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CAPN3靶向的细胞周期调控因子鉴定及其在消化器官发育和功能中的作用研究
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作者 王明韫 丁锋 +1 位作者 苏保纯 彭金荣 《中国细胞生物学学报》 2026年第2期294-314,共21页
CAPN3是钙离子依赖的半胱氨酸蛋白酶calpain家族的成员。在斑马鱼中的研究发现,Capn3b(CAPN3同源蛋白)可被核仁蛋白Def招募至核仁以裂解p53、Chk1和Wee1等调控细胞周期的蛋白质,进而调控肝脏发育和再生,提示DEF-CAPN3/Def-Capn3b蛋白裂... CAPN3是钙离子依赖的半胱氨酸蛋白酶calpain家族的成员。在斑马鱼中的研究发现,Capn3b(CAPN3同源蛋白)可被核仁蛋白Def招募至核仁以裂解p53、Chk1和Wee1等调控细胞周期的蛋白质,进而调控肝脏发育和再生,提示DEF-CAPN3/Def-Capn3b蛋白裂解途径在细胞周期调控中发挥重要作用。但是,CAPN3是否靶向其他细胞周期调控因子却不得而知。该研究利用体外酶活实验系统检测了人CAPN3(hCAPN3)对29个人细胞周期素和13个细胞周期相关因子的裂解情况,最终鉴定出CCAR2、CCNL1、RBL1、RBL24个蛋白是hCAPN3的新底物。接着,该研究利用CRISPR-Cas9技术针对这4个蛋白的编码基因分别构建了斑马鱼同源基因的突变体。通过利用肝脏、胰腺和肠道特异性探针进行原位杂交分析发现,rbl1基因敲除显著延缓斑马鱼肝脏发育,rbl2基因敲除显示出对肠道发育的潜在影响。虽然rbl1突变体可活可育,但RNA-seq数据分析发现,成鱼肝细胞代谢活性相关基因表达显著上调,而昼夜节律和免疫应答等相关基因表达显著下调,说明rbl1突变体肝脏功能发生紊乱。该研究成果拓展了对DEF-CAPN3/Def-Capn3b复合物在细胞周期调控中的功能及作用机制的认识。 展开更多
关键词 capn3 DEF Rbl1 细胞周期 蛋白降解 肝脏发育
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早胜牛CAPN1基因多态性及表达差异分析
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作者 石福岳 王燕燕 +5 位作者 顾玲荣 王胜明 高博 张锋涛 高梓越 徐建峰 《饲料研究》 北大核心 2025年第24期91-96,共6页
试验旨在探究钙蛋白酶I(CAPN1)基因在早胜牛群体中的多态性及其对肉用性状的影响,评估其作为影响肉用性状候选功能基因的潜力。共采集320份早胜牛血样,通过直接测序法检测CAPN1基因的单核苷酸多态性(SNP)位点,分析其与肉质性状的关联性... 试验旨在探究钙蛋白酶I(CAPN1)基因在早胜牛群体中的多态性及其对肉用性状的影响,评估其作为影响肉用性状候选功能基因的潜力。共采集320份早胜牛血样,通过直接测序法检测CAPN1基因的单核苷酸多态性(SNP)位点,分析其与肉质性状的关联性;并利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术,检测该基因在不同组织及不同基因型个体中的mRNA表达水平。结果显示,在CAPN1基因中共鉴定出3个SNP位点,分别为A3854G、C5709G和G11058A。关联分析表明,C5709G位点与宰前活重、眼肌面积显著相关(P<0.05),G11058A位点与眼肌面积、剪切力显著相关(P<0.05)。CAPN1基因在腿肌、背最长肌、肝脏和心脏中均有表达,表达量从腿肌到心脏逐步升高;在G11058A位点,FF型个体的mRNA相对表达量显著高于EE型(P<0.05)。皮尔逊相关分析进一步显示,CAPN1基因表达量与剪切力、眼肌面积存在显著相关(P<0.05)。研究表明,早胜牛CAPN1基因的G11058A位点与部分肉用性状显著相关,可作为早胜牛肉用性状选育的潜在遗传标记。 展开更多
关键词 早胜牛 capn1基因 关联分析 表达差异
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美国白王鸽CAPN11基因的单核苷酸多态性及其对屠宰性状的影响
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作者 王维 龙霞 +3 位作者 张依裕 田应平 王小亚 蔡平 《贵州畜牧兽医》 2025年第4期17-20,共4页
