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Detection and Comparison of Pathogen of Virus Disease in Pumpkin by RT-PCR and IC-PCR
1
作者 YANG Guohui ZHANG Zhongkai CUI Chongshi 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2006年第2期129-132,共4页
Two kinds of methods RT-PCR and IC-PCR were used to detect pathogen of virus disease of pumpkin and the sensitivity of the two methods was compared. The results showed that PRSV-W and CMV were detected in diseased sam... Two kinds of methods RT-PCR and IC-PCR were used to detect pathogen of virus disease of pumpkin and the sensitivity of the two methods was compared. The results showed that PRSV-W and CMV were detected in diseased samples gathered in Yunnan Province, while WMV and CMV were detected in diseased samples gathered in Heilongjiang Province. The sensitivity of RT-PCR is higher than that of IC-PCR, but the effect of IC-PCR in the specialization of bonding reaction and requisition for experiment material is better than that of RT-PCR. 展开更多
关键词 PUMPKIN virus disease RT-PCR ic-pcr
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进境西瓜种子中西瓜细菌性果斑病菌的检测鉴定 被引量:3
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作者 廖富荣 林石明 +4 位作者 方志鹏 黄蓬英 陈红运 陈青 吴媛 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期135-138,共4页
由嗜酸菌属西瓜种(Acidovorax citrulli)引起的西瓜细菌性果斑病是西瓜等葫芦科作物上的一种极具毁灭性的病害,该病原细菌可以由种子携带传播。本研究通过直接研磨种子,用双抗体夹心酶联免疫吸附测定法(DAS-ELISA)和免疫捕捉聚合酶链式... 由嗜酸菌属西瓜种(Acidovorax citrulli)引起的西瓜细菌性果斑病是西瓜等葫芦科作物上的一种极具毁灭性的病害,该病原细菌可以由种子携带传播。本研究通过直接研磨种子,用双抗体夹心酶联免疫吸附测定法(DAS-ELISA)和免疫捕捉聚合酶链式反应法(IC-PCR)对进境的西瓜种子进行检测,并且对PCR产物进一步克隆测序。结果表明,在DAS-ELISA产生阳性结果的样品中,IC-PCR结果也产生阳性。序列分析表明,该序列与已知的该病菌16S rRNA基因的相应序列具有100%同源性。因此,2006年这批来自台湾的西瓜种子携带有嗜酸菌属西瓜种(Acidovorax citrulli)。 展开更多
关键词 西瓜种子 DAS-ELISA ic-pcr 嗜酸菌属西瓜种 种子携带
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滇黑两省黄瓜花叶病毒南瓜分离物外壳蛋白基因序列分析 被引量:2
3
作者 杨国慧 张仲凯 崔崇士 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1237-1240,共4页
