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HLA-A/B基因多态性与女性高危型HPV16/18感染和宫颈癌易感性的关联性分析
1
作者 卢庭婷 黄海鹏 +1 位作者 陈基强 张柯媛 《中国免疫学杂志》 北大核心 2026年第3期574-580,共7页
目的:探讨宫颈癌患者HLA-A/B基因多态性与高危型HPV16/18感染及宫颈癌易感性之间的关联。方法:选取2020年1月至2023年6月在广西医科大学第一附属医院确诊的宫颈癌患者作为观察组(n=205),选取同期参加宫颈癌筛查项目的健康女性作为对照组... 目的:探讨宫颈癌患者HLA-A/B基因多态性与高危型HPV16/18感染及宫颈癌易感性之间的关联。方法:选取2020年1月至2023年6月在广西医科大学第一附属医院确诊的宫颈癌患者作为观察组(n=205),选取同期参加宫颈癌筛查项目的健康女性作为对照组(n=97)。PCR和测序法检测受试者HLA-A/B基因进行分型;PCR-荧光标记法检测受试者HPV基因分型;流式细胞术检测受试者宫颈脱落细胞中CD8^(+)T细胞水平及其表面活性抑制分子PD-1、TIM-3阳性率;Spearman相关性分析HLA-A/B基因多态性与宫颈癌患者高危型HPV感染、宫颈癌易感性及CD8^(+)T细胞功能间的相关性。结果:所有受试者中检测到11种HLA-A等位基因和22种HLA-B等位基因。观察组患者HLA-A*02、A*03、A*11、HLA-B*27和B*44等HLA-A/B等位基因出现频率明显高于对照组(均P<0.05)。高危型HPV感染的宫颈癌患者HLA-A*02、A*11、HLA-B*07和B*44等HLAA/B等位基因频率高于非高危型HPV感染的宫颈癌患者(均P<0.05)。Spearman相关性分析表明,HLA-A*02和HLA-A*11与宫颈癌呈正相关(r=0.205、0.138,P=0.013、0.027),HLA-A*02和HLA-B*44分别与高危型和非高危型HPV感染呈正相关(r=0.123、0.253,P=0.008、0.020)、HLA-A*02、HLA-A*11和HLA-B*44分别与颈脱落细胞中CD8^(+)T细胞水平(r=0.115、0.169、0.153,P=0.011、0.025、0.020)、PD-1阳性率(r=0.101、0.136、0.163,P=0.040、0.033、0.031)及TIM-3阳性率(r=0.124、0.201、0.211,P=0.005、0.008、0.009)均呈正相关。结论:携带HLA-A*02和A*11的个体与高危型HPV16/18感染呈显著正相关,而HLA-A*02和HLA-B*44为女性宫颈癌患者的易感基因,可能与CD8^(+)T细胞免疫功能耗竭有关。 展开更多
关键词 宫颈癌 HLA-A/B 易感性 高危型HPV 基因多态性
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基于形态学和DNA条形码的青藏高原东缘鼢鼠物种鉴定
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作者 蔡振媛 孔虹颖 +8 位作者 何振邦 宋鹏飞 郭凡 李斌 梁程博 胡天石 徐波 林中原 张同作 《兽类学报》 北大核心 2026年第1期116-128,共13页
物种分类和鉴定是生物学研究的基石,综合分子生物学和经典分类学方法进行物种鉴定可提高结果可靠性。本研究采用传统形态学和线粒体细胞色素b基因(Cyt b)序列对青藏高原东缘青海省海东市平安区采集的74个鼢鼠样本进行物种鉴定。头骨形... 物种分类和鉴定是生物学研究的基石,综合分子生物学和经典分类学方法进行物种鉴定可提高结果可靠性。本研究采用传统形态学和线粒体细胞色素b基因(Cyt b)序列对青藏高原东缘青海省海东市平安区采集的74个鼢鼠样本进行物种鉴定。头骨形态鉴定结果显示,尾巴被稀疏短白毛的鼢鼠个体(Pac)为甘肃鼢鼠(Eospalax cansus),而尾巴被密毛的个体(Pab)为高原鼢鼠(Eospalax baileyi)。74个鼢鼠样本的Cyt b序列共定义了25个单倍型,结合GenBank中8种鼢鼠的Cyt b序列进行分析,在构建的系统发育树中,已知8种鼢鼠序列各自聚为1个单系群,平安区Pab的16个单倍型与已知高原鼢鼠聚为一支,Pac的8个单倍型与已知甘肃鼢鼠聚为一支。遗传距离结果显示,Pac与已知甘肃鼢鼠遗传距离小于与其他物种的遗传距离(P<0.001),Pab与已知高原鼢鼠的遗传距离小于与其他物种的遗传距离(P<0.001)。Cyt b基因分析和形态鉴定结果一致,Cyt b是鼢鼠鉴定的一个有效的DNA条形码基因。综合形态学和DNA条形码鉴定结果,平安区分布着2种鼢鼠:甘肃鼢鼠和高原鼢鼠。在地理分布上,甘肃鼢鼠主要分布在平安区北部邻近黄土高原海拔相对较低的区域,高原鼢鼠则分布在南部邻近青藏高原海拔相对较高的区域。本研究加深了对平安区鼢鼠物种组成和分布特征的了解,并为解决鼢鼠物种形态鉴定难的问题提供了DNA条形码解决方案。 展开更多
