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海南黑山羊GDF9基因nsSNP功能性预测及与产羔数的关联分析 被引量：1
1
作者 管凇 施力光 +3 位作者 林雨 蒋剑箫 武洪志 彭维祺 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第5期2166-2176,共11页
【目的】探究海南黑山羊产羔性状的分子遗传信息以及生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)基因多态性与产羔数间的相关性,以期为山羊多胎育种提供有用的分子标记。【方法】以海南黑山羊为研究对象,采集222只山羊的血液... 【目的】探究海南黑山羊产羔性状的分子遗传信息以及生长分化因子9(growth differentiation factor 9,GDF9)基因多态性与产羔数间的相关性,以期为山羊多胎育种提供有用的分子标记。【方法】以海南黑山羊为研究对象,采集222只山羊的血液样本进行GDF9基因非同义单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphism,nsSNP)筛选。采用SnaPshot方法进行基因分型,利用SPSS 19.0软件中一般线性模型对GDF9基因多态位点与海南黑山羊产羔数进行关联分析,并对nsSNP位点进行生物信息学分析。【结果】GDF9基因共检测到15个变异位点,其中错义突变位点7个:T755C、G1264T、G2296A、G2335A、C2730T、G2773A、C3330T;同义突变位点6个:G888A、T951G、A972C、T2631C、A2871C、G3101A;插入位点2个:3101G3102和3140T3141。755 bp处发生的T→C突变导致蛋氨酸(Met)变为苏氨酸(Thr);1264 bp处发生的G→T突变导致丙氨酸(Ala)变为丝氨酸(Ser);2296和2335 bp处发生的G→A突变导致缬氨酸(Val)变为异亮氨酸(IIe);2730 bp处发生的C→T突变导致亮氨酸(Leu)变为苯丙氨酸(Phe);2773 bp处发生的G→A突变导致丙氨酸(Ala)变为苏氨酸(Thr);3330 bp处发生的C→T突变导致脯氨酸(Pro)变为亮氨酸(Leu);而在3101~3102、3140~3141 bp处G与T的插入使得氨基酸完全改变。海南黑山羊T755C位点TT和CC基因型个体的平均产羔数显著高于TC基因型(P<0.05),G2335A和G2773A位点AA基因型个体的平均产羔数均显著高于GG和GA基因型(P<0.05),C2730T位点TT基因型个体的平均产羔数显著高于CC和CT基因型(P<0.05)。nsSNP功能性预测及高级结构分析结果显示,T755C→M252T、C2730T→L912F、G2335A→V780I、G2296A→V767I、G2773A→A926T 5个nsSNPs位点均属于有害突变,其中,T755C→M252T、C2730T→L912F位点的mRNA二级结构和蛋白三级结构变化较大,可能对蛋白功能有较大影响。【结论】本研究预测到海南黑山羊GDF9基因的5个有害突变位点,结合与产羔数的关联分析和蛋白功能预测,推测T755C→M252T、C2730T→L912F 2个位点可作为海南黑山羊多胎性状选育的分子标记,为山羊多胎分子标记辅助育种提供了参考依据。 展开更多
关键词 海南黑山羊 GDF9基因 nsSNP 产羔数 生物信息学
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海南黑山羊BMP15、ESR、GnRHR基因nsSNPs功能性预测及与产羔数的关联性分析
2
作者 管凇 施力光 +2 位作者 林雨 武洪志 彭维祺 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2025年第12期53-59,共7页
为了探究海南黑山羊产羔性状的分子遗传信息及产羔性状基因多态性与产羔数之间的相关性,试验以海南黑山羊为研究对象,采用SnaPshot方法进行单核苷酸多态性(SNP)位点的筛选和分型,将SNP位点与产羔数进行关联分析,并对与产羔数相关的SNP... 为了探究海南黑山羊产羔性状的分子遗传信息及产羔性状基因多态性与产羔数之间的相关性,试验以海南黑山羊为研究对象,采用SnaPshot方法进行单核苷酸多态性(SNP)位点的筛选和分型,将SNP位点与产羔数进行关联分析,并对与产羔数相关的SNP位点进行非同义单核苷酸多态性(nsSNPs)位点生物信息学分析。结果表明:在BMP15、ESR、GnRHR 3个基因中共检测到7个错义突变位点,分别是BMP15基因中的C35G、C46G、G139A突变位点,ESR基因中的G127A、A187G突变位点,GnRHR基因中的A126G、G153A突变位点和1个ESR基因同义突变位点T333C;BMP15基因中G139A突变位点的AA基因型产羔数显著高于GG、GA基因型(P<0.05),ESR基因A187G突变位点的AA、GG基因型产羔数显著高于AG基因型(P<0.05),GnRHR基因中G153A突变位点的AA基因型产羔数显著高于GG、GA基因型(P<0.05);BMP15基因氨基酸突变位点G47S、ESR基因氨基酸突变位点T63A、GnRHR基因氨基酸突变位点G52R属于有害突变位点且mRNA二级结构、蛋白质二级结构和三级结构变化较大。说明预测的BMP15基因氨基酸突变位点G47S、ESR2基因氨基酸突变位点T63A、GnRHR基因氨基酸突变位点G52R这3个突变位点可以作为海南黑山羊多胎性状选育的分子标记。 展开更多
关键词 海南黑山羊 BMP15 ESR GnRHR 多态性 产羔数 生物信息学