利用免疫捕捉多聚酶链式反应(Immuno-Capture PCR,IC-PCR)方法从南瓜的两个黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)云南分离物(CMV-YN)和黑龙江分离物(CMV-HLJ)中扩增获得约700bp的外壳蛋白(Coat protein,CP)基因片段,并克隆到pGEM-T... 利用免疫捕捉多聚酶链式反应(Immuno-Capture PCR,IC-PCR)方法从南瓜的两个黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)云南分离物(CMV-YN)和黑龙江分离物(CMV-HLJ)中扩增获得约700bp的外壳蛋白(Coat protein,CP)基因片段,并克隆到pGEM-T载体中。核苷酸序列测定表明,CMV-HLJ和CMV-YN两个分离物CP基因长为657bp,编码219个氨基酸,两个分离物的核苷酸和氨基酸同源性分别达到96.8%和97.4%。和国外CMV亚组Ⅰ6个分离物核苷酸序列同源性在90%以上,氨基酸同源性在97%以上,和亚组Ⅱ6个分离物的同源性分别为66.4%和73.4%。和国内亚组Ⅰ10个分离物的核苷酸同源性都在89.5%以上,氨基酸同源性在93%以上,而和亚组Ⅱ两个分离物的同源性分别为68.3%和73.5%。序列分析结果表明CMV-HLJ和CMV-YN两个分离物属于CMV亚组Ⅰ。 展开更多
关键词 南瓜 CMV ic-pcr CP基因
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生鲜肉中肠炎沙门菌分子生物学特征分析 被引量:3
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作者 周俊英 付有荣 +1 位作者 郭清莲 齐小保 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1227-1228,共2页
目的了解生鲜肉类中肠炎沙门菌耐药性及基因变异情况。方法药敏试验采用K-B法,用碱裂解法提取细菌的质粒DNA,采用肠杆菌重复基因间隔重复共有序列(ERIC-PCR)技术对10株肠炎沙门菌进行基因分析,运用NTSYS-PC2.0软件进行同源性比较,聚类... 目的了解生鲜肉类中肠炎沙门菌耐药性及基因变异情况。方法药敏试验采用K-B法,用碱裂解法提取细菌的质粒DNA,采用肠杆菌重复基因间隔重复共有序列(ERIC-PCR)技术对10株肠炎沙门菌进行基因分析,运用NTSYS-PC2.0软件进行同源性比较,聚类分析。结果药敏呈现出多重耐药;基因谱系与聚类分析可将菌株分为3大类,扩增片段长度为250bp~2000bp,在85%的同源度上可分为A、B、C等3个型,其中A型2株,B型6株,C型2株。结论生鲜肉中肠炎沙门菌耐药情况比较普遍,10株肠炎沙门菌基因变异较小,ERIC-PCR技术是分析、鉴定肠炎沙门菌,追溯食物中肠炎沙门菌的有用和可行的工具。 展开更多
关键词 肠炎沙门菌 ERic-pcr 耐药性 聚类分析
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采用PCR技术检测植物病原菌
5
作者 覃川杰 屠善军 《浙江万里学院学报》 2005年第2期119-122,共4页
聚合酶联反应(PolymeraseChainReaction,PCR)用于各类DNA、RNA的体外扩增,具有灵敏、特异、快速等诸多优点,目前已广泛地作为人类、动植物病毒、真菌等分子检测的重要手段.并在此基础上与分子生物学其他最新技术相结合,进一步发展了IC-P... 聚合酶联反应(PolymeraseChainReaction,PCR)用于各类DNA、RNA的体外扩增,具有灵敏、特异、快速等诸多优点,目前已广泛地作为人类、动植物病毒、真菌等分子检测的重要手段.并在此基础上与分子生物学其他最新技术相结合,进一步发展了IC-PCR,realtimefluorescentPCR,PCR-ELISA等复合PCR技术.将PCR技术与这些方法的突出优点相结合使用,从而提供了更快捷、特异、准确、高效检测侵染植物病原菌的方法. 展开更多
关键词 植物病原菌 PCR PCR-ELISA ic-pcr REAL time FLUORESCENT PCR multiplex PCR Nested RT-PCR
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百合无症病毒的RT-PCR和IC-RT-PCR检测 被引量:43
6
