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大豆GmAux/IAA16调控根系响应低磷胁迫的功能
1
作者 陆云艳 张雅琼 +6 位作者 温宪勤 荀岚 王亮 董蓉娇 董文汉 陈军文 梁泉 《分子植物育种》 北大核心 2025年第17期5633-5643,共11页
Aux/IAA16参与多种植物对生物胁迫和非生物胁迫响应的调控,但它是否参与大豆低磷胁迫响应尚有待于深入研究。本研究从大豆[Glycine max(L.)Merr.]根部克隆GmAux/IAA16基因的全长CDS序列,其开放阅读框为954 bp,编码317个氨基酸,蛋白质分... Aux/IAA16参与多种植物对生物胁迫和非生物胁迫响应的调控,但它是否参与大豆低磷胁迫响应尚有待于深入研究。本研究从大豆[Glycine max(L.)Merr.]根部克隆GmAux/IAA16基因的全长CDS序列,其开放阅读框为954 bp,编码317个氨基酸,蛋白质分子量为34.6 kD,理论等电点为9.18。序列比对和系统进化分析表明,大豆GmAux/IAA16与木豆CcAux/IAA16蛋白在系统发育上具有相似性,亚细胞定位结果显示该蛋白定位于细胞核。低磷胁迫条件下,过表达GmAux/IAA16基因的烟草植株通过促进根系生长、优化营养吸收,从而保证了自身生长需求,显著增强植物对磷胁迫的适应能力。与野生型(WT)相比,过表达GmAux/IAA16烟草在低磷条件下培养15 d,根系总长度、根系总表面积、根体积、侧根数量分别增加0.39%、13.42%和23.53%,差异达到显著或极显著水平;叶片氮含量提高2.86%、根系氮含量提高9.15%,叶片磷含量提高8.24%、根系磷含量提高5.04%,差异达到显著水平;植株株高、茎粗、总干重和根冠比分别比正常磷水平提高了21.43%、11.71%、7.81%和27.78%,差异达到显著或极显著水平。此外,低磷胁迫下转基因植株中ACP(酸性磷酸酶)、POD(过氧化物酶)、IAAO(吲哚乙酸氧化酶)、RNase(核糖核酸酶)等酶活性显著增加,揭示GmAux/IAA16可能通过调节这些酶的活性来增强大豆对低磷胁迫条件的适应性。本研究结果为Aux/IAA16基因在大豆分子育种及提高作物磷效率中的应用提供了科学依据。 展开更多
关键词 大豆 aux/IAA16 低磷胁迫 根系形态 氮磷吸收
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西瓜AUX/LAX基因的鉴定及在芽再生过程中的表达分析
2
作者 王铎 许昕阳 +3 位作者 沈佳 寿伟松 何艳军 轩正英 《山东农业科学》 北大核心 2025年第3期1-9,共9页
生长素是最重要的植物激素之一,生长素内流载体AUX/LAX(AUXIN RESISTENT1/LIKE AUX1)与多膜跨越蛋白和氨基酸转运蛋白有关,参与生长素的主动运输过程。AUX/LAX基因已在多个物种中被鉴定,被发现在植物多个生长发育过程中发挥非常重要的作... 生长素是最重要的植物激素之一,生长素内流载体AUX/LAX(AUXIN RESISTENT1/LIKE AUX1)与多膜跨越蛋白和氨基酸转运蛋白有关,参与生长素的主动运输过程。AUX/LAX基因已在多个物种中被鉴定,被发现在植物多个生长发育过程中发挥非常重要的作用,但在西瓜中还没有相关报道。本研究在全基因组水平对西瓜AUX/LAX基因进行鉴定,并对其结构、系统发育、启动子顺式调控元件等进行了分析。结果表明,从西瓜全基因组中鉴定到5个AUX/LAX基因,都含有保守的Aa_trans结构域;对西瓜与拟南芥、水稻、黄瓜的21个AUX/LAX蛋白进行系统进化分析,它们被聚为两个亚族,而绝大多数西瓜与黄瓜的AUX/LAX蛋白存在一对一同源关系;从西瓜AUX/LAX基因启动子上鉴定到脱落酸、茉莉酸甲酯、水杨酸响应元件(TCAelement),以及赤霉素等激素和厌氧诱导、低温、干旱等防御和非生物胁迫响应元件。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析发现,除了ClAUX/LAX4,其他ClAUX/LAXs均在雄花中的表达水平最低,具有显著的组织特异性;而且西瓜AUX/LAXs基因在分化能力不同的西瓜材料中的表达各不相同,其中ClAUX/LAX5在分化5 d的高再生材料中的表达水平显著高于低再生材料,暗示其可能在西瓜芽再生过程中发挥重要作用。本研究结果可为进一步研究生长素在西瓜芽再生过程中的作用提供证据,并为挖掘西瓜芽再生调控基因奠定基础。 展开更多
