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大豆GmAux/IAA16调控根系响应低磷胁迫的功能
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作者 陆云艳 张雅琼 +6 位作者 温宪勤 荀岚 王亮 董蓉娇 董文汉 陈军文 梁泉 《分子植物育种》 北大核心 2025年第17期5633-5643,共11页
Aux/IAA16参与多种植物对生物胁迫和非生物胁迫响应的调控,但它是否参与大豆低磷胁迫响应尚有待于深入研究。本研究从大豆[Glycine max(L.)Merr.]根部克隆GmAux/IAA16基因的全长CDS序列,其开放阅读框为954 bp,编码317个氨基酸,蛋白质分... Aux/IAA16参与多种植物对生物胁迫和非生物胁迫响应的调控,但它是否参与大豆低磷胁迫响应尚有待于深入研究。本研究从大豆[Glycine max(L.)Merr.]根部克隆GmAux/IAA16基因的全长CDS序列,其开放阅读框为954 bp,编码317个氨基酸,蛋白质分子量为34.6 kD,理论等电点为9.18。序列比对和系统进化分析表明,大豆GmAux/IAA16与木豆CcAux/IAA16蛋白在系统发育上具有相似性,亚细胞定位结果显示该蛋白定位于细胞核。低磷胁迫条件下,过表达GmAux/IAA16基因的烟草植株通过促进根系生长、优化营养吸收,从而保证了自身生长需求,显著增强植物对磷胁迫的适应能力。与野生型(WT)相比,过表达GmAux/IAA16烟草在低磷条件下培养15 d,根系总长度、根系总表面积、根体积、侧根数量分别增加0.39%、13.42%和23.53%,差异达到显著或极显著水平;叶片氮含量提高2.86%、根系氮含量提高9.15%,叶片磷含量提高8.24%、根系磷含量提高5.04%,差异达到显著水平;植株株高、茎粗、总干重和根冠比分别比正常磷水平提高了21.43%、11.71%、7.81%和27.78%,差异达到显著或极显著水平。此外,低磷胁迫下转基因植株中ACP(酸性磷酸酶)、POD(过氧化物酶)、IAAO(吲哚乙酸氧化酶)、RNase(核糖核酸酶)等酶活性显著增加,揭示GmAux/IAA16可能通过调节这些酶的活性来增强大豆对低磷胁迫条件的适应性。本研究结果为Aux/IAA16基因在大豆分子育种及提高作物磷效率中的应用提供了科学依据。 展开更多
关键词 大豆 aux/IAA16 低磷胁迫 根系形态 氮磷吸收
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西瓜AUX/LAX基因的鉴定及在芽再生过程中的表达分析
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作者 王铎 许昕阳 +3 位作者 沈佳 寿伟松 何艳军 轩正英 《山东农业科学》 北大核心 2025年第3期1-9,共9页
生长素是最重要的植物激素之一,生长素内流载体AUX/LAX(AUXIN RESISTENT1/LIKE AUX1)与多膜跨越蛋白和氨基酸转运蛋白有关,参与生长素的主动运输过程。AUX/LAX基因已在多个物种中被鉴定,被发现在植物多个生长发育过程中发挥非常重要的作... 生长素是最重要的植物激素之一,生长素内流载体AUX/LAX(AUXIN RESISTENT1/LIKE AUX1)与多膜跨越蛋白和氨基酸转运蛋白有关,参与生长素的主动运输过程。AUX/LAX基因已在多个物种中被鉴定,被发现在植物多个生长发育过程中发挥非常重要的作用,但在西瓜中还没有相关报道。本研究在全基因组水平对西瓜AUX/LAX基因进行鉴定,并对其结构、系统发育、启动子顺式调控元件等进行了分析。结果表明,从西瓜全基因组中鉴定到5个AUX/LAX基因,都含有保守的Aa_trans结构域;对西瓜与拟南芥、水稻、黄瓜的21个AUX/LAX蛋白进行系统进化分析,它们被聚为两个亚族,而绝大多数西瓜与黄瓜的AUX/LAX蛋白存在一对一同源关系;从西瓜AUX/LAX基因启动子上鉴定到脱落酸、茉莉酸甲酯、水杨酸响应元件(TCAelement),以及赤霉素等激素和厌氧诱导、低温、干旱等防御和非生物胁迫响应元件。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析发现,除了ClAUX/LAX4,其他ClAUX/LAXs均在雄花中的表达水平最低,具有显著的组织特异性;而且西瓜AUX/LAXs基因在分化能力不同的西瓜材料中的表达各不相同,其中ClAUX/LAX5在分化5 d的高再生材料中的表达水平显著高于低再生材料,暗示其可能在西瓜芽再生过程中发挥重要作用。本研究结果可为进一步研究生长素在西瓜芽再生过程中的作用提供证据,并为挖掘西瓜芽再生调控基因奠定基础。 展开更多
关键词 生长素转运载体 aux/LAX基因 西瓜 芽再生过程 基因表达
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花椒Aux/IAA基因家族鉴定及表达分析
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作者 吴梦佳 陈磊 +1 位作者 李博通 刘永红 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第4期117-126,共10页