关键词 DNA条形码技术 鼢鼠 Cyt b 形态 系统发育 遗传距离
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基于线粒体DNA Cyt b、12S rRNA和D-loop序列的铜鱼养殖群体遗传多样性分析
3
作者 吴斌 贺刚 +3 位作者 陶志英 邓勇辉 郭怿宁 袁嘉欣 《渔业研究》 2026年第2期181-189,共9页
【目的】本研究分别利用线粒体DNA Cyt b、12S rRNA和D-loop序列对铜鱼(Coreius heterodon)养殖群体进行遗传多样性分析,初步了解其遗传多样性。【方法】采用已报道的特异性引物对线粒体DNA Cyt b、12S rRNA和D-loop序列进行聚合酶链式... 【目的】本研究分别利用线粒体DNA Cyt b、12S rRNA和D-loop序列对铜鱼(Coreius heterodon)养殖群体进行遗传多样性分析,初步了解其遗传多样性。【方法】采用已报道的特异性引物对线粒体DNA Cyt b、12S rRNA和D-loop序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,并采用双脱氧测序法(Sanger)对扩增产物进行测序。遗传多样性参数由DNASP 6.12软件计算;采用MEGA 11.0软件分析DNA序列的碱基组成和变异位点;利用Kimura双参数模型计算单倍型间的遗传距离,采用邻接法(NJ)和最大似然法(ML)构建D-loop全序列单倍型系统进化树。【结果】用于分析的线粒体DNA Cyt b、12S rRNA和D-loop序列长度分别为1110~1147、425~445和972~1023 bp,平均长度分别为1122.77、430.00和1000.47 bp,中位数长度分别为1122、429和1001 bp。在线粒体DNA Cyt b、12S rRNA和D-loop序列中,分别检测出8、1和14个变异位点,以及22、19和30种单倍型,单倍型间遗传距离分别为0~0.004、0~0.005和0~0.007。基于线粒体DNA Cyt b、12S rRNA和D-loop序列的平均单倍型多样性(Hd)分别为0.547±0.0105、0.186±0.0078和0.885±0.0013;平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.00076、0.00044和0.00258;平均核苷酸差异数(k)为0.830、0.186和2.432。同时,歧点分布分析图谱呈现单峰型,在中性检验中Tajima’s D(D=-1.040,P>0.01)为负值,但统计结果为不显著(P>0.01)。【结论】铜鱼养殖群体遗传多样性相对较低,且单倍型间存在广泛的基因交流,但铜鱼养殖群体的种群数量下降。因此,建立起遗传多样性丰富的铜鱼人工繁殖的基础亲鱼群体,解决铜鱼亲本培育问题,持续壮大铜鱼养殖群体规模是首要任务。 展开更多
关键词 铜鱼 Cyt b 12S rRNA D-loop序列 遗传多样性
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雅砻江中游干支流软刺裸裂尻鱼群体遗传结构分析
4
作者 王继安 曾如奎 +6 位作者 汪鄂洲 董微微 李娟 朱滨 阙延福 乔晔 邵科 《水生态学杂志》 北大核心 2026年第1期205-213,共9页
分析雅砻江中游软刺裸裂尻鱼(Schizopygopsis malacanthus)不同地理群体的遗传结构,为其野生资源保护提供理论依据,并为雅砻江中游过鱼设施和增殖放流效果评估提供本底数据。2023年在两河口坝上曲入河和坝下干支流共采集187尾5个软刺裸... 分析雅砻江中游软刺裸裂尻鱼(Schizopygopsis malacanthus)不同地理群体的遗传结构,为其野生资源保护提供理论依据,并为雅砻江中游过鱼设施和增殖放流效果评估提供本底数据。2023年在两河口坝上曲入河和坝下干支流共采集187尾5个软刺裸裂尻鱼野生群体遗传材料,并测定了其线粒体Cyt b序列,分析了其遗传多样性、遗传结构和种群历史动态。结果表明,187尾软刺裸裂尻鱼样本中共检测到多态位点103个,定义了30个单倍型。5个群体单倍型多样性范围(0.669±0.032)~(0.938±0.024),核苷酸多样性范围(0.022 69±0.004 65)~(0.004 37±0.000 34),表明雅砻江中游软刺裸裂尻鱼总体遗传多样性较高。群体间总的遗传分化指数Fst为0.764 20(P<0.01),除支流卧龙寺沟群体与城南大桥群体间存在频繁的基因交流外,其余群体间遗传分化显著。分子方差分析(AMOVA)显示,软刺裸裂尻鱼76.42%的分子遗传变异来源于群体间,23.58%的变异来源于群体内。分子系统进化关系分析表明,5个软刺裸裂尻鱼群体存在2个明显的单倍型谱系分支,其中霍曲河群体为单独一支,与其余4个群体亲缘关系较远。中性检验结果显示,软刺裸裂尻鱼在近期历史上群体大小保持稳定,未经历显著的种群扩张事件。 展开更多
关键词 软刺裸裂尻鱼 遗传多样性 遗传结构 细胞色素B 雅砻江中游
