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基于线粒体Cyt-b序列的太湖湖鲚与短颌鲚种群遗传分析 被引量：9
1
作者 轩中亚 姜涛 +2 位作者 刘洪波 陈修报 杨健 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2020年第4期33-40,共8页
为了解太湖的湖鲚(Coilia nasus taihuensis)与短颌鲚(Coilia brachygnathus)的遗传多样性及遗传分化情况,利用线粒体细胞色素b(Cyt-b)基因,开展了种群遗传学研究。结果显示,47条序列共有变异位点26个,其中,简约信息位点12个,共得到22... 为了解太湖的湖鲚(Coilia nasus taihuensis)与短颌鲚(Coilia brachygnathus)的遗传多样性及遗传分化情况,利用线粒体细胞色素b(Cyt-b)基因,开展了种群遗传学研究。结果显示,47条序列共有变异位点26个,其中,简约信息位点12个,共得到22个单倍型。两物种间Fst值达0.703,分化程度较高,种群间的基因流仅为0.212。湖鲚种群内平均Kimura双参数遗传距离为0.002,短颌鲚种群内为0.001,而湖鲚与短颌鲚种间平均Kimura双参数遗传距离为0.005,湖鲚与短颌鲚种间遗传距离高于湖鲚种群内部遗传距离,也高于短颌鲚种群内部遗传距离。系统发育树和单倍型网络图结果显示,湖鲚与短颌鲚分成2个大的类群,但有1个湖鲚个体与短颌鲚具有共有单倍型。总体结果显示,湖鲚与短颌鲚之间存在明显的遗传分化,Cyt-b序列可用于区分湖鲚与短颌鲚个体。 展开更多
关键词 湖鲚 短颌鲚 cyt-b 遗传分化
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基于Cyt-B基因鉴定肉制品中鸭源性成分的研究 被引量：3
2
作者 刘玟妍 陈思秀 +4 位作者 王天添 段思琪 艾金霞 王艳双 孙丽媛 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2019年第24期173-179,共7页
基于Cyt-B基因设计特异性引物,建立高效快速检测肉制品中鸭源性成分的方法。选取Cyt-B基因作为检测靶标,应用生物信息学技术设计各物种特异性引物,建立聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)体系检测肉制品中鸭源性成分,并将... 基于Cyt-B基因设计特异性引物,建立高效快速检测肉制品中鸭源性成分的方法。选取Cyt-B基因作为检测靶标,应用生物信息学技术设计各物种特异性引物,建立聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)体系检测肉制品中鸭源性成分,并将鸭特异性基因片段进行克隆和测序分析。该检测体系可以对鸭肉含量为1pg的肉制品实现稳定检测,灵敏度髙,特异性好。测序分析结果显示克隆的特异性基因序列与Genbank中相同物种(序列ID:EU755253.1)的核苷酸同源性达100%。该文建立的基于Cyt-B基因的PCR检测方法,可实现对肉制品中鸭源性成分高效快速的检测,既为肉类产品DNA鉴定试剂盒的研发提供试验基础,也有望对肉制品的市场监管和相关执法提供有力的技术保障。 展开更多
关键词 cyt-b基因 鸭源性成分 聚合酶链式反应 克隆 生物信息学
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基于形态学和DNA条形码的青藏高原东缘鼢鼠物种鉴定
3
作者 蔡振媛 孔虹颖 +8 位作者 何振邦 宋鹏飞 郭凡 李斌 梁程博 胡天石 徐波 林中原 张同作 《兽类学报》 北大核心 2026年第1期116-128,共13页
物种分类和鉴定是生物学研究的基石,综合分子生物学和经典分类学方法进行物种鉴定可提高结果可靠性。本研究采用传统形态学和线粒体细胞色素b基因(Cyt b)序列对青藏高原东缘青海省海东市平安区采集的74个鼢鼠样本进行物种鉴定。头骨形... 物种分类和鉴定是生物学研究的基石,综合分子生物学和经典分类学方法进行物种鉴定可提高结果可靠性。本研究采用传统形态学和线粒体细胞色素b基因(Cyt b)序列对青藏高原东缘青海省海东市平安区采集的74个鼢鼠样本进行物种鉴定。头骨形态鉴定结果显示,尾巴被稀疏短白毛的鼢鼠个体(Pac)为甘肃鼢鼠(Eospalax cansus),而尾巴被密毛的个体(Pab)为高原鼢鼠(Eospalax baileyi)。74个鼢鼠样本的Cyt b序列共定义了25个单倍型,结合GenBank中8种鼢鼠的Cyt b序列进行分析,在构建的系统发育树中,已知8种鼢鼠序列各自聚为1个单系群,平安区Pab的16个单倍型与已知高原鼢鼠聚为一支,Pac的8个单倍型与已知甘肃鼢鼠聚为一支。遗传距离结果显示,Pac与已知甘肃鼢鼠遗传距离小于与其他物种的遗传距离(P<0.001),Pab与已知高原鼢鼠的遗传距离小于与其他物种的遗传距离(P<0.001)。Cyt b基因分析和形态鉴定结果一致,Cyt b是鼢鼠鉴定的一个有效的DNA条形码基因。综合形态学和DNA条形码鉴定结果,平安区分布着2种鼢鼠:甘肃鼢鼠和高原鼢鼠。在地理分布上,甘肃鼢鼠主要分布在平安区北部邻近黄土高原海拔相对较低的区域,高原鼢鼠则分布在南部邻近青藏高原海拔相对较高的区域。本研究加深了对平安区鼢鼠物种组成和分布特征的了解,并为解决鼢鼠物种形态鉴定难的问题提供了DNA条形码解决方案。 展开更多
