基于全基因组重测序的不结球白菜KASP分子标记开发与应用

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作者 张艳 沈卓 +3 位作者 杨易 周轩 吴增祥 黎庭耀 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期613-621,共9页

【目的】基于全基因组重测序数据开发不结球白菜KASP分子标记,以期丰富该物种的遗传信息,为不结球白菜种质资源鉴定、基因定位及分子标记辅助育种提供技术支持。【方法】对2份不结球白菜高代自交系C40和JY70进行全基因组及DNA重测序及... 【目的】基于全基因组重测序数据开发不结球白菜KASP分子标记,以期丰富该物种的遗传信息,为不结球白菜种质资源鉴定、基因定位及分子标记辅助育种提供技术支持。【方法】对2份不结球白菜高代自交系C40和JY70进行全基因组及DNA重测序及比对分析,挑选出差异SNP位点用于KASP分子标记开发,并对55份不结球白菜种质资源进行遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建。【结果】C40和JY70之间基因型不一致、测序深度大于10X且等位基因纯合的SNP位点有460849个。每条染色体上选择分布相对均匀的15个SNP位点设计成KASP引物,利用150对KASP引物对C40和JY70进行基因型分型检测,发现有86对引物成功分型,基于其对55份不结球白菜种质资源的基因型分型结果,筛选获得41个在不结球白菜中扩增质量高的KASP分子标记。41个KASP分子标记对55份不结球白菜种质资源的遗传多样性分析结果显示,其主要等位基因频率为0.5000~0.9273,平均为0.6643;基因多样性指数为0.1349~0.5000,平均为0.4257;多态性信息含量(PIC)为0.1258~0.3750,平均为0.3322,PIC>0.2500的位点占所有位点的94.5%,多态性较高。55份不结球白菜种质资源分为三大类群,相同类型的种质资源聚类在一起,其中地理来源相同的资源又聚类在一起,有效地反映了种质间的亲缘关系。利用PIC最高的15个KASP分子标记构建了55份不结球白菜种质资源的DNA指纹图谱。【结论】开发获得41个不结球白菜KASP分子标记,可用于不结球白菜种质资源鉴定、基因定位及分子标记辅助育种。 展开更多

关键词 不结球白菜 KASP分子标记 遗传多样性分析 DNA指纹图谱

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农杆菌介导的油菜遗传转化研究进展 被引量：8

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作者 韩德俊 袁本威 +2 位作者 胡甘 陈耀锋 李振岐 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2005年第11期18-22,共5页

综述了农杆菌介导的油菜等芸薹属植物高效转化体系建立的影响因素,总结了基因工程在改良油 菜等芸薹属植物性状中的最新研究进展,评述了植物in Planta转化法在油菜中的应用。

关键词 油菜 农杆菌介导 in planta转化

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白菜单株产量与相关农艺性状的灰色关联度分析初探 被引量：9

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作者 李晓锋 朱玉英 +1 位作者 侯瑞贤 朱红芳 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2010年第5期194-196,共3页

利用灰色关联度分析的方法对11份白菜杂交组合的单株产量与相关农艺性状的关系进行了初步研究。结果表明:白菜主要相关农艺性状对单株产量影响的大小依次为:单株叶重>叶宽>叶柄下宽>株高>开展度>叶长>叶柄长>叶柄... 利用灰色关联度分析的方法对11份白菜杂交组合的单株产量与相关农艺性状的关系进行了初步研究。结果表明:白菜主要相关农艺性状对单株产量影响的大小依次为:单株叶重>叶宽>叶柄下宽>株高>开展度>叶长>叶柄长>叶柄厚>叶柄上宽>叶数。因此,在白菜杂交育种过程中可以把单株叶重、叶宽、叶柄下宽和株高作为选育的重点性状,并结合其他性状进行综合筛选。 展开更多

关键词 白菜 单株产量 农艺性状 灰色关联度

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甘蓝型油菜的花期与生育期QTL定位 被引量：4

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作者 俎峰 赵凯琴 +5 位作者 张云云 田正书 刘亚俊 奚俊玉 束正齐 符明联 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期500-505,共6页

