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狭缝引导配体1-3’非翻译区抑制心肌成纤维细胞纤维化表型的作用
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作者 王娅 伍华燕 +5 位作者 高原 吴茹诗 关佩莹 李晖 方俊涛 单志新 《中山大学学报(医学科学版)》 北大核心 2025年第3期466-474,共9页
【目的】研究狭缝引导配体1(Slit1)的3’非翻译区序列部分片段(Slit1-3’UTR)对心肌成纤维细胞的纤维化表型的调节作用和可能机制。【方法】利用腺病毒介导在ICR乳小鼠心肌成纤维细胞(mCFs)中过表达Slit1-3’UTR 1526nt序列(Slit1-3’UT... 【目的】研究狭缝引导配体1(Slit1)的3’非翻译区序列部分片段(Slit1-3’UTR)对心肌成纤维细胞的纤维化表型的调节作用和可能机制。【方法】利用腺病毒介导在ICR乳小鼠心肌成纤维细胞(mCFs)中过表达Slit1-3’UTR 1526nt序列(Slit1-3’UTR 1526nt),使用蛋白质免疫印迹技术评估mCFs中胶原Iα1/(COL1A1)、胶原IIIα1/(COL3A1)、α平滑肌肌动蛋白(α-SMA)等纤维化相关基因的表达水平,结合EdU和Trans-well实验评估对mCFs增殖和迁移能力的影响。利用血管紧张素II(AngⅡ)处理mCFs,检测Slit1-3’UTR 1526nt对于AngⅡ处理mCFs中纤维化表型的影响。过表达Slit1-3’UTR 1526nt后转染miR-34a-5p的类似物,放线菌素D干预实验检测Slit1-3’UTR 1526nt的mRNA的稳定性。过表达Slit1-3’UTR 1526nt检测mCFs中miR-34a-5p及其靶基因SIRT1的水平。分别转染miR-34a-5p和靶向SIRT1基因的小干扰RNA(si-SIRT1),检测对Slit1-3’UTR 1526nt调控mCFs纤维化表型的影响。【结果】利用腺病毒可在mCFs中有效介导过表达Slit1-3’UTR 1526nt,过表达Slit1-3’UTR1526nt可显著抑制mCFs纤维化基因的表达和mCFs增殖、迁移能力,抑制AngⅡ诱导mCFs的纤维化表型。放线菌素D实验结果显示转染miR-34a-5p降低mCFs中Slit1-3’UTR1526nt的稳定性,而过表达Slit1-3’UTR 1526nt时mCFs中miR-34a-5p水平降低。转染miR-34a-5p可促纤维化表型,并可逆转Slit1-3’UTR 1526nt对mCFs纤维化表型的抑制作用。在mCFs中过表达Slit1-3’UTR 1526nt显著升高miR-34a-5p靶基因SIRT1水平,在mCFs中分别转染miR-34a-5p和siRNA可一致性地逆转Slit1-3’UTR 1526nt抑制mCFs的纤维化表型。【结论】Slit1-3’UTR1526nt通过特异结合miR-34a-5p并增加其靶基因SIRT1表达发挥抑制mCFs纤维化表型的作用。 展开更多
关键词 心肌纤维化 狭缝引导配体1(Slit1) 3’非翻译区(3’UTR) 微RNA 心肌成纤维细胞
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双乾肉羊SERPINA1基因3’UTR区多态性及与肉质性状关联研究
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作者 李欣 刘昕昕 +8 位作者 缪立生 杨少滢 马惠海 曹阳 阮洪玲 唐于鑫 张喜路 肖艳华 赵中利 《东北农业科学》 2025年第5期109-114,共6页
本文研究SERPINA1基因多态性对绵羊肉质品质的影响,试验选取49只8月龄的双乾肉羊作为研究对象,筛查SERPINA1基因3’UTR区的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)位点,并测定其肉质性状,分析SNPs与双乾肉羊肉质性状间... 本文研究SERPINA1基因多态性对绵羊肉质品质的影响,试验选取49只8月龄的双乾肉羊作为研究对象,筛查SERPINA1基因3’UTR区的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)位点,并测定其肉质性状,分析SNPs与双乾肉羊肉质性状间的关联性。结果表明,SERPINA1基因3’UTR区第33位碱基存在A>G突变。该位点的遗传纯合度(Ho)为0.5408,有效等位基因数(Ne)为1.8491,多态信息含量(PIC)为0.3538,处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),属于中度多态。在肉质性状方面,该群体中GG基因型个体的肉嫩度显著高于AA基因型个体和AG基因型个体。由此可见,绵羊SERPINA1基因的3’UTR区A33G等位基因多态性与双乾肉羊肉嫩度显著相关,该位点有助于早期筛选出具有优良肉质的绵羊个体,从而提高优质肉羊选育速度,节约饲养成本。 展开更多