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多浪羊ESR1基因多态性与产羔性状的关联性分析 被引量：1
3
作者 杨旻奇 黄巧艳 +3 位作者 韩笑 伍柏仰 乌兰·合得尔 邢凤 《中国草食动物科学》 北大核心 2025年第4期96-101,共6页
为了揭示ESR1基因多态性与多浪羊产羔性状的关系,探究其对多浪羊产羔性状的作用,采用PCR直接测序法对ESR1基因外显子1和内含子4中2个单核苷酸多态性进行了研究,对这2个位点的基因型频率和等位基因频率进行了统计,分析其杂合度(He)、有... 为了揭示ESR1基因多态性与多浪羊产羔性状的关系,探究其对多浪羊产羔性状的作用,采用PCR直接测序法对ESR1基因外显子1和内含子4中2个单核苷酸多态性进行了研究,对这2个位点的基因型频率和等位基因频率进行了统计,分析其杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)、多态信息含量(PIC)等遗传参数,并与多浪羊产羔数进行了相关分析。结果表明,在多浪羊单羔群体中,g.75378892 A>T位点的优势等位基因为A,基因频率为0.64;g.75521224 T>A位点的优势等位基因为T,基因频率为0.66。在多浪羊多羔群体中,g.75378892 A>T位点的优势等位基因为A,基因频率为0.62;g.75521224 T>A位点的优势等位基因为T,基因频率为0.64。g.75378892A>T位点的突变为错义突变,由异亮氨酸(Ile)突变为苯丙氨酸(Phe)。g.75378892 A>T位点和g.75521224 T>A位点的多态信息含量均处于中度多态(0.25<PIC<0.50)。多浪羊ESR1基因g.75378892 A>T突变位点的AT基因型个体的产羔数显著高于AA基因型个体(P<0.05);g.75521224 T>A突变位点的AT基因型个体的产羔数显著高于AA基因型个体和TT基因型个体(P<0.05)。由此推断,ESR1基因可以作为多浪羊多羔性状的候选基因。 展开更多
关键词 ESR1基因 PCR测序 SNPS 遗传参数 产羔数
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杜湖杂交对湖羊产羔数和羔羊初生重的影响 被引量：1
4
作者 杨全法 解贞先 +2 位作者 贺小云 储明星 肖国亮 《现代畜牧科技》 2025年第2期56-59,共4页
为探究杜湖杂交对湖羊产羔数和羔羊初生重的影响,试验采用杜泊公羊与湖羊公羊分别对经产湖羊母羊进行配种,记录每组母羊的产羔数、羔羊性别和初生重等信息,并进行均值检验和单因素ANOVA分析。结果发现,杜湖杂交组(DH组)与湖羊本交(HH组... 为探究杜湖杂交对湖羊产羔数和羔羊初生重的影响,试验采用杜泊公羊与湖羊公羊分别对经产湖羊母羊进行配种,记录每组母羊的产羔数、羔羊性别和初生重等信息,并进行均值检验和单因素ANOVA分析。结果发现,杜湖杂交组(DH组)与湖羊本交(HH组)母羊产羔率分别为207.30%、215.46%;DH组和HH组组内不同产羔类型下相同性别羔羊初生重相互之间均存在极显著差异(P<0.01);DH组和HH组产单羔、双羔、三羔和四羔羔羊平均初生重分别为4.37 kg和3.18 kg、3.90 kg和2.98 kg、3.48 kg和2.89 kg、3.01 kg和2.72 kg,其相同产羔类型的公羔及母羔初生重之间存在极显著差异(P<0.01);说明杜湖杂交后母羊产羔率影响不显著,但对湖羊羔羊初生重有显著影响。 展开更多
关键词 湖羊 杜泊羊 产羔率
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绵羊 CTSB、PATL2和NOTCH4 基因多态性及其与产羔数的关联分析
5
作者 贾一轩 狄冉 +4 位作者 王翔宇 贺小云 龚一鸣 梁琛 储明星 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第6期202-207,共6页
为探究CTSB、PATL2和NOTCH4基因的多态性及其与绵羊产羔数之间的关系,以期寻找绵羊产羔数性状相关的分子标记。结合前期的全基因组重测序结果,筛选这3个基因的候选SNP位点,利用SequenomMassARRAY SNP技术对单羔组(苏尼特羊和巴美肉羊)... 为探究CTSB、PATL2和NOTCH4基因的多态性及其与绵羊产羔数之间的关系,以期寻找绵羊产羔数性状相关的分子标记。结合前期的全基因组重测序结果,筛选这3个基因的候选SNP位点,利用SequenomMassARRAY SNP技术对单羔组(苏尼特羊和巴美肉羊)和多羔组(湖羊、小尾寒羊和策勒黑羊)共5个绵羊品种上述3个基因的候选多态性位点进行基因分型和群体遗传学分析,并与小尾寒羊产羔数进行关联分析。结果显示,所检测3个基因的5个SNP位点均表现出中、低度多态;CTSB基因g.104438571T>C位点(P<0.05)、NOTCH4基因g.26312001G>A位点(P<0.01)和PATL2基因g.30788209G>A位点(P<0.01)的基因频率在单羔和多羔品种间差异显著;5个绵羊品种的CTSB基因g.104438547G>A位点和NOTCH4基因g.26313972C>G位点及小尾寒羊CTSB基因g.104438571T>C位点均不处于哈迪-温伯格平衡状态(P<0.05),其余各位点在不同品种中均处于平衡状态;CTSB基因g.104438547G>A位点、NOTCH4基因g.26313972C>G和g.26312001G>A位点突变导致了氨基酸改变;关联分析结果显示,所检测3个基因的5个SNP与小尾寒羊产羔数间无显著关联(P>0.05),但胎次对小尾寒羊产羔数有极显著影响(P<0.01)。综上,CTSB、PATL2和NOTCH4基因的5个SNP多态性位点不适合作为小尾寒羊产羔数选育的有效分子标记。 展开更多
