析显示SMPD3与静息态树突状细胞显著正相关(r=0.44,P=3.6×10^(-3)),与中性粒细胞显著负相关(r=-0.48,P=1.7×10^(-3));而CYP4F3与单核细胞和中性粒细胞显著正相关(r=0.76,P=7.6×10^(-9);r=0.73,P=6.0×10^(-8)),与T细胞滤泡辅助细胞和静息态树突状细胞显著负相关(r=-0.38,P=0.01;r=-0.38,P=0.01);⑥体外分子实验证明,在骨关节炎组SMPD3 mRNA和蛋白水平显著增高,而CYP4F3降低;⑦结果显示,骨关节炎软骨细胞脂质代谢特征基因SMPD3和CYP4F3可作为骨关节炎靶向治疗及软骨修复或退变的潜在生物标记物,为深入探究国人群体中脂质代谢异常与骨关节炎的关系及临床靶向治疗提供新策略。 展开更多
关键词 骨关节炎 脂质代谢 加权基因共表达网络分析 机器学习 靶向治疗 软骨修复或退变
暂未订购
制造业国有企业“主体-资源-能力”耦合及驱动机制研究——基于价值共创超网络视角
6
作者 高凯 翟君培 刘婷婷 《软科学》 北大核心 2026年第1期12-19,34,共9页
基于价值共创目标探究超网络内制造业国有企业“主体-资源-能力”耦合协调的互动效应,构建耦合协调度模型分析“主体-资源-能力”耦合协调水平的动态演变趋势及区域空间差异,运用灰色关联度模型进一步分析其驱动机制。研究发现:(1)制造... 基于价值共创目标探究超网络内制造业国有企业“主体-资源-能力”耦合协调的互动效应,构建耦合协调度模型分析“主体-资源-能力”耦合协调水平的动态演变趋势及区域空间差异,运用灰色关联度模型进一步分析其驱动机制。研究发现:(1)制造业国有企业“主体-资源-能力”总体耦合水平逐渐提升,且其相较于制造业民营企业的领先优势逐渐减小;(2)制造业国有企业“主体-资源-能力”耦合水平呈现“东高西低”特征;(3)不同区域内制造业国有企业耦合驱动机制存在差异,东部地区依赖市场化机制和开放型经济,中部地区更受金融支持和市场化改革驱动,而西部地区对金融资本和政策支持的依赖性更强。 展开更多
关键词 制造业国有企业 价值共创 超网络 耦合协调度
原文传递
网红经济背景下直播电商生态系统的价值共创机制、制约因素及治理路径
7
作者 李盼道 荣健博 《西南石油大学学报(社会科学版)》 2026年第1期93-103,共11页
网红经济是互联网技术深度发展所催生的产物,直播电商是网红经济中最具代表性的商业模式。实现直播电商生态价值共创既是直播电商健康良性发展的内在条件,也是网红经济背景下新兴商业模式的发展目标。本文以直播电商为研究对象,以直播... 网红经济是互联网技术深度发展所催生的产物,直播电商是网红经济中最具代表性的商业模式。实现直播电商生态价值共创既是直播电商健康良性发展的内在条件,也是网红经济背景下新兴商业模式的发展目标。本文以直播电商为研究对象,以直播电商价值共创为研究主题,以价值共创理论为研究基础,系统描述网红经济背景下直播电商各生态主体要素及其相互关系,客观阐释直播电商生态系统价值共创的内在机制及其制约因素,深刻揭示直播电商生态系统价值共创的本质。研究认为,直播电商生态价值共创是各主体之间利益互动的结果;根据各生态主体在生态系统中所扮演的角色不同,可将价值共创划分为信任价值共创、产品价值共创、平台价值共创和体验价值共创;其本质是网红直播电商生态各主体克服制约因素并实现价值参与、价值创造和价值提升的过程。 展开更多
关键词 网红经济 直播电商 生态系统 价值共创 数字经济 网络强国
在线阅读 下载PDF
放牧干扰下土壤微生物泛化种和特化种群落的研究
8
作者 江康威 吕程 +4 位作者 王亚菲 李宏 张芷晴 吐尔逊娜依·热依木 张青青 《中国草地学报》 北大核心 2026年第1期1-14,共14页