关键词 生长素转运载体 aux/LAX基因 西瓜 芽再生过程 基因表达
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花椒Aux/IAA基因家族鉴定及表达分析
3
作者 吴梦佳 陈磊 +1 位作者 李博通 刘永红 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第4期117-126,共10页
Aux/IAA基因家族在植物生长素信号传导途径和植物发育中起着至关重要的调节作用。本研究从花椒(Zanthoxylum bungeanum)基因组中鉴定出51个Aux/IAA基因。系统发育树、保守基序和基因结构分析显示,花椒Aux/IAA基因被划分为7个亚家族,同... Aux/IAA基因家族在植物生长素信号传导途径和植物发育中起着至关重要的调节作用。本研究从花椒(Zanthoxylum bungeanum)基因组中鉴定出51个Aux/IAA基因。系统发育树、保守基序和基因结构分析显示,花椒Aux/IAA基因被划分为7个亚家族,同一个亚家族有着相似的基因结构,34个(67%)基因具有串联重复和片段复制。花椒Aux/IAA基因的启动子序列中包含大量与植物激素和生长发育相关的顺式作用元件。不同时期花椒刺中ZbIAA基因的表达图谱显示,ZbIAA1、ZbIAA5、ZbIAA25、ZbIAA30和ZbIAA44基因在花椒刺中的表达水平显著高于其他基因,可能在花椒刺发育过程中起重要作用。密码子偏好性分析表明,花椒Aux/IAA基因家族密码子偏好以A/T碱基结尾,ZbIAA基因中有25个密码子具有偏好性,有2个密码子没有偏好性。研究结果为深入解析花椒Aux/IAA基因家族的功能奠定了理论基础。 展开更多
关键词 花椒 aux/IAA基因家族 刺发育 密码子偏好性
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木薯MeAux/IAA19基因的克隆及功能初探 被引量：1
4
作者 刘小丽 韦运谢 《热带生物学报》 2025年第3期363-369,共7页
为了探究Aux/IAA基因的初步功能,本研究克隆并鉴定了木薯(Manihot esculenta)MeIAA19基因,通过生物信息学分析发现,该基因编码244个氨基酸,具有典型Aux/IAA蛋白的PB1保守结构域。通过构建MeIAA19-pET32a原核表达载体,诱导表达出该蛋白,... 为了探究Aux/IAA基因的初步功能,本研究克隆并鉴定了木薯(Manihot esculenta)MeIAA19基因,通过生物信息学分析发现,该基因编码244个氨基酸,具有典型Aux/IAA蛋白的PB1保守结构域。通过构建MeIAA19-pET32a原核表达载体,诱导表达出该蛋白,并通过外源施加蛋白促进木薯植株活性氧爆发和MePRs基因表达量。基因表达分析表明,MeIAA19基因的表达量在Xam侵染过程中随时间的延长而增加。本研究结果显示,木薯MeIAA19基因可能参与了木薯免疫。 展开更多
关键词 木薯 aux/IAA蛋白 原核表达 表达分析 功能分析
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白梨Aux/IAA基因家族的鉴定与生物信息学分析
5
作者 王菲 纪丕钰 +4 位作者 黄玉玉 周燕 张敏 李鼎立 吴礽超 《分子植物育种》 北大核心 2025年第21期7294-7302,共9页
生长素Aux/IAA是最早发现的一种植物激素,直接或间接调控植物生长发育。本研究分析了白梨全基因组数据,筛选鉴定出白梨Aux/IAA家族基因17个。生物信息学分析显示,白梨Aux/IAA家族基因长度差异较大,非均匀分布在9条染色体上;基因定位于... 生长素Aux/IAA是最早发现的一种植物激素,直接或间接调控植物生长发育。本研究分析了白梨全基因组数据,筛选鉴定出白梨Aux/IAA家族基因17个。生物信息学分析显示,白梨Aux/IAA家族基因长度差异较大,非均匀分布在9条染色体上;基因定位于细胞核,其编码的蛋白质包含189~373氨基酸,酸碱性差异较大,为不稳定蛋白、亲水性蛋白;家族基因具有IAA典型保守结构域,且多数基因三级结构相似。Aux/IAA家族基因亲缘关系分析显示,白梨Aux/IAA家族基因可以分为6个类群,与苹果Aux/IAA基因亲缘关系最近。本研究为生长素Aux/IAA在梨属植物中的系统研究提供了基础。 展开更多
关键词 白梨 aux/IAA基因家族 生物信息学分析