关键词 DNA条形码技术 鼢鼠 Cyt b 形态 系统发育 遗传距离
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雅砻江中游干支流软刺裸裂尻鱼群体遗传结构分析
4
作者 王继安 曾如奎 +6 位作者 汪鄂洲 董微微 李娟 朱滨 阙延福 乔晔 邵科 《水生态学杂志》 北大核心 2026年第1期205-213,共9页
分析雅砻江中游软刺裸裂尻鱼(Schizopygopsis malacanthus)不同地理群体的遗传结构,为其野生资源保护提供理论依据,并为雅砻江中游过鱼设施和增殖放流效果评估提供本底数据。2023年在两河口坝上曲入河和坝下干支流共采集187尾5个软刺裸... 分析雅砻江中游软刺裸裂尻鱼(Schizopygopsis malacanthus)不同地理群体的遗传结构,为其野生资源保护提供理论依据,并为雅砻江中游过鱼设施和增殖放流效果评估提供本底数据。2023年在两河口坝上曲入河和坝下干支流共采集187尾5个软刺裸裂尻鱼野生群体遗传材料,并测定了其线粒体Cyt b序列,分析了其遗传多样性、遗传结构和种群历史动态。结果表明,187尾软刺裸裂尻鱼样本中共检测到多态位点103个,定义了30个单倍型。5个群体单倍型多样性范围(0.669±0.032)~(0.938±0.024),核苷酸多样性范围(0.022 69±0.004 65)~(0.004 37±0.000 34),表明雅砻江中游软刺裸裂尻鱼总体遗传多样性较高。群体间总的遗传分化指数Fst为0.764 20(P<0.01),除支流卧龙寺沟群体与城南大桥群体间存在频繁的基因交流外,其余群体间遗传分化显著。分子方差分析(AMOVA)显示,软刺裸裂尻鱼76.42%的分子遗传变异来源于群体间,23.58%的变异来源于群体内。分子系统进化关系分析表明,5个软刺裸裂尻鱼群体存在2个明显的单倍型谱系分支,其中霍曲河群体为单独一支,与其余4个群体亲缘关系较远。中性检验结果显示,软刺裸裂尻鱼在近期历史上群体大小保持稳定,未经历显著的种群扩张事件。 展开更多
关键词 软刺裸裂尻鱼 遗传多样性 遗传结构 细胞色素B 雅砻江中游
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基于Cyt b基因解析禁渔初期长江中游鲢群体遗传多样性特征
5
作者 陈会娟 黄宇帆 +5 位作者 傅延波 袁亮亮 张清欢 汪登强 袁希平 段辛斌 《水生态学杂志》 北大核心 2026年第1期181-189,共9页
分析长江中游干流及附属湖泊鲢(Hypophthalmichthys molitrix)自然群体的遗传多样性特征,为评估禁渔初期的遗传保护效果提供科学依据。基于线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列,对2024年采自长江中游的5个地理群体共157尾鲢(枝江23尾,洞庭... 分析长江中游干流及附属湖泊鲢(Hypophthalmichthys molitrix)自然群体的遗传多样性特征,为评估禁渔初期的遗传保护效果提供科学依据。基于线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列,对2024年采自长江中游的5个地理群体共157尾鲢(枝江23尾,洞庭湖36尾,白螺36尾,武穴25尾,鄱阳湖37尾)进行遗传特征解析。结果表明,5个群体单倍型多样性(Hd)为0.657~0.830,核苷酸多样性(Pi)为0.00318~0.01454,Hd和Pi平均值分别为0.723和0.00892;AMOVA分析显示5个鲢群体有97.06%的变异来自群体内部,仅有2.94%来自群体间,总体的遗传分化指数(FST)为0.02940(P<0.05)。成对遗传分化指数和基因流(Nm)分析显示白螺群体和鄱阳湖群体出现遗传分化现象(FST=0.12486,P<0.05,Nm=1.73),其余群体间均无遗传分化现象(FST<0.05,P>0.05,Nm>4)。基于单倍型构建的Maximum likelihood系统发育树和Network网络结构图均显示定义的16个单倍型可分为2支,2个分支间出现遗传分化现象(FST=0.90021,P<0.05,Nm=0.04)。 展开更多
关键词 鲢 十年禁渔期 Cyt b基因 遗传多样性 长江中游