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基于Cyt b基因的雅鲁藏布江中下游巨须裂腹鱼种群遗传多样性研究
5
作者 王淘 崔韵文 +6 位作者 林鹏程 赵书燕 冯霖杰 王栋 旦正道吉 常涛 张富铁 《淡水渔业》 北大核心 2026年第2期57-67,共11页
采用线粒体Cyt b基因对雅鲁藏布江中下游8个地理群体共155尾巨须裂腹鱼(Schizothorax macropogon)样本进行遗传多样性分析。结果显示:巨须裂腹鱼总体多态位点为40个,单倍型数33个,总体单倍型多样性(Hd)为0.792,核苷酸多样性(Pi)为0.001... 采用线粒体Cyt b基因对雅鲁藏布江中下游8个地理群体共155尾巨须裂腹鱼(Schizothorax macropogon)样本进行遗传多样性分析。结果显示:巨须裂腹鱼总体多态位点为40个,单倍型数33个,总体单倍型多样性(Hd)为0.792,核苷酸多样性(Pi)为0.00184,遗传多样性水平相比于10年前已有所下降。基于邻接法构建的系统发育树和单倍型网络图结果一致,8个群体之间的遗传距离均在0.003以下,各群体并未形成明显的地理分布格局。各地理群体间遗传分化系数Fst值为-0.01941~0.12259,除日村(RC)群体与其他群体间以外,其它群体间遗传差异较小,遗传分化现象不明显,说明群体间基因交流频繁。分子方差分析(AMOVA)显示:96.67%的遗传变异由群体内个体间产生。中性检验、错配分布分析、贝叶斯天际线分析综合结果表明巨须裂腹鱼群体近期发生了种群扩张事件,进化历史复杂。综上结果表明,巨须裂腹鱼群体遗传多样性水平在裂腹鱼属鱼类中相对较低且在下降,急需提出合理的管理措施,以加强雅鲁藏布江流域巨须裂腹鱼的资源保护与复壮工作。 展开更多
关键词 巨须裂腹鱼(Schizothorax macropogon) Cyt b基因 遗传多样性 遗传结构 种群历史动态
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基于线粒体细胞色素b基因的小黄鱼6个野生群体遗传特征研究
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作者 杜书然 祝斐 +6 位作者 徐大凤 陈淑吟 贾超峰 孟乾 孙瑞健 高波 李忠琦 《水产科技情报》 2026年第2期69-75,共7页
为了解小黄鱼(Larimichthys polyactis)不同地理种群的遗传特征,为其种质资源保护和可持续开发利用提供理论基础,基于Cytb基因(线粒体细胞色素b基因)标记的方法对我国东部沿海6个小黄鱼群体的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果表明,... 为了解小黄鱼(Larimichthys polyactis)不同地理种群的遗传特征,为其种质资源保护和可持续开发利用提供理论基础,基于Cytb基因(线粒体细胞色素b基因)标记的方法对我国东部沿海6个小黄鱼群体的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果表明,6个群体中共有变异位点138个,占19.86%,其中简约信息位点102个,单独位点36个;共检测出96个单倍型,其中共享单倍型有15个,独有单倍型81个。6个群体的单倍型多样性为0.925~0.972,核苷酸多样性为0.00348~0.03531。分子方差分析(AMOVA)表明,群体内遗传变异指数(91.89%)高于群体间变异指数(8.11%),中性检验表明,除了霞浦群体可能有过较小的群体扩张,其他群体均比较稳定。小黄鱼群体单倍型多样性较高,但核苷酸多样性较低,总体来说群体分化程度不大,比较稳定。霞浦群体相比其他5个群体遗传距离较大,遗传分化程度较高。 展开更多
关键词 小黄鱼 细胞色素B基因 野生群体 遗传多样性
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面向合围作战场景的多无人机任务规划方法
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作者 郭超勐 张振华 +2 位作者 边疆 李俊慧 李宇华 《火力与指挥控制》 北大核心 2026年第1期165-175,共11页
针对合围作战场景下多无人机任务规划,建立了合围场景数学模型,提出了一种改进遗传算法的任务分配方法和同时到达目标的合围航迹规划方法。改进遗传算法构建了一种混合编码方式,引入禁忌搜索和动态参数机制,避免陷入局部最优。合围航迹... 针对合围作战场景下多无人机任务规划,建立了合围场景数学模型,提出了一种改进遗传算法的任务分配方法和同时到达目标的合围航迹规划方法。改进遗传算法构建了一种混合编码方式,引入禁忌搜索和动态参数机制,避免陷入局部最优。合围航迹规划基于B样条优化,引入合围时间调整,权衡了轨迹平滑、运动学和同时到达时间约束。仿真结果验证了所提任务分配方法优于蚁群算法,合围航迹规划方法提升了Theta*效果,满足合围等约束。 展开更多
