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In vivo consequences of varying degrees of OTOA alteration elucidated using knock-in mouse models and pseudogene contamination-free long-read sequencing
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作者 Ju Ang Kim Bong Jik Kim +7 位作者 Chung Lee Go Hun Seo Hane Lee Jin Hee Han Ava Niazi Joosang Park Byung Yoon Choi Sungjin Park 《Genes & Diseases》 2025年第3期88-92,共5页
Otoancorin(OTOA)is a glycosylphosphatidylinositol(GPI)-anchored protein mediating the attachment of the tectorial membrane(TM)to the spiral limbus(SL)in the inner ear.Homozygous or compound heterozygous mutations in O... Otoancorin(OTOA)is a glycosylphosphatidylinositol(GPI)-anchored protein mediating the attachment of the tectorial membrane(TM)to the spiral limbus(SL)in the inner ear.Homozygous or compound heterozygous mutations in OTOA cause autosomal recessive deafness(DFNB22).We performed short-read exome sequencing(SRS)in a 10-monthold boy with sensorineural hearing loss,identifying a potential p.Glu787*variant in OTOA.Interestingly,this variant is common among normal-hearing individuals,leading us to question its pathogenic potential. 展开更多
关键词 vivo consequences glycosylphosphatidylinositol anchored protein autosomal recessive deafness dfnb we tectorial membrane tectorial membrane tm pseudogene contamination free long read sequencing knock mouse models sensorineural hearing lossidentifying
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Free gait generation method for omnidirectional locomotion on abrupt terrain with multi-legged biomimetic robot 被引量:1
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作者 陈甫 赵杰 +1 位作者 臧希喆 闫继宏 《Journal of Harbin Institute of Technology(New Series)》 EI CAS 2011年第2期101-106,共6页
In order to achieve omnidirectional locomotion on rough terrain with multi-legged biomimetic robot,a free gait generation approach is proposed based on local rules.The phase coordinates of each operation leg was estab... In order to achieve omnidirectional locomotion on rough terrain with multi-legged biomimetic robot,a free gait generation approach is proposed based on local rules.The phase coordinates of each operation leg was established according to the motion task and a universal depiction of leg-end locomotion was implemented;the mathematical relation of gait pattern and walking velocity of