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Pedestrian Height Estimation and 3D Reconstruction Using Pixel-resolution Mapping Method Without Special Patterns 被引量:2
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作者 Bing-Xing Wu Suat Utku Ay Ahmed Abdel-Rahim 《International Journal of Automation and computing》 EI CSCD 2019年第4期449-461,共13页
Extracting the three-dimensional (3D) information including location and height of a pedestrian is important for vision-based intelligent traffic monitoring systems. This paper tackles the relationship between pixels... Extracting the three-dimensional (3D) information including location and height of a pedestrian is important for vision-based intelligent traffic monitoring systems. This paper tackles the relationship between pixels′ actual size and pixels′ spatial resolution through a new method named pixel-resolution mapping (P-RM). The proposed P-RM method derives the equations for pixels′ spatial resolutions (XY-direction) and object′s height (Z-direction) in the real world, while introducing new tilt angle and mounting height calibration methods that do not require special calibration patterns placed in the real world. Both controlled laboratory and actual world experiments were performed and reported. The tests on 3D mensuration using proposed P-RM method showed overall better than 98.7% accuracy in laboratory environments and better than 96% accuracy in real world pedestrian height estimations. The 3D reconstructed images for measured points were also determined with the proposed P-RM method which shows that the proposed method provides a general algorithm for 3D information extraction. 展开更多
关键词 TRAFFIC monitoring application spatial RESOLUTION pixel-resolution mapping (P-RM) method 3D information PEDESTRIAN height estimation
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Mining Applicable Elite Alleles of Growth Duration, Plant Height and Panicle Number per Plant by Conditional QTL Mapping in Japonica Rice 被引量:2
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作者 Jian-hua JIANG Qi-bing ZHAO +4 位作者 Qiang-ming LIU Lan CHEN Fu-long CHEN Bao-jian QIAO De-lin HONG 《Rice science》 SCIE 2011年第3期196-203,共8页
Unconditional and conditional QTL mapping were conducted for growth duration (GD), plant height (PH) and effective panicle number per plant (PN) using a recombinant inbred line (RIL) population derived from a cross be... Unconditional and conditional QTL mapping were conducted for growth duration (GD), plant height (PH) and effective panicle number per plant (PN) using a recombinant inbred line (RIL) population derived from a cross between two japonica rice varieties Xiushui 79 and C Bao. The RIL population consisted of 254 lines was planted in two environments, Nanjing and Sihong, Jiangsu Province, China. Results showed that additive effects were major in all of QTLs for GD, PH and PN detected by the two methods, and the epistatic effects explained a small proportion of phenotypic variation. No interactions were detected between additive QTL and environment, and between epistatic QTL pairs and environment. After growth duration was adjusted to an identical level, RM80-160bp was detected as an applicable elite allele for PN, with an additive effect of 0.71. When effective panicle number per plant was adjusted to an identical level, RM448-240bp was detected as an applicable elite allele for GD, with an additive effect of 4.64. After plant height was adjusted to an identical level, RM80-160bp was detected as an applicable elite allele for PN, with an additive effect of 0.62, and RM448-240bp was detected as an applicable elite allele for GD, with an additive effect of 3.89. These applicable elite alleles could be used to improve target traits without influencing the other two traits. 展开更多