为了探究钙蛋白酶11(CAPN11)基因的遗传变异对美国白王鸽屠宰性状的影响,选择美国白王鸽108只,利用PCR与直接测序相结合的方法对CAPN11基因的单核苷酸多态性(SNPs)进行检测,并分析SNPs与屠宰性状的关联性。结果:在美国白王鸽CAPN11基因... 为了探究钙蛋白酶11(CAPN11)基因的遗传变异对美国白王鸽屠宰性状的影响,选择美国白王鸽108只,利用PCR与直接测序相结合的方法对CAPN11基因的单核苷酸多态性(SNPs)进行检测,并分析SNPs与屠宰性状的关联性。结果:在美国白王鸽CAPN11基因中检测到3个SNPs位点,分别是第6外显子上的g.4766 C>T、g.4769 C>T、g.4871 C>T,其中g.4766 C>T位点属于低度多态,g.4769 C>T和g.4871 C>T位点属于中度多态,CAPN11基因的3个突变位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);g.4766 C>T位点发现CC型、CT型2种基因型,g.4769 C>T和g.4871 C>T位点发现CC型、CT型、TT型3种基因型;CAPN11基因的g.4766 C>T位点各基因型对屠宰性状无显著影响,g.4769 C>T位点的各基因型对活体重、放血重有显著影响,g.4871 C>T位点的各基因型对活体重、放血重、屠宰重、全净膛重、胸肌重、腿肌重有显著影响。结论:美国白王鸽CAPN11基因遗传变异影响屠宰性状,CAPN11基因可作为进一步选育的候选基因。 展开更多
关键词 美国白王鸽 capn11基因 单核苷酸多态性 屠宰性状
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中国西门塔尔牛CAPN1基因SNPs及其与经济性状关联分析 被引量:13
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作者 田璐 岳文斌 +4 位作者 李姣 袁峥嵘 高雪 李俊雅 许尚忠 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期785-789,共5页
本研究旨在分析CAPN1基因部分SNPs与中国西门塔尔牛经济性状的关联性。试验选取同龄、同场的135头中国西门塔尔牛为材料,利用PCR-RFLP方法检测CAPN1 316和CAPN1 4751 2个SNPs位点的多态性,并进行方差分析。结果发现,CAPN1 316SNP位点与... 本研究旨在分析CAPN1基因部分SNPs与中国西门塔尔牛经济性状的关联性。试验选取同龄、同场的135头中国西门塔尔牛为材料,利用PCR-RFLP方法检测CAPN1 316和CAPN1 4751 2个SNPs位点的多态性,并进行方差分析。结果发现,CAPN1 316SNP位点与大理石花纹显著相关(P<0.05),杂合子AB基因型个体的大理石纹评分显著高于AA和BB基因型个体(P<0.05);CAPN1 4751位点与大理石花纹和剪切力显著相关(P<0.05),大理石花纹性状中杂合子AB基因型个体评分显著高于AA基因型个体,剪切力性状中BB基因型个体显著高于AA基因型个体。结果表明,CAPN1 316和CAPN1 4751位点适合用于中国西门塔尔牛眼肌、肌肉大理石花纹的分子标记选择。 展开更多
关键词 中国西门塔尔牛 capn1基因 SNPS 经济性状 关联分析
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鸭骨骼肌早期发育过程中钙蛋白酶3(CAPN3)基因的表达及其与肌纤维性状的关联 被引量:8
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作者 朱文奇 徐文娟 +6 位作者 束婧婷 陈文峰 单艳菊 刘宏祥 胡艳 李慧芳 王金玉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期385-390,共6页