Aux/IAA基因家族在植物生长素信号传导途径和植物发育中起着至关重要的调节作用。本研究从花椒(Zanthoxylum bungeanum)基因组中鉴定出51个Aux/IAA基因。系统发育树、保守基序和基因结构分析显示,花椒Aux/IAA基因被划分为7个亚家族,同... Aux/IAA基因家族在植物生长素信号传导途径和植物发育中起着至关重要的调节作用。本研究从花椒(Zanthoxylum bungeanum)基因组中鉴定出51个Aux/IAA基因。系统发育树、保守基序和基因结构分析显示,花椒Aux/IAA基因被划分为7个亚家族,同一个亚家族有着相似的基因结构,34个(67%)基因具有串联重复和片段复制。花椒Aux/IAA基因的启动子序列中包含大量与植物激素和生长发育相关的顺式作用元件。不同时期花椒刺中ZbIAA基因的表达图谱显示,ZbIAA1、ZbIAA5、ZbIAA25、ZbIAA30和ZbIAA44基因在花椒刺中的表达水平显著高于其他基因,可能在花椒刺发育过程中起重要作用。密码子偏好性分析表明,花椒Aux/IAA基因家族密码子偏好以A/T碱基结尾,ZbIAA基因中有25个密码子具有偏好性,有2个密码子没有偏好性。研究结果为深入解析花椒Aux/IAA基因家族的功能奠定了理论基础。 展开更多
关键词 花椒 aux/IAA基因家族 刺发育 密码子偏好性
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木薯MeAux/IAA19基因的克隆及功能初探 被引量:1
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作者 刘小丽 韦运谢 《热带生物学报》 2025年第3期363-369,共7页
为了探究Aux/IAA基因的初步功能,本研究克隆并鉴定了木薯(Manihot esculenta)MeIAA19基因,通过生物信息学分析发现,该基因编码244个氨基酸,具有典型Aux/IAA蛋白的PB1保守结构域。通过构建MeIAA19-pET32a原核表达载体,诱导表达出该蛋白,... 为了探究Aux/IAA基因的初步功能,本研究克隆并鉴定了木薯(Manihot esculenta)MeIAA19基因,通过生物信息学分析发现,该基因编码244个氨基酸,具有典型Aux/IAA蛋白的PB1保守结构域。通过构建MeIAA19-pET32a原核表达载体,诱导表达出该蛋白,并通过外源施加蛋白促进木薯植株活性氧爆发和MePRs基因表达量。基因表达分析表明,MeIAA19基因的表达量在Xam侵染过程中随时间的延长而增加。本研究结果显示,木薯MeIAA19基因可能参与了木薯免疫。 展开更多
关键词 木薯 aux/IAA蛋白 原核表达 表达分析 功能分析
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Advances in the study of auxin early response genes:Aux/IAA,GH3,and SAUR 被引量:3
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作者 Dongfang Bao Senqiu Chang +1 位作者 Xiaodong Li Yanhua Qi 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2024年第4期964-978,共15页
Auxin plays a crucial role in all aspects of plant growth and development.Auxin can induce the rapid and efficient expression of some genes,which are named auxin early response genes(AERGs),mainly including the three ... Auxin plays a crucial role in all aspects of plant growth and development.Auxin can induce the rapid and efficient expression of some genes,which are named auxin early response genes(AERGs),mainly including the three families:auxin/indole-3-acetic acid(Aux/IAA),Gretchen Hagen 3(GH3),and small auxin-up RNA(SAUR).Aux/IAA encodes the Aux/IAA protein,which is a negative regulator of auxin response.Aux/IAA and auxin response factor(ARF)form a heterodimer and participate in a variety of physiological processes through classical or non-classical auxin signaling pathways.The GH3 encodes auxin amide synthetase,which catalyzes the binding of auxin to acyl-containing small molecule substrates(such as amino acids and jasmonic acid),and regulates plant growth and stresses by regulating auxin homeostasis.SAURs is a class of small auxin