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Aux/IAA家族基因GhAux1沉默促进棉花幼苗的生长 被引量：1
6
作者 王丽 王俐锋 +3 位作者 赵盼盼 李用芳 王太霞 李景原 《河南农业科学》 北大核心 2019年第6期46-51,80,共7页
为明确Aux/IAA家族基因GhAux1在棉花幼苗生长发育中的功能,利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术构建了重组表达载体pTRV-GhAux1,转化农杆菌并注射到棉花幼苗子叶,采用qRT-PCR检测GhAux1沉默效率,并对GhAux1沉默植株的表型、内源生长素(IAA... 为明确Aux/IAA家族基因GhAux1在棉花幼苗生长发育中的功能,利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术构建了重组表达载体pTRV-GhAux1,转化农杆菌并注射到棉花幼苗子叶,采用qRT-PCR检测GhAux1沉默效率,并对GhAux1沉默植株的表型、内源生长素(IAA)含量和赤霉素(GA4)含量以及GA合成关键酶基因的表达进行了分析。结果表明,成功建立了VIGS体系,注射含pTRV-GhAux1的菌液后15d,GhAux1在沉默植株中的表达量仅为空载体对照的26%;注射含pTRV-GhAux1的菌液后24、27、30d,GhAux1沉默植株的株高较空载体对照分别显著增加了18%、27%、20%,其中注射后27d达到极显著水平;注射含pTRV-GhAux1的菌液后21、24、27d,GhAux1沉默植株的节间内源GA4含量比空载体对照分别增加了33%、20%、33%,且GA合成关键酶基因GhGA20ox1、GhGA20ox2和GhGA3ox1的表达量均显著或极显著增加,而IAA含量仅在注射后27d显著增加。表明GhAux1参与IAA与GA的互作,可调控GA合成途径下游基因的表达,抑制棉花幼苗的生长。 展开更多
关键词 棉花 病毒诱导的基因沉默 aux/IAA Ghaux1 赤霉素
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高粱全基因组生长素原初响应基因Aux/IAA的序列特征分析 被引量：20
7
作者 王益军 吕燕萍 +2 位作者 谢秦 邓德祥 卞云龙 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期688-694,共7页
生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用。Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一。采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25... 生长素在生物体的生长、发育与分化过程中发挥着重要作用。Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的三大基因家族之一。采用生物信息学的方法,对高粱全基因组Aux/IAA基因进行序列特征分析表明,高粱基因组中共有25个Aux/IAA基因,分布于高粱9对染色体,在高粱第6号染色体上未发现Aux/IAA基因。序列比对与系统发生分析表明,22个(88%)高粱Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域,19对高粱/玉米Aux/IAA蛋白、2对高粱/水稻Aux/IAA蛋白处于系统进化树的同一分支。该研究结果不仅有助于生长素信号转导通路的解析,而且可以为其他作物基因家族的研究提供参考。 展开更多
关键词 高粱 生长素 aux/IAA基因家族 比较基因组学
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地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1的克隆和表达分析 被引量：9
8
作者 王丰青 田云鹤 +5 位作者 李明杰 杨金凤 张宝 林文雄 陈新建 张重义 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第23期4033-4039,共7页