关键词 japonica rice growth duration plant height effective panicle number per plant unconditional QTL mapping conditional QTL mapping recombinant inbred line
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大豆株高和主茎节数QTL定位及候选基因挖掘 被引量:1
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作者 陈亮宇 张君 +5 位作者 韩笑 李雪莹 姚丹 宋阳 宋百兴 杨松楠 《吉林农业大学学报》 北大核心 2025年第2期226-235,共10页
株高和主茎节数是影响大豆产量的重要性状,开发相关分子标记及挖掘其分子机制有益于加速其在育种工作中的利用。以“吉农45”“绥农76”为亲本杂交得到F_(2)群体,基于对群体SNP标记构建的遗传图谱及表型数据,联合采用CIM、ICIM及GCIM 3... 株高和主茎节数是影响大豆产量的重要性状,开发相关分子标记及挖掘其分子机制有益于加速其在育种工作中的利用。以“吉农45”“绥农76”为亲本杂交得到F_(2)群体,基于对群体SNP标记构建的遗传图谱及表型数据,联合采用CIM、ICIM及GCIM 3种定位方法进行数量性状基因座(QTL)定位,并对QTL置信区间内定位到的基因进行功能注释。结果获得7个与大豆株高(PH)相关的QTL位点,3个与主茎节数(NN)相关的QTL位点。其中,qNN-20-1,qPH-4-1,qPH-6-1,qPH-19-1及qPH-20-1与前人研究结果相近或重合,qNN-7-1,qNN-7-2,qPH-9-1,qPH-12-1和qPH-19-2为新发现的位点,并且qNN-20-1与qPH-20-1存在重叠区域。依赖基因注释结果在位点内筛得32个候选基因,表明这些位点参与细胞进程及植物激素协调网络,进而导致株高或主茎节数的变化。研究结果将为大豆株型改良种提供理论依据,为剖析株高和主茎节数的遗传机制奠定理论基础。 展开更多
关键词 大豆 株高 主茎节数 QTL定位 候选基因
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玉米矮化突变体d309的基因定位与遗传分析
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作者 张恩会 李健 +3 位作者 王逸茹 王小东 马朋涛 郑军 《植物遗传资源学报》 北大核心 2025年第1期165-176,共12页
玉米的株高是决定其产量和稳定性的关键因素之一。本研究旨在通过优化玉米株型来提高玉米的单产。本课题组在B73的诱变材料中发现了一个矮化突变体d309,该突变体通过连续自交得以稳定遗传。遗传分析揭示,d309突变体的表型受单一隐性基... 玉米的株高是决定其产量和稳定性的关键因素之一。本研究旨在通过优化玉米株型来提高玉米的单产。本课题组在B73的诱变材料中发现了一个矮化突变体d309,该突变体通过连续自交得以稳定遗传。遗传分析揭示,d309突变体的表型受单一隐性基因控制。与B73自交系相比,d309突变体展现出显著降低的株高和缩短的节间。细胞学研究表明,d309突变体在第5和第6茎节间的细胞长度显著缩短。通过构建d309与PH6WC的F2分离群体,并运用BSR-seq技术,将突变位点定位在第3号染色体的3.47~17.47 Mb区间。进一步通过基因定位将突变位点定位于5-4和5-7两对分子标记之间,该区间内只有1个开放阅读框(Zm00001d039634),编码赤霉素3-氧化酶(GA3ox,gibberellin 3-oxidases),已被报道为Dwarf1。测序结果显示,d309突变体在Zm00001d039634基因CDS区存在单个核苷酸的突变,导致氨基酸序列改变。蛋白质结构预测表明,该突变位点位于Fe(II)2OGD(Iron 2-oxoglutarate dioxygenase)结构域内。通过外源施加赤霉素,d309突变体的矮化表型得到恢复,从而确认d309为一个赤霉素合成缺陷型突变体。此外,d309突变体与已报道的Dwarf1等位突变体在突变机制上存在差异,表明d309可能是Dwarf1基因的一个新等位基因。 展开更多
关键词 玉米株高 矮化突变体 图位克隆 赤霉素合成
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基于BSA-seq的番木瓜株高候选基因定位
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作者 吴夏明 周陈平 +5 位作者 杨敏 徐泽 邝瑞彬 刘传和 贺涵 魏岳荣 《生物技术通报》 北大核心 2025年第9期54-61,共8页
【目的】株高是影响番木瓜产量和品质的重要性状之一,定位番木瓜株高的主要候选基因,为番木瓜的矮化育种提供基因资源。【方法】以YY(植株较高)和GM(植株较矮)为亲本构建定位群体,利用BSA-seq技术对两亲本以及子代混池GY-H(高池)和GY-S... 【目的】株高是影响番木瓜产量和品质的重要性状之一,定位番木瓜株高的主要候选基因,为番木瓜的矮化育种提供基因资源。【方法】以YY(植株较高)和GM(植株较矮)为亲本构建定位群体,利用BSA-seq技术对两亲本以及子代混池GY-H(高池)和GY-S(矮池)进行测序分析,数据经质控后,利用ED以及SNP-index法计算混池之间的基因频率差距,定位番木瓜株高候选区间。【结果】本次BSA-seq产生的数据良好,数据经过滤后,最终得到高质量的SNP位点337980个用于基因定位,利用ED以及SNP-index法计算寻找混池之间基因型频率的显著差异,最终分别在第3、6和8染色体上共定位到大小为0.93 Mb的候选区间,将该区间与番木瓜‘紫晖’参考基因组比对,0.93 Mb的区间内共包含46个编码基因,其中,有37个基因被注释。【结论】Cp_zihui12764、Cp_zihui06963、Cp_zihui07024和Cp_zihui12732可能是调控番木瓜株高的候选基因。 展开更多
关键词 番木瓜 株高 BSA-seq 基因定位 候选基因
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基于多目标规划的五原X波段双偏振雷达选址方法的探讨 被引量:1
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作者 师利霞 《气象水文海洋仪器》 2025年第2期71-74,共4页
