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Development of Multi-PCR for Differentiation of Vaccine Strain and Field Isolate of Porcine Pseudorabies Virus 被引量:2
1
作者 蔺芳 尹双辉 +2 位作者 尚佑军 刘艳红 刘湘涛 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2009年第2期36-38,46,共4页
Three pairs of primer were designed for amplification of porcine pseudorabies virus (PRV) gB, gE, and TK gene by multiplex PCR (multi-PCR) in order to differentiate vaccine strains from field isolates. Three speci... Three pairs of primer were designed for amplification of porcine pseudorabies virus (PRV) gB, gE, and TK gene by multiplex PCR (multi-PCR) in order to differentiate vaccine strains from field isolates. Three specific bands were obtained respectively at the expected size, 427 bp (gB gene), 298 bp (gEgene), and 208 bp (TKgene), Then four different gene-deleted vaccines of PRV were detected by multi-PCR. One ex- pected specific band was observed in one of samples, while two bands in the others. As shown by the detection results, the multi-PCR has high sensitivity and specificity and should be applied in pathogen diagnosis and epidemiological investigation in the future. 展开更多
关键词 Porcine pseudorabies virus multi-pcr Differentiation detection
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2015—2022年河南省食品和临床鼠伤寒沙门菌及单相鼠伤寒沙门菌的耐药特征比较分析 被引量:1
2
作者 吴玲玲 邱正勇 +3 位作者 李永利 廖兴广 韩志伟 张秀丽 《中国食品卫生杂志》 CSCD 北大核心 2024年第6期646-652,共7页
目的 了解2015-2022年河南省临床和食品来源的鼠伤寒沙门菌和单相鼠伤寒沙门菌的流行情况和耐药特征。方法 对2015-2022年河南省食品和临床分离的399株鼠伤寒沙门菌疑似菌株进行血清复核和药敏实验,采用血清凝集法和多重荧光PCR方法进... 目的 了解2015-2022年河南省临床和食品来源的鼠伤寒沙门菌和单相鼠伤寒沙门菌的流行情况和耐药特征。方法 对2015-2022年河南省食品和临床分离的399株鼠伤寒沙门菌疑似菌株进行血清复核和药敏实验,采用血清凝集法和多重荧光PCR方法进行血清分型,采用微量肉汤稀释法进行抗生素药物的敏感试验,耐药性比较采用χ^(2)检验。结果 399株鼠伤寒沙门菌疑似菌株中包含单相鼠伤寒沙门菌225株(56.39%),鼠伤寒沙门菌174株。两种沙门菌对氨苄西林、氯霉素和四环素的耐药率较高,均达到50%以上。2017年开始出现对亚胺培南和甲氧苄啶/磺胺甲噁唑的耐药菌株,单相鼠伤寒沙门菌对氨苄西林和庆大霉素的耐药率高于鼠伤寒沙门菌,差异有显著性(P<0.05)。鼠伤寒沙门菌对头孢唑啉的耐药率高于单相鼠伤寒沙门菌,差异有显著性(P<0.05),两种沙门菌对3类及以上抗生素耐药率达到60%以上,共同多重优势耐药谱为耐氨苄西林-氯霉素-甲氧苄啶/磺胺甲噁唑-四环素。结论 单相鼠伤寒沙门菌检出率略高于鼠伤寒沙门菌,成为河南省鼠伤寒沙门菌临床分离株的优势血清型,两种沙门菌均普遍耐药且多重耐药现象严重,应加强监测单相鼠伤寒沙门菌的耐药情况和食品来源鼠伤寒沙门菌的检出情况,防止菌株进一步扩散。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 单相鼠伤寒沙门菌 多重荧光PCR 耐药性 多重耐药 河南