本研究选择生长速度不同的高邮鸭和金定鸭为试验材料,对不同品种鸭胚胎期和出雏早期肌肉中钙蛋白酶3(calpain3,CAPN3)基因的表达及其与肌纤维性状的关联性进行了研究。采用实时荧光定量PCR方法研究鸭13、17、21、25、27胚龄和出雏后7日... 本研究选择生长速度不同的高邮鸭和金定鸭为试验材料,对不同品种鸭胚胎期和出雏早期肌肉中钙蛋白酶3(calpain3,CAPN3)基因的表达及其与肌纤维性状的关联性进行了研究。采用实时荧光定量PCR方法研究鸭13、17、21、25、27胚龄和出雏后7日龄胸肌和腿肌中CAPN3基因表达的发育性变化。结果发现,CAPN3mRNA在2个品种鸭早期肌肉发育中具有相似的表达模式,并表现出显著的时间特异性,而品种和性别效应并不显著。在胸肌中,呈现先下降后上升的趋势,25胚龄前表达量均较低,21胚龄最低,出雏前(27胚龄)至7日龄表达量显著上升。在腿肌中,呈现"波浪形"表达模式,在21胚龄表达量最高。腿肌CAPN3基因表达与肌纤维类型、直径、面积和密度之间呈现不同程度的线性相关,部分指标在金定鸭中达到了显著水平。初步推测,CAPN3基因与肌纤维类型和肌纤维的生长发育密切相关。 展开更多
关键词 早期发育 肌纤维 基因表达 capn3
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钙蛋白酶3(CAPN3)基因多态性与牛胴体性状的关联分析 被引量:7
6
作者 侯冠彧 曾鸿普 +3 位作者 王东劲 管松 黄显洲 许尚忠 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期398-402,共5页
为了探讨钙蛋白酶3(Calpain3,CAPN3)基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,寻找与牛肉质性状相关的分子标记,对CAPN3基因的5′端区域进行SNPs检测,分析不同基因型在不同品种或者组合群体间的分布规律。利用测序和PCR-RFLP的方法进行S... 为了探讨钙蛋白酶3(Calpain3,CAPN3)基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,寻找与牛肉质性状相关的分子标记,对CAPN3基因的5′端区域进行SNPs检测,分析不同基因型在不同品种或者组合群体间的分布规律。利用测序和PCR-RFLP的方法进行SNPs检测和基因型分析,计算等位基因频率、各位点多态信息含量。结果发现,2546位处发生点突变C→T。各位点的3种基因型与牛生产性状的最小二乘分析结果表明,AB与BB基因型个体在胴体质量指标上存在显著差异(P<0.05)。初步推断CAPN3基因可能是影响牛肉质性状潜在的主效基因或与主效基因连锁,并且这个位点具有成为分子标记的潜在可能。 展开更多
关键词 capn3 PCR-RFLP 胴体性状 SNP
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钙蛋白酶Ⅰ(CAPN1)基因多态性与鸡肉嫩度和屠体性状的相关研究 被引量:26
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作者 张增荣 朱庆 +1 位作者 蒋小松 杜华锐 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期982-988,共7页
为了探讨CAPN1基因作为影响鸡肌肉嫩度候选基因的可能性,寻找与鸡嫩度性状相关的分子标记,对钙蛋白酶Ⅰ(CAPN1)基因的CDS区进行SNPs检测,分析不同基因型在5个优质肉鸡纯品系和3个配套系间分布规律。利用测序和单链构象多态(SSCP)的方法... 为了探讨CAPN1基因作为影响鸡肌肉嫩度候选基因的可能性,寻找与鸡嫩度性状相关的分子标记,对钙蛋白酶Ⅰ(CAPN1)基因的CDS区进行SNPs检测,分析不同基因型在5个优质肉鸡纯品系和3个配套系间分布规律。利用测序和单链构象多态(SSCP)的方法进行SNPs检测和基因型的分析,计算等位基因频率、各位点多态信息含量。结果发现2546位(位点A)处发生点突变由C→T和3535位(位点B)处发生点突变由G→A。各位点的3种基因型与肉鸡生产性状的最小二乘分析结果表明,各位点的各种基因型个体在肌纤维密度和部分屠体性状指标存在显著差异(P<0.05)。初步推断CAPN1基因可能是影响鸡嫩度性状潜在的主效基因或与主效基因连锁,并且这些位点具有成为分子标记的潜在可能。 展开更多
关键词 钙蛋白酶Ⅰ(capn1) SNPS 肌肉嫩度
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中国人CAPN10基因单核苷酸多态性的分布及其在北方汉族2型糖尿病人群中的关联分析 被引量:10
