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泌尿道感染样本分离出黏液型肯塔基沙门菌ST198.2-11例报道 被引量：1
1
作者 刘瑛 陈峰 +2 位作者 李虎 刘玥 许学斌 《检验医学》 2025年第10期1030-1034,共5页
沙门菌(Salmonella)是人类重要的感染型食源性病原[1],分布于全球的养殖动物(畜禽类)和水产品中,存在物种与优势菌共存[2]。人经粪-口途径感染沙门菌后,因个体免疫水平差异症状有所不同:低龄幼儿易出现腹泻、腹痛、发烧等典型感染性腹... 沙门菌(Salmonella)是人类重要的感染型食源性病原[1],分布于全球的养殖动物(畜禽类)和水产品中,存在物种与优势菌共存[2]。人经粪-口途径感染沙门菌后,因个体免疫水平差异症状有所不同:低龄幼儿易出现腹泻、腹痛、发烧等典型感染性腹泻症状;成人可自限,罹患基础性疾病者易经肠系膜静脉系统入血形成菌血症、脓毒血症等重症,甚至死亡[3]。沙门菌泌尿道感染不常见,危险因素与患者免疫功能低下和潜在的泌尿系统结构异常有关[4-7]。2023年8月,上海交通大学医学院附属新华医院自1例泌尿道感染患者清洁中段尿样本中首次分离到1株高水平耐药、黏液型的肯塔基沙门菌。该患者急诊就医,临床多次经验用药治疗失败。本文基于全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)结果,结合国内外持续流行的高水平耐药肯塔基沙门菌ST198.2-1耐药克隆等报道[8-10],对病例进行解析。 展开更多
关键词 肯塔基沙门菌ST198.2-1 黏液型 菌毛调节蛋白基因 泌尿道感染
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临床产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌目细菌感染应对策略专家共识(2025)
2
作者 卓超 徐英春 +23 位作者 俞云松 井然 邹明祥 李军 邬靖敏 胡付品 张菁 郑波 刘正印 于湘友 邱海波 施毅 佘丹阳 冯四洲 梅雪 许巍 程剑剑 吴安华 李春辉 宗志勇 周志慧 陆旻雅 李雪 奕巧莲 《中国感染控制杂志》 北大核心 2025年第9期1191-1207,共17页
肠杆菌目细菌是医院感染的重要病原体,可导致多种严重感染性疾病。自首次报道以来,产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌目细菌(extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacterales, ESBL-E)已在全球范围内广泛流行。此类菌株常呈现多重... 肠杆菌目细菌是医院感染的重要病原体,可导致多种严重感染性疾病。自首次报道以来,产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌目细菌(extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacterales, ESBL-E)已在全球范围内广泛流行。此类菌株常呈现多重耐药性,显著增加感染治疗失败风险及患者病死率。中国ESBL-E的防控面临诸多挑战,包括高流行率、区域分布差异显著、实验室检测能力不均衡、抗菌药物管理和用药能力存在差异等问题。为此,由卓超、徐英春、俞云松教授发起,联合多学科专家共同制订了《临床产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌目细菌感染应对策略专家共识(2025)》。本共识系统梳理了ESBL-E的国内外流行病学特征、临床实验室检测技术、治疗原则和主要治疗药物、感染防控措施,并针对不同感染源(包括血流、颅内、呼吸系统、胸腔纵隔、腹腔、泌尿系统感染)和特殊人群(中性粒细胞缺乏伴发热、急诊及儿童患者),详细阐述了病原学感染特点及分层治疗原则,旨在提高临床实验室对ESBL-E的检出能力,规范医疗机构针对ESBL-E感染的诊疗策略,为遏制ESBL-E在中国的流行、降低相关发病率和病死率提供科学指导。 展开更多
