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c-GMP诱导对盐胁迫下番茄的转录组分析 被引量:3
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作者 朱晓林 魏小红 +2 位作者 王宝强 王贤 张明君 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第10期1788-1797,共10页
以市场常见的番茄为材料,采用Illumina高通量测序技术对NaCl胁迫、c-GMP诱导以及两者组合处理下番茄幼苗进行转录组测序。结果表明:共获得83.35 Gb的原始数据,Q30碱基百分比在90.91%及以上,分别将各样品的原始读数与指定的参考基因组进... 以市场常见的番茄为材料,采用Illumina高通量测序技术对NaCl胁迫、c-GMP诱导以及两者组合处理下番茄幼苗进行转录组测序。结果表明:共获得83.35 Gb的原始数据,Q30碱基百分比在90.91%及以上,分别将各样品的原始读数与指定的参考基因组进行序列比对,比对效率从88.03%到92.74%不等。同时将得到的31734条序列注释到不同的数据库(GO、KEGG、KOG、NR、Pfam、Swiss-Prot和egg NOG),通过GO数据库,将其划分到细胞组分、分子功能以及生物学过程三大注释类别下的51个亚功能组中,通过COG数据库与KEGG数据库将其分别注释到25个类别与128个代谢通路。在NaCl胁迫、c-GMP诱导以及两者组合处理下共发现SNP位点127944个,其中仅有22.6%的SNP位点位于非编码区。差异基因结果显示,c-GMP能诱导盐胁迫下更多基因的表达。该转录组测序数据可靠,结果覆盖面广,为番茄c-GMP诱导盐胁迫下基因挖掘与功能研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 番茄 盐胁迫 c-gmp诱导 转录组分析
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响应第二信使分子环状二核苷酸的细菌核糖开关研究进展
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作者 刘政言 宋馨 +3 位作者 王光强 夏永军 艾连中 熊智强 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第20期378-385,共8页
第二信使分子在细菌响应外界环境变化的信号传导过程中发挥重要作用。环状二核苷酸(cyclic dinucleotides,CDG)是一类新发现的第二信使分子包括环二鸟苷酸(cyclic diguanosine monophosphate,c-di-GMP)和环二腺苷酸(cyclic diadenosine ... 第二信使分子在细菌响应外界环境变化的信号传导过程中发挥重要作用。环状二核苷酸(cyclic dinucleotides,CDG)是一类新发现的第二信使分子包括环二鸟苷酸(cyclic diguanosine monophosphate,c-di-GMP)和环二腺苷酸(cyclic diadenosine monophosphate,c-di-AMP),调控细菌细胞壁代谢、钾离子稳态、生物膜形成和DNA修复等生理功能。为理解CDG分子调控机制,该文综述了响应CDG的核糖开关结构及其调控机制,通过系统分析CDG核糖开关对基因表达的调控作用,旨在深化对信号转导机制的理解,以期为第二信使分子介导的信号网络调控研究提供借鉴。 展开更多
关键词 核糖开关 第二信使分子 环状二核苷酸 环二鸟苷酸 环二腺苷酸
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青枯菌GMI 1000菌株c-di-GMP代谢酶调控基因vsrD功能研究
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作者 杨晓欣 许景升 +3 位作者 徐进 韩文超 李志明 冯洁 《植物保护》 北大核心 2025年第3期102-112,共11页
