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转录组水平分析非洲菊bZIP基因家族对隐地疫霉菌侵染的响应
1
作者 卢珍红 李绅崇 +3 位作者 单芹丽 吴丽芳 杨春梅 原晓龙 《西部林业科学》 北大核心 2025年第6期1-13,共13页
为探究非洲菊bZIP基因家族在响应隐地疫霉菌侵染中的功能,本研究首先对侵染后不同时期的根部和叶片组织进行Illumina测序,并通过生物信息学方法从非洲菊全基因组中鉴定出bZIP基因家族成员。以此为基础,进一步整合转录组表达谱与RT-PCR... 为探究非洲菊bZIP基因家族在响应隐地疫霉菌侵染中的功能,本研究首先对侵染后不同时期的根部和叶片组织进行Illumina测序,并通过生物信息学方法从非洲菊全基因组中鉴定出bZIP基因家族成员。以此为基础,进一步整合转录组表达谱与RT-PCR验证分析,系统分析该基因家族在防御反应中的潜在功能。结果显示:(1)不同感染时期根部和叶片的转录组数据中存在许多DEGs;功能富集分析显示根据富集程度排名前四的代谢通路分别为氨基酸生物合成、植物激素信号转导、苯丙烷代谢途径、半胱氨酸和甲硫氨酸代谢等。(2)利用生物信息学方法从非洲菊全基因组数据中筛选到79个bZIP家族基因,分别命名为GjbZIP1~GjbZIP79;聚类将其分为12个亚家族,其中D簇参与植物抗病和发育,有11个成员;保守结构域显示bZIPs均至少含有1个N-X7-R/K保守基序。(3)顺式作用元件分析发现,GjbZIP11和GjbZIP42这2个转录因子含有激素响应元件、TCA-element,与拟南芥启动病害防御相依的元件一致。(4)RT-PCR分析显示D簇GjbZIP11和GjbZIP42的表达水平较高;隐地疫霉菌侵染非洲菊根部后,GjbZIP11基因的表达量先显著下降,然后逐步上升;GjbZIP42则呈现出下降-上升-下降的趋势;在叶部,这2个基因均呈现逐步上升的趋势。本研究可为非洲菊bZIP转录因子在抗隐地疫霉菌侵染响应及功能验证提供数据支持和理论基础。 展开更多
关键词 非洲菊 隐地疫霉菌 转录因子bzip 基因家族分析 生物胁迫
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bZIP转录因子CsFcr3调控暹罗炭疽菌对DMI和QoI类杀菌剂敏感性的功能研究
2
作者 杨洪 张超 +3 位作者 薛雯轩 黄韦媛 林春花 王立丰 《生物技术通报》 北大核心 2025年第12期342-350,共9页
【目的】从我国橡胶树炭疽病的田间优势菌暹罗炭疽菌(Colletotrichum siamense)中克隆bZIP转录因子CsFcr3,明确其序列和结构特征,分析CsFcr3在暹罗炭疽菌对6种不同类型杀菌剂敏感性中的生物学功能,为深入研究病原真菌耐药性调控机制奠... 【目的】从我国橡胶树炭疽病的田间优势菌暹罗炭疽菌(Colletotrichum siamense)中克隆bZIP转录因子CsFcr3,明确其序列和结构特征,分析CsFcr3在暹罗炭疽菌对6种不同类型杀菌剂敏感性中的生物学功能,为深入研究病原真菌耐药性调控机制奠定基础。【方法】采用同源克隆从C.siamense中克隆了bZIP转录因子CsFcr3,并进行序列及结构特征分析,利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析杀菌剂胁迫下CsFcr3的表达模式;利用同源重组和PEG介导的原生质体转化技术对CsFcr3进行基因敲除,分析敲除突变体对不同杀菌剂敏感性的变化。【结果】CsFcr3开放阅读框长度为1101 bp,编码336个氨基酸残基,具有bZIP_Yap保守结构域;RT-qPCR结果表明,DMI类杀菌剂苯醚甲环唑、戊唑醇、咪鲜胺及甲氧基丙烯酸酯(QoI)类杀菌剂吡唑醚菌酯胁迫下CsFcr3均显著上调表达;与野生型菌株相比,CsFcr3基因缺失突变体对氟康唑、戊唑醇和咪鲜胺的敏感性均降低,对吡唑醚菌酯的敏感性增加,而对苯醚甲环唑和咯菌腈的敏感性无显著变化。【结论】从暹罗炭疽菌中克隆得到具有bZIP转录因子典型基序和保守结构域的CsFcr3,且与酿酒酵母Yap3p高度同源。CsFcr3主要参与调控暹罗炭疽菌对DMI类和QoI类杀菌剂的敏感性而不参与菌株对吡咯类杀菌剂敏感性的调控。 展开更多
关键词 炭疽病 暹罗炭疽 巴西橡胶树 bzip转录因子 杀菌剂 敏感性
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续随子bZIP转录因子家族鉴定及其响应干旱胁迫的分析
3
作者 葛丽萍 苏云婷 +3 位作者 张玉胜 王子瑜 孙岩 李润植 《植物生理学报》 北大核心 2025年第9期1331-1348,共18页
碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)转录因子是普遍存在于真核生物中相对保守的一类转录调节因子,广泛参与调节植物生长发育及逆境胁迫应答等生物学过程。为解析续随子(Euphorbia lathyris)bZIP蛋白的生物学功能,本研究鉴定续随... 碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)转录因子是普遍存在于真核生物中相对保守的一类转录调节因子,广泛参与调节植物生长发育及逆境胁迫应答等生物学过程。为解析续随子(Euphorbia lathyris)bZIP蛋白的生物学功能,本研究鉴定续随子bZIP基因家族成员并分析其理化特性,探究其在干旱胁迫下的表达谱。结果表明,从续随子全基因组中鉴定出44个bZIP基因家族成员,不均匀分布在9条染色体上,片段重复是ElbZIP基因家族进化和扩增的主要驱动力。续随子bZIP家族成员划分为12个亚族。启动子顺式作用元件分析显示,ElbZIP基因启动子区域含有多种胁迫响应元件。选择启动子区域同时包含干旱胁迫响应元件(MBS)和防御与胁迫应答元件(TC-rich repeats)的7个ElbZIP候选基因分析其表达谱,发现ElbZIP基因在7个组织中都有表达,但表达量有差异,其中ElbZIP1整体表达水平较高。ElbZIP1基因在干旱胁迫的叶片和根部表达量较高。ElbZIP1蛋白位于细胞核,行使转录调控功能。与非转基因对照植株相比,异源超表达ElbZIP1转基因烟草植株的超氧化物歧化酶(SOD)活性和可溶性糖含量升高,丙二醛(MDA)含量显著下降,膜脂氧化减少。进一步对烟草内源相关基因表达分析揭示,过表达ElbZIP1显著上调干旱胁迫信号通路相关的NtRD22、NtRD29A等抗逆基因的表达。本研究结果表明,部分bZIP家族成员参与了续随子干旱胁迫应答,其中ElbZIP1正向调控植物抗旱性。 展开更多
关键词 续随子 碱性亮氨酸拉链(bzip) 干旱胁迫 烟草遗传转化 亚细胞定位
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构树bZIP基因家族鉴定及硒代谢相关基因筛选
4
作者 卜宪辰 郭龙飞 +5 位作者 祝嫦晔 陈强文 程水源 张威威 许锋 廖咏玲 《南方农业学报》 北大核心 2025年第1期135-148,共14页
【目的】对构树bZIP基因家族成员进行鉴定及分析,并筛选构树中参与硒代谢的关键基因,为深入研究构树bZIP基因家族生物学功能及其在构树硒代谢中的作用机制提供理论依据。【方法】基于构树全基因组数据,利用生物信息学方法鉴定构树bZIP... 【目的】对构树bZIP基因家族成员进行鉴定及分析,并筛选构树中参与硒代谢的关键基因,为深入研究构树bZIP基因家族生物学功能及其在构树硒代谢中的作用机制提供理论依据。【方法】基于构树全基因组数据,利用生物信息学方法鉴定构树bZIP基因家族成员,并对其基因结构、启动子顺式作用元件、蛋白的系统进化关系等进行分析,并通过根癌农杆菌介导烟草叶片的瞬时转化法进行蛋白亚细胞定位。通过转录组测序(RNA-Seq)和实时荧光定量PCR分析构树bZIP家族基因在不同硒源及不同浓度处理下的表达水平。【结果】共鉴定得到38个bZIP基因家族成员(BpbZIP01~BpbZIP38),编码的氨基酸数量为140~894个,相对分子质量为16357.39~96969.63 Da,理论等电点为5.24~9.76,均为亲水性蛋白,不稳定系数为52.54~73.89,36个BpbZIPs蛋白定位于细胞核,BpbZIP15和BpbZIP19分别定位于过氧化物酶体和内质网。由系统发育进化树可知,将BpbZIPs蛋白分为10个亚族,BpbZIPs蛋白在各亚族中的数量为6个(A亚族)、1个(B亚族)、1个(C亚族)、7个(D亚族)、2个(E亚族)、1个(F亚族)、4个(G亚族)、2个(H亚族)、6个(I亚族)和8个(S亚族),各亚族中多数BpbZiPs与桑树bZIP聚成一支。不同BpbZIPs基因在外显子数量上差异较大,为1~16个,但相同亚族的基因长度和结构具有一定的相似性。BpbZIPs基因启动子含有光响应、激素和胁迫应答等多种响应元件。在不同浓度的硒酸钠和亚硒酸钠处理下,除BpbZIP17基因未表达外,其余BpbZIPs基因均对硒处理有上调或下调表达。结合相关分析和实时荧光定量PCR结果可知,亚硒酸钠和硒酸钠处理后BpbZIP04和BpbZIP05基因的表达水平均与总硒含量密切相关。【结论】构树bZIP基因家族成员参与多种生物和非生物胁迫,BpbZIP04和BpbZIP05基因在构树硒代谢与耐受性中发挥重要作用。 展开更多
关键词 构树 bzip基因家族 生物信息学分析 表达模式 硒代谢
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蓖麻bZIP基因家族的全基因组鉴定、生物信息学及表达分析 被引量：2
5
作者 王冬艳 张春玲 +3 位作者 冯研 王丽新 昝睿 狄建军 《安徽农学通报》 2025年第2期27-35,共9页