为揭示天山北坡中段山地草甸微生物群落中泛化种和特化种群落对不同放牧强度的响应,本研究以围封草地为对照,研究轻度放牧、重度放牧以及对照样地中泛化种和特化种的变化特征,并探究放牧干扰下泛化种和特化种群落与土壤因子的关联。结... 为揭示天山北坡中段山地草甸微生物群落中泛化种和特化种群落对不同放牧强度的响应,本研究以围封草地为对照,研究轻度放牧、重度放牧以及对照样地中泛化种和特化种的变化特征,并探究放牧干扰下泛化种和特化种群落与土壤因子的关联。结果显示,与重度放牧相比,轻度放牧显著提高了土壤微生物泛化种和特化种的α多样性(Shannon-Wiener指数)和β多样性。在不同放牧样地中,变形菌门、放线菌门和酸杆菌门是细菌泛化种和特化种群落的优势菌门,子囊菌门、担子菌门和壶菌门是真菌泛化种和特化种群落的优势菌门。随着放牧强度增大,泛化种和特化种群落共现网络结构的节点数目、边数目、平均度和鲁棒性呈先增加后降低的趋势,易损性则呈先降低后上升的趋势。土壤细菌和真菌群落的确定性比例同样随着放牧强度增大呈上升趋势,但二者仍以随机性过程为主导。基于Tax4Fun2和FUNGuild数据库发现,放牧改变了细菌功能类群的代谢能力,并改变真菌功能类群的丰度。Mantel text和随机森林的结果表明,放牧干扰下土壤因子与泛化种和特化种群落存在显著关联,但泛化种的解释率低于特化种。 展开更多
关键词 泛化种 特化种 群落构建 共现网络 功能预测
在线阅读 下载PDF
假单胞菌生物有机肥促进烤烟生长的土壤微生物学机制
9
作者 徐文正 郭芳阳 +5 位作者 王孟孟 刘巧真 韩会阁 李小杰 吴照辉 王典 《中国烟草科学》 北大核心 2026年第1期69-78,共10页
为明确增施假单胞菌生物有机肥影响烤烟生长的土壤微生物学机制,设置常规施肥(CK)、增施传统有机肥(OF)和增施假单胞菌生物有机肥(BF)三个处理,分析其对烤烟单株叶片干质量、根际土壤养分、微生物群落结构及病原真菌相对丰度的影响。结... 为明确增施假单胞菌生物有机肥影响烤烟生长的土壤微生物学机制,设置常规施肥(CK)、增施传统有机肥(OF)和增施假单胞菌生物有机肥(BF)三个处理,分析其对烤烟单株叶片干质量、根际土壤养分、微生物群落结构及病原真菌相对丰度的影响。结果表明,BF显著提高单株叶片干质量,较OF和CK分别提高0.98%和12.1%;与CK相比,BF显著增加了烤后烟叶产值,提高了土壤速效氮、速效磷、速效钾、可溶性有机碳(DOC)含量及微生物共现网络稳定性,显著降低病原真菌相对丰度。随机森林分析表明,DOC、平均聚类系数、平均路径长度和病原真菌相对丰度是影响叶片干质量的关键因子,其中叶片干质量与DOC含量和微生物共现网络聚集系数极显著正相关,与平均路径长度及病原真菌相对丰度负相关。综上,增施假单胞菌生物有机肥可优化根际土壤养分状况与微生物网络结构,抑制病原真菌,促进烤烟生长,较传统有机肥具有更好的应用前景。 展开更多
关键词 烤烟 生物有机肥 微生物群落结构 微生物共现网络 可溶性有机碳
在线阅读 下载PDF
基于WGCNA的辣椒抗疫病关键基因的挖掘
10
作者 石凤岩 魏美君 +2 位作者 王秀雪 张曦 邹春蕾 《园艺学报》 北大核心 2026年第1期257-274,共18页
辣椒疫病是由辣椒疫霉菌侵染引起的一种极具破坏性的土传病害,严重制约辣椒生产。目前辣椒抗疫病的分子机制尚不清楚,抗性基因的挖掘和功能分析是抗病育种的基础和前提。通过前期筛选,获得了对辣椒疫霉菌1、2和3号生理小种均表现免疫性... 辣椒疫病是由辣椒疫霉菌侵染引起的一种极具破坏性的土传病害,严重制约辣椒生产。目前辣椒抗疫病的分子机制尚不清楚,抗性基因的挖掘和功能分析是抗病育种的基础和前提。通过前期筛选,获得了对辣椒疫霉菌1、2和3号生理小种均表现免疫性的辣椒高代自交系ZCM334,该品系在接菌后,所有植株没有任何感病症状。在接菌后不同时间点(0、12、24和48 h)采集ZCM334和感病材料Early Calwonder的根部样本,并进行转录组测序和加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)。共鉴定到17个共表达模块,其中4个与ZCM334抗疫病性呈显著正相关。