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菠菜冷胁迫和热胁迫下转录组学和代谢组学联合分析
被引量：
1
1
作者
宫瑞
张林琳
+3 位作者
崔彦玲
陈海丽
李然红
潜宗伟
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2024年第6期27-39,共13页
温度胁迫是影响菠菜品质和产量的主要非生物胁迫之一,研究菠菜对温度胁迫响应的分子机制对菠菜抗逆育种具有重要意义。为给菠菜抗冷胁迫、热胁迫机制研究提供理论基础,以菠菜耐冷胁迫自交系D3和耐热自交系M10为试验材料,对其在冷胁迫和...
温度胁迫是影响菠菜品质和产量的主要非生物胁迫之一,研究菠菜对温度胁迫响应的分子机制对菠菜抗逆育种具有重要意义。为给菠菜抗冷胁迫、热胁迫机制研究提供理论基础,以菠菜耐冷胁迫自交系D3和耐热自交系M10为试验材料,对其在冷胁迫和热胁迫下的转录组和代谢组进行了分析,以期探讨菠菜抗逆的转录和代谢机制。转录组学分析表明,在冷胁迫和热胁迫下,耐冷自交系D3和耐热自交系M10的差异基因富集最多的途径基本相同。代谢组学分析表明,冷胁迫下在基因与基因组数据库(KEGG)富集通路中共同富集在嘧啶代谢、赖氨酸降解通路中;热胁迫下在KEGG富集通路中共同富集在色氨酸代谢,甲苯降解,各种其他次生代谢物的生物合成,甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸的代谢通路中;转录组学和代谢组学联合分析结合基因注释,确定了SpADH(sov2g036390)、SpSHMT(sov1g001130)、SpALDH-1(sov4g007150)为菠菜耐冷胁迫的候选基因,SpALDH-1(sov4g007150)、SpALDH-2(sov1g043320)、SpNPC(sov1g040610)为菠菜耐热胁迫的候选基因,其中,SpALDH-1(sov4g007150)在冷胁迫和热胁迫下都显著表达,可能是菠菜抗逆的相关调控基因。
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关键词
菠菜
冷胁迫
热胁迫
转录组
代谢组
候选基因
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职称材料
芹菜黄色突变体的遗传及生长表现研究
被引量：
2
2
作者
王帅
沈火林
吴晓霞
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2010年第B12期119-122,共4页
为了研究芹菜黄化突变的遗传规律及黄化突变体与正常个体的生长表现差异,对黄化突变自交系CE188H与正常绿色自交系CE155杂交的F2分离群体进行了性状观察分析,经卡平方(χ2)分析证明黄化突变与正常绿色的分离比例符合1∶3的分离预期,该...
为了研究芹菜黄化突变的遗传规律及黄化突变体与正常个体的生长表现差异,对黄化突变自交系CE188H与正常绿色自交系CE155杂交的F2分离群体进行了性状观察分析,经卡平方(χ2)分析证明黄化突变与正常绿色的分离比例符合1∶3的分离预期,该黄色性状为质量性状,由1对隐性核基因控制,绿色性状对黄色性状为完全显性,且黄色性状的表现不受温度、光照等环境条件的影响。通过观察测定芹菜黄化突变自交系CE188H(yel yel)和正常绿色自交系CE188L(YEL YEL,与CE188H为近等基因系)的株高、展开度、叶柄长度、叶柄宽度、鲜质量、干质量,以及叶绿素、可溶性固形物和粗纤维含量,结果表明,该黄化突变体叶片中叶绿素含量仅为正常株的55.64%;黄化突变体CE188H在整个生长过程中叶片数量多于正常绿色自交系CE188L,平均为CE188L的1.18倍,但株高、展开度、叶柄长度、鲜质量、干质量显著低于正常绿色自交系,叶柄宽度、干物质含量、可溶性固形物含量无显著差异;黄化突变体CE188H的粗纤维含量是正常CE188L的1.23倍。黄色性状遗传稳定可作为苗期标记性状在芹菜杂种种子的生产和纯度鉴定中应用。
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关键词
芹菜
黄化突变体
遗传规律
生长表现
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职称材料
基于SSR标记的莴苣品种鉴定体系的建立及应用
被引量：
5
3
作者
凌晨
赵洪
+6 位作者
颜军
马莹雪
冯艳芳
张靖立
李波
邓超
徐振江
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2022年第4期34-44,共11页
为建立莴苣品种DNA分子快速鉴定技术体系,选择8个表型差异大、不同类型的莴苣品种,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳从245对引物中初筛出81对引物,对初筛引物添加荧光标记,另选择90个有代表性的莴苣品种,利用毛细管电泳复筛出22对核心引物,依据...