关键词 任务分配 航迹规划 合围作战 遗传算法 B样条
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基于Cyt b基因解析禁渔初期长江中游鲢群体遗传多样性特征
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作者 陈会娟 黄宇帆 +5 位作者 傅延波 袁亮亮 张清欢 汪登强 袁希平 段辛斌 《水生态学杂志》 北大核心 2026年第1期181-189,共9页
分析长江中游干流及附属湖泊鲢(Hypophthalmichthys molitrix)自然群体的遗传多样性特征,为评估禁渔初期的遗传保护效果提供科学依据。基于线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列,对2024年采自长江中游的5个地理群体共157尾鲢(枝江23尾,洞庭... 分析长江中游干流及附属湖泊鲢(Hypophthalmichthys molitrix)自然群体的遗传多样性特征,为评估禁渔初期的遗传保护效果提供科学依据。基于线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列,对2024年采自长江中游的5个地理群体共157尾鲢(枝江23尾,洞庭湖36尾,白螺36尾,武穴25尾,鄱阳湖37尾)进行遗传特征解析。结果表明,5个群体单倍型多样性(Hd)为0.657~0.830,核苷酸多样性(Pi)为0.00318~0.01454,Hd和Pi平均值分别为0.723和0.00892;AMOVA分析显示5个鲢群体有97.06%的变异来自群体内部,仅有2.94%来自群体间,总体的遗传分化指数(FST)为0.02940(P<0.05)。成对遗传分化指数和基因流(Nm)分析显示白螺群体和鄱阳湖群体出现遗传分化现象(FST=0.12486,P<0.05,Nm=1.73),其余群体间均无遗传分化现象(FST<0.05,P>0.05,Nm>4)。基于单倍型构建的Maximum likelihood系统发育树和Network网络结构图均显示定义的16个单倍型可分为2支,2个分支间出现遗传分化现象(FST=0.90021,P<0.05,Nm=0.04)。 展开更多
关键词 鲢 十年禁渔期 Cyt b基因 遗传多样性 长江中游
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CD5阳性弥漫大B细胞淋巴瘤分子生物学研究进展
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作者 马梦雨 朱尊民 《临床血液学杂志》 2026年第1期101-106,共6页
CD5阳性弥漫大B细胞淋巴瘤(CD5 positive diffuse large B-cell lymphoma,CD5^(+)DLBCL)是DLBCL的一种独特亚型,具有高度侵袭性,常表现为体能状态较差、乳酸脱氢酶升高、高龄(>60岁)、女性、结外受累多见,与DLBCL非特指型比较预后较... CD5阳性弥漫大B细胞淋巴瘤(CD5 positive diffuse large B-cell lymphoma,CD5^(+)DLBCL)是DLBCL的一种独特亚型,具有高度侵袭性,常表现为体能状态较差、乳酸脱氢酶升高、高龄(>60岁)、女性、结外受累多见,与DLBCL非特指型比较预后较差。研究显示,即使经过R-CHOP治疗,仍有40%左右的患者出现复发或难治,中枢神经系统复发率也更高。近年来,针对CD5^(+)DLBCL在遗传学和生物学方面不断进行探索,加深了人们对CD5^(+)DLBCL的认识,促进了更多有效的方案应用于CD5^(+)DLBCL的治疗中。文章主要对近年来CD5^(+)DLBCL的免疫表型特点、基因及染色体特征的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 CD5阳性弥漫大B细胞淋巴瘤 免疫表型 遗传学
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基于改进NSGA-Ⅲ的多Delta机器人协作食品动态分拣研究 被引量：1
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作者 郭凌岑 王海晖 +1 位作者 赵小霏 王思璐 《食品与机械》 北大核心 2025年第7期72-77,共6页