功能富集分析结果显示,上述4个模块中的基因主要富集在植物激素信号转导、糖酵解、葡萄糖生成以及脂肪酸降解等代谢通路。对这4个模块作相关性分析,预测出12个可能与辣椒抗疫病相关的核心基因,其中包括6个已知功能基因(CA06g02420、CA06g08970、CA01g15560、CA09g14900、CA09g14910和CA09g15310)和6个新基因(novel.5608、novel.2732、novel.3300、novel.752、novel.2181和novel.12038),并构建了基因调控网络。qRT-PCR分析发现,这12个核心基因在ZCM334中显著高表达,且在接菌后24或48 h表达量最高。 展开更多
关键词 辣椒 辣椒疫霉菌 抗病性 基因共表达网络 基因挖掘 核心基因 代谢通路
原文传递
自然越冬过程不同种源天竺桂激素信号转导及转录组分析
11
作者 崔罗敏 殷云龙 +3 位作者 於朝广 喻方圆 陶承友 芦治国 《植物资源与环境学报》 北大核心 2026年第1期25-35,47,共12页
以栽培于江苏南京的安徽、河南和浙江3个种源的天竺桂(Cinnamomum japonicum Siebold)为研究材料,对自然越冬过程其叶片中激素含量和转录组进行分析。结果表明:自然越冬过程河南种源的天竺桂叶片中吲哚乙酸含量显著高于(p<0.05)安徽... 以栽培于江苏南京的安徽、河南和浙江3个种源的天竺桂(Cinnamomum japonicum Siebold)为研究材料,对自然越冬过程其叶片中激素含量和转录组进行分析。结果表明:自然越冬过程河南种源的天竺桂叶片中吲哚乙酸含量显著高于(p<0.05)安徽和浙江种源,安徽种源的天竺桂叶片中脱落酸、水杨酸和赤霉素A1含量总体显著高于河南和浙江种源。转录组测序共获得192466个unigene,进行Nr、Nt、KO、Swiss-Prot、KOG、GO和PFAM 7大数据库的基因功能注释,注释率为54.4%。差异表达基因筛选、k-means聚类分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA)结果表明:植物-病原体互作、淀粉和蔗糖代谢以及植物激素信号转导3个关键KEGG通路显著富集。脱落酸和水杨酸信号通路是天竺桂应对自然越冬的重要代谢通路,其中脱落酸受体基因(PYR/PYL)、蔗糖非发酵激酶基因(SnRK 2)、脱落酸应答元件结合因子基因(ABF)、病程相关基因非表达子1(NPR1)、TGACG结合模体(TGA)转录因子基因和病程相关基因(PR-1)具有重要作用。随机挑选6个差异表达基因的实时荧光定量PCR相对表达量与转录组表达量的变化趋势一致。综上所述,3个种源天竺桂通过特异的激素动态平衡与激素信号通路协同调控适应自然越冬,其中河南种源表现出更强的抗寒代谢调控能力。 展开更多
关键词 天竺桂 自然越冬 植物激素 抗寒性 转录组 加权基因共表达网络分析(WGCNA)
在线阅读 下载PDF
转录组学测序解析难治性高血压基因表达特征及核心差异基因
12
作者 姜彤 彭世靖 +3 位作者 王姗姗 王昱琪 赵文杰 杨雯晴 《遗传》 北大核心 2026年第1期76-86,共11页
难治性高血压(resistant hypertension,RH)是高血压疾病谱中危险类型之一,发病机制复杂。为探寻该病相关核心差异基因,本研究对2022年收集自山东中医药大学附属医院及山东大学第五人民医院的30份血液样本(10例高血压患者、10例RH患者、10... 难治性高血压(resistant hypertension,RH)是高血压疾病谱中危险类型之一,发病机制复杂。为探寻该病相关核心差异基因,本研究对2022年收集自山东中医药大学附属医院及山东大学第五人民医院的30份血液样本(10例高血压患者、10例RH患者、10名健康对照者)进行了转录组测序。利用DESeq2分析筛选出731个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)鉴定出2个与RH显著相关的模块(含1,944个基因)。