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RAD51AP1通过CDK1/PI3K/AKT通路影响卵巢癌细胞增殖、细胞周期和凋亡 被引量:1
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作者 林丽丽 莫新宇 +1 位作者 刘莉 莫芳 《中国优生与遗传杂志》 2024年第9期1812-1819,共8页
目的探讨RAD51相关蛋白1(RAD51AP1)通过调控细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)/磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)通路对卵巢癌细胞(OVCAR3)增殖、细胞周期和凋亡的影响及其分子机制。方法通过生信数据库筛选差异表达基因,及对RAD51... 目的探讨RAD51相关蛋白1(RAD51AP1)通过调控细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)/磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)通路对卵巢癌细胞(OVCAR3)增殖、细胞周期和凋亡的影响及其分子机制。方法通过生信数据库筛选差异表达基因,及对RAD51AP1在卵巢癌患者中的表达和总生存期进行分析,qRT-PCR和Western blot检测卵巢癌细胞系中RAD51AP1表达;体外培养OVCAR3细胞,分为Ctrl组、NC组、RAD51AP1-KD组、RAD51AP1-KD+CDK1组,qRT-PCR和Westernblot检测RAD51AP1、CDK1和PI3K/AKT通路相关蛋白表达,CCK8和平板克隆形成实验检测细胞增殖,细胞周期和凋亡由流式细胞术测定。结果差异表达基因RAD51AP1在卵巢癌组织和细胞系中显著上调(P<0.05),且其高表达患者的总生存期时间短(P<0.05);敲低RAD51AP1显著降低了OVCAR3细胞活力和克隆形成能力,阻滞细胞在G0/G1期,促进凋亡,下调CDK1、PI3K和P-AKT的表达(P<0.05),过表达CDK1则部分逆转上述指标(P<0.05)。结论RAD51AP1在卵巢癌细胞中高表达,敲低RAD51AP1可通过调节CDK1/PI3K/AKT通路抑制卵巢癌细胞增殖,诱导细胞周期阻滞和凋亡。 展开更多
关键词 RAD51相关蛋白1(ap1) 细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1) 磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)信号通路 卵巢癌 细胞周期
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RAD51AP1基因表达在三阴性乳腺癌脑转移中的生物信息分析 被引量:2
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作者 欧丹 蔡钢 陈佳艺 《诊断学理论与实践》 2024年第2期146-154,共9页
目的:采用生物信息分析筛选三阴性乳腺癌脑转移相关差异性表达基因(differentially expressed genes,DEG),并探索影响预后的潜在作用机制。方法:在基因表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)检索获得GSE76250(三阴性乳腺癌组织与正... 目的:采用生物信息分析筛选三阴性乳腺癌脑转移相关差异性表达基因(differentially expressed genes,DEG),并探索影响预后的潜在作用机制。方法:在基因表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)检索获得GSE76250(三阴性乳腺癌组织与正常乳腺组织)和GSE125989(三阴性乳腺癌脑转移病灶组织与三阴性乳腺癌原发灶组织) 2个数据集,筛选DEG。采用GO(Gene Ontology)分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析寻找潜在的三阴性乳腺癌脑转移相关基因。通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库中的临床组织样本,验证相关基因表达水平与乳腺癌预后间的关系,并使用KEGG的基因集进行基因富集分析,评估DEG可能参与的信号通路。结果:在GSE125989和GSE76250数据集中共筛选出52个DEG,蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction, PPI)分析提示RAD51AP1为三阴性乳腺癌脑转移的重要相关基因。TCGA数据分析显示,相较于癌旁组织RAD51AP1在乳腺癌组织中高表达;不同分子分型中,基底样型中乳腺癌PAD51AP1高表达。以RAD51AP1在癌组织表达中位数[log2(TPM+1)=3.85],将乳腺癌患者分为高表达和低表达组,生存分析显示,高表达患者的中位生存期差于低表达者[3 873 d比3 945 d,P<0.05,HR=1.40(1.01~1.94)]。通过GO、KEGG、基因富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)发现,RAD51AP1在细胞周期、DNA复制、错配修复等信号通路中有富集明显。基于细胞周期和DNA损伤修复信号通路相关蛋白信息构建PPI,筛选与RAD51AP1直接相互作用的蛋白质,其中增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)与RAD51AP1的相关性较强(R=0.715,P<0.001)。结论:RAD51AP1在三阴性乳腺癌及其脑转移组织中高表达,可能作为潜在的诊断三阴性乳腺癌及预后不良的生物标志物,且其异常表达介导乳腺癌脑转移进程可能与PCNA相关。 展开更多