关键词 超广谱Β-内酰胺酶 产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌目细菌 抗菌药物 目标治疗 分层治疗 共识
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2021—2023年甘肃省食源性和腹泻病例沙门菌全基因组特征研究
3
作者 兰光 申艳琴 +5 位作者 张璟 李欣颖 闫静 刘小菊 何婕 王伟 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第9期952-959,共8页
目的分析甘肃省2021—2023年食源性和腹泻病例中沙门菌的全基因组特征。方法研究收集163株沙门菌,经生化鉴定后,进行血清学分型、全基因组测序及生物信息学分析。结果分离出27种血清型,鼠伤寒沙门菌单相变种(S.4,[5],12∶1∶-)、肠炎沙... 目的分析甘肃省2021—2023年食源性和腹泻病例中沙门菌的全基因组特征。方法研究收集163株沙门菌,经生化鉴定后,进行血清学分型、全基因组测序及生物信息学分析。结果分离出27种血清型,鼠伤寒沙门菌单相变种(S.4,[5],12∶1∶-)、肠炎沙门菌和伦敦沙门菌为优势血清型,且不同样本来源的血清型分布存在差异。MLST分型获得27种ST型,主要为ST34、ST11、ST155和ST19,分型与血清学结果高度关联。检出374类共17673个毒力基因,携带多种毒力岛,部分菌株携带毒性质粒基因,其中45株肠炎沙门菌中检出的毒力因子种类、数目高于其他血清型沙门菌。耐药基因检测到69个,涵盖13类抗菌药物,多数菌株携带多种耐药基因。此外,检出35种质粒型,部分质粒与耐药性相关;还发现3种消毒剂抗性基因。结论甘肃省沙门菌血清型和ST型分布广泛,耐药基因和毒力基因多样,抗消毒剂基因的出现对传统消毒措施构成挑战,研究结果为防控沙门菌感染提供了科学依据。 展开更多
关键词 沙门菌 血清型分型 全基因组测序 耐药基因 毒力基因 抗性基因
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阿拉丘沙门菌的遗传特征及耐药基因初步研究
4
作者 刘玥 许学斌 +4 位作者 胡屹 顾其芳 刘诚 袁政安 陈敏 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第2期164-170,共7页
目的 基于阿拉丘沙门菌分离株的全基因组分析,初步探讨其遗传特征及耐药基因分布。方法 收集并鉴定5株来自不同来源(人源与非人源)的阿拉丘沙门菌,对其进行表型和血清型验证、抗菌药物敏感性测定以及全基因组测序分析。利用全球公开数... 目的 基于阿拉丘沙门菌分离株的全基因组分析,初步探讨其遗传特征及耐药基因分布。方法 收集并鉴定5株来自不同来源(人源与非人源)的阿拉丘沙门菌,对其进行表型和血清型验证、抗菌药物敏感性测定以及全基因组测序分析。利用全球公开数据库的阿拉丘沙门菌基因组数据,对这些菌株的毒力基因、耐药基因和质粒复制子进行预测,并构建系统发育树以探讨其遗传背景。结果 我国阿拉丘沙门菌的首例报告出现于2015年的上海,临床特征主要为腹泻,菌株主要集中在东部和南部沿海地区。本次研究的5株菌株中,4株归属于序列型ST2061,1株归属于ST1298。所有菌株对大多数临床常用抗菌药物敏感。全基因组分析结果显示,2株ST2061菌株携带bla KPC-2基因,1株ST1298菌株携带fosA7基因。在全球阿拉丘沙门菌群体的5个遗传进化群(C1~C5)中,本研究的ST2061克隆位于C1群,与英国菌株高度同源;而ST1298克隆位于C4群,为携带磷霉素耐药基因fosA7的全球流行克隆。结论 本研究初步呈现我国阿拉丘沙门菌分离株的遗传和耐药特征,提示存在携带bla_(KPC-2)和fosA7基因的菌株出现。为后续在更大范围内开展的分子流行病学监测与溯源分析提供参考,并强调加强阿拉丘沙门菌耐药性监测的重要性。 展开更多
关键词 阿拉丘沙门菌 bla KPC-2 fosA7 系统发育进化
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2023年北京市房山区单相鼠伤寒沙门菌耐药性及耐药基因毒力基因研究
5
作者 刘海波 刘颖 +3 位作者 王云霞 史文凤 张冬然 赵耀 《江苏卫生保健》 2025年第4期344-346,共3页
