蔗茅EfBBX基因家族鉴定及冷胁迫下表达模式分析

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作者 农韦优 赵昌祖 +5 位作者 钱禛锋 丁倩 王誉洁 陈疏影 何丽莲 李富生 《生物技术通报》 北大核心 2026年第2期267-277,共11页

【目的】B-box型锌指蛋白(BBX蛋白)在抵御植物非生物胁迫中具有重要作用。蔗茅具有良好的耐冷性,可为甘蔗的耐冷遗传改良提供基因资源。对蔗茅EfBBX基因家族成员鉴定和特征分析,并探究其在冷胁迫中的生物学功能。【方法】从蔗茅全基因... 【目的】B-box型锌指蛋白(BBX蛋白)在抵御植物非生物胁迫中具有重要作用。蔗茅具有良好的耐冷性,可为甘蔗的耐冷遗传改良提供基因资源。对蔗茅EfBBX基因家族成员鉴定和特征分析,并探究其在冷胁迫中的生物学功能。【方法】从蔗茅全基因组中鉴定出EfBBX基因家族成员,通过生物信息学方法分析其理化性质、系统进化、染色体定位、共线性分析、基因结构、保守结构域和启动子顺式元件;RT-qPCR试验对EfBBX基因家族成员进行冷胁迫下的表达模式分析。以蔗茅无性系E2为材料,克隆EfBBX4、EfBBX10和EfBBX18基因CDS序列,并将EfBBX18基因在本氏烟草中进行瞬时表达。【结果】在蔗茅全基因组中鉴定出19个EfBBX基因家族成员,划分为5个亚家族,其不均匀分布于蔗茅10条染色体中的6条;亚细胞定位预测显示EfBBX蛋白主要位于细胞核和叶绿体中;EfBBX基因家族的启动子区域含有大量激素、非生物胁迫响应以及光响应相关元件;RT-qPCR实验证实,10个基因可以被冷胁迫诱导表达;成功克隆了EfBBX4、EfBBX10和EfBBX18基因,其中蔗茅EfBBX18在本氏烟草中的瞬时表达可增强烟草的耐冷性。【结论】从蔗茅基因组中鉴定出19个Ef BBX基因,10个基因均可以被冷胁迫诱导表达,成功克隆3个基因,其中EfBBX18在本氏烟草中的瞬时表达可增强烟草的耐冷性。 展开更多

关键词 蔗茅 bbx基因家族 基因家族鉴定 生物信息学 冷胁迫 表达模式 瞬时表达 耐冷性

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兰州百合三个LdBBXs基因的克隆与表达分析

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作者 刘鑫 王嘉雯 +4 位作者 李进伟 牟策 杨盼盼 明军 徐雷锋 《生物技术通报》 北大核心 2025年第5期186-196,共11页

【目的】B-box(BBX)第Ⅳ亚组的许多成员在光调控花青素苷合成中扮演着重要角色,克隆兰州百合BBX基因并分析其对不同光照时间的应答及对鳞片变红的影响,为培育见光不变色兰州百合品种提供重要的候选基因。【方法】克隆从兰州百合转录组... 【目的】B-box(BBX)第Ⅳ亚组的许多成员在光调控花青素苷合成中扮演着重要角色,克隆兰州百合BBX基因并分析其对不同光照时间的应答及对鳞片变红的影响,为培育见光不变色兰州百合品种提供重要的候选基因。【方法】克隆从兰州百合转录组鉴定获得的3个BBX第Ⅳ亚组成员(LdBBX21、LdBBX22、LdBBX24),并对其编码的蛋白进行生物信息学分析和亚细胞定位,基于实时荧光定量PCR研究其在兰州百合不同组织及鳞片光处理后的表达模式。【结果】LdBBX21、LdBBX22、LdBBX24均含有2个B-box保守结构域,属于第Ⅳ亚组的BBX蛋白。亚细胞定位结果显示,LdBBX21、LdBBX22、LdBBX24均定位于细胞核。组织特异性表达分析表明,LdBBX22和LdBBX24在花中的表达量最高,在鳞片中的表达量最低,LdBBX21与之相反。RT-qPCR分析表明,在不同光照时长处理的鳞片中,LdBBX21的基因表达量随光照时长的增加总体呈下降趋势;LdBBX22的基因表达量随光照时长的增加而上升,与花青素苷含量的变化趋势基本相同;LdBBX24随光照时长的增加,表达量总体呈先上升后下降趋势。【结论】LdBBX21、LdBBX22、LdBBX24均可能在光调控兰州百合鳞片花青素苷合成中起着重要功能,本研究为后续研究兰州百合BBX基因功能验证奠定基础。 展开更多