关键词 SERPINA1基因 3’UTR 双乾肉羊 肉质性状 SNP
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猪体外胚胎第一次卵裂前后3′UTR组的动态变化
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作者 刘小英 王昕昕 +2 位作者 赵晗 杜志强 杨彩侠 《畜牧与兽医》 北大核心 2025年第6期13-19,共7页
旨在分析猪体外受精(IVF)和孤雌激活(PA)胚胎第一次卵裂前后mRNA的3′UTR组动态变化,为进一步试验揭示3′UTR转录后调控母源mRNAs的降解分子机制提供参考。利用课题组获得的猪IVF和PA来源的1-细胞与2-细胞期胚胎的单细胞RNA-seq(scRNA-s... 旨在分析猪体外受精(IVF)和孤雌激活(PA)胚胎第一次卵裂前后mRNA的3′UTR组动态变化,为进一步试验揭示3′UTR转录后调控母源mRNAs的降解分子机制提供参考。利用课题组获得的猪IVF和PA来源的1-细胞与2-细胞期胚胎的单细胞RNA-seq(scRNA-seq)数据集,使用DaPars软件分析鉴定3′UTRs有差异的mRNAs并对其参与的信号通路进行富集,筛选差异较大的mRNAs,对其3′UTRs进行整合基因组浏览器(IGV)可视化分析,进一步筛选3′UTRs平均长度在卵裂前后有显著差异的mRNAs,对其3′UTRs中存在的胞质多聚腺苷酸化元件(CPE)、多聚腺苷酸化信号(PAS)、microRNA结合位点和m6A位点等顺式功能元件进行预测。结果:猪IVF和PA胚胎第一次卵裂前后分别有207和117个mRNAs的3′UTRs显著差异(P<0.05),这些mRNAs分别参与不同的基因本体分析(GO)和京都基因与基因组百科全书分析(KEGG)通路;进一步分析表明,猪IVF胚胎第一次卵裂前后的核转运蛋白α3(KPNA3),猪PA胚胎第一次卵裂前后的高迁移率族蛋白B1(HMGB1)、酪蛋白激酶1γ3亚型(CSNK1G3)和Ras结合结构域家族成员3(RASSF3)的3′UTRs的平均长度差异大于90 nt;这4个mRNAs 3′UTRs中包含的CPE和PAS,KPNA3和CSNK1G33′UTRs中包含的microRNA结合位点,以及CSNK1G33′UTRs中包含的m6A位点的位置、个数和种类存在差异。综上,猪IVF和PA胚胎第一次卵裂前后众多mRNAs的3′UTRs发生了显著的变化,猪IVF胚胎组的KPNA3,PA胚胎组的HMGB1、CSNK1G3和RASSF33′UTRs的平均长度在第一次卵裂前后差异较大,这些mRNAs的丰度可能受到3′UTRs中包含的功能元件差异的调控。 展开更多
关键词 体外受精胚胎 孤雌激活胚胎 DaPars 3′UTR组
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日本脑炎病毒非经典翻译起始调控的分子机制
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作者 《中国兽医科学》编辑部 李燕华 《中国兽医科学》 北大核心 2025年第10期1419-1420,共2页
日本脑炎病毒(Japanese encephalitis virus)作为严格的活细胞内“寄生”生物,依靠宿主翻译系统完成自身病毒蛋白合成。JEV感染会触发宿主翻译关闭(host shutoff),这是宿主限制病毒感染的一种自我保护机制。在此情况下,JEV能够利用一种... 日本脑炎病毒(Japanese encephalitis virus)作为严格的活细胞内“寄生”生物,依靠宿主翻译系统完成自身病毒蛋白合成。JEV感染会触发宿主翻译关闭(host shutoff),这是宿主限制病毒感染的一种自我保护机制。在此情况下,JEV能够利用一种不依赖Ⅰ型帽子结构的非经典翻译起始策略,从而逃逸宿主翻译关闭以抵抗宿主的抗病毒作用。2025年5月8日,扬州大学兽医学院李燕华教授团队在Advanced Science上发表了题为“DDX3 regulates the cap-independent translation of the Japanese encephalitis virus via its interactions with PABP1 and the untranslated regions of the viral genome ”的研究论文,首次揭示了日本脑炎病毒经5′/3′UTR调控非经典翻译起始的分子机制,增强了对正黄病毒在宿主翻译关闭状态下翻译起始调控的理解。 展开更多
关键词 日本脑炎病毒(JEV) 非经典翻译起始 5′/3′UTR
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不同代次广西巴马小型猪内源性反转录病毒3′UTR克隆及结构和调控元件分析 被引量:2
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作者 欧阳康 邓世杰 +3 位作者 吴健敏 陈凤莲 张启模 郭亚芬 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1169-1174,共6页