关键词 三阴性乳腺癌 脑转移 生物信息学分析 RAD51ap1
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AP1S1在乳腺癌中的表达及其对化疗耐药的影响
3
作者 李晨欣 李启基 +4 位作者 张娣 杨颖倩 张煜浩 王锐 叶丽平 《热带医学杂志》 CAS 2024年第6期776-782,800,I0002,共9页
目的 探究接头相关蛋白复合物1亚基σ1(AP1S1)基因表达水平与乳腺癌化疗患者预后之间的相关性,分析AP1S1在乳腺癌化疗耐药中的作用。方法 采用生物信息学方法,对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌患者和乳腺正常组织的AP1S1表达水... 目的 探究接头相关蛋白复合物1亚基σ1(AP1S1)基因表达水平与乳腺癌化疗患者预后之间的相关性,分析AP1S1在乳腺癌化疗耐药中的作用。方法 采用生物信息学方法,对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌患者和乳腺正常组织的AP1S1表达水平差异进行分析。运用Kaplan-Meier生存分析法,探究AP1S1表达水平与乳腺癌化疗患者无复发生存预后的关联。通过细胞培养、RNA提取、实时荧光定量PCR、蛋白质免疫印迹(Western blot)分析及药物敏感性实验等多种实验手段,基于AP1S1高表达的乳腺癌细胞模型,研究AP1S1基因高表达对乳腺癌细胞化疗耐药的影响,并考察AP1S1过表达对肿瘤细胞干性及上皮-间充质转化(EMT)特性标志物表达的作用。结果 乳腺癌组织中AP1S1基因的表达水平显著高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。在肿瘤不同分期,AP1S1基因的表达水平均表现出显著高于正常组织,差异均有统计学意义(P均<0.05);其中4期肿瘤的过表达水平更高,差异有统计学意义(P<0.05)。管腔(Luminal)型、人类表皮生长因子2(HER2)阳性型和三阴型乳腺癌组织较正常组织均表现出AP1S1基因高表达,差异均有统计学意义(P均<0.05);其中在HER2阳性型和三阴型乳腺癌组织中AP1S1表达水平更高,差异均有统计学意义(P均<0.05)。Kaplan-Meier生存分析发现,AP1S1高表达的乳腺癌患者在化疗后无复发生存期显著短于低表达组,差异有统计学意义(P=0.038);在三阴型、HER2阳性乳腺癌患者中,AP1S1高表达与化疗后预后不良显著相关(P=0.037、0.017);Luminal B型患者中,AP1S1高表达与较长的无复发生存期显著相关(P=0.007)。实时荧光定量PCR显示,与对照组比较,在AP1S1过表达的细胞系CAL-51-oe-AP1S1、Hs-578T-oe-AP1S1中AP1S1转录水平显著上调,差异均有统计学意义(t=23.51、6.22,P均<0.05);Western blot结果显示,与对照组比较,在AP1S1过表达的细胞系CAL-51-oe-AP1S1、Hs-578T-oe-AP1S1中AP1S1蛋白水平显著上调,差异均有统计学意义(P均<0.05);肿瘤药物敏感性基因组项目(GDSC)数据库中分析结果显示,乳腺癌细胞CAL-51、Hs-578T的半抑制浓度(IC50)分别为0.008 398、0.000 935μmol/L;药物毒性实验结果显示,过表达AP1S1显著增强了乳腺癌细胞CAL-51、Hs-578T对化疗药物多西紫杉醇的耐受性,差异均有统计学意义(t=8.74、9.90,P均<0.05);三维培养实验结果显示,过表达AP1S1的CAL-51细胞形成更多的球体细胞团,而对照组的结构在药物作用下显著恶化,差异有统计学意义(t=11.54,P<0.05)。与对照组比较,在CAL-51-oeAP1S1、Hs-578T-oe-AP1S1乳腺癌细胞系中,AP1S1过表达在转录水平上显著上调了干细胞标志基因纳诺克同源盒(NANOG)、辛烷结合转录因子4 (OCT4)、性别决定区相关HMG盒基因2 (SOX2)、B细胞特异性分化基因1(BMI1)以及多药耐药相关基因ATP结合盒转运蛋白G2(ABCG2)的表达,差异均有统计学意义(t=20.75、39.05、28.55、29.76、94.18,24.78、17.79、19.60、14.10、16.79,P均<0.05);同时显著降低了上皮钙黏蛋白(E-cadherin)(CDH1)和紧密连接蛋白1(TJP1)的mRNA表达,并增加了与EMT相关的标志物神经钙黏蛋白(N-cadherin)(CDH2)和波形蛋白(VIM)的表达,差异均有统计学意义(t=6.26、4.99、9.79、5.23,13.25、19.87、13.83、11.42,P均<0.05)。在CAL51细胞系中,Western blot结果显示,AP1S1的过表达导致干细胞标志基因SOX2的表达水平上升和多药耐药基因ABCG2的表达增加,同时显著抑制了细胞黏附蛋白E-cadherin的表达,并促进了N-cadherin的过表达,差异均有统计学意义(P均<0.05)。结论 AP1S1在乳腺癌中高表达,不仅促进化疗药物多西紫杉醇的耐药性,还促进乳腺癌细胞的干性增强并诱发EMT过程。 展开更多