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分布于贵州的一种小麝鼩分类地位的厘定 被引量：1
6
作者 刘铸 张璐 +5 位作者 郭秋颖 张智慧 蒋纹静 田新民 金志民 张隽晟 《兽类学报》 北大核心 2025年第4期537-547,共11页
2018—2023年,在贵州省毕节市七星关区野角乡和六盘水市杨梅乡慕尼克村采集麝鼩属待鉴定标本(Croc⁃idura sp.)25号。基于线粒体细胞色素b基因构建的系统进化树显示待鉴定标本以100%的置信度聚为一个进化支。待鉴定标本在系统进化树上与... 2018—2023年,在贵州省毕节市七星关区野角乡和六盘水市杨梅乡慕尼克村采集麝鼩属待鉴定标本(Croc⁃idura sp.)25号。基于线粒体细胞色素b基因构建的系统进化树显示待鉴定标本以100%的置信度聚为一个进化支。待鉴定标本在系统进化树上与五指山小麝鼩(广西)(C.wuchihensis GX)表现出最近的系统进化关系,且以90%的置信度分为明显的2个进化支。待鉴定标本与麝鼩属其他物种的遗传距离范围是0.0702~0.1817,其中与五指山小麝鼩(广西)的遗传距离最小(0.0702),但明显大于灰麝鼩(C.attenuata)与安徽麝鼩(C.anhuiensis)的遗传距离(0.0365)、华南中麝鼩(C.rapax)与安徽麝鼩的遗传距离(0.0376)、台湾长尾麝鼩(C.kurodai)与大麝鼩(C.lasiura)的遗传距离(0.0410)及华南中麝鼩与灰麝鼩的遗传距离(0.0490)。待鉴定标本与我国南方已知可能分布的其他麝鼩属小型物种[山东小麝鼩C.shantungensis、印支小麝鼩C.indochinensis、东阳江麝鼩C.dong⁃yangjiangensis、五指山小麝鼩(海南)C.wuchihensis HN和五指山小麝鼩(广西)C.wuchihensis GX]存在一定形态差异。待鉴定标本与已报道的C.ilensis phaeopus形态较为一致。鉴于形态学上有明显区分特征,且分子生物学鉴定结果支持待鉴定标本为物种分类阶元,因此,待鉴定标本之前可能是一个隐存种——暗黑小麝鼩(C.phaeopus)。其区分特征:体型较小(头体长48.1~63.6 mm),尾较长(尾长31.5~46.9 mm);颅骨较小(颅全长15.68~16.91 mm,颅基长14.78~15.84 mm,腭长6.43~7.34 mm,上齿列长6.21~6.70 mm,下齿列长6.04~6.69 mm);背部呈深黑褐色,腹部呈黑灰色;前、后足背面均呈黑褐色。 展开更多
关键词 麝鼩属 Cyt b基因 形态学 暗黑小麝鼩 隐存种
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马口鱼不同水系地理种群的遗传多样性分析
7
作者 何美峰 薛凌展 +2 位作者 吴斌 樊海平 崔利峰 《渔业研究》 2025年第2期212-222,共11页
【目的】进一步了解马口鱼的种质资源现状,为其种质资源的保护和养殖群体的遗传多样性的保持提供科学依据。【方法】本研究利用PCR扩增获得5个马口鱼群体(牡丹江、建溪、富屯溪、汀江和南渡江)共计136尾个体的线粒体Cyt b基因和D-loop... 【目的】进一步了解马口鱼的种质资源现状,为其种质资源的保护和养殖群体的遗传多样性的保持提供科学依据。【方法】本研究利用PCR扩增获得5个马口鱼群体(牡丹江、建溪、富屯溪、汀江和南渡江)共计136尾个体的线粒体Cyt b基因和D-loop区序列部分片段,分析了群体间的遗传分化和遗传多样性。【结果】基于Cyt b基因和D-loop区序列定义的单倍型分别为35和37,整体单倍型多样性指数和核苷酸多样性分别为0.922和0.05426、0.875和0.02824,2个标记均显示汀江群体遗传多样性相对较高,牡丹江群体相对较低。基于Cyt b基因和D-loop区序列计算的马口鱼群体间的遗传距离分别为0.00304~0.10311、0.00089~0.05153。马口鱼群体间的遗传变异[96.00%(Cyt b)、62.23%(D-loop)]远高于群体内[4.00%(Cyt b)、33.77%(D-loop)],群体间遗传分化均达到显著水平(P<0.05)。基于Cyt b基因单倍型系统进化树显示,5个马口鱼群体可以分为3支,闽江建溪、闽江富屯溪、汀江群体与九龙江群体聚为一支,牡丹江群体与阿穆尔河、图们江和辽河群体聚为一支,南渡江群体与海南群体聚为一支,形成明显的地理谱系格局。牡丹江、闽江(建溪和富屯溪)和汀江群体在历史上均未发生扩张事件,而南渡江群体在历史上可能发生过扩张事件。【结论】南渡江和汀江群体遗传多样性较丰富,牡丹江、闽江相对较贫乏,应加大对牡丹江和闽江马口鱼的保护力度。 展开更多
关键词 马口鱼 Cyt b基因 D-LOOP区 遗传多样性
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线粒体Cyt b基因对九种穿山甲鉴别力的分析