文章利用天气雷达遮蔽角图及等射束高度图,分析了五原县X波段雷达的受遮挡情况、探测能力等,基于多目标规划初步选取了3个点作为五原雷达备选安装位置,通过使用光学经纬仪、GPS定位仪及测距仪对五原县气象局周边高大建筑物遮蔽仰角及距... 文章利用天气雷达遮蔽角图及等射束高度图,分析了五原县X波段雷达的受遮挡情况、探测能力等,基于多目标规划初步选取了3个点作为五原雷达备选安装位置,通过使用光学经纬仪、GPS定位仪及测距仪对五原县气象局周边高大建筑物遮蔽仰角及距离进行测试,对五原县天气雷达3个拟选站址受遮挡情况和探测能力进行了定量比对和定性研究,最终确定了雷达最佳安装地址和塔架基座高度,以期为天气雷达选址提供参考。 展开更多
关键词 X波段双线偏振雷达 选址 遮蔽角图 等射束高度图 经纬仪 GPS定位仪
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无人机航测技术在复杂地形测绘中的精度分析
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作者 魏涛 韩磊 《北斗与空间信息应用技术》 2025年第2期87-89,106,共4页
本文聚焦于无人机航测技术在复杂地形测绘中的精度分析,提出了基于飞行高度、传感器精度、GPS定位精度和气象条件的精度优化方案。通过仿真模型和现场监测数据验证,发现飞行高度对精度有显著影响,且随着飞行高度增加,传感器误差、GPS定... 本文聚焦于无人机航测技术在复杂地形测绘中的精度分析,提出了基于飞行高度、传感器精度、GPS定位精度和气象条件的精度优化方案。通过仿真模型和现场监测数据验证,发现飞行高度对精度有显著影响,且随着飞行高度增加,传感器误差、GPS定位误差和气象条件误差逐渐增大。模拟结果表明,采用实时动态差分技术(RTK)和精密单点定位(PPP)技术能有效提升定位精度。气象监测和飞行计划优化能够有效减少不良气候对测量精度的负面影响。通过综合这些措施,无人机航测在复杂地形中的精度得到了显著提升。研究表明,无人机航测技术具备良好的应用前景,但仍需持续优化精度控制技术以应对不同环境的挑战。 展开更多
关键词 无人机航测 测绘精度 飞行高度 GPS定位
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玉米种质资源株高和穗位的全基因组关联分析
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作者 李乐 李世风 +5 位作者 罗致春 尹立新 李为国 唐顺学 闫治斌 田冰川 《湖南农业科学》 2025年第8期1-6,共6页
为了筛选株高和穗位高符合高产需求的玉米材料,对215份玉米种质资源进行全基因组测序和表型采集,并对基因型、抗病及产量等表型优选出的种质资源进行全基因组关联分析(GWAS)。结果表明:215份玉米种质资源可以分为SS、NSS、PA、兰卡斯特... 为了筛选株高和穗位高符合高产需求的玉米材料,对215份玉米种质资源进行全基因组测序和表型采集,并对基因型、抗病及产量等表型优选出的种质资源进行全基因组关联分析(GWAS)。结果表明:215份玉米种质资源可以分为SS、NSS、PA、兰卡斯特、塘四平头和旅大红骨6个亚群,材料具有较高的代表性;对优选的134份种质资源进行全基因组关联分析,挖掘到株高和穗位高的QTL位点7个,其中2个QTL位点与已经克隆的基因位点存在重合,5个QTL位点为新的QTL位点,并且在7号染色体上株高和穗位同时定位到一个QTL区间。这些QTL位点为株高和穗位基因的精细定位提供了依据。 展开更多
关键词 玉米 种质资源 株高 穗位 基因定位
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基于3K和48K SNP芯片进行高低种植密度下玉米株高相关性状的作图比较
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作者 李阳婧 杨泽兵 +4 位作者 罗洁 池双红 刘应红 易强 侯宪斌 《核农学报》 北大核心 2025年第4期719-727,共9页
为了比较不同密度单核苷酸多态性(SNP)芯片的数量性状位点(QTL)作图效率,本研究基于Maize SNP 3K和48K芯片对来源于R08×掖478的271个重组自交系(RIL)群体进行基因分型,采用完备区间作图法定位四个环境和两种种植密度条件下玉米株... 为了比较不同密度单核苷酸多态性(SNP)芯片的数量性状位点(QTL)作图效率,本研究基于Maize SNP 3K和48K芯片对来源于R08×掖478的271个重组自交系(RIL)群体进行基因分型,采用完备区间作图法定位四个环境和两种种植密度条件下玉米株高相关性状的QTL。结果表明,利用48K SNP芯片分型结果构建的遗传图谱分辨率高于3K(标记数:2 804个bin vs 683个SNP;图谱长:3 863.77 cM vs 1 786.06 cM;标记平均间距:1.38 cM vs 2.65 cM)。基于48K-遗传图谱在高低种植密度下定位到的QTL较3K-遗传图谱多近40%(86/62),两者共定位到28个位置相同的QTL,约占48K-遗传图谱检测到QTL总数的32.6%和3K-遗传图谱检测到QTL总数的45.2%。利用48K-遗传图谱在高种植密度下检出51个QTL,低种植密度下检出60个QTL,其中密度钝感型QTL为25个。基于高密度标记芯片作图具有更高的效率,可用于高效解析玉米数量性状。本研究结果为玉米耐密候选基因的进一步精细定位提供了理论支撑。 展开更多
关键词 高密度基因芯片 玉米株高 耐密性 QTL作图分辨率比较
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基于GeoSLAM技术的城市树木保护应用
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作者 宋康明 周广华 谢云鹏 《北京测绘》 2025年第10期1479-1484,共6页
针对城市化进程中树木保护与城市建设发展的矛盾,本文以广州市黄埔区某园区为试点,采用无需全球卫星导航系统(GNSS)信号的地理空间同步定位与地图构建(GeoSLAM)移动激光扫描技术,沿"S"形路径采集树木三维点云数据,经开源三维... 针对城市化进程中树木保护与城市建设发展的矛盾,本文以广州市黄埔区某园区为试点,采用无需全球卫星导航系统(GNSS)信号的地理空间同步定位与地图构建(GeoSLAM)移动激光扫描技术,沿"S"形路径采集树木三维点云数据,经开源三维点云和网格处理软件点云配准(CloudCompare)预处理和激光雷达点云数据处理分析软件LiDAR360精处理后提取胸径参数,并与传统皮尺测量结果对比验证。实验结果表明:27株样本树木的激光测量最大绝对误差为2.9 cm、最大相对误差为7.05%,可同步精准获取树木空间定位信息,并基于胸径阈值实现保护对象智能筛选。该技术通过非接触式、全天候作业构建树木基础数据库,为城市更新建设中科学平衡生态保护与开发需求提供了量化决策依据,兼具生态价值与工程实践推广意义。 展开更多
关键词 树木保护 城市建设 城市更新 GeoSLAM激光扫描技术 胸径
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深部复杂环境工作面液压支架压力-位姿融合分析技术
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作者 巩师鑫 《工矿自动化》 北大核心 2025年第1期71-77,共7页