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作者 孙红霞 张奎星 +11 位作者 杜玮南 施锦绣 姜正文 左瑾 黄薇 陈竺 沈岩 姚志建 强伯勤 杭建梅 王姮 方福德 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期228-233,共6页
目的检测始发现于墨西哥裔美国人群中的2型糖尿病易感基因CAPN10的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)在中国人群中的分布,并探讨其与中国北方汉族人群2型糖尿病的关联关系。方法对27份取自中国不同民族人群DNA标本进行... 目的检测始发现于墨西哥裔美国人群中的2型糖尿病易感基因CAPN10的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)在中国人群中的分布,并探讨其与中国北方汉族人群2型糖尿病的关联关系。方法对27份取自中国不同民族人群DNA标本进行测序,以确定CAPN10基因中的SNP位点分布;选择其中5个位点,用单碱基延伸(single-baseextension,SBE)法对156例北方汉族正常人和173例2型糖尿病患者DNA标本进行SNP分型及病例-对照关联分析;对文献报道的易感基因CAPN10中的3个阳性位点进行单体型分析,并对其中1个位点在68个2型糖尿病家系(377例)中进行传递不平衡检验(transmission-disequilibriumtest,TDT)和同胞传递不平衡检验(sibtransmission-disequilibriumtest,STDT)。结果在所检测的8936bp长度范围内共检出40个SNP,平均约223bp出现1个SNP,各多态性在基因中呈不均匀分布;中国人CAPN10的SNP与文献报道的墨西哥裔美国人群中该基因多态性存在较大的差异;所选择的5个SNP位点等位基因频率分布在正常人群和2型糖尿病患者间的差异无统计学意义(P>0.05);上述3个阳性位点单体型频率在两组人群间差异无统计学意义(P>0.05);TDT和STDT均无统计学意义(P>0.05)。结论CAPN10基因SNP具有民族差异; 展开更多
关键词 中国人 capn10基因 单核苷酸多态性 北方汉族人 2型糖尿病
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CAPN1和CAST基因在牦牛不同组织中的表达差异研究 被引量:8
9
作者 姚慧 陈智华 +2 位作者 钟金城 曾贤彬 柴志欣 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2014年第3期139-141,149,共4页
为检测钙蛋白酶基因(CAPN1)和钙蛋白酶抑制基因(CAST)在牦牛心、肝、脾、肺、肾、胃、眼肌、腹肌等不同组织中的表达水平,采用实时荧光定量PCR技术分析这2个基因的表达规律。结果显示,CAPN1和CAST基因在牦牛的8种组织中均有表达,但在不... 为检测钙蛋白酶基因(CAPN1)和钙蛋白酶抑制基因(CAST)在牦牛心、肝、脾、肺、肾、胃、眼肌、腹肌等不同组织中的表达水平,采用实时荧光定量PCR技术分析这2个基因的表达规律。结果显示,CAPN1和CAST基因在牦牛的8种组织中均有表达,但在不同组织的表达量存在差异。CAPN1基因在眼肌中的表达量最高,其次为腹肌,在肌肉中的表达量显著高于内脏组织,内脏组织中,在肝脏的表达量最高,其次为肾脏,胃中的表达量最低;CAST基因在胃中的表达量最高,其次为眼肌、腹肌,在肾脏中的表达量最低。 展开更多
关键词 牦牛 capn1基因 CAST基因 实时荧光定量PCR 基因表达差异
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应用nested和touch down PCR技术分离牦牛CAPN1大亚基基因EST 被引量:6
10
作者 蔡欣 吴建平 +3 位作者 徐明旭 张利平 汪虹英 刘雅楠 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2005年第2期14-18,共5页