8
作者 韩松霖 马跃 +4 位作者 李波 刘微 穆佳童 徐艳春 杨淑慧 《野生动物学报》 北大核心 2025年第1期50-62,共13页
为优化穿山甲的分子鉴定方法,采用9种穿山甲54条Cyt b基因完整序列,评估了MEGA11软件中的7种模型和23种碱基替换类型所估算的遗传距离的物种分辨率、Cyt b基因全序列及各区域鉴别力。结果表明:K2P模型和p-distance模型基于颠换(T_(V))... 为优化穿山甲的分子鉴定方法,采用9种穿山甲54条Cyt b基因完整序列,评估了MEGA11软件中的7种模型和23种碱基替换类型所估算的遗传距离的物种分辨率、Cyt b基因全序列及各区域鉴别力。结果表明:K2P模型和p-distance模型基于颠换(T_(V))计算的遗传距离具有最优的物种分辨率;Cyt b基因全序列有较好的物种鉴别能力,其中,第301~400号和第851~950号的2个碱基序位片段组合时具有最高的物种分辨率,是鉴别9种穿山甲的最佳理论区段。现有的方法中推荐使用Kocher等的引物。今后在研发中采用多重PCR结合高通量测序对多片段组合进行分析,将会提高穿山甲的鉴别力。 展开更多
关键词 穿山甲 细胞色素b基因(Cyt b) 遗传距离 物种鉴定
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大规模人工增殖放流对青海湖裸鲤种群多样性的影响
9
作者 陈生学 刘思嘉 +7 位作者 田菲 祁洪芳 俞录贤 柴长凯 汪洋 江华敏 李晓环 赵凯 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第3期102-110,共9页
分析大规模人工增殖放流对青海湖裸鲤种群的影响,为今后实施更加有效的保护措施提供科学依据。对2020—2022年间青海湖裸鲤增殖放流的幼鱼群体(FL)、野生群体(SS)、保种群体(BZ)3个群体以及增殖放流前的历史群体(LS)进行形态学测量、文... 分析大规模人工增殖放流对青海湖裸鲤种群的影响,为今后实施更加有效的保护措施提供科学依据。对2020—2022年间青海湖裸鲤增殖放流的幼鱼群体(FL)、野生群体(SS)、保种群体(BZ)3个群体以及增殖放流前的历史群体(LS)进行形态学测量、文献调研及线粒体基因测序,对形态特征、遗传多样性及种群结构进行比较分析。结果显示,形态特征上,青海湖裸鲤第一鳃弓外鳃耙数和体长体高比等形态特征SS与LS群体之间无显著差异(P>0.05);对3461个样本的细胞色素b基因(Cyt b)测序后共获得20个变异位点和23个单倍型,比较分析单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数在SS、FL、BZ与LS之间无显著差异(P>0.05);单倍型网络分析显示SS、FL、BZ与LS的遗传结构一致。研究结果表明,科学合理的人工增殖放流措施并没有影响青海湖裸鲤种群原有的遗传多样性和种群结构。 展开更多
关键词 青海湖裸鲤 遗传多样性 大规模人工增殖放流 线粒体细胞色素B 形态特征
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基于线粒体cyt b基因的华南沿海地区5个大刺鳅地理种群的群体遗传多样性研究
10
作者 陈锭娴 林胜跃 +7 位作者 王凯丰 刘兰苑 叶树政 蓝昭军 韩崇 龚剑 桂林 李强 《四川动物》 北大核心 2025年第5期505-514,共10页
为探究华南沿海地区5个大刺鳅Mastacembelus armatus种群的群体遗传多样性和遗传结构,测定分析了155个样本的线粒体cyt b基因。结果显示,cyt b基因序列长1138 bp,包含48个变异位点和28个单倍型,单倍型多样性为0.77200,核苷酸多样性为0.0... 为探究华南沿海地区5个大刺鳅Mastacembelus armatus种群的群体遗传多样性和遗传结构,测定分析了155个样本的线粒体cyt b基因。结果显示,cyt b基因序列长1138 bp,包含48个变异位点和28个单倍型,单倍型多样性为0.77200,核苷酸多样性为0.00590。AMOVA分析显示,其遗传变异主要来源于群体内(62.85%)。系统发育分析显示,所有群体聚成2支:支系Ⅰ包括南流江和红河水系的全部样本,以及郁江、南渡江和鉴江的部分样本;支系Ⅱ则主要由南渡江、郁江和鉴江的另一部分样本组成。由单倍型网络关系图可知,南渡江、郁江、南流江和鉴江种群共享单倍型H5的个体数量最多,推测H5可能是该地区最古老的单倍型,其他单倍型可能由其逐步进化而来。种群核苷酸错配分析和中性检验结果表明,除红河和南流江种群外,其他种群近期未发生过种群扩张事件。本研究结果为华南沿海地区大刺鳅种质资源的保护和合理开发利用提供了参考资料。 展开更多
关键词 大刺鳅 cyt b基因 遗传多样性 遗传结构