利用CDNA末端快速扩增技术(RACE)成功扩增了广西巴马小型猪近交系连续4代次及封闭群的猪内源性反转录病毒(PERV)3UTR,共获得8条序列(GenBank登录号分别为:GQ475493、GQ475494、GQ475495、GQ475496、GQ475497、GQ475498、GQ475499、GQ475... 利用CDNA末端快速扩增技术(RACE)成功扩增了广西巴马小型猪近交系连续4代次及封闭群的猪内源性反转录病毒(PERV)3UTR,共获得8条序列(GenBank登录号分别为:GQ475493、GQ475494、GQ475495、GQ475496、GQ475497、GQ475498、GQ475499、GQ475500),分为638、749bp 2种不同的类型,都属于PERV-A亚型。以PERV-3UTR构建遗传进化树,PERV-A,B,C分群清晰,3UTR可作为PERV亚型区分的另一基因序列。对调控元件定位分析,推测具有749bp类型3UTR的PERV病毒转录水平更高。在所获得序列的209~227bp位置,发现了"CTTGAAACTT"10个碱基的1.9个重复。模拟RNA二级结构,广西巴马小型猪PERV-3UTR 2种类型无论从空间构型、自由能,还是茎环数量都存在明显的不同。这些结果为全面评价广西巴马小型猪来源的PERV病原安全性提供了参考。 展开更多
关键词 猪内源性反转录病毒 广西巴马小型猪 RACE 3utr
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鸭肝炎病毒基因组3′末端序列的克隆和分析 被引量:73
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作者 丁春宇 张大丙 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期312-319,共8页
用3′RACE和RT-PCR扩增并克隆鸭肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)Ⅰ型毒株C80和Ⅰ型变异株E63的3′末端序列。分析结果显示,C80株和E63株基因组3′末端均包含1 359 nt的3D、终止密码子TGA、长314nt的3′UTR,而poly(A)尾分别含18... 用3′RACE和RT-PCR扩增并克隆鸭肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)Ⅰ型毒株C80和Ⅰ型变异株E63的3′末端序列。分析结果显示,C80株和E63株基因组3′末端均包含1 359 nt的3D、终止密码子TGA、长314nt的3′UTR,而poly(A)尾分别含18个A和19个A。由2株DHV 3D核苷酸序列所推导的3D蛋白均含453个氨基酸,均包含KDELR、DxxxxD、GxxCSGxxxTxxxNS、YGDD和FLKR等小RNA病毒RNA聚合酶的特征基序,该结果进一步证实Ⅰ型DHV属于小RNA病毒科的成员。两株DHV与小RNA病毒科9个已知属之间3D蛋白的氨基酸序列同源性为16%-37%,介于属间3D蛋白的氨基酸序列同源性范围(18%-60%)之内;此外,Ⅰ型DHV的3′UTR在小RNA病毒科是最长的。用3D蛋白进行进化分析的结果表明,Ⅰ型DHV可能属于小RNA病毒科的一个独立的病毒属。 展开更多
关键词 鸭肝炎病毒 3D基因 3′UTR POLY(A) 3′RACE
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中国美利奴羊DLX3基因3′UTR的多态性及其与羊毛品质性状的关联分析 被引量:7
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作者 荣恩光 王志鹏 +3 位作者 张志威 杨华 李辉 王宁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期358-367,共10页
为探讨DLX3基因的多态性与绵羊羊毛品质及生长性状的关系,本研究以5个品系的中国美利奴羊(新疆军垦型)为试验材料,采用PCR-RFLP方法开展了DLX3基因3′UTR区4个SNPs的多态性检测。通过卡方检验分析了4个SNPs在各品系绵羊中的等位基因频率... 为探讨DLX3基因的多态性与绵羊羊毛品质及生长性状的关系,本研究以5个品系的中国美利奴羊(新疆军垦型)为试验材料,采用PCR-RFLP方法开展了DLX3基因3′UTR区4个SNPs的多态性检测。通过卡方检验分析了4个SNPs在各品系绵羊中的等位基因频率,采用连锁不平衡分析构建了这4个SNPs的单倍型,最后将单位点和单倍型分别与绵羊羊毛品质和生长性状进行关联分析。结果表明:4个SNPs在5个品系间的等位基因频率均存在极显著差异(P<0.01);超细毛绵羊品系与其他4个品系间的基因型分布均存在极显著差异(P<0.01),2个多胎品系与其他3个品系间的基因型分布同样存在极显著差异(P<0.01);相关分析显示,这4个SNPs及其单倍型均对羊毛卷曲度有显著影响(P<0.05),而对其他羊毛性状及生长性状无显著影响(P>0.05)。由此可见,中国美利奴羊(新疆军垦型)DLX3基因3′UTR区的多态性与绵羊毛发卷曲度性状显著相关,可以尝试使用这些SNPs开展高品质细毛羊的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 中国美利奴羊(新疆军垦型) DLX3基因 SNPS 3′UTR