 钙激活中性蛋白酶1(CAPN1)基因是影响肉嫩度的侯选基因。根据GeneBank中已公布的CAPN1基因cDNA序列设计同源PCR引物,通过RT,nested和touch-downPCR技术从牦牛肌肉组织总RNA中分离目的序列,与pGEM-T-easy载体连接后转化DH5α感受态菌株...  钙激活中性蛋白酶1(CAPN1)基因是影响肉嫩度的侯选基因。根据GeneBank中已公布的CAPN1基因cDNA序列设计同源PCR引物,通过RT,nested和touch-downPCR技术从牦牛肌肉组织总RNA中分离目的序列,与pGEM-T-easy载体连接后转化DH5α感受态菌株,通过PCR扩增、限制性酶切和测序分析鉴定阳性克隆。分离到的基因片段为牦牛CAPN1大亚基的部分编码序列,在GeneBank中的注册号为AY197555,与奶牛、人、食蟹猴、小鼠、绵羊以及大鼠相应序列的同源性分别为98%,89%,89%,83%,96%和81%,在不同物种之间具有较强的保守性。CAPN1基因EST的分离为进一步研究牦牛CAPN1基因奠定了基础。此研究表明,在总RNA质量不理想的情况下,同时采用这2种技术可以较大限度地获取目的序列。 展开更多
关键词 nested和touch-down PCR EST分离 capn1大亚基基因 牦牛
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牛CAPN3基因多态性及与肉质性状相关性分析 被引量:4
11
作者 柳思源 徐靖博 +10 位作者 任久生 于汪洋 杨连玉 邓琼 姜昊 马腾壑 赵志辉 贾丽坤 贾丽伟 赵玉民 张嘉保 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1509-1512,共4页
以中国草原红牛、西门塔尔牛、利木赞牛、天一冈山黑牛为试验对象,利用PCR-SSCP结合测序的方法进行SNPs检测,并采用SPSS软件分析CAPN3基因的遗传多态性与肉质性状的关系。结果表明,仅在草原红牛及天一冈山黑牛中发现第46 414处(NC_0073... 以中国草原红牛、西门塔尔牛、利木赞牛、天一冈山黑牛为试验对象,利用PCR-SSCP结合测序的方法进行SNPs检测,并采用SPSS软件分析CAPN3基因的遗传多态性与肉质性状的关系。结果表明,仅在草原红牛及天一冈山黑牛中发现第46 414处(NC_007308)发生G→T的突变,且发生G→T突变的位点所对应不同基因型的个体,其大理石花纹、失水率、滴水损失和剪切力这些肉质性状存在显著差异,而西门塔尔牛和利木赞牛中未发现此突变。 展开更多
关键词 capn3 基因多态性 PCR-SSCP 肉质性状
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CAPN3基因在草原红牛不同组织中的表达差异 被引量:6
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作者 刘博洋 秦立红 +5 位作者 廉传江 田静 张金玉 姜昊 赵志辉 杨润军 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第10期105-109,共5页
钙激活中性蛋白酶(CAPN3)参与哺乳动物体内多种重要的生理生化过程,但是有关它的确切生理功能和作用机制研究较少。本研究采用实时荧光定量PCR技术检测CAPN3基因在草原红牛多种组织中的表达水平差异情况。试验结果表明,CAPN3基因在所检... 钙激活中性蛋白酶(CAPN3)参与哺乳动物体内多种重要的生理生化过程,但是有关它的确切生理功能和作用机制研究较少。本研究采用实时荧光定量PCR技术检测CAPN3基因在草原红牛多种组织中的表达水平差异情况。试验结果表明,CAPN3基因在所检测草原红牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、十二指肠、瘤胃和背最长肌8种组织中均有表达,且在不同组织中的表达水平有所不同。草原红牛脾脏中的CAPN3基因表达量显著高于其他组织,十二指肠和瘤胃中的CAPN3基因表达量显著高于心脏、肝脏、肺脏、肾脏和背最长肌。本试验为肉牛肉质性状的改良提供了分子遗传学依据,并为深入研究草原红牛体内CAPN3基因的生物学作用及作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 草原红牛 capn3 实时荧光定量PCR 表达水平
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野猪CAPN10基因两个剪接变异体的克隆、序列分析和表达 被引量:2
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作者 杨秀芹 关庆芝 +3 位作者 于浩 郭丽娟 刘慧 刘娣 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期1609-1614,共6页
