目的:基于网络药理学和分子对接技术探究半夏泻心汤治疗糖尿病认知功能障碍(diabetes-associated cognitive dysfunction,DCD)的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology...目的:基于网络药理学和分子对接技术探究半夏泻心汤治疗糖尿病认知功能障碍(diabetes-associated cognitive dysfunction,DCD)的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、PubChem等数据库筛选半夏泻心汤主要活性成分,结合SuperPred靶点预测工具、BATMAN、UniProt数据库预测活性成分可能的作用靶点;通过在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、TTD、DrugBank及PharmGkb数据库搜索并建立DCD疾病靶点信息数据集,利用STITCH、STRING数据库以及Cytoscape 3.8.1软件构建成分靶点与疾病靶点蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络;将核心靶点导入DAVID 6.8数据库,进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集与京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析;通过Open Babel 2.3.2软件及Protein Data Bank数据库获得受体蛋白,利用PYMOL 2.3.4、AutoDock Tools及Vina 1.1.2等软件对受体蛋白与配体小分子分别进行分子对接。运用高效液相色谱方法分析含有汉黄芩素、小檗碱、黄芩素、甘草苷的混标样品及含药血清。结果:筛选出190个半夏泻心汤潜在活性成分、281个化合物靶点及1490个DCD相关靶点;拓扑分析得到34个核心靶点;GO功能富集分析和KEGG通路分析得到358个生物过程条目及92条通路;分子对接发现,配体小分子均稳定地位于对接口袋内,其中,原阿片碱与活性位点附近的Tyr-634、Tyr-651、Lys-652氨基酸形成氢键结合到SIRT1,其对接得分值最佳;高效液相色谱分析发现,含药血清中可能含有汉黄芩素、小檗碱、黄芩素、甘草苷等药物代谢后的成分。结论:半夏泻心汤治疗DCD具有多通路、多靶点等作用,其主要通过FoxO、HIF-1、MAPK、雌激素、TNF、癌症和Toll样受体等信号通路发挥抑制细胞凋亡、抗炎、抗氧化,调节自噬及突触可塑性等作用。展开更多
目的:采用文献计量学的方法对半夏研究现状与发展趋势进行总结与分析。方法:检索中国知网(CNKI)、万方数据(Wanfang Data)、维普中文科技期刊数据库(VIP)、Web of Science核心集数据库2004年至2024年收录的中药半夏相关文献,利用CiteSp...目的:采用文献计量学的方法对半夏研究现状与发展趋势进行总结与分析。方法:检索中国知网(CNKI)、万方数据(Wanfang Data)、维普中文科技期刊数据库(VIP)、Web of Science核心集数据库2004年至2024年收录的中药半夏相关文献,利用CiteSpace软件、R语言环境下的文献计量学包Bibliometrix对已发表的近20年半夏研究的年发文量、期刊分布、研究现状、研究热点及发展趋势进行可视化分析。结果:共纳入中文文献3692篇,英文文献373篇,显示2004-2011年发文量稳步上升,近十年总体发文量逐步稳定,其中英文文献的发文量近10年间稳定上涨。目前半夏的研究热点以半夏的真伪鉴别方法、药理作用及其机制和临床应用为主。结论:经典名方的开发及临床用药规律是半夏未来研究的前沿内容,同时分子对接等生物信息学技术进一步应用可为半夏及其复方的研究提供新思路。展开更多
文摘目的:基于网络药理学和分子对接技术探究半夏泻心汤治疗糖尿病认知功能障碍(diabetes-associated cognitive dysfunction,DCD)的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、PubChem等数据库筛选半夏泻心汤主要活性成分,结合SuperPred靶点预测工具、BATMAN、UniProt数据库预测活性成分可能的作用靶点;通过在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、TTD、DrugBank及PharmGkb数据库搜索并建立DCD疾病靶点信息数据集,利用STITCH、STRING数据库以及Cytoscape 3.8.1软件构建成分靶点与疾病靶点蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络;将核心靶点导入DAVID 6.8数据库,进行基因本体论(gene ontology,GO)功能富集与京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析;通过Open Babel 2.3.2软件及Protein Data Bank数据库获得受体蛋白,利用PYMOL 2.3.4、AutoDock Tools及Vina 1.1.2等软件对受体蛋白与配体小分子分别进行分子对接。运用高效液相色谱方法分析含有汉黄芩素、小檗碱、黄芩素、甘草苷的混标样品及含药血清。结果:筛选出190个半夏泻心汤潜在活性成分、281个化合物靶点及1490个DCD相关靶点;拓扑分析得到34个核心靶点;GO功能富集分析和KEGG通路分析得到358个生物过程条目及92条通路;分子对接发现,配体小分子均稳定地位于对接口袋内,其中,原阿片碱与活性位点附近的Tyr-634、Tyr-651、Lys-652氨基酸形成氢键结合到SIRT1,其对接得分值最佳;高效液相色谱分析发现,含药血清中可能含有汉黄芩素、小檗碱、黄芩素、甘草苷等药物代谢后的成分。结论:半夏泻心汤治疗DCD具有多通路、多靶点等作用,其主要通过FoxO、HIF-1、MAPK、雌激素、TNF、癌症和Toll样受体等信号通路发挥抑制细胞凋亡、抗炎、抗氧化,调节自噬及突触可塑性等作用。
文摘目的:采用文献计量学的方法对半夏研究现状与发展趋势进行总结与分析。方法:检索中国知网(CNKI)、万方数据(Wanfang Data)、维普中文科技期刊数据库(VIP)、Web of Science核心集数据库2004年至2024年收录的中药半夏相关文献,利用CiteSpace软件、R语言环境下的文献计量学包Bibliometrix对已发表的近20年半夏研究的年发文量、期刊分布、研究现状、研究热点及发展趋势进行可视化分析。结果:共纳入中文文献3692篇,英文文献373篇,显示2004-2011年发文量稳步上升,近十年总体发文量逐步稳定,其中英文文献的发文量近10年间稳定上涨。目前半夏的研究热点以半夏的真伪鉴别方法、药理作用及其机制和临床应用为主。结论:经典名方的开发及临床用药规律是半夏未来研究的前沿内容,同时分子对接等生物信息学技术进一步应用可为半夏及其复方的研究提供新思路。