为了克隆地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1,分析地黄RgIAA1的时空表达特性及对逆境胁迫的响应。以拟南芥AtIAA14的cDNA序列为探针在地黄转录组数据库中进行比对,应用生物信息学方法分析RgIAA1的序列特征及进化关系,以实时荧光定量PCR技术检测R... 为了克隆地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1,分析地黄RgIAA1的时空表达特性及对逆境胁迫的响应。以拟南芥AtIAA14的cDNA序列为探针在地黄转录组数据库中进行比对,应用生物信息学方法分析RgIAA1的序列特征及进化关系,以实时荧光定量PCR技术检测RgIAA1在地黄不同组织以及逆境胁迫下的表达量。结果表明,获得1条903 bp的cDNA序列,包含一个681 bp完整的开放阅读框(ORF),编码226个氨基酸,具有Aux/IAA家族蛋白的典型结构域和特征序列。RgIAA1在地黄不同组织中的表达呈差异表达,其中在地黄幼嫩叶片里表达强度最大,其次为茎,且随着叶片的伸展,RgIAA1表达强度不断降低。在连作时RgIAA1的表达量升高,NaCl和渍水胁迫下RgIAA1的表达量降低。实验首次克隆了地黄Aux/IAA家族基因RgIAA1,为阐明其在地黄生长发育和逆境胁迫中的分子功能奠定基础。 展开更多
关键词 地黄 aux IAA家族基因 序列特征 表达分析
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粗山羊草全基因组Aux/IAA基因家族的分离、染色体定位及序列分析 被引量：10
9
作者 乔麟轶 李欣 +6 位作者 畅志坚 张晓军 詹海仙 郭慧娟 李建波 常建忠 郑军 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2059-2069,共11页
生长素是植物生长发育过程中的关键激素之一,Aux/IAA家族基因是重要的生长素原初响应基因。通过生物信息学方法从粗山羊草(Aegilops tauschii)全基因组中分离出28个Aux/IAA基因,其中20个粗山羊草Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域;28个Aux/... 生长素是植物生长发育过程中的关键激素之一,Aux/IAA家族基因是重要的生长素原初响应基因。通过生物信息学方法从粗山羊草(Aegilops tauschii)全基因组中分离出28个Aux/IAA基因,其中20个粗山羊草Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域;28个Aux/IAA基因分布于全部7对染色体上,5个基因分别具有位于同一位点的已知标记。粗山羊草IAA3、IAA11和IAA26的表达具有组织特异性,分别在雌蕊、种子和根中特异表达。系统发育显示,11对粗山羊草-乌拉尔图小麦Aux/IAA蛋白、5对粗山羊草-大麦Aux/IAA蛋白直系同源。共线性分析表明,粗山羊草Aux/IAA基因与短柄草、水稻中同源基因具有很好的共线性。本研究分离的相关基因不仅可用于小麦的遗传改良,也为深入研究小麦Aux/IAA基因提供了信息。 展开更多
关键词 粗山羊草 生长素 aux/IAA基因家族 染色体定位 生物信息学
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黄瓜果实发育早期Aux/IAA家族部分基因的差异表达分析 被引量：7
10
作者 王垒 娄丽娜 +2 位作者 闫立英 娄群峰 陈劲枫 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期13-17,共5页
用生物信息学方法获得28个黄瓜Aux/IAA家族基因,选取具有Aux/IAA蛋白典型特征及与单性结实基因SIIAA9亲缘关系较近的6个基因(Csa020459、Csa006680、Csa003118、Csa016715、Csa018571和Csa012115),并以单性结实和非单性结实自交系6401和... 用生物信息学方法获得28个黄瓜Aux/IAA家族基因,选取具有Aux/IAA蛋白典型特征及与单性结实基因SIIAA9亲缘关系较近的6个基因(Csa020459、Csa006680、Csa003118、Csa016715、Csa018571和Csa012115),并以单性结实和非单性结实自交系6401和6429为试材,对这6个基因设计特异引物,在黄瓜果实的cDNA中进行测序验证,同时利用半定量RT-PCR技术在开花当天和花后第2和4天的6401、6429及授粉的6429果实中进行表达分析。结果显示:有5个基因可以检测到表达情况,其中Csa016715在未授粉的6429果实发育过程中表达丰度较低,而在6401和授粉的6429果实中高水平表达。 展开更多