目的了解北京市房山区单相鼠伤寒沙门菌的耐药情况、菌株间的同源性及其携带的耐药基因毒力基因情况。方法对2023年分离自食品和腹泻人群的8株单相鼠伤寒沙门菌进行血清学鉴定,采用微量肉汤稀释法进行19种药物的敏感性试验,应用脉冲场... 目的了解北京市房山区单相鼠伤寒沙门菌的耐药情况、菌株间的同源性及其携带的耐药基因毒力基因情况。方法对2023年分离自食品和腹泻人群的8株单相鼠伤寒沙门菌进行血清学鉴定,采用微量肉汤稀释法进行19种药物的敏感性试验,应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型及聚类分析,同时进行全基因组测序、多位点序列分型分析及耐药基因毒力基因预测。结果单相鼠伤寒沙门菌对氨苄西林耐药率最高(100%),其次为四环素(75.00%),多重耐药率达62.50%。8株菌分为8种PFGE带型,多位点序列分型显示,序列ST34占绝对优势(7/8);tetB基因和四环素类药物四环素的符合率达到87.50%,floR基因与酰胺醇类药物氯霉素的符合率达到87.50%;8株菌共检出6类毒力因子,涉及108种相关毒力基因。结论房山区单相鼠伤寒菌耐药严重,菌株间遗传多样性明显,提示应加强食品、环境、动物等样本监测,开展暴露危险因素调查,降低该菌型的扩散风险。 展开更多
关键词 单相鼠伤寒沙门菌 耐药性 耐药基因 毒力基因
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血流感染金黄色葡萄球菌不同耐药株生物膜形成能力和毒力关系研究
6
作者 王娟 汤英贤 +2 位作者 陈凌娟 叶海恩 徐令清 《国际检验医学杂志》 2025年第14期1753-1757,1763,共6页
目的探讨血流感染金黄色葡萄球菌(SA)不同耐药株生物膜形成能力和毒力关系。方法收集42株血流感染SA并使用BDM50全自动细菌鉴定药物敏感系统进行鉴定和药物敏感试验,结晶紫染色法测定生物膜形成能力,通过检测胞外脂肪酶、胞外蛋白酶和... 目的探讨血流感染金黄色葡萄球菌(SA)不同耐药株生物膜形成能力和毒力关系。方法收集42株血流感染SA并使用BDM50全自动细菌鉴定药物敏感系统进行鉴定和药物敏感试验,结晶紫染色法测定生物膜形成能力,通过检测胞外脂肪酶、胞外蛋白酶和溶血素及大蜡螟幼虫毒力试验评估其毒力。结果42株血流感染SA中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)有16株(38.10%);42株血流感染SA有25株(59.50%)具有生物膜形成能力,其中甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)有18株,MRSA有7株;42株血流感染SA中37株(88.10%)能产生溶血素、18株(42.90%)能产胞外蛋白酶、没有能产生胞外脂肪酶的菌株;大蜡螟幼虫毒力试验显示MRSA的毒力强于MSSA。结论MRSA相对于MSSA产生胞外酶的占比更高,毒力更强,生物膜的形成能力相对较弱。 展开更多
关键词 血流感染 金黄色葡萄球菌 生物膜 毒力
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12种抗生素组合对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌联合药敏试验
7
作者 王东平 苏爱美 韩欣怡 《现代检验医学杂志》 2025年第2期64-69,共6页
目的观察黏菌素(COL)分别联合替加环素(TGC)、头孢哌酮/舒巴坦(SCF)、氨苄西林/舒巴坦(SAM)、美罗培南(MEM)、阿米卡星(AK)和左氧氟沙星(LEV),TGC分别联合SCF,SAM,MEM和AK,SCF分别联合MEM和AK对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)体外联合... 目的观察黏菌素(COL)分别联合替加环素(TGC)、头孢哌酮/舒巴坦(SCF)、氨苄西林/舒巴坦(SAM)、美罗培南(MEM)、阿米卡星(AK)和左氧氟沙星(LEV),TGC分别联合SCF,SAM,MEM和AK,SCF分别联合MEM和AK对耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)体外联合药物敏感性,筛选有效的抗感染治疗方案。