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利用SAS中非线性混和效应模型分析城市中阿拉伯按蚊水体滋生环境的时空变异系数
1
作者
Benjamin G. JACOB
Daniel A. GRIFFITH
+2 位作者
Joseph M. MWANGANGI
Charles MBOGO
Robert J. NOVAK
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2010年第2期85-97,共13页
目前对于时间序列分析中出现的空间自相关现象,已经有很多的的文献详述了如何对这种现象进行识别与建模分析。但是,对于撒哈拉以南非洲地区疟疾的主要媒介-阿拉伯按蚊幼虫滋生地的地理空间相关性方面的研究还没研究报道。在空间回归...
目前对于时间序列分析中出现的空间自相关现象,已经有很多的的文献详述了如何对这种现象进行识别与建模分析。但是,对于撒哈拉以南非洲地区疟疾的主要媒介-阿拉伯按蚊幼虫滋生地的地理空间相关性方面的研究还没研究报道。在空间回归分析中,空间相关性主要通过空间滤波方法完成,该滤波方法通过分析时间序列中随机误差的分布特征。运用基于地理连接矩阵的非参数特征向量分解空间滤波方法,以寻求能鉴别阿拉伯按蚊幼虫滋生水生环境的预测因子。首先,选择肯尼亚的两个城市,Kisumu和Malindi,进行了蚊虫滋生水体的现场采样工作。然后获取快鸟(QuickBird)卫星数据;并利用该数据对冈比亚按蚊的滋生水体进行遥感影像分析。把这些水体的地理空间信息数据输入SAS/GIS模型中,进行单因素分析、相关分析、数据分布分析、以及全局空间自相关统计。然后,利用空间协方差参数生成局部空间自相关指数(如:Moran’s指数)。并由该模型生成了选择性特征向量的粗子集,此粗子集可以被用来研究这些样方变量间的空间互作效应。最后,利用贝叶斯系数估计法定义矩阵中各参数的期望先验参数值,得知水体环境的深度是决定该水体能否滋生阿拉伯按蚊的关键预测性因素,并且深度与其滋生可能性呈明显的正相关关系;由转移空间连接矩阵生成的特征向量的特殊子集可以获知由阿拉伯按蚊水生环境预测因子以及所建立的空间回归模型中空间误差的相关性。
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关键词
快鸟
阿拉伯按蚊
特征向量空间自相关
贝叶斯分析
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职称材料
我国多斑按蚊复合体mtDNA-COⅠ基因序列特征与系统发育学研究
被引量:
3
2
作者
武松
黄芳
+6 位作者
周水森
袁良
倪洋洋
王玉娇
张亮亮
倪兴
汤林华
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2013年第2期158-160,172,共4页
目的测序并比较多斑按蚊复合体5成员种(伪威氏按蚊、多斑按蚊、威氏按蚊、达罗毗按蚊及塞沃按蚊)mtD-NA-COⅠ基因序列差异,并探讨其系统进化关系。方法多斑按蚊复合体经形态学和ITS2分子鉴定种型后,PCR扩增多斑按蚊复合体mtDNA-COⅠ基...