multi-legged robot was put forward;combined polynomial curve was adopted to generate the leg-end trajectory,which was capable of accomplishing walking missions and accommodating to landform conditions;a distributed network of local rules for gait control was constructed based on a set of local rules operating between adjacent legs.In the simulation experiments,adaptive regulation of inter-leg phase sequence,omnidirectional locomotion and ground accommodation were realized.Moreover,statically stable free gait was obtained simultaneously,which provided multi-legged robot with the capability of walking on irregular terrain reliably and expeditiously. 展开更多
关键词 multi-legged robot rough terrain walking free gait local rules inter-leg phase sequence
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Free fatty acids, glucose, and insulin in type 2 diabetes mellitus 被引量:1
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作者 Rob NM Weijers 《World Journal of Diabetes》 SCIE 2022年第3期275-277,共3页
Xu et al used the HOMA2 model to estimate theβ-cell function and insulin resistance levels in an individual from simultaneously measured fasting plasma glucose and fasting plasma insulin levels.This method is based o... Xu et al used the HOMA2 model to estimate theβ-cell function and insulin resistance levels in an individual from simultaneously measured fasting plasma glucose and fasting plasma insulin levels.This method is based on the assumption that the glucose-insulin axis is central for the metabolic activities,which led to type 2 diabetes.However,significant downregulation of both the NKX2-1 gene and the TPD52L3 gene force an increase in the release of free fatty acids(FFAs)into the blood circulation,which leads to a marked reduction in membrane flexibility.These data favor a FFA-glucose-insulin axis.The authors are invited to extend their study with the introduction of the saturation index(number of carbon-carbon double bonds per 100 fatty-acyl chains),as observed in erythrocytes. 展开更多
关键词 free fatty acids Membrane flexibility NKX2-1 gene RNA sequencing Type 2 diabetes TPD52L-3 gene Unsaturation index
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基于k-mer特征集合的非比对算法研究进展
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作者 杨振华 《河北北方学院学报(自然科学版)》 2025年第1期30-36,共7页