将模块基因与DEGs取交集获得229个关键DEGs。基因本体(Gene Ontology,GO)分析显示,这些关键DEGs显著富集于药物分解代谢过程、血红蛋白复合体、过氧化物酶活性等条目;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析表明,这些DEGs与VEGF信号通路和线粒体自噬等通路相关。进一步构建蛋白质-蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络,并运用Cytoscape软件的cytohubba插件整合12种算法筛选核心基因(取各算法前20名基因交集),初步确定GATA1、EPB42、ANK1、SNCA为核心差异基因。qRT-PCR验证结果证实GATA1与EPB42的表达变化与测序结果一致。该研究表明,RH的发生涉及多基因协同作用,核心基因(如GATA1、EPB42)及相关通路(如VEGF信号通路、线粒体自噬)的扰动可能在疾病进程中发挥重要作用,这为深入理解RH的病理机制提供了新线索。 展开更多
关键词 难治性高血压 转录组学 加权基因共表达网络分析
暂未订购
藜麦GRAS基因家族的鉴定及其在生殖发育中的调控功能
13
作者 杨炀 张帅 +3 位作者 董陈文华 曾孟琼 林春 毛自朝 《浙江农业学报》 北大核心 2026年第1期35-53,共19页
GRAS基因家族在植物生长发育与逆境响应中具有重要调控功能,但目前尚未见其在藜麦(Chenopodium quinoa)生殖发育中的相关报道。本研究基于最新藜麦基因组数据,系统鉴定并分析藜麦GRAS家族(CqGRAS)成员,重点解析其基因结构、启动子顺式... GRAS基因家族在植物生长发育与逆境响应中具有重要调控功能,但目前尚未见其在藜麦(Chenopodium quinoa)生殖发育中的相关报道。本研究基于最新藜麦基因组数据,系统鉴定并分析藜麦GRAS家族(CqGRAS)成员,重点解析其基因结构、启动子顺式作用元件,以及在营养与生殖生长阶段的表达模式与调控机制。同时,将CqGRAS成员与拟南芥、藜麦二倍体祖先Chenopodium watsonii(A基因组)和Chenopodium suecicum(B基因组)的GRAS基因进行对比分析。结果共鉴定到51个CqGRAS基因,这些基因普遍内含子数量较少,且与拟南芥及二倍体藜属物种GRAS基因具有较高同源性。启动子分析表明,该家族基因富含响应植物激素(如赤霉素、脱落酸、乙烯和茉莉酸)、生长发育与逆境胁迫的顺式作用元件。系统进化分析将CqGRAS家族划分为10个亚家族,其中HAM(CqHAM01)、PAT1(CqPAT1-06/07/08)、DELLA(CqDELLA01/02)、DLT(CqDLT01/02)和SHR(CqSHR05/06)在花序和发育种子中表达水平较高。加权基因共表达网络分析提示,这些与生殖发育相关的CqGRAS基因可能通过整合光信号与激素信号通路,调控藜麦花和种子的生长发育。本研究为阐明GRAS家族在藜麦生殖发育中的功能提供了新见解,并为深入解析其分子机制与育种应用奠定了基础。 展开更多
关键词 藜麦 GRAS基因家族 生殖调控 加权基因共表达网络分析 生殖发育
在线阅读 下载PDF
FGF信号途径介导鹿角杯形珊瑚水螅体高温脱离的分子机制探究
14
作者 王艺 余秋玉 +2 位作者 曾赛男 刘兆群 周智 《海洋学报》 北大核心 2026年第1期42-55,共14页