为了解蓖麻bZIP基因家族成员的组成和家族进化关系及特征,本研究利用生物信息学鉴定家族成员,进行基因结构、蛋白质保守基序分析及系统发育分析,同时分析其蛋白的理化性质、磷酸化位点和互作关系,以及该基因在组织中的表达模式和表达量... 为了解蓖麻bZIP基因家族成员的组成和家族进化关系及特征,本研究利用生物信息学鉴定家族成员,进行基因结构、蛋白质保守基序分析及系统发育分析,同时分析其蛋白的理化性质、磷酸化位点和互作关系,以及该基因在组织中的表达模式和表达量。结果表明,共鉴定出46个蓖麻bZIP基因家族成员,位于10个染色体上;基因结构与蛋白质保守基序较为复杂,可分为11个亚族,包含25个基序;与拟南芥进化相似,较为保守;bZIP蛋白为亲水性蛋白,位于细胞核、细胞膜和叶绿体,主要通过丝氨酸的磷酸化来发挥生物学作用,蛋白RcbZIP18、RcbZIP27、RcbZIP2、RcbZIP17和RcbZIP46之间的联系较多,通过蛋白间的相互作用参与蓖麻各个生长时期;该基因家族均参与叶、茎、根和胚等生长时期的发育调控,其中RcbZIP10、RcbZIP25和RcbZIP44在叶片和种子中表现出明显的组织差异性。上述结果为蓖麻bZIP基因家族成员的功能研究提供参考。 展开更多
关键词 蓖麻 bzip家族 生物信息学分析 系统进化 表达分析
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野菊CibZIP43基因及其启动子的克隆与表达分析
6
作者 刘晏廷 黄沁梅 何淼 《北方园艺》 北大核心 2025年第11期23-31,共9页
以野菊(Chrysanthemum indicum)为试材,基于镉胁迫转录组数据,采用RT-PCR克隆、生物信息学分析及启动子功能验证技术,解析CibZIP43基因在镉胁迫响应中的作用机制,以期为发掘野菊抗逆基因资源提供参考依据。结果表明:CibZIP43基因开放阅... 以野菊(Chrysanthemum indicum)为试材,基于镉胁迫转录组数据,采用RT-PCR克隆、生物信息学分析及启动子功能验证技术,解析CibZIP43基因在镉胁迫响应中的作用机制,以期为发掘野菊抗逆基因资源提供参考依据。结果表明:CibZIP43基因开放阅读框长516 bp,编码171个氨基酸,其蛋白相对分子质量为20144.29,属不稳定亲水性蛋白,与菊科青蒿同源关系最近;该基因受镉胁迫显著诱导,在叶中的表达量于1 h降至最低,根中于8 h达最低值。启动子序列含MYB结合位点、脱落酸、乙烯及光响应等顺式作用元件。构建5′端缺失片段瞬时表达载体后通过GUS活性检测证实其启动子具有功能活性。 展开更多
关键词 野菊 bzip 镉胁迫 启动子 表达分析
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橡胶草bZIP基因家族鉴定及胶乳高表达基因功能分析
7
作者 赵同 张盛敏 +2 位作者 曹杰 唐朝荣 刘开业 《南方农业学报》 北大核心 2025年第9期2723-2735,共13页
[目的]探究橡胶草bZIP基因家族在天然橡胶生物合成中的调控功能,为解析b ZIP转录因子在天然橡胶生物合成中的调控机制打下基础。[方法]采用生物信息学方法从橡胶草全基因组中鉴定出bZIP基因家族成员,对其基因结构及编码蛋白保守基序、... [目的]探究橡胶草bZIP基因家族在天然橡胶生物合成中的调控功能,为解析b ZIP转录因子在天然橡胶生物合成中的调控机制打下基础。[方法]采用生物信息学方法从橡胶草全基因组中鉴定出bZIP基因家族成员,对其基因结构及编码蛋白保守基序、保守结构域进行预测分析,基于转录组测序数据筛选出在胶乳组织中较高表达且具有组织表达特异性的候选基因,PCR克隆候选基因的编码区(CDS)序列,并对其编码蛋白进行亚细胞定位、转录自激活活性和蛋白互作分析。将构建的基因敲除载体pCAMBIA1300-pYAO-cas9-TkbZIPs和超表达载体pCAMBIA1300-35S-TkbZIPs-GFP进行遗传转化,筛选获得TkbZIPs基因敲除株系和超表达株系。[结果]从橡胶草中共鉴定到53个bZIP基因家族成员,根据不同组织的转录组数据筛选出4个候选基因TkbZIP1、TkbZIP2、TkbZIP3和TkbZIP4,其CDS序列长度为468、564、465和1092 bp,分别编码155、187、154和363个氨基酸残基。通过实时荧光定量PCR验证发现,仅TkbZIP3和TkbZIP4基因在胶乳中表达量较高,其中TkbZIP4基因在胶乳中具有特异性表达,而TkbZIP1和TkbZIP2在胶乳中的相对表达量较低,无明显的组织表达特异性。亚细胞定位结果显示,4个TkbZIPs蛋白均定位在细胞核。酵母转录自激活试验结果显示,TkbZIP1、TkbZIP2和TkbZIP3具有转录自激活活性,而TkbZIP4无转录自激活活性。双分子荧光互补(BiFC)试验结果显示,TkbZIP1、TkbZIP2、TkbZIP3和TkbZIP4蛋白之间相互作用形成异源二聚体,且4个TkbZIPs蛋白自身也能相互作用形成同源二聚体。通过遗传转化获得TkbZIP2和TkbZIP3基因超表达株系和TkbZIP1、TkbZIP2和TkbZIP3基因敲除株系。[结论]TkbZIP1、TkbZIP2、TkbZIP3和TkbZIP4基因在胶乳中高表达,可能在天然橡胶生物合成中发挥重要的调控功能。4个胶乳中高表达的TkbZIPs蛋白之间能形成同源二聚体或异源二聚体,推测b ZIP蛋白以二聚体形式调控下游基因表达。成功获得了TkbZIP2和TkbZIP3基因超表达材料和TkbZIP1、TkbZIP2和TkbZIP3基因敲除材料,可用于后续bZIP基因家族调控天然橡胶生物合成研究。 展开更多