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红喉歌鸲黑龙江种群遗传多样性和遗传结构分析
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作者 姜川 朱文文 李波 《野生动物学报》 北大核心 2025年第1期153-162,共10页
为揭示红喉歌鸲(Calliope calliope)黑龙江种群的遗传多样性和遗传结构,测定了85只个体细胞色素b基因序列,结合下载的135条同源序列进行综合分析。结果显示:黑龙江种群包含50个细胞色素b基因单倍型(1143 bp),其中42个为独特的新单倍型,... 为揭示红喉歌鸲(Calliope calliope)黑龙江种群的遗传多样性和遗传结构,测定了85只个体细胞色素b基因序列,结合下载的135条同源序列进行综合分析。结果显示:黑龙江种群包含50个细胞色素b基因单倍型(1143 bp),其中42个为独特的新单倍型,8个为共享单倍型。黑龙江种群具有较高的单倍型多样性(h=0.9340±0.0210),但核苷酸多样性较低(π=0.0030±0.0003),且二者均低于西伯利亚、远东岛屿及沿海种群。对此可能的解释是该种群过去经历了瓶颈事件,并可能受过去捕猎活动以及生境破坏的影响。系统发育分析表明,黑龙江种群没有其他支系单倍型的渗入,属于指名亚种。历史动态分析结果表明,黑龙江种群在更新世晚期、末次盛冰期前经历了扩张。本研究揭示了红喉歌鸲黑龙江种群的遗传状况,可为制定合理的物种保护措施提供科学依据。 展开更多
关键词 红喉歌鸲 细胞色素B基因 遗传多样性 遗传结构 种群扩张
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基于Cyt b基因序列的黄斑蓝子鱼群体遗传多样性分析
12
作者 郑鹏 李文俊 +7 位作者 陈锭娴 黄小林 王凯丰 刘兰苑 韩崇 李强 杨育凯 黄忠 《南方水产科学》 北大核心 2025年第4期109-118,共10页
黄斑蓝子鱼(Siganus oramin)养殖群体已出现经济性状衰退和遗传多样性下降问题。为保护野生种质资源,对采自中国东南沿海7个地理群体(湛江北部湾BB、海南文昌WC、阳江沙扒湾SB、深圳大鹏湾DP、深圳大亚湾DY、漳州东山湾DS和宁德三沙湾SS... 黄斑蓝子鱼(Siganus oramin)养殖群体已出现经济性状衰退和遗传多样性下降问题。为保护野生种质资源,对采自中国东南沿海7个地理群体(湛江北部湾BB、海南文昌WC、阳江沙扒湾SB、深圳大鹏湾DP、深圳大亚湾DY、漳州东山湾DS和宁德三沙湾SS)的197尾样本进行线粒体Cyt b基因测序分析,旨在评估野生群体的遗传多样性状况。结果显示,黄斑蓝子鱼的线粒体Cyt b基因全序列长度为1141 bp,包含140个变异位点,81个单倍型,表现出高单倍型多样性(Hd=0.921±0.014)和低核苷酸多样性(Pi=0.0064±0.0010)的特点。遗传距离和遗传分化结果均显示黄斑蓝子鱼群体间未发生明显分化,各地理群体亲缘关系较近。基于Cyt b基因序列构建的NJ树显示,81个单倍型散落分布在一个支系,各群体均未形成明显单系群。单倍型网络分析结果亦表明不同地理区的黄斑蓝子鱼群体间未发生明显分化。AMOVA分析表明,黄斑蓝子鱼遗传分化主要来自群体内部(99.83%)。中性检验结果显示,Fu's Fs值为显著的负值(−24.605,p<0.05);贝叶斯天际线图表明黄斑蓝子鱼短时间内经历了瓶颈效应以及种群扩张事件,推测其扩张时间约为1.577万年前。 展开更多
关键词 线粒体Cyt b基因 黄斑蓝子鱼 遗传多样性 种群扩张
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基于Cyt b基因的广西主要河流斑鳠遗传多样性分析
13
作者 朱威霖 何泽霖 +5 位作者 吴铁军 韦友传 张棋麟 覃飞 罗帮 陈晓汉 《西南农业学报》 北大核心 2025年第12期2692-2699,共8页
【目的】基于Cyt b基因分析广西主要河流斑鳠的遗传多样性,为斑鳠种质资源的保护策略制定与可持续利用提供科学依据。【方法】以Cyt b基因为分子标记,对广西贵港(GG)、百色(BS)、大化(DH)和柳州(LZ)4个地理群体共120尾斑鳠个体进行遗传... 【目的】基于Cyt b基因分析广西主要河流斑鳠的遗传多样性,为斑鳠种质资源的保护策略制定与可持续利用提供科学依据。【方法】以Cyt b基因为分子标记,对广西贵港(GG)、百色(BS)、大化(DH)和柳州(LZ)4个地理群体共120尾斑鳠个体进行遗传多样性及遗传结构分析。【结果】斑鳠Cyt b基因序列长度为1141 bp,碱基组成具有明显的偏倚性,A、T、G、C含量分别为29.74%、30.78%、13.65%、25.83%,AT含量(60.52%)大于CG含量(39.48%)。