为了进一步研究CAPN10在肌肉生长和肉质中的作用,本研究采用RT-PCR和RACE相结合的方法克隆野猪CAPN10 cDNA并进行序列分析,采用相对定量RT-PCR和竞争性RT-PCR方法研究该基因的表达情况。获得了野猪CAPN10的2个剪接变异体,二者前604个氨... 为了进一步研究CAPN10在肌肉生长和肉质中的作用,本研究采用RT-PCR和RACE相结合的方法克隆野猪CAPN10 cDNA并进行序列分析,采用相对定量RT-PCR和竞争性RT-PCR方法研究该基因的表达情况。获得了野猪CAPN10的2个剪接变异体,二者前604个氨基酸完全相同,在多肽链相同位置处都存在着钙蛋白酶家族的特征性结构域和催化活性中心;相对定量RT-PCR分析表明,CAPN10普遍表达于所检测的野猪12种组织内,在6、9、12月龄的肌肉组织中大白猪的表达量显著高于同一发育时期的野家杂交猪(P<0.05);竞争性RT-PCR分析表明,2个变异体都表达于所检测的野猪9种组织内。结果表明CAPN10的表达量与肌肉的嫩度可能具有一定的相关性。 展开更多
关键词 野猪 capn10 克隆 序列分析 表达
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延边黄牛CAPN3基因多态性与氨基酸含量关系研究 被引量:3
14
作者 金鑫 张立春 +4 位作者 任春宇 李赵志 曹阳 严昌国 金海国 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第7期3485-3487,共3页
[目的]对延边黄牛CAPN3基因多态性与氨基酸含量关系进行研究。[方法]应用PCR-SSCP检测了96头延边黄牛CAPN3基因多态性,并采用SPSS软件对各基因型的氨基酸含量进行差异显著性分析。[结果]CAPN3基因发生G55556A突变,差异显著性分析结果显... [目的]对延边黄牛CAPN3基因多态性与氨基酸含量关系进行研究。[方法]应用PCR-SSCP检测了96头延边黄牛CAPN3基因多态性,并采用SPSS软件对各基因型的氨基酸含量进行差异显著性分析。[结果]CAPN3基因发生G55556A突变,差异显著性分析结果显示,该位点不同基因型之间的脂肪酸和氨基酸含量存在差异,其中AA基因型油酸含量显著低于GG基因型(P<0.05)。不同基因型个体天冬氨酸、谷氨酸、丝氨酸、组氨酸、苏氨酸、精氨酸、丙氨酸、络氨酸、缬氨酸、苯丙氨酸、异亮氨酸、亮氨酸和脯氨酸含量上存在显著性差异,且均表现为AA基因型氨基酸含量显著高于GG基因型。[结论]CAPN3基因与延边黄牛氨基酸含量显著相关。 展开更多
关键词 延边黄牛 capn3 氨基酸 PCR-SSCP
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猪CAPN1基因部分外显子及3′UTR区的SNPs检测 被引量:2
15
作者 杨秀芹 刘慧 +3 位作者 郭丽娟 关庆芝 许尧 刘娣 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期741-746,共6页
以野猪、民猪和大白猪为研究对象,根据网上公布的序列设计了7对引物,采用测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP方法对CAPN1基因的部分外显子和3′UTR区进行了单核苷酸多态性检测和基因型分析,探讨CAPN1基因多态性与瘦肉率和嫩度的关系。研究发现11... 以野猪、民猪和大白猪为研究对象,根据网上公布的序列设计了7对引物,采用测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP方法对CAPN1基因的部分外显子和3′UTR区进行了单核苷酸多态性检测和基因型分析,探讨CAPN1基因多态性与瘦肉率和嫩度的关系。研究发现11个SNPs,其中5个位于外显子,4个位于内含子,2个位于3′UTR区,外显子中的突变有一处是错义突变,导致了蛋白质多肽链第260位氨基酸发生了M/V的替代。群体遗传学分析表明,在所检测的各多态位点上,野猪、民猪、大白猪3个品种间不同基因型的分布都存在着极显著的差异(P<0.01),而野猪和民猪之间各基因型的分布差异不显著(P>0.05),民猪和大白猪之间各基因型的分布存在着极显著的差异(P<0.01)。结合品种特性分析表明,P4、P6引物和3′UTR区HinfⅠ位点所检测的不同基因型和瘦肉率具有一定的相关性。 展开更多