本研究从鹿角杯形珊瑚(Pocillopora damicornis)中鉴定并克隆了2个成纤维细胞生长因子(fibroblast growth factor,FGF)基因,命名为PdFGF1和PdFGF17。序列分析结果表明,PdFGF1与Pd-FGF17分别编码195个和149个氨基酸,均含有信号肽和典型的... 本研究从鹿角杯形珊瑚(Pocillopora damicornis)中鉴定并克隆了2个成纤维细胞生长因子(fibroblast growth factor,FGF)基因,命名为PdFGF1和PdFGF17。序列分析结果表明,PdFGF1与Pd-FGF17分别编码195个和149个氨基酸,均含有信号肽和典型的FGF结构域,并具有β-折叠、η-环等拓扑结构。高等动物FGF家族分为FGF1、FGF4、FGF7、FGF8、FGF9、FGF11、FGF19等7个亚家族。多序列比对和系统进化树分析结果表明,PdFGF1属于FGF1亚家族,与人(Homo sapiens)FGF1的序列一致性为30.15%;PdFGF17属于FGF8亚家族,与人FGF1的序列一致性为29.36%。为进一步揭示Pd-FGF1和PdFGF17的生物学功能,本研究分析了高温诱导鹿角杯形珊瑚水螅体脱离的转录组数据,发现在水螅体高温脱离过程中FGF家族基因(PdFGF1、PdFGF2、PdFGF9、PdFGF17、PdFGF18、PdFGFR1、PdFGFR2、PdFGFR3及PdFGFR4)的表达水平显著上升,且FGF信号途径能够激活下游Ras/MAPK级联反应,驱动细胞骨架重构与细胞黏附调节;Cytoscape基因共表达网络分析还揭示FGF与珊瑚共肉(coenosarc)胞外基质(extracellular matrix,ECM)降解相关基因(ADAMTSs、COL21A1、CTSZ、P4HA等)存在显著共表达关系。综上,本研究发现高温激活了鹿角杯形珊瑚的FGF信号途径,促进了共肉组织ECM的降解,进而介导共肉裂解和水螅体脱离。 展开更多
关键词 成纤维细胞生长因子 水螅体脱离 热胁迫 加权基因共表达网络分析 基因克隆
在线阅读 下载PDF
典农河冬季水体与沉积物细菌群落结构的差异特征及其影响因素
15
作者 倪成 赵增锋 +4 位作者 邱小琮 赵睿智 王楚尤 王凯 周博 《微生物学报》 北大核心 2026年第1期213-230,共18页
【目的】探究冬季河流生态系统中水体与沉积物细菌群落的结构差异及其影响因素。【方法】以典农河为研究对象,冬季设置14个采样点,基于16S rRNA基因高通量测序技术系统分析细菌群落组成与多样性、构建共现网络、评估随机过程在群落组装... 【目的】探究冬季河流生态系统中水体与沉积物细菌群落的结构差异及其影响因素。【方法】以典农河为研究对象,冬季设置14个采样点,基于16S rRNA基因高通量测序技术系统分析细菌群落组成与多样性、构建共现网络、评估随机过程在群落组装中的作用,并进行环境因子相关性分析。【结果】沉积物细菌群落的α多样性指数显著高于水体(P<0.001),且其群落结构更稳定;β多样性分解表明两者的群落差异主要与物种周转相关;随机过程在两类群落构建中占主导地位;沉积物细菌群落的共现网络结构更复杂、协同性更强,关键物种主要参与碳、硫循环,稀有类群在网络稳定性中发挥重要作用;水体细菌群落主要受溶解氧(dissolved oxygen,DO)、叶绿素a(chlorophyll a,Chl-a)与水温(water temperature,WT)等因子调控,沉积物群落则受pH、有机质(soil organic matter,SOM)与氮素因子影响。【结论】本研究系统揭示了冬季典农河水体与沉积物细菌群落在结构组成、共现网络以及相关环境因子方面的差异特征,为深入理解冰冻期河流细菌群落的生态适应性及水体与沉积物细菌群落的差异格局提供了科学依据。 展开更多
关键词 典农河 水体 沉积物 细菌 共现网络
原文传递
不同营养状态与季节变化驱动的典型高原湖泊浮游生物生态位结构及稳定性差异
16
作者 徐楷 郭学涛 +6 位作者 褚献献 刘美璇 杨丹萍 陈宇 段高旗 彭剑峰 李艳红 《环境科学学报》 北大核心 2026年第1期151-165,共15页