关键词 绵羊 CTSB基因 PATL2基因 NOTCH4基因 产羔数 SNP分型 关联研究
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山羊GLIS3和POU3F4基因多态性与产羔性能的关联分析
6
作者 贾一轩 李佳骏 +3 位作者 狄冉 王翔宇 梁琛 储明星 《中国草食动物科学》 北大核心 2025年第6期65-70,共6页
本研究旨在分析GLIS3和POU3F4基因在3个不同山羊品种(云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊)中的多态性及其与产羔性能的关联性。利用MassARRAY?技术分别对GLIS3和POU3F4基因的5个候选位点(GLIS3 g.40506054C>T、g.40506051C>T、g.... 本研究旨在分析GLIS3和POU3F4基因在3个不同山羊品种(云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊)中的多态性及其与产羔性能的关联性。利用MassARRAY?技术分别对GLIS3和POU3F4基因的5个候选位点(GLIS3 g.40506054C>T、g.40506051C>T、g.40221045G>C、g.40221044A>C和POU3F4 g.6229283T>G)进行基因分型,探索其在3个山羊群体中的遗传学特征,并分析其与云上黑山羊的产羔性能(包括产羔数、初生窝重和断奶窝重)的关联性。结果表明,5个位点在3个品种山羊中均为中、低度多态性;在济宁青山羊和辽宁绒山羊中,GLIS3基因g.40506054C>T位点存在极显著差异(P<0.01),g.40506051C>T位点存在显著差异(P<0.05)。在云上黑山羊中,GLIS3基因g.40506054C>T位点CC基因型个体的初生窝重显著高于CT基因型个体和TT基因型个体(P<0.05),g.40221044A>C位点AC基因型个体的产羔数显著高于AA基因型个体(P<0.05);POU3F4基因g.6229283T>G位点GT基因型个体的断奶窝重显著高于TT基因型个体(P<0.05)。综上,GLIS3基因g.40506054C>T位点、g.40221044A>C位点和POU3F4基因g.6229283T>G位点可以作为山羊初生窝重、产羔数和断奶窝重的潜在分子标记。 展开更多
关键词 山羊 产羔性能 断奶窝重 候选基因 关联分析
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COIL和BMP15基因组织表达与阿勒泰羊产羔数的关联分析
7
作者 马应国 於建国 +3 位作者 李林波 艾布什 郝耿 刘玲玲 《中国饲料》 北大核心 2025年第9期38-44,共7页
本试验以阿勒泰羊为研究对象,筛选与阿勒泰羊的产羔数相关的候选基因,为寻找绵羊产羔性状分子标记和绵羊育种提供科学依据。利用KASP分型技术,对BMP15和COIL基因SNP进行基因分型并将不同基因型与产羔数关联分析,同时利用qPCR法对BMP15和... 本试验以阿勒泰羊为研究对象,筛选与阿勒泰羊的产羔数相关的候选基因,为寻找绵羊产羔性状分子标记和绵羊育种提供科学依据。利用KASP分型技术,对BMP15和COIL基因SNP进行基因分型并将不同基因型与产羔数关联分析,同时利用qPCR法对BMP15和COIL基因在产单双羔阿勒泰羊9个不同组织中的相对表达量进行分析。结果表明,COIL基因(g.7321466C>G)检测出GG(0.36)、GC(0.50)和CC(0.14)型。BMP15基因(g.E2-775T>C)检测出AA(0.76)、AG(0.22)和GG(0.01)型。遗传学分析表明,COIL和BMP15基因PIC值分别为0.48和0.23,为中度和低度多态位点。χ^(2)检验结果表明,两个基因在阿勒泰羊中均处于哈代温伯格(Hardy-weinberg)平衡(P>0.05)。关联分析显示,BMP15基因三种基因型产羔数间有显著差异(P<0.05),AA型的产羔数比AG和GG型多了0.14和0.61只。COIL基因的不同基因型产羔数间有显著差异(P<0.05),GG的产羔数型比GC和CC型多了0.2和0.31只。qPCR分析结果显示,BMP15基因在双羔组下丘脑、小脑中表达量极显著高于单羔组(P<0.01),卵巢中表达量显著高于单羔组(P<0.05);COIL基因在双羔组垂体表达量极显著高于单羔组(P<0.01),下丘脑表达量显著高于单羔组(P<0.05)。BMP15基因g.E2-775T>C位点不同基因型的产羔数差异显著,AA型产羔数显著高于AG和GG型产羔数(P<0.05),该基因可能通过下丘脑神经分泌小细胞分泌某种激素作用于卵巢,刺激卵巢超数排卵进而影响阿勒泰羊的产羔数,COIL基因g.7321466C>G位点GG基因型个体产羔数显著高于GC和CC型(P<0.05),该基因可能通过垂体释放某种激素作用于子宫或卵巢而影响产羔数,其具体的作用机制有待进一步研究。BMP15和COIL基因两位点与阿勒泰羊产羔数密切相关,可作为影响阿勒泰羊产羔数潜在的分子标记。 展开更多
关键词 阿勒泰羊 BMP15基因 COIL基因 组织表达 多态性 产羔数
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多浪羊与湖羊杂交产羔性状COIL及BMPR-IB基因遗传效应分析
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作者 史香云 李焦智 +1 位作者 刘玲玲 刘武军 《新疆农业科学》 北大核心 2025年第1期243-250,共8页