4个斑鳠群体共检测出100个多态性位点,划分至68个单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.722~0.977,核苷酸多样性(Pi)为0.00116~0.00281,具体表现为LZ>BS>GG>DH,总体呈高单倍型多样性和低核苷酸多样性特征,说明广西主要河流斑鳠群体总体遗传多样性偏低。各斑鳠群体间遗传距离为0.01640~0.02520,遗传分化系数(Fst)为0.00430~0.08555,DH群体与GG群体的遗传距离最近(0.01640),亲缘关系较近;GG群体与LZ群体的遗传距离最远(0.02520),亲缘关系较远。分子方差分析结果表明,广西主要河流斑鳠遗传变异主要来源于群体内。斑鳠群体单倍型分布和系统发育树显示,4个斑鳠群体的共享单倍型Hap1为优势单倍型,未形成独特的地理分布。中性检验结果表明,4个斑鳠群体Tajima’s D和Fu’s Fs均为负值,且显著偏离中性(P<0.05),说明广西主要河流的斑鳠经历过种群扩张。【结论】广西主要河流斑鳠遗传多样性较低,建议将4个斑鳠地理群体归入同一管理单元实施就地保护,重点维护斑鳠栖息地连通性与种群自然交流,并加强栖息地保护力度。 展开更多
关键词 斑鳠 遗传多样性 Cyt b基因 广西主要河流
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似刺鳊[鱼句]群体线粒体cyt b基因遗传变异
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作者 肖俊 鲁翠云 +5 位作者 尤连祥 巫伟华 龙凡 那荣滨 郑先虎 丁立云 《水产学杂志》 2025年第6期1-6,共6页
为了解长江中下游湖泊似刺鳊[鱼句](Paracanthobrama guichenoti)群体的遗传变异,本研究分析了八里湖(BL)、军山湖(JL)和大官湖(DL)群体的线粒体细胞色素b(cytochrome b,cyt b)基因的单倍型分布及遗传特征。结果在90个样本的cyt b基因序... 为了解长江中下游湖泊似刺鳊[鱼句](Paracanthobrama guichenoti)群体的遗传变异,本研究分析了八里湖(BL)、军山湖(JL)和大官湖(DL)群体的线粒体细胞色素b(cytochrome b,cyt b)基因的单倍型分布及遗传特征。结果在90个样本的cyt b基因序列(1141 bp)中共检测到8个变异位点,定义了9种单倍型,其中Hap1、Hap6和Hap7为3个群体的共同单倍型,合计占比为64.4%;BL群体单倍型数量最多(7种),而JL群体的单倍型多样性(Hd=0.699±0.046)和核苷酸多样性(π=0.00086±0.00013)最高。AMOVA分析显示,群体间遗传变异占总变异的22.02%,八里湖群体(BL)与军山湖(JL)和大官湖(DL)群体间的遗传分化较大(Fst>0.15)。本研究结果可为似刺鳊[鱼句]种群的合理开发利用提供参考。 展开更多
关键词 似刺鳊[鱼句] 线粒体细胞色素B基因 单倍型分布 遗传变异
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检疫性有害生物枣咔实蝇的快速分子鉴定 被引量：3
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作者 陈光辉 李焱 +1 位作者 张小菊 胡红英 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2021年第1期46-54,共9页
枣咔实蝇Carpomya vesuviana Costa是枣树果实的一种重要检疫性害虫,其寄主枣树在我国种植广泛,该虫一旦传入和扩散,将对我国新疆红枣产业造成严重危害。本研究以枣咔实蝇蛹和成虫为对象,通过提取枣咔实蝇蛹和成虫样品的基因组DNA,借助... 枣咔实蝇Carpomya vesuviana Costa是枣树果实的一种重要检疫性害虫,其寄主枣树在我国种植广泛,该虫一旦传入和扩散,将对我国新疆红枣产业造成严重危害。本研究以枣咔实蝇蛹和成虫为对象,通过提取枣咔实蝇蛹和成虫样品的基因组DNA,借助生物信息学分析软件挖掘枣咔实蝇ITS2、16S rRNA、CYT-B-D、CYT-B-C、COI-5'、COI-3'、COII等分子鉴定靶点序列并设计扩增引物,以建立枣咔实蝇的快速分子鉴定技术。PCR扩增、测序和序列相似性结果显示,从枣咔实蝇蛹和成虫中获得的16条序列(含14条新序列),分析表明其中CYT-B、COI、COII可作为枣咔实蝇分子鉴定序列。该技术可应用于枣咔实蝇的识别鉴定、实时监测、早期防治等项工作。 展开更多
关键词 枣咔实蝇 DNA条形码 鉴定 ITS2 16S rRNA cyt-b-D cyt-b-C COI-5' COI-3' COII
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黄河水系马口鱼属一新种——济水马口鱼