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BVDV、IBRV和AKAV多重PCR检测方法的建立与应用 被引量:7
3
作者 鲍显伟 李昊 +3 位作者 李小龙 石亚楠 王雪妍 许立华 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期39-43,87,共6页
牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)、牛传染性鼻气管炎病毒(infectious bovine rhinotracheitis virus,IBRV)和阿卡斑病毒(Akabane virus,AKAV)是引起牛发生繁殖障碍性传染病的主要病原。本研究根据BVDV的5′-UTR、I... 牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)、牛传染性鼻气管炎病毒(infectious bovine rhinotracheitis virus,IBRV)和阿卡斑病毒(Akabane virus,AKAV)是引起牛发生繁殖障碍性传染病的主要病原。本研究根据BVDV的5′-UTR、IBRV的gB基因和AKAV的S基因设计了3对特异性引物,构建了检测BVDV、IBRV和AKAV的多重PCR方法,并优化反应体系和条件,验证了该方法的特异性和敏感性。结果显示,构建的多重PCR方法对其他牛源病毒无扩增,对BVDV、IBRV和AKAV的最低检测限分别为10^(3)、10^(3)和10^(4)拷贝/μL。对采集的184份临床血清样品进行检测,BVDV、IBRV和AKAV的阳性率分别为18.48%、14.13%和1.63%,BVDV和IBRV 2种病原混合感染的阳性率为3.8%,BVDV和AKAV两种病原混合感染的阳性率为1.63%。该结果与我国出入境检疫行业标准符合率达92%以上,BVDV+IBRV和BVDV+AKAV混合感染的符合率为100%。表明本研究建立的多重PCR检测方法可用于临床样品的检测。BVDV、IBRV和AKAV多重PCR检测方法的建立,为我国牛群BVD、IBR和AKA的检测和流行病学调查提供了一种快捷简便的分子生物学检测方法。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 牛传染性鼻气管炎病毒 阿卡斑病毒 多重PCR
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散养土鸡J亚群禽白血病病毒和网状内皮组织增生症病毒混合感染的诊断 被引量:2
4
作者 刘兰 梁雄燕 +2 位作者 李拓凡 顾玉芳 杨玉莹 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2017年第4期47-49,I0003,共4页
湖北某农户散养的土鸡,鸡群精神委靡、整体消瘦,对病鸡进行剖检,发现部分鸡体表和脏器可见大小不等的肿瘤结节。取病变典型的组织制作病理切片,镜检可看到髓样细胞瘤和网状细胞。提取病鸡组织DNA,用两组Multi-PCR分别检测A、B、J亚群禽... 湖北某农户散养的土鸡,鸡群精神委靡、整体消瘦,对病鸡进行剖检,发现部分鸡体表和脏器可见大小不等的肿瘤结节。取病变典型的组织制作病理切片,镜检可看到髓样细胞瘤和网状细胞。提取病鸡组织DNA,用两组Multi-PCR分别检测A、B、J亚群禽白血病病毒(ALV-A、ALV-B、ALV-J)和马立克病病毒(MDV)、禽网状内皮增生症病毒(REV)。结果仅扩增出与ALV-J和REV相应的条带,表明该鸡群为ALV-J和REV混合感染。 展开更多
关键词 J亚群白血病 网状内皮组织增生症 混合感染 病理组织切片 multi-pcr
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结核分枝杆菌katG、rpoB、rpsL耐药基因快速检测方法的建立 被引量:2
5
作者 杨柳 苏明权 +4 位作者 程晓东 岳乔红 马越云 刘家云 郝晓柯 《中国卫生检验杂志》 CAS 2009年第8期1735-1737,共3页