方法收集2023年1~12月青岛市第八人民医院临床标本中分离的非重复CRAB 58株,采用微量肉汤稀释法测定抗生素对菌株的最低抑菌浓度(MIC),棋盘法进行联合药敏试验,计算部分抑菌浓度指数(FIC)判定联合效果。结果COL+SCF协同率为70.69%,协同率与相加率之和为96.55%。COL+TGC,COL+SAM,COL+MEM,COL+AK,COL+LEV,TGC+SCF,TGC+SAM,TGC+MEM,TGC+AK,SCF+MEM及SCF+AK协同率分别为34.48%,65.52%,51.72%,37.93%,22.42%,27.59%,27.59%,37.93%,41.38%,48.28%和25.86%;协同率与相加率之和分别为77.58%,91.38%,84.48%,65.52%,39.66%,67.25%,62.07%,58.62%,55.17%,82.76%和74.14%。12种药物联合方案对CRAB菌株的MIC范围,MIC50和MIC90值与各个单药相比均有不同程度的减低,所有组合均未出现拮抗作用。结论COL+SCF的协同率与相加率之和最高,COL+LEV协同率与相加率之和最低,可作为临床经验用药参考。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 棋盘法 联合药敏试验 部分抑菌浓度指数
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85株耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌表型及基因型分布 被引量：1
8
作者 王美娜 孟庆兰 +3 位作者 王俊瑞 郑文琪 福泉 顾岩 《中华医院感染学杂志》 北大核心 2025年第9期1299-1304,共6页
目的 对耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)菌株进行表型、基因型检测,了解CRE的耐药表型、分子学特征。方法 收集内蒙古医科大学附属医院2019年1月-2023年8月微生物实验室经分离鉴定并留存的85株CRE菌株标本,碳青霉烯酶抑制剂增强试验行碳... 目的 对耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)菌株进行表型、基因型检测,了解CRE的耐药表型、分子学特征。方法 收集内蒙古医科大学附属医院2019年1月-2023年8月微生物实验室经分离鉴定并留存的85株CRE菌株标本,碳青霉烯酶抑制剂增强试验行碳青霉烯酶表型检测,聚合酶链反应(PCR)进行碳青霉烯酶基因型检测,多位点序列分型(MLST)进一步分析序列型(ST)。结果 进行表型检测的85株CRE菌株中,携带丝氨酸酶(A类碳青霉烯酶)的CRE菌株有54株,携带金属酶(B类碳青霉烯酶)的CRE菌株有23株,同时产A类和B类碳青霉烯酶的CRE菌株共有5株,不产A类和/或B类碳青霉烯酶的CRE菌株共3株。73株CRE完成5种常见的碳青霉烯酶基因扩增,bla_(KPC)检出率最高,其次为bla_(NDM),未检测出携带bla_(IMP)、bla_(VIM)、bla_(0XA-48)耐药基因。51株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)共分为7种ST型,ST1、ST11、ST15、ST23、ST34、ST690、ST4862。结论 医院CRE检出率最高为CRKP,流行株以ST11为主;耐药表型以产丝氨酸酶最常见,耐药基因型以KPC型碳青霉烯酶为主。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌 表型 基因型 序列型 流行株
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2015—2021年CHINET临床分离肠杆菌目细菌对碳青霉烯类耐药性变迁 被引量：1
9