关键词 兰州百合 bbx 基因克隆 表达分析

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菊花BBX基因家族鉴定及UV-A处理下表达模式分析

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作者 龙振涛 向理理 朱凡 《湖南农业科学》 2025年第8期80-90,共11页

BBX(B-box)家族是一类锌指蛋白转录因子(Zinc finger protein transcription factor),在植物光信号转导、光周期调控及次生代谢调控过程中起重要作用。基于菊花基因组数据库Mum GARDEN,系统鉴定并分析了菊花(Chrysanthemum morifolium R... BBX(B-box)家族是一类锌指蛋白转录因子(Zinc finger protein transcription factor),在植物光信号转导、光周期调控及次生代谢调控过程中起重要作用。基于菊花基因组数据库Mum GARDEN,系统鉴定并分析了菊花(Chrysanthemum morifolium Ramat.)BBX基因家族(CmBBXs)的成员,对其进行生物信息学分析与功能预测。结果显示:共鉴定出35个CmBBXs成员;系统进化分析表明CmBBXs可分为5个亚族,不同亚族CmBBXs的保守结构域存在差异;启动子顺式作用元件预测表明CmBBXs存在大量光响应元件,部分成员存在MYB的结合位点;UV-A处理下的表达模式分析发现4个CmBBXs成员的表达模式与已报道的菊花花青苷调控基因CmMYB6相似,推测这些CmBBXs可能参与光调控花青苷代谢。 展开更多

关键词 菊花 bbx基因家族 鉴定 花青苷 表达

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桂花OfBBXs基因家族鉴定及成花调控基因的备选

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作者 勾啸 温鹏花 +2 位作者 阮沐宁 方众力 张鑫 《中国农学通报》 2025年第33期121-130,共10页

为筛选参与桂花成花调控的候选基因,本研究以‘日香桂’全基因组为试材,采用生物信息学方法鉴定OfBBX基因家族成员,对其理化性质、系统进化关系、桂花种内及桂花-拟南芥种间共线性关系、组织表达模式进行综合分析,并结合启动子区顺式作... 为筛选参与桂花成花调控的候选基因,本研究以‘日香桂’全基因组为试材,采用生物信息学方法鉴定OfBBX基因家族成员,对其理化性质、系统进化关系、桂花种内及桂花-拟南芥种间共线性关系、组织表达模式进行综合分析,并结合启动子区顺式作用元件预测其功能。结果共鉴定出42个OfBBX基因,其编码蛋白分子量20.54k~53.71 kDa,等电点4.46~8.61,疏水指数-0.904~-0.027。系统进化将OfBBX分为I-V五组(11/7/5/14/7个成员),各组Motif与B-box/CCT结构域高度保守。检测到OfBBX基因发生了串联重复或片段复制事件,与拟南芥存在48对共线BBX基因。其中7个OfBBX基因在花组织中表达量较高,启动子富含光反应型元件;OfBBX19与拟南芥AtBBX1(CONSTANS)同支、共线、同源,其表达量在花器官中显著上调。本研究筛选出OfBBX18/19等7个候选基因,OfBBX19可能是CONSTANS同源基因并介导光周期调控,为桂花花发育机制研究提供分子标记。 展开更多

关键词 桂花 bbx 基因家族 转录因子 生物信息学

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光皮桦BBX类基因BlCOL13的克隆与表达分析 被引量：7

5

作者 窦锦青 程龙军 +2 位作者 徐凤华 张俊红 童再康 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1367-1377,共11页

