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B3GNT6在结直肠癌中的临床特征与生存预后分析
1
作者 徐铭泽 叶锦宁 +3 位作者 袁凯涛 陈创奇 蔡世荣 马晋平 《消化肿瘤杂志（电子版）》 2022年第1期27-31,共5页
目的回顾性研究β-1,3-N-乙酰氨基葡糖转移酶6(B3GNT6)在结直肠癌患者临床样本中表达的临床意义。方法选取2012年1月至2014年12月中山大学附属第一医院诊治的154例结直肠癌患者的临床病理资料及随访资料。应用免疫组织化学法检测B3GNT6... 目的回顾性研究β-1,3-N-乙酰氨基葡糖转移酶6(B3GNT6)在结直肠癌患者临床样本中表达的临床意义。方法选取2012年1月至2014年12月中山大学附属第一医院诊治的154例结直肠癌患者的临床病理资料及随访资料。应用免疫组织化学法检测B3GNT6蛋白在肿瘤组织中的表达情况,经过病理玻片扫描仪数字化处理后,借助Qupath软件对阳性区域进行评分,并用X-tile软件选择合适的截断值,应用卡方检验分析B3GNT6蛋白表达差异与临床病理参数的相关性,Kaplan-Meier法分析B3GNT6蛋白表达与患者预后的相关性。结果154例患者年龄(59.8±12.8)岁,男女比例为1.26:1.00。Qupath软件对癌组织进行H-score评分后,X-tile软件计算出H-score最佳截断值为57.44,根据B3GNT6表达情况将所有患者分为B3GNT6低表达组(104例)和高表达组(50例)。B3GNT6低表达与淋巴结转移(P=0.012)、TNM分期(P=0.012)有关。Kaplan-Meier法分析发现B3GNT6高表达组患者预后较好(P=0.0026);单因素及多因素Cox回归分析提示B3GNT6表达是评价结直肠癌患者预后的独立危险因素(HR=0.295,95%CI:0.137~0.634,P=0.002)。结论B3GNT6可能作为结直肠癌患者预后评估的生物标志物。 展开更多
关键词 b3gnt6 结直肠癌 免疫组织化学 预后
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基于生物信息学分析B3GNT6作为胃癌早期诊断及预后生物标志物的研究 被引量：1
2
作者 史秋婷 孙铭泽 《解剖科学进展》 CAS 2023年第4期378-382,共5页
目的通过生物信息学分析筛选出可以早期诊断及判断胃癌预后的生物标志物。方法从GEO数据库获得GSE数据集,使用GEO2R在线工具筛选出差异表达基因(DEGs),应用基因本体论(GO)及京都基因和基因组数据库(KEGG)进行功能及通路富集分析,利用STR... 目的通过生物信息学分析筛选出可以早期诊断及判断胃癌预后的生物标志物。方法从GEO数据库获得GSE数据集,使用GEO2R在线工具筛选出差异表达基因(DEGs),应用基因本体论(GO)及京都基因和基因组数据库(KEGG)进行功能及通路富集分析,利用STRING、Cytoscape和cBioPortal分析出蛋白相互作用(PPI)网络、共表达基因及枢纽(Hub)基因。基于Kaplan-Meier分析预后生存曲线,使用HPA、Onco mine、UALCAN分析Hub基因在胃癌组织中的表达情况。结果本研究共得到26个Hub基因,它们主要富集在O-聚糖(O-glycan)生物过程。Hub基因中生存分析显示B3GNT6和GATA6的GC患者总生存期较差。在TCGA中,B3GNT6在胃癌组织中表达明显下调,而GATA6表达无显著性差异。结论B3GNT6可能作为潜在的胃癌早期诊断及判断预后的生物标志物。 展开更多
关键词 胃癌 生物信息学 b3gnt6 O-GLYCAN
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