关键词 ap1S1 乳腺癌 多西紫杉醇 化疗耐药
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AP1基因转化地被菊品种‘玉人面’的研究 被引量:20
4
作者 吕晋慧 吴月亮 +1 位作者 孙磊 张启翔 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第9期128-132,共5页
The flower’s meristematic characteristic gene AP1 was introduced into Chrysanthemum morifolium cv. ‘Yu Ren Mian’ mediated by Agrobacterium tumefaciens.The factors influencing genetic transformation protocol were st... The flower’s meristematic characteristic gene AP1 was introduced into Chrysanthemum morifolium cv. ‘Yu Ren Mian’ mediated by Agrobacterium tumefaciens.The factors influencing genetic transformation protocol were studied.The results showed that the leaf explants precultured for 2~8 hours or not precultured were best for transformation by A. tumefaciens. The suitable concentration of bacterial and the time for infecting was OD_ 600 0.5 for 10 minutes. Leaves were cocultivated with bacterial at 23~25 ℃ for 2 days,then delayed selection for 3 days. Kan^r plant were selected by increased selective press from 5 mg·L ~ -1 G418 to 7.5 mg5L~ -1 G418 followed by 10 mg5L~ -1 G418. The integration of AP1 gene into C. morifolium ‘Yu Ren Mian’ was confirmed by PCR and Southern blotting.Two of transgenic plants bloomed 15 days earlier than untransformed plants. 展开更多
关键词 地被菊 ap1基因 根癌农杆菌 遗传转化
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建兰AP1基因的克隆、表达及其与MADS-box转录因子相互作用的分析 被引量:20
5
作者 吴菁华 吴少华 +1 位作者 杨超 张志忠 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1935-1942,共8页
为研究APl/SQUA类MADS-box基因在建兰花发育中作用,以‘四季大青’建兰花芽为材料,用RT-PCR和RACE技术获得AP1基因,命名为CeAP1。序列分析表明,CeAP1基因cDNA全长866 bp,其开放阅读框编码一个含241个氨基酸的蛋白质。通过蛋白序列比对发... 为研究APl/SQUA类MADS-box基因在建兰花发育中作用,以‘四季大青’建兰花芽为材料,用RT-PCR和RACE技术获得AP1基因,命名为CeAP1。序列分析表明,CeAP1基因cDNA全长866 bp,其开放阅读框编码一个含241个氨基酸的蛋白质。通过蛋白序列比对发现CeAP1与兰科植物的AP1蛋白质同源性较高。荧光定量PCR分析表明,CeAP1基因在建兰花发育初期高水平表达,同时在营养器官中也表达。酵母双杂交试验分析显示,CeAP1能自身形成同源二聚体,同时也能与除CeAG1外的其他MADS-box发生相互作用。 展开更多
关键词 建兰 花发育 ap1同源基因 相互作用
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无抗性选择标记转AP1基因抗病水稻新品系的选育 被引量:9
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作者 于恒秀 刘巧泉 +6 位作者 王玲 赵志鹏 徐丽 黄奔立 龚志云 汤述翥 顾铭洪 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期2373-2379,共7页