目的:建立一套应用multi-PCR-SSCP(multiple-Polymerase Chain Reaction-Single Strand Cinformation Poly-morphism)快速检测结核分枝杆菌耐药基因突变的方法,评价该方法的临床应用价值。方法:分别用常规PCR和multi-PCR-SSCP检测58株... 目的:建立一套应用multi-PCR-SSCP(multiple-Polymerase Chain Reaction-Single Strand Cinformation Poly-morphism)快速检测结核分枝杆菌耐药基因突变的方法,评价该方法的临床应用价值。方法:分别用常规PCR和multi-PCR-SSCP检测58株结核分枝杆菌临床分离株katG、rpoB、rpsL基因突变并与常规药敏试验检测结果进行对比。结果:经常规药敏试验检测,58株结核分枝杆菌临床分离株中有41株耐药,其中,耐异烟肼(INH)35株;耐利福平(RFP)31株;耐链霉素(SM)31株。单基因PCR-SSCP与multi-PCR-SSCP分析结果一致,检出katG、rpoB、rpsL基因的突变率分别为65.7%(23/35)、84%(26/31)、71%(22/31),17株药物敏感株中有1株rpoB基因SSCP电泳条带与结核杆菌标准株结果有差异。结论:multi-PCR-SSCP方法敏感、特异,可快速检测结核分枝杆菌katG、rpoB、rpsL耐药基因的突变,将该方法与药敏试验联合应用可互相弥补,成为临床指导用药的好方法。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 KATG RPOB RPSL 基因突变 multi-pcr-SSCP
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重症监护病区碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌的主动筛查及基因分析 被引量:4
6
作者 张慧 周聪 +3 位作者 徐茂锁 余司文 申春梅 林勇 《贵州医科大学学报》 CAS 2024年第11期1711-1716,共6页
目的调查重症监护病区(ICU)患者在住院期间碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)主动筛查菌株的分布以及CRE耐药基因的检测和分析。方法收集424例ICU患者直肠拭子、咽拭子和腹股沟拭子样本,采用肉汤增菌法进行CRE阳性病例的主动筛查,全自动... 目的调查重症监护病区(ICU)患者在住院期间碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)主动筛查菌株的分布以及CRE耐药基因的检测和分析。方法收集424例ICU患者直肠拭子、咽拭子和腹股沟拭子样本,采用肉汤增菌法进行CRE阳性病例的主动筛查,全自动药敏分析仪进行体外药敏试验,PCR法检测碳青霉烯酶耐药基因,通过多位点序列分型(MLST)和肠杆菌基因间重复共有序列PCR分析CRE菌株的同源性关系。结果直肠拭子、咽拭子和腹股沟拭子CRE筛查阳性率分别为12.5%、5.0%和4.2%,CRE菌株主要来自肺炎克雷伯菌(82.6%)、大肠埃希菌(9.8%)和产气肠杆菌(4.3%),CRE菌株对替加环素、头孢他啶阿维巴坦敏感性较好(>90%);92株CRE碳青霉类耐药基因检测,以blaKPC-2亚型(91.3%)为主;MLST分型结果显示76株碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)主要为ST11型(69.7%)和ST15型(28.9%);ERIC-PCR扩增结果分析显示,76株肺炎克雷伯菌主要为谱型A(69.7%)和谱型B(28.9%)。结论ICU住院患者CRE主动筛查以blaKPC-2亚型的CRKP为主,MLST分型和ERIC-PCR扩增结果聚类分析发现主要存在两个克隆株传播。 展开更多
关键词 重症监护病区 碳青霉烯类耐药肠杆菌科 细菌筛查 耐药基因检测 多位点序列分型 肠杆菌基因间重复共有序列PCR
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多重PCR筛选临床细菌耐药整合子基因 被引量:9
7
作者 肖增璜 石磊 +5 位作者 邱春嫦 付强 苏健裕 冯洁 陈洵 李琳 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期480-485,共6页