青枯菌Ralstonia solanacearum是全球作物生产中的一种重要病原细菌。由青枯菌引起的植物细菌性枯萎病(简称青枯病)危害数百种经济作物并造成严重经济损失。环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是一种广泛存在于细菌中的第二信使分... 青枯菌Ralstonia solanacearum是全球作物生产中的一种重要病原细菌。由青枯菌引起的植物细菌性枯萎病(简称青枯病)危害数百种经济作物并造成严重经济损失。环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是一种广泛存在于细菌中的第二信使分子,通过调控生物膜形成、运动性等影响病原菌致病力。但在青枯菌中,c-di-GMP的调控网络并不清楚。本试验以青枯菌GMI 1000中的c-di-GMP降解酶基因gedrG缺失突变体菌株(ΔgedrG-GMI)为研究对象,将pMiniHimarI RB1质粒通过双亲共结合法导入ΔgedrG-GMI突变体,筛选运动性表型恢复的转座子插入突变体(transposon mutagenesis),共鉴定了13272株转座子插入突变体。其中,转座子插入vsrD基因时,ΔgedrG-GMI运动性恢复为野生型水平。分析表明vsrD基因缺失后,突变株运动性极显著增强,胞内c-di-GMP水平降低,致病力丧失,vsrD基因互补菌株运动性恢复至缺失前水平。以上结果表明,vsrD参与了青枯菌GMI 1000中c-di-GMP调控通路,影响GMI 1000运动性,且与致病性密切相关。 展开更多
关键词 青枯菌 C-DI-GMP 致病力 运动性 调控
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海洋暖化对细菌生物被膜及其诱导厚壳贻贝幼虫变态能力的影响
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作者 马蕃 陶钰 +1 位作者 杨金龙 梁箫 《大连海洋大学学报》 北大核心 2025年第2期241-249,共9页
为探究海洋暖化对细菌生物被膜及其诱导厚壳贻贝(Mytilus coruscus)幼虫变态能力的影响,以具有诱导贻贝幼虫变态能力的常见海假交替单胞菌(Pseudoalteromonas marina)为试验菌株,结合东海海域海表面温度和未来海洋暖化升高水温,分别设... 为探究海洋暖化对细菌生物被膜及其诱导厚壳贻贝(Mytilus coruscus)幼虫变态能力的影响,以具有诱导贻贝幼虫变态能力的常见海假交替单胞菌(Pseudoalteromonas marina)为试验菌株,结合东海海域海表面温度和未来海洋暖化升高水温,分别设置14℃、18℃、22℃、27℃、31℃水温条件以制备细菌生物被膜,分析其生物学特性及诱导贻贝幼虫变态能力变化。结果表明:随着海水温度上升,生物被膜细菌密度、胞外α多糖、第二信使c-di-GMP含量及幼虫变态率呈先升高后下降趋势,22℃时幼虫变态率和c-di-GMP含量均达到峰值,细菌生物被膜诱导贻贝幼虫变态能力与(c-di-GMP)含量显著正相关,与胞外β多糖无相关性;此外,胞外多糖具有诱导能力的脂多糖、可拉酸含量变化与细菌生物被膜诱导能力变化一致,而纤维素含量随温度升高而升高;因此,海洋暖化导致c-di-GMP含量变化,从而影响胞外多糖的分泌,最终影响细菌生物被膜对贻贝幼虫变态诱导能力。本研究对改善海洋暖化下贻贝幼虫变态效率及构建未来海水贝类健康养殖体系提供有益参考。 展开更多
关键词 海洋暖化 生物被膜 幼虫变态 C-DI-GMP 胞外多糖
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泰国伯克霍尔德氏菌环二鸟苷酸代谢关键酶PdcA的筛选及活性分析
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作者 王卓 李新 沈锡辉 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第10期169-180,共12页
【目的】筛选泰国伯克霍尔德氏菌环二鸟苷酸(c-di-GMP)代谢关键酶,并对其活性以及突变体的运动性、生物膜形成能力和毒性等进行分析,为相关致病性伯克霍尔德氏菌的防治提供科学依据。【方法】以泰国伯克霍尔德氏菌E264菌株为研究对象,... 【目的】筛选泰国伯克霍尔德氏菌环二鸟苷酸(c-di-GMP)代谢关键酶,并对其活性以及突变体的运动性、生物膜形成能力和毒性等进行分析,为相关致病性伯克霍尔德氏菌的防治提供科学依据。【方法】以泰国伯克霍尔德氏菌E264菌株为研究对象,通过氨基酸多序列比对筛选泰国伯克霍尔德氏菌中的c-di-GMP代谢酶的关键活性位点。采用同源重组方法构建单基因缺失突变体,利用泳动试验和生物膜形成试验筛选c-di-GMP代谢关键酶,并通过体外酶促反应和高效液相色谱分析其酶活性。通过大蜡螟幼虫感染试验检测c-di-GMP代谢关键酶基因缺失对E264菌株毒性的影响。