关键词 黄瓜 单性结实 aux/IAA 表达分析 果实发育
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黄瓜果实中ARF和Aux/IAA基因对外源激素的应答 被引量：5
11
作者 王垒 陈劲枫 +2 位作者 娄丽娜 娄群峰 贾利 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1127-1131,共5页
以非单性结实黄瓜自交系‘6429’为试验材料,对当天开花的果实进行CPPU、Spd、NAA、2,4-D和IAA等5种生长物质处理,以清水为对照,选取9个ARF基因(Csa019264、Csa019265、Csa009209、Csa009210、Csa021954、Csa012237、Csa012805、Csa015... 以非单性结实黄瓜自交系‘6429’为试验材料,对当天开花的果实进行CPPU、Spd、NAA、2,4-D和IAA等5种生长物质处理,以清水为对照,选取9个ARF基因(Csa019264、Csa019265、Csa009209、Csa009210、Csa021954、Csa012237、Csa012805、Csa015176、Csa010564)和5个Aux/IAA基因(Csa003118、Csa012115、Csa016715、Csa006680、Csa018571)设计特异引物,取开花当天与花后第2、4天的果实及其茎、叶作RT-PCR分析。结果显示,9个ARF基因的表达水平显示出了很大的差异,Csa012805在所有激素处理后的果实中都有较高水平的表达而清水处理中未检测到;5个Aux/IAA基因中的4个在6种处理后的果实及茎叶中都有表达,推测是组成型表达基因,Csa016715在激素处理后的果实中比清水处理的未发育果实中的表达水平高。推测Csa012805和Csa016715这2个基因对黄瓜果实膨大起促进作用。 展开更多
关键词 单性结实 ARF aux/IAA 表达 果实发育
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芸薹属大白菜Aux/IAA基因家族的生物信息学分析 被引量：9
12
作者 郑小敏 赵敬会 +2 位作者 李荣冲 王瑞雪 张涛 《北方园艺》 CAS 北大核心 2012年第14期109-113,共5页
Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的3类基因家族之一。现主要从基因组水平研究白菜Aux/IAA基因的分布及特征。结果表明:从BRAD共检测到59条白菜Aux/IAA基因,不均等分布在白菜的全部10条染色体上。通过多重... Aux/IAA基因家族在生长素诱导的早期做出响应,是生长素早期应答的3类基因家族之一。现主要从基因组水平研究白菜Aux/IAA基因的分布及特征。结果表明:从BRAD共检测到59条白菜Aux/IAA基因,不均等分布在白菜的全部10条染色体上。通过多重比对和基序探测结果显示,40条白菜Aux/IAA基因具有4个保守基序,其它基因的保守基序则有不同程度的分化。系统进化分析表明,Aux/IAA基因家族可分为7个亚家族。通过表达模式预测发现,白菜Aux/IAA基因家族表达模式也有较大差异。 展开更多
关键词 芸薹属大白菜 生长素 aux/IAA基因家族 生物信息学分析
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香蕉Aux/IAA基因家族密码子偏好性分析 被引量：5
13
作者 孙雪丽 郝向阳 +7 位作者 李蓉 项蕾蕾 彭丽云 刘范 田娜 程春振 赖钟雄 王天池 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期2467-2475,共9页
