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亚洲人群ADIPOQ基因(T45G)多态性与多囊卵巢综合征易感性meta分析
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作者 周青 刘帅妹 +4 位作者 张瑞金 李孟兰 封婕 黄丽丽 林宁 《中国计划生育学杂志》 2025年第9期1932-1937,共6页
目的:评价脂联素基因(ADIPOQ)T45G位点多态性与亚洲人群多囊卵巢综合征(PCOS)的易感性。方法:检索中国知网、万方和PubMed等中英文数据库2025年4月前发表关于ADIPOQ(T45G)基因多态性与亚洲人群多囊卵巢综合征之间关系的研究,采用stata1... 目的:评价脂联素基因(ADIPOQ)T45G位点多态性与亚洲人群多囊卵巢综合征(PCOS)的易感性。方法:检索中国知网、万方和PubMed等中英文数据库2025年4月前发表关于ADIPOQ(T45G)基因多态性与亚洲人群多囊卵巢综合征之间关系的研究,采用stata11.0软件进行统计分析。结果:共纳入11项研究,包含多囊卵巢综合征患者2121例和健康对照组2189例,ADIPOQ(T45G)基因5种遗传比较模型(G比T:OR=0.99,95%CI 0.83~1.18,Ph=0.006;GG比TT:OR=1.07,95%CI 0.81~1.40,Ph=0.324;GT比TT:OR=1.03,95%CI 0.83~1.29,Ph=0.006;GG+GT比TT:OR=1.01,95%CI 0.81~1.26,Ph=0.005;GG比TT+GT:OR=1.00,95%CI 0.77~1.31,Ph=0.390),提示ADIPOQ(T45G)基因多态性与亚洲人群多囊卵巢综合征之间不存在相关性,按照地理位置进行亚组分析,未发现显著意义的关联。结论:ADIPOQ(T45G)基因多态性可能与亚洲人群多囊卵巢综合征之间不存在相关性。 展开更多
关键词 多囊卵巢综合征 脂联素基因 基因多态性
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基于GEO数据库鉴定ADIPOQ为脂肪肉瘤预后良好的生物标志物 被引量:1
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作者 赵欢欢 张国川 《数理医药学杂志》 CAS 2024年第5期341-348,共8页
目的探寻脂肪肉瘤的预后生物标志物,以作为其潜在的治疗靶点。方法从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载GSE21122、GSE159659及GSE30929数据集,采用R语言limma包鉴定脂肪肉瘤与正常脂肪组织间的显著差异基因,利用gg... 目的探寻脂肪肉瘤的预后生物标志物,以作为其潜在的治疗靶点。方法从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中下载GSE21122、GSE159659及GSE30929数据集,采用R语言limma包鉴定脂肪肉瘤与正常脂肪组织间的显著差异基因,利用ggvenn包获得共同差异基因。利用survival和survminer包进行Cox回归分析和Kaplan-Meier生存分析。采用corr.text函数分析ADIPOQ与多种免疫检查点分子的相关性。利用clusterProfiler包对高低表达ADIPOQ脂肪肉瘤之间的差异表达基因进行功能富集分析。结果在GSE21122和GSE159659数据集中,分别鉴定出155个和39个显著差异基因。Venn图显示存在25个共同差异基因。多因素Cox回归分析结果显示,ADIPOQ可作为脂肪肉瘤预后良好的独立因素[HR=0.68,95%CI(0.49,0.94),P=0.022]。与正常脂肪组织相比,ADIPOQ在脂肪肉瘤组织中显著低表达(P<0.001)。Kaplan-Meier生存分析结果显示,高表达ADIPOQ脂肪肉瘤患者的无远处复发生存期(distant recurrence free survival,DRFS)显著高于低表达组(P<0.001)。Spearman相关性分析结果显示,ADIPOQ与ICOS、TNFSF9、LAG3、CTLA4、CD47、CD200、CD86、PDCD1LG2等免疫检查点分子量呈负相关关系(P<0.05)。基因本体(GeneOntology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genesand Genomes,KEGG)分析结果显示,高低表达ADIPOQ脂肪肉瘤之间的上调基因在营养物质代谢及相关通路中富集,下调基因在细胞分裂、细胞周期等生物学功能中富集。结论ADIPOQ可作为脂肪肉瘤患者预后良好的生物标志物,其可能具有抑制多种免疫检查点表达的作用,从而改善脂肪肉瘤患者的预后。 展开更多
关键词 脂肪肉瘤 adipoq GEO数据库 预后 生物标志物
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天祝白牦牛ADIPOQ基因的克隆及生物信息学分析
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作者 若周么 石斌刚 +2 位作者 王向彦 祁有鹏 胡江 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第13期105-110,115,共7页
脂联素(ADIPOQ)是一种主要由脂肪组织分泌的内源性细胞因子,在调节脂类代谢中发挥重要作用,该基因通过调控脂质代谢影响动物机体脂肪沉积。为探讨ADIPOQ基因编码蛋白序列特征及组织表达模式,试验对天祝白牦牛ADIPOQ基因编码序列(CDS)进... 脂联素(ADIPOQ)是一种主要由脂肪组织分泌的内源性细胞因子,在调节脂类代谢中发挥重要作用,该基因通过调控脂质代谢影响动物机体脂肪沉积。为探讨ADIPOQ基因编码蛋白序列特征及组织表达模式,试验对天祝白牦牛ADIPOQ基因编码序列(CDS)进行克隆测序,获得天祝白牦牛ADIPOQ基因CDS区,利用生物信息学软件预测天祝白牦牛ADIPOQ基因及其编码氨基酸序列特征。结果表明:天祝白牦牛ADIPOQ基因CDS区全长723 bp,编码240个氨基酸,其中甘氨酸含量(14.17%)最高,具有亲水性,蛋白质二级结构和三级结构以无规则卷曲和延伸链为主。ADIPOQ基因编码蛋白具有一个信号肽,无跨膜结构,属于分泌蛋白,其可能与ADIPOR1、ADIPORZ、RETN、PLIN1和LEP等10个蛋白质存在相互作用,与山羊的氨基酸序列相似性为91.6%,与绵羊、山羊亲缘关系最近,具有一定的保守性。说明试验成功克隆了天祝白牦牛ADIPOQ基因的CDS区,ADIPOQ基因可能在脂肪沉积过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 天祝白牦牛 adipoq基因 克隆 CDS区 生物信息学分析
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Relationship between the rs2241766 ADIPOQ Polymorphism in a Black African Population and the Occurrence of Type 2 Diabetes
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作者 Aude Syntia Mbang Bengone Rosalie Nikiema-Ndong +6 位作者 Elisabeth Lendoye Alvine Sibylle Batou Edwige Nnegue Edzo Serge Bekale Daniela Nsame Frédéric Da Dari Félix Ovono Abessolo 《American Journal of Molecular Biology》 CAS 2024年第2期97-106,共10页