up-regulated RNAs.SAUR response to auxin is complex,and the process may occur at the transcriptional,post-transcriptional and protein levels.With the development of multi-omics,significant progress has been made in the study of Aux/IAA,GH3,and SAUR genes,but there are still many unknowns.This review offers insight into the characteristics of Aux/IAA,GH3,and SAUR gene families,and their roles in roots,hypocotyls,leaves,leaf inclinations,flowers,seed development,stress response,and phytohormone crosstalk,and provides clues for future research on phytohormone signaling and the molecular design breeding of crops. 展开更多
关键词 auxIN aux/IAA GH3 SAUR STRESS
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中国南瓜CmoAux/IAA基因的克隆和表达特征分析 被引量:1
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作者 任广乾 刘正响 +3 位作者 韩圆圆 陈碧华 李新峥 李庆飞 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第10期30-37,共8页
在前期对中国南瓜败育雌蕊和正常雌蕊进行转录组分析发现,CmoAux/IAA基因可能参与了雌花发育,为进一步探究其生物学功能,利用同源序列克隆法从中国南瓜中克隆得到全长为600 bp的CmoAux/IAA基因,该基因编码199个氨基酸;保守结构域分析结... 在前期对中国南瓜败育雌蕊和正常雌蕊进行转录组分析发现,CmoAux/IAA基因可能参与了雌花发育,为进一步探究其生物学功能,利用同源序列克隆法从中国南瓜中克隆得到全长为600 bp的CmoAux/IAA基因,该基因编码199个氨基酸;保守结构域分析结果表明,其属于Aux/IAA家族,包含结构域Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ;该蛋白无信号肽和跨膜结构。多序列比对和系统进化树分析结果显示,CmoAux/IAA氨基酸序列与印度南瓜XP_022986212.1的氨基酸序列、美洲南瓜XP_023513171.1的氨基酸序列亲缘关系较近,相似度高达98.01%、96.50%。拟南芥原生质体亚细胞定位结果显示,CmoAux/IAA蛋白定位于细胞核和细胞质。实时荧光定量结果显示,该基因具有组织表达特异性,主要在南瓜植株生长点及雌花柱头中表达,柱头中的相对表达量是雄蕊的137倍,在叶和根中不表达,其可能在植株生长点幼嫩组织分化或雌花发育过程中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 中国南瓜 aux/IAA 基因克隆 生物信息学分析 亚细胞定位
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植物非典型Aux/IAA蛋白应答生长素研究进展 被引量:2
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作者 周玉滢 陈辉 刘斯穆 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期651-658,共8页
植物激素生长素调控植物生长发育及环境适应的多个过程,包括胚胎发育、器官发生和向性生长等。生长素发挥生物学功能主要依赖于经典的TIR1/AFB-auxin-Aux/IAA-ARF信号转导途径。其中,由4个保守结构域组成的典型Aux/IAA蛋白作为TIR1/AFB... 植物激素生长素调控植物生长发育及环境适应的多个过程,包括胚胎发育、器官发生和向性生长等。生长素发挥生物学功能主要依赖于经典的TIR1/AFB-auxin-Aux/IAA-ARF信号转导途径。其中,由4个保守结构域组成的典型Aux/IAA蛋白作为TIR1/AFB的共受体在生长素信号转导过程中发挥关键作用。然而,近年来发现缺乏保守结构域的非典型Aux/IAA蛋白也参与生长素的应答与调控作用。该文从蛋白结构、生物学功能及参与生长素信号转导等方面综述了非典型Aux/IAA蛋白的研究进展,探讨和展望了非典型Aux/IAA蛋白的研究方向。 展开更多
关键词 生长素 aux/IAA蛋白 非典型aux/IAA蛋白 结构与功能 信号转导
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Camellia sinensis CsMYB4a participates in regulation of stamen growth by interaction with auxin signaling transduction repressor CsAUX/IAA4 被引量:2