随着高通量测序技术的发展,产生了大量全基因组序列数据。为提升非比对算法在构建全基因组序列进化关系方面的灵敏度和准确性,选择合适的k-mer模体数目十分重要。综述了4类基于k-mer特征集的非比对计算方法:k-mer频率、k-mer间隔分布、k... 随着高通量测序技术的发展,产生了大量全基因组序列数据。为提升非比对算法在构建全基因组序列进化关系方面的灵敏度和准确性,选择合适的k-mer模体数目十分重要。综述了4类基于k-mer特征集的非比对计算方法:k-mer频率、k-mer间隔分布、k-mer与机器学习结合以及k-mer频谱。这些非比对算法在选择k-mer模体数目时具有一定的随意性,从而降低了其作为物种分类标准的可靠性。基于k-mer频谱特征的方法,能够筛选出与基因组进化密切相关的k-mer客观特征集合,这为更加客观表征物种进化关系提供了有效方法。 展开更多
关键词 非比对算法 全基因组序列 k-mer特征集合 进化关系
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全自由呼吸心脏磁共振检查之左、右心功能成像及分析 被引量:1
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作者 刘乐乐 尹刚 +7 位作者 蒋梦迪 韩紫娟 安靖 王开福 王伟 葛英辉 刘婷 陆敏杰 《放射学实践》 北大核心 2025年第11期1383-1389,共7页
目的:探讨全自由呼吸下(FB)压缩感知(CS)实时采集与回顾性运动校正(MoCo)技术结合的电影序列在左、右心室功能成像及分析中的可行性,并与常规心脏磁共振(CMR)回顾性心电门控K空间分段(Seg)填充采集的屏气(BH)电影序列进行对比。方法:前... 目的:探讨全自由呼吸下(FB)压缩感知(CS)实时采集与回顾性运动校正(MoCo)技术结合的电影序列在左、右心室功能成像及分析中的可行性,并与常规心脏磁共振(CMR)回顾性心电门控K空间分段(Seg)填充采集的屏气(BH)电影序列进行对比。方法:前瞻性纳入47例心脏病患者,采用3.0T MR扫描仪,分别获得FB和BH电影图像。使用Likert 5分量表评估两种电影序列的图像质量(IQ)及测量左、右心室功能参数包括舒张末期容积(EDV)、收缩末期容积(ESV)、每搏输出量(SV)、射血分数(EF)、心排血量(CO)及心肌质量(Mass)。结果:FB和BH序列的图像质量评分分别为3.83±0.73和3.98±0.82(Z=-1.313,P=0.189)。FB和BH序列的平均扫描时间分别为(150.43±28.27)s和(397.92±42.64)s(Z=-5.978,P<0.001)。两种技术在评估双心室容积各种参数时差异无统计学意义(均P>0.05),Bland-Atlman分析显示了良好的一致性。结论:自由呼吸运动校正的心脏电影MRI结合压缩感知技术与常规屏气电影序列相比,图像质量相近,左右心室收缩功能评价一致性好,且显著缩短了扫描时间,明显提高了临床扫描效率。 展开更多
关键词 心脏磁共振成像 电影序列 压缩感知 自由呼吸 运动校正
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自由能计算指导的cyst(e)inase的理性设计
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作者 唐梦佳 夏志勇 +4 位作者 张倩 樊帅 张志斐 李小娜 杨兆勇 《生物学杂志》 北大核心 2025年第6期1-6,61,共7页
胱硫醚γ-裂解酶(CGL)的突变体cyst(e)inase能够有效降解胱氨酸(CSSC)和半胱氨酸(L-Cys),并通过破坏肿瘤细胞的氧化还原稳态展现出抗肿瘤活性,但目前仍未达到临床应用的要求。为了提高cyst(e)inase在降解CSSC和L-Cys方面的活性及其热力... 胱硫醚γ-裂解酶(CGL)的突变体cyst(e)inase能够有效降解胱氨酸(CSSC)和半胱氨酸(L-Cys),并通过破坏肿瘤细胞的氧化还原稳态展现出抗肿瘤活性,但目前仍未达到临床应用的要求。为了提高cyst(e)inase在降解CSSC和L-Cys方面的活性及其热力学稳定性,研究通过分析蛋白序列的保守性,聚焦保守性较高的氨基酸位点,结合虚拟位点饱和突变计算自由能,筛选出潜在的有益突变体。研究结果表明,针对119个位点进行虚拟饱和突变后,通过自由能计算筛选出32个潜在的有益突变体。实验验证表明,其中,8个突变体在对CSSC和L-Cys的活性上有所提高。其中,最优突变体S206I,与cyst(e)inase相比,对CSSC和L-Cys活性分别提高了40%和60%,k_(cat)/K_(m)分别提高了23%和230%,T_(m)值提高了1.89℃。研究通过简便高效的设计策略,获得了具有活性和稳定性都提高的突变体,为后续酶制剂药物的改造提供了重要的示范。 展开更多
关键词 胱硫醚γ-裂解酶 理性设计 自由能计算 序列保守性 酶动力学
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基于级联映射ZC序列的大容量GFRA前导设计方法
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作者 甄立 马明珂 +3 位作者 裴晨晨 董萍 王文静 秦浩 《电讯技术》 北大核心 2025年第5期800-808,共9页