作者 王继华 瞿素萍 +2 位作者 孔宝华 陆琳 余朝秀 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 2004年第2期148-150,173,共4页
应用DAS-ELISA,RT-PCR和IC-RT-PCR技术检测百合无症病毒(LSV)。结果表明:RT-PCR和IC-RT-PCR分别可从2ng和200ng百合叶片组织中检测出LSV,分别是DAS-ELISA敏感度的1000倍和10倍。百合鳞茎的不同取样部位对PCR检测结果的影响较大,RT-PCR... 应用DAS-ELISA,RT-PCR和IC-RT-PCR技术检测百合无症病毒(LSV)。结果表明:RT-PCR和IC-RT-PCR分别可从2ng和200ng百合叶片组织中检测出LSV,分别是DAS-ELISA敏感度的1000倍和10倍。百合鳞茎的不同取样部位对PCR检测结果的影响较大,RT-PCR难以从鳞片和根部检测出病毒,但IC-RT-PCR可以检测出病毒。 展开更多
关键词 百合 无症病毒 RT-PCR IC-RT-PCR DAS—ELISA 检测技术 切花
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DAS-ELISA、RT-PCR和IC-RT-PCR检测葡萄卷叶病毒Ⅲ的比较研究 被引量:17
7
作者 陈建军 2刘崇怀 +2 位作者 古勤生 潘兴 曹孜义 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期173-177,共5页
在生长季节分3次对部分葡萄品种枝条上部、中部和下部叶片及韧皮部,进行双抗体夹心法(DAS-ELISA)、反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和免疫捕捉反转录聚合酶链式反应(IC-RT-PCR)3种方法检测卷叶病毒Ⅲ(GLRaV-3)的比较。结果表明:DAS-ELISA... 在生长季节分3次对部分葡萄品种枝条上部、中部和下部叶片及韧皮部,进行双抗体夹心法(DAS-ELISA)、反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和免疫捕捉反转录聚合酶链式反应(IC-RT-PCR)3种方法检测卷叶病毒Ⅲ(GLRaV-3)的比较。结果表明:DAS-ELISA的检出率明显低于RT-PCR和IC-RT-PCR方法。RT-PCR可以检测出RNA提取液为1:10-4的GLRaV-3病毒,但它受到了提取RNA难以及其它物质(如蛋白质、DNA等)干扰的影响,检测难度增加。从检测的灵敏度来看,RT-PCR和IC-RT-PCR比DAS-ELISA灵敏;并且,IC-RT-PCR比其它两种方法较快,整个过程仅需8h。 展开更多
关键词 DAS-ELISA RT-PCR IC-RT-PCR 葡萄 卷叶病毒Ⅲ 比较研究 检测 检出率
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烟草环斑病毒的RT-PCR和IC-RT-PCR检测方法研究 被引量:12
8
作者 杨翠云 曹洁 +3 位作者 于翠 高焕利 沈禹飞 代光辉 《上海农业学报》 CSCD 2007年第1期83-87,共5页
根据TRSV CP基因的保守序列设计引物,RT-PCR和IC-RT-PCR能从TRSV的2个分离物中分别扩增到与预期大小相同的DNA条带,序列测定和分析表明所扩增序列为TRSV CP基因的部分序列,在系统关系树上与TRSV的其他分离物形成一簇,表明所建立的RT-PCR... 根据TRSV CP基因的保守序列设计引物,RT-PCR和IC-RT-PCR能从TRSV的2个分离物中分别扩增到与预期大小相同的DNA条带,序列测定和分析表明所扩增序列为TRSV CP基因的部分序列,在系统关系树上与TRSV的其他分离物形成一簇,表明所建立的RT-PCR和IC-RT-PCR检测方法是可靠的。 展开更多
关键词 烟草环斑病毒(TRSV) RT-PCR IC-RT-PCR 检测方法
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九种单核细胞增生性李斯特菌检测技术效果比较及评价 被引量:4
9
作者 刘雅莉 刘芳 +4 位作者 韩舜愈 刘箐 孙志博 夏俊芳 朱小清 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期84-92,共9页