为建立莴苣品种DNA分子快速鉴定技术体系,选择8个表型差异大、不同类型的莴苣品种,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳从245对引物中初筛出81对引物,对初筛引物添加荧光标记,另选择90个有代表性的莴苣品种,利用毛细管电泳复筛出22对核心引物,依据扩增片段大小为各引物选择了相应的参照样品,采集了233个莴苣品种的DNA指纹数据。结果表明,22对核心引物在233个莴苣品种中共检测到269个等位基因,每对引物检测到等位基因为4~22个,平均为12.23个,PIC值为0.37~0.89,平均为0.73。聚类分析结果表明,233个供试品种主要划分为茎用和叶用两大类群,叶用类群中结球莴苣聚成一类,半结球莴苣趋于聚成一类,散叶莴苣难以聚成一类。对核心引物未能区分开的6组15个品种进行田间种植对比鉴定,3对品种表型性状无明显差异被判定为相同品种,表型性状有明显差异的品种大部分性状表达状态相同或相近,为近似品种,表明分子指纹聚类结果与基于表型的分类结果基本一致。此外,8组24个同名品种均能从分子上进行区分。利用筛选出的22对核心引物构建了233个莴苣品种的指纹数据库,建立了通用于茎用莴苣和叶用莴苣的品种鉴定技术体系,可用于莴苣品种和种质资源快速鉴定、遗传多样性分析和DUS测试辅助筛选近似品种等工作。
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关键词
莴苣
品种鉴定体系
SSR标记
DNA指纹图谱
DUS测试
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职称材料
青菜花粉管通道法导入外源DNA的研究初报
被引量：
2
4
作者
王光清
王蕴珠
+7 位作者
胡容霞
杨金水
葛扣麟
李美珍
陈根法
郑振钧
王吟雪
王垂丁
《复旦学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
1996年第2期127-131,共5页
采用花粉管通道法，将青菜株系７６Ｆ５、１４号大白菜、紫阳等三个品种的总ＤＮＡ及质粒ｐＡｃｔｌ－ＤＤＮＡ导入青菜６０５品系，收获青菜种子．种子发芽后分别提取约两周苗龄的小苗总ＤＮＡ，并经ＥｃｏＲＩ酶切，以ｇｕｓ基因片段...