为获得无任何抗生素抗性基因的抗病转基因水稻新品系,将克隆自甜椒的两亲性蛋白AP1基因与潮霉素抗性选择标记基因(HPT)分别构建位于同一农杆菌双元载体上的两个独立的T-DNA区中,并经农杆菌介导,将其导入江苏省推广的两个粳稻品种广陵香... 为获得无任何抗生素抗性基因的抗病转基因水稻新品系,将克隆自甜椒的两亲性蛋白AP1基因与潮霉素抗性选择标记基因(HPT)分别构建位于同一农杆菌双元载体上的两个独立的T-DNA区中,并经农杆菌介导,将其导入江苏省推广的两个粳稻品种广陵香粳和武香粳9号中,获得了一批转基因水稻植株。PCR和Southern杂交分析表明,AP1基因和HPT基因已同时导入受体基因组中,并从共转化植株的自交后代中筛选到了无HPT基因的转AP1基因水稻植株。结合田间农艺性状考察,选育了多个无抗性选择标记基因的纯合转AP1基因水稻新品系;抗病性鉴定结果表明,转AP1基因水稻对稻白叶枯病的抗性与未转化对照相比有显著提高,部分转基因水稻对纹枯病的抗性与未转化对照相比也有一定程度的提高。 展开更多
关键词 水稻 抗病 ap1基因 无抗性选择标记 白叶枯病 纹枯病
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草莓AP1同源基因的克隆、表达及启动子分析 被引量:11
7
作者 邹冬梅 刘月学 +3 位作者 张志宏 李贺 马跃 代红艳 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1972-1981,共10页
【目的】从草莓(Fragaria×ananassa)中克隆APETALA1(AP1)同源基因,并分析其在不同组织、器官及不同花发育阶段的表达水平,探讨其在草莓植株成花进程中的作用。【方法】根据其它物种AP1同源基因的保守序列设计简并引物,以草莓幼叶... 【目的】从草莓(Fragaria×ananassa)中克隆APETALA1(AP1)同源基因,并分析其在不同组织、器官及不同花发育阶段的表达水平,探讨其在草莓植株成花进程中的作用。【方法】根据其它物种AP1同源基因的保守序列设计简并引物,以草莓幼叶和花芽为试材,克隆得到AP1的基因片段,在此基础上利用RACE的方法分离获得其cDNA全长。利用实时定量RT-PCR分析草莓不同组织、器官及不同花发育阶段中AP1同源基因的表达水平。利用染色体步移的方法分离启动子序列。【结果】从草莓品种‘花姬’中克隆出AP1同源基因的cDNA全长序列,命名为FaAP1;其CDS长度为735 bp,编码245个氨基酸,与玫瑰AP1-1的氨基酸序列同源性最高,达到92%,与拟南芥AtAP1的氨基酸序列同源性为64.00%。FaAP1编码的氨基酸全长序列符合MADS-box基因家族特征,包含MADS-box、I-间插域、K-box域和C-末端几个结构域,是MIKC类型的MADS-box基因家族的成员。实时定量RT-PCR结果表明,在不同组织、不同花器官及不同花发育阶段中FaAP1的表达量存在差异。其启动子除了具有TATA/CAAT-box外还包含一些特异作用元件。【结论】从草莓中分离出的FaAP1基因,在花分生组织形成和花器官发育中有一定的调控作用。 展开更多
关键词 草莓 ap1同源基因 分离 表达 启动子
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牛乳腺炎无乳链球菌菌毛岛屿辅助蛋白AP1基因的克隆及其表达产物的抗原性鉴定 被引量:11
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作者 锡林高娃 吴金花 +4 位作者 布日额 刘洋 王学理 刘燕 郭闯 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2013年第6期481-484,488,共5页
目的克隆与高效表达无乳链球菌细胞表面菌毛岛屿辅助蛋白AP1基因编码蛋白抗原优势区,并进行抗原性分析及鉴定。方法根据GenBank上公布的牛乳腺炎无乳链球菌辅助蛋白AP1(EU929387.1)基因序列,利用生物信息学学软件Primer5.0和DNA MAN,根... 目的克隆与高效表达无乳链球菌细胞表面菌毛岛屿辅助蛋白AP1基因编码蛋白抗原优势区,并进行抗原性分析及鉴定。方法根据GenBank上公布的牛乳腺炎无乳链球菌辅助蛋白AP1(EU929387.1)基因序列,利用生物信息学学软件Primer5.0和DNA MAN,根据其辅助蛋白保守序列设计、合成1对克隆引物,以分离于内蒙古东部地区乳源性无乳链球菌临床菌株总DNA为模板,PCR扩增辅助蛋白AP1基因序列,经克隆与测序后构建重组表达载体AP1-pET30,转化大肠埃希菌BL21,并进行高效表达,目的蛋白经亲和层析纯化后进行Western blot鉴定。结果克隆的抗原表位序列片段大小为714bp,编码238氨基酸残基,与GenBank公布的AP1(EU929387.1)基因序列相似性为99.72%,氨基酸残基相似性为99.58%。构建的重组表达载体经诱导表达可溶性蛋白,纯化后重组蛋白的纯度>95%,Western blot分析重组蛋白能被牛源无乳链球菌阳性血清识别。结论成功构建了pET-30a-AP1重组表达载体,该载体能可溶性表达重组蛋白,表达产物具有良好抗原反应性,为进一步研究辅助蛋白AP1的结构、功能以及抗原表位的鉴定奠定了实验基础。 展开更多
关键词 菌毛岛屿 ap1基因 克隆 抗原性
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荔枝APETALA1(AP1)同源基因cDNA全长克隆及其表达研究 被引量:11
9