目的:建立多重PCR方法并对临床菌株进行扩增及整合子分类。方法:采用多重PCR对21株来自临床的耐药菌株进行了第一、二和三类整合酶基因(intI)筛选。结果:16株携带第一类整合酶基因;1株携带第一和第二类整合酶基因;2株含第二类整合酶基... 目的:建立多重PCR方法并对临床菌株进行扩增及整合子分类。方法:采用多重PCR对21株来自临床的耐药菌株进行了第一、二和三类整合酶基因(intI)筛选。结果:16株携带第一类整合酶基因;1株携带第一和第二类整合酶基因;2株含第二类整合酶基因;1株含第三类整合酶基因;1株不含第一、二和三类整合酶基因。结论:筛选细菌耐药整合子基因分类的多重PCR方法简便可靠;整合子广泛存在于临床耐药细菌中。 展开更多
关键词 多重PCR 整合子 整合酶基因 耐药菌株 酶基因 合子 临床 细菌 筛选 PCR方法
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犬瘟热、犬冠状病毒联合RT-PCR检测方法的建立及应用 被引量:24
8
作者 乔军 孟庆龄 +2 位作者 夏咸柱 何宏彬 范泉水 《西南农业学报》 CSCD 2002年第1期93-95,共3页
用CDV、CCV特异性引物对同一样品中CDV和CCVRNA模板进行联合RT PCR扩增 ,并对扩增条件进行了优化。结果同时得到了两条大小与试验设计完全相符的特异性扩增带 ,且不扩增犬细小病毒、犬腺病毒、犬副流感病毒、轮状病毒的核酸。敏感性试... 用CDV、CCV特异性引物对同一样品中CDV和CCVRNA模板进行联合RT PCR扩增 ,并对扩增条件进行了优化。结果同时得到了两条大小与试验设计完全相符的特异性扩增带 ,且不扩增犬细小病毒、犬腺病毒、犬副流感病毒、轮状病毒的核酸。敏感性试验表明 ,该联合PCR能检测出 10 - 4倍稀释的CDV模板 (10 6 6 TCID50 / 0 1mL)和 10 - 3倍稀释的CCV模板 (10 5 9TCID50 /0 1mL)。通过对 7份临床发病犬病料的检测 ,其阳性检出率高于电镜负染检查。初步应用表明 ,此法具有高度敏感、特异、准确、快速等特点 ,适用于兽医临床对CDV。 展开更多
关键词 犬瘟热 犬冠状病毒 RT-PCR检测 应用 特异性引物 核酸 敏感性 CCV模板 电镜负染 兽医临床
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分子标记辅助培育水稻抗白叶枯病和稻瘟病三基因聚合系 被引量:68
9
作者 倪大虎 易成新 +7 位作者 李莉 汪秀峰 张毅 赵开军 王春连 章琦 王文相 杨剑波 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期100-105,共6页
水稻的白叶枯病和稻瘟病是水稻的两大主要病害,通过分子标记辅助选择与传统的杂交、自交相结合的方法,将抗稻瘟病的Pi9(t)基因和抗白叶枯病的Xa21及Xa23基因聚合到同一株系中,经多代大田或/和温室接菌鉴定、室内标记选择和田间农... 水稻的白叶枯病和稻瘟病是水稻的两大主要病害,通过分子标记辅助选择与传统的杂交、自交相结合的方法,将抗稻瘟病的Pi9(t)基因和抗白叶枯病的Xa21及Xa23基因聚合到同一株系中,经多代大田或/和温室接菌鉴定、室内标记选择和田间农艺性状的筛选,获得了4个三基因聚合且农艺性状优良的株系L17-L20。用不同国家和地区的20个稻瘟病小种、中国流行的7个白叶枯病菌系c1-c7以及安徽省流行的白叶枯病菌系进行大田或,和温室抗病性鉴定,结果显示,株系L17-L20对20个稻瘟病小种均表现出抗性,抗性水平与Pi9(t)基因的供体亲本75-1-127相当,抗谱相同;对白叶枯病的抗性和抗谱与Xa23基因相似,不论在苗期还是在成株期均抗白叶枯病。与Xa21、Xa23基因的供体亲本M12和CBB23相比,成株期的抗性水平有所增强。利用多重PCR技术,在同一PCR反应中可同时选择Pig(t)和Xa21基因,提高了PCR选择效率。 展开更多
关键词 白叶枯病 稻瘟病 Pi9(t)基因 XA21基因 Xa23基因 分子标记辅助选择 多重PCR
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嗜麦芽寡养单胞菌中Ⅱ类整合酶基因的发现及意义 被引量:19
10
作者 邓笑伟 刘长庭 +4 位作者 李天智 王俊锋 粱立武 黄燕萍 莫晨 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1061-1063,共3页