[目的]探索提升多Delta机器人协作的食品动态分拣准确率和效率的方法。[方法]基于多Delta机器人食品自动化生产线,提出一种结合动态目标跟踪、多机器人任务分类和机器人轨迹规划的多Delta机器人协作食品动态分拣方法。通过精确计算传送... [目的]探索提升多Delta机器人协作的食品动态分拣准确率和效率的方法。[方法]基于多Delta机器人食品自动化生产线,提出一种结合动态目标跟踪、多机器人任务分类和机器人轨迹规划的多Delta机器人协作食品动态分拣方法。通过精确计算传送带移动距离,并结合相机实时采集的目标坐标信息,实现对食品动态位置的精准捕捉。通过集中控制分配策略,根据各机器人的工作状态与任务优先级,科学合理地进行任务分配。通过改进的第三代非支配排序遗传算法和5次非均匀有理B样条曲线实现多目标综合最优轨迹规划。并通过搭建试验平台对所提方法的性能进行全面验证。[结果]试验所提多Delta机器人协作分拣方法具有优异的性能。在实际运行中,该方法实现了食品分拣的高精度、高效率与高稳定性,分拣成功率为100%,分拣平均时间为0.231 s,平均运行冲击为4.45×10^(3)(°)/s^(3),平均运行能耗为2.45×10^(2)(°)/s^(2),有效满足了食品生产对高效、稳定作业的需求。[结论]通过优化现有动态分拣方法并结合多机器人可以实现食品的准确、高效和稳定分拣。 展开更多
关键词 食品自动化生产线 多Delta机器人 动态目标跟踪 第三代非支配排序遗传算法 非均匀有理B样条
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马口鱼不同水系地理种群的遗传多样性分析
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作者 何美峰 薛凌展 +2 位作者 吴斌 樊海平 崔利峰 《渔业研究》 2025年第2期212-222,共11页
【目的】进一步了解马口鱼的种质资源现状,为其种质资源的保护和养殖群体的遗传多样性的保持提供科学依据。【方法】本研究利用PCR扩增获得5个马口鱼群体(牡丹江、建溪、富屯溪、汀江和南渡江)共计136尾个体的线粒体Cyt b基因和D-loop... 【目的】进一步了解马口鱼的种质资源现状,为其种质资源的保护和养殖群体的遗传多样性的保持提供科学依据。【方法】本研究利用PCR扩增获得5个马口鱼群体(牡丹江、建溪、富屯溪、汀江和南渡江)共计136尾个体的线粒体Cyt b基因和D-loop区序列部分片段,分析了群体间的遗传分化和遗传多样性。【结果】基于Cyt b基因和D-loop区序列定义的单倍型分别为35和37,整体单倍型多样性指数和核苷酸多样性分别为0.922和0.05426、0.875和0.02824,2个标记均显示汀江群体遗传多样性相对较高,牡丹江群体相对较低。基于Cyt b基因和D-loop区序列计算的马口鱼群体间的遗传距离分别为0.00304~0.10311、0.00089~0.05153。马口鱼群体间的遗传变异[96.00%(Cyt b)、62.23%(D-loop)]远高于群体内[4.00%(Cyt b)、33.77%(D-loop)],群体间遗传分化均达到显著水平(P<0.05)。基于Cyt b基因单倍型系统进化树显示,5个马口鱼群体可以分为3支,闽江建溪、闽江富屯溪、汀江群体与九龙江群体聚为一支,牡丹江群体与阿穆尔河、图们江和辽河群体聚为一支,南渡江群体与海南群体聚为一支,形成明显的地理谱系格局。牡丹江、闽江(建溪和富屯溪)和汀江群体在历史上均未发生扩张事件,而南渡江群体在历史上可能发生过扩张事件。【结论】南渡江和汀江群体遗传多样性较丰富,牡丹江、闽江相对较贫乏,应加大对牡丹江和闽江马口鱼的保护力度。 展开更多
关键词 马口鱼 Cyt b基因 D-LOOP区 遗传多样性
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基于s和B样条曲线的传输机构分段轨迹规划 被引量：3
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作者 王玉明 杨宝海 +2 位作者 姚宇轩 梁斌 刘冬 《组合机床与自动化加工技术》 北大核心 2025年第1期84-87,共4页
为了改善Pecvd设备在运输石墨舟过程中遇到的振动、过量损耗等问题,提出一种分段式作业轨迹规划方法。分别采用自适应的s曲线以及B样条曲线对传输机构的两段作业轨迹进行轨迹规划,并对较复杂的B样条曲线轨迹采用自适应遗传算法进行优化... 为了改善Pecvd设备在运输石墨舟过程中遇到的振动、过量损耗等问题,提出一种分段式作业轨迹规划方法。分别采用自适应的s曲线以及B样条曲线对传输机构的两段作业轨迹进行轨迹规划,并对较复杂的B样条曲线轨迹采用自适应遗传算法进行优化;同时采用模糊PID控制方法,将机构控制误差限制在合理范围之内。通过石墨舟传输机构模型轨迹仿真实验,验证了所提出的分段轨迹规划方法可使机构运动平稳;实际样机实验验证了该方法控制信号误差在5%以内。实验结果表明,所提出的轨迹规划方法在效率、误差控制方面均符合生产需求,可用于实际生产。 展开更多
关键词 轨迹规划 S曲线 B样条曲线 遗传算法
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线粒体Cyt b基因对九种穿山甲鉴别力的分析
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作者 韩松霖 马跃 +4 位作者 李波 刘微 穆佳童 徐艳春 杨淑慧 《野生动物学报》 北大核心 2025年第1期50-62,共13页