【目的】对甘蓝型油菜花期和生育期QTL进行定位,为精细定位和克隆早花基因及开展分子标记辅助早熟油菜品种选育提供理论依据。【方法】以极早熟甘蓝型油菜G28、甘蓝型油菜H008及以二者为亲本构建的175个F1DH株系为材料,利用甘蓝型油菜60... 【目的】对甘蓝型油菜花期和生育期QTL进行定位,为精细定位和克隆早花基因及开展分子标记辅助早熟油菜品种选育提供理论依据。【方法】以极早熟甘蓝型油菜G28、甘蓝型油菜H008及以二者为亲本构建的175个F1DH株系为材料,利用甘蓝型油菜60K SNP芯片分型技术绘制高密度遗传连锁图谱,并采用完备复合区间作图法对2016─2017年度丽江和临沧2个生长环境下甘蓝型油菜的花期(FT)和生育期(MT)田间调查数据进行QTL扫描分析。【结果】F1DH株系花期与生育期具有较明显的超亲现象,表明双亲材料控制花期和生育期的位点不同。F1DH株系在丽江生长环境下花期与生育期相关系数为0.63,在临沧生长环境下二者相关系数为0.79,即花期与生育期呈较高的正相关。利用SNP芯片构建的高密度遗传连锁图谱共包含19条连锁群,7601个SNPs位点,总长3838.2 c M。在丽江和临沧2个生长环境下共检测到6个花期QTL和5个生育期QTL,分布于A02、A07、C02、C03、C06、C07和C09连锁群上,可分别解释2.96%～17.40%和4.98%～11.82%的遗传变异。花期QTL qFTA02-1和qFTC03-2在2生长个环境下均可检测到,加性效应值相反,其中qFTA02-1具有最高的LOD值(20.43)、贡献率(17.40%)和加性效应值(3.27 d),且与生育期QTL qMTA02-1置信区间重叠,是最主要的花期主效QTL;qFTC03-2为次要的花期主效QTL。在qFTA02-1置信区间内发现2个拟南芥花期调控关键基因FLC和FY的油菜同源基因拷贝BnaA02g00370D和BnaA02g01670D。【结论】花期主效QTL qFTA02-1和qFTC03-2可用于分子标记辅助选育早熟油菜品种。BnaA02g00370D和BnaA02g01670D可能为qFTA02-1置信区间内控制甘蓝型油菜花期性状的目标基因。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜 花期 生育期 QTL定位 SNP芯片

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SRAP标记预测甘蓝型油菜常规品种间杂种优势 被引量：5

5

作者 顾慧 陈新军 +4 位作者 付三雄 戚存扣 张洁夫 浦惠明 陈松 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第6期169-171,共3页

以14份甘蓝型油菜常规品种(系)做亲本,配置12×2组合,利用SRAP标记估算亲本间遗传距离,并于成熟期考查F1代杂种优势表现,将两者做相关性分析,探讨SRAP标记预测常规品种间杂种优势的效率。结果发现,在考查的11个性状中,仅单株生产力... 以14份甘蓝型油菜常规品种(系)做亲本,配置12×2组合,利用SRAP标记估算亲本间遗传距离,并于成熟期考查F1代杂种优势表现,将两者做相关性分析,探讨SRAP标记预测常规品种间杂种优势的效率。结果发现,在考查的11个性状中,仅单株生产力超亲优势与遗传距离相关系数达到显著水平(P<0.05),为-0.426 2,但决定系数较低,为0.181 6,其他性状均未达到显著水平。表明SRAP标记难以预测甘蓝型油菜常规品种间的杂种优势。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜 SRAP 遗传距离 杂种优势预测

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甘蓝型油菜与黑芥种间杂种基因组亲缘关系研究 被引量：2

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作者 陈纪鹏 刘小林 胡月清 《江苏农业科学》 北大核心 2015年第6期87-90,共4页