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作者 赵黎明 许晓军 《四川动物》 北大核心 2025年第4期447-456,共10页
2023年5月,在黄河水系的大峪河(济源)和大汶河(济南)采集到马口鱼属Opsariichthys一新种,命名为济水马口鱼Opsariichthys jishuiensis sp.nov.。经比较,可根据一系列关键形态特征区别于同属其他物种:口裂侧缘平直、上颌正中无缺刻,上颌... 2023年5月,在黄河水系的大峪河(济源)和大汶河(济南)采集到马口鱼属Opsariichthys一新种,命名为济水马口鱼Opsariichthys jishuiensis sp.nov.。经比较,可根据一系列关键形态特征区别于同属其他物种:口裂侧缘平直、上颌正中无缺刻,上颌骨向后延伸不超过眼前缘垂直下方,胸鳍末端超过腹鳍起点,侧线鳞43~47枚,侧线下鳞3行。在马口鱼属中,新种济水马口鱼与长鳍马口鱼O.evolans和大鳞马口鱼O.macrolepis形态较为相似,但在以下特征仍存在明显区别:尾柄长占体长的10.1%~17.0%(长鳍马口鱼:17.8%~21.6%,大鳞马口鱼:16.9%~24.2%),下颌珠星2行(长鳍马口鱼1行),下咽齿3行(大鳞马口鱼2行)。基于线粒体cyt b基因构建的系统发育树显示,济水马口鱼为一个单系群,与同属其他物种的K2P遗传距离为0.079~0.118,达到物种分化水平。 展开更多
关键词 马口鱼属 新种 黄河 cyt b基因
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长江流域中华沙塘鳢与河川沙塘鳢基于线粒体Cyt b基因的种群遗传及形态分化研究
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作者 王雪 刘怡然 +5 位作者 任艳 谢德兵 周莉 李波 王守荣 朱思华 《水生生物学报》 北大核心 2025年第11期28-39,共12页
研究基于线粒体Cyt b基因,对中华沙塘鳢和河川沙塘鳢进行群体遗传学研究,并利用传统形态学参数与框架结构数据相结合的方法探究二者间的形态差异。遗传多样性分析结果表明,采自永州、咸宁及潜江共计3个地点128尾中华沙塘鳢共检测到21个... 研究基于线粒体Cyt b基因,对中华沙塘鳢和河川沙塘鳢进行群体遗传学研究,并利用传统形态学参数与框架结构数据相结合的方法探究二者间的形态差异。遗传多样性分析结果表明,采自永州、咸宁及潜江共计3个地点128尾中华沙塘鳢共检测到21个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.868和0.00407;采自湖州、宣城、南京及安庆共计4个地点195尾河川沙塘鳢共检测到28个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.910和0.02000。基于BI法和ML法构建的单倍型分子系统发育树结果显示,所有沙塘鳢属鱼类聚为1个单系,两物种也各自构成1个单系,且得到较强的支持。中华沙塘鳢识别出2个谱系,河川沙塘鳢识别出3个谱系,二者均呈现明显的地理格局分布。AMOVA结果显示中华沙塘鳢各地理群体间的遗传分化指数为0.463—0.845;河川沙塘鳢各地理群体间的遗传分化指数为0.653—0.930,种群间表现为高度的遗传分化,群体间均存在广泛的地理隔离。中性检验和错配分析表明,中华沙塘鳢咸宁(XN)种群经历过近期的扩张,时间为0.20 Ma,其余群体历史动态分析各方法的结果稍有差异,显示种群历史相对复杂。综合形态分析结果,中华沙塘鳢和河川沙塘鳢存在明显形态差异。主成分分析结果显示二者间仅少量个体有重叠,绝大部分个体能较好分开。判别分析获得综合判别准确率为95.7%,判别效果极显著(P<0.01),研究建立的判别公式可以进行两种鱼类的简单判别。通过主成分分析和判别分析识别出对种间差异最具贡献的8个形态特征变量,分别是眼后头长、第一背鳍长、第一背鳍基长、胸鳍长、BH、BI、CD、CG,大多与鳍条和躯干部的特征相关。本研究中,形态分化(Q_(ST))与遗传分化(F_(ST))之间没有显著相关性,但统计分析表明两种沙塘鳢属鱼类种间以及种群间的遗传分化程度显著大于其形态分化程度,表明表型在不同的群体中受到偏向的选择。 展开更多
关键词 形态分化 Cyt b 遗传多样性 主成分分析 判别分析 中华沙塘鳢 河川沙塘鳢
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陕西省黄鼠的遗传学特征分析 被引量：2
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作者 安翠红 陈宝宝 +3 位作者 范锁平 孙养信 吕文 鲁亮 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期538-541,共4页