为优化穿山甲的分子鉴定方法,采用9种穿山甲54条Cyt b基因完整序列,评估了MEGA11软件中的7种模型和23种碱基替换类型所估算的遗传距离的物种分辨率、Cyt b基因全序列及各区域鉴别力。结果表明:K2P模型和p-distance模型基于颠换(T_(V))... 为优化穿山甲的分子鉴定方法,采用9种穿山甲54条Cyt b基因完整序列,评估了MEGA11软件中的7种模型和23种碱基替换类型所估算的遗传距离的物种分辨率、Cyt b基因全序列及各区域鉴别力。结果表明:K2P模型和p-distance模型基于颠换(T_(V))计算的遗传距离具有最优的物种分辨率;Cyt b基因全序列有较好的物种鉴别能力,其中,第301~400号和第851~950号的2个碱基序位片段组合时具有最高的物种分辨率,是鉴别9种穿山甲的最佳理论区段。现有的方法中推荐使用Kocher等的引物。今后在研发中采用多重PCR结合高通量测序对多片段组合进行分析,将会提高穿山甲的鉴别力。 展开更多
关键词 穿山甲 细胞色素b基因(Cyt b) 遗传距离 物种鉴定
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基于线粒体cyt b基因的华南沿海地区5个大刺鳅地理种群的群体遗传多样性研究
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作者 陈锭娴 林胜跃 +7 位作者 王凯丰 刘兰苑 叶树政 蓝昭军 韩崇 龚剑 桂林 李强 《四川动物》 北大核心 2025年第5期505-514,共10页
为探究华南沿海地区5个大刺鳅Mastacembelus armatus种群的群体遗传多样性和遗传结构,测定分析了155个样本的线粒体cyt b基因。结果显示,cyt b基因序列长1138 bp,包含48个变异位点和28个单倍型,单倍型多样性为0.77200,核苷酸多样性为0.0... 为探究华南沿海地区5个大刺鳅Mastacembelus armatus种群的群体遗传多样性和遗传结构,测定分析了155个样本的线粒体cyt b基因。结果显示,cyt b基因序列长1138 bp,包含48个变异位点和28个单倍型,单倍型多样性为0.77200,核苷酸多样性为0.00590。AMOVA分析显示,其遗传变异主要来源于群体内(62.85%)。系统发育分析显示,所有群体聚成2支:支系Ⅰ包括南流江和红河水系的全部样本,以及郁江、南渡江和鉴江的部分样本;支系Ⅱ则主要由南渡江、郁江和鉴江的另一部分样本组成。由单倍型网络关系图可知,南渡江、郁江、南流江和鉴江种群共享单倍型H5的个体数量最多,推测H5可能是该地区最古老的单倍型,其他单倍型可能由其逐步进化而来。种群核苷酸错配分析和中性检验结果表明,除红河和南流江种群外,其他种群近期未发生过种群扩张事件。本研究结果为华南沿海地区大刺鳅种质资源的保护和合理开发利用提供了参考资料。 展开更多
关键词 大刺鳅 cyt b基因 遗传多样性 遗传结构
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2023-2024年新疆乙型Victoria系流感病毒血凝素基因特征分析
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作者 陈媛 张璇 +7 位作者 黄佳 李泉希 谢媛 陈恬澜 米日扎提·努尔买买提 珲德孜·阿吾西 尼格德力·阿力腾赛尔 马鑫 《病毒学报》 北大核心 2025年第4期1097-1104,共8页
为分析新疆2023-2024年乙型Victoria系流感病毒血凝素基因特征,本文从新疆15家国家级流感监测网络实验室分离上送的BV系流感毒株中随机选取14株,进行二代全基因组序列测定。通过生物信息学软件MEGA X、BioEdit、ChiPot、NetNGlyc 1.0 Se... 为分析新疆2023-2024年乙型Victoria系流感病毒血凝素基因特征,本文从新疆15家国家级流感监测网络实验室分离上送的BV系流感毒株中随机选取14株,进行二代全基因组序列测定。通过生物信息学软件MEGA X、BioEdit、ChiPot、NetNGlyc 1.0 Services进行基因序列特征及同源性分析。2023-2024年度共监测流感毒株14份,抗原性分析显示,所有毒株均为B/Austria/1359417/2021(BV)疫苗株的类似株,未检测到低反应株;与疫苗株相比,核苷酸同源性为98.8%~99.5%,氨基酸同源性为99.4%~99.8%;14株BV系流感毒株HA基因与疫苗亲缘关系极高,均以162-164位三缺失为主要分支特征,共同归属于V1A.3a.2分支;共2个位点发生氨基酸变异,分别为E128D(11/14)和E183K(11/14),仅E128D位点处于120环,属于关键位点变异;所有流感毒株均未发现糖基化位点的置换变异。2023-2024年新疆BV系流感毒株与疫苗株进化起源相同,未发现新的变异株,提示该组分疫苗匹配性好,但仍发现潜在的非关键位点的变异,故今后仍需加强流感监测工作,为BV系流感病毒的分子进化规律以及流行病学监测提供研究基础。 展开更多
关键词 乙型Victoria系流感病毒 同源性 基因特征