作者 丁峰 彭宏祥 +5 位作者 罗聪 李冬波 朱建华 秦献泉 何新华 曹辉庆 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期2373-2380,共8页
应用RT-PCR方法克隆得到荔枝AP1同源基因cDNA全长,命名为LcAP1(基因登录号:JN214349)。LcAP1基因开放阅读框738 bp,编码245个氨基酸,推测蛋白质分子量为28.39 kD,等电点为9.69。序列分析显示,LcAP1基因编码的蛋白在1~61氨基酸含有1个M... 应用RT-PCR方法克隆得到荔枝AP1同源基因cDNA全长,命名为LcAP1(基因登录号:JN214349)。LcAP1基因开放阅读框738 bp,编码245个氨基酸,推测蛋白质分子量为28.39 kD,等电点为9.69。序列分析显示,LcAP1基因编码的蛋白在1~61氨基酸含有1个MADS盒结构域,在89~179氨基酸有1个K盒结构域。蛋白质二级结构预测表明,LcAP1基因编码的蛋白有3个α螺旋,2个β折叠区,8个β转角。同源分析表明,LcAP1基因在不同植物中的一致性为72%~82%。半定量RT-PCR分析表明,在‘三月红’荔枝花芽分化期,LcAP1基因在成熟叶、幼叶、老茎、嫩茎、花芽和花梗中均表达,在花芽中表达最多。 展开更多
关键词 荔枝 APETALA1(ap1)基因 序列分析 表达模式
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花分生组织决定基因AP1转化矮牵牛的研究 被引量:37
10
作者 安利忻 刘荣维 +1 位作者 陈章良 李毅 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2001年第1期63-66,共4页
利用RT_PCR方法从拟南芥 (Arabidopsisthaliana (L .)Heynh .)中克隆了花分生组织决定基因 (flower_meristem_identitygene)AP1,进行了全序列测定。测序结果显示 ,所得到的基因与发表的序列仅有一个碱基的差异 ,但并不影响蛋白质的一级... 利用RT_PCR方法从拟南芥 (Arabidopsisthaliana (L .)Heynh .)中克隆了花分生组织决定基因 (flower_meristem_identitygene)AP1,进行了全序列测定。测序结果显示 ,所得到的基因与发表的序列仅有一个碱基的差异 ,但并不影响蛋白质的一级结构。将AP1基因克隆入植物中间载体p2 0 8,通过根癌土壤杆菌 (Agrobacteriumtumefaciens (SmithetTownsend)Conn)介导的方法转化矮牵牛 (PetuniahybridaVilm .)。对转基因植株进行了PCR和Southern检测 ,所得到的两个株系的转基因矮牵牛在R0 代即表现出提前且持续不断地开花的特性 。 展开更多
关键词 拟南芥 花分生组织决定基因 ap1 矮牵牛 基因转化
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芒果AP1同源基因的克隆及其生物信息学分析 被引量:17
11
作者 罗聪 何新华 +3 位作者 陈虎 蒋雅琴 高美萍 李杨瑞 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期851-858,共8页
我们采用RT-PCR方法克隆了2个A州同源基因全长cDNA,分别命名为MAPl—1(GenBankac—cession No.FJ529206)和MAPl—2(GenBankaccession No.FJ529207)。MAPl—1编码247个氨基酸,开放阅读框长度为741bp,蛋白质分子量为28.54kD,... 我们采用RT-PCR方法克隆了2个A州同源基因全长cDNA,分别命名为MAPl—1(GenBankac—cession No.FJ529206)和MAPl—2(GenBankaccession No.FJ529207)。MAPl—1编码247个氨基酸,开放阅读框长度为741bp,蛋白质分子量为28.54kD,等电点为8.31;MAPl—2编码248个氨基酸,开放阅读框长度为744bp,蛋白质分子量为28.78kD,等电点为8.70。同源性分析表明,它们的核苷酸序列与其它木本植物A纠同源基因的一致性为72%~81%。实验分析表明,MAPl—1和MAPl—2第1至第61个氨基酸含有一个MADS盒结构域,第88至第178个为K盒结构域;两个基因均定位于细胞核,且功能位点分布存在着不同,推测这两个基因在花器官发育过程中的功能存在差异。蛋白二级结构预测显示,MAPl—1蛋白有12个α-螺旋,4个8折叠区,14个β-转角;而MAP1—2蛋白有11个α-螺旋,5个B折叠区,15个β-转角;其大多数氨基酸具有亲水性。本研究有助于进一步了解芒果的开花分子机理及成花的生物学发育阶段。 展开更多
关键词 芒果 ap1(APETALA1)基因 克隆 生物信息学分析
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牛乳腺炎无乳链球菌PI-2a菌毛岛辅助蛋白AP1、BP主要抗原域串联表达及其免疫活性鉴定 被引量:8
12
作者 布日额 王金良 +5 位作者 吴金花 锡林高娃 陈金龙 孙立杰 王华 朝洛蒙 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第7期609-613,618,共6页