通过对香蕉Aux/IAA (auxin/indole-3-acetic acid)基因家族密码子使用偏好性进行研究为进一步的功能研究尤其是异源表达验证提供参考。本研究采用CodonW、EMBOSS在线程序、SPSS和Origin软件分析了香蕉Aux/IAA基因家族的密码子使用偏好... 通过对香蕉Aux/IAA (auxin/indole-3-acetic acid)基因家族密码子使用偏好性进行研究为进一步的功能研究尤其是异源表达验证提供参考。本研究采用CodonW、EMBOSS在线程序、SPSS和Origin软件分析了香蕉Aux/IAA基因家族的密码子使用偏好性参数,并和香蕉基因组以及几种遗传转化再生体系成熟的模式植物基因组做了比较。结果表明:家族基因密码子偏好性较弱,偏好使用G或C,且以G或C结尾,与单子叶植物密码子偏好特性较为一致,UUG、GCA、GAC、GGA是该家族的最优密码子,具有偏好性的密码子和最优密码子与香蕉基因组差异较大。香蕉Aux/IAA基因家族密码子偏好性主要受突变压力影响。在密码子改造和优化的基础上,大肠杆菌原核表达系统适合作为该家族成员的异源表达系统,烟草可作为该家族基因遗传转化的受体。本研究结果有助于开展香蕉Aux/IAA基因家族的功能研究。 展开更多
关键词 香蕉 aux/IAA基因家族 密码子偏好性 基因功能研究
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三月李及其红肉突变体Aux/IAA家族基因鉴定及分析 被引量：4
14
作者 方智振 姜翠翠 +2 位作者 周丹蓉 潘少霖 叶新福 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期247-255,共9页
为了解Aux/IAA家族基因在李果实成熟过程中的生物学功能,通过生物信息学鉴定三月李及其红肉突变体果实转录组中的Aux/IAA家族基因,并分析其在果实成熟过程中的表达模式。结果表明,三月李及其红肉突变体果实转录组中共有26个Aux/IAA家族... 为了解Aux/IAA家族基因在李果实成熟过程中的生物学功能,通过生物信息学鉴定三月李及其红肉突变体果实转录组中的Aux/IAA家族基因,并分析其在果实成熟过程中的表达模式。结果表明,三月李及其红肉突变体果实转录组中共有26个Aux/IAA家族成员,大部分为位于细胞核的不稳定亲水蛋白质。系统进化树分析表明,Aux/IAA家族成员可分为A、B两组,共9个亚组。大部分Aux/IAA蛋白质含有4个高度保守的结构域。16个Aux/IAA家族基因在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中差异表达。PsIAA11、PsIAA13、PsIAA14、PsIAA18、PsIAA19和PsIAA25在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中的表达模式存在显著差异。上述结果表明,Aux/IAA家族基因与李果实成熟密切相关,这为深入研究Aux/IAA家族基因在李果实成熟过程中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 李 转录组 aux/IAA家族 生物信息学分析 表达分析
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应用rDNA ITS区测序评估API20C AUX及CHROMagar对酵母菌的鉴定 被引量：3
15
作者 陈中举 孙自镛 +6 位作者 李丽 朱旭慧 张蓓 田磊 简翠 汪玥 闫少珍 《现代检验医学杂志》 CAS 2013年第5期68-71,共4页
目的 使用真菌内转录间隔区（ITS ）测序分析鉴定酵母菌的方法评估API 20C AUX和CHROMagar两种鉴定方法,为临床实验室选择快速、准确鉴定酵母菌的方法提供依据.方法 收集同济医院2010～2012年临床分离的172株酵母菌,以ITS区测序分析鉴... 目的 使用真菌内转录间隔区（ITS ）测序分析鉴定酵母菌的方法评估API 20C AUX和CHROMagar两种鉴定方法,为临床实验室选择快速、准确鉴定酵母菌的方法提供依据.方法 收集同济医院2010～2012年临床分离的172株酵母菌,以ITS区测序分析鉴定方法为标准,对API 20C AUX及CHROMagar 24 h,48 h显色鉴定方法进行评估,计算其鉴定符合率.结果 与测序分析比较,API20C AUX鉴定对白色念珠菌、热带念珠菌、光滑念珠菌、克柔念珠菌的鉴定符合率均为100%,对新型隐球菌及近平滑念珠菌的鉴定符合率分别为95%和97.6%;CHROMagar对白色念珠菌和克柔念珠菌24 h和48 h鉴定符合率均为100%,对热带念珠菌24 h和48 h鉴定符合率分别为85.3%和94.1%,对光滑念珠菌24 h和48 h鉴定符合率分别为70%和83.3%,对新型隐球菌和近平滑念珠菌不能进行鉴定.结论 API 20C AUX鉴定系统可以作为临床实验室常规鉴定的手段,对于CHROMagar鉴定培养基只能用于实验室对酵母菌的初步筛查,对白色念珠菌、克柔念珠菌、光滑念珠菌和热带念珠菌的鉴定效果较好,对其他念珠菌及隐球菌的鉴定还需其他方法进行补充. 展开更多