关键词 橡胶草 bzip基因家族 鉴定 超表达 敲除
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黄栌枯萎病菌转录因子VdbZIP2的功能
8
作者 李洒 王永林 《中国森林病虫》 北大核心 2025年第2期1-11,共11页
为深入探究引起毁灭性林木病害——黄栌枯萎病病原菌大丽轮枝菌Verticillium dahliae的致病机制,通过PEG介导原生质体遗传转化法获得黄栌枯萎病菌bZIP转录因子VdbZIP2突变体,开展VdbZIP2突变体的生物学性状分析,并进行致病性测定。结果... 为深入探究引起毁灭性林木病害——黄栌枯萎病病原菌大丽轮枝菌Verticillium dahliae的致病机制,通过PEG介导原生质体遗传转化法获得黄栌枯萎病菌bZIP转录因子VdbZIP2突变体,开展VdbZIP2突变体的生物学性状分析,并进行致病性测定。结果表明:敲除VdbZIP2明显影响了黄栌枯萎病菌黑色素合成、微菌核发育、细胞壁胁迫敏感性以及对速效氮源的利用,VdbZIP2不是毒性必需的基因。明确黄栌枯萎病菌转录因子VdbZIP2参与微菌核形成、逆境胁迫和氮源利用过程,为后续深入解析VdbZIP2的分子调控网络提供重要线索。 展开更多
关键词 大丽轮枝菌 黄栌枯萎病 bzip转录因子 黑色素 微菌核 毒性
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富民枳bZIP基因家族的鉴定和干旱胁迫表达 被引量：1
9
作者 张珊珊 张攀 杨文忠 《东北林业大学学报》 北大核心 2025年第4期12-22,共11页
为深入研究富民枳bZIP基因家族在干旱胁迫中发挥的功能及筛选抗旱基因,采用生物信息学的方法对富民枳bZIP基因家族进行分析。结果表明:富民枳中鉴定到53个bZIP基因,不均匀地分布在9条染色体上。根据系统进化分析,这些基因可划分为10个亚... 为深入研究富民枳bZIP基因家族在干旱胁迫中发挥的功能及筛选抗旱基因,采用生物信息学的方法对富民枳bZIP基因家族进行分析。结果表明:富民枳中鉴定到53个bZIP基因,不均匀地分布在9条染色体上。根据系统进化分析,这些基因可划分为10个亚族,不同亚族的内含子数目及保守基序差异较大。共线性分析表明,富民枳bZIP基因之间存在片段复制事件,富民枳bZIP与拟南芥和枳分别存在62和69个同源基因对。GO和KEGG富集分析表明,PpbZIPs成员响应ABA和渗透压刺激,参与植物激素信号转导途径。顺式作用元件分析表明,PpbZIPs基因启动子含大量的干旱响应元件和ABA响应元件。利用枳的转录组数据,筛选了8个富民枳bZIP抗旱候选基因。qRT-PCR分析结果表明,在干旱胁迫下,除了PpbZIP46其余7个基因表达均显著上升,表明这些基因参与了干旱胁迫响应。受干旱胁迫诱导上调表达的7个PpbZIPs基因,可能是重要的抗旱基因,研究结果为挖掘富民枳bZIP抗旱基因提供参考。 展开更多
关键词 富民枳 bzip 干旱胁迫 系统进化 表达分析
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木薯MebZIP27基因的克隆与原核表达分析
10
作者 曾力旺 张小燕 +7 位作者 林墁 杨静琳 林素妍 潘子墨 雷鑫芳 吴春来 曾坚 胡伟 《福建农业学报》 北大核心 2025年第1期1-9,共9页
【目的】碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)蛋白是真核生物中一类独特的转录因子,在植物的生长、发育和生理代谢调控中发挥着关键作用。特别是A类bZIPs通常负责调控携带ABA依赖元件的基因,进而引发ABA响应或实现环境适应。深... 【目的】碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)蛋白是真核生物中一类独特的转录因子,在植物的生长、发育和生理代谢调控中发挥着关键作用。特别是A类bZIPs通常负责调控携带ABA依赖元件的基因,进而引发ABA响应或实现环境适应。深入研究A类木薯bZIPs转录因子的功能,可进一步了解其调控ABA表达的分子机理。【方法】通过RT-PCR技术克隆MebZIP27基因,并运用生物信息学方法对其进行基因和蛋白质水平的分析。此外,通过荧光定量PCR检测MebZIP27基因的时空表达模式及其对逆境的响应,并尝试通过原核表达获得MebZIP27蛋白。【结果】MebZIP27基因位于木薯第5号染色体上,编码区全长1251 bp,具备典型的bZIP结构域特征。该基因与麻风树(Hevea brasiliensis)和橡胶树(Jatropha curcas)的A类bZIP序列一致性分别高达80.00%和85.41%,表明其属于A类bZIP亚族成员。