在面向卫星物联网的免授权随机接入(Grant-free Random Access,GFRA)系统中,受大规模连接和设备随机激活的影响,前导碰撞成为用户接入性能提升的主要制约因素。鉴于此,借助正交与非正交序列在前导检测和冲突抑制方面的各自优势,提出一... 在面向卫星物联网的免授权随机接入(Grant-free Random Access,GFRA)系统中,受大规模连接和设备随机激活的影响,前导碰撞成为用户接入性能提升的主要制约因素。鉴于此,借助正交与非正交序列在前导检测和冲突抑制方面的各自优势,提出一种基于混合ZC(Zadoff-Chu)序列的大容量前导设计和检测方法。该方法利用正交ZC序列与其循环移位映射的不同根ZC序列级联来构建前导序列,并采用一种基于假设检验的两阶段干扰消除活跃用户检测算法,以确保大规模接入场景下的高精度用户识别。此外,对所提前导结构进行扩展,将相位旋转因子与多段非正交序列相结合,在不增加峰均比的前提下进一步扩大前导集容量。所提方法较现有复合和正交前导方法具有显著改善的多用户识别性能,在相同活跃用户下,成功检测概率最大提升约30.3%。 展开更多
关键词 卫星物联网 免授权随机接入(GFRA) 活跃用户检测 级联映射前导 ZC序列
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血浆游离DNA检测对非小细胞肺癌靶向治疗相关基因筛选及患者预后预测的研究
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作者 邓绮玲 宋迪 +3 位作者 奚可欣 谢晓婷 吴小延 赵卫 《中国癌症杂志》 北大核心 2025年第4期355-364,共10页
背景与目的:肿瘤患者血浆游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)高通量检测广泛用于肿瘤靶向治疗相关基因的筛选。本研究探讨cfDNA中Ⅰ类及Ⅱ类靶向治疗相关基因变异类型及数量与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患癌预后的关系... 背景与目的:肿瘤患者血浆游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)高通量检测广泛用于肿瘤靶向治疗相关基因的筛选。本研究探讨cfDNA中Ⅰ类及Ⅱ类靶向治疗相关基因变异类型及数量与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患癌预后的关系。方法:收集2021年—2023年在中山大学肿瘤防治中心进行血浆cfDNA高通量测序项目的NSCLC患者的测序结果及临床资料,并对入组患者从2021年6月1日采集血浆当天开始截至2024年5月27日进行生存随访,并使用GraphPad Prism 8.0及SPSS Statistics 25.0对患者生存期与临床资料及测序结果中Ⅰ类与Ⅱ类靶向治疗相关基因类型及数目进行单因素及多因素统计学分析(伦理批号:B2024-359-01)。结果:313例NSCLC患者中确诊时分期Ⅰ期25例(7.98%)、Ⅱ期20例(6.39%)、Ⅲ期38例(12.14%)和Ⅳ期230例(73.48%);组内NSCLC分型包含腺癌(90.10%),鳞癌(5.11%),大细胞癌(2.87%)及其他分型(1.92%);入组的NSCLC患者血浆cfDNA中Ⅰ类与Ⅱ类靶向治疗相关基因数及占比分别为:0个(25.24%)、1个(17.57%)、2个(19.17%)、3个(14.38%)、4个(8.31%)、5个及以上(15.34%)。患者血浆cfDNA高通量测序检测结果中,突变频率最高的3个基因分别为EGFR、TP53、ERBB2基因,其中EGFR基因突变频率为36.04%,TP53基因突变频率为30.63%,ERBB2基因突变频率为4.95%。患者生存期不仅与热点靶向基因表达情况相关,与血浆cfDNA高通量测序中Ⅰ类和Ⅱ类靶向相关位点基因变异个数也呈正相关。经过治疗后无靶向治疗相关基因的位点变异比有靶向治疗相关基因的位点变异的患者的生存期长,死亡风险可降低63.2%。而单纯一个基因位点变异比多个驱动基因位点变异的患者的生存期长,死亡风险更低,所测得的Ⅰ类及Ⅱ类靶向治疗药物在3个基因数以内,基因数目越少,患者的生存期越长。结论:血浆cfDNA高通量测序中Ⅰ类和Ⅱ类靶向相关位点基因变异个数对经过治疗后的NSCLC患者的生存期有影响。血浆cfDNA高通量测序检测可作为患者预后的评估指标。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 血浆游离DNA 高通量测序 基因突变位点 靶向治疗药物筛选 生存分析
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开绕组永磁同步电机的无模型电流预测控制策略 被引量:1
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作者 路冰 邓福军 《自动化与仪表》 2025年第1期43-48,53,共7页
针对共母线型开绕组永磁同步电机的零序电流和模型电流预测控制中电机参数易受影响的问题,提出了一种无模型电流预测策略。首先,将电流预测控制与无模型控制结合,引入线性状态观测器对系统扰动进行估计;其次,使用价值函数以及电压矢量... 针对共母线型开绕组永磁同步电机的零序电流和模型电流预测控制中电机参数易受影响的问题,提出了一种无模型电流预测策略。首先,将电流预测控制与无模型控制结合,引入线性状态观测器对系统扰动进行估计;其次,使用价值函数以及电压矢量扇形策略选择最佳基本电压矢量和作用时间,且通过非零矢量产生的零序电压和参考值的差量得到补偿的零序电压,并选择计算其注入的混合零矢量以及作用时间;最后,用滑模控制改进状态误差反馈的自抗扰控制来代替速度环的PI控制。仿真结果表明,该改进方法使零序电流的波动范围缩小在0.2 A之间,提高了系统的响应速度,验证了此方法的有效性和可行性。 展开更多
