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牛ACAA1和ACAA2基因多态性及其与生产性状的关联分析 被引量:8
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作者 李恒德 王淑辉 +3 位作者 许尚忠 高雪 任红艳 陈金宝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期696-700,共5页
以鲁西牛、秦川牛、安格斯、海福特和西门塔尔与蒙古牛杂交牛5个品种共178头为试验材料,通过等位基因特异性聚合酶链式反应(AS-PCR)技术,发现牛乙酰辅酶A酰基转移酶1(ACAA1)基因的A1066G(GenBank登录号:EF576938)和A1452G(GenBank登录号... 以鲁西牛、秦川牛、安格斯、海福特和西门塔尔与蒙古牛杂交牛5个品种共178头为试验材料,通过等位基因特异性聚合酶链式反应(AS-PCR)技术,发现牛乙酰辅酶A酰基转移酶1(ACAA1)基因的A1066G(GenBank登录号:EF576938)和A1452G(GenBank登录号:EF576938)2个单核苷酸多态(SNP),其中A1066G突变位于外显子9,是同义突变,A1452G突变位于3′非翻译区(UTR);发现牛乙酰辅酶A酰基转移酶2(ACAA2)基因的C33119T(GenBank登录号:EF583005)单核苷酸多态,位于内含子8上。对ACAA1基因的2个SNP进行分析没有发现单倍型。2个基因多态性与牛生长性状的关联分析表明:ACAA1基因A1066G突变位点的3种基因型间眼肌面积差异显著(P<0.05),AA型最高,AG型次之,GG型最低;ACAA1基因A1452G突变位点的3种基因型间眼肌面积差异显著(P<0.05),GG型最高,AG型次之,AA型最低;ACAA2基因C33119T突变3种基因型间日增重差异极显著(P<0.01),其中CT型最高,TT型次之,CC型最低;眼肌面积差异显著(P<0.05),其中CC型最高,TT型次之,CT型最低。 展开更多
关键词 ACAA1 acaa2 AS-PCR 生产性状
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牦牛ACAA2基因克隆及组织表达分析 被引量:12
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作者 陈美 柴志欣 +5 位作者 武志娟 王会 王吉坤 王嘉博 钟金城 信金伟 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期51-57,共7页
为获得牦牛ACAA2基因CDS区序列,研究该基因在牦牛不同组织中表达情况。利用RT-PCR方法克隆类乌齐牦牛ACAA2基因CDS序列并分析生物信息学,荧光定量PCR(qPCR)方法检测ACAA2基因在麦洼牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌和臀肌组织中... 为获得牦牛ACAA2基因CDS区序列,研究该基因在牦牛不同组织中表达情况。利用RT-PCR方法克隆类乌齐牦牛ACAA2基因CDS序列并分析生物信息学,荧光定量PCR(qPCR)方法检测ACAA2基因在麦洼牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌和臀肌组织中表达情况。结果表明,ACAA2基因CDS序列全长为1194 bp,开放阅读框为1101 bp(GenBank登录号:MT861180),共编码366个氨基酸;同源性比对分析显示,牦牛和黄牛亲缘关系最近,其次是马,其ACAA2基因核苷酸序列同源性分别达92.0%和88.7%;ACAA2蛋白亲水性平均值为-0.127,不稳定指数(Ⅱ)为40.88,为不稳定蛋白;无信号肽和跨膜结构,属于非分泌蛋白;存在14个丝氨酸(Ser)、10个苏氨酸(Thr)和4个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点;组织表达分析显示,ACAA2基因在牦牛肾脏和肝脏组织中表达差异极显著,在胸肌和臀肌中表达量最低。研究为初步探究ACAA2基因在牦牛脂肪代谢中作用提供理论依据。 展开更多
关键词 牦牛 acaa2基因 克隆 组织表达
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数据库挖掘ACAA2基因在卵巢癌中的表达及血根碱对其水平的影响 被引量:1
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作者 倪娜 杨艳 +2 位作者 张琴 冷天艳 杨丽华 《肿瘤预防与治疗》 2020年第5期408-413,共6页
目的:卵巢癌是女性生殖系统常见恶性肿瘤,死亡率居高不下且预后差。血根碱是白屈菜中的主要活性成分之一,具有潜在的抗癌作用。本研究通过Oncomine数据库挖掘乙酰辅酶A酰基转移酶2(acetyl-Coenzyme A acyltransferase 2,ACAA2)在浆液性... 目的:卵巢癌是女性生殖系统常见恶性肿瘤,死亡率居高不下且预后差。血根碱是白屈菜中的主要活性成分之一,具有潜在的抗癌作用。本研究通过Oncomine数据库挖掘乙酰辅酶A酰基转移酶2(acetyl-Coenzyme A acyltransferase 2,ACAA2)在浆液性卵巢癌中的表达情况及其临床意义,并在体外实验中探究血根碱对卵巢癌细胞ACAA2水平的影响。方法:获取并二次分析Oncomine数据库中ACAA2的信息,探讨ACAA2在浆液性卵巢癌中的表达,借助Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存分析,探讨其与卵巢癌患者预后的关系。血根碱处理人浆液性卵巢癌SKOV3细胞,基因芯片检测,获得差异表达基因,探讨血根碱对卵巢癌SKOV3细胞ACAA2基因表达的影响。结果:Oncomine数据库中共收录了447项ACAA2基因在不同类型肿瘤中的研究数据,其中9项超过1 500个样本涉及卵巢癌的研究。与正常卵巢组织相比,ACAA2在浆液性卵巢癌中表达降低差异有统计学意义(P<0.05)。ACAA2高表达者总体生存率高于低表达者(P<0.05)。血根碱处理后卵巢癌SKOV3细胞中ACAA2表达水平显著上调(|logFC|≥2,FDR<0.05,P<0.05)。结论:浆液性卵巢癌组织中ACAA2表达降低,表达水平高者预后更好,可能发挥抑癌基因的作用,血根碱可能通过上调ACAA2基因发挥作用。 展开更多
关键词 浆液性卵巢癌 acaa2 Oncomine数据库 血根碱
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