利用RACE、RT-PCR以及基因组步移技术克隆得到光皮桦Bl COL13全长c DNA(Gen Bank登录号:KP663425)、全长DNA及其启动子序列。该基因DNA全长2 808 bp,具有4个外显子,3个内含子;c DNA全长1 370 bp,包含1 140 bp的开放阅读框,编码含379个... 利用RACE、RT-PCR以及基因组步移技术克隆得到光皮桦Bl COL13全长c DNA(Gen Bank登录号:KP663425)、全长DNA及其启动子序列。该基因DNA全长2 808 bp,具有4个外显子,3个内含子;c DNA全长1 370 bp,包含1 140 bp的开放阅读框,编码含379个氨基酸的蛋白。Bl COL13蛋白N、C端分别有两个B-box和一个CCT结构域,属于典型的BBX蛋白。以拟南芥中BBX蛋白的分类为参照,通过聚类分析表明Bl COL13属于Ⅱ型BBX蛋白;克隆得到的Bl COL13启动子序列长685 bp,含有多个与成花、光响应、激素信号转导以及逆境胁迫相关的顺式作用元件。亚细胞定位试验结果表明该基因主要在细胞核中表达。不同组织中该基因都有一定程度的表达,但在雄花中表达量最高。低温、干旱、ABA和盐胁迫等非生物逆境都在一定程度上诱导Bl COL13的表达,盐胁迫的影响最为明显,表明该基因在光皮桦逆境响应中可能发挥比较重要的作用。 展开更多

关键词 光皮桦 BETULA luminifera BlCOL13 bbx 基因克隆 表达分析

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矮牵牛BBX基因家族成员鉴定及对不同光质的表达响应 被引量：6

6

作者 符真珠 蒋卉 +8 位作者 王锐 王慧娟 李艳敏 徐梦岚 晁亚琮 董晓宇 高杰 王利民 张和臣 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期50-58,共9页

BBXs (B-box zinc finger genes)是植物中一类重要的编码转录因子的基因,它们在控制植物生长发育、响应环境胁迫中起着重要作用。本研究对两个矮牵牛野生种(Petunia inflata和P. axillaris)基因组中的BBXs基因家族成员进行了鉴定和分析... BBXs (B-box zinc finger genes)是植物中一类重要的编码转录因子的基因,它们在控制植物生长发育、响应环境胁迫中起着重要作用。本研究对两个矮牵牛野生种(Petunia inflata和P. axillaris)基因组中的BBXs基因家族成员进行了鉴定和分析;其中在P. axillaris基因组中共发现有29个成员,在P. inflata有32个成员。氨基酸序列比对和进化树分析表明,它们共分化形成了5个亚家族,其中含有2个B-box结构域的有3个亚家族,分别是G1、G2和G4;只有1个B-box结构域的有G3和G5。另外,在G1、G2和G3亚家族中的成员除了含有B-box结构域,在C端还有一个相对保守的CCT结构域。对不同光质条件下矮牵牛花瓣中的BBXs基因进行转录分析,发现共有9个成员出现了差异性表达;其中BBX18、BBX24和BBX25在红光条件下表达明显减弱,与矮牵牛花色积累的表型趋势一致,推测它们可能参与不同光质条件下花青苷的调控过程。 展开更多

关键词 转录因子 bbx基因 基因表达 矮牵牛 光质

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玉米BBX基因家族鉴定及表达分析 被引量：8

7

作者 赵长江 徐尚缘 +4 位作者 都梦翔 宋巨奇 徐晶宇 杨克军 李佐同 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期677-689,共13页

BBX(B-box)是一类光温响应转录因子家族参与植物光形态建成及逆境响应。为揭示ZmBBX家族基因功能,采用生物信息学方法在玉米基因组水平对该基因家族进行鉴定,并对其基本理化性质、基因结构、系统进化关系、启动子顺式作用元件和基因表... BBX(B-box)是一类光温响应转录因子家族参与植物光形态建成及逆境响应。为揭示ZmBBX家族基因功能,采用生物信息学方法在玉米基因组水平对该基因家族进行鉴定,并对其基本理化性质、基因结构、系统进化关系、启动子顺式作用元件和基因表达谱进行分析。ZmBBX基因家族共有34个成员,划分为5个亚族,编码蛋白氨基酸介于142~498aa,预测大多数成员定位于细胞核内。ZmBBX基因启动子存在大量的光响应元件、胁迫响应元件、激素应答元件和生长发育相关的顺式作用元件。全生育期组织表达谱发现,ZmBBX7、ZmBBX27和ZmBBX28在玉米的全生育期均高表达,ZmBBX3、ZmBBX5、ZmBBX14、ZmBBX15、ZmBBX19和ZmBBX20在玉米叶片中表达量较高,ZmBBX6、ZmBBX11、ZmBBX18和ZmBBX32在玉米叶片和种子形成前期等时期表达量较高。同时,对实验室盐处理转录数据分析发现,ZmBBX1、ZmBBX3、ZmBBX9、ZmBBX12、ZmBBX13、ZmBBX21、ZmBBX25、ZmBBX29和ZmBBX339个基因在地上和地下都差异表达,其中除ZmBBX3在叶片和根中表达不同外,其余基因在叶片和根中基本都上调表达。基于全生育期转录组数据的共表达及GO和KEGG富集分析发现,ZmBBX1、ZmBBX4、ZmBBX10、ZmBBX16和ZmBBX32可能通过蛋白互作介导光依赖的MEbrown模块中萌发籽粒的代谢和生长发育调控。蛋白互作预测分析发现,ZmBBX不仅可以发生同源互作,而且可发生异源互作,并且得到共表达转录数据的支持。综上,ZmBBX基因全生育期组织表达和逆境表达分化明显,在盐等非生物逆境和光相关的生长发育调控中发挥重要作用。 展开更多