关键词 开绕组永磁同步电机 共直流母线 零序电流 滑模自抗扰控制 无模型预测控制
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中山体育馆自由曲面双层网架施工过程模拟与监测
10
作者 高晓明 么学春 +1 位作者 郭世超 宗亮 《四川建筑科学研究》 2025年第1期103-110,共8页
中山体育馆上部结构复杂,施工难度较大。对中山体育馆上部自由曲面双层网架的施工过程进行了数值模拟,实现了对施工过程的精准预测,并对实际工程提供了指导。通过ABAQUS建立了网架有限元模型,对网架不同拼装方案、支座焊接顺序和卸载顺... 中山体育馆上部结构复杂,施工难度较大。对中山体育馆上部自由曲面双层网架的施工过程进行了数值模拟,实现了对施工过程的精准预测,并对实际工程提供了指导。通过ABAQUS建立了网架有限元模型,对网架不同拼装方案、支座焊接顺序和卸载顺序进行了有限元计算分析以及预变形分析,对施工过程中竖向变形预测值较大节点进行了施工监测。结果表明:施工过程中结构的内力、变形均处于安全水平,可以根据现场条件选择较优的施工方案和施工顺序,通过2次正装迭代即可满足结构设计位形;竖向变形实测值与预测值吻合较好,施工过程模拟较为准确。 展开更多
关键词 自由曲面双层网架 施工模拟 施工方案 施工顺序
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基于临床因素-MRI平衡式稳态自由进动序列影像组学诊断直肠癌T2与T3分期效能的研究 被引量:1
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作者 章俊 张海青 +3 位作者 张敏 夏鹏 陶利 李君君 《中国实验诊断学》 2025年第3期249-256,共8页
目的探讨基于临床因素结合MRI平衡式稳态自由进动序列(balanced steady-state free precession,b SSFP)影像组学诊断直肠癌T2与T3分期效能的研究。方法回顾性分析经病理证实的236例直肠癌患者,术前均行MRI检查,其中T2期102例,T3期134例... 目的探讨基于临床因素结合MRI平衡式稳态自由进动序列(balanced steady-state free precession,b SSFP)影像组学诊断直肠癌T2与T3分期效能的研究。方法回顾性分析经病理证实的236例直肠癌患者,术前均行MRI检查,其中T2期102例,T3期134例。首先,将入组病例按8∶2的比例随机分为训练组(n=189)和验证组(n=47),采用多种统计学方法和建模技术,包括t检验/Wilcoxons秩和检验、最小绝对收缩和选择算子算法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)、Spearman相关性分析和Logistic回归等,分析常规T2WI序列、b SSFP序列和临床因素的影像组学特征,分别构建单一序列影像组学模型和临床因素-b SSFP序列联合模型,绘制受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic,ROC)和计算曲线下面积(area under the curve,AUC)、特异度和灵敏度,比较并验证多种影像组学模型在直肠癌T2与T3分期中的诊断效能。结果影像组学模型具有较强的鉴别能力,其中常规T2WI序列影像组学模型训练组(AUC:0.793,95%CI:0.786~0.838),特异度为0.779,灵敏度为0.635;验证组(AUC:0.661,95%CI:0.551~0.817),特异度为0.781,灵敏度为0.648;b SSFP序列训练组(AUC:0.925,95%CI:0.923~0.927),特异度为0.918,灵敏度为0.861;验证组(AUC:0.830,95%CI:0.815~0.833),特异度为0.900,灵敏度为0.750;临床因素结合b SSFP序列影像学组学联合模型训练组(AUC:0.938;95%CI:0.926~0.950),特异度为0.971,灵敏度为0.878;验证组(AUC:0.867;95%CI:0.806~0.984),特异度为0.935,灵敏度为0.815,校准度良好且差异有统计学意义(P<0.05)。结论基于临床因素结合磁共振b SSFP序列影像组学联合模型能高效能诊断直肠癌T2与T3分期。 展开更多
关键词 磁共振成像 影像组学 平衡式稳态自由进动序列 直肠癌 T2期 T3期
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Redesign of a short-chain dehydrogenase/reductase for asymmetric synthesis of ethyl (R)-2-hydroxy-4-phenylbutanoate based on per-residue free energy decomposition and sequence conservatism analysis 被引量:1