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大规模人工增殖放流对青海湖裸鲤种群多样性的影响
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作者 陈生学 刘思嘉 +7 位作者 田菲 祁洪芳 俞录贤 柴长凯 汪洋 江华敏 李晓环 赵凯 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第3期102-110,共9页
分析大规模人工增殖放流对青海湖裸鲤种群的影响,为今后实施更加有效的保护措施提供科学依据。对2020—2022年间青海湖裸鲤增殖放流的幼鱼群体(FL)、野生群体(SS)、保种群体(BZ)3个群体以及增殖放流前的历史群体(LS)进行形态学测量、文... 分析大规模人工增殖放流对青海湖裸鲤种群的影响,为今后实施更加有效的保护措施提供科学依据。对2020—2022年间青海湖裸鲤增殖放流的幼鱼群体(FL)、野生群体(SS)、保种群体(BZ)3个群体以及增殖放流前的历史群体(LS)进行形态学测量、文献调研及线粒体基因测序,对形态特征、遗传多样性及种群结构进行比较分析。结果显示,形态特征上,青海湖裸鲤第一鳃弓外鳃耙数和体长体高比等形态特征SS与LS群体之间无显著差异(P>0.05);对3461个样本的细胞色素b基因(Cyt b)测序后共获得20个变异位点和23个单倍型,比较分析单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数在SS、FL、BZ与LS之间无显著差异(P>0.05);单倍型网络分析显示SS、FL、BZ与LS的遗传结构一致。研究结果表明,科学合理的人工增殖放流措施并没有影响青海湖裸鲤种群原有的遗传多样性和种群结构。 展开更多
关键词 青海湖裸鲤 遗传多样性 大规模人工增殖放流 线粒体细胞色素B 形态特征
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红喉歌鸲黑龙江种群遗传多样性和遗传结构分析
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作者 姜川 朱文文 李波 《野生动物学报》 北大核心 2025年第1期153-162,共10页
为揭示红喉歌鸲(Calliope calliope)黑龙江种群的遗传多样性和遗传结构,测定了85只个体细胞色素b基因序列,结合下载的135条同源序列进行综合分析。结果显示:黑龙江种群包含50个细胞色素b基因单倍型(1143 bp),其中42个为独特的新单倍型,... 为揭示红喉歌鸲(Calliope calliope)黑龙江种群的遗传多样性和遗传结构,测定了85只个体细胞色素b基因序列,结合下载的135条同源序列进行综合分析。结果显示:黑龙江种群包含50个细胞色素b基因单倍型(1143 bp),其中42个为独特的新单倍型,8个为共享单倍型。黑龙江种群具有较高的单倍型多样性(h=0.9340±0.0210),但核苷酸多样性较低(π=0.0030±0.0003),且二者均低于西伯利亚、远东岛屿及沿海种群。对此可能的解释是该种群过去经历了瓶颈事件,并可能受过去捕猎活动以及生境破坏的影响。系统发育分析表明,黑龙江种群没有其他支系单倍型的渗入,属于指名亚种。历史动态分析结果表明,黑龙江种群在更新世晚期、末次盛冰期前经历了扩张。本研究揭示了红喉歌鸲黑龙江种群的遗传状况,可为制定合理的物种保护措施提供科学依据。 展开更多
关键词 红喉歌鸲 细胞色素B基因 遗传多样性 遗传结构 种群扩张
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似刺鳊[鱼句]群体线粒体cyt b基因遗传变异
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作者 肖俊 鲁翠云 +5 位作者 尤连祥 巫伟华 龙凡 那荣滨 郑先虎 丁立云 《水产学杂志》 2025年第6期1-6,共6页
为了解长江中下游湖泊似刺鳊[鱼句](Paracanthobrama guichenoti)群体的遗传变异,本研究分析了八里湖(BL)、军山湖(JL)和大官湖(DL)群体的线粒体细胞色素b(cytochrome b,cyt b)基因的单倍型分布及遗传特征。结果在90个样本的cyt b基因序... 为了解长江中下游湖泊似刺鳊[鱼句](Paracanthobrama guichenoti)群体的遗传变异,本研究分析了八里湖(BL)、军山湖(JL)和大官湖(DL)群体的线粒体细胞色素b(cytochrome b,cyt b)基因的单倍型分布及遗传特征。结果在90个样本的cyt b基因序列(1141 bp)中共检测到8个变异位点,定义了9种单倍型,其中Hap1、Hap6和Hap7为3个群体的共同单倍型,合计占比为64.4%;BL群体单倍型数量最多(7种),而JL群体的单倍型多样性(Hd=0.699±0.046)和核苷酸多样性(π=0.00086±0.00013)最高。AMOVA分析显示,群体间遗传变异占总变异的22.02%,八里湖群体(BL)与军山湖(JL)和大官湖(DL)群体间的遗传分化较大(Fst>0.15)。本研究结果可为似刺鳊[鱼句]种群的合理开发利用提供参考。 展开更多