【结果】共筛选到14个c-di-GMP代谢酶,其中BTH_Ⅰ0751和BTH_Ⅰ1393的EAL结构域以及BTH_Ⅰ2871的GGDEF结构域活性位点发生了突变;成功构建了14个c-di-GMP代谢酶基因缺失突变体,并筛选出PdcA(BTH_Ⅱ2363)为c-di-GMP代谢关键酶。结构域分析结果显示,PdcA含有Per-ARNT-Sim(PAS)传感结构域(N-端)和GGDEF结构域(C-端);酶活性分析结果显示,PdcA具有c-di-GMP合成酶活性,能够调节胞内c-di-GMP水平,而且其PAS结构域对酶活性的发挥至关重要。大蜡螟幼虫感染试验发现,pdcA的缺失增强了泰国伯克霍尔德氏菌E264的毒力。【结论】PdcA是泰国伯克霍尔德氏菌E264 c-di-GMP代谢的关键酶,能够调节其运动性、生物膜形成能力以及毒力。PdcA的c-di-GMP合成活性依赖于自身的PAS结构域。 展开更多
关键词 泰国伯克霍尔德氏菌 环二鸟苷酸 PDCA 运动性 生物膜形成能力
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汉氏葡糖醋杆菌HDM1-3中第二信使c-di-GMP相关结构域蛋白质的生物信息学分析
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作者 杨承 庄梓涵 +3 位作者 吴昊基 陈炫 雷虹 李元敬 《黑龙江大学自然科学学报》 2025年第1期81-89,共9页
为探究汉氏葡糖醋杆菌(Komagataeibacter hansenii,K.hansenii)HDM1-3所包含的GGDEF结构域对合成环二鸟苷酸(cyclic diguanylate monophosphate,c-di-GMP)的作用,挖掘c-di-GMP对该菌种产细菌纤维素(Bacterial cellulose,BC)的作用,采用... 为探究汉氏葡糖醋杆菌(Komagataeibacter hansenii,K.hansenii)HDM1-3所包含的GGDEF结构域对合成环二鸟苷酸(cyclic diguanylate monophosphate,c-di-GMP)的作用,挖掘c-di-GMP对该菌种产细菌纤维素(Bacterial cellulose,BC)的作用,采用生物信息学方法系统分析了K.hansenii HDM1-3菌株的基因组,发现K.hansenii HDM1-3菌株中共有8个基因含有GGDEF-EAL结构域。利用Hmmer软件、Pfam数据库、SMART(Simple Modular Architecture Research Tool)平台、MEME Suite平台、MEGA11(Molecular Evolutionary Genetics Analysis 11)软件、ClustalW平台、Swiss-model平台、NCBI(National Center for Biotechnology Information)平台、InterPro平台及BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)平台对该菌株所含有GGDEF-EAL结构域的功能进行了分析,并深入探究了该结构域对细菌纤维素产量的影响。功能预测分析表明,K.hansenii HDM1-3中含有GGDEF-EAL结构域的8个基因均参与c-di-GMP的合成、降解及信号传导。 展开更多
关键词 汉氏葡糖醋杆菌HDM1-3 C-DI-GMP 生物信息学 GGDEF-EAL结构域
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环二核苷酸调控地杆菌胞外电子传递机制及其应用研究进展
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作者 徐家成 刘健 +1 位作者 周玮 胡译丹 《安全与环境工程》 北大核心 2025年第4期313-322,共10页
异化铁还原菌具有独特的胞外电子传递功能,直接影响多种元素的生物化学地球循环。在自然环境中,微生物常被吸附于矿物表面形成生物被膜,并以此方式与矿物相互作用。为了利用不同含铁矿物以适应环境多样性,微生物进化出了由c型细胞色素... 异化铁还原菌具有独特的胞外电子传递功能,直接影响多种元素的生物化学地球循环。在自然环境中,微生物常被吸附于矿物表面形成生物被膜,并以此方式与矿物相互作用。为了利用不同含铁矿物以适应环境多样性,微生物进化出了由c型细胞色素组成的多种胞外电子传递途径。微生物如何调节胞外电子传递网络是一个重要问题。近年来相关研究表明,环二鸟苷酸(c-di-GMP)和环鸟苷腺苷酸(c-di-GAMP)在调节Geobacter spp.等异化铁还原菌的胞外电子传递(extracellular electron transfer,EET)中发挥着重要的作用。以异化铁还原菌模式菌株(地杆菌属)为例,首先介绍了其胞外电子传递机制;其次介绍了地杆菌生物被膜的形成及其胞外基质;最后介绍了环二核苷酸信号分子对胞外电子传递过程中的调控作用。此外,综述了环二核苷酸信号分子对地杆菌的调控作用在环境、能源领域中的应用。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 环鸟苷腺苷酸 胞外电子传递(EET) 生物被膜 c型细胞色素