采用传统生物学方法、显色培养基方法、自制三抗体夹心ELISA试剂盒(TAS-ELISA)、基因组直接PCR(DNA Direct-PCR)、菌裂解直接PCR(Bacterium Direct-PCR)、免疫捕捉PCR(IC-PCR)、生物PCR(Bio-PCR)、SYBR Green染料实时荧光PCR(SYBR Green... 采用传统生物学方法、显色培养基方法、自制三抗体夹心ELISA试剂盒(TAS-ELISA)、基因组直接PCR(DNA Direct-PCR)、菌裂解直接PCR(Bacterium Direct-PCR)、免疫捕捉PCR(IC-PCR)、生物PCR(Bio-PCR)、SYBR Green染料实时荧光PCR(SYBR Green Real time-PCR)、探针实时荧光PCR(TaqMan Real time-PCR)检测纯菌液及模拟带菌食品中的单核细胞增生性李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)。结果表明:传统生物学培养方法出现假阳性;TAS-ELISA、DNADirect-PCR、Bacterium Direct-PCR、IC-PCR最低检测限分别为106、102、105、104CFU/ml;显色培养基、SYBR Green Real time-PCR灵敏度达102CFU/ml;Bio-PCR、TaqMan Real time-PCR检测灵敏度最高,均为101CFU/ml。显色培养基、TAS-ELISA操作简单,适合大量样品的初检;IC-PCR具有灵敏、特异、快速、经济的优点,特别适合大体积样品中微量病原的检测;Bio-PCR、TaqMan Real time-PCR灵敏度高、特异性好,适合阳性样品的复检以及科研使用。 展开更多
关键词 单核细胞增生性李斯特菌 三抗体夹心ELISA 免疫捕捉PCR 生物PCR 实时荧光 定量PCR
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齿兰环斑病毒与建兰花叶病毒分子检测研究 被引量:5
10
作者 闻伟刚 谭钟 +1 位作者 崔俊霞 陈先锋 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期65-69,共5页
齿兰环斑病毒(Odontoglossum ringspot virus,ORSV)与建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,Cy MV)是严重危害兰科植物的两种主要病毒。本研究根据病毒外壳蛋白基因设计特异性引物,应用ELISA、普通RT-PCR、巢式RT-PCR和免疫捕获RT-PCR4... 齿兰环斑病毒(Odontoglossum ringspot virus,ORSV)与建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,Cy MV)是严重危害兰科植物的两种主要病毒。本研究根据病毒外壳蛋白基因设计特异性引物,应用ELISA、普通RT-PCR、巢式RT-PCR和免疫捕获RT-PCR4种方法进行了检测研究与比较。结果表明:普通RT-PCR与ELISA方法检测灵敏度相当;巢式RT-PCR检测灵敏度要比普通RT-PCR与ELISA方法高出104倍以上;免疫捕获RT-PCR检测灵敏度介于普通RT-PCR和巢式RT-PCR之间。采用巢式RT-PCR方法对我国台湾进境的蝴蝶兰植株样本检测,1号样本出现与阳性对照一致的特异条带。双向测序分析,扩增产物序列与ORSV外壳蛋白基因具有100%的同源性,表明1号蝴蝶兰样本携带ORSV。 展开更多
关键词 齿兰环斑病毒 建兰花叶病毒 巢式RT—PCR 免疫捕获RT-PCR 检测灵敏度
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黄瓜绿斑驳花叶病毒的鉴定及分子检测 被引量:19
11
作者 黄静 廖富荣 +2 位作者 林石明 陈青 王宗华 《中国农学通报》 CSCD 2007年第4期318-322,共5页