关键词 玉米 bbx 基因家族 表达分析

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抑制类胰岛素肽BBX-B8基因的表达对家蚕抗逆性的影响

8

作者 郑小坚 陆叶 +3 位作者 曹广力 薛仁宇 沈卫德 贡成良 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期590-596,共7页

家蚕类胰岛素肽(bombyxin)具有调节糖代谢、促进翅芽和造血器官细胞增殖、调控前胸腺分泌活性等功能。为探讨家蚕类胰岛素肽其它的生理功能,将Bombyxin B家族的BBX-B8基因克隆进pGEM-T载体,通过体外转录合成BBX-B8 dsRNA,研究RNAi介导的... 家蚕类胰岛素肽(bombyxin)具有调节糖代谢、促进翅芽和造血器官细胞增殖、调控前胸腺分泌活性等功能。为探讨家蚕类胰岛素肽其它的生理功能,将Bombyxin B家族的BBX-B8基因克隆进pGEM-T载体,通过体外转录合成BBX-B8 dsRNA,研究RNAi介导的BBX-B8基因沉默对蚕体耐高温、低温和饥饿的能力及部分保护酶活性的影响。Western blotting检测显示,给家蚕5龄2d幼虫注射1μg/μLBBX-B8 dsRNA(10μL/头)3d后,脑组织中BBX-B8的表达水平下降30.80%。给家蚕5龄3d幼虫注射1μg/μLBBX-B8 dsRNA(10μL/头)2d后,血液中超氧化物歧化酶(SOD)活性、总抗氧化能力(T-AOC)分别提高17.81%、41.86%,而过氧化氢酶(CAT)活性与对照无显著差异。给家蚕5龄3d幼虫注射BBX-B8 dsRNA 2d后进行高温(40℃,3h)和低温(4℃,3h)冲击,化蛹率比对照提高12.76个百分点;注射BBX-B8 dsRNA后禁食处理,在饥饿状态下的化蛹率比对照低9.29个百分点。研究结果提示:在家蚕5龄幼虫期抑制BBX的表达,可刺激血液中SOD活性上升,增强蚕体抗氧化能力,从而产生一系列生理应激反应,导致其对高温和低温的应激能力提高;家蚕的代谢活动加剧,能量消耗增加,耐饥饿能力下降。 展开更多

关键词 家蚕类胰岛素 bbx-B8基因 RNA干扰 高温低温冲击 饥饿 保护酶

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茶树CsBBX基因家族的鉴定与表达 被引量：14

9

作者 叶一隽 李佳敏 +2 位作者 曹红利 李远华 岳川 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1508-1516,共9页