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STM2503调控鼠伤寒沙门菌的生物被膜形成和压力适应性
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作者 王南威 李莉莉 +6 位作者 陈凯风 周洲平 潘鹏 关晋 徐成刚 廖明 张建民 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第16期3294-3304,共11页
【目的】通过揭示c-di-GMP通路基因STM2503调控鼠伤寒沙门菌生物被膜形成,进而影响其环境应激能力的机制,以期挖掘调控鼠伤寒沙门菌压力适应性的关键因子,为防控策略的制定提供理论依据。【方法】以λ-Red同源重组方法构建STM2503缺失株... 【目的】通过揭示c-di-GMP通路基因STM2503调控鼠伤寒沙门菌生物被膜形成,进而影响其环境应激能力的机制,以期挖掘调控鼠伤寒沙门菌压力适应性的关键因子,为防控策略的制定提供理论依据。【方法】以λ-Red同源重组方法构建STM2503缺失株,并利用质粒PBAD表达STM2503来构建相应的基因回补株。然后通过检测不同STM2503表达水平菌株中信号分子c-di-GMP的含量揭示STM2503对菌株胞内c-di-GMP水平的影响。接下来,利用细菌运动性检测、结晶紫染色等试验检测了STM2503对菌株运动性和生物被膜形成能力的影响,并利用实时荧光定量PCR从基因层面揭示其对菌株运动性和生物被膜形成的调控机制。最后,通过抗生素处理、氧化应激、消毒剂应激等试验探究了STM2503对鼠伤寒沙门菌压力适应性的影响。【结果】与野生株(WT269)相比,STM2503的缺失使菌株胞内c-di-GMP含量升高了37.51%(P<0.001),且不影响菌株的正常生长。另外,STM2503的缺失提高了菌株各胞外基质合成基因的表达水平,使缺失株胞外多糖、胞外DNA和胞外蛋白质含量分别增加了10.30%(P<0.01)、33.59%(P<0.001)和27.60%(P<0.01),最终使菌株的生物被膜形成能力显著增强了1.63倍(P<0.01)。并且,269ΔSTM2503通过降低鞭毛合成相关基因fliA与flhC的表达使其在6 h的运动直径较野生株相比下降了17.22%(P<0.01)。这些变化最终导致269ΔSTM2503菌株对头孢噻肟、头孢吡肟、阿莫西林等β-内酰胺类抗生素的敏感性降低1—3倍,且在氧胁迫和SDS消毒剂胁迫下表现出了更强的适应能力。【结论】STM2503参与信号分子c-di-GMP的降解,并通过抑制胞外基质的合成降低鼠伤寒沙门菌的生物被膜形成能力,通过上调鞭毛合成基因的表达增强菌株的运动性,进而降低菌株的耐药性和环境压力适应能力,本研究为鼠伤寒沙门菌关键防控靶点的挖掘提供了理论基础。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 C-DI-GMP STM2503 生物被膜 运动性
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铜绿假单胞菌PAO1中环二鸟苷单磷酸代谢蛋白PA0285感应环境因素的研究
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作者 海娥 张慧敏 +3 位作者 高晓菁 张小敏 郭嘉义 黄卫东 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第6期653-658,共6页