Background: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a metabolic disease, characterized by chronic hyperglycemia. This pathology is linked to various genes whose interaction with the environment promotes its development. Th... Background: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a metabolic disease, characterized by chronic hyperglycemia. This pathology is linked to various genes whose interaction with the environment promotes its development. The aim of this work was to determine the relationship between the rs2241766 (T/G) polymorphism of the ADIPOQ gene with type 2 diabetes in the black population. Material and Methods: This work was a case-control study, involving type 2 diabetics subjects (n = 94) and controls (n = 82). The study took place from September 2022 to September 2023. Patients were recruited in the Endocrinology Department of the Libreville University Hospital Center. Analysis was performed in the Biochemistry laboratory of the University of Health Sciences in Libreville and at the Research Institute of Health Sciences of Bobodioulasso. Genomic DNA was extracted using the protocol Qiagen kit and the PCR-RFLP method was used to determine the rs2241766 (T/G) polymorphism of the ADIPOQ gene. Results: Only 2 genotypes were found in this population, the TT genotype and the GT genotype. The proportions were not different between the two groups (p = 0.1095) neither the distribution of G and T alleles (p = 0.1095). On the other hand, the HDL hypocholesterolemia was frequent in subjects with the GT genotype compared to TT heterozygous (51.1% vs 48.9%, p = 0.0280;OR = 0.55 [0.30 - 1.01]). Conclusion: There was no association between the rs2241766 (T/G) variant of the ADIPOQ gene and the occurrence of type 2 diabetes in this population. On the other hand, a relationship between HDL hypocholesterolemia and the GT genotype has been established. 展开更多
关键词 Type 2 Diabetes Mellitus POLYMORPHISM rs2241766 adipoq PCR-RFLP
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ADIPOQ shRNA在猪前体脂肪细胞中转染体系的优化 被引量:4
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作者 李付娟 王帅 +8 位作者 朱亚楠 任久生 柳思源 徐靖博 张阳阳 孙广杰 高妍 张嘉保 陈承祯 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期616-621,626,共7页
根据Genbank提供的猪ADIPOQ基因序列及shRNA设计原则,化学合成4段编码短发夹RNA的寡核苷酸序列,将其定向克隆到pGPU6/GFP/Neo中U6启动子的下游,转化DH5α菌株,双酶切鉴定正确后进行测序,将构建好的真核表达载体转染前体脂肪细胞,并对条... 根据Genbank提供的猪ADIPOQ基因序列及shRNA设计原则,化学合成4段编码短发夹RNA的寡核苷酸序列,将其定向克隆到pGPU6/GFP/Neo中U6启动子的下游,转化DH5α菌株,双酶切鉴定正确后进行测序,将构建好的真核表达载体转染前体脂肪细胞,并对条件进行优化。限制性内切酶PstⅠ和BamHⅠ酶切显示设计合成的shRNA编码序列被成功插入pGPU6/GFP/Neo质粒中,测序结果显示插入片断与设计序列完全一致,证明重组质粒构建成功,转入到前体脂肪细胞中,可以看见绿色荧光蛋白表达。当质粒浓度0.6μg,脂质体2000是1.2μL,两者质量/体积比为l∶2时,此时转染效率最高,达到53.9%。成功构建了猪ADIPOQ基因的shRNA真核表达载体,并成功将该质粒转入猪的前体脂肪细胞中去,还对质粒与脂质体2000用量比条件进行了优化,此举能为进一步研究ADI-POQ在猪前体脂肪细胞中的功能奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 adipoq基因 SHRNA 真核表达载体 RNAI 前体脂肪细胞
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贵州地方山羊ADIPOQ基因外显子1和3多态性研究 被引量:3
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作者 孙振梅 陈祥 +3 位作者 龙威海 徐厚强 冯文武 李鹏程 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期500-505,共6页