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作者 Guoliang Ma Mingzhuo Li +8 位作者 Yingling Wu Changjuan Jiang Yifan Chen Dawei Xing Yue Zhao Yajun Liu Xiaolan Jiang Tao Xia Liping Gao 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2024年第1期188-201,共14页
Subgroup 4(Sg4)members of the R2R3-MYB are generally known as negative regulators of the phenylpropanoid pathway in plants.Our previous research showed that a R2R3-MYB Sg4 member from Camellia sinensis(CsMYB4a)inhibit... Subgroup 4(Sg4)members of the R2R3-MYB are generally known as negative regulators of the phenylpropanoid pathway in plants.Our previous research showed that a R2R3-MYB Sg4 member from Camellia sinensis(CsMYB4a)inhibits expression of some genes in the phenylpropanoid pathway,but its physiological function in the tea plant remained unknown.Here,CsMYB4a was found to be highly expressed in anther and filaments,and participated in regulating filament growth.Transcriptome analysis and exogenous auxin treatment showed that the target of CsMYB4a might be the auxin signal pathway.Auxin/indole-3-acetic acid 4(AUX/IAA4),a repressor in auxin signal transduction,was detected from a yeast two-hybrid screen using CsMYB4a as bait.Gene silencing assays showed that both CsIAA4 and CsMYB4a regulate filament growth.Tobacco plants overexpressing CsIAA4 were insensitive to exogenous a-NAA,consistent with overexpression of CsMYB4a.Protein-protein interaction experiments revealed that CsMYB4a interacts with N-terminal of CsIAA4 to prevent CsIAA4 degradation.Knock out of the endogenous NtIAA4 gene,a CsIAA4 homolog,in tobacco alleviated filament growth inhibition and a-NAA insensitivity in plants overexpressing CsMYB4a.All results strongly suggest that CsMYB4a works synergistically with CsIAA4 and participates in regulation of the auxin pathway in stamen. 展开更多
关键词 aux/IAA4 auxin signaling CsMYB4a Subgroup 4 R2R3-MYB
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基于构式语法理论的“NP AUX VP”句法构式研究
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作者 张艳艳 《晋中学院学报》 2024年第6期86-90,共5页
构式语法(Construction Grammar,简称Cx G)强调语言结构的模式和框架,这些模式和框架可以被用来构建语言的意义和形式。基于Goldberg构式语法框架,以张汉熙所著的Advanced English(《高级英语》)为语料,对NP AUX VP构式进行认知解读,从... 构式语法(Construction Grammar,简称Cx G)强调语言结构的模式和框架,这些模式和框架可以被用来构建语言的意义和形式。基于Goldberg构式语法框架,以张汉熙所著的Advanced English(《高级英语》)为语料,对NP AUX VP构式进行认知解读,从全新的视角分析AUX在句法构式中的作用,分析并总结该构式在英语语言中的支配作用,最大程度地发挥该构式的句式结构、语义表征和语用功能,发挥构式语法在二语习得中的作用,从而帮助外语学习者从宏观角度把握语言特征,促进学习者语法能力的提升。 展开更多