目的分析铜绿假单胞菌中环二鸟苷单磷酸(c-di-GMP)代谢蛋白PA0285感应环境因素的作用,探讨其参与c-di-GMP信号转导的机制。方法通过PCR技术对pa0285转座子突变菌株进行遗传背景确认;以铜绿假单胞菌野生型PAO1和2株PA0285插入失活突变菌... 目的分析铜绿假单胞菌中环二鸟苷单磷酸(c-di-GMP)代谢蛋白PA0285感应环境因素的作用,探讨其参与c-di-GMP信号转导的机制。方法通过PCR技术对pa0285转座子突变菌株进行遗传背景确认;以铜绿假单胞菌野生型PAO1和2株PA0285插入失活突变菌株为研究对象,选定24种化合物,利用绿色荧光蛋白(GFP)报告基因融合法及刚果红结合试验,检测细菌胞内c-di-GMP水平;通过生物膜定量试验分析特定环境因素对细菌生物膜形成的影响;使用CAS平板法进一步分析PA0285在特定环境条件下对细菌分泌嗜铁素的调控。结果细菌基因组PCR结果表明转座子插入致pa0285基因失活;GFP报告基因融合法、刚果红结合试验及生物膜定量检测结果显示,与野生型PAO1相比,突变菌Δpa0285胞内c-di-GMP水平升高(F=88.92,P<0.01),生物膜合成增加(F=15.82,P<0.01);将异亮氨酸(Ile)或缬氨酸(Val)添加至培养基时,突变菌Δpa0285胞内c-di-GMP水平与PAO1相比降低(F=15.17,60.17,P<0.01),生物膜合成与PAO1比较差异无统计学意义(F=3.462,0.5018,P=0.10001,0.6287)。CAS定量检测结果显示,与野生型PAO1相比,突变菌Δpa0285分泌嗜铁素含量下降(F=58.22,P<0.01);CAS平板观察结果显示,无外源化合物添加时,突变菌Δpa0285菌落的螯合圈与野生型PAO1相比偏小,将精氨酸(Arg)、MgCl2、CaCl2添加至培养基时,突变菌Δpa0285的菌落螯合圈与PAO1相比大小相近;将Val和Ile添加至培养基时,突变菌Δpa0285的菌落螯合圈与野生型PAO1相比偏大。结论铜绿假单胞菌PAO1中代谢蛋白PA0285具有磷酸二酯酶(PDE)的活性;PA0285通过调控胞内c-di-GMP水平,进而影响生物膜合成及嗜铁素的分泌,以感应环境中氨基酸Val和Ile。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌PAO1 PA0285蛋白 环二鸟苷单磷酸 环境信号
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心钠素、环磷酸鸟苷在心功能不全时的变化及其意义 被引量:2
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作者 曾秋棠 涂源淑 《临床内科杂志》 CAS 1990年第6期30-31,共2页
应用放射免疫法检测63例心衰患者和62例健康人的血浆心钠素(PANF),其中28例健康人和46例心衰患者同时测定血浆鸟苷(c-GMP)水平,结果心衰患者PANF和c-GMP明显高于正常人,且与心衰程度及治疗好转前后呈相关关系。ANF和c-GMP可以作为反应... 应用放射免疫法检测63例心衰患者和62例健康人的血浆心钠素(PANF),其中28例健康人和46例心衰患者同时测定血浆鸟苷(c-GMP)水平,结果心衰患者PANF和c-GMP明显高于正常人,且与心衰程度及治疗好转前后呈相关关系。ANF和c-GMP可以作为反应心衰严重程度和判断疗效的指标。 展开更多
关键词 心力衰竭 PANF c-gmp
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塔里木盆地17个引进红枣品种HPLC指纹图谱及定量测定的研究 被引量:2
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作者 刘丹 隋月红 +2 位作者 陈朋 沈立荣 白红进 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2015年第21期3248-3252,共5页
目的建立塔里木盆地17个引进红枣品种高效液相色谱指纹图谱方法,为红枣品质的科学评价和产品的质量控制提供科学依据。方法采用HPLC法,色谱柱TOSOH TSKgel ODS-100V C18柱(150 mm×4.6 mm,3μm),流动相为甲醇-0.3%磷酸二氢钾缓冲水... 目的建立塔里木盆地17个引进红枣品种高效液相色谱指纹图谱方法,为红枣品质的科学评价和产品的质量控制提供科学依据。方法采用HPLC法,色谱柱TOSOH TSKgel ODS-100V C18柱(150 mm×4.6 mm,3μm),流动相为甲醇-0.3%磷酸二氢钾缓冲水溶液,梯度洗脱,体积流量1.0 m L/min,柱温40℃,检测波长260 nm。对采自塔里木大学种质资源圃中17个引进品种的红枣进行指纹图谱研究,用药典委员会颁布的中药色谱指纹图谱相似度评价系统2004A进行评价。结果建立了红枣的指纹图谱,标定了22个共有峰,各峰分离度良好,并对尿嘧啶、次黄嘌呤、腺嘌呤、胞苷、尿苷、环磷酸腺苷(c AMP)、环磷酸鸟苷(c GMP)进行测定。结论 HPLC指纹图谱分析技术可用于红枣的鉴别。 展开更多