目的测序并比较多斑按蚊复合体5成员种(伪威氏按蚊、多斑按蚊、威氏按蚊、达罗毗按蚊及塞沃按蚊)mtD-NA-COⅠ基因序列差异,并探讨其系统进化关系。方法多斑按蚊复合体经形态学和ITS2分子鉴定种型后,PCR扩增多斑按蚊复合体mtDNA-COⅠ基因序列,采用Chromas软件核对,必要时手动调整,采用Bioedit软件进行比对分析,采用Mega3.0软件构建系统进化树。结果 PCR扩增mtDNA-COⅠ基因序列全长约645~660bp,平均G+C含量为29.1%,A+T含量为70.9%。5种不同算法计算的5成员种成对种间距离有较小偏差,但种间遗传距离范围基本趋于一致,以塞沃按蚊、达罗毗按蚊及多斑按蚊亲缘关系最近,其后依次为威氏按蚊和伪威氏按蚊。结论根据mtDNA-COⅠ基因序列,采用不同方法构建的多斑按蚊复合体系统进化树结果基本一致,该基因序列适用于多斑按蚊复合体分析系统学分析。
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关键词
多斑按蚊复合体
mtDNA-COⅠ
系统发育关系
原文传递
微小按蚊不同发育期蛋白质和同工酶的研究
3
作者
俞渊
朱昌亮
+2 位作者
彭小妹
何菊菊
叶炳辉
《南京医学院学报》
CSCD
1991年第4期272-273,281,共3页
用聚丙烯酰胺凝胶等电点聚焦电泳法,比较研究了微小按蚊(广义)卵、二龄和四龄幼虫、蛹及雌性成虫蛋白质和酯酶同工酶电泳图谱。微小按蚊(广义)不同发育期蛋白质等电点pH值,卵、幼虫、蛹和成虫显带区在pH4.1~9.5,其中在酸性区显带最多,...
用聚丙烯酰胺凝胶等电点聚焦电泳法,比较研究了微小按蚊(广义)卵、二龄和四龄幼虫、蛹及雌性成虫蛋白质和酯酶同工酶电泳图谱。微小按蚊(广义)不同发育期蛋白质等电点pH值,卵、幼虫、蛹和成虫显带区在pH4.1~9.5,其中在酸性区显带最多,碱性次之;酯酶同工酶等电点pH值显带区在pH4.2~7.8,其中酸性区显带最多,中性次之。并对微小按蚊复合体作了讨论。
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关键词
微小按蚊
发育期
蛋白
同功酶
原文传递
题名
利用SAS中非线性混和效应模型分析城市中阿拉伯按蚊水体滋生环境的时空变异系数
1
作者
Benjamin G. JACOB
Daniel A. GRIFFITH
Joseph M. MWANGANGI
Charles MBOGO
Robert J. NOVAK
机构
School of Medicine
Political and Policy Sciences
Kenya Medical Research Institute ( KEMRI)
出处
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2010年第2期85-97,共13页
文摘
目前对于时间序列分析中出现的空间自相关现象,已经有很多的的文献详述了如何对这种现象进行识别与建模分析。但是,对于撒哈拉以南非洲地区疟疾的主要媒介-阿拉伯按蚊幼虫滋生地的地理空间相关性方面的研究还没研究报道。在空间回归分析中,空间相关性主要通过空间滤波方法完成,该滤波方法通过分析时间序列中随机误差的分布特征。运用基于地理连接矩阵的非参数特征向量分解空间滤波方法,以寻求能鉴别阿拉伯按蚊幼虫滋生水生环境的预测因子。首先,选择肯尼亚的两个城市,Kisumu和Malindi,进行了蚊虫滋生水体的现场采样工作。然后获取快鸟(QuickBird)卫星数据;并利用该数据对冈比亚按蚊的滋生水体进行遥感影像分析。把这些水体的地理空间信息数据输入SAS/GIS模型中,进行单因素分析、相关分析、数据分布分析、以及全局空间自相关统计。然后,利用空间协方差参数生成局部空间自相关指数(如:Moran’s指数)。并由该模型生成了选择性特征向量的粗子集,此粗子集可以被用来研究这些样方变量间的空间互作效应。最后,利用贝叶斯系数估计法定义矩阵中各参数的期望先验参数值,得知水体环境的深度是决定该水体能否滋生阿拉伯按蚊的关键预测性因素,并且深度与其滋生可能性呈明显的正相关关系;由转移空间连接矩阵生成的特征向量的特殊子集可以获知由阿拉伯按蚊水生环境预测因子以及所建立的空间回归模型中空间误差的相关性。
关键词
快鸟
阿拉伯按蚊
特征向量空间自相关
贝叶斯分析
Keywords
QuickBird
anopheles
gambiae
s
. 1.