为分析山羊ADIPOQ基因的多态性,筛选出对山羊繁殖性状有显著影响的SNPs位点,本研究以黔北麻羊和贵州黑山羊为试验对象,构建池DNA,采用PCR产物直接测序法对2个品种山羊该基因的外显子1和3进行单核苷酸多态性检测,估算各SNPs等位基因频率... 为分析山羊ADIPOQ基因的多态性,筛选出对山羊繁殖性状有显著影响的SNPs位点,本研究以黔北麻羊和贵州黑山羊为试验对象,构建池DNA,采用PCR产物直接测序法对2个品种山羊该基因的外显子1和3进行单核苷酸多态性检测,估算各SNPs等位基因频率,并利用在线软件预测不同基因型的m RNA二级结构。结果显示,4对引物扩增片段均存在多态性,共发现5个单碱基突变,分别位于内含子1中的C109G,外显子3中的A730G、G1055A、A1691T和A2244G。利用生物信息学软件对外显子3中的A1691T、A2244G进行分析,结果表明2个SNPs位点均导致编码的m RNA二级结构发生改变。表明ADIPOQ基因在黔北麻羊和贵州黑山羊群体中存在较高的遗传多样性,ADIPOQ位点有望丰富两个山羊品种繁殖性状的研究内容。 展开更多
关键词 山羊 单核苷酸多态性 adipoq 外显子
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不同猪种ADIPOQ基因外显子2多态性及其与山西白猪体重和体尺性状的关联分析 被引量:3
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作者 周胜花 赵园园 +9 位作者 王媛媛 王鹤洁 秦本源 张宁芳 乐宝玉 成志敏 高鹏飞 郭晓红 李步高 曹果清 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第12期3497-3504,共8页
本研究旨在检测猪脂联素(adiponectin,ADIPOQ)基因外显子2的多态性,并分析其对山西白猪体重和体尺性状的影响。采用PCR-SSCP技术检测了长白猪、大白猪、杜洛克猪、山西白猪、山西黑猪和马身猪6个猪种392个个体ADIPOQ基因外显子2的多态性... 本研究旨在检测猪脂联素(adiponectin,ADIPOQ)基因外显子2的多态性,并分析其对山西白猪体重和体尺性状的影响。采用PCR-SSCP技术检测了长白猪、大白猪、杜洛克猪、山西白猪、山西黑猪和马身猪6个猪种392个个体ADIPOQ基因外显子2的多态性,并采用GLM程序分析了ADIPOQ基因外显子2多态性与山西白猪体重和体尺性状的关联性。结果显示,在ADIPOQ基因外显子2的89bp处检测到G→A错义突变,引起缬氨酸(Val)向异亮氨酸(Ile)的转变。ADIPOQ基因外显子2存在3种基因型:AA、AB、BB,2个等位基因:A和B。杜洛克猪中只有BB基因型,长白猪、大白猪、山西白猪和山西黑猪中BB基因型为优势基因型,马身猪中AA基因型频率最高。在引入品种长白猪、大白猪和杜洛克猪中B等位基因为优势等位基因,基因频率分别为0.96、0.96和1.00;在地方品种马身猪中A等位基因频率(0.52)略高于B等位基因(0.48);在培育品种山西白猪和山西黑猪中B等位基因频率分别为0.76和0.78,介于引入猪种和地方品种之间。基因型频率分布在马身猪、山西白猪和山西黑猪之间无显著差异(P>0.05),杜洛克猪与长白猪、大白猪间差异均不显著(P>0.05),而长白猪和大白猪间差异显著(P<0.05),任意一个引入品种与马身猪、山西白猪和山西黑猪之间的差异均达到极显著水平(P<0.01)。ADIPOQ基因外显子2多态性对断奶重有显著影响,其中BB基因型个体28日龄断奶重显著高于AA和AB基因型(P<0.05),AA和AB基因型间无显著差异(P>0.05),但对其他性状无显著影响,说明该位点只在个体发育早期阶段起作用。 展开更多
关键词 脂联素(adipoq)基因 多态性 体重性状 体尺性状
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ADIPOQ基因单体型与不同性别绵羊生长性状的关联分析 被引量:4
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作者 安清明 周辉通 +3 位作者 刘秀 李少斌 罗玉柱 Jon G.Hickford 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期825-832,共8页
旨在探讨ADIPOQ基因单体型对绵羊生长性状的性别差异,筛选出对绵羊生长性状具有性别差异的单体型,为提高绵羊生产效率及加速遗传改良进程提供依据。本研究以1 185只新西兰罗姆尼羊(公556只,母629只)为研究对象,利用PCR-SSCP方法检测不... 旨在探讨ADIPOQ基因单体型对绵羊生长性状的性别差异,筛选出对绵羊生长性状具有性别差异的单体型,为提高绵羊生产效率及加速遗传改良进程提供依据。本研究以1 185只新西兰罗姆尼羊(公556只,母629只)为研究对象,利用PCR-SSCP方法检测不同性别绵羊中ADIPOQ基因变异及单体型分型情况。利用GLMs模型进行单体型与不同性别绵羊生长性状的关联分析。评估单体型对生长性状的表型影响效应,筛选出对绵羊生长性状具有性别差异的单体型。结果表明,绵羊ADIPOQ基因具有丰富的核苷酸变异及单体型构型,且单体型构型分布频率在不同性别绵羊中存在差异(本试验中单体型D_1-A_2及D_1-C_2只在母羔中检测到);关联分析结果表明,ADIPOQ基因单体型对绵羊生长性状的影响存在性别特异性。结果显示,存在单体型A_1-A_2的公羔群体具有较低的断尾重(P=0.033)、断奶重(P=0.020)和断奶前生长速度(P=0.026);其它单体型未发现对公羔生长性状具有显著性别特异性,且所有被检测的单体型对母羔生长性状均无显著影响。结果提示,ADIPOQ基因单体型构型分布频率在绵羊公、母羔中存在性别差异,且其对绵羊生长性状也具有性别特异性,存在单体型A_1-A_2的公羔生产性能较低,可以以此作为提高公羔生产性能的理论指导依据。 展开更多
关键词 adipoq基因 单体型 性别差异 生长性状
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UCP2-866G/A和ADIPOQ+45T/G基因多态性的交互作用与2型糖尿病合并冠心病发病风险的关系 被引量:2
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作者 索树珍 隋小芳 +2 位作者 李雪杰 杨泽 王凤玲 《现代生物医学进展》 CAS 2016年第12期2258-2263,共6页
目的:探讨UCP2-866G/A和ADIPOQ+45T/G基因多态性的交互作用与2型糖尿病合并冠心病发病风险的关系。方法:随机选取2014年10月至2015年5月在佳木斯大学附属第一医院就诊的130例单纯2型糖尿病患者和128例2型糖尿病合并冠心病患者进行病例... 目的:探讨UCP2-866G/A和ADIPOQ+45T/G基因多态性的交互作用与2型糖尿病合并冠心病发病风险的关系。方法:随机选取2014年10月至2015年5月在佳木斯大学附属第一医院就诊的130例单纯2型糖尿病患者和128例2型糖尿病合并冠心病患者进行病例对照研究。分别采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法和聚合酶链反应-高分辨率溶解曲线(PCR-HRM)方法检测UCP2-866G/A和ADIPOQ+45T/G的基因多态性,并用非条件Logistic回归分析两基因间的交互作用。结果:在两组间分别进行UCP2-866G/A和ADIPOQ+45T/G基因多态性的单独关联分析,两变异位点的基因型和等位基因的频率在两组间的分布及遗传模型关联分析均无统计学差异(P>0.05)。两变异位点联合分析发现,UCP2-866 G/A的GG、GA分别和ADIPOQ+45T/G的TG在2型糖尿病合并冠心病中存在正向交互作用(P=0.000,OR_I=OR_(AB)/(OR_A×OR_B)=30.533/(0.549×0.116)>1;P=0.007,OR_I=OR_(AB)/(OR_A×OR_B)=13.914/(0.525×0.116)>1。结论:该研究显示:UCP2-866G/A和ADIPOQ+45T/G单一基因的多态性与2型糖尿病合并冠心病患病风险无关,而两者之间的交互作用可能增加2型糖尿病合并冠心病的发病风险。 展开更多