作者 吉文翔 蒋童 +88 位作者 沈继录 杨洋 胡付品 朱德妹 徐元宏 黄颖 张峰波 季萍 谢轶 康梅 王传清 付盼 徐英春 张小江 孙自镛 陈中举 倪语星 孙景勇 褚云卓 田素飞 胡志东 李金 俞云松 林洁 单斌 杜艳 郭素芳 魏莲花 邹凤梅 胡云建 艾效曼 卓超 苏丹虹 郭大文 赵金英 喻华 黄湘宁 刘文恩 李艳明 金炎 邵春红 徐雪松 鄢超 王山梅 楚亚菲 张利侠 马娟 周树平 周艳 朱镭 孟晋华 董方 吕志勇 胡芳芳 沈瀚 周万青 贾伟 李刚 吴劲松 卢月梅 李继红 段金菊 康建邦 马晓波 郑燕萍 郭如意 朱焱 陈运生 孟青 王世富 胡雪飞 张泓 王春 黄文辉 汪瑞忠 房华 俞碧霞 赵勇 龚萍 温开镇 张贻荣 刘江山 廖龙凤 顾洪芹 姜琳 贺雯 薛顺虹 冯佼 岳春雷 《中国感染与化疗杂志》 北大核心 2025年第4期445-454,共10页
目的分析总结2015—2021年中国CHINET肠杆菌目细菌对碳青霉烯类的耐药性变迁,为临床抗感染治疗提供实验室依据。方法采用商品化药敏试验自动测试仪按照CHINET统一监测方案进行抗菌药物药敏试验,参照CLSI M1002021版标准判读结果。结果2... 目的分析总结2015—2021年中国CHINET肠杆菌目细菌对碳青霉烯类的耐药性变迁,为临床抗感染治疗提供实验室依据。方法采用商品化药敏试验自动测试仪按照CHINET统一监测方案进行抗菌药物药敏试验,参照CLSI M1002021版标准判读结果。结果2015—2021年,七年间碳青霉烯类耐药肠杆菌目细菌(CRE)总检出率9.43%(62342/661235)。肠杆菌目细菌中以肺炎克雷伯菌、弗劳地枸橼酸杆菌和阴沟肠杆菌的CRE菌株检出率高,分别为22.38%、9.73%和8.47%。大肠埃希菌中CRE菌株的检出率为1.99%。在沙门菌属和志贺菌属的某些菌株中亦已发现有CRE菌株。CRE菌株主要分离自呼吸道标本(44.23±2.80)%、血液标本(20.88±3.40)%和尿液标本(18.40±3.45)%。科室分布主要集中在重症监护病房(ICU)(27.43±5.20)%。药敏试验结果显示,CRE菌株不仅对所有测试的β内酰胺类抗菌药耐药,而且对非β内酰胺类抗菌药物亦大多耐药;其对替加环素、多黏菌素敏感,细菌耐药率低。结论七年间,CRE菌株的检出率呈现逐年递增的趋势,对临床大多抗菌药物呈现高度耐药,临床医师应合理使用抗菌药物进行抗感染治疗。同时,医院应加强对重点科室如ICU等的管理,并采取有效的抗感染措施,遏制此类耐药菌在医院内的暴发和流行。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌 细菌耐药监测 变迁
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肉鸡屠宰环节多重耐药ST314肯塔基沙门菌的全基因组序列分析 被引量：1
10
作者 李佳芮 孙瑞源 +7 位作者 何沛杰 刘淏天 旷如意 夏静 崔敏 黄勇 邹立扣 韩新锋 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第5期537-543,共7页
目的分析肉鸡源多重耐药ST314肯塔基沙门菌的耐药特征、毒力基因和遗传进化背景。方法测定肉鸡屠宰环节中分离得到的ST314肯塔基沙门菌对临床常见抗菌药物的敏感性。通过全基因组测序(WGS)和生物信息学方法分析其耐药基因、毒力因子和... 目的分析肉鸡源多重耐药ST314肯塔基沙门菌的耐药特征、毒力基因和遗传进化背景。方法测定肉鸡屠宰环节中分离得到的ST314肯塔基沙门菌对临床常见抗菌药物的敏感性。通过全基因组测序(WGS)和生物信息学方法分析其耐药基因、毒力因子和水平移动元件(MGEs)等相关信息。结果三株ST314克隆均表现出高度耐药性。F4-2S对7类14种药物、F4T对7类13种药物以及Y23对6类9种药物耐药。F4-2S与F4T具有高度同源性,均携带9类13种耐药基因,以及分泌系统和效应蛋白等一系列毒力因子。含有的IncR和IncX1型质粒增强了其耐药性和致病性。Y23基因组完成图包含一条染色体和两个质粒。染色体上仅有一种耐药基因,但携带与细菌入侵有关的Ⅲ型分泌系统(T3SS)等众多毒力因子,而质粒pY23-1上携带8类19种耐药基因。相似质粒的比对结果显示,pY23-1与pZ1323SSL0055、pSAL-045同源关系较近,均携带多种耐药基因,提示其在细菌耐药进化中可能扮演重要角色。结论ST314肯塔基沙门菌具有复杂的耐药机制及致病潜力,质粒上的耐药基因及其MGEs有助于细菌耐药性的产生和传播。染色体含有的多种毒力因子,可能是导致ST314克隆毒力增强的重要原因。 展开更多