关键词 构式语法 NP aux VP 句法构式
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决明Aux/IAA和ARF基因家族鉴定、表达及蛋白互作分析 被引量:6
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作者 冯昭 刘世鹏 +5 位作者 吕蕊花 吕瑞华 胡晓晨 张明英 毛仁俊 张岗 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期751-763,共13页
植物生长素早期响应基因家族(auxin/indole-3-acetic acid,Aux/IAA)及其与生长素响应转录因子(auxin response factor,ARF)的互作是调控植物生长发育的重要方式。本文基于药用植物决明(Senna tora L.)全基因组数据鉴定到28个StoIAA和24... 植物生长素早期响应基因家族(auxin/indole-3-acetic acid,Aux/IAA)及其与生长素响应转录因子(auxin response factor,ARF)的互作是调控植物生长发育的重要方式。本文基于药用植物决明(Senna tora L.)全基因组数据鉴定到28个StoIAA和24个StoARF成员,分别归为10个和8个亚家族。系统发育树和共线性分析发现,决明与大豆(Glycine max)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)的IAA、ARF同源基因均存在密切的进化关系,且基因片段重复事件主导了StoIAA和StoARF的扩张。基因结构分析显示,绝大多数StoIAAs和StoARFs含有特征保守结构域。转录组数据分析显示,StoIAAs和StoARFs在叶、根和种子中均有表达,部分成员具有组织表达特异性。StoIAA和StoARF启动子区域多含有与胁迫响应、生长发育、激素诱导、次生代谢等相关的作用元件。基因表达分析显示许多StoIAAs和StoARFs能够迅速响应干旱和盐胁迫,且在两种胁迫条件下表现出相似的表达模式。酵母双杂交实验证实StoARF8和StoARF10分别与多个StoIAA蛋白之间同时存在不同程度的互作。以上研究结果为进一步开展决明Aux/IAA和ARF基因家族的生物学功能分析提供基础。 展开更多
关键词 决明 aux/IAA 生长素响应转录因子 激素 蛋白互作
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油茶Aux/IAA基因家族的鉴定与分析 被引量:1
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作者 张廷忠 梁康 +2 位作者 陈荟 朱亚艳 许杰 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第9期2847-2855,共9页
为了获取油茶Aux/IAA基因家族的分布和结构特征,利用HMM进行油茶全基因组Aux/IAA基因的鉴定。结果表明,油茶Aux/IAA基因非均匀分布在10条染色体上;序列长度和外显子数量差异较大,氨基酸长度范围在132~1085之间,外显子数量为2~16个,同一... 为了获取油茶Aux/IAA基因家族的分布和结构特征,利用HMM进行油茶全基因组Aux/IAA基因的鉴定。结果表明,油茶Aux/IAA基因非均匀分布在10条染色体上;序列长度和外显子数量差异较大,氨基酸长度范围在132~1085之间,外显子数量为2~16个,同一系统发育亚组上的基因具有类似的外显子数量和基序结构;油茶Aux/IAA部分基因具备响应生长素的顺式作用元件外,还具备其他激素响应的基序和光响应元件。转录组数据表明,CoIAAChr12_3、CoIAAChr7_5、CoIAAChr9_3、CoIAAChr9_4、CoIAAChr7_6基因在油茶花芽、花瓣、萼片、雄蕊、雌蕊中高表达,可能与花的形成和发育相关。CoIAAChr12_5在油茶种子中高表达,可能与油茶种子发育相关。本研究为Aux/IAA基因家族在油茶中的系统研究提供了基础。 展开更多
关键词 油茶 基因家族 aux/IAA 启动子元件分析 基因表达
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尼泊尔黄堇Aux/IAA基因家族的鉴定与UVB处理下表达模式分析 被引量:1
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作者 梁佳林 赵爽 +2 位作者 李幸儿 赵成周 李萍 《生物技术通报》 CSCD 北大核心 2024年第12期182-192,共11页
【目的】鉴定尼泊尔黄堇Aux/IAA基因家族,为尼泊尔黄堇Aux/IAA基因功能研究及抵御逆境胁迫提供理论基础。【方法】基于尼泊尔黄堇全长转录组数据,鉴定和分析尼泊尔黄堇Aux/IAA(ChAux-IAA)基因家族成员,并对其蛋白质理化性质、系统进化... 【目的】鉴定尼泊尔黄堇Aux/IAA基因家族,为尼泊尔黄堇Aux/IAA基因功能研究及抵御逆境胁迫提供理论基础。【方法】基于尼泊尔黄堇全长转录组数据,鉴定和分析尼泊尔黄堇Aux/IAA(ChAux-IAA)基因家族成员,并对其蛋白质理化性质、系统进化树、基因结构、蛋白质三级结构及蛋白质互作关系、启动子顺式作用元件进行分析。此外,对尼泊尔黄堇进行不同时间(0.5 h、48 h)UV-B处理,检测ChAux/IAA基因家族的表达模式。【结果】尼泊尔黄堇ChAux/IAA基因家族共有20个成员,大多数位于细胞核中,少数位于叶绿体、线粒体和细胞壁中。ChAux/IAA基因家族编码蛋白属于亲水性蛋白。ChAux/IAA基因家族的顺式作用元件中存在光响应元件,表明该基因家族可能参与植物的生长发育和抵御紫外胁迫。通过RT-qPCR分析发现,在UV-B处理下,20个ChAux/IAA的表达量均较对照组增加,其中ChIAA2、ChIAA3、ChIAA4、ChIAA10、ChIAA13和ChIAA21表达量增加更加显著,表明ChAux/IAA基因家族在其抵御紫外线胁迫方面具有重要功能。【结论】共鉴定出20个ChAux/IAA基因家族成员,ChAux/IAA基因家族在UV-B胁迫中发挥重要作用。 展开更多