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草原红牛胰岛素样生长因子Ⅰ受体基因3′UTR序列多态性分析 被引量:7
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作者 张金玉 秦立红 +3 位作者 张国梁 赵玉民 张嘉保 赵志辉 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第7期103-106,共4页
以58头草原红牛为试验材料,采用PCR-SSCP技术对胰岛素样生长因子Ⅰ受体(IGF-ⅠR)基因3′UTR序列多态性进行了检测。结果表明,在IGF-ⅠR基因3′UTR中发现PCR-SSCP的多态位点,有2种等位基因和3种基因型。对所得基因型与生长和胴体性状的... 以58头草原红牛为试验材料,采用PCR-SSCP技术对胰岛素样生长因子Ⅰ受体(IGF-ⅠR)基因3′UTR序列多态性进行了检测。结果表明,在IGF-ⅠR基因3′UTR中发现PCR-SSCP的多态位点,有2种等位基因和3种基因型。对所得基因型与生长和胴体性状的相关性分析结果发现,在3′UTR中AB型的胴体产肉率、肉骨比显著高于AA、BB型(P<0.05);AA型的脂肪覆盖率显著高于BB型(P<0.05),与AB型差异不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 草原红牛 IGF-ⅠR基因 3′UTR 多态性分析
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鼻咽癌表达下调基因NASG3'UTR可变剪接分析及其在多种肿瘤中的表达 被引量:4
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作者 张必成 朱诗国 +5 位作者 向娟娟 周鸣 聂新民 肖炳睪 李小玲 李桂源 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第5期477-480,共4页
背景与目的:采用抑制性消减杂交技术已分离获得了人鼻咽组织特异性基因NASG。本研究对人鼻咽组织特异性表达且在鼻咽癌表达下调的NASG基因3'非编码区(untranslatedregion,UTR)的可变剪接进行分析,并考察NASG基因在多种肿瘤组织中的... 背景与目的:采用抑制性消减杂交技术已分离获得了人鼻咽组织特异性基因NASG。本研究对人鼻咽组织特异性表达且在鼻咽癌表达下调的NASG基因3'非编码区(untranslatedregion,UTR)的可变剪接进行分析,并考察NASG基因在多种肿瘤组织中的表达。方法:在NASG基因3'UTR存在可变剪接部位的两端设计引物进行RT-PCR扩增,分离扩增产物并测序。用RT-PCR检测NASG基因在鼻咽癌中的表达,采用了肿瘤表达谱阵列(cancerprofilingarray)杂交分析NASG基因在多种肿瘤组织的表达状况。结果:NASG基因3'UTR存在3种剪接产物,NASG基因在71%的鼻咽癌活检组织中表达下调,25%的肺癌组织中表达上调,而在其他肿瘤及其配对的正常组织未见明显表达。结论:NASG基因3'UTR存在3种剪接产物,NASG基因的表达异常是鼻咽癌和肺癌发生、发展过程中重要的分子事件。 展开更多
关键词 鼻咽癌 表达 下调基因 NASG3′UTR 可变剪接 分析及其在多种肿瘤 表达
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家兔BMP7基因3′UTR的克隆及序列分析 被引量:5
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作者 赵巧辉 陈其新 +2 位作者 李明 石晓卫 刘孟洲 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2009年第2期11-14,共4页
【目的】研究家兔BMP7基因3′非翻译区(3′UTR)序列的结构及功能特点。【方法】以家兔肾脏组织为材料,应用3′RACE技术对家兔BMP7基因3′UTR序列进行扩增,并与GenBank中登陆的其他哺乳动物相应序列进行比较分析。【结果】成功克隆了家兔... 【目的】研究家兔BMP7基因3′非翻译区(3′UTR)序列的结构及功能特点。【方法】以家兔肾脏组织为材料,应用3′RACE技术对家兔BMP7基因3′UTR序列进行扩增,并与GenBank中登陆的其他哺乳动物相应序列进行比较分析。【结果】成功克隆了家兔BMP7基因的3′UTR(GenBank号:EU004072);在3′UTR序列末端存在2个切割与胞质多聚腺苷化特异因子(CPSF)结合位点(AAUAAA)和1个11 bp的poly(A)。家兔BMP7基因3′UTR序列与小鼠、人、牛和猪的一致性分别为41.45%,50.30%,47.84%和57.91%,相对不保守。【结论】家兔BMP7基因3′UTR结构特点可能与其基因功能有关。 展开更多