【目的】分析COIL及BMPR-IB基因与产羔数关联性,探究多浪羊与湖羊(简称多湖杂交)后代产羔性状COIL及BMPR-IB基因的遗传效应。【方法】研究以多浪羊与湖羊级进杂交F_(1)代、F_(2)代、F_(3)代为研究对象,随机选取多湖杂交F_(1)代(228只)、... 【目的】分析COIL及BMPR-IB基因与产羔数关联性,探究多浪羊与湖羊(简称多湖杂交)后代产羔性状COIL及BMPR-IB基因的遗传效应。【方法】研究以多浪羊与湖羊级进杂交F_(1)代、F_(2)代、F_(3)代为研究对象,随机选取多湖杂交F_(1)代(228只)、F_(2)代(254只)、F_(3)代(252只),进行全血DNA提取,COIL基因利用扩增阻滞突变系统PCR(ARMS-PCR)技术基因分型、BMPR-IB基因利用限制性内切酶片段长度多态性技术(PCR-RFLP)基因分型后,与产羔数关联分析。【结果】在多湖杂交F_(1)代中,突变纯合GG型产羔数极显著高于突变杂合CG、野生CC型产羔数(P<0.01),突变杂合CG型产羔数极显著高于野生CC型产羔数(P<0.01);在多湖杂交F_(2)代中突变纯合GG型与突变杂合CG、野生CC型产羔数间均差异极显著(P<0.01);在多湖杂交F_(3)代中,突变纯合GG、突变杂合CG型产羔数极显著高于CC型(P<0.01),GG型产羔数极显著高于CG型(P<0.05)。在多湖杂交F_(1)、F_(2)、F_(3)代中均为突变纯合BB型产羔数极显著高于突变杂合B+型、野生++型产羔数(P<0.01),突变杂合B+型产羔数极显著高于野生++型产羔数(P<0.01)。【结论】COIL基因与BMPR-IB基因均对多湖杂交后代产羔数影响显著,但BMPR-IB基因在多湖杂交后代突变率较低,可能不适合作为筛选多湖杂交双羔群体的关键基因,COIL基因可以作为筛选多湖杂交高繁殖率的新候选基因。 展开更多
关键词 多浪羊 湖羊 杂交 产羔性状 COIL基因 BMPR-IB基因 遗传效应
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和田羊FecB基因多态性与产羔数及生长性状关联分析
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作者 杨存明 田可川 +9 位作者 张文浩 刘黎 阿布力克木·阿地力 李雪 梁贵晨 赵志文 李超 高伟 黄锡霞 田月珍 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第4期160-163,共4页
本文旨在探索FecB基因g.746 A>G位点多态性对和田羊(多胎型)产羔数和生长性状的影响。试验选取130只生长发育良好的成年和田羊,利用KASP技术检测和田羊FecB基因多态性,并分析其与产羔数和体尺体重的相关性。结果表明:和田羊群体FecB... 本文旨在探索FecB基因g.746 A>G位点多态性对和田羊(多胎型)产羔数和生长性状的影响。试验选取130只生长发育良好的成年和田羊,利用KASP技术检测和田羊FecB基因多态性,并分析其与产羔数和体尺体重的相关性。结果表明:和田羊群体FecB基因g.746 A>G突变位点存在BB、B+和++3种基因型,B为优势等位基因,群体中基因纯合度为0.525,杂合度为0.475,有效等位基因数为1.905,多态信息含量为0.362,处于中度多态,且群体处于哈迪-温伯格平衡状态。和田羊平均产羔数BB基因型显著高于B+和++基因型个体,B+与++基因型个体平均产羔数无显著差异,FecB突变与生长性状间均无显著差异。综上所述,FecB基因可作为影响和田羊多胎性状的候选基因用于标记辅助选择,为和田羊多胎品系的培育提供参考。 展开更多
关键词 和田羊 FECB 产羔数 生长性状
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陕北细毛羊BMPR1B基因多态性与产羔数的关联分析
10
作者 宋晓越 刘伟 +10 位作者 谢宇杰 姬凯 李慧敏 朱海鲸 郝嘉旭 杜晓敏 张鑫 张磊 王振有 冯继英 屈雷 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第9期144-148,共5页
绵羊产羔性状的遗传力较低,利用分子遗传标记,筛选绵羊产羔性状相关的基因突变,是提高繁殖性能的重要方法之一。陕北细毛羊是陕西省特色品种,毛细度优势突出,但产羔性能较低,严重制约了陕北细毛羊大规模发展。国内外研究表明,骨形态发... 绵羊产羔性状的遗传力较低,利用分子遗传标记,筛选绵羊产羔性状相关的基因突变,是提高繁殖性能的重要方法之一。陕北细毛羊是陕西省特色品种,毛细度优势突出,但产羔性能较低,严重制约了陕北细毛羊大规模发展。国内外研究表明,骨形态发生蛋白受体1B(Bone Morphogenetic Protein Receptor 1B,BMPR1B)基因能提升多个绵羊品种的产羔性能,本研究通过筛选BMPR1B基因在陕北细毛羊中的FecB突变和InDel突变,并分析其与产羔数之间的相关性,旨在探寻该基因对产羔性能的影响。结果显示,陕北细毛羊BMPR1B基因存在FecB突变和InDel突变,其中,InDel P3-23bp位点DD基因型个体的产羔率大于其他基因型个体。本研究首次研究了陕北细毛羊BMPR1B基因的多态性,为培育多羔型陕北细毛羊提供了参考。 展开更多
关键词 陕北细毛羊 BMPR1B基因 产羔数 FECB INDEL
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TrKA、NGF基因多态性及其与德新肉用细毛羊产羔数关联分析