关键词 酵母菌 内转录间隔区 API 20C aux CHROMAGAR
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以分子生物学鉴定结果为“金标准”评估Rapid ID Yeast Plus及API20C AUX对酵母样真菌的鉴定效能 被引量：4
16
作者 范欣 王贺 +8 位作者 苏霄翔 肖盟 马雪菲 马超越 刘旭光 马然 吴玥 陈艳钊 徐英春 《中国真菌学杂志》 CSCD 2013年第5期274-280,共7页
目的以分子生物学方法为"金标准"对两种商品化酵母样真菌鉴定产品Rapid ID Yeast Plus(简称RapID YST)及API20C AUX(简称API20C)的鉴定效能进行评估。方法从2010年中国医院侵袭性真菌感染监测网菌株库中筛选酵母样真菌25种,共... 目的以分子生物学方法为"金标准"对两种商品化酵母样真菌鉴定产品Rapid ID Yeast Plus(简称RapID YST)及API20C AUX(简称API20C)的鉴定效能进行评估。方法从2010年中国医院侵袭性真菌感染监测网菌株库中筛选酵母样真菌25种,共计194株。其中,包含临床最常见的5种酵母样真菌(白念珠菌、热带念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌、新生隐球菌)共130株,占研究总菌株数的67.0%。所有菌株已经过分子生物学方法准确鉴定至种水平。菌株复苏分纯后,严格按照产品操作指南,平行进行RapID YST和API20C鉴定。结果所研究菌株中,有181株(18种)在RapID YST鉴定菌种数据库中,所有在库菌株种及复合体鉴定正确率为87.8%(159/181)。相比,API鉴定菌种库包含菌株174株(18种),在库菌株种及复合体鉴定正确率为92.0%(160/174)。RapID YST与API20C对于5种临床常见的酵母样真菌的种鉴定正确率分别为93.1%和97.1%。对于库外菌株,RapID YST的鉴定错误率分别为23.1%(3/13),相比API20C的鉴定错误率为60.0%(12/20)。综合此次评估结果,二者对酵母样真菌的鉴定效能无显著差异(McNemar检验,P>0.05)。结论两种商品化产品对酵母样真菌的鉴定效能基本一致;相较而言,RapID YST在操作便捷性、检测时间方面具有较大优势。 展开更多
关键词 侵袭性真菌病 酵母样真菌 RAPID ID YEAST PLUS API20C aux 分子生物学鉴定
暂未订购
马尾松Aux/IAA家族相关基因克隆及初步分析 被引量：6
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作者 苏江 郭天玮 季孔庶 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1822-1830,共9页
生长素信号转导途径在植物生长发育过程中起到至关重要的作用,Aux/IAA(auxin/indoleacetic acids)家族基因可以直接和生长素相连而发生作用。研究马尾松Aux/IAA家族相关基因,可为马尾松体内生长素信号转导途径提供理论支持。本研究克隆... 生长素信号转导途径在植物生长发育过程中起到至关重要的作用,Aux/IAA(auxin/indoleacetic acids)家族基因可以直接和生长素相连而发生作用。研究马尾松Aux/IAA家族相关基因,可为马尾松体内生长素信号转导途径提供理论支持。本研究克隆出3个Aux/IAA家族基因,分别命名为Pm IAA1、Pm IAA2和Pm IAA3。Pm IAA1基因,c DNA全长1 330 bp,包含711 bp完整的ORF,能够编码含有236个氨基酸的蛋白质,此蛋白相对分子质量为26 015.6 u,等电点为7.01;Pm IAA2基因,c DNA全长1 628 bp,包含909 bp完整的ORF,能够编码含有302个氨基酸的蛋白质,此蛋白相对分子质量为41 176.1 u,等电点为5.25;Pm IAA3基因,c DNA全长1 316 bp,包含759 bp完整的ORF,能够编码含有252个氨基酸的蛋白质,此蛋白相对分子质量为28 060.1 u,等电点为6.01。