关键词 UCP2 adipoq 基因多态性 2型糖尿病 冠心病
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绵羊脂联素基因(ADIPOQ)多态性及其与生长及胴体性状关联性分析 被引量:4
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作者 安清明 周辉通 +2 位作者 吴震洋 罗玉柱 Jon G.Hickford 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1807-1817,共11页
【目的】检测绵羊ADIPOQ基因多态性及连锁现状,评估该基因突变对绵羊生长及胴体性状的影响,以期丰富绵羊相关重要经济性状的分子遗传研究基础。【方法】以8个不同品种的商品绵羊为研究对象,利用PCR-SSCP方法检测ADIPOQ基因Exon-1区和Exo... 【目的】检测绵羊ADIPOQ基因多态性及连锁现状,评估该基因突变对绵羊生长及胴体性状的影响,以期丰富绵羊相关重要经济性状的分子遗传研究基础。【方法】以8个不同品种的商品绵羊为研究对象,利用PCR-SSCP方法检测ADIPOQ基因Exon-1区和Exon-2区变异,利用GLMs模型进行评估该基因突变对绵羊生长及胴体性状的影响。【结果】绵羊ADIPOQ基因Exon-1区和Exon-2区共检测到13个突变位点,其中Exon-2区发现的c.46T/C突变导致编码氨基酸p.Tyr16His转变。Exon-1区等位基因A1和B1为优势等位基因,Exon-2区等位基因A2和D2为优势等位基因,且两个区域的等位基因均存在种群差异,大多数品种在两个区域中的变异为中度多态(0.25<PIC<0.5),只有美利奴羊在Exon-2区为高度多态(PIC>0.5),特克塞尔、派伦代和丘陵陶塞特羊在Exon-2区为低度多态(PIC<0.25);两段区域间存在的突变位点为高度连锁,且趋向于共同遗传(D’=0.952,r2=0.365)。关联分析结果表明,ADIPOQ基因Exon-1区变异对绵羊生长性状存在性别差异,携带等位基因A1的公羔具有较低的断尾重、断奶重和断奶前生长速度(P<0.05),而携带等位基因A1的母羔却与生长性状无显著关联;携带等位基因B1的公羔与生长性状无显著关联,但携带等位基因B1的母羔却具有较高的断尾重(P<0.05);同时发现基因型为B1B1的公羔个体具有更高的断尾重和断奶重(P<0.05);胴体性状关联分析结果表明,携带等位基因A1的群体具有较低的热胴体重、腰部瘦肉量、后腿瘦肉量和总瘦肉量(P<0.05),携带等位基因B1的群体则具有较高的后腿瘦肉量、后腿瘦肉比例和较低的肩部瘦肉比例(P<0.05);基因型为B1B1的个体均有较高的热胴体重、腰部瘦肉量、后腿瘦肉量和总瘦肉量(P<0.05)。【结论】绵羊ADIPOQ基因的两段区域具有丰富的多态性,Exon-2区域中的c.46T/C为非同义突变。Exon-1区变异影响绵羊的生长性状和胴体性状,淘汰携带等位基因A1的个体和选留存在等位基因B1的个体、或留存B1B1基因型的个体和淘汰A1A1的个体,均可有效改善绵羊后代群体的部分生长性状和胴体性状。 展开更多
关键词 绵羊 adipoq 基因 性别差异 生长性状 胴体性状
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饲喂青贮桑叶对陕北白绒山羊PPARγ、ADIPOQ、aP2 mRNA表达的影响 被引量:3
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作者 侯海瑞 刘功炜 +3 位作者 王尧悦 杨雨鑫 贾亚洲 张恩平 《家畜生态学报》 北大核心 2017年第12期18-23,共6页
试验旨在研究日粮中添加不同水平的青贮桑叶对陕北白绒山羊脂肪组织(皮下脂肪、尾部脂肪、肾周脂肪)、肝脏、肌肉组织中PPARγ、ADIPOQ、aP2mRNA表达的影响。选取8~9月龄体重相近体况基本一致的陕北白绒山羊羯羊40只,随机分为4组,分别... 试验旨在研究日粮中添加不同水平的青贮桑叶对陕北白绒山羊脂肪组织(皮下脂肪、尾部脂肪、肾周脂肪)、肝脏、肌肉组织中PPARγ、ADIPOQ、aP2mRNA表达的影响。选取8~9月龄体重相近体况基本一致的陕北白绒山羊羯羊40只,随机分为4组,分别饲喂含青贮桑叶为0%(Ⅰ组),10%(Ⅱ组),15%(Ⅲ组),20%(IV组)的日粮,试验期70d,其中预试期10d,正试期60d;饲养试验结束后屠宰,取皮下脂肪、尾部脂肪、肾周脂肪、肝脏、背最长肌组织进行RT-PCR,检测上述基因mRNA表达量。结果如下,PPARγ、ADIPOQ、aP2 mRNA在陕北白绒山羊不同组织部位均有表达,PPARγ、aP2mRNA在皮下脂肪组织表达量显著高于所检测的其他组织(P<0.05),ADIPOQ mRNA在脂肪组织的表达显著高于肝脏和肌肉组织(P<0.05)。在皮下脂肪组织和肝脏,PPARγ、ADIPOQ、aP2mRNA的表达量I组显著高于其他组(P<0.05),不同添加水平的青贮桑叶对其他组织部位PPARγ、ADIPOQ、aP2mRNA的表达量的影响不一致。结果表明,饲喂青贮桑叶能显著影响陕北白绒山羊脂肪代谢相关基因mRNA的表达,青贮桑叶可以作为潜在的具有降脂功效的饲料补充料添加到山羊饲料中以调节脂肪沉积改善肉品质。 展开更多
关键词 青贮桑叶 陕北白绒山羊 PPARΓ adipoq aP2
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贵州白山羊ADIPOQ基因生物信息及组织表达特异性分析 被引量:5
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作者 安清明 王星 +4 位作者 黄永震 孟金柱 赵园园 田秀珍 吴震洋 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第8期84-90,共7页
为明确贵州白山羊ADIPOQ基因及其编码蛋白的结构及功能,本实验通过PCR技术拼接白山羊外显子序列,分析其生物信息学特征及在公母羊不同组织中的表达特点。结果表明:白山羊ADIPOQ基因CDS区长720 bp、编码239个氨基酸,编码蛋白为水溶性蛋白... 为明确贵州白山羊ADIPOQ基因及其编码蛋白的结构及功能,本实验通过PCR技术拼接白山羊外显子序列,分析其生物信息学特征及在公母羊不同组织中的表达特点。结果表明:白山羊ADIPOQ基因CDS区长720 bp、编码239个氨基酸,编码蛋白为水溶性蛋白,相对分子量为25 955.14 ku,理论等电点为5.96,且存在17个氨基酸的信号肽区,不属于跨膜蛋白,但属于分泌蛋白,含有16个磷酸化位点,具有1个C1Q保守结构域,主要与ADIPOR1、ADIPOR2、CDH13及LEP蛋白进行信息互作,系统进化分析结果与亲缘关系远近一致。实时荧光定量检测表明,ADIPOQ基因在白山羊各组织中均有表达,其中ADIPOQ基因在肺的表达量最高,其次是脾、心和肝,在肾中表达量较低,且这种表达存在性别差异,ADIPOQ基因在母羊脾脏、肺脏和心脏组织中的表达量较高,而在公羊的肝脏和肾脏中表达量较高。本研究通过对贵州白山羊ADIPOQ基因、编码蛋白的生物信息学及不同组织表达分析,预测了ADIPOQ蛋白分子作用及功能,为进一步分析ADIPOQ基因在白山羊脂肪累积过程中的功能奠定了理论基础。 展开更多
关键词 贵州白山羊 adipoq基因 生物信息 性别差异 组织表达
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绵羊ADIPOQ多态性与生长性状的关联分析 被引量:3