关键词 似刺鳊[鱼句] 线粒体细胞色素B基因 单倍型分布 遗传变异
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基于Cyt b基因的广西主要河流斑鳠遗传多样性分析
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作者 朱威霖 何泽霖 +5 位作者 吴铁军 韦友传 张棋麟 覃飞 罗帮 陈晓汉 《西南农业学报》 北大核心 2025年第12期2692-2699,共8页
【目的】基于Cyt b基因分析广西主要河流斑鳠的遗传多样性,为斑鳠种质资源的保护策略制定与可持续利用提供科学依据。【方法】以Cyt b基因为分子标记,对广西贵港(GG)、百色(BS)、大化(DH)和柳州(LZ)4个地理群体共120尾斑鳠个体进行遗传... 【目的】基于Cyt b基因分析广西主要河流斑鳠的遗传多样性,为斑鳠种质资源的保护策略制定与可持续利用提供科学依据。【方法】以Cyt b基因为分子标记,对广西贵港(GG)、百色(BS)、大化(DH)和柳州(LZ)4个地理群体共120尾斑鳠个体进行遗传多样性及遗传结构分析。【结果】斑鳠Cyt b基因序列长度为1141 bp,碱基组成具有明显的偏倚性,A、T、G、C含量分别为29.74%、30.78%、13.65%、25.83%,AT含量(60.52%)大于CG含量(39.48%)。4个斑鳠群体共检测出100个多态性位点,划分至68个单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.722~0.977,核苷酸多样性(Pi)为0.00116~0.00281,具体表现为LZ>BS>GG>DH,总体呈高单倍型多样性和低核苷酸多样性特征,说明广西主要河流斑鳠群体总体遗传多样性偏低。各斑鳠群体间遗传距离为0.01640~0.02520,遗传分化系数(Fst)为0.00430~0.08555,DH群体与GG群体的遗传距离最近(0.01640),亲缘关系较近;GG群体与LZ群体的遗传距离最远(0.02520),亲缘关系较远。分子方差分析结果表明,广西主要河流斑鳠遗传变异主要来源于群体内。斑鳠群体单倍型分布和系统发育树显示,4个斑鳠群体的共享单倍型Hap1为优势单倍型,未形成独特的地理分布。中性检验结果表明,4个斑鳠群体Tajima’s D和Fu’s Fs均为负值,且显著偏离中性(P<0.05),说明广西主要河流的斑鳠经历过种群扩张。【结论】广西主要河流斑鳠遗传多样性较低,建议将4个斑鳠地理群体归入同一管理单元实施就地保护,重点维护斑鳠栖息地连通性与种群自然交流,并加强栖息地保护力度。 展开更多
关键词 斑鳠 遗传多样性 Cyt b基因 广西主要河流
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基于Cyt b基因序列的黄斑蓝子鱼群体遗传多样性分析
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作者 郑鹏 李文俊 +7 位作者 陈锭娴 黄小林 王凯丰 刘兰苑 韩崇 李强 杨育凯 黄忠 《南方水产科学》 北大核心 2025年第4期109-118,共10页
黄斑蓝子鱼(Siganus oramin)养殖群体已出现经济性状衰退和遗传多样性下降问题。为保护野生种质资源,对采自中国东南沿海7个地理群体(湛江北部湾BB、海南文昌WC、阳江沙扒湾SB、深圳大鹏湾DP、深圳大亚湾DY、漳州东山湾DS和宁德三沙湾SS... 黄斑蓝子鱼(Siganus oramin)养殖群体已出现经济性状衰退和遗传多样性下降问题。为保护野生种质资源,对采自中国东南沿海7个地理群体(湛江北部湾BB、海南文昌WC、阳江沙扒湾SB、深圳大鹏湾DP、深圳大亚湾DY、漳州东山湾DS和宁德三沙湾SS)的197尾样本进行线粒体Cyt b基因测序分析,旨在评估野生群体的遗传多样性状况。结果显示,黄斑蓝子鱼的线粒体Cyt b基因全序列长度为1141 bp,包含140个变异位点,81个单倍型,表现出高单倍型多样性(Hd=0.921±0.014)和低核苷酸多样性(Pi=0.0064±0.0010)的特点。遗传距离和遗传分化结果均显示黄斑蓝子鱼群体间未发生明显分化,各地理群体亲缘关系较近。基于Cyt b基因序列构建的NJ树显示,81个单倍型散落分布在一个支系,各群体均未形成明显单系群。单倍型网络分析结果亦表明不同地理区的黄斑蓝子鱼群体间未发生明显分化。AMOVA分析表明,黄斑蓝子鱼遗传分化主要来自群体内部(99.83%)。中性检验结果显示,Fu's Fs值为显著的负值(−24.605,p<0.05);贝叶斯天际线图表明黄斑蓝子鱼短时间内经历了瓶颈效应以及种群扩张事件,推测其扩张时间约为1.577万年前。 展开更多
关键词 线粒体Cyt b基因 黄斑蓝子鱼 遗传多样性 种群扩张
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