转录因子Jun是丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路下游重要的响应因子,可参与细胞生长、死亡和免疫反应等多种生命活动的调节。但对其在家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus,Bm-NPV)...转录因子Jun是丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路下游重要的响应因子,可参与细胞生长、死亡和免疫反应等多种生命活动的调节。但对其在家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus,Bm-NPV)侵染的家蚕细胞中的表达调控机制尚鲜见报道。为了深入探究BmJun在病毒侵染过程中对下游靶基因的调控作用,本研究采用ChIP-seq技术对家蚕BmN细胞中BmJun富集的DNA片段展开分析并进行鉴定。ChIP-seq结果发现大量的结合峰,除了坐落在基因间区外,还在基因启动子区有富集,并且在转录起始位点上下游1000 bp处的reads计数密度较大,暗示BmJun具有调控下游基因的作用。GO功能富集分析显示,BmJun结合的基因涉及组织器官发育、细胞质膜成分、信号受体活性、分子传感器活性、跨膜信号受体活性等功能。KEGG信号通路富集结果显示,BmJun结合相关基因在Wnt信号通路、昆虫激素合成、细胞色素P450对外源性药物的代谢作用、视黄醇新陈代谢、Hippo信号通路、黑色素生成、不饱和脂肪酸的生物合成、cAMP信号通路、mTOR信号通路、凋亡等通路有显著富集。最后,经过筛选获得并鉴定了BmJun在宿主基因组上结合的靶基因,根据已报道的Jun功能分析了BmJun的下游调控网络。研究结果将为BmNPV侵染期间家蚕转录因子BmJun参与调控相关功能的深入研究提供新参考。展开更多
文摘转录因子Jun是丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路下游重要的响应因子,可参与细胞生长、死亡和免疫反应等多种生命活动的调节。但对其在家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus,Bm-NPV)侵染的家蚕细胞中的表达调控机制尚鲜见报道。为了深入探究BmJun在病毒侵染过程中对下游靶基因的调控作用,本研究采用ChIP-seq技术对家蚕BmN细胞中BmJun富集的DNA片段展开分析并进行鉴定。ChIP-seq结果发现大量的结合峰,除了坐落在基因间区外,还在基因启动子区有富集,并且在转录起始位点上下游1000 bp处的reads计数密度较大,暗示BmJun具有调控下游基因的作用。GO功能富集分析显示,BmJun结合的基因涉及组织器官发育、细胞质膜成分、信号受体活性、分子传感器活性、跨膜信号受体活性等功能。KEGG信号通路富集结果显示,BmJun结合相关基因在Wnt信号通路、昆虫激素合成、细胞色素P450对外源性药物的代谢作用、视黄醇新陈代谢、Hippo信号通路、黑色素生成、不饱和脂肪酸的生物合成、cAMP信号通路、mTOR信号通路、凋亡等通路有显著富集。最后,经过筛选获得并鉴定了BmJun在宿主基因组上结合的靶基因,根据已报道的Jun功能分析了BmJun的下游调控网络。研究结果将为BmNPV侵染期间家蚕转录因子BmJun参与调控相关功能的深入研究提供新参考。