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作者 梁鹏 张天闻 +5 位作者 孟科 邵顺成 邹诗凡 荣轩 强浩 冯登侦 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期2239-2256,共18页
【目的】探讨ADIPOQ遗传变异对绵羊生长性状的影响,找到与宁夏优质肉羊培育中生长性状相关的分子遗传标记,为宁夏优质肉羊的分子辅助育种的研究提供依据。【方法】首先利用液相捕获测序技术获得ADIPOQ在杜泊羊、滩羊和小尾寒羊中的变异... 【目的】探讨ADIPOQ遗传变异对绵羊生长性状的影响,找到与宁夏优质肉羊培育中生长性状相关的分子遗传标记,为宁夏优质肉羊的分子辅助育种的研究提供依据。【方法】首先利用液相捕获测序技术获得ADIPOQ在杜泊羊、滩羊和小尾寒羊中的变异位点,同时采集383只3个品种的不同杂交后代群体耳组织,采用飞行质谱技术对确定的SNPs位点进行基因分型检测,并使用Haploview软件对多态性位点进行连锁不平衡分析和构建单倍型,与绵羊初生和3月龄的生长性状进行关联分析。【结果】共筛选到7个SNPs位点,且7个位点在杂交后代群体中均表现出多态性,SNP1—SNP7位点的优势基因型分别为CC、GG、GG、CT、AG、GG和AA,优势等位基因分别为C、G、G、C、G、G和A。X^(2)检验发现,所有位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(除SNP7位点在所有个体中偏离了平衡)。SNP1(F_(2)代除外)、SNP4、SNP5和SNP6位点在各杂交后代及所有个体中均处于中度多态(0.25≤PIC<0.50),SNP2和SNP3在F_(2)代及SNP7在H_(1)代群体中均处于中度多态(0.25≤PIC<0.50),而在其他群体中处于低度多态(PIC<0.25)。连锁不平衡分析发现,SNP2-SNP3和SNP5-SNP6形成了两处强连锁,均构建出3种单倍型,组合后分别形成4和6种基因型,其中优势基因型分别为H_(1)H_(1)和H4H6。将SNP2-SNP3和SNP5-SNP6形成的单倍型再组合后产生13种基因型,其优势基因型为H_(1)H_(1)H4H6。单个位点关联分析表明:SNP1位点在F_(1)代群体中,GG基因型的初生胸围显著高于CG基因型(P<0.05),在H_(2)代群体中,CC基因型的初生体斜长显著高于CG基因型(P<0.05)。SNP2位点在H_(1)代群体中,CC基因型的初生体高显著低于CG和GG基因型(P<0.05)。SNP3位点在F_(1)代群体中,AG基因型的3月龄体重显著高于GG基因型(P<0.05),在H_(1)代群体中,AA基因型的初生体高显著低于AG和GG基因型(P<0.05)。SNP4位点在F_(1)代群体中,CC基因型的3月龄体重显著高于CT和TT基因型(P<0.05),在F_(2)代群体中,CT基因型的初生体重和初生胸围显著高于TT基因型(P<0.05),在H_(1)代群体中,TT基因型的初生体重显著低于CC和CT基因型(P<0.05),在H_(2)代群体中,TT基因型的初生体高和初生体斜长显著高于CT基因型(P<0.05)。SNP5位点在F_(2)代群体中,AA基因型的初生体高和初生体斜长显著高于GG基因型(P<0.05)。SNP6位点的不同基因型在F_(2)代、H_(1)代和H_(2)代的初生体重、体高、体斜长、3月龄体高和胸围上均有不同程度的显著差异(P<0.05)。SNP7位点在H_(2)代群体中,AA基因型的初生体斜长显著高于GA基因型(P<0.05)。联合所有群体进行分析时发现,SNP2位点CG基因型的初生体重和体斜长显著高于GG基因型(P<0.05),SNP4位点TT基因型的初生体重显著低于CC和CT基因型(P<0.05),SNP6位点AA基因型的初生体重显著高于GG和GA基因型(P<0.05)、初生胸围显著高于GG基因型(P<0.05),其他5个位点的基因型在生长性状上均无显著差异(P>0.05)。单倍型组合关联分析发现:H_(2)H3基因型的初生体重和初生体斜长显著高于其他基因型(P<0.05);而SNP5-SNP6单倍型组合中,H5H5基因型的初生体重显著高于H5H6和H6H6(P<0.05)、初生体高显著高于H5H6(P<0.05)、初生胸围显著高于H6H6(P<0.05),H4H4基因型的3月龄体重显著高于H5H5基因型(P<0.05)、3月龄体高和体斜长显著高于H4H6基因型(P<0.05)、3月龄胸围显著高于H4H5、H5H6和H5H5基因型(P<0.05)。SNP2-SNP3和SNP5-SNP6形成的单倍型再组合后,H_(2)H3H4H4基因型的初生体重、体高、体斜长和胸围最高,与其他基因型有不同程度的差异,H_(1)H_(1)H4H6的3月龄体斜长显著低于H_(1)H_(2)H4H4和H_(2)H_(2)H4H4基因型(P<0.05)。【结论】ADIPOQ的遗传变异对绵羊的生长性状具有不同程度的影响,研究中的7个SNPs位点可以作为宁夏优质肉羊选育中生长性状的潜在分子标记。 展开更多
关键词 绵羊 adipoq 多态性 生长性状 单倍型
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贵州黑山羊ADIPOQ基因组织表达分析及脂肪中表达规律研究 被引量:3
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作者 杨洋 陈浩林 +1 位作者 徐敏 倪锴 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第10期56-59,共4页
本实验旨在探究ADIPOQ基因在贵州黑山羊不同组织中的表达谱和在不同月龄脂肪组织中的表达规律。采用qRT-PCR检测了贵州黑山羊8个组织样(心、肝、脾、肺、肾、胃、背最长肌和脂肪组织)及5个不同时期(1、3、6、9、12月龄)脂肪组织中ADIPO... 本实验旨在探究ADIPOQ基因在贵州黑山羊不同组织中的表达谱和在不同月龄脂肪组织中的表达规律。采用qRT-PCR检测了贵州黑山羊8个组织样(心、肝、脾、肺、肾、胃、背最长肌和脂肪组织)及5个不同时期(1、3、6、9、12月龄)脂肪组织中ADIPOQ基因的表达量。结果表明:ADIPOQ基因在黑山羊8个组织中均有表达,其中在脂肪组织的表达量最高,肾脏中表达量最低;时序表达结果表明ADIPOQ基因总体表达趋势为先增加再减少,其中在6月龄表达量最高,在12月龄表达量最低。说明ADIPOQ基因对贵州黑山羊脂肪代谢具有一定的调控作用,或可作为研究黑山羊肉质品质的候选基因。 展开更多
关键词 黑山羊 adipoq基因 表达规律 脂肪代谢
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Association between ADIPOQ gene polymorphisms and the risk of new-onset diabetes mellitus after liver transplantation 被引量:6
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作者 Chao Cen Hai-Xing Fang +5 位作者 Song-Feng Yu Ji-Min Liu Yuan-Xing Liu Lin Zhou Jun Yu Shu-Sen Zheng 《Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International》 SCIE CAS CSCD 2017年第6期602-609,共8页