目的构建无乳链球菌菌毛岛屿辅助蛋白AP1、菌毛骨架蛋白BP主要抗原域串联表达重组载体,对表达产物进行抗原性分析及鉴定。方法利用DNAstar Protean功能筛选AP1和BP主要抗原结构域,引入15位柔性多肽,通过重叠延伸PCR技术串联融合AP1、BP... 目的构建无乳链球菌菌毛岛屿辅助蛋白AP1、菌毛骨架蛋白BP主要抗原域串联表达重组载体,对表达产物进行抗原性分析及鉴定。方法利用DNAstar Protean功能筛选AP1和BP主要抗原结构域,引入15位柔性多肽,通过重叠延伸PCR技术串联融合AP1、BP主要抗原决定簇基因区,PCR扩增串联体基因片段,克隆至pET-30a(+)载体后转化BL21(DE3)细胞,表达的目的蛋白经亲和层析纯化后进行Western blot鉴定。结果 PCR扩增出321bp的AP1和660bp的BP主要抗原域,经重叠延伸PCR获得966bp的AP1、BP串联体基因片段,DNA测序表明无碱基缺失、突变和移码。构建的重组表达载体经IPTG诱导能可溶性表达分子质量约45ku的目的蛋白,纯化后重组蛋白的纯度≥95%,Western blot分析表明,重组融合蛋白能被兔源抗无乳链球菌阳性血清识别。结论重叠延伸PCR获得AP1、BP主要抗原域串联体,构建的pET-30a(+)/AP1+BP重组表达载体能以包涵体形式表达目的蛋白,表达产物具有良好的反应原性,为研究基于AP1、BP蛋白的致病机制及其免疫活性奠定了实验基础。 展开更多
关键词 无乳链球菌 菌毛岛屿 ap1、BP 串联表达
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Y系山定子AP1同源基因的克隆及序列分析 被引量:6
13
作者 王娟 田建保 +4 位作者 杜俊杰 杨廷桢 王骞 孙俊杰 弓桂花 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期66-70,共5页
以Y系山定子为试材研究AP1基因,试图为缩短果树童期提供理论依据。根据已登录的苹果AP1基因保守序列设计引物,以Y系山定子的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得1 010 bp的基因片段;PCR产物纯化后,将其连接到pMD18-T载体上,连接产物转化大... 以Y系山定子为试材研究AP1基因,试图为缩短果树童期提供理论依据。根据已登录的苹果AP1基因保守序列设计引物,以Y系山定子的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得1 010 bp的基因片段;PCR产物纯化后,将其连接到pMD18-T载体上,连接产物转化大肠杆菌DH5α菌株感受态细胞,通过蓝白斑筛选、质粒长度和酶切鉴定,获得重组质粒并测序。测序结果表明,该序列有2个外显子、1个内含子及2个内含子的一部分,编码区共编码81个氨基酸;对氨基酸序列保守性分析发现,第13-81个氨基酸为MADS-box基因家族特有的K区域;其氨基酸序列在GenBank中同源性检索表明,Y系山定子与其他植物AP1同源基因的氨基酸序列同源性为67.9%-100%。研究结果为揭示Y系山定子早花现象的分子机制奠定了基础,对果树育种具有重要的理论价值和实际意义。 展开更多
关键词 Y系山定子 ap1(APETALA1)基因 PCR 克隆 序列分析
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文心兰开花相关OnAP1-like基因的克隆及表达分析 被引量:8
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作者 崔波 武振江 +3 位作者 刘佳 张国付 袁秀云 叶永忠 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期357-364,共8页
以南茜文心兰(Gower Ramsey)盛花期花葶提取的总RNA为模板,通过RT-PCR与RACE扩增,获得一个958 bp的AP1(APETALA1)-like基因的cDNA全长序列,其基因编码区690 bp,共编码氨基酸229个,命名为OnAP1-like(登录号:KC426946)。蛋白质二级结构分... 以南茜文心兰(Gower Ramsey)盛花期花葶提取的总RNA为模板,通过RT-PCR与RACE扩增,获得一个958 bp的AP1(APETALA1)-like基因的cDNA全长序列,其基因编码区690 bp,共编码氨基酸229个,命名为OnAP1-like(登录号:KC426946)。蛋白质二级结构分析表明,该蛋白质48.91%为α螺旋,10.92%为β折叠,40.17%为无规则卷曲,为亲水性蛋白质。蛋白序列比对和进化树分析表明,OnAP1-like蛋白与蕙兰AP1-like蛋白一致性最高,进化距离最近。利用RT-qPCR对从文心兰不同时期不同器官中的OnAP1-like基因表达量进行分析,结果表明,同一器官不同发育时期比较,在叶中,花蕾期的表达量最高;在根中,随发育时间推移,表达量逐渐升高,至花后期达到最高;在花葶中的表达量的趋势与根相同。同一时期不同器官比较,抽葶前,根中表达量高于叶片;花蕾期,花瓣中的表达量最高;盛花期和花后期,花葶中的表达量最高。推测该基因在花的发育及形成中发挥作用。 展开更多
关键词 文心兰 MADS-box基因ap1-like RT-QPCR 克隆 表达分析
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牛乳腺炎无乳链球菌PI-2a菌毛岛屿辅助蛋白AP1、BP、AP2三基因的串联表达及其免疫原性研究 被引量:4