锌指蛋白是一类含有“手指状”结构域的蛋白质,其中B-BOX(BBX)蛋白在植物的生长发育及逆境胁迫响应中具有重要的作用.利用生物信息学方法,从茶树基因组中鉴定出31个CsBBX基因,全面分析其生物信息学特征,同时分析它们在干旱、盐胁迫和MeJ... 锌指蛋白是一类含有“手指状”结构域的蛋白质,其中B-BOX(BBX)蛋白在植物的生长发育及逆境胁迫响应中具有重要的作用.利用生物信息学方法,从茶树基因组中鉴定出31个CsBBX基因,全面分析其生物信息学特征,同时分析它们在干旱、盐胁迫和MeJA处理中的转录组数据.结果显示,CsBBX基因大小差异较大,开放阅读框在324-1746 bp之间,编码氨基酸长在107-581 aa之间.CsBBX的编码蛋白序列中含有保守的BOX1(B1)、BOX2(B2)和CCT结构域,可以分为B1B2+CCT(Ⅰ和Ⅱ)、B1+CCT(Ⅲ)、B1+B2(Ⅳ)和B1(Ⅴ)等5种类型.启动子顺式作用元件预测显示,CsBBX基因启动子中含有多种光响应元件,同时还富含多种与植物生长发育及逆境胁迫响应相关的顺式作用元件.CsBBX基因在叶片组织中具有较高的表达水平,且部分基因随着叶片成熟度的增加转录水平升高.干旱和盐胁迫条件下,大部分CsBBX基因的表达受抑制,而部分基因被诱导表达;大部分CsBBX基因的表达受MeJA诱导.因此推测CsBBX基因在茶树生长发育及抗逆响应中发挥了重要的功能. 展开更多

关键词 茶树 bbx基因家族 锌指蛋白 逆境胁迫 基因表达

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马铃薯BBX基因家族的全基因组鉴定及表达分析 被引量：9

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作者 马文婧 刘震 +6 位作者 李志涛 朱金勇 李泓阳 陈丽敏 史田斌 张俊莲 刘玉汇 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期2797-2812,共16页

B-box (BBX)基因家族是一类锌指蛋白转录因子,在植物生长发育过程中起重要作用。本研究鉴定了30个马铃薯BBXs家族成员,对其理化性质、染色体定位、基因结构、蛋白保守结构域、基因重复事件、表达模式和蛋白互作网络进行了分析。结果表明... B-box (BBX)基因家族是一类锌指蛋白转录因子,在植物生长发育过程中起重要作用。本研究鉴定了30个马铃薯BBXs家族成员,对其理化性质、染色体定位、基因结构、蛋白保守结构域、基因重复事件、表达模式和蛋白互作网络进行了分析。结果表明, 30个StBBX基因家族成员不均匀的分布在11条染色体上。通过对其基因结构和系统发育特征的分析,将30个StBBXs分为5个亚类。共线性分析表明,马铃薯StBBXs与拟南芥AtBBXs间存在15对直系同源基因。利用PGSC数据库下载的RNA-seq数据,分析了BBX基因家族在双单倍体(DM)马铃薯不同组织部位、非生物胁迫和外源激素处理下的表达。此外,本研究对3种不同颜色块茎的马铃薯品种的薯皮和薯肉进行了RNA-seq,研究了StBBXs在不同颜色的薯皮和薯肉中的表达模式,分析了它们与花色素苷合成关键基因表达之间的相关性。利用String数据库构建了在彩色块茎中差异表达的StBBXs基因的蛋白互作网络。这些结果为进一步了解StBBX基因家族以及进一步分析StBBX基因在马铃薯非生物胁迫耐受和花青素生物合成中的功能提供了理论依据。 展开更多

关键词 马铃薯 bbx基因家族 非生物胁迫 花青素生物合成 表达分析

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独行菜LaBBX基因低温表达响应与密码子偏性分析 被引量：2

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作者 周茜 陈芸 +3 位作者 王玉州 王继莲 凯迪日耶·玉苏普 赵惠新 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1253-1262,共10页

BBX是调控植物非生物胁迫相关基因表达,响应植物逆境胁迫的重要锌指蛋白类转录因子。为探究BBX在独行菜(Lepidium apetalum)幼苗耐受低温生长中的表达响应及其密码子偏好性,本研究基于独行菜转录组数据,筛选独行菜BBX编码基因的cDNA序列... BBX是调控植物非生物胁迫相关基因表达,响应植物逆境胁迫的重要锌指蛋白类转录因子。为探究BBX在独行菜(Lepidium apetalum)幼苗耐受低温生长中的表达响应及其密码子偏好性,本研究基于独行菜转录组数据,筛选独行菜BBX编码基因的cDNA序列,并从独行菜幼苗中克隆获得全长733 bp的基因编码区序列,命名为LaBBX。序列分析表明,LaBBX由242个氨基酸组成,包含2个B-box锌指蛋白结构域,蛋白分子量为61.66 kDa,等电点为5.09,无信号肽和跨膜区。独行菜幼苗受低温胁迫时,LaBBX基因显著上调表达,6 h上调表达至21倍,且24 h内均呈现高水平表达,说明该转录因子可能在独行菜幼苗受低温胁迫时起重要作用。偏好性分析结果显示,独行菜LaBBX基因的ENc、CAI值和GC含量分别为55.453、0.244和46.78%,其密码子使用偏性较弱,相对偏好使用AT,高频密码子有8个,CDS序列及RSCU聚类分析中与十字花科植物最相近;其偏好性的形成与突变和自然选择等诸多因素相关,酵母菌表达系统更适合作为LaBBX基因的异源表达受体,拟南芥是适宜LaBBX基因的遗传转化受体。本研究为了解独行菜LaBBX基因的异源表达及基因功能提供了重要参考。 展开更多