亚细胞定位结果显示,MebZIP27基因位于细胞核。qRT-PCR分析结果表明,MebZIP27基因在木薯储藏根中表达最为显著。在甘露醇、NaCl和低温处理下,MebZIP27基因未表现出显著诱导表达,但在ABA和H2O2处理下表现出显著诱导。通过原核表达成功获得了MebZIP27基因编码的蛋白,并通过谷胱甘肽琼脂糖珠微球分离技术对GST-MebZIP27蛋白进行了纯化。【结论】木薯中的MebZIP27基因属于A类bZIP基因家族,定位于细胞核,在木薯储藏根中的表达最为显著。此外,MebZIP27基因在ABA和H2O2处理下表现出显著诱导。这些结果为深入研究MebZIP27基因在ABA信号调控中的作用提供了参考依据。 展开更多
关键词 木薯 bzips 非生物胁迫 原核表达
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bZIP转录因子在植物逆境响应中的作用
11
作者 胡昳凡 王敏丽 +6 位作者 孙志博 王欣悦 赵楠 王嫱 徐鹤轩 王雪松 刘丽杰 《高师理科学刊》 2025年第12期78-83,共6页
在植物的生长发育中经常会受到多种逆境的伤害,如干旱、盐渍、低温、高温及病虫害等,植物体内会形成一系列的响应机制来应对各种生物胁迫及非生物胁迫造成的影响。作为植物转录因子家族的重要成员,bZIP转录因子结构域由碱性区域和亮氨... 在植物的生长发育中经常会受到多种逆境的伤害,如干旱、盐渍、低温、高温及病虫害等,植物体内会形成一系列的响应机制来应对各种生物胁迫及非生物胁迫造成的影响。作为植物转录因子家族的重要成员,bZIP转录因子结构域由碱性区域和亮氨酸拉链区域两部分组成,bZIP蛋白通过其特有的亮氨酸拉链结构域,在多种逆境响应过程中发挥核心调控作用。介绍了b ZIP转录因子的结构特征及其分子作用机制,系统性地整合了b ZIP蛋白在应对干旱、高盐、极端温度等非生物胁迫以及病原体、虫害等生物胁迫中的特异性调控机制。重点阐释了其通过磷酸化修饰、异源二聚化等进行调控的分子机制,如何作为关键节点参与ABA,JA,SA等多种激素信号通路,从而构建出协同的胁迫响应网络。不仅总结了b ZIP介导的胁迫适应性策略,还讨论了当前研究的局限性,并提出了利用合成生物学手段操纵关键b ZIP基因以培育抗逆作物的构想,为深入解析植物抗逆分子网络提供了新的视角和理论框架。 展开更多
关键词 bzip转录因子 生物胁迫 非生物胁迫
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药用植物中bZIP转录因子家族的研究进展
12
作者 胡漪文 陈丽娟 +1 位作者 黄利 王光志 《中药与临床》 2025年第2期56-61,16,共7页
中药材的产量和品质受其基原植物的生长发育及活性物质的合成与积累影响。碱性亮氨酸拉链(basic-region leucinezipper,bZIP)转录因子能够调控基因表达,从而参与植物的多个生理过程。目前从多种药用植物中鉴定出的bZIP转录因子家族成员... 中药材的产量和品质受其基原植物的生长发育及活性物质的合成与积累影响。碱性亮氨酸拉链(basic-region leucinezipper,bZIP)转录因子能够调控基因表达,从而参与植物的多个生理过程。目前从多种药用植物中鉴定出的bZIP转录因子家族成员显示出其在药用植物生长发育、抗逆胁迫和活性物质的合成与积累过程中发挥积极作用。本研究围绕bZIP转录因子的结构、在药用植物中的分类与鉴定、参与调控药用植物生理过程等方面,讨论了利用bZIP转录因子深入挖掘功能基因的潜力,为bZIP转录因子的分子调控机制研究和提高中药材产量和品质奠定基础。 展开更多
关键词 bzip 药用植物 生长发育 胁迫 活性物质
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甜瓜bZIP转录因子的全基因组鉴定和分析
13
作者 特木其勒 布图格勒 +1 位作者 金兰 高峰 《内蒙古师范大学学报(自然科学版蒙古文)》 2025年第1期10-18,70,共10页
甜瓜(Cucumismelo L.)含有56个bZIP转录因,基因组分析表明,大部分bZIP转录因蛋白的等电点较高,含有多个motif1结构以及不同的顺式作用元件。这些基因参与调节应激反应、生长发育等过程。基因表达分析显示,甜瓜不同组织中bZIP基因含量与... 甜瓜(Cucumismelo L.)含有56个bZIP转录因,基因组分析表明,大部分bZIP转录因蛋白的等电点较高,含有多个motif1结构以及不同的顺式作用元件。这些基因参与调节应激反应、生长发育等过程。基因表达分析显示,甜瓜不同组织中bZIP基因含量与种类也不同,例如,MELO3C025623.2.1基因在甜瓜叶含量最高,MELO3C009753.2.1基因在甜瓜根部含量高等。蛋白互作分析表明,该家族互作蛋白主要参与植物昼夜节律调节、离子转运、植物MAPK信号传递、植物激素转导、特异性DNA结合等途径。 展开更多