高原湖泊浮游生物群落的组成和稳定性随季节和富营养化条件而变化.目前对高原湖泊浮游生物生态位与网络结构在不同营养状态和季节背景下的协同变化机制仍缺乏系统研究.本研究选取云南滇池、程海和泸沽湖为研究对象,于2024年7月和12月采... 高原湖泊浮游生物群落的组成和稳定性随季节和富营养化条件而变化.目前对高原湖泊浮游生物生态位与网络结构在不同营养状态和季节背景下的协同变化机制仍缺乏系统研究.本研究选取云南滇池、程海和泸沽湖为研究对象,于2024年7月和12月采样,结合生态位重叠指数、非度量多维尺度分析(NMDS)和共现网络方法,探讨浮游生物资源利用格局与系统稳定性在季节尺度上的响应特征.结果表明,滇池夏冬季均由蓝藻主导,群落结构单一且生态位重叠集中,导致对少数关键节点的高度依赖,网络在定向扰动下极易失稳,稳定性主要受DON、DO(夏季),以及DOC、DO(冬季)等因子驱动.程海夏季群落物种少、结构集中,稳定性依赖关键物种且脆弱性高;到冬季网络去中心化、生态位分化增强,网络依赖度下降,表现出较强的季节可塑性,夏季稳定性受NO_(3)^(-)-N和DO驱动,冬季受COD和TN影响.泸沽湖夏季浮游植物群落结构复杂、定向移除下显示核心节点的依赖;冬季动物网络最大脆弱性最低,生态位重叠整体偏低,稳定性主要受ORP、NO_(3)^(-)-N(夏季),以及DO、DOC(冬季)调控.本研究有助于深化对高原湖泊浮游生物结构与稳定性响应机制的理解,并为生态系统状态评估与差异化管理提供参考依据. 展开更多
关键词 云南高原湖泊 浮游生物 生态位重叠 共现网络
原文传递
基于宏基因组学揭示生物降解地膜对棉田土壤微生物群落的影响
17
作者 刘淑娥 董兆飞 +1 位作者 张爱华 闵伟 《环境科学》 北大核心 2026年第1期650-662,共13页
生物降解地膜作为传统地膜的替代品,已引起人们广泛关注,然而关于生物降解地膜长期覆盖对土壤微生物群落结构的影响尚未明晰.因此,设置传统地膜(CMPs)和生物降解地膜(BMPs)这两个处理,通过传统地膜覆盖26 a和生物降解地膜覆盖11a的大田... 生物降解地膜作为传统地膜的替代品,已引起人们广泛关注,然而关于生物降解地膜长期覆盖对土壤微生物群落结构的影响尚未明晰.因此,设置传统地膜(CMPs)和生物降解地膜(BMPs)这两个处理,通过传统地膜覆盖26 a和生物降解地膜覆盖11a的大田试验,采用宏基因组学技术,探究生物降解地膜对干旱区棉田土壤微生物群落结构的影响.结果表明,与CMPs处理相比,BMPs处理显著降低土壤含水量(SWC)、容重(BD)和速效磷(AP),分别降低25.00%、12.50%和12.09%,但显著增加土壤孔隙度(SP),增幅为10.07%. BMPs处理(124个)较CMPs处理(182个)显著降低独有物种数目.门水平下,BMPs处理显著增加变形菌门(Proteobacteria)的相对丰度,显著降低放线菌门(Actinobacteria)的相对丰度;属水平下,BMPs处理显著增加类诺卡氏菌属(Nocardioides)、红色杆菌属(Solirubrobacter)和硝化螺菌属(Nitrospira)的相对丰度,显著降低鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)的相对丰度.同时,BMPs处理微生物群落之间的正相关比例和平均度较CMPs处理显著增加16.32%和8.71%,降低了微生物群落模块化程度,降低1.89%,促进了微生物群落的共生关系和稳定性. BMPs处理显著增加xylA、narG/nxrA和nasA等基因的相对丰度,显著降低accA、 frdA、nirB、nrtA、gcd和phoR等基因的相对丰度,促进了碳降解、反硝化和同化硝酸盐还原过程,抑制了异化硝酸还原和无机磷增溶过程.生物降解地膜较传统地膜提高了土壤微生物群落复杂性和稳定性,并且土壤SWC和AP是影响微生物群落组成的关键环境因子. 展开更多
关键词 宏基因组 生物降解地膜(BMPs) 微生物 共线网络 功能基因
原文传递
加权基因共表达网络分析筛选早发2型糖尿病相关代谢物的初步研究
18
作者 黄珂 李文婷 +1 位作者 王茜 蒋升 《中国糖尿病杂志》 北大核心 2026年第1期17-24,共8页