采用花粉管通道法，将青菜株系７６Ｆ５、１４号大白菜、紫阳等三个品种的总ＤＮＡ及质粒ｐＡｃｔｌ－ＤＤＮＡ导入青菜６０５品系，收获青菜种子．种子发芽后分别提取约两周苗龄的小苗总ＤＮＡ，并经ＥｃｏＲＩ酶切，以ｇｕｓ基因片段为探针做分子杂交．证实了外源ｇｕｓ基因已整合到青菜６０５品系中；田间观察还获得了一株与供体大白菜花形相似的变异株．
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关键词
青菜
分子育种
花粉管通道
外源DNA导入
育种
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职称材料
题名
菠菜冷胁迫和热胁迫下转录组学和代谢组学联合分析
被引量：
1
1
作者
宫瑞
张林琳
崔彦玲
陈海丽
李然红
潜宗伟
机构
牡丹江师范学院生命科学与技术学院
北京市农林科学院蔬菜研究所
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2024年第6期27-39,共13页
基金
北京市联合攻关项目(G20220628003-01)
北京市农林科学院创新项目(KJCX20230126)
+1 种基金
北京蔬菜研究中心创新发展计划(KYC202302)
北京蔬菜研究中心协同创新项目(XTCX202302)。
文摘
温度胁迫是影响菠菜品质和产量的主要非生物胁迫之一,研究菠菜对温度胁迫响应的分子机制对菠菜抗逆育种具有重要意义。为给菠菜抗冷胁迫、热胁迫机制研究提供理论基础,以菠菜耐冷胁迫自交系D3和耐热自交系M10为试验材料,对其在冷胁迫和热胁迫下的转录组和代谢组进行了分析,以期探讨菠菜抗逆的转录和代谢机制。转录组学分析表明,在冷胁迫和热胁迫下,耐冷自交系D3和耐热自交系M10的差异基因富集最多的途径基本相同。代谢组学分析表明,冷胁迫下在基因与基因组数据库(KEGG)富集通路中共同富集在嘧啶代谢、赖氨酸降解通路中;热胁迫下在KEGG富集通路中共同富集在色氨酸代谢,甲苯降解,各种其他次生代谢物的生物合成,甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸的代谢通路中;转录组学和代谢组学联合分析结合基因注释,确定了SpADH(sov2g036390)、SpSHMT(sov1g001130)、SpALDH-1(sov4g007150)为菠菜耐冷胁迫的候选基因,SpALDH-1(sov4g007150)、SpALDH-2(sov1g043320)、SpNPC(sov1g040610)为菠菜耐热胁迫的候选基因,其中,SpALDH-1(sov4g007150)在冷胁迫和热胁迫下都显著表达,可能是菠菜抗逆的相关调控基因。
关键词
菠菜
冷胁迫
热胁迫
转录组
代谢组
候选基因
Keywords
Spinach
Cold stress
Heat stress
Transcriptome
Metabolome
Candidate gene
分类号
S636.03 [农业科学—蔬菜学]
Q38 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
芹菜黄色突变体的遗传及生长表现研究
被引量：
2
2
作者
王帅
沈火林
吴晓霞
机构
中国农业大学农学与生物技术学院
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2010年第B12期119-122,共4页
文摘
为了研究芹菜黄化突变的遗传规律及黄化突变体与正常个体的生长表现差异,对黄化突变自交系CE188H与正常绿色自交系CE155杂交的F2分离群体进行了性状观察分析,经卡平方(χ2)分析证明黄化突变与正常绿色的分离比例符合1∶3的分离预期,该黄色性状为质量性状,由1对隐性核基因控制,绿色性状对黄色性状为完全显性,且黄色性状的表现不受温度、光照等环境条件的影响。通过观察测定芹菜黄化突变自交系CE188H(yel yel)和正常绿色自交系CE188L(YEL YEL,与CE188H为近等基因系)的株高、展开度、叶柄长度、叶柄宽度、鲜质量、干质量,以及叶绿素、可溶性固形物和粗纤维含量,结果表明,该黄化突变体叶片中叶绿素含量仅为正常株的55.64%;黄化突变体CE188H在整个生长过程中叶片数量多于正常绿色自交系CE188L,平均为CE188L的1.18倍,但株高、展开度、叶柄长度、鲜质量、干质量显著低于正常绿色自交系,叶柄宽度、干物质含量、可溶性固形物含量无显著差异;黄化突变体CE188H的粗纤维含量是正常CE188L的1.23倍。黄色性状遗传稳定可作为苗期标记性状在芹菜杂种种子的生产和纯度鉴定中应用。
关键词
芹菜
黄化突变体
遗传规律
生长表现
Keywords
Celery
Yellow mutant
Genetic regulation
Growth performance
分类号
S636.03 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
基于SSR标记的莴苣品种鉴定体系的建立及应用
被引量：
5
3
作者
凌晨
赵洪
颜军
马莹雪
冯艳芳
张靖立
李波
邓超
徐振江
机构
华南农业大学农学院