目的检测Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类整合子在嗜麦芽寡养单胞菌临床分离株中存在情况,分析整合子对细菌耐药性的影响。方法应用多重PCR方法筛选嗜麦芽寡养单胞菌整合酶基因。结果Ⅰ类整合子的检出率为13.4%,其中3株菌同时带有Ⅰ类和Ⅱ类整合子,Ⅱ类整... 目的检测Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类整合子在嗜麦芽寡养单胞菌临床分离株中存在情况,分析整合子对细菌耐药性的影响。方法应用多重PCR方法筛选嗜麦芽寡养单胞菌整合酶基因。结果Ⅰ类整合子的检出率为13.4%,其中3株菌同时带有Ⅰ类和Ⅱ类整合子,Ⅱ类整合子的阳性率为3.6%,未检测到Ⅲ类整合子。结论嗜麦芽寡养单胞菌中主要分布Ⅰ类整合子,首次发现嗜麦芽寡养单胞菌中含有Ⅱ类整合子,Ⅱ类整合酶基因可能增加细菌多药耐药的发生。 展开更多
关键词 嗜麦芽寡养单胞菌 整合子 多重PCR
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基于COI与SRY序列建立梅花鹿、马鹿及其杂交鹿茸的分子鉴别方法 被引量:19
11
作者 魏艺聪 蒋超 +3 位作者 袁媛 赵玉洋 金艳 黄璐琦 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第23期4588-4592,共5页
为了建立梅花鹿、马鹿及其杂交鹿茸的特异性PCR鉴别方法。采集不同来源的梅花鹿、马鹿鹿及其杂交鹿的鹿角或鹿茸样品共48份,其中24份为市场流通的待测样品。分别利用COI与SRY基因序列作为其父母本的鉴别标记,对已知样品的COI与SRY基因... 为了建立梅花鹿、马鹿及其杂交鹿茸的特异性PCR鉴别方法。采集不同来源的梅花鹿、马鹿鹿及其杂交鹿的鹿角或鹿茸样品共48份,其中24份为市场流通的待测样品。分别利用COI与SRY基因序列作为其父母本的鉴别标记,对已知样品的COI与SRY基因进行扩增、测序,进行同源比对后根据其变异位点设计特异鉴别引物,分别基于COI与SRY基因建立对梅花鹿、马鹿及其杂交鹿的鹿茸的特异PCR鉴定方法,并随机对市场流通的24份待测鹿茸样品进行鉴别分析。该实验所构建双位点特异PCR体系,基于COI的鉴别位点,可通过PCR扩增获得232 bp的梅花鹿特异片段,而产生518 bp的马鹿特异片段;而基于SRY的鉴别位点,通过PCR扩增获得803 bp的梅花鹿特异片段,而产生425 bp的马鹿特异片段。随机抽取市场流通中的24个待测鹿茸样品,经鉴定有3个样品属于马·花杂交的鹿茸样品。该实验建立对梅花鹿、马鹿及其杂交鹿的鹿茸的PCR鉴别方法简便、可靠。 展开更多
关键词 梅花鹿 马鹿 杂交 双位点特异PCR体系 COI SRY
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多重PCR技术鉴定番茄Ty-1和Mi基因 被引量:27
12
作者 于力 朱龙英 +3 位作者 万延慧 杨少军 朱为民 薛林宝 《分子植物育种》 CAS CSCD 2008年第1期165-169,共5页
利用同一PCR反应体系,对分别与番茄(Lycopersion esculentum)抗黄化曲叶病毒(Tomato YellowLeaf Curl virus)病的Ty-1基因和番茄抗根结线虫(root-knot nematode)的Mi基因紧密连锁的SCAR标记进行同时扩增筛选,扩增的特异性片段与单引物... 利用同一PCR反应体系,对分别与番茄(Lycopersion esculentum)抗黄化曲叶病毒(Tomato YellowLeaf Curl virus)病的Ty-1基因和番茄抗根结线虫(root-knot nematode)的Mi基因紧密连锁的SCAR标记进行同时扩增筛选,扩增的特异性片段与单引物扩增片段完全吻合。与Ty-1基因紧密连锁的SCAR1标记为共显性标记,抗感材料均产生398bp的特异片段,纯合和杂合抗病基因型存在Taq I酶切位点,酶切后分别产生了303bp和95bp以及398bp、303bp和95bp的特异性片段,而感病基因型无此酶切位点。与Mi基因紧密连锁的SCAR2标记也为共显性标记,抗感材料均产生750bp的特异片段,纯合和杂合抗病基因型存在Taq I酶切位点,酶切后分别产生了570bp和180bp以及750bp、570bp和180bp的特异性片段,而感病基因型无此酶切位点。酶切结果仍为750bp的产物。经反复验证,结果准确可靠,可以用于在同一PCR反应体系中对两个抗病基因进行同时筛选鉴定。 展开更多