关键词 家兔 哺乳动物 骨形态形成蛋白7 3’UTR 生物信息学分析
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登革2型病毒中国株3′非编码区RNA元件对翻译的影响 被引量:2
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作者 尉雁 姜涛 +6 位作者 李晓峰 赵慧 刘忠钰 邓永强 刘然 秦成峰 秦鄂德 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期583-588,共6页
【目的】探讨登革病毒(dengue virus,DEN)3′非编码区(untranslated region,UTR)RNA元件(VR、RCS2、CS2、CS1和SL)对基因组翻译的影响。【方法】首先构建登革2型病毒中国株(DEN2-43)UTR与萤火虫荧光素酶基因(LUC)组成的病毒诱导报告基因... 【目的】探讨登革病毒(dengue virus,DEN)3′非编码区(untranslated region,UTR)RNA元件(VR、RCS2、CS2、CS1和SL)对基因组翻译的影响。【方法】首先构建登革2型病毒中国株(DEN2-43)UTR与萤火虫荧光素酶基因(LUC)组成的病毒诱导报告基因(virus induced reporter gene,VIRG),在此基础上分别构建包含DEN2-433′UTR不同RNA元件的VIRG,并通过LUC检测、实时RT-PCR和Western blot方法分析含有不同元件VIRG对翻译效率的影响。【结果】发现完整的3′UTR缺失可显著抑制翻译,含有病毒VR元件VIRG的翻译水平与完整3′UTR的VIRG相似,RCS2或CS2元件可提高VIRG的翻译效率,CS1或SL元件可降低VIRG的翻译效率。【结论】DEN2-43病毒基因组3′UTR参与了报告基因的翻译,其不同元件具有可上调和下调报告基因翻译效率的作用。 展开更多
关键词 登革病毒 3’UTR 翻译调控
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靶向猪ATGL基因的miRNA预测及鉴定 被引量:2
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作者 戴丽荷 褚晓红 +2 位作者 路伏增 黄孙平 徐如海 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1281-1289,共9页
本试验旨在初步筛选出调控猪脂肪甘油三酯脂肪酶基因(ATGL)的miRNA。利用生物信息学分析预测10条靶向ATGL基因的猪miRNAs,然后通过装载含猪ATGL基因3′UTR序列来构建pMIR-Luc报告基因载体,以及通过装载含反向miRNA种子区对应的3′UTR序... 本试验旨在初步筛选出调控猪脂肪甘油三酯脂肪酶基因(ATGL)的miRNA。利用生物信息学分析预测10条靶向ATGL基因的猪miRNAs,然后通过装载含猪ATGL基因3′UTR序列来构建pMIR-Luc报告基因载体,以及通过装载含反向miRNA种子区对应的3′UTR序列来构建3个突变载体作为阴性对照,以pRL-TK载体作为内参,与候选miRNA模拟物共转染HEK 293T细胞,最终利用双荧光素酶报告基因法来检测荧光素酶活性。试验成功构建了含猪ATGL基因3′UTR序列的重组载体pMIR-ATGL-3′UTR,双荧光素酶报告基因试验显示sscmiR-769-3p、ssc-miR-1343、ssc-miR-7137-3p、ssc-miR-671-5p、ssc-miR-149能下调293T细胞中pMIR-ATGL-3′UTR的荧光素酶活性,而点突变试验证实了ssc-miR-1343与ssc-miR-7137-3p能通过与猪ATGL基因3′UTR上预测的种子区结合下调荧光素酶活性。结果表明,sc-miR-1343与ssc-miR-7137-3p通过靶向结合3′UTR对猪ATGL基因有下调作用。 展开更多
关键词 ATGL基因 MIRNA 双荧光素酶报告基因系统 3′UTR
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喉癌中microRNA-24对S100A8基因3′非翻译区的作用 被引量:5
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作者 郭艳 尚超 +1 位作者 钟鸣 富伟能 《解剖科学进展》 CAS 2011年第3期280-283,286,共5页