【研究目的】黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)的快速鉴定检测是控制该潜在危险性有害生物蔓延的有效途径。【方法】通过汁液摩擦接种、透射电镜观察、双抗夹心酶联免疫吸附测定法(DAS-ELISA)和RT-PCR方... 【研究目的】黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)的快速鉴定检测是控制该潜在危险性有害生物蔓延的有效途径。【方法】通过汁液摩擦接种、透射电镜观察、双抗夹心酶联免疫吸附测定法(DAS-ELISA)和RT-PCR方法对该病毒进行鉴定;同时对RT-PCR反应体系及扩增程序进行优化,建立CGMMV免疫捕获RT-PCR(IC-RT-PCR)检测方法。【结果】血清学、生物学、电镜观察和分子生物学方法证明供试样本为黄瓜绿斑驳花叶病毒引致。IC-RT-PCR方法可以简化RNA的提取,降低对试验材料要求。【结论】IC-RT-PCR的建立为CGMMV的检测提供了操作更为简便、特异性更强的快速、准确的检测方法。 展开更多
关键词 黄瓜绿斑驳花叶病毒 摩擦接种 DAS-MSA 免疫捕获RT-CR
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免疫捕捉PCR和直接PCR技术检测单核细胞增生性李斯特菌比较研究 被引量:3
12
作者 刘雅莉 刘箐 +6 位作者 刘芳 韩舜愈 王婧 夏俊芳 汪小波 樊学军 田绿波 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第20期243-248,共6页
将免疫学技术与分子生物学技术相结合,建立了免疫捕捉PCR(IC-PCR),并与传统的直接PCR(Direct-PCR)进行比较。结果显示:纯菌液中IC-PCR检测灵敏度(104CFU/mL)是Direct-PCR灵敏度(105CFU/mL)的10倍;模拟带菌实验结果表明:IC-PCR最低可检测... 将免疫学技术与分子生物学技术相结合,建立了免疫捕捉PCR(IC-PCR),并与传统的直接PCR(Direct-PCR)进行比较。结果显示:纯菌液中IC-PCR检测灵敏度(104CFU/mL)是Direct-PCR灵敏度(105CFU/mL)的10倍;模拟带菌实验结果表明:IC-PCR最低可检测到5×101个细菌/PCR反应体系(即104CFU/mL),检测限比Direct-PCR(5×103个细菌/PCR反应体系即106CFU/mL)高100倍;特异性实验、干扰实验结果表明IC-PCR可特异检测单核细胞增生性李斯特菌(Listeria monaytogenes,LM),而和18株其他常见食源性致病菌无交叉反应。IC-PCR具有快速、经济、灵敏、特异等优点,是一种适合食品安全监管部门、食品企业的LM快速检测方法。 展开更多
关键词 单核细胞增生性李斯特菌 免疫捕捉PCR 直接PCR
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应用IC-RT-PCR法检测怀地黄中烟草花叶病毒(TMV) 被引量:7
13
作者 杜琳 向进乐 +2 位作者 樊金玲 李欣 罗磊 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第13期2092-2095,共4页
目的:建立一套快速、灵敏、高效的怀地黄TMV检测技术,为怀地黄TMV的脱毒检测提供技术支持,以实现怀地黄脱毒苗的产业化生产,改善病毒病引起的品种退化现象。方法:根据GenBank上登录的TMV外壳蛋白基因保守序列,设计特异性引物,利用免疫捕... 目的:建立一套快速、灵敏、高效的怀地黄TMV检测技术,为怀地黄TMV的脱毒检测提供技术支持,以实现怀地黄脱毒苗的产业化生产,改善病毒病引起的品种退化现象。方法:根据GenBank上登录的TMV外壳蛋白基因保守序列,设计特异性引物,利用免疫捕捉RT-PCR(IC-RT-PCR)技术检测怀地黄中的TMV,并对PCR扩增产物进行测序。结果:利用IC-RT-PCR技术扩增出了预期目的条带,其扩增产物与地黄TMV CP基因(登录号为AY555269)核苷酸序列的同源性达95.29%,氨基酸同源性达96.7%。结论:建立了怀地黄TMV的IC-RT-PCR检测技术,集免疫学与分子生物学检测技术于一体,灵敏度高,操作简便,适合于怀地黄TMV的快速检测。 展开更多
关键词 怀地黄 TMV IC—RT—PCR 序列分析 病毒检测
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马铃薯Y病毒单克隆抗体的制备及其检测应用 被引量:12
14
作者 宋革 郭玉双 +2 位作者 饶黎霞 周雪平 吴建祥 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期517-526,共10页