以甘蓝型油菜和黑芥为亲本,采用人工杂交并结合胚培养合成了A、B、C三基因组杂种。基因组原位杂交结果显示,在花粉母细胞减数分裂终变期,B基因组染色体以0.41～0.90的频率形成同配二价体,A、C基因组染色体以4.25～5.94频率形成二价体,B... 以甘蓝型油菜和黑芥为亲本,采用人工杂交并结合胚培养合成了A、B、C三基因组杂种。基因组原位杂交结果显示,在花粉母细胞减数分裂终变期,B基因组染色体以0.41～0.90的频率形成同配二价体,A、C基因组染色体以4.25～5.94频率形成二价体,B基因组与A、C基因组间形成异配二价体的频率在0.96～1.65之间,B基因组与A、C基因有较远的亲缘关系;减数分裂后期I染色体分离极不规律;B基因组染色体分离表现为多样性,2∶6极端分离方式以19%的比例出现;落后染色体、染色体桥及非四分孢子都在减数分裂过程中出现,极端异常的减数分裂是导致花粉不育的重要原因。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜 黑芥 基因组 原位杂交 染色体 亲缘关系

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低温对油菜种子萌发和成苗的影响 被引量：4

7

作者 曹栋栋 陈合云 +2 位作者 张振兰 阮晓丽 阮关海 《山东农业科学》 2013年第9期56-58,共3页

试验采用3个油菜品种浙油18、高油605和浙油50,研究了低温对种子发芽和田间成苗的影响。结果表明,在低温条件下,浙油50新种的发芽势、发芽率、发芽指数和幼苗鲜重均最高,且田间成苗率也最高;高油605陈种的发芽最差;浙油50适宜晚直播。

关键词 油菜 种子 活力 低温发芽 田间成苗

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低温弱光对不同品种青菜生理生化指标的影响 被引量：2

8

作者 张渝洁 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2009年第5期179-180,共2页

对苏州青、阳都青菜2个青菜品种的幼苗分别进行低温弱光（4～8℃、500 lx）双重胁迫处理。结果表明，随着胁迫时间的增长，植株体内超氧化物歧化酶（s0D）总活性、叶绿素的含量均呈下降趋势，丙二醛（MDA）和可溶性糖的含量均呈上升趋... 对苏州青、阳都青菜2个青菜品种的幼苗分别进行低温弱光（4～8℃、500 lx）双重胁迫处理。结果表明，随着胁迫时间的增长，植株体内超氧化物歧化酶（s0D）总活性、叶绿素的含量均呈下降趋势，丙二醛（MDA）和可溶性糖的含量均呈上升趋势，不同品种青菜幼苗的各项生理生化指标的变化及程度不同，分别表现出不同的耐低温弱光能力。总体来说，苏州青的耐低温弱光能力较强，而阳都青菜的耐低温弱光能力较弱。 展开更多

关键词 青菜 低温弱光 胁迫

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普通不结球白菜抗虫转基因植株的获得 被引量：27

9

作者 佘建明 蔡小宁 +3 位作者 朱祯 朱卫民 张初贤 袁希汉 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2000年第2期79-82,共4页

以普通不结球白菜品种“中脚黑叶”和“矮脚黑叶”种子无菌苗的子叶为外植体材料 ,在附加 2 mg/LCPPU、0 .1m g/L NAA和 7.5 m g/L Ag NO3的稍作修改的 MS培养基上诱导不定芽。子叶 (柄 )和子叶切段诱导不定芽频率分别为 32 .5 2 %、4.3... 以普通不结球白菜品种“中脚黑叶”和“矮脚黑叶”种子无菌苗的子叶为外植体材料 ,在附加 2 mg/LCPPU、0 .1m g/L NAA和 7.5 m g/L Ag NO3的稍作修改的 MS培养基上诱导不定芽。子叶 (柄 )和子叶切段诱导不定芽频率分别为 32 .5 2 %、4.35 %和 4.79%、11.5 5 %。应用农杆菌介导法将含有豇豆胰蛋白酶抑制剂基因 (Cp TI)和新霉素磷酸转移酶基因 (N PT )的重组质粒导入普通不结球白菜 ,获得具有卡那霉素抗性的再生植株。具有卡那霉素抗性的当代转基因植株 (T0 )及其自交后代 (T1 )植株经 PCR和 Southern blot分子检测 ,确认抗虫基因已整合到受体植株的基因组中 ,并通过有性生殖遗传给后代。体外生物学测定结果 ,显示抗虫性状在转基因植株自交后代植株中得到表达。 展开更多