针对当前深部复杂环境工作面液压支架群信息感知匮乏、数据分析不足、装备运行参数规律和数据模型难以支撑智能化开采及支护决策等问题,以淮南口孜东矿140502深部“三软”煤层大采高工作面为应用场景,通过构建深部工作面液压支架姿态监... 针对当前深部复杂环境工作面液压支架群信息感知匮乏、数据分析不足、装备运行参数规律和数据模型难以支撑智能化开采及支护决策等问题,以淮南口孜东矿140502深部“三软”煤层大采高工作面为应用场景,通过构建深部工作面液压支架姿态监测系统,实现液压支架立柱压力和空间位姿的连续感知。基于工作面液压支架顶梁和底座横滚角数据,利用线段拟合方法实现工作面顶底板三维走向趋势实时可视化。基于工作面液压支架压力-位姿数据,建立液压支架压力-位姿数据映射关系和液压支架位姿计算模型。通过深部工作面支架压力和位姿的融合分析,揭示工作面采高、支架顶梁合力大小及合力作用点动态变化规律:相比于工作面两端液压支架,工作面中部液压支架采高最小,而工作面机尾的液压支架采高最大;工作面中部液压支架顶梁合力在大部分时间内都小于工作面两端液压支架顶梁合力;相比于工作面两端部支架,工作面中部支架顶梁合力作用点更偏向前立柱位置。 展开更多
关键词 深部煤层 液压支架 姿态监测 态势映射 融合分析 采高 顶梁合力 合力作用点
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Mining Elite Alleles of Growth Duration and Productive Panicle Number per Plant by Association Mapping with Conditional Phenotypic Value in Japonica Rice 被引量:1
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作者 JIANG Jian-hua CHEN Lan +2 位作者 LIU Qiang-ming HE Ying-jun HONG De-lin 《Rice science》 SCIE 2013年第3期200-206,共7页
To provide genetic information and materials for breeding hybrid japonica rice with wide adaptability and strong competitive advantage of yield, elite alleles and their carrier varieties of growth duration (GD) and ... To provide genetic information and materials for breeding hybrid japonica rice with wide adaptability and strong competitive advantage of yield, elite alleles and their carrier varieties of growth duration (GD) and productive panicle number per plant (PN) were detected. A natural population composed of 94 japonica varieties was phenotyped for the GD, PN and plant height (PH) in two environments. The conditional phenotypic data were transferred by the linear model method in software QGAStation 1.0, and association mapping based on the unconditional and conditional phenotype values of GD and PN was analyzed by using general linear model in software TASSEL. A total of 34 simple sequence repeat (SSR) marker loci associated with GD and PN were detected in the two environments. Among them, 15 were associated with GD, and 19 were associated with PN. Four elite alleles of RM8095-120bp, RM7102-176bp, RM72-170bp and RM72-178bp were associated with GD, and their carrier varieties were Hongmangshajing, Nipponbare, Hongmangshajing and Nannongjing 62401, respectively. These elite alleles from the carrier varieties can shorten GD by 2.03-9.93 d when they were introduced into improved materials. RM72-182bp associated with PN was an elite allele, and its carrier variety was Xiaoqingzhong. It can increase PN by three when introduced into improved materials. Moreover, these elite alleles can be used to improve target traits without influencing another two traits. 展开更多
关键词 japonica rice growth duration productive panicle number per plant plant height association mapping with conditional phenotypic value elite allele
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The Validity of Open-Source Elevations for Different Topographic Map Scales and Geomatics Applications
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作者 Gomaa M. Dawod Ibrahim E. Ascoura 《Journal of Geographic Information System》 2021年第2期148-165,共18页
This paper presents an analysis of four open-source Global Digital Elevation Models (GDEMs) and compares them on two topographic profiles (nearly flat, and hills regions) for mapping and geomatics applications. The ch... This paper presents an analysis of four open-source Global Digital Elevation Models (GDEMs) and compares them on two topographic profiles (nearly flat, and hills regions) for mapping and geomatics applications. The chief intention is to investigate if GDEMs-based heights, contour intervals, slopes, and topographic profiles are valid for all map scales