关键词 红枣 高效液相色谱 指纹图谱 尿嘧啶 次黄嘌呤 腺嘌呤 胞苷 尿苷 c AMP c GMP
原文传递
问号钩端螺旋体GGDEF和EAL/HD-GYP结构域蛋白生物信息学分析 被引量:2
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作者 丁士标 肖国辉 +2 位作者 孔亮亮 严杰 林旭瑷 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期109-113,共5页
目的分析问号钩端螺旋体(钩体)环二鸟苷酸(Cyclic dimeric-GMP,c-di-GMP)调节相关的GGDEF和EAL/HD-GYP结构域蛋白生物信息学结果,为后续的功能研究奠定基础。方法 PSI-BLAST方法分析编码GGDEF和EAL/HDGYP结构域蛋白的基因;利用相应生物... 目的分析问号钩端螺旋体(钩体)环二鸟苷酸(Cyclic dimeric-GMP,c-di-GMP)调节相关的GGDEF和EAL/HD-GYP结构域蛋白生物信息学结果,为后续的功能研究奠定基础。方法 PSI-BLAST方法分析编码GGDEF和EAL/HDGYP结构域蛋白的基因;利用相应生物信息学软件对蛋白信号肽序列、跨膜序列、蛋白结构、同源性进行分析并构建目的蛋白进化树。结果问号钩体中22个蛋白分别含有GGDEF或EAL/HD-GYP结构域,多数蛋白均有感受器结构域和跨膜区。7个具有PAS输入感受器的GGDEF结构域蛋白进化较为独立,位于单独的一个分支,其余6个GGDEF结构域蛋白则分散在不同的分支上。4个EAL结构域蛋白和2个HD-GYP结构域蛋白进化上也较为独立,分别处于同一进化分支。3个GGDEF和EAL结构域耦合的蛋白在进化关系上更趋向于PDE活性蛋白。结论钩体具有多拷贝的合成和降解c-di-GMP相关蛋白编码基因,表明在钩体中c-di-GMP网络具有高度复杂性,同时反映出钩体对环境条件的改变具有复杂的应对机制。 展开更多
关键词 问号钩端螺旋体 环二鸟苷酸 鸟苷酸环化酶 磷酸二酯酶
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病原细菌受体介导的c-di-GMP信号传导及其调控机制 被引量:3
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作者 杨凤环 田芳 +1 位作者 陈华民 何晨阳 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期9-14,共6页
细菌第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)信号网络系统主要涉及信号代谢、识别、接受、传递、功能表达和调控。c-di-GMP胞内水平受到鸟苷酸环化酶(DGC)和磷酸二酯酶(PDE)的控制。c-di-GMP信号受体类型多样,包括转录调控因子、PilZ结构域蛋白... 细菌第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)信号网络系统主要涉及信号代谢、识别、接受、传递、功能表达和调控。c-di-GMP胞内水平受到鸟苷酸环化酶(DGC)和磷酸二酯酶(PDE)的控制。c-di-GMP信号受体类型多样,包括转录调控因子、PilZ结构域蛋白、退化的GGDEF和EAL结构域蛋白、核糖体开关、多核苷酸磷酸化酶和新发现的蛋白激酶等。c-di-GMP受体接受信号后,可以在转录、翻译以及翻译后水平上对下游靶标进行调控,从而影响细菌的毒性、运动性、生物膜形成、细胞分裂等生理生化过程。本文结合本实验室对水稻白叶枯病菌的研究结果,综述了近年来国内外在c-di-GMP信号受体介导的调控机制等方面的研究进展。 展开更多
关键词 C-DI-GMP 信号代谢 受体 传导 调控
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一种基于TTP/C协议的容错策略研究 被引量:5
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作者 魏婷 张喜民 陈益 《航空计算技术》 2008年第3期90-93,共4页