关键词 普通不结球白菜 转基因植株 农杆菌 CPTI

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外源基因在不结球白菜转基因植株后代中的表达 被引量：8

10

作者 佘建明 蔡小宁 +5 位作者 朱卫民 张初贤 朱祯 袁希汉 苏小俊 李彬 《江苏农业学报》 CSCD 2002年第1期33-36,共4页

应用农杆菌介导法将含有豇豆胰蛋白酶抑制剂基因和新霉素磷酸转移酶基因的重组质粒导入不结球白菜地方品种———“中脚黑叶”和“矮脚黑叶”中 ,获得抗虫转基因植株。卡那霉素抗性和抗虫性在转基因植株自交后代T1代植株中发生分离 ;在... 应用农杆菌介导法将含有豇豆胰蛋白酶抑制剂基因和新霉素磷酸转移酶基因的重组质粒导入不结球白菜地方品种———“中脚黑叶”和“矮脚黑叶”中 ,获得抗虫转基因植株。卡那霉素抗性和抗虫性在转基因植株自交后代T1代植株中发生分离 ;在T2 代中出现 3种不同类型的株系 :抗性纯合、杂合型和敏感性纯合株系。卡那霉素抗性和抗虫性在转基因植株自交后代中的表现基本符合孟德尔显性单基因的分离规律。从T2 、T3 、T4代中选择出抗虫性纯合株系 ,并获得一批对 1～ 2龄鳞翅目小菜蛾、斜纹夜蛾幼虫的校正死亡率达 6 0 展开更多

关键词 不结球白菜 转基因植株 豇豆胰蛋白酶抑制剂基因 新霉素磷酸转移酶基因 抗虫性

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反义CYP86MF基因植物表达载体的构建及其对白菜的转化 被引量：10

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作者 余小林 曹家树 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期179-184,共6页

在获得一个与白菜核雄性不育相关的编码细胞色素P450(CYP450)的基因CYP86MF的基础上,采用PCR技术在该基因的内部第901个碱基至第1338个碱基之间设计引物,扩增出438bp序列作为反义基因片段.把该反义片段连接至pBI121双元载体质粒上得到Ca... 在获得一个与白菜核雄性不育相关的编码细胞色素P450(CYP450)的基因CYP86MF的基础上,采用PCR技术在该基因的内部第901个碱基至第1338个碱基之间设计引物,扩增出438bp序列作为反义基因片段.把该反义片段连接至pBI121双元载体质粒上得到CaMV35S组成型启动子的表达载体pBI35S-AMF,随后利用"三亲杂交"法将pBI35S-AMF质粒转入农杆菌LBA4404和EHA105两个菌株中.PCR扩增和酶切鉴定结果表明,所构建的反义CYP86MF基因植物表达载体pBI35S-AMF是正确的,并已成功导入了根癌农杆菌中.随后,按照已建立的遗传转化体系对'上海青'白菜进行了转化,并获得130了多株转化再生植株. 展开更多

关键词 CY86MF基因 植物表达载体 白菜 遗传转化 反义RNA技术 根癌农杆菌 核雄性不育

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油菜萝卜胞质雄性不育系与诸葛菜属间杂种回交一代(BC_1)的快速繁殖及生根 被引量：1

12

作者 雷远成 吴俊 +3 位作者 骞宇 邓运涛 高辉 李旭锋 《四川大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期349-351,共3页

将油菜OguCMS与诸葛菜属间杂种回交一代 (BC1) ,在MS附加不同激素浓度的基本培养基上诱导丛生芽 结果发现 ,MS +1.5mg/L 6 BA +0 .15mg/LNAA对诱导丛生芽有较好的效果 ,丛生芽增殖系数可达 3.2 .小芽生根培养基以MS +0 .

关键词 油莱 萝卜胞质雄性不育系 OGUCMS 诸葛菜 丛生芽 快速繁殖 属间杂种回交 生根

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‘紫罗兰’白菜叶片再生体系的建立 被引量：2

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作者 吕星光 李敏 +1 位作者 刘维信 刘倩倩 《北方园艺》 CAS 北大核心 2015年第7期103-106,共4页