目的明确分布于陕西省的黄鼠的遗传学特征。方法测定COI、Cyt-b基因序列,与内蒙古科右中旗、正镶白旗达乌尔黄鼠、宁夏海原县阿拉善黄鼠同类基因序列进行比对,分析遗传距离,构建系统发育NJ树。结果陕西省定边县黄鼠COI基因序列与宁夏阿... 目的明确分布于陕西省的黄鼠的遗传学特征。方法测定COI、Cyt-b基因序列,与内蒙古科右中旗、正镶白旗达乌尔黄鼠、宁夏海原县阿拉善黄鼠同类基因序列进行比对,分析遗传距离,构建系统发育NJ树。结果陕西省定边县黄鼠COI基因序列与宁夏阿拉善黄鼠的遗传距离≤0.5%,与内蒙达乌尔黄鼠遗传距离在7.9%~9.3%之间,Cyt-b基因序列与宁夏阿拉善黄鼠的遗传距离为≤2.2%,与内蒙达乌尔黄鼠遗传距离在8.9%~11.2%之间。基于COI和Cyt-b基因的NJ系统树可见所有样本序列形成两个高支持度的单一分支,陕西定边县黄鼠与宁夏阿拉善黄鼠聚为一类,两者与内蒙达乌尔黄鼠形成两个独立分支,基于COI基因的NJ系统树显示陕西各地样本聚为一类。结论陕西省的黄鼠应为阿拉善黄鼠。 展开更多
关键词 黄鼠 DNA条形码 COI基因 cyt-b基因 阿拉善黄鼠 陕西 达乌尔黄鼠
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全血培养胞质分裂阻断微核(CBMN)实验方法的改进 被引量：3
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作者 廖亚平 张鼎 +2 位作者 孙梓桉 孟芳梅 梁玉华 《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期395-399,共5页
目的改良全血培养胞质分裂阻断微核(cytokinesis-block micronucleus,CBMN)实验制片法及探讨细胞松弛素B(cytochalasin B,cyt-B)的最佳浓度。方法依据常规微核试验制片法,在低渗液的温度、固定液比例和操作手法等方面改进实验方法;设置... 目的改良全血培养胞质分裂阻断微核(cytokinesis-block micronucleus,CBMN)实验制片法及探讨细胞松弛素B(cytochalasin B,cyt-B)的最佳浓度。方法依据常规微核试验制片法,在低渗液的温度、固定液比例和操作手法等方面改进实验方法;设置不同浓度cyt-B组(4、5、6、7μg/mL),常规外周血淋巴培养至44 h加入cyt-B,继续培养至68 h或72 h,收获细胞。按人类微核计划(HUMN Project)中的识别标准识别双核、多核细胞和微核(micronuclei,MN),确定cyt-B最适浓度,并分析cyt—B对自发微核率的影响。结果改良法所获的双核淋巴细胞的胞膜完整,边界清晰,微核易于辨认。培养72 h后,cyt-B浓度≥5"g/mL时,双核细胞比例较4μg/mL组显著增加(P=0.001);cyt-B浓度≥6μg/mL时,三核以上细胞比例显著增加(P=0.01)。培养68 h后,cyt-B浓度为6μg/mL时,双核细胞比例较高(58.4%)。各浓度组淋巴细胞自发微核率的差异无统计学意义(P=0.32)。结论改良法选用cyt—B浓度为5μg/mL、培养72 h或cyt-B浓度为6μg/mL、培养68 h时收获的细胞,可获得大量双核细胞,且胞膜完整,染色清晰;cyt-B对淋巴细胞自发微核率无显著影响。 展开更多
关键词 胞质分裂阻断微核(CBMN)法 细胞松弛素(cyt-b) 全血培养法 微核(MN)
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美国红鱼细胞色素b基因和控制区基因序列的初步分析 被引量：3
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作者 李鹏飞 周永东 +1 位作者 徐汉祥 薛利建 《浙江海洋学院学报（自然科学版）》 CAS 2008年第2期119-122,共4页
采用PCR技术扩增了美国红鱼线粒体DNA的细胞色素b和控制区基因片段,PCR扩增产物直接测序,分别得到1140bp和623bp的核苷酸序列。将所得序列与从Genbank中查到的美国红鱼序列进行比较,分析了序列中碱基的组成及变异情况,为美国红鱼的合理... 采用PCR技术扩增了美国红鱼线粒体DNA的细胞色素b和控制区基因片段,PCR扩增产物直接测序,分别得到1140bp和623bp的核苷酸序列。将所得序列与从Genbank中查到的美国红鱼序列进行比较,分析了序列中碱基的组成及变异情况,为美国红鱼的合理开发利用及养殖发展规划的制定提供遗传学数据,为保护中国海域生物种质资源多样性提供科学依据。 展开更多
关键词 美国红鱼 线粒体DNA cyt-b基因 控制区基因
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