关键词 肯塔基沙门菌 多重耐药 超广谱Β-内酰胺酶 全基因组测序
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幽门螺杆菌感染引起胃黏膜解痉多肽表达化生机制 被引量：1
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作者 王海诺 李玙璠 +3 位作者 王雨莹 沈倩影 朱进霞 郑丽飞 《基础医学与临床》 CAS 2025年第1期130-134,共5页
幽门螺杆菌(H.pylori)感染后胃黏膜会发生炎性反应和解痉多肽表达化生(SPEM)。这些病症会进一步诱导慢性胃炎、胃溃疡,甚至胃癌。因此,SPEM通常被认为是胃黏膜损伤和癌变的早期指标之一。阐明H.pylori诱导的SPEM细胞来源和分子调控可以... 幽门螺杆菌(H.pylori)感染后胃黏膜会发生炎性反应和解痉多肽表达化生(SPEM)。这些病症会进一步诱导慢性胃炎、胃溃疡,甚至胃癌。因此,SPEM通常被认为是胃黏膜损伤和癌变的早期指标之一。阐明H.pylori诱导的SPEM细胞来源和分子调控可以更深入地了解相关胃黏膜疾病的发病机制,并为其疾病的诊断和治疗提供新的思路和靶点。本文对SPEM相关的分子标志物进行了总结,阐述了TFF2、CD44v9和AQP5在H.pylori感染和SPEM中的调控作用。对SPEM细胞的起源以及相关分子调控机制进行了综述。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 胃黏膜解痉多肽表达化生
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2015—2021年CHINET临床分离大肠埃希菌耐药性变迁
12
作者 王山梅 马冰 +87 位作者 李轶 杨洋 胡付品 朱德妹 徐英春 张小江 张朝霞 季萍 谢轶 康梅 王传清 王爱敏 徐元宏 黄颖 孙自镛 陈中举 倪语星 孙景勇 褚云卓 田素飞 胡志东 李金 俞云松 林洁 单斌 杜艳 郭素芳 魏莲花 邹凤梅 张泓 王春 胡云建 艾效曼 卓超 苏丹虹 郭大文 赵金英 喻华 黄湘宁 刘文恩 李艳明 金炎 邵春红 徐雪松 鄢超 张利侠 马娟 周树平 周艳 朱镭 孟晋华 董方 吕志勇 胡芳芳 沈瀚 周万青 贾伟 李刚 吴劲松 卢月梅 李继红 段金菊 康建邦 马晓波 郑燕萍 郭如意 朱焱 陈运生 孟青 王世富 胡雪飞 沈继录 黄文辉 汪瑞忠 房华 俞碧霞 赵勇 龚萍 温开镇 张贻荣 刘江山 廖龙凤 顾洪芹 姜琳 贺雯 薛顺虹 冯佼 岳春雷 《中国感染与化疗杂志》 北大核心 2025年第1期39-47,共9页
目的了解2015—2021年CHINET所属52所医院临床分离大肠埃希菌对各类抗菌药物的耐药性及变迁。方法按照CHINET耐药监测网统一方案进行大肠埃希菌的抗菌药物敏感性试验。采用WHONET 5.6及SPSS 20.0软件进行数据分析。结果2015—2021年共... 目的了解2015—2021年CHINET所属52所医院临床分离大肠埃希菌对各类抗菌药物的耐药性及变迁。方法按照CHINET耐药监测网统一方案进行大肠埃希菌的抗菌药物敏感性试验。采用WHONET 5.6及SPSS 20.0软件进行数据分析。结果2015—2021年共分离到非重复大肠埃希菌临床分离株289760株,主要分离自尿液标本[(44.7±3.2)%],女性尿标本占比高于男性(59.0%对29.5%);未成年人呼吸道及脑脊液标本分离株占比均高于成人(16.7%对7.8%,0.8%对0.1%);上述差异均有统计学意义(P值<0.05)。内科分离株占比最多[(28.9±2.8)%],有增长趋势。7年间,产ESBL大肠埃希菌及碳青霉烯类耐药大肠埃希菌(carbapenem resistant Escherichia coli,CREco)总检出率分别为55.9%及1.8%。产ESBL大肠埃希菌历年检出率三级医院最高。儿童医院CREco历年检出率高于二、三级医院。三级医院产ESBL大肠埃希菌、儿童医院产ESBL大肠埃希菌和CREco检出率均有下降趋势。二、三级医院CREco检出率有缓慢上升趋势。历年抗生素耐药率变化趋势缓慢。