以‘紫罗兰’白菜无菌苗叶片为外植体,研究了不同6-BA和NAA浓度组合对白菜真叶不定芽再生的影响,同时采用不同生根培养基对再生芽进行生根诱导。结果表明:诱导‘紫罗兰’白菜真叶分化的适宜培养基为MS+2mg/L 6-BA+1mg/L NAA+4mg/L AgNO3... 以‘紫罗兰’白菜无菌苗叶片为外植体,研究了不同6-BA和NAA浓度组合对白菜真叶不定芽再生的影响,同时采用不同生根培养基对再生芽进行生根诱导。结果表明:诱导‘紫罗兰’白菜真叶分化的适宜培养基为MS+2mg/L 6-BA+1mg/L NAA+4mg/L AgNO3,每个外植体平均再生芽数为1.42个;生根培养基以MS+0.5mg/L NAA最佳,平均每个不定芽诱导根数为16.54个。该试验结果为‘紫罗兰’白菜材料的快速繁殖提供了理论和技术参考。 展开更多

关键词 '紫罗兰’白菜 组织培养 叶片 再生

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五十五份小白菜自交系的SSR遗传多样性分析 被引量：3

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作者 谢晋 滕长才 +2 位作者 赵志刚 余青兰 赵洪朝 《北方园艺》 CAS 北大核心 2018年第12期7-12,共6页

以55份小白菜自交系为试材,采用SSR分子标记技术对其遗传多样性进行分析,以期为育种中杂交组合的选配及种质创新提供参考依据。结果表明:从分布在10条染色体上的110对引物中筛选出44对稳定的多态性引物,得到105个多态性位点,平均每对引... 以55份小白菜自交系为试材,采用SSR分子标记技术对其遗传多样性进行分析,以期为育种中杂交组合的选配及种质创新提供参考依据。结果表明:从分布在10条染色体上的110对引物中筛选出44对稳定的多态性引物,得到105个多态性位点,平均每对引物扩增的条带数为2.4,每条染色体上平均多态性位点为10.5个,遗传距离在0.016 9~0.754 4,平均为0.373 0,参试材料间差异较大;聚类分析将55份材料分为四大类群,其中第Ⅰ大类31份材料,第Ⅱ大类8份材料,第Ⅲ大类5份材料,第Ⅳ大类11份材料。在这些材料中,大多数来源相同的聚为一类,少部分个体分布在不同类群中,可能是由于这些材料在人为与自然选择以及栽培环境的影响下发生了变异。 展开更多

关键词 小白菜 SSR 遗传多样性 种质资源

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甘蓝型油菜紫色酸性磷酸酶基因类似物的生物信息学分析

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作者 邹春阳 臧新 +2 位作者 杨冬之 曹刚强 焦思凯 《北方园艺》 CAS 北大核心 2016年第13期93-97,共5页

利用生物信息网络数据库,对甘蓝型油菜紫色酸性磷酸酶基因(PAP)类似物编码的蛋白进行生物信息学分析,以预测该蛋白的理化性质、分子结构与生物学功能。结果表明:该基因编码的蛋白含481个氨基酸,其蛋白的分子式为C2520H3714N666O719S19,... 利用生物信息网络数据库,对甘蓝型油菜紫色酸性磷酸酶基因(PAP)类似物编码的蛋白进行生物信息学分析,以预测该蛋白的理化性质、分子结构与生物学功能。结果表明:该基因编码的蛋白含481个氨基酸,其蛋白的分子式为C2520H3714N666O719S19,分子量为55.45kDa,等电点为6.35,为亲水性分泌型蛋白,并且不稳定;存在3个跨膜螺旋区域及3个卷曲螺旋结构,含有1个信号肽、39个潜在磷酸化位点和3个N-糖基化修饰,存在6种类型特定的功能位点,主要定位于高尔基体;氨基酸序列同源性分析表明,该基因编码的蛋白与甘蓝型油菜PAP12家族具有较近的亲缘关系,直系同源于甘蓝型油菜PAP12-5;二级结构主要为无规则卷曲、延伸链和α?螺旋,具有较为明显的10个螺旋和26个折叠;具有PAP的保守结构域,属于金属磷酸二酯酶超家族成员;根据保守结构域及功能位点分析发现该基因属于紫色酸性磷酸酶类,可能属于甘蓝型油菜PAP基因家族成员,预测其编码产物在植物磷高效利用与吸收中发挥重要的生理功能。生物信息学分析及结合蛋白的结构与功能预测分析可为深入研究甘蓝型油菜PAP提供理论指导。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜 紫色酸性磷酸酶(PAP)基因 生物信息学分析 功能预测

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