目的利用加权基因共表达网络(WGCNA)分析筛选早发2型糖尿病(EOD)关键代谢物。方法选取2024年4月至2024年9月于郑州大学附属洛阳中心医院内分泌科住院治疗的EOD患者24例,分为BMI 18.5~23.9 kg/m^(2)的正常(NORM)组,BMI 24.0~27.9 kg/m^(2... 目的利用加权基因共表达网络(WGCNA)分析筛选早发2型糖尿病(EOD)关键代谢物。方法选取2024年4月至2024年9月于郑州大学附属洛阳中心医院内分泌科住院治疗的EOD患者24例,分为BMI 18.5~23.9 kg/m^(2)的正常(NORM)组,BMI 24.0~27.9 kg/m^(2)的超重(OW)组及BMI≥28.0 kg/m^(2)的肥胖(OB)组,每组8例。比较各组一般资料及生化指标,取各组血清及粪便样本进行代谢组学分析,利用WGCNA构建基因共表达网络,筛选代谢物中重要模块,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析核心代谢物,比较核心代谢物组间变量重要性投影值(VIP)和倍数变化值(FC)。结果NORM、OW、OB组BMI、WC、臀围、血尿酸、TC、2 hC-P依次升高(P<0.05)。OW、OB组腰高比高于NORM组(P<0.05),25羟维生素D3、2 hPG低于NORM组(P<0.05)。OW组HbA_(1)c、FPG、同型半胱氨酸(Hcy)、TG、LDL-C高于NORM组(P<0.05),血肌酐(Scr)、HDL-C低于NORM组(P<0.05)。OB组WHR高于NORM、OW组(P<0.05),HbA_(1)c、TG低于OW组(P<0.05),Scr、HDL-C高于OW组(P<0.05)。OPLS-DA分析显示,各组分间区分明显,数据整体呈现良好的重复性。Pearson相关分析筛选得到7个模块,分别为darkred、yellowgreen、skyblue、cyan、royalblue、darkmagenta、steelblue,各包含55、33、48、1162、90、38、46个代谢物(P<0.05)。筛选WGCNA网络中排名前10的核心代谢物进行KEGG功能注释,结果显示,all-trans-4-oxoretinoic acid被注释到Retinol metabolism通路,Thymidine被注释到Pyrimidine metabolism通路,2-Methyl-1-hydroxybutyl-ThPP被注释到Valine、leucine and isoleucine degradation通路,all-trans-4-oxoretinoic acid位于darkred模块,Hcy与darkred模块呈负相关,2-Methyl-1-hydroxybutyl-ThPP、Thymidine均位于skyblue模块,Hcy与skyblue模块呈正相关。OW组2-Methyl-1-hydroxybutyl-ThPP、Thymidine表达较OB、NORM组显著(VIP>1,FC>1)。结论代谢物2-Methyl-1-hydroxybutyl-ThPP、Thymidine与EOD的发生发展相关,可能导致Hcy升高。 展开更多
关键词 糖尿病 2型 早发 加权基因共表达网络分析 代谢组学
原文传递
不同培肥措施对褐土土壤微生物群落和酶活性的影响
19
作者 殷浩凯 李倩 +5 位作者 赵宇航 解文艳 周怀平 杨振兴 刘志平 贺丽燕 《环境科学》 北大核心 2026年第2期1366-1378,共13页
