为鉴定鱼源鲁氏耶尔森氏菌(Yersinia ruckeri)SC09菌株水生环境中不同温度的转录组水平上的差异,研究采用链特异性转录组测序(Strand-specific RNA-seq)技术对菌体生理温度(28℃)和实验培养温度(37℃)下进行链特异性测序,原始数据质控后...为鉴定鱼源鲁氏耶尔森氏菌(Yersinia ruckeri)SC09菌株水生环境中不同温度的转录组水平上的差异,研究采用链特异性转录组测序(Strand-specific RNA-seq)技术对菌体生理温度(28℃)和实验培养温度(37℃)下进行链特异性测序,原始数据质控后,筛选得到差异表达基因,通过KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库对差异表达基因进行富集分析,并利用Rockhopper软件筛选出的重要原核生物基因簇进行验证。结果显示,共筛选获得173个显著差异表达基因(P<0.05),其中包括58个上调基因,主要富集到一些特殊的碳水化合物代谢相关的通路中;以及115个下调基因,主要富集到双组份信号系统中与三羧酸循环相关的代谢通路上,同时部分基因富集到编码鞭毛素相关的基因簇中。结果表明,相对于37℃的实验室培养温度,在水生环境的生理温度条件下(28℃)SC09菌株拥有较高的运动性和较强的葡萄糖代谢,但相对的SC09菌株代谢一些特殊糖类的能力减弱。展开更多
【目的】确定草鱼(Ctenopharyngodon idellus)中出现的以肌肉出血、脾脏肿大、肠炎、鳔出血为典型症状的疾病的病原,为该病的防治提供参考。【方法】采用病原分离纯化、生理生化试验、16S r DNA检测、系统进化分析、动物回归感染试验等...【目的】确定草鱼(Ctenopharyngodon idellus)中出现的以肌肉出血、脾脏肿大、肠炎、鳔出血为典型症状的疾病的病原,为该病的防治提供参考。【方法】采用病原分离纯化、生理生化试验、16S r DNA检测、系统进化分析、动物回归感染试验等方法对致病菌进行鉴定,采用纸片法确定病原的药敏特性。【结果】分离株为革兰氏阴性短杆菌,菌落表面光滑、圆形,颜色为白色;有运动性,硫化氢反应、V-P反应阴性,能发酵葡萄糖、果糖、麦芽糖;16S r DNA测序结果与鲁氏耶尔森菌(Yersinia ruckeri)同源性为99%;回归试验攻毒组与临床病例表现一致;药敏试验结果显示该菌对氨苄西林、恩诺沙星、氟苯尼考等19种抗菌药敏感,对青霉素G、苯唑西林、利福平、万古霉素、克拉霉素、红霉素、头孢他啶、麦迪霉素和痢特灵存在耐药性。【结论】该例草鱼疾病的病原为鲁氏耶尔森菌,在草鱼上为首次报道,生产中可选用恩诺沙星、氟苯尼考等水产类常用抗菌药进行防治。展开更多
文摘为鉴定鱼源鲁氏耶尔森氏菌(Yersinia ruckeri)SC09菌株水生环境中不同温度的转录组水平上的差异,研究采用链特异性转录组测序(Strand-specific RNA-seq)技术对菌体生理温度(28℃)和实验培养温度(37℃)下进行链特异性测序,原始数据质控后,筛选得到差异表达基因,通过KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库对差异表达基因进行富集分析,并利用Rockhopper软件筛选出的重要原核生物基因簇进行验证。结果显示,共筛选获得173个显著差异表达基因(P<0.05),其中包括58个上调基因,主要富集到一些特殊的碳水化合物代谢相关的通路中;以及115个下调基因,主要富集到双组份信号系统中与三羧酸循环相关的代谢通路上,同时部分基因富集到编码鞭毛素相关的基因簇中。结果表明,相对于37℃的实验室培养温度,在水生环境的生理温度条件下(28℃)SC09菌株拥有较高的运动性和较强的葡萄糖代谢,但相对的SC09菌株代谢一些特殊糖类的能力减弱。
文摘【目的】确定草鱼(Ctenopharyngodon idellus)中出现的以肌肉出血、脾脏肿大、肠炎、鳔出血为典型症状的疾病的病原,为该病的防治提供参考。【方法】采用病原分离纯化、生理生化试验、16S r DNA检测、系统进化分析、动物回归感染试验等方法对致病菌进行鉴定,采用纸片法确定病原的药敏特性。【结果】分离株为革兰氏阴性短杆菌,菌落表面光滑、圆形,颜色为白色;有运动性,硫化氢反应、V-P反应阴性,能发酵葡萄糖、果糖、麦芽糖;16S r DNA测序结果与鲁氏耶尔森菌(Yersinia ruckeri)同源性为99%;回归试验攻毒组与临床病例表现一致;药敏试验结果显示该菌对氨苄西林、恩诺沙星、氟苯尼考等19种抗菌药敏感,对青霉素G、苯唑西林、利福平、万古霉素、克拉霉素、红霉素、头孢他啶、麦迪霉素和痢特灵存在耐药性。【结论】该例草鱼疾病的病原为鲁氏耶尔森菌,在草鱼上为首次报道,生产中可选用恩诺沙星、氟苯尼考等水产类常用抗菌药进行防治。