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作者 李鹏飞 朱梦婷 +11 位作者 哈尼克孜·吐拉甫 高杰 陶维昆 董桂花 闫娜娜 马锦晨 刘波 林长春 王许 王博 吴伟伟 齐·阿拉达尔 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第1期242-247,共6页
为研究TrKA和NGF基因多态性对德新肉用细毛羊产羔数的影响,本研究以德新肉用细毛羊为研究对象,采集试验群体血液样本,提取DNA,利用PCR-RFLP技术及一代测序技术检测基因多态性,结合单因素方差分析和一般线性模型分析统计各个基因型与产... 为研究TrKA和NGF基因多态性对德新肉用细毛羊产羔数的影响,本研究以德新肉用细毛羊为研究对象,采集试验群体血液样本,提取DNA,利用PCR-RFLP技术及一代测序技术检测基因多态性,结合单因素方差分析和一般线性模型分析统计各个基因型与产羔数性状的相关性。结果显示,在德新肉用细毛羊群体中TrKA和NGF基因具有多态性,且这2个基因在试验群体中均存在3种基因型。TrKA基因在rs106814725位点发现C/T的替换,而NGF基因在rs92654175位点发现G/A的替换。携带TT基因型的TrKA基因和GG基因型的NGF基因的个体在产羔数上显著高于其他基因型。结果表明,TrKA和NGF基因可能是影响德新肉用细毛羊多羔性能的候选基因。本研究结论可以为德新肉用细毛羊的核心群选育奠定基础。 展开更多
关键词 德新肉用细毛羊 TrKA基因 NGF基因 SNP 产羔数
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绒山羊ADAMTS1基因多态性及其与产羔性状关联分析
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作者 张兆玲 吴铁成 +6 位作者 王涛 刘俊阳 高玉林 朱莉仙 赵生国 蔡原 刘斌 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第9期184-191,共8页
本研究旨在通过对绒山羊ADAMTS1基因多态性与产羔性状的关联性分析,为内蒙古绒山羊分子育种提供有效的遗传标记及理论依据。随机选取20只内蒙古绒山羊血液DNA,采用PCR扩增技术对ADAMTS1基因的3'-UTR、5'-UTR、外显子和启动子序... 本研究旨在通过对绒山羊ADAMTS1基因多态性与产羔性状的关联性分析,为内蒙古绒山羊分子育种提供有效的遗传标记及理论依据。随机选取20只内蒙古绒山羊血液DNA,采用PCR扩增技术对ADAMTS1基因的3'-UTR、5'-UTR、外显子和启动子序列进行扩增并测序。根据Blast比对结果,统计ADAMTS1基因发生突变的SNP位点,再利用质谱法对128只绒山羊个体进行基因分型检测,应用一般线性模型进行SNPs位点与产羔性状的最小二乘分析。结果表明:ADAMTS1基因在5'-UTR存在SNP1(g.7974733.G>A)和SNP2(g.7974889.G>T)2个突变位点,在外显子1处存在SNP3(g.7975314.G>C)、外显子2处存在SNP4(g.7977537.T>G)、外显子4处存在SNP5(g.7978785.C>A)共3个突变位点,5个位点均符合HardyWeinberg平衡。二级结构预测显示SNP2(g.7974889.G>T)、SNP4(g.7977537.T>G)位点碱基突变均会引起ADAMTS1基因mRNA二级结构发生改变;SNP4(g.7977537.T>G)位点CT型羊的产羔数极显著高于CC型,显著高于TT型;初生重与产羔数呈反比,CT型羊的初生重极显著低于CC型,显著低于TT型,CT型羊的断乳重显著低于CC型;SNP2(g.7974889.G>T)突变位点TG型羊的产羔数显著高于GG型。综上,ADAMTS1基因SNP2(g.7974889.G>T)位点是内蒙古绒山羊产羔数选育的潜在分子标记,SNP4(g.7977537.T>G)位点是内蒙古绒山羊产羔数、初生重和断乳重选育的潜在分子标记。 展开更多
关键词 ADAMTS1基因 内蒙古绒山羊 产羔性状 SNP
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贵州黑山羊AMH、CYP19A1基因多态性及其与产羔数的关联分析
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作者 杨蓉 周迪 +9 位作者 王珍梅 田兴舟 陈祥 吕艳丽 吴雨 敖叶 郭振刚 赵德鹏 黄清赟 张悻 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第10期4785-4795,共11页
【目的】分析贵州黑山羊抗缪勒氏管激素(AMH)、芳香化酶P450(CYP19A1)基因多态性,筛选出对山羊产羔数有显著影响的单核苷酸多态性(SNP)位点。【方法】以贵州黑山羊为研究对象,利用PCR产物直接测序,对AMH、CYP19A1基因全部外显子进SNP位... 【目的】分析贵州黑山羊抗缪勒氏管激素(AMH)、芳香化酶P450(CYP19A1)基因多态性,筛选出对山羊产羔数有显著影响的单核苷酸多态性(SNP)位点。【方法】以贵州黑山羊为研究对象,利用PCR产物直接测序,对AMH、CYP19A1基因全部外显子进SNP位点筛选,运用在线软件预测AMH、CYP19A1蛋白的二级结构、三级结构以及信号肽,并进行SNP位点与产羔数的关联分析。【结果】在贵州黑山羊AMH基因第5外显子处发现1个SNP位点:g.2612 A>G;在CYP19A 1基因第5外显子处发现1个SNP位点:g.37836 T>C;在CYP19A1基因第10外显子处发现2个SNPs位点:g.48986 C>T和g.49046 A>G。二级结构、三级结构预测发现,AMH、CYP19A1蛋白突变后二级结构稳定性降低,其中无规则卷曲占比最高,具有更高的复杂性,且AMH、CYP19A1蛋白不存在信号肽。