关键词 尼泊尔黄堇 aux/IAA基因家族 UV-B胁迫 全长转录组 生物信息学 基因表达分析
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红花Aux/IAA基因家族鉴定及盐胁迫响应分析 被引量:1
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作者 刘湘楠 胡祥祥 +2 位作者 乔梦燚 周丹宁 朱畇昊 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第6期68-76,共9页
为了对红花Aux/IAA基因家族进行生物信息学分析,研究该基因在红花生长发育中的调控作用,利用生物信息学方法,在红花全基因组中鉴定出28个Aux/IAA基因。根据其与拟南芥Aux/IAA基因的系统发育关系,使用MEGA 7.0做出系统发育进化树。经理... 为了对红花Aux/IAA基因家族进行生物信息学分析,研究该基因在红花生长发育中的调控作用,利用生物信息学方法,在红花全基因组中鉴定出28个Aux/IAA基因。根据其与拟南芥Aux/IAA基因的系统发育关系,使用MEGA 7.0做出系统发育进化树。经理化性质分析,红花Aux/IAA蛋白为亲水性蛋白,且79%位于细胞核中,大多数红花Aux/IAA蛋白表现为偏酸性;经聚类分析,将红花Aux/IAA基因分为5个亚族。基因结构分析表明,所有基因均含有1~9个内含子。这些基因在红花的9条染色体上非均匀地分布,其中9号染色体上分布最多,有7个Aux/IAA基因。红花Aux/IAA基因在不同发育期及不同外源激素处理下表达量各不相同。对保守基序作图分析发现,大部分红花Aux/IAA蛋白具有4个共同的保守基序,分别为motif 1、motif 2、motif 3、motif 4,qRT-PCR结果表明,不同浓度盐胁迫处理24 h后,基因CtAux/IAA1相对表达量呈上调趋势,推测此基因可能与提高红花抗盐胁迫能力有关。本研究结果将有助于了解红花Aux/IAA基因家族在生长发育过程中的功能并筛选优良基因。 展开更多
关键词 红花 aux/IAA基因家族 生物信息学分析 盐胁迫
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油茶果皮发育相关ARF-Aux/IAA互作分析
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作者 徐嘉娟 刘四黑 +4 位作者 杨冰 魏莹莹 朱亚艳 许杰 王港 《种子》 北大核心 2024年第6期12-20,共9页
生长素在植物生长发育过程中发挥重要调控作用,ARF和Aux/IAA是生长素介导的信号转导通路中的关键调节因子。果皮厚度直接影响油茶的经济产量,不同种质的油茶果皮厚度具有明显的分化,为进一步研究油茶果皮厚度调控机制,通过转录组学和生... 生长素在植物生长发育过程中发挥重要调控作用,ARF和Aux/IAA是生长素介导的信号转导通路中的关键调节因子。果皮厚度直接影响油茶的经济产量,不同种质的油茶果皮厚度具有明显的分化,为进一步研究油茶果皮厚度调控机制,通过转录组学和生物信息学系统分析油茶果皮转录组数据,筛选油茶果皮发育过程中可能存在相互作用的CoARF和CoIAA基因。结果表明,在油茶果皮转录组数据中共鉴定到19个CoARF和17个CoIAA基因,有10对CoARF-CoIAA(8个CoARF基因和6个CoIAA基因)的时空表达存在显著相关性,将其编码蛋白序列分别与拟南芥中的ARFs和IAAs构建系统进化树后发现,CoARF14、CoARF19和CoARF11与起转录抑制作用的AtARFS具有较近的亲缘关系。而CoARF6和CoARF10与起转录激活作用的AtARFS具有较近的亲缘关系。互作蛋白以拟南芥为参考进一步进行同源映射校验后,最终确定CoARF10-CoIAA5、CoARF6-CoIAA2和CoARF14-CoIAA12三对组合可能通过相互作用传递生长素信号参与调控油茶果皮发育。 展开更多
关键词 果皮发育 ARF aux/IAA 互作筛选
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半夏珠芽发育相关PteAUX1基因的克隆与表达分析
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作者 罗睿 田晨 +3 位作者 夏丽莎 陈海丽 杜声珊 罗须 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第18期6000-6009,共10页