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作者 Bingmei Su Lian Xu +5 位作者 Xinqi Xu Lichao Wang Aipeng Li Juan Lin Lidan Ye Hongwei Yu 《Green Synthesis and Catalysis》 2020年第2期150-159,共10页
As an important building block for the synthesis of angiotensin-converting enzyme inhibitors,ethyl(R)-2-hy-droxyl-4-phenylbutanoate[(R)-HPBE]has attracted increasing attention.The key to industrial biosynthesis of(R)-... As an important building block for the synthesis of angiotensin-converting enzyme inhibitors,ethyl(R)-2-hy-droxyl-4-phenylbutanoate[(R)-HPBE]has attracted increasing attention.The key to industrial biosynthesis of(R)-HPBE is a biocatalyst that efficiently reduces ethyl 2-oxo-4-phenylbutanoate(OPBE)with high R-enantiose-lectivity.This paper proposed a strategy for identifying key residues involved in enantioselectivity control based on per-residue free energy decomposition and sequence conservatism analysis.Using this strategy,4 noncon-servative sites with high energy contribution to binding of OPBE were chosen as engineering targets,generating variant Mu27 with 99%conversion and 98%(R)ee value at substrate loading of up to 500 mmol/L.MD simu-lations suggested the higher stability and formation probability of Mu27-OPBEproR prereaction state as key rea-sons for the excellent R-enantioselectivity of Mu27 towards OPBE.The success in this study provides a viable approach for rational design of alcohol dehydrogenases with high enantioselectivity towards unnatural substrates. 展开更多
关键词 Ethyl(R)-2-hydroxy-4-phenylbutanoate Rational design Enantioselectivity Short-chain dehydrogenase/reductase Per-residue free energy decomposition sequence conservatism analysis
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基于共线性长测序数据的单染色体组装方法
13
作者 李梦然 甘祥超 《南京农业大学学报》 北大核心 2025年第4期969-976,共8页
[目的]本文提出一种基于长测序数据的单染色体组装方法,旨在更加准确高效组装出完整的基因组。[方法]利用GALA中的染色体分离算法,将初步组装中的contigs按染色体进行聚类,然后提取测序数据中的reads进行单染色体组装。受到测序数据质... [目的]本文提出一种基于长测序数据的单染色体组装方法,旨在更加准确高效组装出完整的基因组。[方法]利用GALA中的染色体分离算法,将初步组装中的contigs按染色体进行聚类,然后提取测序数据中的reads进行单染色体组装。受到测序数据质量和预组装结果的影响,有时contigs的聚类结果不够完美,导致后续单染色体组装难度增加。为了克服这一问题,提出了一种基于共线性分析辅助聚类的方法。该方法利用同物种或亲缘关系较近物种的参考基因组与GALA聚类生成的scaffolding groups进行共线性分析,根据比对结果将属于同一条染色体的scaffolding groups进行合并,使scaffolding groups中的序列长度与整条染色体相当,再根据合并后的结果提取reads进行单染色体组装。[结果]这套方法被应用在水稻(Oryza sativa)和桃金娘(Rhodomyrtus tomentosa)基因组组装,利用ONT的水稻测序数据组装出了长度379.89 Mb,N50为30.54 Mb,包含12条完整端粒到端粒的染色体。基于HiFi测序数据组装出总长度485.54 Mb,包含11条染色体,N50为46.71 Mb,不存在任何gap的桃金娘基因组。[结论]本文提出的组装方法不仅组装出准确完整的基因组,而且对不同种类的测序数据具有很强的适用性,为后续开展基因组学相关研究提供了可靠数据资源。 展开更多