关键词 甜瓜 bzip 转录因子 基因家族
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铁皮石斛bZIP转录因子家族全基因组鉴定及表达分析
14
作者 曾丹 黄园 +5 位作者 王健 张艳 刘庆霞 谷荣辉 孙庆文 陈宏宇 《生物技术通报》 北大核心 2025年第8期197-210,共14页
【目的】鉴定铁皮石斛(Dendrobium officinale) bZIP基因家族,通过生物信息学和基因表达分析,阐明DobZIP转录因子的生物学功能,为后续深入探究DobZIP转录因子的分子机制提供理论指导。【方法】基于IMP数据库中的铁皮石斛基因组数据鉴定... 【目的】鉴定铁皮石斛(Dendrobium officinale) bZIP基因家族,通过生物信息学和基因表达分析,阐明DobZIP转录因子的生物学功能,为后续深入探究DobZIP转录因子的分子机制提供理论指导。【方法】基于IMP数据库中的铁皮石斛基因组数据鉴定出铁皮石斛bZIP基因家族成员,对该家族成员进行多项生物信息学分析,同时利用转录组数据和实时荧光定量PCR技术对DobZIP转录因子进行组织表达模式及非生物胁迫表达分析。【结果】共鉴定出54个DobZIP基因,DobZIP蛋白均无信号肽,仅有DobZIP54有跨膜结构域,亚细胞定位主要在细胞核中。DobZIP家族成员划分在10个亚家族,且同一亚家族成员含有相似的结构和基序;DobZIP不均匀地分布在18条染色体上,有两对基因间存在串联关系,种间存在多条共线性关系,与水稻的b ZIP家族同源性较高。顺势作用元件分析表明,DobZIP家族成员均含有多个参与生长发育和响应逆境胁迫的顺式作用元件。基因表达模式分析显示,DobZIP家族成员存在组织表达特异性,且DobZIP4、DobZIP10、DobZIP28、DobZIP32、DobZIP37在不同程度上受低温、干旱和氯化钠胁迫的诱导。除DobZIP32和DobZIP37外,DobZIP4、DobZIP10、DobZIP28还受高温胁迫的诱导。【结论】铁皮石斛基因组中共鉴定出54个DobZIP基因,DobZIP具有组织表达特异性,且DobZIP4、DobZIP10、DobZIP28、DobZIP32、DobZIP37在低温、干旱和氯化钠胁迫下均受到不同程度的诱导。 展开更多
关键词 铁皮石斛 转录因子 bzip 生信分析 基因表达分析
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党参bZIP转录因子家族的鉴定和表达分析
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作者 张晨 刘吉爽 +1 位作者 姚远 肖莹 《植物生理学报》 北大核心 2025年第6期777-788,共12页
碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与了植物生长发育、胁迫响应和次生代谢产物生物合成等过程。本研究在党参(Codonopsis pilosula)基因组中鉴定出41个bZIP家族基因。系统发育分析将其分为13个亚族;... 碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与了植物生长发育、胁迫响应和次生代谢产物生物合成等过程。本研究在党参(Codonopsis pilosula)基因组中鉴定出41个bZIP家族基因。系统发育分析将其分为13个亚族;基因结构和保守基序分析表明,同一亚族的蛋白具有相似的保守基序和结构域,Motif 1为bZIP家族特有的碱性区域,保守性最强,在党参bZIP蛋白中均有分布;顺式作用元件分析表明,bZIP成员上游启动子区域存在多种非生物胁迫元件、激素响应元件和防御应激反应元件,其中光信号响应元件占比最大;转录组表达模式分析显示,17条bZIP基因在高光处理下表达量升高,其中的6条积极响应光信号。本研究将为党参bZIP转录因子的功能研究奠定基础,为参与光信号响应的bZIP转录因子的筛选提供依据。 展开更多
关键词 bzip转录因子 党参 系统发育分析 光信号响应
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多刺绿绒蒿bZIP基因家族的鉴定及生物信息学分析
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作者 李真 马兰民 +2 位作者 张文惠平 东主南加 孙胜男 《种子》 北大核心 2025年第8期10-20,29,共12页