of topographic mapping, which constitutes a major issue in mapping activities. Two case studies, the Nile delta in Egypt and Makkah city in Saudi Arabia, have been utilized to represent flat and moderate-topography patterns. The investigated GDEMs include the most-recent released models: ASTER v.3, ACE 2, SRTMGL1 v.3, and NASADEM_HGT v.1 released in 2019 and 2020 with spatial resolutions of 1 and 3 arc seconds. Available accurate Ground Control Points (GCP) consist of 540 stations in the Nile delta and 175 stations in Makkah. Based on the available datasets in two study areas, it has been found that the accuracy of investigated GDEMs over known checkpoints ranges from ±2.5 and ±5.1 meters in the Nile delta region, while it varies between ±5.1 and ±8.0 meters in the Makkah area. That indicates that the utilization of GDEMs in topographic mapping differs significantly between flat and hilly spatial regions. Therefore, it is recommended to avoid using GDEMs for developing topographic maps of scale 1:25,000 or larger in flat regions and map scale 1:50,000 or larger in hilly regions. Additionally, the accomplished results showed that all GDEM-based slopes do not match with the actual slopes from known GCP over cross section’s length up to 30 kilometers. Thus, it is concluded that GDEMs are not the appropriate heights’ source for topographic mapping at medium and large map scales, and could not be utilized for topographic profiling in precise engineering and geomatics applications. 展开更多
关键词 Topographic maps GDEMs heightS map Scales Contour Interval
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Analysis of unmanned aerial vehicle navigation and height control system based on GPS 被引量:3
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作者 Jianjun Zhang Hong Yuan 《Journal of Systems Engineering and Electronics》 SCIE EI CSCD 2010年第4期643-649,共7页
According to the characteristic of global positioning system(GPS) reflection signals,a GPS delay mapping receiver system scheme is put forward,which not only satisfies the unmanned aerial vehicle(UAV) guidance loc... According to the characteristic of global positioning system(GPS) reflection signals,a GPS delay mapping receiver system scheme is put forward,which not only satisfies the unmanned aerial vehicle(UAV) guidance localization but also realizes height measurement.A code delay algorithm is put forward,which processes the direct and land reflected signal and outputs the navigation data and specular point.The GPS terrain reflected echo signal mathematical equation is inferred.The reflecting signal area,when the GPS signal passes the land,is analyzed.The height survey model reflected land surface characteristic is established.A simulation system which carries guidance localization of the UAV and the height measuring control through the GPS direct signal and the land reflected signal is designed,taken the GPS satellite as the illumination source,the receiver is put on the UAV.Then the UAV guidance signal,the GPS reflection signal and receiver's parallel processing are realized.The parallel processing reduces UAV's payload and raises system's operating efficiency.The simulation results confirms the validity of the model and also provides the basis for the UAV's optimization design. 展开更多
关键词 height measuring global positioning system(GPS) reflected signal delay mapping receiver unmanned aerial vehicle(UAV).