农业农村部科技发展中心
农业农村部植物新品种测试(上海)分中心
上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所
衡阳市蔬菜研究所
北京市农林科学院
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2022年第4期34-44,共11页
基金
国家物种品种资源保护项目(19200085)。
文摘
为建立莴苣品种DNA分子快速鉴定技术体系,选择8个表型差异大、不同类型的莴苣品种,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳从245对引物中初筛出81对引物,对初筛引物添加荧光标记,另选择90个有代表性的莴苣品种,利用毛细管电泳复筛出22对核心引物,依据扩增片段大小为各引物选择了相应的参照样品,采集了233个莴苣品种的DNA指纹数据。结果表明,22对核心引物在233个莴苣品种中共检测到269个等位基因,每对引物检测到等位基因为4~22个,平均为12.23个,PIC值为0.37~0.89,平均为0.73。聚类分析结果表明,233个供试品种主要划分为茎用和叶用两大类群,叶用类群中结球莴苣聚成一类,半结球莴苣趋于聚成一类,散叶莴苣难以聚成一类。对核心引物未能区分开的6组15个品种进行田间种植对比鉴定,3对品种表型性状无明显差异被判定为相同品种,表型性状有明显差异的品种大部分性状表达状态相同或相近,为近似品种,表明分子指纹聚类结果与基于表型的分类结果基本一致。此外,8组24个同名品种均能从分子上进行区分。利用筛选出的22对核心引物构建了233个莴苣品种的指纹数据库,建立了通用于茎用莴苣和叶用莴苣的品种鉴定技术体系,可用于莴苣品种和种质资源快速鉴定、遗传多样性分析和DUS测试辅助筛选近似品种等工作。
关键词
莴苣
品种鉴定体系
SSR标记
DNA指纹图谱
DUS测试
Keywords
Lettuce
Variety identification system
SSR markers
DNA fingerprint
DUS testing
分类号
S636.03 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
青菜花粉管通道法导入外源DNA的研究初报
被引量：
2
4
作者
王光清
王蕴珠
胡容霞
杨金水
葛扣麟
李美珍
陈根法
郑振钧
王吟雪
王垂丁
机构
复旦大学遗传学研究所
出处
《复旦学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
1996年第2期127-131,共5页
基金
上海市科学技术发展基金
文摘
采用花粉管通道法，将青菜株系７６Ｆ５、１４号大白菜、紫阳等三个品种的总ＤＮＡ及质粒ｐＡｃｔｌ－ＤＤＮＡ导入青菜６０５品系，收获青菜种子．种子发芽后分别提取约两周苗龄的小苗总ＤＮＡ，并经ＥｃｏＲＩ酶切，以ｇｕｓ基因片段为探针做分子杂交．证实了外源ｇｕｓ基因已整合到青菜６０５品系中；田间观察还获得了一株与供体大白菜花形相似的变异株．
关键词
青菜
分子育种
花粉管通道
外源DNA导入
育种
Keywords
cabbage
molecular breeding
pollen-tube pathway
introduction of foreign DNA
variant plant.
分类号
S636.03 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
菠菜冷胁迫和热胁迫下转录组学和代谢组学联合分析
宫瑞
张林琳
崔彦玲
陈海丽
李然红
潜宗伟
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2024
1
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职称材料
2
芹菜黄色突变体的遗传及生长表现研究
王帅
沈火林
吴晓霞
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2010
2
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职称材料
3
基于SSR标记的莴苣品种鉴定体系的建立及应用
凌晨
赵洪
颜军
马莹雪
冯艳芳
张靖立
李波
邓超
徐振江
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2022
5
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职称材料
4
青菜花粉管通道法导入外源DNA的研究初报
王光清
王蕴珠
胡容霞
杨金水
葛扣麟
李美珍
陈根法
郑振钧
王吟雪
王垂丁
《复旦学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
1996
2
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职称材料
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