组成员协议(GMP)是基于TTP/C的一种软件容错策略。在传统的GMP策略中,故障的节点都会将自己从本地成员表中删除,在有n个节点的系统中,出现(n-3)次连续的故障后,可能会导致GMP策略无效。研究了一种新型的GMP容错策略,可对瞬态故障的节点... 组成员协议(GMP)是基于TTP/C的一种软件容错策略。在传统的GMP策略中,故障的节点都会将自己从本地成员表中删除,在有n个节点的系统中,出现(n-3)次连续的故障后,可能会导致GMP策略无效。研究了一种新型的GMP容错策略,可对瞬态故障的节点进行恢复,使其在(3n+1)个时间段内重新返回到系统中,增强了系统的容错鲁棒性。 展开更多
关键词 容错 3TP/C GMP
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外源性C-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响 被引量:3
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作者 闫文娟 吴补领 +4 位作者 屈铁军 高杰 赵红萍 苏凌云 余擎 《牙体牙髓牙周病学杂志》 CAS 北大核心 2009年第9期510-512,共3页
目的:初步探讨外源性c-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。方法:外源性c-di-GMP与生理盐水分别加入至含变形链球菌UA159菌液的BHI培养基中,比较两组对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。结果:c-di-GMP处理组与生理盐水组相比,产... 目的:初步探讨外源性c-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。方法:外源性c-di-GMP与生理盐水分别加入至含变形链球菌UA159菌液的BHI培养基中,比较两组对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。结果:c-di-GMP处理组与生理盐水组相比,产酸、耐酸能力明显下降,差异有统计学意义,经t检验,P<0.05。结论:c-di-GMP可以抑制变形链球菌的产酸、耐酸能力,可以单独也可以与其它的抗龋制剂联合应用控制龋病。 展开更多
关键词 c—dj—GMP 变形链球菌 产酸 耐酸
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环二鸟苷酸与铜绿假单胞菌形成生物膜的相关性研究 被引量:2
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作者 王岚 刘新 +1 位作者 吴怡 方芳 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2012年第18期3001-3003,共3页
目的:通过构建环二鸟苷酸降解酶磷脂酶D基因突变株,探讨环二鸟苷酸与铜绿假单胞菌形成生物膜的相关性。方法:采用基因工程技术构建磷脂酶D基因突变质粒,通过同源重组转化至野生型铜绿假单胞菌PAO1,抗性筛选获得基因突变株bf-。扫描电子... 目的:通过构建环二鸟苷酸降解酶磷脂酶D基因突变株,探讨环二鸟苷酸与铜绿假单胞菌形成生物膜的相关性。方法:采用基因工程技术构建磷脂酶D基因突变质粒,通过同源重组转化至野生型铜绿假单胞菌PAO1,抗性筛选获得基因突变株bf-。扫描电子显微镜下观察基因突变株与野生菌株生物膜表型的差异。结果:与野生菌株相比,基因突变株bf-细菌微克隆的形成增加,有利于细菌在导管材料表面形成生物膜。结论:环二鸟苷酸的增加可促进细菌生物膜的形成,与铜绿假单胞菌引起的院内感染和耐药性密切相关。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 铜绿假单胞菌 基因突变 生物膜
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Biofilm与c-di-GMP专刊序言--微生物的社会性、c-di-GMP调控及研究新技术 被引量:2
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作者 钱韦 马旅雁 +1 位作者 谷立川 张炼辉 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1351-1356,共6页