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湖南省似大地水准面模型对比研究
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作者 喻艳梅 尹羿晖 《科技创新与应用》 2024年第26期109-112,共4页
正常高系统是以似大地水准面为基准的高程系统,也是中国目前采用的高程系统。随着GNSS定位技术的广泛应用,已能在10-7~10-9的精度量级上获得测量点的平面位置,但是却一直未能以相应的精度求解点的高程值。因此,通过建立高精度、高分辨... 正常高系统是以似大地水准面为基准的高程系统,也是中国目前采用的高程系统。随着GNSS定位技术的广泛应用,已能在10-7~10-9的精度量级上获得测量点的平面位置,但是却一直未能以相应的精度求解点的高程值。因此,通过建立高精度、高分辨率的区域似大地水准面模型提升高程测量的精度,成为重要的技术手段。该文通过对湖南省2007似大地水准面模型后期各似大地水准面模型的对比研究,找到模型的差异,并对差异较大的地区进行特征分析,查找形成差异的原因,可为全省二、三等水准网测量和大地水准面再精化工作提供参考。 展开更多
关键词 大地水准面 高程异常 似大地水准面模型 等值线图 模型对比
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控制玉米株高基因PHR1的基因克隆 被引量:3
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作者 杨晨曦 周文期 +8 位作者 周香艳 刘忠祥 周玉乾 刘芥杉 杨彦忠 何海军 王晓娟 连晓荣 李永生 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期55-66,共12页
株高属于玉米理想株型育种的一个重要指标,不但影响玉米机械化收获,更与玉米的倒伏性和生物产量密切相关。本研究以低剂量快中子(4.19 Gy)辐照诱变玉米自交系KWS39获得的矮秆低穗位突变体为研究对象,该突变体命名为plant height reducin... 株高属于玉米理想株型育种的一个重要指标,不但影响玉米机械化收获,更与玉米的倒伏性和生物产量密切相关。本研究以低剂量快中子(4.19 Gy)辐照诱变玉米自交系KWS39获得的矮秆低穗位突变体为研究对象,该突变体命名为plant height reducing mutant-1(phr-1),开展了表型性状的田间调查分析,并利用phr-1×B73获得的F2分离群体,借助极端性状混池测序分析法(BSA-seq)及目标区段重组交换鉴定的方法,基于B73参考基因组对目标区段内的基因进行挖掘和功能注释,定位候选基因。研究结果表明,在1号染色体Bin1.06区间可能存在变异位点,进而利用大的分离群体结合目标区段多态性标记开发,将目标区段精细定位分子标记到Umc1122和Umc1583a两个标记之间约600 kb区间,该区段内存在一个控制株高的已知基因Brachytic2(BR2),BR2编码一个调控玉米茎秆中生长素极性运输的糖蛋白。候选基因测序结果表明,phr-1是BR2基因在第4个外显子处插入了165 bp的序列,导致第547位氨基酸变为终止子,蛋白翻译提前终止。phr-1的基因突变位点和变异方式与已报道的br2-1单个碱基发生变异位点完全不同,通过等位杂交实验证明了phr-1突变体就是br2-1的一个新等位突变体,候选基因就是BR2基因。本研究为玉米BR2基因在玉米株高遗传改良中提供了新的种质资源。 展开更多
关键词 玉米 株高 穗位高 BSA混池测序 基因定位 功能分析
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基于InDel标记的谷子株高QTL定位 被引量:4
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作者 杜晓芬 钱枰励 +5 位作者 唐楚楚 杜德杰 韩康妮 李禹欣 王智兰 王军 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期217-225,共9页
插入/缺失(InDel)标记在植物基因组中广泛分布,然而谷子中InDel标记的数量十分有限。为挖掘InDel位点和开发分子标记,本研究基于衡谷12号和长农35号的深度重测序结果,分析其单核苷酸多态性(SNP)、InDel和结构变异(SV)。利用JoinMap 4软... 插入/缺失(InDel)标记在植物基因组中广泛分布,然而谷子中InDel标记的数量十分有限。为挖掘InDel位点和开发分子标记,本研究基于衡谷12号和长农35号的深度重测序结果,分析其单核苷酸多态性(SNP)、InDel和结构变异(SV)。利用JoinMap 4软件构建连锁遗传图谱,利用WinQTLCart 2.5软件定位株高数量性状位点(QTL),利用生物信息学、测序和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)进行候选基因分析。研究表明,3种变异类型数量由多到少排序为SNP>InDel>SV;获得1392个在衡谷12号和长农35号中具有多态性的InDel标记,多态性率为35.14%,这些标记在谷子9条染色体上分布不均;获得一张包含467个InDel标记的谷子遗传连锁图谱,该图谱总图距448.45 cM,平均图距0.96 cM;利用F2群体定位了4个株高QTL(qPH5-1、qPH5-2、qPH9-1和qPH9-2),进一步利用重组自交系(RIL)群体对其中2个效应值较大的QTL(qPH5-1和qPH9-2)进行验证,结果重新检测到qPH9-2,似然比的自然对数(LOD)值为93.6,加性效应为-46.15,解释表型贡献率(PVE)达91.06%;Seita.9G080400在编码区存在2处非同义突变,且在茎中表达水平呈极显著差异,推测Seita.9G080400可能是控制株高的关键候选基因。本研究开发的InDel标记能够良好地应用于株高QTL定位,同时可为谷子种质资源鉴定、亲缘关系分析等研究提供一套好用的分子标记。 展开更多