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作者 布日额 王金良 +5 位作者 吴金花 锡林高娃 陈金龙 孙立杰 王华 朝洛蒙 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期138-141,共4页
为探究无乳链球菌菌毛岛屿3个亚基AP1、AP2、BP融合蛋白的抗原性,本研究根据该3个亚基基因的主要抗原结构域序列设计并合成引物,通过重叠延伸PCR技术获得上述3个亚基的串联核苷酸片段,并插入pET-30a(+)载体,转化至BL21(DE3)感受态细胞... 为探究无乳链球菌菌毛岛屿3个亚基AP1、AP2、BP融合蛋白的抗原性,本研究根据该3个亚基基因的主要抗原结构域序列设计并合成引物,通过重叠延伸PCR技术获得上述3个亚基的串联核苷酸片段,并插入pET-30a(+)载体,转化至BL21(DE3)感受态细胞后诱导表达,表达蛋白经亲和层析纯化后进行western blot鉴定和小鼠免疫实验。结果表明,AP1-AP2-BP融合抗原具有良好的反应原性和免疫原性。本研究为进一步研究无乳链球菌基于AP1-BP-AP2融合蛋白的致病机制、检测制剂及亚单位疫苗研制提供了实验依据。 展开更多
关键词 无乳链球菌 菌毛岛屿 ap1 BP AP2 串联表达
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毛果杨PtrAP1-2基因启动子的克隆及其瞬时表达分析 被引量:5
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作者 陈仲 王佳 安新民 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期591-597,共7页
为了研究杨树AP1同源基因的表达规律,利用PCR技术从毛果杨基因组DNA中克隆出PtrAP1-2基因上游一段2103bp序列。联合使用PLACE和PlantCARE在线软件分析序列,结果表明该序列含有TATA-box和CAAT-box启动子基本元件,另外含有MRE、GT1-motif... 为了研究杨树AP1同源基因的表达规律,利用PCR技术从毛果杨基因组DNA中克隆出PtrAP1-2基因上游一段2103bp序列。联合使用PLACE和PlantCARE在线软件分析序列,结果表明该序列含有TATA-box和CAAT-box启动子基本元件,另外含有MRE、GT1-motif、AE-box、TCT-motif和Box4多种光响应元件,因此,PtrAP1-2可能与植物开花过程紧密相关。在序列分析的基础上,构建了PtrAP1-2基因启动子驱动GUS报告基因的植物表达载体,命名为PtrAP1-2pro::GUS。利用农杆菌介导的瞬时表达法转化烟草,结果表明PtrAP1-2启动子可以驱动GUS基因在烟草萼片和花瓣中特异表达,在根、茎、叶、雄蕊和心皮等其他组织部位里没有GUS表达活性,这表明PtrAP1-2pro为花器官特异表达启动子。 展开更多
关键词 毛果杨 ap1 启动子 GUS 瞬时表达
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芥菜AP1基因体外表达及其与FLC相互作用的验证 被引量:3
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作者 汤青林 许俊强 +1 位作者 宋明 王志敏 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期1328-1333,共6页
芥菜花分生组织决定因子AP1与开花路径核心调节子FLC可能存在直接的相互作用,从而调节开花时间。为进一步检测该相互作用,从芥菜"QJ"材料中同源克隆了790bp的AP1cDNA序列,该基因编码256个氨基酸。生物信息学分析表明,AP1属MIK... 芥菜花分生组织决定因子AP1与开花路径核心调节子FLC可能存在直接的相互作用,从而调节开花时间。为进一步检测该相互作用,从芥菜"QJ"材料中同源克隆了790bp的AP1cDNA序列,该基因编码256个氨基酸。生物信息学分析表明,AP1属MIKC型蛋白,其MADS域含有2个螺旋和2个折叠,第1个螺旋内含有1个不保守氨基酸位点;而K域含有3个螺旋,第1、2个螺旋内各有1个不保守位点,第3个螺旋内具有4个不保守位点。同时构建了原核表达质粒pET43.1a-AP1,转化宿主菌大肠杆菌BL21,以IPTG诱导该融合蛋白体外表达。利用pET43.1a-AP1融合蛋白序列中6×His标签与Ni+结合的特点,结合SDS-PAGE分析,证实了体外表达蛋白AP1能与FLC相互作用并形成复合体,该结果为深入研究AP1与FLC互作机制及花分生组织的分子调控奠定了基础。 展开更多
关键词 芥菜 ap1基因 FLC 蛋白互作
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萼脊兰SeAP1-like基因的克隆与表达载体构建 被引量:4
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作者 蒋素华 袁秀云 +3 位作者 王洁琼 武振江 张国付 崔波 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2015年第1期105-109,共5页