χ^(2)检验结果显示,4个SNPs位点基因座均偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),均属于中度多态(0.25<PIC<0.5)。关联分析结果表明,AMH基因g.2612 A>G位点GG基因型贵州黑山羊产羔数极显著或显著高于AG和AA基因型(P<0.01;P<0.05);CYP19A1基因g.49046 A>G位点GG基因型贵州黑山羊产羔数显著高于AA和AG基因型(P<0.05);其他2个SNPs位点不同基因型间产羔数无显著差异(P>0.05)。【结论】AMH、CYP19A1基因g.2612 A>G、g.49046 A>G位点与贵州黑山羊产羔数具有显著相关,可作为山羊产羔性状的分子标记。试验结果为研究贵州黑山羊多胎性状提供了理论依据。 展开更多
关键词 贵州黑山羊 AMH基因 CYP19A1基因 多态性 产羔数
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湖羊产羔性状和生长性状的分子标记研究进展 被引量：1
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作者 王昊天 赵瑞霞 张天闻 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第3期60-68,共9页
湖羊是我国特有的绵羊品种,凭借高繁殖力、高生长速度和高环境适应性等优势成为养殖数量较多的绵羊品种之一。在绵羊养殖业中,产羔性状和生长性状的优劣与经济效益息息相关。随着现代分子生物学发展,分子标记辅助选择技术在绵羊产羔性... 湖羊是我国特有的绵羊品种,凭借高繁殖力、高生长速度和高环境适应性等优势成为养殖数量较多的绵羊品种之一。在绵羊养殖业中,产羔性状和生长性状的优劣与经济效益息息相关。随着现代分子生物学发展,分子标记辅助选择技术在绵羊产羔性状和生长性状的育种改良工作中发挥了重要作用,对优势分子标记进行获取和应用,可显著降低育种改良成本并提高育种改良速度。因此,本文综述了湖羊BMPR1B、ESR、GDF9、MC4R、GHR、GH、PLAG1等基因中的多个分子标记及其对湖羊产羔性状和生长性状的遗传效应,旨在为高产、优质、快长等新品种湖羊的培育提供科学资料。 展开更多
关键词 产羔性状 生长性状 分子标记 养殖业 湖羊
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GDF9、BMPR1B、FSHR基因多态性及其与兴羔肉羊产羔数的关联分析
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作者 乌日古木拉 文兰 +6 位作者 田进东 塔拉 何小龙 王标 达赖 付绍印 丽春 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第4期196-205,共10页
本文通过对繁殖性状相关基因进行Sanger测序和KASP分型检测,挖掘与兴羔肉羊产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),为高繁殖力绵羊分子育种提供新的遗传标记。选取250只兴羔肉羊进行血液样品的采集并... 本文通过对繁殖性状相关基因进行Sanger测序和KASP分型检测,挖掘与兴羔肉羊产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),为高繁殖力绵羊分子育种提供新的遗传标记。选取250只兴羔肉羊进行血液样品的采集并提取基因组DNA,利用混合PCR结合Sanger测序技术检测绵羊生长分化因子9(Growth Differentiation Factor,GDF9)、骨形态发生蛋白受体1B(Bone Morphogenetic Protein Receptor 1B,BMPR1B)、卵泡雌激素受体(Follicle Stimulating Hormone Receptor,FSHR)基因启动子以及第1外显子区DNA序列的多态性,采用KASP技术对多态性位点进行分型检测并利用SPSS 26.0软件的一般线性模型(One-way ANOVA)进行关联分析,研究其与产羔数之间的相关性。结果显示,在GDF9基因启动子区存在g.41771007A>C、g.41770949G>A、g.41770718A>C,BMPR1B基因启动子区存在g.29461868G>A、g.29461739T>G、g.29315643A>G,FSHR基因启动子区存在g.75132264C>T、g.75132365T>C及第1外显子区存在g.75132817G>A共9个多态性位点。卡方检验表明,GDF9基因的g.41771007A>C、g.41770949G>A,BMPR1B基因的g.29315643A>G以及FSHR基因的g.75132365T>C、g.75132264C>T位点均处于哈代-温伯格(Hardy-Weinberg)平衡状态(P>0.05);将处于哈代-温伯格平衡的位点与产羔数关联分析显示,BMPR1B基因的g.29315643A>G,FSHR基因的g.75132264C>T、g.75132365T>C位点与兴羔肉羊产羔数有显著关联;连锁不平衡分析结果表明,兴羔肉羊群体中,GDF9基因和BMPR1B基因的6个位点之间处于较弱的连锁平衡状态,而FSHR基因的3个位点之间处于较强的连锁不平衡状态。以上结果表明,在兴羔肉羊GDF9、BMPR1B及FSHR基因上鉴定到9个多态性位点,其中BMPR1B基因的g.29315643A>G和FSHR基因的g.75132264C>T、g.75132365T>C位点可作为兴羔肉羊的潜在候选遗传标记。本研究结果为兴羔肉羊繁殖性能的研究提供了参考数据。 展开更多