关键词 基因组组装 长测序数据 单染色体组装 无间隙 共线性分析
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求解一类非线性矩阵方程正定解的无逆迭代算法
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作者 熊昊 王云 黄玉莲 《广西民族大学学报(自然科学版)》 2025年第4期77-83,共7页
该文讨论非线性矩阵方程X+A^(*)X^(-t)A=I的Hermite正定解的迭代方法。首先利用系数矩阵给出矩阵方程Hermite正定解的存在区间并提出一种新的无逆迭代格式,构建出新算法的研究思路,并利用偏序和迭代序列的单调有界性证明了所给迭代算法... 该文讨论非线性矩阵方程X+A^(*)X^(-t)A=I的Hermite正定解的迭代方法。首先利用系数矩阵给出矩阵方程Hermite正定解的存在区间并提出一种新的无逆迭代格式,构建出新算法的研究思路,并利用偏序和迭代序列的单调有界性证明了所给迭代算法的收敛性。同时证明了当系数矩阵A是正规矩阵时,产生的迭代序列{X_(k)}{Y_(k)}可交换。最后运用3个数值算例验证所给方法优于现有无逆迭代算法。 展开更多
关键词 非线性矩阵方程 HERMITE正定解 无逆迭代 迭代序列 收敛性
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孕妇尿液游离DNA在胎儿染色体异常检测中的研究进展
15
作者 赵佳 宋硕 《妇儿健康导刊》 2025年第5期27-31,36,共6页
孕妇尿液游离DNA作为一种非侵入性的生物标志物,在胎儿染色体异常检测中展现出巨大的潜力。胎儿游离DNA的血浆清除机制之一是由肾脏经尿液清除,通过高通量测序技术开发基于尿液游离DNA的无创检测,以确定胎儿染色体非整倍体异常,对比现... 孕妇尿液游离DNA作为一种非侵入性的生物标志物,在胎儿染色体异常检测中展现出巨大的潜力。胎儿游离DNA的血浆清除机制之一是由肾脏经尿液清除,通过高通量测序技术开发基于尿液游离DNA的无创检测,以确定胎儿染色体非整倍体异常,对比现有外周血无创产前检测技术,尿液有望成为一种更安全、便捷的临床诊断标本。本文就孕妇尿液游离DNA在胎儿染色体异常检测中应用进展进行综述。 展开更多
关键词 孕妇尿液 游离DNA 胎儿染色体异常 高通量测序
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纳米孔测序技术在脓毒症病原学诊断中的应用进展
16
作者 王栋 杨泺 张李涛 《标记免疫分析与临床》 2025年第7期1506-1511,共6页
脓毒症是一种由感染引起的宿主反应失调所致的危及生命的器官功能障碍,表现为一种具有高死亡率的临床综合征。快速明确病原体是精准治疗脓毒症的重要基石。“血培养”目前存在检测周期长、阳性检出率低及覆盖面窄等不足。近年来,纳米孔... 脓毒症是一种由感染引起的宿主反应失调所致的危及生命的器官功能障碍,表现为一种具有高死亡率的临床综合征。快速明确病原体是精准治疗脓毒症的重要基石。“血培养”目前存在检测周期长、阳性检出率低及覆盖面窄等不足。近年来,纳米孔测序技术(nanopore sequencing technology,NST)以其快速实时分析、长读取长度及无需扩增的特点,逐渐成为脓毒症病原学诊断领域的新技术之一。本文将主要介绍NST的原理及特点,以及其在脓毒症感染病原体快速鉴定和病原体耐药基因的检测中的应用,并对该技术的不足进行阐述和应用前景进行展望,以期能够为NST在脓毒症诊疗中的应用研究提供视角。 展开更多
关键词 纳米孔测序技术 脓毒症 病原学诊断 快速诊断 微生物游离DNA 抗菌药物耐药
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基于Bp-MRI平衡式稳态自由进动序列和Gd-DTPA增强影像组学诊断直肠癌壁外血管侵犯效能的研究
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作者 章俊 沈倩丽 +1 位作者 李君君 张海青 《影像科学与光化学》 2025年第6期12-19,共8页
目的:评估基于双参数MRI的b-SSFP序列和Gd-DTPA增强影像组学联合模型在直肠癌壁外血管侵犯诊断中的效能。方法:纳入166例经病理确诊的直肠癌患者,分为两组进行模型训练和验证。通过手动划分ROI并提取影像组学特征,构建预测模型。结果:... 目的:评估基于双参数MRI的b-SSFP序列和Gd-DTPA增强影像组学联合模型在直肠癌壁外血管侵犯诊断中的效能。方法:纳入166例经病理确诊的直肠癌患者,分为两组进行模型训练和验证。通过手动划分ROI并提取影像组学特征,构建预测模型。结果:双参数影像组学模型在训练组和验证组中均表现出高诊断效能,AUC值分别为0.950和0.957,特异度分别为0.929和0.924,灵敏度分别为0.924和0.935。结论:本研究提出的联合模型在直肠癌壁外血管侵犯的术前诊断中具有高效能,具有临床推广价值。未来研究将进一步探索模型的优化和应用范围。 展开更多