BACKGROUND:New-onset diabetes after transplantation(NODAT) has become one of the major factors that affect the overall survival and long-term life quality in liver transplantation(LT) recipients. Previous studies foun... BACKGROUND:New-onset diabetes after transplantation(NODAT) has become one of the major factors that affect the overall survival and long-term life quality in liver transplantation(LT) recipients. Previous studies found that the serum adiponectin concentration of diabetic patients is significantly lower than that of healthy subjects. Adiponectin regulates the blood glucose level by increasing body sensitivity to insulin through various mechanisms. In this study, we aimed to investigate the impact of diabetes related gene polymorphisms on the development of NODAT in liver recipients.METHODS:A total of 256 LT patients in a single-center were selected retrospectively for the study. Genomic DNA was extracted from explanted liver tissues, and tested for twelve diabetes mellitus associated single nucleotide polymorphisms by Sequenom Mass ARRAY. Modified clinical models in predicting NODAT were established and evaluated.RESULTS:The GG genotype of ADIPOQ rs1501299 gene polymorphism was significantly more frequent in NODAT than non-NODAT LT patients(56% vs 39%, P=0.014). Dominant model(GG vs GT+TT, P=0.030) and recessive model(GT+GG vs TT, P=0.005) also confirmed the genotype distribution difference between NODAT and non-NODAT groups. Age(OR=1.048, P=0.004), BMI(OR=1.107, P=0.041), and blood tacrolimus level at 1-month LT(OR=1.170, P=0.003) were clinical independent risk factors of NODAT. Furthermore, rs1501299 could improve the ability of clinical model in predicting NODAT(AUROC=0.743, P<0.001).CONCLUSION:ADIPOQ rs1501299 gene polymorphism is associated with an increased risk of NODAT, which should be added to the clinical models in predicting the occurrence of NODAT in LT recipients. 展开更多
关键词 adipoq gene polymorphisms diabetes mellitus liver transplantation
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ADIPOQ基因多态性与前列腺癌易感性的相关性研究 被引量:6
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作者 顾成元 吴俊龙 +5 位作者 朱煜 许华 秦晓健 朱耀 戴波 叶定伟 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期665-670,共6页
背景与目的:环境因素在前列腺癌发病机制中的作用,尤其是高脂肪摄入饮食、缺乏体力活动等引起的肥胖逐渐受到重视。脂联素可能是前列腺癌与肥胖之间潜在的分子递质,本研究旨在探讨编码脂联素的ADIPOQ基因多态性与中国人群前列腺癌发病... 背景与目的:环境因素在前列腺癌发病机制中的作用,尤其是高脂肪摄入饮食、缺乏体力活动等引起的肥胖逐渐受到重视。脂联素可能是前列腺癌与肥胖之间潜在的分子递质,本研究旨在探讨编码脂联素的ADIPOQ基因多态性与中国人群前列腺癌发病风险的关联性。方法:提取917例前列腺癌患者和1 036例正常对照男性的外周血DNA,通过TaqMan探针技术检测ADIPOQ基因rs266729和rs182052的多态性。采用Logistic回归模型分析各基因型与前列腺癌发病风险的关系,在此基础上分析其与体质量指数的关系。结果:对照组中rs266729和rs182052两位点的基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P=0.29和0.83)。rs266729和rs182052两位点各基因型在两组间的分布差异无统计学意义(P=0.88和0.63)。与野生型相比,两位点的杂合型及突变型携带者患病风险差异无统计学意义(OR=0.97,95%CI:0.81~1.16;OR=0.89,95%CI:0.73~1.09)。分层分析显示,在年龄≤69岁的人群中,rs182052 AA基因型携带者的前列腺癌发病风险仅为AG或GG基因型携带者的73%(95%CI:0.54~0.99),差异有统计学意义(P=0.04)。rs182052遗传变异与体质量指数相关(P=0.03)。结论:ADIPOQ基因rs266729和rs182052可能与中国人群前列腺癌总体发病风险无关,rs182052 AA基因型携带者≤69岁时发病风险较低,并且该位点的遗传变异与前列腺癌患者的体质量指数相关。 展开更多
关键词 adipoq 基因多态性 前列腺癌
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Genetic variations of the ADIPOQ gene and risk of prostate cancer in Chinese Han men 被引量:3
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作者 Cheng-Yuan Gu 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2014年第6期878-883,共6页