关键词 绵羊 GDF9基因 BMPR1B基因 FSHR基因 产羔数
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SMAD1和KISS1基因组织表达量与阿勒泰羊产羔数的关联分析
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作者 马应国 於建国 +3 位作者 艾布什·努尔兰 叶尔肯·黑扎提 郝耿 刘玲玲 《新疆农业科学》 北大核心 2025年第9期2276-2285,共10页
【目的】本研究以阿勒泰羊为研究对象,对SMAD家族成员1(SMAD1)和肿瘤转移抑制基因(KISS1)与基因多态性与产羔数的相关性分析,同时利用qPCR法研究对该基因在单、双羔组的阿勒泰羊的不同组织间内mRNA差异表达量,以寻找绵羊产羔性状分子标... 【目的】本研究以阿勒泰羊为研究对象,对SMAD家族成员1(SMAD1)和肿瘤转移抑制基因(KISS1)与基因多态性与产羔数的相关性分析,同时利用qPCR法研究对该基因在单、双羔组的阿勒泰羊的不同组织间内mRNA差异表达量,以寻找绵羊产羔性状分子标记和绵羊育种提供科学依据。【方法】对KISS1和SMAD1基因SNP进行KASP基因分型,并将不同基因型与产羔数进行关联分析。利用qPCR法对KISS1和SMAD1基因在单、多羔阿勒泰羊9个不同组织中的相对表达水平进行检测。【结果】SMAD1基因(g.12487190G>T)2种基因型频率为0.93(GG)和0.07(GT),KISS1基因(g.1311578G>T)2种基因型频率为0.88(GG)和0.12(GT);群体遗传学分析表明,SMAD1和KISS1基因处于低度多态位点(PIC<0.25);χ^(2)检验结果表明均处于哈代温伯格(Hardy-weinberg)平衡状态(P>0.05);关联分析表明,SMAD1基因g.12487190G>T位点的GG基因型个体产羔数与GT基因型个体产羔数差异不显著(P>0.05),KISS1基因g.1311578G>T位点的GT基因型个体产羔数显著高于GG基因型个体产羔数(P<0.05);qPCR结果显示:KISS1基因主要在阿勒泰羊的子宫、垂体和下丘脑组织中表达,对不同产羔数相同组织的表达量分析表明,在多羔组中子宫组织中mRNA的表达量显著高于单羔组(P<0.05)。SMAD1基因主要在阿勒泰羊的下丘脑、子宫和垂体组织中表达,对不同产羔数相同组织表达量的分析表明,在多羔组下丘脑的mRNA的表达量显著高于单羔组(P<0.05)。【结论】KISS1基因可能与阿勒泰羊的胚胎发育密切相关,其g.1311578G>T位点可作为阿勒泰羊产羔性状选育的潜在分子标记。 展开更多
关键词 阿勒泰羊 SMAD1基因 KISS1基因 组织表达 多态性 产羔数
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山羊FAM135A和STK3基因多态性与产羔性能的关联分析
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作者 余平 狄冉 储明星 《特产研究》 2025年第3期27-32,38,共7页
本研究旨在分析序列相似性家族135成员A(Family With Sequence Similarity 135 Member A, FAM135A)基因和丝/酪氨酸蛋白激酶3(Serine/Threonine Protein Kinase 3, STK3)基因的多态性位点与山羊产羔数的关联。基于Sequenom MassARRAY SN... 本研究旨在分析序列相似性家族135成员A(Family With Sequence Similarity 135 Member A, FAM135A)基因和丝/酪氨酸蛋白激酶3(Serine/Threonine Protein Kinase 3, STK3)基因的多态性位点与山羊产羔数的关联。基于Sequenom MassARRAY SNP技术对FAM135A和STK3基因的4个候选位点进行分型,并分析了云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中4个候选位点的遗传学特征,同时将这些突变位点与云上黑山羊的繁殖性能(包括产羔数、初生窝重和断奶窝重)作了关联分析。结果显示,在不同繁殖力品种(济宁青山羊和辽宁绒山羊)中,FAM135A基因的g.91260230 G>T和g.91261141 G>A位点以及STK3基因的g.16434985 C>T位点基因型的分布存在着极显著差异(P <0.01);而不同繁殖力品种中STK3基因的g.16648187 C>T位点的基因型分布却没有明显差异(P>0.05)。关联分析结果表明,g.91260230 G>T位点的各基因型在云上黑山羊的产羔数、初生窝重和断奶窝重上都没有明显差异(P>0.05);但g.91261141 G>A位点与产羔数和初生窝重显著相关,GG型产羔数和窝重均显著高于AG型(P <0.05);g.16434985 C>T位点TT型的初生窝重显著高于CT型(P <0.05),但该位点的各基因型对山羊的产羔数和断奶窝重并没有显著影响(P>0.05);g.16648187 C>T位点与山羊的产羔数和初生窝重之间都没有显著关联(P>0.05)。综上,本研究发现FAM135A基因的g.91261141 G>A位点是云上黑山羊产羔数与初生窝重选择的潜在遗传标记。STK3基因的g.16434985 C>T位点适合初生窝重的选择。 展开更多
关键词 山羊 产羔数 窝重 FAM135A基因 STK3基因
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繁殖羊场春季产羔管理 被引量：1