生长素在中药植物半夏的珠芽发育中可能具有重要调节作用,但生长素调控珠芽发育的分子机制尚不清楚。本研究利用半夏及近缘植物滴水珠的RNA-seq结果筛选珠芽发育过程中影响内源生长素浓度的共差异表达基因,对筛选序列RACE克隆获得全长CD... 生长素在中药植物半夏的珠芽发育中可能具有重要调节作用,但生长素调控珠芽发育的分子机制尚不清楚。本研究利用半夏及近缘植物滴水珠的RNA-seq结果筛选珠芽发育过程中影响内源生长素浓度的共差异表达基因,对筛选序列RACE克隆获得全长CDS或测序验证后进行序列分析,通过定量PCR对该基因在半夏珠芽发育过程中的时空表达特性进行分析。研究结果表明,珠芽发生过程中生长素合成、失活和运输环节都有差异表达基因,2个物种珠芽发生过程中共差异表达生长素输入蛋白AUX1/LAX家族成员(PteAUX1和PcoLAX2);序列分析发现编码蛋白二级结构都具有11个跨膜结构域,功能相关重要位点保守;PteAUX1在半夏叶柄的珠芽发生部位上/下随珠芽发生而差异表达。上述结果表明生长素输入蛋白AUX1/LAX家族成员在半夏叶柄珠芽发生部位上/下不同时期的差异表达可能导致该部位的内源生长素积累从而调节珠芽的发生。研究结果可为进一步探讨半夏珠芽发育调节的信号转导途径提供理论基础。 展开更多
关键词 半夏(Pinellia ternata) 滴水珠(Pinellia cordata) 生长素 aux1/LAX 珠芽
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Aux/IAA家族基因GhAux1沉默促进棉花幼苗的生长 被引量:1
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作者 王丽 王俐锋 +3 位作者 赵盼盼 李用芳 王太霞 李景原 《河南农业科学》 北大核心 2019年第6期46-51,80,共7页
为明确Aux/IAA家族基因GhAux1在棉花幼苗生长发育中的功能,利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术构建了重组表达载体pTRV-GhAux1,转化农杆菌并注射到棉花幼苗子叶,采用qRT-PCR检测GhAux1沉默效率,并对GhAux1沉默植株的表型、内源生长素(IAA... 为明确Aux/IAA家族基因GhAux1在棉花幼苗生长发育中的功能,利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术构建了重组表达载体pTRV-GhAux1,转化农杆菌并注射到棉花幼苗子叶,采用qRT-PCR检测GhAux1沉默效率,并对GhAux1沉默植株的表型、内源生长素(IAA)含量和赤霉素(GA4)含量以及GA合成关键酶基因的表达进行了分析。结果表明,成功建立了VIGS体系,注射含pTRV-GhAux1的菌液后15d,GhAux1在沉默植株中的表达量仅为空载体对照的26%;注射含pTRV-GhAux1的菌液后24、27、30d,GhAux1沉默植株的株高较空载体对照分别显著增加了18%、27%、20%,其中注射后27d达到极显著水平;注射含pTRV-GhAux1的菌液后21、24、27d,GhAux1沉默植株的节间内源GA4含量比空载体对照分别增加了33%、20%、33%,且GA合成关键酶基因GhGA20ox1、GhGA20ox2和GhGA3ox1的表达量均显著或极显著增加,而IAA含量仅在注射后27d显著增加。表明GhAux1参与IAA与GA的互作,可调控GA合成途径下游基因的表达,抑制棉花幼苗的生长。 展开更多
关键词 棉花 病毒诱导的基因沉默 aux/IAA Ghaux1 赤霉素
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高粱全基因组生长素原初响应基因Aux/IAA的序列特征分析 被引量:20
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作者 王益军 吕燕萍 +2 位作者 谢秦 邓德祥 卞云龙 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期688-694,共7页
生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用。Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一。采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25... 生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用。Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一。采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25个Aux/IAA基因,分布于高粱9对染色体,在高粱第6号染色体上未发现Aux/IAA基因。序列比对与系统发生分析表明,22个(88%)高粱Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域,19对高粱/玉米Aux/IAA蛋白、2对高粱/水稻Aux/IAA蛋白处于系统进化树的同一分支。该研究结果不仅有助于生长素信号转导通路的解析,而且可以为其他作物基因家族的研究提供参考。 展开更多
关键词 高粱 生长素 aux/IAA基因家族 比较基因组学
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地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1的克隆和表达分析 被引量:9