Adiponectin secreted by adipose tissue has been implicated in prostate carcinogenesis. Genetic variations in ADIPOQare thought to influence the activity of adiponectin, thus relating to cancer occurrence. In this hosp... Adiponectin secreted by adipose tissue has been implicated in prostate carcinogenesis. Genetic variations in ADIPOQare thought to influence the activity of adiponectin, thus relating to cancer occurrence. In this hospital-based case-control study of 917 prostate cancer (PCa) cases and 1036 cancer-free controls, we evaluated the association of single nucleotide polymorphisms in ADIPOQ with risk of PCa and adiponectin levels in Chinese Han men. Variants of ADIPOQ were genotyped by Taqman polymerase chain reaction method. The plasma adiponectin concentrations were measured by enzyme.linked immunosorbent assay (ELISA) in a subset of cases and controls. We found that the ADIPOQ rs3774262 variant AA genotype was associated with both decreased PCa risk [adjusted odds ratio (OR): 0.66, 95% confidence interval (CI) =0.48-0.92] and increased plasma adiponectin levels (P= 0.036 and 0,043), with significant difference by tumor grade, clinical stage, and aggressiveness. A significant interaction between ADIPOQ rs3774262 and body mass index was observed in modifying the risk of PCa (P=6.7 × 10-3). ADIPOQ rs266729 and rs182052 were not related to PCa risk or plasma adiponectin levels. Our data support that ADIPOQ rs3774262 may affect PCa risk in combination with plasma adiponectin levels in Chinese Han men. It may contribute to the molecular basis for the association between obesity and PCa. 展开更多
关键词 ADIPONECTIN adipoq POLYMORPHISM prostate cancer
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Association of the ADIPOQ Rs2241766 and Rs266729 Polymorphisms with Metabolic Syndrome in the Chinese Population:A Meta-analysis 被引量:3
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作者 ZHOU Jun Mei ZHANG Ming +8 位作者 WANG Shu WANG Bing Yuan HAN Cheng Yi REN Yong Cheng ZHANG Lu ZHANG Hong Yan YANG Xiang Yu ZHAO Yang HU Dong Sheng 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2016年第7期505-515,共11页
Objective This meta-analysis was performed to summarize the association of the ADIPOQ rs2241766 and rs266729 polymorphisms with metabolic syndrome(MS) in the Chinese population.Methods We searched for articles in ME... Objective This meta-analysis was performed to summarize the association of the ADIPOQ rs2241766 and rs266729 polymorphisms with metabolic syndrome(MS) in the Chinese population.Methods We searched for articles in MEDLINE via PubM ed,EMBASE,HuG E Navigator,CNKI,and Wanfang databases and calculated odds ratios(ORs) with 95% confidence intervals(CIs) to determine the strength of associations in fixed-or random-effects models.Results We included 21 articles in the meta-analysis:17 reports of ADIPOQ rs2241766 with 3628 cases and 3000 controls and 8 of rs266729 with 2021 cases and 2226 controls.We found an increased risk of MS with the ADIPOQ rs2241766 polymorphism in some genetic models(allele model:OR=1.12,95% CI:1.03-1.21;dominant model:OR=1.15,95% CI:1.04-1.28;homozygote model:OR=1.22,95% CI:1.00-1.49) but no association with the ADIPOQ rs266729 polymorphism(allele model:OR=0.98,95% CI:0.82-1.17;dominant model:OR=0.90,95% CI:0.79-1.02;recessive model:OR=1.09,95% CI:0.85-1.39;homozygote model:OR=1.03,95% CI:0.80-1.33).Conclusion The results of this meta-analysis suggest an association between the ADIPOQ rs2241766 polymorphism and MS in the Chinese population.G allele of ADIPOQ rs2241766 increases the risk of MS.Better designed studies with different ethnic populations and larger sample sizes are needed for assessing the relationship between ADIPOQ rs2241766 and rs266729 polymorphisms and MS in the future. 展开更多