目的分析喉癌中S100A8基因3'UTR与其靶向miRNA的调控作用。方法构建S100A8基因3′UTR野生型和突变型荧光素酶载体,应用MiRanda和RNA22软件预测S100A8基因3'UTR靶向miRNA,共转构建的荧光素酶载体和靶miRNA前体于喉癌Hep2细胞中,... 目的分析喉癌中S100A8基因3'UTR与其靶向miRNA的调控作用。方法构建S100A8基因3′UTR野生型和突变型荧光素酶载体,应用MiRanda和RNA22软件预测S100A8基因3'UTR靶向miRNA,共转构建的荧光素酶载体和靶miRNA前体于喉癌Hep2细胞中,双荧光素酶检测系统测定荧光素酶活性。结果成功构建了S100A8基因3'UTR荧光素酶载体,在S100A83'UTR第3bp位置预测到一个miR-24结合位点,与转染controlmiR组和突变型载体组相比,miR-24前体能明显降低野生型载体的荧光素酶活性(P<0.05)。结论 miR-24靶向负性调控S100A8基因3'UTR活性。 展开更多
关键词 喉癌 S100A8 3′UTR MIRNA
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miR-4295在鼻咽癌细胞增殖中的作用 被引量:4
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作者 钟文 肖烈钢 +2 位作者 易瑶 钟海林 谢栋 《热带医学杂志》 CAS 2019年第11期1343-1347,共5页
目的探讨miR-4295在鼻咽癌细胞发生发展及增殖过程中的作用及相关的分子机制。方法通过脂质体转染miR-4295 mimic,inhibitor及其NC到鼻咽癌细胞株6-10B,CNE2。分别应用MTT实验、软琼脂集落形成实验检测miR-4295对鼻咽癌细胞增殖能力的影... 目的探讨miR-4295在鼻咽癌细胞发生发展及增殖过程中的作用及相关的分子机制。方法通过脂质体转染miR-4295 mimic,inhibitor及其NC到鼻咽癌细胞株6-10B,CNE2。分别应用MTT实验、软琼脂集落形成实验检测miR-4295对鼻咽癌细胞增殖能力的影响;WB和QPCR方法检测miR-4295、细胞周期素D1(CyclinD1)、p21cip1、Rb、pRb在细胞中蛋白及mRNA的表达水平。通过Targetscan分析预测miR-4295与SOX9的3’UTR的结合情况,采用双荧光素酶报告实验检测miR-4295与SOX9的结合情况,同时采用WB检测细胞株中SOX9的表达。结果MTT、软琼脂集落形成实验均显示过表达miR-4295后鼻咽癌细胞增殖能力明显增强,细胞生长速率高于NC组,细胞集落形成个数多于NC组,差异均有统计学意义(P<0.05);而miR-4295沉默后鼻咽癌细胞增殖能力明显降低,与NC-in组相比,差异有统计学意义(P<0.05);WB及QPCR结果显示:过表达miR-4295后,细胞周期蛋白CyclinD1表达升高而细胞周期抑制因子p21cip1下调;通过Targetscan预测发现miR-4295靶向结合SOX9的3’UTR,荧光素酶活性检测结果发现miR-4295过表达后荧光素酶活性明显低于NC组及突变组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论上调miR-4295可通过抑制SOX9蛋白翻译从而促进鼻咽癌细胞增殖能力,并调节细胞周期相关蛋白,在鼻咽癌发生发展中扮演重要的角色。 展开更多
关键词 miR-4295 鼻咽癌 细胞增殖 3′UTR SOX9
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猪蛋白编码基因3’UTR中IRPRE1元件的鉴定及其基因特征分析 被引量:1
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作者 赵为民 曹静 +5 位作者 邢菲 王丽 任守文 付言峰 李碧侠 方晓敏 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期336-342,共7页
为鉴定猪全基因组范围内蛋白编码基因3’UTR(3’-untranslated region)中反向重复PRE1(inverted repeated PRE1,IRPRE1)元件,对猪全基因组的22342个蛋白编码基因的3’UTR序列进行重复序列元件的生物信息学分析。结果表明:猪蛋白编码基因... 为鉴定猪全基因组范围内蛋白编码基因3’UTR(3’-untranslated region)中反向重复PRE1(inverted repeated PRE1,IRPRE1)元件,对猪全基因组的22342个蛋白编码基因的3’UTR序列进行重复序列元件的生物信息学分析。结果表明:猪蛋白编码基因的3’UTR序列中短散在重复序列与简单重复序列在重复序列的类别中所占比例较高,分别为27.58%与31.08%;在SINE/t RNA的重复元件中,Pre0_SS和PRE1x元件所占的比例较高,分别为41.83%和37.51%;共有1 094个候选蛋白编码基因的3’UTR中含有IRPRE1元件;GO分析发现这些候选基因主要参与m RNA经由剪接体的剪接、细胞分裂、RNA通过酯交换反应发生的剪接、T细胞激活、RNA剪接、T细胞受体信号通路、对糖苷反应、甘油三酯稳态、外源性凋亡信号通路的正调节及胆固醇合成等生物过程;KEGG pathway分析发现这些候选基因参与了缬草碱、亮氨酸和异亮氨酸降解途径、TNF信号通路、T细胞受体信号通路、RIG-I样受体信号通路、吞噬体、剪接体、胆汁分泌、甲状腺激素合成和凋亡;对3个蛋白编码基因的3’UTR中的IRPRE1元件进行鉴定发现,其在多个组织中广泛表达。 展开更多