马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)是危害农作物的重要病毒之一,在全球广泛传播并造成了严重的经济损失,而建立特异、灵敏的检测技术是防控PVY的关键。本研究以提纯PVYN病毒粒子为抗原免疫BALB/c小鼠,利用杂交瘤技术获得4株能分泌PVY单... 马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)是危害农作物的重要病毒之一,在全球广泛传播并造成了严重的经济损失,而建立特异、灵敏的检测技术是防控PVY的关键。本研究以提纯PVYN病毒粒子为抗原免疫BALB/c小鼠,利用杂交瘤技术获得4株能分泌PVY单克隆抗体的杂交瘤细胞株(3B2、3E4、20B2和25C2),杂交瘤细胞分泌的腹水单抗的效价在10^(-6)~10^(-7)之间,Western blot分析发现3B2、3E4和20B2这3株单抗仅与感染PVY的叶片中1条分子质量约为30ku的蛋白有特异性反应。该蛋白的分子质量与PVY的外壳蛋白亚基大小相符,推测制备的这3个单抗能识别PVY的外壳蛋白亚基,而25C2单抗与感染PVY的病叶组织中约55ku的蛋白有特异性反应。进而以制备的单抗为核心建立了检测植株中PVY的ACP-ELISA、dot-ELISA、tissue blot-ELISA和IC-RTPCR这4种血清学方法。特异性分析结果表明,这4种血清学方法检测感染PVY的样品呈阳性反应,而检测健康的烟草和马铃薯及感染马铃薯S病毒、马铃薯X病毒、马铃薯卷叶病毒、马铃薯A病毒的样品呈阴性反应;灵敏度分析结果表明,ACP-ELISA和dot-ELISA检测马铃薯病叶的灵敏度分别达1∶81 920倍和1∶10 240倍稀释(g/mL),而具有最高检测灵敏度的IC-RT-PCR方法在感病植物组织稀释到1∶5 242 880倍(g/mL)时仍能检测到病毒。用建立的血清学方法对2015年采自云南的30个田间马铃薯样品进行检测,结果发现其中有20样品感染PVY,且血清学方法的检测结果与RT-PCR结果一致。抗PVY特异、灵敏单抗的制备及血清学检测方法的建立,为我国作物上PVY的检测和诊断、脱毒种薯生产、抗病育种和科学防控提供了物质和技术支撑。 展开更多
关键词 马铃薯Y病毒 单克隆抗体 ACP-ELISA DOT-ELISA TISSUE blot-ELISA IC-RT-PCR
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检测砂梨潜隐病毒的IC-RT-PCR和TC-RT-PCR的研究 被引量:8
15
作者 邓晓云 洪霓 +1 位作者 胡红菊 王国平 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期569-572,共4页
以砂梨为试材,在生物学和血清学检测的基础上,采用免疫捕作RT-PCR穴IC-RT-PCR雪和试管捕作RT-PCR穴TC-RT-PCR雪技术,对苹果褪绿叶斑病毒(Applechloroticleafspotvirus,ACLSV)和苹果茎沟病毒(Applestemgroovingvirus,ASGV)进行了检测分... 以砂梨为试材,在生物学和血清学检测的基础上,采用免疫捕作RT-PCR穴IC-RT-PCR雪和试管捕作RT-PCR穴TC-RT-PCR雪技术,对苹果褪绿叶斑病毒(Applechloroticleafspotvirus,ACLSV)和苹果茎沟病毒(Applestemgroovingvirus,ASGV)进行了检测分析。结果表明,TC/IC-RT-PCR均能有效检测梨粗提液中的ACLSV和ASGV,分别获得了大小约358bp和499bp的目标扩增片段;但IC-RT-PCR检测ACLSV的效果受到病毒分离株间血清学关系影响。与传统的RT-PCR相比,IC/TC-RT-PCR不仅灵敏度更高,而且不需提取总RNA,可以简化操作程序和减少苯酚、氯仿类有机试剂对人体的伤害和对环境的污染,适合于大量梨样品的病毒快速灵敏检测。 展开更多
关键词 砂梨 ACLSV ASGV IC—RT—PCR TC—RT—PCR
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李坏死环斑病毒检测方法的比较研究 被引量:3
16
作者 郭俊 陈精兰 +3 位作者 李凡 黄扬 尹朝先 陈海如 《西南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期91-94,共4页