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作者 苏畜 《农家致富》 2025年第2期35-36,共2页
春季是母羊产羔比较集中的季节,但是早春气温多变等诸多因素会影响羔羊的成活率,因此,繁殖羊场应做好母羊分娩产羔和羊羔的管理工作,这对于维护母羊健康,提高羔羊的成活率,促进羔羊健康生长具有重要作用。一、母羊产羔管理母羊正常产羔... 春季是母羊产羔比较集中的季节,但是早春气温多变等诸多因素会影响羔羊的成活率,因此,繁殖羊场应做好母羊分娩产羔和羊羔的管理工作,这对于维护母羊健康,提高羔羊的成活率,促进羔羊健康生长具有重要作用。一、母羊产羔管理母羊正常产羔时,应让其自行产出。 展开更多
关键词 产羔 羔羊 羊场 成活率 母羊 羊羔 早春 健康生长
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澳湖F1代RASA2基因多态性及其与产羔性状的关联分析
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作者 王若桐 裴琳琳 +4 位作者 王文豪 王金龙 高庆华 徐鑫 刘春洁 《塔里木大学学报》 2025年第6期77-87,共11页
本研究以澳湖F1代绵羊群体为研究对象,采用PCR测序检测600只母羊RASA2基因20号外显子上3个单核苷酸多态性(SNP)位点,并根据PASW statistics 18.0 GLM和SPSS 22.0软件分析RASA2基因3个SNPs位点(g.245315235T>A、g.2451314883T>C和g... 本研究以澳湖F1代绵羊群体为研究对象,采用PCR测序检测600只母羊RASA2基因20号外显子上3个单核苷酸多态性(SNP)位点,并根据PASW statistics 18.0 GLM和SPSS 22.0软件分析RASA2基因3个SNPs位点(g.245315235T>A、g.2451314883T>C和g.2451314934T>C)的突变与2~3岁母羊不同体重(41~50 kg,51~60 kg,61~70 kg)不同胎次产羔数的关联性。结果显示RASA2基因中检测到3个SNPs位点:g.245315235T>A、g.2451314934T>C和g.2451314883T>C位点,分别产生优势基因型TA、TC、TC,且均为中度多态,其中g.245315235T>A属于错义突变,在第422密码子第3位,导致氨基酸从半胱氨酸(Cys)突变成谷氨酸(Glu);g.245314883T>C属于错义突变,在第366密码子第2位,导致氨基酸从甲硫氨酸(Met)变成Cys;g.245314934T>C属于错义突变,在第320密码子第2位,导致氨基酸从亮氨酸(Leu)突变成脯氨酸(Pro)。3个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),但3个SNPs位点两两间存在连锁不平衡,产生4种单倍型TA、TC、CA、CC。关联分析发现,体重在51~60 kg的TA、TC、TC突变基因型与不同胎次产羔数均呈显著相关,聚合基因型主要以TTAA和TCTC为主。本研究揭示RASA2基因SNPs位点的多态性,在绵羊繁殖性状进化选择过程中具有强渗透性,可能为将来多胎肉羊新品种(系)培育和选择提供可参考的数据依据。 展开更多
关键词 RASA2基因 澳湖F1代 SNP 产羔性状
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不同繁殖力绵羊GnRHR基因多态性检测及其与产羔数关联分析
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作者 郭鹏飞 赵高平 +4 位作者 赵宇龙 宋永利 包花拉 李云霞 李喜和 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第9期219-226,共8页
为探究GnRHR基因多态性与不同繁殖力绵羊产羔数关联性,筛选与绵羊繁殖性状显著相关的分子遗传标记,本研究以东佛里生羊、乌珠穆沁羊和湖羊3种不同繁殖力绵羊为研究对象,通过混合DNA池直接测序获取SNP位点,使用HRM分析技术对这3种绵羊群... 为探究GnRHR基因多态性与不同繁殖力绵羊产羔数关联性,筛选与绵羊繁殖性状显著相关的分子遗传标记,本研究以东佛里生羊、乌珠穆沁羊和湖羊3种不同繁殖力绵羊为研究对象,通过混合DNA池直接测序获取SNP位点,使用HRM分析技术对这3种绵羊群体进行基因分型,随后分析不同基因型母羊之间产羔数的差异。研究结果表明:东佛里生羊GnRHR基因第1外显子发现存在C289T位点突变,表现有CC和CT2种基因型,其中CT基因型母羊平均产羔数1.76只,显著高于CC基因型母羊;乌珠穆沁羊和湖羊GnRHR基因第3外显子都存在A779G位点突变,表现有AA和AG 2种基因型,但不同基因型母羊间产羔数不具有显著差异;3种绵羊GnRHR基因第3外显子都存T1487C位点突变,表现有TT、TC和CC 3种基因型,且东佛里生羊TT比TC和CC基因型母羊分别平均多产羔0.21只和0.32只(P<0.05),乌珠穆沁羊TT和TC基因型母羊分别比CC基因型母羊平均多产羔0.39只和0.34只(P<0.05)。综上所述,GnRHR基因C289T和T1487C位点与东佛里生羊产羔数有显著关联,且T1487C位点与乌珠穆沁羊产羔数同样具有显著相关性,这2位点初步揭示了GnRHR基因与绵羊繁殖性状之间的关联性,并为进一步筛选和利用相关分子标记提供了基础数据,为高繁殖力新品系绵羊的选育奠定了基础。 展开更多
关键词 绵羊 繁殖性能 GnRHR基因 产羔数 关联分析
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