关键词 蛋白编码基因 3’UTR IRPRE1元件 特征分析
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上海市崇明县热性惊厥与SCN1A基因热点多态性变异的相关性分析 被引量:1
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作者 叶桂云 陈柳 +1 位作者 戴红 刘晓青 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1643-1647,共5页
目的·了解上海市崇明县儿童热性惊厥(FS)与电压门控钠离子通道α1亚型(SCNIA)基因外显子25、26及3'UTR区域之间的相关性。方法·提取96例FS患儿[包括32例全面性癫痫伴热性惊厥附加症(GEFS+)患儿]和53例健康对照组儿童的外... 目的·了解上海市崇明县儿童热性惊厥(FS)与电压门控钠离子通道α1亚型(SCNIA)基因外显子25、26及3'UTR区域之间的相关性。方法·提取96例FS患儿[包括32例全面性癫痫伴热性惊厥附加症(GEFS+)患儿]和53例健康对照组儿童的外周静脉血基因组DNA,进行SCNIA基因E25、E26及3'UTR区域PCR扩增及测序分析。结果·病例组和对照组SCNIA基因E25、E26均未见突变。3'UTR区域1例GEFS+患儿存在c.310-311delGT变异,2例FS患儿存在c.589T>G变异,6例存在c.593T>G变异;对照组均未发现变异。病例组和对照组已报道的单核苷酸多态性(SNP)c.1025T>C发生频率分别为18.2%和24.5%,2组间差异无统计学意义。预测结果显示114种miRNA能与SCNIA基因3'UTR区结合。c.310-311delGT不位于miRNA与SCN1A基因3'UTR区的结合序列内,c.589T>G变异、c.589T>G变异均位于此序列中。结论·经检测SCNIA基因E25、E26均未见突变;3'UTR区域发现c.310-311de1GT、c.589T>G和c.593T>G变异;SNPc.1025T>C与FS无明显关联。 展开更多
关键词 热性惊厥 SCN1A 全面性癫痫伴热性惊厥附加症 单核苷酸多态性 3'UTR
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中甸犏牛SLC11A1基因3'非翻译区多态位点研究及其与抗病性关联的评估 被引量:1
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作者 王利平 席冬梅 +3 位作者 熊和丽 李国治 李鹏 邓卫东 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2018年第9期131-137,共7页
为研究中甸犏牛溶质载体转运蛋白基因(SLC11A1)的结构变异情况,并评估结构变异与抗病性的关联,采集了114个样品,扩增了SLC11A1基因3'非翻译区(3'UTR)部分序列,测序共检测到3个微卫星多态位点(MS1、MS2、MS3)和3个核苷酸变异(1 ... 为研究中甸犏牛溶质载体转运蛋白基因(SLC11A1)的结构变异情况,并评估结构变异与抗病性的关联,采集了114个样品,扩增了SLC11A1基因3'非翻译区(3'UTR)部分序列,测序共检测到3个微卫星多态位点(MS1、MS2、MS3)和3个核苷酸变异(1 782位点T→G、1 805位点G→A、1 907位点G→T),其中MS1有6个等位基因(GT10、GT12、GT14—17)、MS2有3个等位基因(GT5—7)、MS3有5个等位基因(GT12—16)。GT12/15、GT5/5、GT13/13基因型频率最高,分别为0. 204、0. 05、0. 324; GT15、GT5、GT13等位基因频率最高分别为0. 284、0. 685、0. 433。对MS1、MS2、MS3这3个多态位点进行单倍型分析,发现了44种单倍型,其中GT12/5/13为优势单倍型,频率为0. 13。χ2比较分析表明,中甸犏牛与婆罗门瘤牛×布兰科牛、荷斯坦牛×布兰科牛、布兰科牛、非洲牛MS1位点的GT12/12基因型频率差异显著(P <0. 01),与西班牙黄牛、荷兰黄牛MS3的GT13/13基因型频率差异显著(P <0. 01),与非洲黄牛差异不显著(P> 0. 05)。综上,中甸犏牛SLC11A1基因3'UTR具有丰富的多态性,推断其GT12/12和GT13/13纯合子基因型与抗病性相关。 展开更多
关键词 SLC11A1基因 中甸犏牛 3′UTR 微卫星多态性(GT)n