针对感染李坏死环斑病毒(Prunus necrotic ringspot virus,PNRSV)植株病毒的特异性检测,将DAS- ELISA、RT-PCR方法综合改进、优化,建立了免疫捕获反转录PCR(IC-RT-PCR)检测PNRSV的方法.该方法采用PNRSV抗体特异性免疫捕获病毒,并根据Gen... 针对感染李坏死环斑病毒(Prunus necrotic ringspot virus,PNRSV)植株病毒的特异性检测,将DAS- ELISA、RT-PCR方法综合改进、优化,建立了免疫捕获反转录PCR(IC-RT-PCR)检测PNRSV的方法.该方法采用PNRSV抗体特异性免疫捕获病毒,并根据GenBank中PNRSV序列设计的特异性引物对PN5/PN3进行PCR扩增,得到约760 bp大小的特异性基因片段.扩增产物经克隆测序后,结果表明:产物序列与PNRSV的外壳蛋白编码基因存在94%~98%的同源性.检测广泛性以及灵敏度比较研究显示.IC-RT-PCR方法能从含量很低的受病样品中检出PNRSV,检测灵敏度与RT-PCR相近,但所检测样品的范围更广,适用于从植物各部位检测低含量的病毒.IC-RT-PCR检测灵敏度比DAS-ELISA方法高出1000倍. 展开更多
关键词 月季 李坏死环斑病毒 检测 RT—PCR IC—RT—PCR
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免疫斑点法和免疫捕获RT-PCR检测黄瓜绿斑驳花叶病毒 被引量:18
17
作者 尚海丽 周雪平 吴建祥 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期485-490,共6页
黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)是葫芦科作物上重要的病毒之一.用提纯的黄瓜绿斑驳花叶病毒免疫新西兰大白兔制备CGMMV的多克隆抗体.该多克隆抗体的间接ELISA效价达1∶512 000,与CGMMV17.5 ku外壳蛋白... 黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)是葫芦科作物上重要的病毒之一.用提纯的黄瓜绿斑驳花叶病毒免疫新西兰大白兔制备CGMMV的多克隆抗体.该多克隆抗体的间接ELISA效价达1∶512 000,与CGMMV17.5 ku外壳蛋白有特异性反应,而与烟草花叶病毒、齿兰环斑病毒和健康植物没有任何反应.用ACP-ELISA分析多抗灵敏度表明多抗检测1∶40 960倍稀释的CGMMV病叶时仍呈阳性反应.用该多抗建立了检测CGMMV的免疫斑点法(dot-ELISA)和免疫捕获RT-PCR方法(IC-RT-PCR).病叶汁液可被dot-ELISA检出的最大稀释度为1∶10 240.IC-RT-PCR从感染CGMMV的病叶组织中扩增到与预期大小相同的480 bp DNA条带,且当CGMMV病叶稀释1∶163 840倍时检测仍呈阳性.检测CGMMV的dot-ELISA和IC-RT-PCR方法的建立为该病毒病的诊断和控制提供了技术支撑. 展开更多
关键词 黄瓜绿斑驳花叶病毒 多克隆抗体 DOT-ELISA IC-RT-PCR
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水稻矮缩病毒昆明分离物抗血清制备及免疫捕捉PCR检测 被引量:6
18
作者 彭潞波 李婷婷 +7 位作者 魏春红 方琦 董家红 张丽珍 苏晓霞 丁铭 张仲凯 李毅 《中国病毒学》 CSCD 2006年第4期408-410,共3页
By Using the modified method to extract Rice dwarf virus virions from infected rice leaves,a concentration 3.854mg/mL of purified virus virions reached,and the Rabbits was immunized with purified virions,yielding high... By Using the modified method to extract Rice dwarf virus virions from infected rice leaves,a concentration 3.854mg/mL of purified virus virions reached,and the Rabbits was immunized with purified virions,yielding