探讨不同培肥措施对褐土农田养分和冬小麦产量的影响,解析土壤胞外酶和微生物群落的变化特征,为高效提升褐土农田土壤肥力和冬小麦产量提供理论依据.基于2017~2024年连续7a的定位试验,包括5种不同培肥措施:不施肥处理(CK)、常规施肥处理... 探讨不同培肥措施对褐土农田养分和冬小麦产量的影响,解析土壤胞外酶和微生物群落的变化特征,为高效提升褐土农田土壤肥力和冬小麦产量提供理论依据.基于2017~2024年连续7a的定位试验,包括5种不同培肥措施:不施肥处理(CK)、常规施肥处理(NPK)、优化施肥处理(NPKM)、单施有机肥处理(OM)和常规施肥+秸秆直接还田处理(NPKS),利用高通量测序技术和生态网络方法,综合分析了土壤养分含量、胞外酶活性、细菌和真菌群落结构和功能.结果表明:①不同培肥措施(NPK、NPKM、NPKS和OM)均可以提高土壤肥力、小麦产量和胞外酶活性,其中NPKS处理提升效果最为显著.②不同培肥措施改变了土壤细菌群落结构组成,不同培肥措施均提高了变形菌门和拟杆菌门的相对丰度,降低了酸杆菌门的相对丰度;SOC、UE和TP是影响细菌群落组成的重要影响因素.③土壤真菌优势门为子囊菌门、担子菌门和被孢霉门;均提高了子囊菌门和被孢霉门相对丰度;DHA、AP和UE是影响真菌群落组成的重要影响因素.④不同培肥措施增加了土壤细菌群落网络的复杂性,降低了土壤真菌群落网络的复杂性.⑤FAPROTAX细菌功能预测结果表明,不同培肥措施提高了土壤碳氮循环相关功能;FUNGuild真菌功能预测表明,秸秆还田可以抑制土壤病原菌的生长,而施加有机肥则会促进腐生真菌生长.不同培肥措施均可提高土壤肥力和胞外酶活性,增加有益菌群丰度,显著改变土壤微生物群落结构和组成,促进土壤碳氮循环,秸秆还田可以抑制土壤病原菌的生长.有机无机配施(NPKS和NPKM)提升效果优于单施化肥(NPK)和单施有机肥(OM),有机无机配施有利于改善土壤质量,促进碳和氮循环,提高作物产量,从而实现旱作农业的可持续发展. 展开更多
关键词 施肥方式 微生物群落 酶活性 土壤养分 高通量测序 共现网络
原文传递
基于加权基因共表达网络分析和分子对接的川乌-黄柏配伍治疗复发性阿弗他溃疡的网络药理学研究及实验验证
20
作者 曹铭晨 荆凡波 +6 位作者 王文晓 张泽南 李文静 程绍远 邵延琳 于红霞 孟凡刚 《山东科学》 2026年第1期31-42,共12页
基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和网络药理学探讨川乌-黄柏配伍外用治疗复发性阿弗他溃疡的分子作用机制。检索整理川乌-黄柏的主要活性成分301个共涉及靶点3273个;WGCNA分析复发性阿弗他溃疡相关基因,R软件VennDiagram包分析药物... 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和网络药理学探讨川乌-黄柏配伍外用治疗复发性阿弗他溃疡的分子作用机制。检索整理川乌-黄柏的主要活性成分301个共涉及靶点3273个;WGCNA分析复发性阿弗他溃疡相关基因,R软件VennDiagram包分析药物相关靶点与不同模块的交集,并基于KEGG、GO、Reactome Gene Sets来源进行通路和过程富集分析和分层聚类,主要涉及细胞凋亡调节和信号传导、谷胱甘肽代谢、PI3K异常的信号传导、表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂耐药性、免疫系统中的细胞因子信号传导、PPAR alpha通路等,分别对应免疫-代谢-修复三个层面;Cytoscape_v3.7.2软件Mcode插件鉴定关键模块的hub基因包括ERBB2、CD44、NFKB1、MMP2,分子对接提示ERBB2与大部分活性成分结合度较高,而双酯型乌头碱与黄柏黄酮类成分主要作用于CD44,黄柏生物碱主要作用于MMP2,川乌单酯型、双酯型生物碱主要作用于NFKB1,两者相辅相成相须为用发挥抗复发性阿弗他溃疡作用。核心成分苯甲酰中乌头胺显著降低L-脂多糖诱导的巨噬细胞活性氧浓度升高,提示川乌作为君药主要通过新陈代谢途径发挥调控作用。 展开更多
关键词 加权基因共表达网络分析(WGCNA) 复发性阿弗他溃疡 系统药理学 川乌 黄柏
暂未订购
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 2 … 145 下一页 到第 页
使用帮助 返回顶部