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骨桥蛋白对胰腺癌细胞金属基质蛋白酶-9转录后调控作用的研究 被引量:1
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作者 周苏君 张国强 +4 位作者 蒋超 蔡海 钟玉兵 高兴 王涛 《广西医学》 CAS 2013年第12期1585-1587,1590,共4页
目的探讨骨桥蛋白对胰腺癌细胞中金属基质蛋白酶-9转录后调控的影响。方法采用荧光定量PCR、荧光素酶报告基因技术检测骨桥蛋白对胰腺癌细胞金属基质蛋白酶-9转录后调控的影响。结果骨桥蛋白促进金属基质蛋白酶-9 mRNA半衰期的延长,上... 目的探讨骨桥蛋白对胰腺癌细胞中金属基质蛋白酶-9转录后调控的影响。方法采用荧光定量PCR、荧光素酶报告基因技术检测骨桥蛋白对胰腺癌细胞金属基质蛋白酶-9转录后调控的影响。结果骨桥蛋白促进金属基质蛋白酶-9 mRNA半衰期的延长,上调含金属基质蛋白酶-9 3'UTR的荧光素酶报告基因的表达。结论骨桥蛋白上调胰腺癌细胞株PANC-1中金属基质蛋白酶-9转录后调控,其主要作用位点在金属基质蛋白酶-93'UTR。 展开更多
关键词 胰腺癌 骨桥蛋白 金属基质蛋白酶-9 3’UTR
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RET基因3'UTR多态性同小儿先天性巨结肠症的相关性 被引量:1
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作者 莫丹 曾甜 +1 位作者 李春宏 李新宁 《中国妇幼保健》 CAS 2015年第32期5616-5618,共3页
目的探析RET基因3'UTR多态性同小儿先天性巨结肠症的相关性研究。方法入选广西壮族自治区妇幼保健院2013年5月-2014年5月小儿先天性巨结肠症患者100例为研究组,同期入选无神经山嵴及消化道系统病变的血液正常标本者100例为对照组,... 目的探析RET基因3'UTR多态性同小儿先天性巨结肠症的相关性研究。方法入选广西壮族自治区妇幼保健院2013年5月-2014年5月小儿先天性巨结肠症患者100例为研究组,同期入选无神经山嵴及消化道系统病变的血液正常标本者100例为对照组,应用生物心肌数据库查找7个RET基因3'UTR多态性位点,进行直接测序法、PCR扩增目的基因测序法分析选取的SNPs位点,进行HSCR及多态性位点统计学分析,分析REET基因3'UTR多态性与小儿先天性巨结肠症的相关性。结果 rs17028C>THE(P):0.81、rs3026782G>AHWE(P):1、rs2742240A>THWE(P):0.13、rs2435355T>CHWE(P):0.8、rs2742241G>AHWE(P):0.51等SNP单个位点与先天性巨结肠症的发病呈负相关,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 RET基因3'UTR的SNPs与小儿先天性巨结肠症呈负相关,为先天性巨结肠症的保护性位点。 展开更多
关键词 相关性分析 小儿先天巨结肠症 RET基因3"UTR
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β珠蛋白基因3′UTR+101G>C(HBB:c.*233G>C)变异的遗传学效应分析 被引量:1
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作者 杜丽 姚翠泽 +4 位作者 包秀琴 梁杰 袁腾龙 秦丹卿 王继成 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1271-1274,共4页
目的:探讨β珠蛋白基因3′UTR+101G>C(HBB:c.*233G>C)变异是否具有遗传学效应,为地中海贫血的基因诊断和遗传咨询提供依据。方法:应用全血细胞分析和毛细管电泳进行血液学指标分析,采用PCR-流式荧光杂交法检测中国南方人群常见的2... 目的:探讨β珠蛋白基因3′UTR+101G>C(HBB:c.*233G>C)变异是否具有遗传学效应,为地中海贫血的基因诊断和遗传咨询提供依据。方法:应用全血细胞分析和毛细管电泳进行血液学指标分析,采用PCR-流式荧光杂交法检测中国南方人群常见的23种地中海贫血相关突变,采用一代测序方法检测β珠蛋白基因(HBB)的其他变异位点。结果:在463个进行HBB基因测序的病例中共检测到7个病例携带HBB:c.*233G>C变异,其中4例同时携带HBB基因其他致病性变异(2例反式排列,2例顺式排列),均为典型的轻型β地中海贫血的血液学特征,3例同时携带异常血红蛋白变异,均不具有β地中海贫血的血液学特征。结论:本研究的数据显示HBB:c.*233G>C变异无明显遗传学效应,应为多态性位点。 展开更多
关键词 β珠蛋白基因 3′UTR+101G>C HBB:c.*233G>C
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