关键词 独行菜 bbx转录因子 基因克隆 表达分析 密码子偏性 聚类分析

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大豆BBX基因家族的鉴定及表达 被引量：8

12

作者 殷丽丽 邢宝龙 +1 位作者 陈晓亮 殷宇 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2022年第6期35-45,共11页

【目的】对大豆(Glycine max)全基因组BBX(B-box)蛋白基因进行鉴定和生物信息学分析,探究其对非生物逆境胁迫的响应模式,为大豆BBX基因的应用提供参考。【方法】利用生物信息学方法鉴定大豆BBX基因家族成员,分析其保守结构域、系统进化... 【目的】对大豆(Glycine max)全基因组BBX(B-box)蛋白基因进行鉴定和生物信息学分析,探究其对非生物逆境胁迫的响应模式,为大豆BBX基因的应用提供参考。【方法】利用生物信息学方法鉴定大豆BBX基因家族成员,分析其保守结构域、系统进化树、基因复制关系、顺式作用元件、组织特异性表达和非生物逆境胁迫(干旱和100 mmol/L NaCl胁迫,均处理0,1,6,12 h)响应模式。【结果】大豆BBX基因家族(GmBBXs)有42个成员,分布在除2和16号染色体外的18条染色体上。保守结构域分析表明,GmBBXs在N端有一个或两个B-box结构域(B-box1和B-box2),B-box1较B-box2保守;部分成员在C端存在一个CCT结构域。系统发育分析表明,GmBBXs家族成员分为5个亚家族,分别为B1+B2+CCT(Ⅰ型和Ⅱ型)、B1+CCT(Ⅲ型)、B1+B2(Ⅳ型)和B1(Ⅴ型)类型,其成员数量分别为3,8,6,18和7。共线性分析发现,在GmBBXs基因的扩展中存在串联复制和片段复制事件,且片段复制事件比例较串联复制大。GmBBXs基因启动子上含有多种顺式作用元件,如光应答元件、逆境胁迫应答元件和激素响应元件等。GmBBXs基因表达分析结果显示,GmBBXs在大豆根、茎、叶、花、荚果和种子中的表达存在差异,不同GmBBXs响应干旱和盐胁迫的方式不同,获得的36个GmBBXs基因表达数据可分为6种表达模式。【结论】在大豆中共鉴定得到42个GmBBXs基因,分布于18条染色体上,其结构域较为保守;GmBBXs的表达具有组织特异性,参与干旱和盐胁迫响应。 展开更多

关键词 大豆育种 bbx基因家族 基因表达 非生物逆境胁迫

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毛果杨BBX基因家族鉴定与生物信息学分析 被引量：4

13

作者 齐小坤 孟祥熹 +4 位作者 赵志明 袁梦婷 杨志慧 武江昊 王进茂 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期41-49,共9页