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作者 王丰青 田云鹤 +5 位作者 李明杰 杨金凤 张宝 林文雄 陈新建 张重义 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第23期4033-4039,共7页
为了克隆地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1,分析地黄RgIAA1的时空表达特性及对逆境胁迫的响应。以拟南芥AtIAA14的cDNA序列为探针在地黄转录组数据库中进行比对,应用生物信息学方法分析RgIAA1的序列特征及进化关系,以实时荧光定量PCR技术检测R... 为了克隆地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1,分析地黄RgIAA1的时空表达特性及对逆境胁迫的响应。以拟南芥AtIAA14的cDNA序列为探针在地黄转录组数据库中进行比对,应用生物信息学方法分析RgIAA1的序列特征及进化关系,以实时荧光定量PCR技术检测RgIAA1在地黄不同组织以及逆境胁迫下的表达量。结果表明,获得1条903 bp的cDNA序列,包含一个681 bp完整的开放阅读框(ORF),编码226个氨基酸,具有Aux/IAA家族蛋白的典型结构域和特征序列。RgIAA1在地黄不同组织中的表达呈差异表达,其中在地黄幼嫩叶片里表达强度最大,其次为茎,且随着叶片的伸展,RgIAA1表达强度不断降低。在连作时RgIAA1的表达量升高,NaCl和渍水胁迫下RgIAA1的表达量降低。实验首次克隆了地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1,为阐明其在地黄生长发育和逆境胁迫中的分子功能奠定基础。 展开更多
关键词 地黄 aux IAA家族基因 序列特征 表达分析
原文传递
粗山羊草全基因组Aux/IAA基因家族的分离、染色体定位及序列分析 被引量:10
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作者 乔麟轶 李欣 +6 位作者 畅志坚 张晓军 詹海仙 郭慧娟 李建波 常建忠 郑军 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2059-2069,共11页
生长素是植物生长发育过程中的关键激素之一,Aux/IAA家族基因是重要的生长素原初响应基因。通过生物信息学方法从粗山羊草(Aegilops tauschii)全基因组中分离出28个Aux/IAA基因,其中20个粗山羊草Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域;28个Aux/... 生长素是植物生长发育过程中的关键激素之一,Aux/IAA家族基因是重要的生长素原初响应基因。通过生物信息学方法从粗山羊草(Aegilops tauschii)全基因组中分离出28个Aux/IAA基因,其中20个粗山羊草Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域;28个Aux/IAA基因分布于全部7对染色体上,5个基因分别具有位于同一位点的已知标记。粗山羊草IAA3、IAA11和IAA26的表达具有组织特异性,分别在雌蕊、种子和根中特异表达。系统发育显示,11对粗山羊草-乌拉尔图小麦Aux/IAA蛋白、5对粗山羊草-大麦Aux/IAA蛋白直系同源。共线性分析表明,粗山羊草Aux/IAA基因与短柄草、水稻中同源基因具有很好的共线性。本研究分离的相关基因不仅可用于小麦的遗传改良,也为深入研究小麦Aux/IAA基因提供了信息。 展开更多
关键词 粗山羊草 生长素 aux/IAA基因家族 染色体定位 生物信息学
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黄瓜果实发育早期Aux/IAA家族部分基因的差异表达分析 被引量:7
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作者 王垒 娄丽娜 +2 位作者 闫立英 娄群峰 陈劲枫 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期13-17,共5页
用生物信息学方法获得28个黄瓜Aux/IAA家族基因,选取具有Aux/IAA蛋白典型特征及与单性结实基因SIIAA9亲缘关系较近的6个基因(Csa020459、Csa006680、Csa003118、Csa016715、Csa018571和Csa012115),并以单性结实和非单性结实自交系6401和... 用生物信息学方法获得28个黄瓜Aux/IAA家族基因,选取具有Aux/IAA蛋白典型特征及与单性结实基因SIIAA9亲缘关系较近的6个基因(Csa020459、Csa006680、Csa003118、Csa016715、Csa018571和Csa012115),并以单性结实和非单性结实自交系6401和6429为试材,对这6个基因设计特异引物,在黄瓜果实的cDNA中进行测序验证,同时利用半定量RT-PCR技术在开花当天和花后第2和4天的6401、6429及授粉的6429果实中进行表达分析。结果显示:有5个基因可以检测到表达情况,其中Csa016715在未授粉的6429果实发育过程中表达丰度较低,而在6401和授粉的6429果实中高水平表达。 展开更多
关键词 黄瓜 单性结实 aux/IAA 表达分析 果实发育
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