根据NCBI网站上萼脊兰AP1-like全长基因序列设计引物,采用RT-PCR法从萼脊兰花瓣中扩增Se AP1-like基因,对扩增产物进行克隆和测序。结果表明,获得的萼脊兰Se AP1-like基因为743 bp,编码247个氨基酸。将Se AP1-like基因插入p CAMBIA1304... 根据NCBI网站上萼脊兰AP1-like全长基因序列设计引物,采用RT-PCR法从萼脊兰花瓣中扩增Se AP1-like基因,对扩增产物进行克隆和测序。结果表明,获得的萼脊兰Se AP1-like基因为743 bp,编码247个氨基酸。将Se AP1-like基因插入p CAMBIA1304载体中,经PCR、双酶切鉴定,证实重组表达质粒中含有目的片段,表明成功构建了高效植物表达载体p CAMBIA1304-Se AP1。对Se AP1-like基因的结构域和所表达蛋白质的亲水性进行了分析,并预测了该基因所表达蛋白的二维结构。结果显示,该基因包含MADS-box和K-box保守域,属于MADS-box基因家族,该蛋白分子属于亲水性蛋白。二级结构分析表明,其包含57.49%的α螺旋、6.07%的延伸链、36.44%的不规则折叠。 展开更多
关键词 萼脊兰 SE ap1-like基因 克隆 载体构建
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内含子源性miRNA通过转录因子AP1调节内皮型一氧化氮合酶表达及血管内皮细胞增殖作用 被引量:3
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作者 李玉媚 王辉 +3 位作者 张文宇 陈伟 胡楠 欧和生 《中国动脉硬化杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期649-654,共6页
目的前期工作发现,内皮型一氧化氮合酶(eNOS)第4内含子的27碱基重复子产生相应27-nt miRNA,并对eNOS的转录和表达有负反馈调节作用。进一步探讨该内含子源性27-nt miRNA对内皮型一氧化氮合酶基因调节的分子机制及血管内皮细胞增殖相关... 目的前期工作发现,内皮型一氧化氮合酶(eNOS)第4内含子的27碱基重复子产生相应27-nt miRNA,并对eNOS的转录和表达有负反馈调节作用。进一步探讨该内含子源性27-nt miRNA对内皮型一氧化氮合酶基因调节的分子机制及血管内皮细胞增殖相关转录因子AP1的作用机制。方法应用MTT法检测人脐静脉内皮细胞(HUVEC)的增殖抑制率;细胞划痕实验检测HUVEC迁移能力;免疫组织化学方法检测内皮细胞中eNOS和AP1蛋白表达水平;进一步用Western Blot检测27-nt miRNA表达相关情况及细胞核转录因子eNOS表达情况。结果27-nt miRNA对HUVEC增殖具有强烈抑制作用(P<0.05);27-nt miRNA对HUVEC迁移具有显著抑制作用(P<0.05);27-nt miRNA显著降低eNOS和AP1蛋白表达(P<0.05);27-nt miRNA通过负调控AP1降低eNOS蛋白表达(P<0.05)。结论 27-nt miRNA显著抑制eNOS和AP1蛋白表达,AP1在27-nt miRNA对eNOS表达调节中起重要作用。 展开更多
关键词 MIRNA 内皮型一氧化氮合酶 内皮细胞 ap1
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microRNA-21对膀胱癌T24细胞增殖的影响及对VEGF和AP1蛋白的调节 被引量:6
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作者 杨国胜 刘百川 尹智峰 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期365-370,共6页
【目的】研究microRNA-21(miR-21)对膀胱癌T24细胞系中血管内皮生长因子(vascularendothelialgrowthfactor,VEGF)和活化因子蛋白-1(activatorprotein-1,AP1)及mRNA表达的调节作用,探讨miR-21对膀胱癌T24细胞增殖的影响。【方法】用人工... 【目的】研究microRNA-21(miR-21)对膀胱癌T24细胞系中血管内皮生长因子(vascularendothelialgrowthfactor,VEGF)和活化因子蛋白-1(activatorprotein-1,AP1)及mRNA表达的调节作用,探讨miR-21对膀胱癌T24细胞增殖的影响。【方法】用人工合成的miR-21相应的双链互补DNA片段,插入pSilencerTM3.1-H1neo载体表达载体,经测序鉴定后作为microRNA的表达质粒;用脂质体将miR-21高表达质粒转染进T24膀胱癌细胞,经G418筛选获得阳性克隆。用RT-PCR技术和Westernblot方法分别检测该细胞系中VEGF和AP1的mRNA和蛋白表达情况。四甲基偶氮唑蓝(MTT)法检测膀胱癌T24细胞增殖的变化情况。【结果】Westernblot结果显示miR-21能够增加VEGF和AP1蛋白的表达,RT-PCR方法分析显示VEGF和AP1mRNA水平升高。MTT显示转染后细胞的生长速率比未转染的细胞明显加快。【结论】miR-21促进T24膀胱癌细胞增殖,提示可能与VEGF和AP1的低表达有关。 展开更多
关键词 MICRORNA-21 VEGF ap1 T24细胞 膀胱肿瘤
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