bZIP转录因子家族在植物生长发育、次生代谢调控以及环境响应等过程中发挥着关键作用。为探究bZIP基因家族在藏药多刺绿绒蒿中的功能,整合藏药多刺绿绒蒿全长转录组的数据,鉴定了bZIP基因家族成员,并对这些基因及其编码的蛋白进行理化... bZIP转录因子家族在植物生长发育、次生代谢调控以及环境响应等过程中发挥着关键作用。为探究bZIP基因家族在藏药多刺绿绒蒿中的功能,整合藏药多刺绿绒蒿全长转录组的数据,鉴定了bZIP基因家族成员,并对这些基因及其编码的蛋白进行理化性质、保守结构域、系统进化关系等生物信息学分析。结果表明,成功筛选出87个bZIP基因,编码的蛋白均具有bZIP结构域,氨基酸数目介于107~723个之间,分子量介于12497.14~44951.86 Da之间,理论等电点在5.18~9.98之间;预测大多数蛋白为亲水性不稳定蛋白且定位于细胞核。系统进化分析表明,多刺绿绒蒿bZIP蛋白与拟南芥和水稻的bZIP基因在多个分支中均有分布,表明这些基因在序列上具有较高的相似性,且具有相似的进化方式,可能在功能上也具有一定的保守性。蛋白三级结构显示,这些蛋白在进化过程中发生了不同程度的进化,包含α-螺旋、β-转角、无规则卷曲及延伸链等空间构象。 展开更多
关键词 多刺绿绒蒿 bzip基因家族 生物信息学 全长转录组
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茶树bZIP转录因子基因CsbZIP1的克隆与表达定位 被引量：9
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作者 曹红利 岳川 +4 位作者 周艳华 王璐 郝心愿 杨亚军 王新超 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1702-1709,共8页
碱性亮氨酸拉链蛋白(bZIP)作为真核生物中分布最广、最保守的一类转录因子,参与多种生物学过程,尤其在植物抵御各种逆境胁迫中有重要作用。采用RACE和RT-PCR技术克隆到茶树bZIP转录因子基因全长cDNA序列,命名为CsbZIP1(GenBank登录号为J... 碱性亮氨酸拉链蛋白(bZIP)作为真核生物中分布最广、最保守的一类转录因子,参与多种生物学过程,尤其在植物抵御各种逆境胁迫中有重要作用。采用RACE和RT-PCR技术克隆到茶树bZIP转录因子基因全长cDNA序列,命名为CsbZIP1(GenBank登录号为JX050148.1)。该基因cDNA全长1515 bp,包含813 bp的完整开放阅读框(ORF),编码270个氨基酸,预测分子量29.484 kD;含有bZIP家族典型的BRLZ结构域碱性结构域和亮氨酸拉链,属于B-zip1家族;系统发育树分析显示CsbZIP1属于bZIP转录因子F亚家族;亚细胞定位结果表明CsbZIP1主要定位于细胞核;qRT-PCR分析表明,4℃低温和NaCl盐胁迫处理均能诱导CsbZIP1的表达,表达量变化趋势都是随着胁迫时间先逐渐升高,到24 h时降低,ABA胁迫处理24 h抑制CsbZIP1的表达。推测CsbZIP1与茶树低温、盐等逆境胁迫密切相关。 展开更多
关键词 茶树 bzip转录因子 Csbzip1 亚细胞定位 克隆表达
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东亚砂藓bZIP转录因子RjbZIP基因的克隆及表达分析 被引量：10
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作者 沙伟 张梅娟 +1 位作者 刘博 徐红红 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2015年第4期13-20,共8页
为研究b ZIP转录因子在苔藓植物中的生物学功能,以东亚砂藓转录组测序获得的一个与b ZIP转录因子同源性较高的基因片段为基础,采用RT-PCR技术克隆得到该基因的c DNA全长序列,命名为Rjb ZIP。该基因c DNA全长为1 477 bp,包含1个1 422 bp... 为研究b ZIP转录因子在苔藓植物中的生物学功能,以东亚砂藓转录组测序获得的一个与b ZIP转录因子同源性较高的基因片段为基础,采用RT-PCR技术克隆得到该基因的c DNA全长序列,命名为Rjb ZIP。该基因c DNA全长为1 477 bp,包含1个1 422 bp的开放阅读框,编码473个氨基酸,预测蛋白分子量为5.114 k Da,等电点为6.97。Rjb ZIP蛋白属于不稳定蛋白,无跨膜区和信号肽结构,亚细胞定位于细胞核。该蛋白含有典型的b ZIP结构域,该结构域包含一个亮氨酸拉链区,一个碱性结构域和一个谷氨酰胺丰富区。实时荧光定量PCR分析显示,在快速脱水、缓慢脱水和脱水后复水处理过程中,东亚砂藓Rjb ZIP基因均能被诱导表达,且对脱水后复水的反应更为迅速,推测该基因参与东亚砂藓抵抗逆境胁迫的应答,为后续进一步研究其功能特征奠定了基础。 展开更多
关键词 东亚砂藓 bzip 转录因子 Rjbzip 基因 基因克隆 表达分析
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CEBPA bZIP框内突变在急性髓系白血病中的研究进展
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作者 陈克敏 黄志斌 +1 位作者 王顺清 张文清 《广州医药》 2025年第2期139-150,共12页