关键词 番茄 Ty-1 MI 多重PCR 分子标记
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用多重PCR快速检测登革病毒并分型 被引量:8
13
作者 肖维威 马文丽 +2 位作者 郑夔 黄吉城 郑文岭 《检验医学》 CAS 北大核心 2004年第5期393-395,共3页
目的 建立一种多重聚合酶链反应 (PCR)方法 ,对不同型别登革病毒进行快速检测及分型。方法 采用 4种型别登革病毒通用的外侧引物进行逆转录PCR(RT PCR)反应 ,继用 4对 (5种 )型特异引物在单管内进行巢式PCR ,依据扩增产物的片段大小... 目的 建立一种多重聚合酶链反应 (PCR)方法 ,对不同型别登革病毒进行快速检测及分型。方法 采用 4种型别登革病毒通用的外侧引物进行逆转录PCR(RT PCR)反应 ,继用 4对 (5种 )型特异引物在单管内进行巢式PCR ,依据扩增产物的片段大小进行分型。结果 采用多重PCR ,扩增出 4 82、119、2 90及 392bp的特异片段 ,分别代表登革病毒 1~ 4型。结论 该方法快速、敏感、特异 ,有一定的推广应用价值。 展开更多
关键词 登革病毒 分型 快速检测 型别 多重PCR 逆转录PCR 多重聚合酶链反应 PCR) 扩增产物 RT—PCR
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细菌耐药整合子intI分类的多重PCR方法的建立及应用 被引量:12
14
作者 冯洁 石磊 +7 位作者 肖增璜 李琳 陈洵 苏健裕 李心晖 郑美萍 邱春嫦 付强 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期599-603,630,共6页
目的建立快速筛选细菌耐药整合子的分类方法,并对21株来自临床的菌株进行整合子筛选和分类。方法根据G enB ank/EM BL内的第一、第二和第三类的整合酶序列,通过软件C lustalW的多重比对分析设计出各类整合子的特异性引物,用对照菌株建... 目的建立快速筛选细菌耐药整合子的分类方法,并对21株来自临床的菌株进行整合子筛选和分类。方法根据G enB ank/EM BL内的第一、第二和第三类的整合酶序列,通过软件C lustalW的多重比对分析设计出各类整合子的特异性引物,用对照菌株建立多重PCR方法并对21株临床菌株进行PCR扩增,通过其PCR扩增产物片段大小的不同进行整合子分类。结果对照菌株实验结果显示,21株临床分离菌株中,15株在565bp处有扩增片段,即为含有第一类整合酶基因;4株在403bp处有扩增片段,即含有第二类整合酶基因;1株在565bp和403bp处均有扩增片段,提示其同时含有第一、二类整合酶基因;1株没有得到任何扩增片段,即不含有这三类整合酶基因;在被测菌株中未发现第三类整合酶基因的阳性菌株。结论本文报道的筛选细菌耐药整合酶基因分类的多重PCR方法效果良好,具有可行性,为更加全面细致研究整合子类型以及整合子介导的细菌耐药机制提供了一种简单易行、快捷有效的方法。 展开更多
关键词 多重PCR 整合子 整合酶基因
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布鲁菌种属鉴定多重PCR方法的建立及初步应用 被引量:13
15
作者 丁家波 张存帅 +5 位作者 彭小兵 蒋颖 程君生 张尔利 蒋玉文 毛开荣 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期594-597,共4页
用BCSP31作为布鲁菌属特异性基因,以IS711基因拷贝数差异作为布鲁菌种间特异性标志,建立了布鲁菌种属特异性的多重PCR鉴定方法。用建立的多重PCR方法对11株(牛种A19,A544,A387;羊种M111,M28,M16;犬种RM6/66;绵羊种63/290;猪种S2,rS2,S13... 用BCSP31作为布鲁菌属特异性基因,以IS711基因拷贝数差异作为布鲁菌种间特异性标志,建立了布鲁菌种属特异性的多重PCR鉴定方法。用建立的多重PCR方法对11株(牛种A19,A544,A387;羊种M111,M28,M16;犬种RM6/66;绵羊种63/290;猪种S2,rS2,S1330)不同种来源的布鲁菌菌体和基因组进行鉴定,结果牛种菌能扩增大小分别为494,223,178bp3条带,羊种菌能扩增出大小分别为733,223,178bp3条带,犬种菌能扩增出大小分别为223,178bp2条带,绵羊种菌能扩增出大小分别为976,223,178bp3条带,猪种菌能扩增出大小分别为285,223,178bp3条带,均与预期一致;而作为对照的大肠杆菌、胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌、流产沙门菌和都柏林沙门菌,均未扩增出任何条带。结果表明,本研究所建立的方法具有良好的特异性,能够区分不同种源的布鲁菌,可用于布鲁菌种属的快速鉴定和流行病学调查。 展开更多
