目的借助高通测序手段对乙型肝炎病毒的序列特征及变异情况进行检测分析。方法选取行肝癌切除术且与乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)相关的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者162例,通过对HBV preS区进行高通量测序,并基...目的借助高通测序手段对乙型肝炎病毒的序列特征及变异情况进行检测分析。方法选取行肝癌切除术且与乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)相关的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者162例,通过对HBV preS区进行高通量测序,并基于序列特征频率和多维度标量对其缺失特征进行分析,以支持向量机搭建下的预测模型对HCC相关性进行分析。结果HCC患者血清与癌组织间的序列特征差异不显著,其中HBV患者B型与C型的序列特征缺失差异显著(P<0.05),基于preS区序列特征的预测平均曲线下面积达到了0.967,具有较高的准确性。结论基于二代高通测序的HCC预测模型能对基因突变位点进行检测,为临床诊断及治疗提供了新的技术手段和工具。展开更多
戊型肝炎是由戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)引发的急性传染病,全球年感染病例约2000万例,总体病死率为0.5%~3%[1]。抗HEV免疫球蛋白M(immunoglobulin M,IgM)在发病初期产生,是近期感染HEV的标志,大多数在3个月内阴转[2]。我国是...戊型肝炎是由戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)引发的急性传染病,全球年感染病例约2000万例,总体病死率为0.5%~3%[1]。抗HEV免疫球蛋白M(immunoglobulin M,IgM)在发病初期产生,是近期感染HEV的标志,大多数在3个月内阴转[2]。我国是HEV高流行地区,浙江省近年来戊型肝炎病例报告数量持续位居全国前列,疾病防控形势严峻[3]。展开更多
文摘目的借助高通测序手段对乙型肝炎病毒的序列特征及变异情况进行检测分析。方法选取行肝癌切除术且与乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)相关的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者162例,通过对HBV preS区进行高通量测序,并基于序列特征频率和多维度标量对其缺失特征进行分析,以支持向量机搭建下的预测模型对HCC相关性进行分析。结果HCC患者血清与癌组织间的序列特征差异不显著,其中HBV患者B型与C型的序列特征缺失差异显著(P<0.05),基于preS区序列特征的预测平均曲线下面积达到了0.967,具有较高的准确性。结论基于二代高通测序的HCC预测模型能对基因突变位点进行检测,为临床诊断及治疗提供了新的技术手段和工具。
文摘戊型肝炎是由戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)引发的急性传染病,全球年感染病例约2000万例,总体病死率为0.5%~3%[1]。抗HEV免疫球蛋白M(immunoglobulin M,IgM)在发病初期产生,是近期感染HEV的标志,大多数在3个月内阴转[2]。我国是HEV高流行地区,浙江省近年来戊型肝炎病例报告数量持续位居全国前列,疾病防控形势严峻[3]。