high titer antiserum;1:20480 by the indirect enzyme-linked immunosorbent assay(I-ELISA)test.The antiserum successfully detected three rice samples from Kunming,Yuxi and Luliang by I-ELISA.Immunocapture polymerase chain reaction(IC-PCR),respectively was the utilized to show that serologic and molecular methods were successfully used for detection of Rice dwarf virus. 展开更多
关键词 水稻矮缩病毒 抗血清 间接ELIZA 免疫捕捉PCR
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建兰花叶病毒的分子生物学检测 被引量:8
19
作者 高焕利 杨翠云 +1 位作者 于翠 马青 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期289-292,296,共5页
根据建兰花叶病毒外壳蛋白基因的保守序列设计2对引物,采用IC-RT-PCR方法和质粒梯度稀释的方法,研究建兰花叶病毒的分子检测方法和灵敏度。结果表明,从21个建兰花叶病毒的病株样品中均能扩增出与预期大小相同的DNA条带,序列测定和序列... 根据建兰花叶病毒外壳蛋白基因的保守序列设计2对引物,采用IC-RT-PCR方法和质粒梯度稀释的方法,研究建兰花叶病毒的分子检测方法和灵敏度。结果表明,从21个建兰花叶病毒的病株样品中均能扩增出与预期大小相同的DNA条带,序列测定和序列同源性分析表明所测定的序列均为CyMV外壳蛋白基因的部分序列,序列同源性均达到89%以上;灵敏度检测结果表明:可检测的最低病毒含量为2.72×10-7μg/mL。 展开更多
关键词 建兰花叶病毒(CyMV) 免疫捕获反转录聚合酶链式反应 灵敏度检测
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IC反应器处理啤酒废水的效能及其微生物群落动态分析 被引量:26
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作者 朱文秀 黄振兴 +1 位作者 任洪艳 阮文权 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第8期2715-2722,共8页
在35℃下连续运行内循环厌氧反应器(IC),通过不断提高进水容积负荷,研究不同运行负荷下反应器处理模拟啤酒废水的运行情况,并探讨微生物的种群结构与其活性变化之间的相互关系.IC反应器效能分析表明其最大进水容积负荷(以COD计)可达20 k... 在35℃下连续运行内循环厌氧反应器(IC),通过不断提高进水容积负荷,研究不同运行负荷下反应器处理模拟啤酒废水的运行情况,并探讨微生物的种群结构与其活性变化之间的相互关系.IC反应器效能分析表明其最大进水容积负荷(以COD计)可达20 kg.(m3.d)-1,COD去除率为85%以上,最大比产甲烷活性(以VSS计)可达210 mL.(g.d)-1;污泥脱氢酶活性与细菌DGGE图谱表明反应器中脱氢酶活性的变化趋势与细菌DGGE条带总光强度的变化趋势一致,DGGE图谱中细菌条带的总光密度值可作为厌氧体系中生物量的一个参考指标;辅酶F420与古细菌DGGE分析表明,污泥中辅酶F420含量与甲烷鬃菌属(Methanosaeta sp.)的相对丰度有一定的相互联系,在低负荷条件下甲烷八叠球菌属(Methanosarcina mazei)优势地位比较显著,随着负荷的提高,甲烷鬃菌属(Methanosaeta sp.)优势地位逐渐显著,且辅酶F420含量随之升高,当最大负荷为20kg.(m3.d)-1时,辅酶F420的含量(以VSS计)达到0.16μmol.g-1,而此时甲烷鬃菌属(Methanosaeta sp.)占据尤为明显的优势地位;聚类分析(UPGAMA)和Shannon指数也表明在不同反应负荷下,微生物的群落结构变化明显. 展开更多
关键词 IC反应器 Shannon指数 PCR-DGGE 脱氢酶 辅酶F420
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