生物被膜(Biofilm)是微生物生存的主要形式。它是一种或多种微生物通过胞外多糖、胞外DNA、蛋白质等组成的基质聚集在一起形成的细胞多聚体。生物被膜中的微生物细胞之间存在密切的信号通讯,并且表现出与浮游生活时完全不同的生理代谢特... 生物被膜(Biofilm)是微生物生存的主要形式。它是一种或多种微生物通过胞外多糖、胞外DNA、蛋白质等组成的基质聚集在一起形成的细胞多聚体。生物被膜中的微生物细胞之间存在密切的信号通讯,并且表现出与浮游生活时完全不同的生理代谢特征,其发育过程受到环二鸟苷单磷酸(c-di-GMP)等细胞第二信使的控制。由于生物被膜在基础生命科学和医疗、工业、农业、环境治理等应用科学中的重要性,相关研究是微生物学领域的前沿之一。本期专刊从生物工程、研究技术、感染与免疫、环境生物学和植物病理学等角度,较系统地对生物被膜的形成机制、调控分子机理、理化特性和应用技术等进行了综述或研究,展示了我国在本领域的研究水平,同时也对本领域未来发展趋势进行了有益的讨论。 展开更多
关键词 生物被膜 环二乌苷单磷酸 调控机制 新技术
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环二鸟苷酸(c-di-GMP)作为潜在免疫佐剂的研究进展 被引量:1
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作者 丛晓燕 时建立 +6 位作者 孙文博 李俊 杜以军 吴家强 陈蕾 陈智 王金宝 《中国兽药杂志》 2014年第2期59-62,共4页
环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,近年来研究发现环二鸟苷酸作为免疫调节剂作用于真核细胞可产生良好的免疫调节作用,实验研究表明其有可能成为具有潜力的疫苗佐剂。本... 环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,近年来研究发现环二鸟苷酸作为免疫调节剂作用于真核细胞可产生良好的免疫调节作用,实验研究表明其有可能成为具有潜力的疫苗佐剂。本文综述了c-di-GMP的结构,生物学功能、免疫特性和作为疫苗佐剂研究等方面的最新研究进展。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 疫苗 佐剂 免疫
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Zynq平台的TTP/C总线控制器容错算法设计 被引量:2
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作者 陈飞 张天宏 《单片机与嵌入式系统应用》 2016年第11期24-27,共4页
在自主设计的TTP/C总线控制器中,充分利用Zynq芯片的可编程逻辑单元和程序处理单元,设计了一种基于成员关系协议(GMP)的容错算法,以快速检测与隔离总线集群中的故障节点。试验表明,所设计的容错算法能有效检测并隔离总线集群中的故障节点。
关键词 容错算法 Zynq TTP/C GMP
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变形链球菌gcp基因敲除菌株表达谱基因芯片 被引量:1
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作者 谢苗苗 胡晓聪 +1 位作者 吴补领 闫文娟 《中国组织工程研究》 CAS CSCD 2013年第33期5988-5994,共7页
背景:前期研究中经证实变形链球菌内部存在单磷酸鸟苷环二聚体信号通路,构建了变形链球菌 gcp 基因敲除菌株。目的:比较变形链球菌野生菌种和 gcp 基因突变菌株基因表达的差异情况,筛选与生物膜相关的基因,进入后续研究。方法:提取两种... 背景:前期研究中经证实变形链球菌内部存在单磷酸鸟苷环二聚体信号通路,构建了变形链球菌 gcp 基因敲除菌株。目的:比较变形链球菌野生菌种和 gcp 基因突变菌株基因表达的差异情况,筛选与生物膜相关的基因,进入后续研究。方法:提取两种细菌的总 RNA,反转录后分别用 cy3 和 cy5 染色。与基因芯片杂交后,扫描结果,进行数据分析,获取差异基因信息,对筛选的基因进行 Real-Time PCR 验证。结果与结论:差异基因主要与糖代谢、生物膜形成有关,选择了 2 个基因进行验证,PCR 结果与芯片结果相符合。变形链球菌 gcp 基因敲除后,突变菌株 ahpC 基因表达上调,磷酸转移酶系统基因表达下调,说明这 2个基因与 c-di-GMP 信号通路的下游途径相关。 展开更多
关键词 组织构建 组织构建细胞学实验 变形链球菌 基因芯片 C-DI-GMP 信号通路 AHPC 磷酸转移酶系统 国家自然科学基金
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