CCAAT增强子结合蛋白A(CEBPA)是调节血液发育过程中髓系分化和造血干祖细胞活性的关键转录因子之一。CEBPA基因突变常见于急性髓系白血病(AML)中,最近研究表明CEBPA bZIP框内单位点和经典双等位基因突变AML患者均具有类似的临床特征,已... CCAAT增强子结合蛋白A(CEBPA)是调节血液发育过程中髓系分化和造血干祖细胞活性的关键转录因子之一。CEBPA基因突变常见于急性髓系白血病(AML)中,最近研究表明CEBPA bZIP框内单位点和经典双等位基因突变AML患者均具有类似的临床特征,已被单独划分为AML亚群。CEBPA bZIP框内突变而非传统的双等位CEBPA基因突变成为AML良好预后的分子指标,表明其在AML疾病进展和治疗预后中的重要性和特殊性。本文将从CEBPA蛋白在血液系统中的功能、CEBPA bZIP框内突变AML的临床特征与分子作用机制、以及伴CEBPA突变AML的治疗现状等方面进行综述,为进一步研究CEBPA bZIP框内突变在AML中的致病性和精准治疗新药物开发提供参考。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 CCAAT增强子结合蛋白A bzip框内突变
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泛素样含PHD和环指结构域蛋白1通过调控巨噬细胞肌腱膜纤维肉瘤因子bZIP转录因子B/细胞肌腱膜纤维肉瘤因子甲基化及自我更新影响脓毒症炎症反应的机制研究
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作者 李易晨 刘丁优 《中国医药指南》 2025年第27期52-57,共6页
目的探讨泛素样含PHD和环指结构域蛋白1(UHRF1)通过调控巨噬细胞肌腱膜纤维肉瘤因子bZIP转录因子B(MafB)/细胞肌腱膜纤维肉瘤因子(c-Maf)的甲基化及自我更新影响脓毒症炎症反应的分子机制。方法将50只8周龄健康的SPF级雄性C57BL/6小鼠... 目的探讨泛素样含PHD和环指结构域蛋白1(UHRF1)通过调控巨噬细胞肌腱膜纤维肉瘤因子bZIP转录因子B(MafB)/细胞肌腱膜纤维肉瘤因子(c-Maf)的甲基化及自我更新影响脓毒症炎症反应的分子机制。方法将50只8周龄健康的SPF级雄性C57BL/6小鼠用随机数字表法分为两组(每组25只)包括WT对照组和WT脓毒症组。WT对照组:未诱导脓毒症,腹腔注射等体积生理盐水。WT脓毒症组:采用盲肠结扎穿孔(CLP)法建立脓毒症模型。另外设置UHRF1^(-/-)脓毒症组(25只)和UHRF1-Mut脓毒症组(25只)。UHRF1^(-/-)脓毒症组:25只UHRF1条件性敲除小鼠行CLP手术。UHRF1-Mut脓毒症组:25只UHRF1点突变小鼠行CLP手术。采用实时定量PCR(qRT-PCR)、Western blot检测MafB/c-Maf的表达,并分析启动子甲基化水平。利用流式细胞术检测巨噬细胞增殖、凋亡及周期分布,免疫荧光评估CD86/CD206阳性细胞率,酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测炎症因子,并进行生存分析及评估肺组织的损伤。结果与WT对照组比,WT脓毒症组MafB/c-Maf mRNA及蛋白表达下调,启动子甲基化水平升高,巨噬细胞增殖率降低(12.45%vs.78.12%),凋亡率(67.12%vs.6.35%)及G0/G1期比例(41.84%vs.30.95%)升高,CD86阳性率增加(34.66%vs.17.34%),CD206阳性率(4.06%vs.16.52%)及Arg1 mRNA(0.18 vs.1.00)降低,促炎因子TNF-α(1.98 vs.0.30)、IL-6(1.76 vs.0.25)升高,IL-10(1.05 vs.4.50)、TGF-β(0.93 vs.4.20)降低,生存率下降(24%vs.100%),肺损伤评分(3.92 vs.0.00)增加(均P<0.05)。与WT脓毒症组比,UHRF1^(-/-)脓毒症组MafB/c-Maf表达上调及甲基化水平下调,巨噬细胞增殖率(27.34%)、CD206阳性率(15.89%)、Arg1 mRNA(0.77)及抗炎因子水平上调,凋亡率(18.23%)、G_(0)/G_(1)期比例(31.35%)、CD86阳性率(17.65%)、促炎因子水平、器官损伤及生存率(68%)显著改善;UHRF1-Mut脓毒症组上述指标呈中间表型(均P<0.05)。结论UHRF1通过增强MafB/c-Maf启动子甲基化抑制其表达,促进巨噬细胞向促炎表型转化并削弱自我更新能力,加剧脓毒症炎症反应及器官损伤;UHRF1缺失可逆转这一过程,提示其作为脓毒症治疗潜在靶点。 展开更多
关键词 脓毒症小鼠 巨噬细胞 泛素样含PHD和环指结构域蛋白1 肌腱膜纤维肉瘤因子bzip转录因子B/细胞肌腱膜纤维肉瘤因子 启动子区甲基化
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