关键词 磁共振成像 影像组学 平衡式稳态自由进动序列 增强扫描 壁外血管侵犯
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我国近海浒苔漂浮种类ITS与18SrDNA序列相似性分析 被引量:20
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作者 应成琦 张婷 +6 位作者 李信书 田千桃 霍元子 马家海 徐韧 王金辉 何培民 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期215-219,共5页
2008年6-7月在青岛近海海域再次发生大量浒苔漂浮现象,并且江苏连云港、如东近海海域也发生了浒苔漂浮现象。实验分别对青岛、连云港、如东海域采集样本进行了nrDNA的ITS全长序列和18S rDNA序列分析及相似性比对。结果表明,青岛、连云... 2008年6-7月在青岛近海海域再次发生大量浒苔漂浮现象,并且江苏连云港、如东近海海域也发生了浒苔漂浮现象。实验分别对青岛、连云港、如东海域采集样本进行了nrDNA的ITS全长序列和18S rDNA序列分析及相似性比对。结果表明,青岛、连云港、如东海域主要漂浮种类QD-01(青岛)、QD-02(青岛)、QD-03(青岛)、LY-01(连云港)、RD-02(如东)5个样品的ITS全长序列相似性为100%,表明青岛、连云港、如东三地沿海浒苔漂浮主要种类为同一种浒苔。18S rDNA序列分析结果也支持这个判断。根据相似性比对和BLAST分析结果,如东海域浒苔漂浮种类还发现少量另外2种绿藻(RD-01和RD-03),其中RD-01为浒苔属。浒苔主要漂浮种类与目前采集到的三地定生浒苔样本ITS全长序列比对存在一定差异,歧化度小于0.3%。 展开更多
关键词 浒苔漂浮种类 ITS 18S RDNA 序列 相似性
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常温SBR亚硝化快速启动及优化试验研究 被引量:19
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作者 李冬 陶晓晓 +2 位作者 李占 王俊安 张杰 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1653-1659,共7页
采用SBR反应器,在高、低氨氮浓度(245.28 mg/L与58.08 mg/L)交替进水及低DO浓度(0.15~0.40 mg/L)的条件下,经过33周期(20 d)的连续运行亚硝化率基本维持在85%左右,成功抑制了亚硝酸盐氧化菌的生长,从而实现了亚硝酸盐氮的大量积累,并... 采用SBR反应器,在高、低氨氮浓度(245.28 mg/L与58.08 mg/L)交替进水及低DO浓度(0.15~0.40 mg/L)的条件下,经过33周期(20 d)的连续运行亚硝化率基本维持在85%左右,成功抑制了亚硝酸盐氧化菌的生长,从而实现了亚硝酸盐氮的大量积累,并考察了低氨氮浓度进水条件下,5个不同DO浓度对亚硝酸盐氮积累的影响.结果表明,在温度为22.3~27.6℃时,5个不同DO平均浓度水平(0.27、0.48、0.72、0.99、1.47 mg/L)下,亚氮增长速率[Δc(NO2--N)/t]与硝氮增长速率[Δc(NO3--N)/t]的比值分别为16.37、17.28、17.69、7.29、3.64,相应地亚硝化率分别为95.28%、94.49%、94.64%、87.84%和78.63%.综合试验结果,将DO平均浓度为0.72 mg/L、曝气时间为4 h确定为亚硝化运行的准佳工况.在该工况下连续运行23个周期(13 d),亚硝化率基本可以维持在94%左右. 展开更多
关键词 常温 亚硝化 SBR 游离氨 溶解氧
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直流下GIS内运动金属微粒的超声波特性及状态识别 被引量:20
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作者 谭向宇 郭浩 +1 位作者 张乔根 张俊 《高电压技术》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第2期391-395,共5页
为研究直流电压下气体绝缘开关装置(GIS)内金属微粒处于不同运动状态时的超声波特性,以及基于微粒超声波特性判别运动状态的方法,建立了一套超声波测量系统,设计了GIS内部金属导电微粒的运动状态模型,分别是滚动、非贯穿性跳动和贯穿性... 为研究直流电压下气体绝缘开关装置(GIS)内金属微粒处于不同运动状态时的超声波特性,以及基于微粒超声波特性判别运动状态的方法,建立了一套超声波测量系统,设计了GIS内部金属导电微粒的运动状态模型,分别是滚动、非贯穿性跳动和贯穿性跳动。采用该测量系统拾取了在直流电压下微粒运动产生的超声波脉冲信号,并在大量试验数据基础上,提出了基于超声波时间序列(相邻两次超声波脉冲关联)区分微粒运动状态的方法。为进一步量化分析,建立了超声波特征参数(相邻两次脉冲幅值之差-相邻脉冲发生时间间隔,即Δu-Δt)。试验结果分析表明,依据统计分布图谱,可区分金属微粒运动的状态。 展开更多
关键词 气体绝缘开关装置 自由导电微粒 超声波传感器 时间序列 跳动 放电识别
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