关键词 谷子 重测序 标记开发 连锁遗传图谱 株高 QTL
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展颖野生稻株高性状的遗传与SD1基因的等位变异分析 被引量:3
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作者 杨先冬 刘伟 +3 位作者 曹利霞 李孝辉 陆怡 傅雪琳 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期18-26,共9页
为了探究SSSL-B50和华粳籼74(HJX74)株高差异的原因,利用SSSL-B50与HJX74回交构建F_(2)群体进行株高性状遗传分析与基因定位。结果显示,F_(1)植株表现为高秆;260个单株组成的F_(2)群体株高出现分离,高秆植株与半矮秆植株分离比例符合3... 为了探究SSSL-B50和华粳籼74(HJX74)株高差异的原因,利用SSSL-B50与HJX74回交构建F_(2)群体进行株高性状遗传分析与基因定位。结果显示,F_(1)植株表现为高秆;260个单株组成的F_(2)群体株高出现分离,高秆植株与半矮秆植株分离比例符合3∶1(χ^(2)=0.18<3.84),说明SSSL-B50高秆性状为显性性状,受1对显性等位基因控制。利用IciMapping软件对F_(2)进行连锁分析,将SSSL-B50携带的高秆基因定位在1号染色体代换片段上的标记S18和X161之间38.38~39.07 Mb。候选基因筛选分析发现,定位区间内存在着“绿色革命”基因座位SD1。对展颖野生稻、SSSL-B50及HJX74进行SD1基因测序及序列比对,发现HJX74的CDS序列与展颖野生稻、SSSL-B50相比有280 bp的缺失,导致氨基酸编码提前终止。qRT-PCR结果表明,SD1表达量在SSSL-B50茎秆的第2,3,4节均显著高于HJX74。此外,与前人报道结果相比,展颖野生稻SD1基因编码的氨基酸序列发生了2处改变(E100G、Q339R)。研究结果弄清楚了展颖野生稻单片段代换系SSSL-B50高秆性状受SD1调控,同时从展颖野生稻鉴定到了SD1的新等位型SD1Glu。 展开更多
关键词 展颖野生稻 株高 染色体片段代换系 基因定位 等位型
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Assessment of the global Copernicus,NASADEM,ASTER and AW3D digital elevation models in Central and Southern Africa 被引量:1
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作者 Chukwuma J.Okolie Jon P.Mills +4 位作者 Adedayo K.Adeleke Julian L.Smit Maria V.Peppa Arif O.Altunel Ikenna D.Arungwa 《Geo-Spatial Information Science》 CSCD 2024年第4期1362-1390,共29页
Validation studies of global Digital Elevation Models(DEMs)in the existing literature are limited by the diversity and spread of landscapes,terrain types considered and sparseness of groundtruth.Moreover,there are kno... Validation studies of global Digital Elevation Models(DEMs)in the existing literature are limited by the diversity and spread of landscapes,terrain types considered and sparseness of groundtruth.Moreover,there are knowledge gaps on the accuracy variations in rugged and complex landscapes,and previous studies have often not relied on robust internal and external validation measures.Thus,there is still only partial understanding and limited perspective of the reliability and adequacy of global DEMs for several applications.In this study,we utilize a