关键词 adipoq POLYMORPHISMS Metabolic syndrome META-ANALYSIS
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Profiling of N6-methyladenosine methylation in porcine longissimus dorsi muscle and unravelling the hub gene ADIPOQ promotes adipogenesis in an m^(6)A-YTHDF1–dependent manner 被引量:3
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作者 Huanfa Gong Tao Gong +2 位作者 Youhua Liu Yizhen Wang Xinxia Wang 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2023年第3期950-965,共16页
Background Intramuscular fat(IMF)content is a critical indicator of pork quality,and abnormal IMF is also relevant to human disease as well as aging.Although N6-methyladenosine(m^(6)A)RNA modification was recently fou... Background Intramuscular fat(IMF)content is a critical indicator of pork quality,and abnormal IMF is also relevant to human disease as well as aging.Although N6-methyladenosine(m^(6)A)RNA modification was recently found to regulate adipogenesis in porcine intramuscular fat,however,the underlying molecular mechanisms was still unclear.Results In this work,we collected 20 longissimus dorsi muscle samples with high(average 3.95%)or low IMF content(average 1.22%)from a unique heterogenous swine population for m^(6)A sequencing(m^(6)A-seq).We discovered 70genes show both differential RNA expression and m^(6)A modification from high and low IMF group,including ADIPOQ and SFRP1,two hub genes inferred through gene co-expression analysis.Particularly,we observed ADIPOQ,which contains three m^(6)A modification sites within 3’untranslated and protein coding region,could promote porcine intramuscular preadipocyte differentiation in an m^(6)A-dependent manner.Furthermore,we found the YT521-B homology domain family protein 1(YTHDF1)could target and promote ADIPOQ mRNA translation.Conclusions Our study provided a comprehensive profiling of m^(6)A methylation in porcine longissimus dorsi muscle and characterized the involvement of m^(6)A epigenetic modification in the regulation of ADIPOQ mRNA on IMF deposition through an m^(6)A-YTHDF1-dependent manner. 展开更多
关键词 adipoq Intramuscular fat N6-methyladenosine PIG YTHDF1
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广东汉族人群ADIPOQ基因rs266729位点单核甘酸多态性与2型糖尿病遗传易感性研究 被引量:2
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作者 于海兵 闫妍 +7 位作者 巫舢 何小艺 胡维 潘海燕 孔丹莉 林子牛 朱萧 丁元林 《中国糖尿病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期481-485,共5页
目的探讨广东地区汉族人群内ADIPOQ基因内rs266729位点与T2DM的遗传易感性的关系。方法采用病例对照研究方案,通过SNPscan TM单核苷酸多态性(SNP)分型技术检测T2DM患者(T2DM组)和正常对照组(NC组)ADIPOQ基因内rs266729位点的基因型。将... 目的探讨广东地区汉族人群内ADIPOQ基因内rs266729位点与T2DM的遗传易感性的关系。方法采用病例对照研究方案,通过SNPscan TM单核苷酸多态性(SNP)分型技术检测T2DM患者(T2DM组)和正常对照组(NC组)ADIPOQ基因内rs266729位点的基因型。将问卷信息、一般资料及生化指标结果与SNP数据整合,进行数据处理,并对基因型及等位基因频率在两组中的分布进行分析。结果单位点基因关联分析发现,ADIPOQ基因内rs2667292位点满足Hardy-Weinberg平衡。ADIPOQ基因rs266729位点C、G等位基因在T2DM组与NC组的分布依次为74.1%、75.1%、25.9%、24.9%,C、G等位基因分布及SNP的基因型分布,差异无统计学意义(P>0.05)。比较遗传模型,调整协变量前后,两组rs266729位点在共显性、显性、隐性及超显性遗传模型下差异均无统计学意义(P>0.05)。结论广东地区汉族人群T2DM患者遗传易感性可能与ADIPOQ基因rs266729位点单核苷酸多态性无关。 展开更多
关键词 糖尿病 2型 adipoq基因 rs266729 单核苷酸多态性
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