Eigenvector
s
s
patial autocorrelation
Baye
s
ian
分类号
O211.61 [理学—概率论与数理统计]
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职称材料
题名
我国多斑按蚊复合体mtDNA-COⅠ基因序列特征与系统发育学研究
被引量:
3
2
作者
武松
黄芳
周水森
袁良
倪洋洋
王玉娇
张亮亮
倪兴
汤林华
机构
安徽中医学院中西医结合临床学院
中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2013年第2期158-160,172,共4页
基金
安徽省自然科学基金项目(No.10040606Q38)
卫生行业科研专项(No.200802021)
+1 种基金
第五轮中国全球基金疟疾项目实施性研究专项基金(No.GF/M5/2010-04)
安徽省优秀青年教师基金项目(No.2009SQRZ119)
文摘
目的测序并比较多斑按蚊复合体5成员种(伪威氏按蚊、多斑按蚊、威氏按蚊、达罗毗按蚊及塞沃按蚊)mtD-NA-COⅠ基因序列差异,并探讨其系统进化关系。方法多斑按蚊复合体经形态学和ITS2分子鉴定种型后,PCR扩增多斑按蚊复合体mtDNA-COⅠ基因序列,采用Chromas软件核对,必要时手动调整,采用Bioedit软件进行比对分析,采用Mega3.0软件构建系统进化树。结果 PCR扩增mtDNA-COⅠ基因序列全长约645~660bp,平均G+C含量为29.1%,A+T含量为70.9%。5种不同算法计算的5成员种成对种间距离有较小偏差,但种间遗传距离范围基本趋于一致,以塞沃按蚊、达罗毗按蚊及多斑按蚊亲缘关系最近,其后依次为威氏按蚊和伪威氏按蚊。结论根据mtDNA-COⅠ基因序列,采用不同方法构建的多斑按蚊复合体系统进化树结果基本一致,该基因序列适用于多斑按蚊复合体分析系统学分析。
关键词
多斑按蚊复合体
mtDNA-COⅠ
系统发育关系
Keywords
anopheles maculates s. 1.
mtDNA-CO Ⅰ
phylogenetic evolution
分类号
R384.1 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
微小按蚊不同发育期蛋白质和同工酶的研究
3
作者
俞渊
朱昌亮
彭小妹
何菊菊
叶炳辉
机构
中国预防医学科学院寄生虫病研究所世界卫生组织疟疾
南京医学院寄生虫学教研室
出处
《南京医学院学报》
CSCD
1991年第4期272-273,281,共3页
文摘
用聚丙烯酰胺凝胶等电点聚焦电泳法,比较研究了微小按蚊(广义)卵、二龄和四龄幼虫、蛹及雌性成虫蛋白质和酯酶同工酶电泳图谱。微小按蚊(广义)不同发育期蛋白质等电点pH值,卵、幼虫、蛹和成虫显带区在pH4.1~9.5,其中在酸性区显带最多,碱性次之;酯酶同工酶等电点pH值显带区在pH4.2~7.8,其中酸性区显带最多,中性次之。并对微小按蚊复合体作了讨论。
关键词
微小按蚊
发育期
蛋白
同功酶
Keywords
anopheles
(Cellia) minimu
s
s
. 1.
protein
s
e
s
tera
s
e
s
i
s
oenzyme
s
Iectrophore
s
i
s
, polyacrylamide gel
分类号
R384.1 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用SAS中非线性混和效应模型分析城市中阿拉伯按蚊水体滋生环境的时空变异系数
Benjamin G. JACOB
Daniel A. GRIFFITH
Joseph M. MWANGANGI
Charles MBOGO
Robert J. NOVAK
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2010
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
我国多斑按蚊复合体mtDNA-COⅠ基因序列特征与系统发育学研究
武松
黄芳
周水森
袁良
倪洋洋
王玉娇
张亮亮
倪兴
汤林华
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2013
3
原文传递
3
微小按蚊不同发育期蛋白质和同工酶的研究
俞渊
朱昌亮
彭小妹
何菊菊
叶炳辉
《南京医学院学报》
CSCD
1991
0
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