dense spread of LiDAR groundtruth to assess the vertical accuracies of four medium-resolution,readily available,free-access and global coverage 1 arc-second(30 m)DEMs:NASADEM,ASTER GDEM,Copernicus GLO-30,and ALOS World 3D(AW3D).The assessment is carried out at landscapes spread across Cape Town,Southern Africa(urban/industrial,agricultural,mountain,peninsula and grassland/shrubland)and forested national parks in Gabon,Central Africa(low-relief tropical rainforest and high-relief tropical rainforest).The statistical analysis is based on robust accuracy metrics that cater for normal and non-normal elevation error distribution,and error ranking.In Cape Town,Copernicus DEM generally had the least vertical error with an overall Mean Error(ME)of 0.82 m and Root Mean Square Error(RMSE)of 2.34 m while ASTER DEM had the poorest performance.However,ASTER GDEM and NASADEM performed better in the low-relief and high-relief tropical forests of Gabon.Generally,the DEM errors have a moderate to high positive correlation in forests,and a low to moderate positive correlation in mountains and urban areas.Copernicus DEM showed superior vertical accuracy in forests with less than 40%tree cover,while ASTER and NASADEM performed better in denser forests with tree cover greater than 70%.This study is a robust regional assessment of these global DEMs. 展开更多
关键词 Global digital elevation model NASADEM ASTER ALOS World 3D COPERNICUS LiDAR NASA Land Vegetation and Ice Sensor(LVIS) height error map
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融合星载GNSS-R数据和多变量参数全球海洋有效波高深度学习反演法 被引量:2
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作者 布金伟 余科根 +4 位作者 汪秋兰 李玲惠 刘馨雨 左小清 常军 《测绘学报》 EI CSCD 北大核心 2024年第7期1321-1335,共15页
星载GNSS-R作为一种新兴的观测方法,最近被应用于有效波高反演。现有研究通常使用从延迟多普勒图中提取的特征值以构建经验地球物理模型函数反演SWH。然而,使用多个变量参数作为模型输入具有很大挑战。为此,本文提出了一个融合星载GNSS-... 星载GNSS-R作为一种新兴的观测方法,最近被应用于有效波高反演。现有研究通常使用从延迟多普勒图中提取的特征值以构建经验地球物理模型函数反演SWH。然而,使用多个变量参数作为模型输入具有很大挑战。为此,本文提出了一个融合星载GNSS-R数据和多变量参数反演全球海面SWH的深度学习网络模型(GloWH-Net)。为了验证本文模型的性能,ERA5、WaveWatchⅢ和AVISO SWH数据被用作广泛测试的参考数据,以评估GloWH-Net模型和先前模型(即经验模型和机器学习模型)的SWH反演性能。结果表明,当分别使用ERA5、WaveWatchⅢ和AVISO SWH作为参考值时,所提的GloWH-Net模型反演SWH的均方根误差分别为0.330、0.393和0.433 m,相关系数分别为0.91、0.89和0.84。相比基于最小方差估计器的经验组合模型反演SWH的均方根误差分别降低了53.45%、48.06%和40.63%;相比袋装树机器学习模型反演SWH的均方根误差分别降低了21.92%、18.72%和4.47%。表明了本文方法在反演全球海面SWH方面具有显著优势。 展开更多
关键词 GNSS-R 延迟多普勒图 海洋有效波高 经验模型 深度学习模型
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