关键词 布鲁菌 BCSP31基因 IS711基因 多重PCR
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上海市1例输血性三日疟病例的实验室检测分析与诊断 被引量:21
16
作者 王真瑜 张耀光 +3 位作者 江莉 李美 朱民 蔡黎 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期362-366,共5页
目的对1例感染源不明的三日疟病例进行实验室检测分析并确诊。方法收集该病例的临床资料,并进行流行病学调查。对患者及其供血者的血样进行血涂片病原学检查、疟疾快速诊断检测(RDT)和巢式PCR检测,并对阳性结果进行测序比对。结果该患... 目的对1例感染源不明的三日疟病例进行实验室检测分析并确诊。方法收集该病例的临床资料,并进行流行病学调查。对患者及其供血者的血样进行血涂片病原学检查、疟疾快速诊断检测(RDT)和巢式PCR检测,并对阳性结果进行测序比对。结果该患者无疟疾流行区居留史和既往疟疾感染史,有外科手术时大量输血史。外周血涂片镜检查见三日疟原虫。流行病学调查显示,该患者接受了3位供血者的血液,但3位供血者血样经血涂片镜检、RDT和巢式PCR检测均未查见疟原虫,后经改进的巢式-多重PCR检测及结果测序比对后显示,与其中1名非洲籍留学生供血者的阳性扩增条带具100%同源性。结论该病例因输血而感染三日疟。实验室检测疟疾疑难病例需经多方法验证方可确诊,改进的巢式-多重PCR方法对低密度疟原虫感染有较好的检测效果。 展开更多
关键词 疟疾 输血 三日疟 血涂片 检测 快速诊断 巢式PCR 巢式-多重PCR
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多重PCR方法快速鉴别猪伪狂犬疫苗毒和野毒 被引量:23
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作者 蔺芳 尹双辉 +3 位作者 尚佑军 刘艳红 刘湘涛 胡永浩 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第13期5889-5891,共3页
根据Genbank中PRV的gB、gE、TK基因序列设计并合成引物,对样品中PRVDNA进行多重PCR扩增及反应条件优化,得到与设计相符合的3条特异性条带,分别为427 bp(gB)、298 bp(gE)和208 bp(TK)。用这3对引物对四种伪狂犬疫苗样品DNA进行多次多重PC... 根据Genbank中PRV的gB、gE、TK基因序列设计并合成引物,对样品中PRVDNA进行多重PCR扩增及反应条件优化,得到与设计相符合的3条特异性条带,分别为427 bp(gB)、298 bp(gE)和208 bp(TK)。用这3对引物对四种伪狂犬疫苗样品DNA进行多次多重PCR扩增,其中1种疫苗得到与设计相符的1条特异性条带,其余为2条。该结果表明,此检测方法敏感度较高,适用于科学研究、临床诊断以及流行病学调查,对根除伪狂犬病具有重要意义。 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 多重PCR 鉴别诊断
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快速PCR法鉴别鱼腥草与百部还魂的方法研究 被引量:12
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作者 魏艺聪 袁媛 +3 位作者 陈建雄 车苏容 赵玉洋 梁一池 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期2163-2166,共4页