关键词 capn1基因 瘦肉率 嫩度 PCR-SSCP PCR-RFLP
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草原红牛CAPN1基因mRNA表达特性分析 被引量:3
16
作者 秦立红 赵玉民 +5 位作者 吴健 李旭 刘基伟 胡成华 赵志辉 张国梁 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期1302-1304,共3页
为了进一步揭示CAPN1的功能,本研究采用实时荧光定量PCR技术对草原红牛初生牛与成年牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、瘤胃、十二指肠、背最长肌8种组织中的CAPN1mRNA表达水平进行了分析。结果表明:CAPN1基因在组织中普遍表达,但表达量... 为了进一步揭示CAPN1的功能,本研究采用实时荧光定量PCR技术对草原红牛初生牛与成年牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、瘤胃、十二指肠、背最长肌8种组织中的CAPN1mRNA表达水平进行了分析。结果表明:CAPN1基因在组织中普遍表达,但表达量存在差异。且成年牛的CAPN1基因在肺脏和瘤胃组织中的表达显著高于初生牛(P<0.05),成年牛在肝脏、脾脏、肾脏和背最长肌组织中CAPN1基因的表达水平极显著高于初生牛(P<0.01)。 展开更多
关键词 中国草原红牛 实时荧光定量PCR capn1基因
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皖东牛CAPN1、CAST基因多态性与肉质性状相关性 被引量:9
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作者 华金玲 郁冯艳 +1 位作者 郭亮 付佳伟 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期24-31,共8页
选用135头体重(493±33)kg,年龄相近皖东育肥牛,颈静脉采血,利用DNA直接测序法测定CAPN1、CAST基因多态性;试验结束屠宰试验育肥牛,取肉样分析皖东牛肉质性状,分析肉质性状与基因多态性相关性。结果表明,皖东牛CAPN1基因存在AA型和B... 选用135头体重(493±33)kg,年龄相近皖东育肥牛,颈静脉采血,利用DNA直接测序法测定CAPN1、CAST基因多态性;试验结束屠宰试验育肥牛,取肉样分析皖东牛肉质性状,分析肉质性状与基因多态性相关性。结果表明,皖东牛CAPN1基因存在AA型和BB型2种基因型,4个单核苷酸多态性位点(SNPs),其中内含子8的C429G和G437A位置各1个突变位点,内含子9的C572T位置1个突变位点,外显子9的G458C位置1个突变位点;CAPN1基因中度多态且极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。皖东牛CAST基因有CT基因型和CC基因型,5个SNPs位点,其中内含子8的A220G、A223G和G239A位置各1个突变位点,外显子9的C369T和G375A位置各1个突变位点;CAST基因中度多态并处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。BB基因型皖东牛肌肉剪切力肉质性状显著高于AA基因型(P<0.05),CT基因型皖东牛肌肉剪切力肉质性状显著高于CC基因型(P<0.05),基因型对其他肉质性状影响差异不显著(P>0.05)。CAPN1和CAST基因多态位点与肌肉嫩度密切相关,可作为皖东牛肉质性状提升候选基因。 展开更多
关键词 皖东牛 capn1基因 CAST基因 基因多态性 肉质性状
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野猪CAPN7基因的克隆、表达和变异分析 被引量:3
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作者 杨秀芹 郭丽娟 +1 位作者 马建章 刘娣 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期503-508,共6页