BBXs(B-box)转录因子家族在植物生长发育和胁迫反应中发挥重要作用。本研究利用生物信息学手段在毛果杨(Populus trichocarpa)基因组筛选并鉴定出28个PtBBXs基因家族成员,对该家族成员进行结构和表达分析表明,PtBBXs基因不均匀地分布于1... BBXs(B-box)转录因子家族在植物生长发育和胁迫反应中发挥重要作用。本研究利用生物信息学手段在毛果杨(Populus trichocarpa)基因组筛选并鉴定出28个PtBBXs基因家族成员,对该家族成员进行结构和表达分析表明,PtBBXs基因不均匀地分布于15条染色体上,其编码的氨基酸残基数介于184-514,全部为酸性蛋白质。依据基因结构和蛋白质保守基序,可将其分为5个组(A-E),全基因组加倍事件是PtBBXs家族基因数量扩增的主要方式。PtBBX家族基因的启动子区域包含大量激素(脱落酸、赤霉素,和水杨酸等)与非生物胁迫(干旱、低温)响应相关的元件,大多数PtBBXs基因在叶片中高表达,而少量PtBBXs基因(PtBBX5/11/12/28)在根或花序中高表达。转录组数据分析表明,PtBBXs在响应非生物胁迫过程中分工不同,组A和组D的多数成员响应了茉莉酸、水杨酸和低温处理,组B(PtBBX16/19)和组C(PtBBX1/2)基因同时响应盐和干旱胁迫。这些结果为今后进一步挖掘PtBBX基因家族成员功能,以及创制林木抗逆新种质,提供了重要的理论依据。 展开更多

关键词 bbx基因家族 毛果杨 生物信息学 转录响应

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青稞BBX基因家族鉴定及其对UV-B的响应 被引量：2

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作者 陈生蓉 史国民 +1 位作者 王乐 何涛 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1760-1769,共10页

B-box(BBX)蛋白是植物中一类重要的转录因子,在控制植物生长发育、响应环境胁迫中起着重要作用。本研究从青稞(Hordeum vulgare L.var.nudum Hook.f.)全基因组中鉴定出18个青稞BBX基因家族成员,分析了它们的理化性质、基因结构、进化关... B-box(BBX)蛋白是植物中一类重要的转录因子,在控制植物生长发育、响应环境胁迫中起着重要作用。本研究从青稞(Hordeum vulgare L.var.nudum Hook.f.)全基因组中鉴定出18个青稞BBX基因家族成员,分析了它们的理化性质、基因结构、进化关系及UV-B照射幼苗后的表达特性等。结果表明:青稞BBX基因的编码序列(CDS)长度为636~2 223 bp;分子质量为22.07~54.29 kDa。系统发育分析将18个HvnBBX分为4个亚类。共线性分析表明青稞种内共产生4对片段复制形成的基因对,种间与玉米进化关系更近;HvnBBX启动子区域包含与逆境胁迫、激素、生长发育等相关顺式作用元件。转录组测序结果显示UV-B照射后青稞叶片中有5个BBX基因(HvnBBX2/4/5/6/17)的表达量显著下调,qRT-PCR验证结果与转录组测序一致。上述结果为深入研究HvnBBX基因的抗紫外功能提供参考。 展开更多

关键词 青稞 bbx基因家族 UV-B照射 基因表达

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家蚕素Ⅱ基因原核表达及蛋白纯化 被引量：2

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作者 徐欣 刘朝阳 +5 位作者 崔海波 杨洋 郭晓琪 张涛 刘庆信 崔为正 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期8-12,共5页

【目的】建立一种简便、快速且能大量获得家蚕素Ⅱ(bombyxin-Ⅱ,BBXⅡ)的有效方法。【方法】运用RTPCR技术得到bombyxin-Ⅱ基因全长cDNA序列,采用原核表达技术对该基因进行异源表达,并利用亲和层析的方法得到纯化的BBXⅡ蛋白。【结果】... 【目的】建立一种简便、快速且能大量获得家蚕素Ⅱ(bombyxin-Ⅱ,BBXⅡ)的有效方法。【方法】运用RTPCR技术得到bombyxin-Ⅱ基因全长cDNA序列,采用原核表达技术对该基因进行异源表达,并利用亲和层析的方法得到纯化的BBXⅡ蛋白。【结果】从家蚕Bombyx mori头部mRNA中经过反转录获得bombyxin-Ⅱ基因的cDNA,并构建了原核表达载体pET28a-BBXⅡ,经过异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导,使BBXⅡ获得了大量表达,进一步用HisTrap HP亲和层析,成功得到大量纯化的BBXⅡ。【结论】本实验建立的原核表达方法和蛋白纯化技术,是大量制备BBXⅡ的一种简易而有效的方法,为进一步开展BBX的分泌机制和作用机理研究,以及利用原核表达系统研发BBX降血糖药物奠定了基础。 展开更多

关键词 家蚕 类胰岛素肽 家蚕素 基因克隆 原核表达 蛋白纯化

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