目的建立鉴别鱼腥草Houttuynia cordata与百部还魂Gymnotheca chinensis的特异性PCR方法。方法采集不同产地的鱼腥草与百部还魂样品各8份,所有样品提取总DNA。通过对其mat K片段进行扩增、测序,进行同源比对后根据其变异位点设计特异鉴... 目的建立鉴别鱼腥草Houttuynia cordata与百部还魂Gymnotheca chinensis的特异性PCR方法。方法采集不同产地的鱼腥草与百部还魂样品各8份,所有样品提取总DNA。通过对其mat K片段进行扩增、测序,进行同源比对后根据其变异位点设计特异鉴别引物,建立特异PCR鉴别方法,并通过加入SYBR Green I染料法对2种中药进行快速检测。另外,构建多重PCR体系,只经一个PCR反应,就能对鱼腥草与百部还魂进行快速分子鉴定。结果所构建特异PCR与多重PCR体系均能产生鱼腥草185 bp的特异鉴别条带,百部还魂389 bp的特异鉴别条带,SYBR Green I染料可进行快速检测方法。结论建立的鱼腥草与百部还魂2种中药的快速PCR鉴别方法简便、可靠。 展开更多
关键词 鱼腥草 百部还魂 特异性PCR 多重PCR体系 MATK
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假单胞菌属细菌中整合子的分布及其可转移耐药性研究 被引量:14
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作者 凌华志 李涛 +1 位作者 徐元宏 曹红霞 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期10-12,共3页
目的研究临床分离假单胞菌属细菌中Ⅰ、Ⅱ类整合子分布及其可转移耐药情况。方法将Ⅰ、Ⅱ类整合酶基因通用引物置于同一反应体系,对假单胞菌属细菌以多重PCR法检测其整合子的分布,并对整合酶基因阳性菌进行接合转移,最后对接合转移成功... 目的研究临床分离假单胞菌属细菌中Ⅰ、Ⅱ类整合子分布及其可转移耐药情况。方法将Ⅰ、Ⅱ类整合酶基因通用引物置于同一反应体系,对假单胞菌属细菌以多重PCR法检测其整合子的分布,并对整合酶基因阳性菌进行接合转移,最后对接合转移成功菌以平板稀释法测其临床株和接合子MIC值。结果Ⅰ类和Ⅱ类整合酶基因在临床分离假单胞菌属细菌中检出率分别为38.1%和2.2%,含整合酶基因的接合子在转移成功接合子中所占比率为13.6%。结论Ⅰ类整合子在假单胞菌感染的临床分离株中所占比例已相当高,但水平传播率还较低。 展开更多
关键词 假单胞菌属 整合子 多重PCR 接合子
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犬腺病毒、犬细小病毒联合PCR方法的建立与应用 被引量:9
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作者 王雷 夏咸柱 +4 位作者 卫广森 扈荣良 刘维全 邹啸环 黄耕 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期262-266,共5页
根据GenBank报道的犬腺病毒(CAV)和犬细小病毒(CPV)序列,设计两对联合PCR引物,其中一对为CAV-1和CAV-2通用引物,另一对为CPV引物。在建立单项PCR基础上,通过优化Mg2+离子浓度和循环参数等反应条件建立联合PCR,确定联合PCR条件为:96℃180... 根据GenBank报道的犬腺病毒(CAV)和犬细小病毒(CPV)序列,设计两对联合PCR引物,其中一对为CAV-1和CAV-2通用引物,另一对为CPV引物。在建立单项PCR基础上,通过优化Mg2+离子浓度和循环参数等反应条件建立联合PCR,确定联合PCR条件为:96℃180s,96℃30s,56℃30s,72℃80s,30个循环。联合PCR结果显示:CAV-1扩增片段大小为497bp,CAV-2为1019bp,CPV为719bp;细胞和其它相关病毒对照均无扩增带。上述PCR产物经用限制性内切酶酶切和克隆测序,结果均与相应病毒的应有条带和序列相同。敏感性比较试验结果表明,联合PCR比用细胞培养分离病毒敏感。将联合PCR应用于15份CAV和CPV细胞培养物,5份CAV-1、1份CAV-2和3份CPV人工感染犬病料以及30份临床病料检测,并与电镜负染、HA/HI及病毒分离等方法的结果进行比较,结果显示,联合PCR的检出率和病毒分离结果一致,高于电镜负染和HA/HI试验。以上结果说明:CAV-1/CAV-2和CPV联合PCR不仅具有很好的特异性和敏感性,而且可以在短时间内(2 5h~3h)同时鉴定出上述三种病毒,因此具有良好的实验室诊断和临床应用价值。 展开更多
关键词 犬腺病毒 犬细小病毒 联合PCR方法 实验室诊断
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