钙蛋白酶是细胞质中主要的蛋白水解酶,在肌肉生长、蛋白转化及嫩化过程中发挥复杂的作用。该研究利用RT-PCR、生物信息学方法克隆野猪(Sus scrofa ussuricus)CAPN7cDNA并进行序列分析,利用相对定量RT-PCR方法研究其组织表达情况和利用PC... 钙蛋白酶是细胞质中主要的蛋白水解酶,在肌肉生长、蛋白转化及嫩化过程中发挥复杂的作用。该研究利用RT-PCR、生物信息学方法克隆野猪(Sus scrofa ussuricus)CAPN7cDNA并进行序列分析,利用相对定量RT-PCR方法研究其组织表达情况和利用PCR-SSCP方法对其进行变异分析。结果表明,野猪CAPN7基因编码区全长2442bp,预期编码813个氨基酸残基,多肽链中存在着calpain家族的催化结构域和催化活性中心;野猪CAPN7不同程度地表达于所检测的12种组织中,在6、9月龄野家杂交猪肌肉组织中的相对表达量高于同一时期的大白猪肌肉组织;所检测到的3种基因型在野猪、民猪和杜洛克中的分布存在着极显著差异。该研究为进一步揭示calpain7的功能提供了分子生物学基础。 展开更多
关键词 野猪 capn7 克隆 序列分析 组织表达 钙蛋白酶
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早胜牛CAPN1基因多态性及与肉质性状的关联性分析 被引量:5
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作者 石福岳 王燕燕 +4 位作者 容维中 高博 徐建峰 董和 张艳丽 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第8期151-155,共5页
本研究旨在寻找与早胜牛肉质性状相关的分子标记位点,为下一步采用分子育种方法进行肉用型早胜牛选育提供理论依据。实验共采集早胜牛血液样本320份,采用直接测序法对早胜牛CAPN1基因外显子21至外显子22区域内的多态位点进行检测,使用Ha... 本研究旨在寻找与早胜牛肉质性状相关的分子标记位点,为下一步采用分子育种方法进行肉用型早胜牛选育提供理论依据。实验共采集早胜牛血液样本320份,采用直接测序法对早胜牛CAPN1基因外显子21至外显子22区域内的多态位点进行检测,使用Haploview 4.2软件分析其连锁不平衡性并构建单倍型,分析单倍型与肉质性状之间的相关性。结果表明,共检测到4个SNPs位点,其中C14899T和C15176A位于内含子21上,G15299A和G15682C位于外显子22上,且4个位点间存在较强的连锁不平衡性,存在6种单倍型组合。经关联性分析,单倍型与早胜牛肉品质性状剪切力、失水率、眼肌面积等显著相关。因此,位于CAPN1基因内含子21和外显子22上的4个SNPs位点与早胜牛肉质性状具有显著相关性,可作为肉用型早胜牛早期选留的候选分子标记。 展开更多
关键词 早胜牛 capn1基因 单倍型 关联分析
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鸡肉嫩度候选基因CAPN1多态性的检测研究 被引量:5
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作者 束婧婷 李慧芳 +5 位作者 张莹 陈宽维 苏一军 邝智祥 朱文奇 韩威 《家畜生态学报》 2010年第2期16-20,共5页
建立基于聚合酶链反应-连接酶检测反应的基因多态性并行检测系统,探讨鸡肉嫩度候选基因钙蛋白酶I(CAPN1)基因的多态性,并分析其在优良地方鸡种-清远麻鸡和快大型隐性白羽鸡中的分布差异。用PCR-LDR方法检测CAPN1 2546、CAPN1 3535和CAPN... 建立基于聚合酶链反应-连接酶检测反应的基因多态性并行检测系统,探讨鸡肉嫩度候选基因钙蛋白酶I(CAPN1)基因的多态性,并分析其在优良地方鸡种-清远麻鸡和快大型隐性白羽鸡中的分布差异。用PCR-LDR方法检测CAPN1 2546、CAPN1 3535和CAPN19950的基因型作单倍型分析,进行各组间基因型分布和等位基因频率x2检验。结果CAPN12546位点未检测到多态,其他两个位点的结果同直接测序分型结果一致,其基因型分布在不同品种中均存在差异,并且在CAPN1 3535位点上达到显著水平,两个位点的单倍型分布在不同品种间也存在较大差异。 展开更多
关键词 连接酶检测反应 capn1基因 基因多态性 肌肉嫩度
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