Pm IAA1蛋白与火距松IAA1蛋白同源性高达95%,Pm IAA2蛋白与火距松IAA2蛋白同源性高达97%,Pm IAA3蛋白与火距松IAA3蛋白同源性高达98%。Pm IAA1、Pm IAA2、Pm IAA3蛋白都含有Aux/IAA结构域,此结构域可以与ARFs(auxin response factors)结合而发生作用,这符合Aux/IAA家族的特点。利用实时定量技术得知,Pm IAA1、Pm IAA2和Pm IAA3在马尾松嫩根、嫩芽、嫩叶中都有表达。Pm IAA1在嫩叶中表达量最高、嫩根中次之、嫩茎中最低;Pm IAA2和Pm IAA3在嫩根中表达最高、嫩叶和嫩茎中次之。本研究可为生长素调控马尾松生长发育相关机理提供依据。 展开更多
关键词 马尾松 生长素 aux/IAA 序列分析 结构预测
原文传递
黄瓜Aux/IAA基因家族的生物信息学分析 被引量：12
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作者 王垒 陈劲枫 贾利 《中国瓜菜》 CAS 2010年第6期1-4,共4页
Aux/IAA基因家族是一个典型的被生长素诱导而表达的基因家族,可以被生长素快速诱导表达。采用生物信息学方法在黄瓜基因组中确定了28个Aux/IAA基因,除4号染色体外,其他6条染色体均有分布,编码蛋白序列在70~427个氨基酸残基之间,22个黄瓜... Aux/IAA基因家族是一个典型的被生长素诱导而表达的基因家族,可以被生长素快速诱导表达。采用生物信息学方法在黄瓜基因组中确定了28个Aux/IAA基因,除4号染色体外,其他6条染色体均有分布,编码蛋白序列在70~427个氨基酸残基之间,22个黄瓜Aux/IAA蛋白具有完整的4个保守结构域,进化方式多样化。该研究结果有助于黄瓜生长素信号转导途径的解析。 展开更多
关键词 黄瓜 生长素 aux/IAA
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植物AUX/IAA基因家族研究进展 被引量：16
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作者 李俊男 燕晓杰 +1 位作者 李枢航 张荣沭 《中国农学通报》 2018年第15期89-92,共4页
AUX/IAA是生长素早期响应基因家族,其编码的蛋白质能通过与生长素响应因子特异性结合来调控生长素响应基因的表达,在整个植物生长素信号转导过程中具有重要作用。为了深入研究生长素信号转导分子机制,本研究介绍了AUX/IAA基因家族的基... AUX/IAA是生长素早期响应基因家族,其编码的蛋白质能通过与生长素响应因子特异性结合来调控生长素响应基因的表达,在整个植物生长素信号转导过程中具有重要作用。为了深入研究生长素信号转导分子机制,本研究介绍了AUX/IAA基因家族的基因克隆、结构特征和组织表达特异性,概括了AUX/IAA基因家族的分子调控机制,总结了AUX/IAA基因的功能。最后对AUX/IAA基因家族未来的研究方向做了探讨。 展开更多
关键词 生长素 aux/IAA基因家族 信号转导 基因功能 调控机制
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AuX(X=Al,Ga,In)分子的势能函数与稳定性的密度泛函研究 被引量：2
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作者 刘凤丽 钱妍 杨卫卫 《黑龙江大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2007年第3期345-348,共4页
根据原子分子反应静力学原理导出了AuX(X=Al,Ga,In)分子基态电子状态及其离解极限,并在B3LYP/LANL2DZ水平上计算了平衡几何、振动频率和解离能。利用Murrell-Sorbie函数拟合出了解析势能函数,并计算出光谱参数和力常数。计算结果表明该... 根据原子分子反应静力学原理导出了AuX(X=Al,Ga,In)分子基态电子状态及其离解极限,并在B3LYP/LANL2DZ水平上计算了平衡几何、振动频率和解离能。利用Murrell-Sorbie函数拟合出了解析势能函数,并计算出光谱参数和力常数。计算结果表明该分子体系是稳定存在的,其中AuAl分子具有强较的稳定性。 展开更多
关键词 aux(X=Al Ga In)分子 势能函数 稳定性 密度泛函(B3LYP)
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