碳青霉烯类药物(亚胺培南、美罗培南)是β内酰类药物中抗菌活性最好的药物(耐药率≤2.1%)。β内酰酶抑制剂复方制剂(哌拉西林-他唑巴坦、头孢哌酮-舒巴坦)、氨基糖苷类药物(阿米卡星)以及呋喃妥因和磷霉素(分离自尿标本菌株)耐药率均在10%以内。不同等级医院和不同科室分离的大肠埃希菌对抗菌药物的耐药率存在差异,尤其对头孢唑林及环丙沙星,分离自非ICU未成年住院患者的菌株耐药率明显低于其他科室患者(P<0.05)。对于大多数药物,分离自ICU的大肠埃希菌耐药率(除替加环素外)高于其他科室;三级医院分离株(替加环素、多黏菌素B、头孢吡肟、碳青霉烯类除外)耐药率高于二级医院和儿童医院。结论大肠埃希菌是重要致病菌,超半数的临床分离株产ESBL。虽然CREco总体检出率低,但在二、三级医院的检出率近年有上升趋势,需特别关注。 展开更多
关键词 细菌耐药监测 大肠埃希菌 药物敏感性试验
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Ebselen抑制巨噬细胞过度炎性反应抗大肠杆菌急性感染
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作者 刘晓雯 牟小琴 +7 位作者 程创 龚双双 张浩然 贺靓 郑锡 王君 王栎清 邹黎黎 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第7期1346-1353,共8页
目的基于前期研究探讨无革兰氏阴性菌抑菌活性的依布硒啉(ebselen,EbSe),可提高大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)感染小鼠生存率的药理机制。方法EbSe干预E.coli感染Raw264.7细胞后,CCK-8法测定Raw264.7细胞活力,电子显微镜观察Raw26... 目的基于前期研究探讨无革兰氏阴性菌抑菌活性的依布硒啉(ebselen,EbSe),可提高大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)感染小鼠生存率的药理机制。方法EbSe干预E.coli感染Raw264.7细胞后,CCK-8法测定Raw264.7细胞活力,电子显微镜观察Raw264.7细胞形态结构,涂板法计算Raw264.7胞内载菌量;流式细胞术检测E.coli感染后Raw264.7及E.coli急性感染小鼠腹腔巨噬细胞极化状态,Raw264.7胞内NO和ROS含量及胞内HO-1表达量;qPCR检测Raw264.7细胞中相关mRNA表达;分光光度法检测Raw264.7胞内GSH含量;免疫荧光观察细胞骨架蛋白状态;Western blot检测细胞内Txnrd1表达。结果微孔法、CCK-8以及电子显微镜观察结果显示EbSe对E.coli、Raw264.7细胞生长无影响;涂板计数结果显示EbSe可降低Raw264.7细胞内载菌量;流式细胞术结果显示,EbSe可降低感染细胞内NO、ROS水平,升高GSH水平,上调M2型极化;qPCR结果显示EbSe可降低感染组细胞内IL-6、IL-1β、iNOS表达,升高HO-1、Txnrd1、Glut1表达;免疫荧光结果显示EbSe处理后的感染组细胞形态与Mox阳性对照相似;Western blot结果显示EbSe可升高感染细胞内Txnrd1蛋白表达。结论EbSe通过调节巨噬细胞极化情况,抑制巨噬细胞过度炎症状态,发挥抗大肠杆菌急性感染的作用效果。 展开更多
关键词 EBSELEN 大肠杆菌 抗菌 巨噬细胞 极化 急性感染
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海南省2021年沙门菌病原学特征及基因组分析
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作者 甘晓婷 孙慧颖 +9 位作者 李丹丹 华德 邝仕壮 吴清波 李烈飞 王瑞 张亚淋 贝雯雯 吴忠慧 遇晓杰 《中国热带医学》 北大核心 2025年第9期1213-1219,共7页
目的分析2021年海南省沙门菌的病原学特征、耐药基因型及遗传进化规律,为沙门菌感染监测及防控策略制定提供科学依据。方法对海南省208株沙门菌(人源134株、食品源70株、未知来源4株)进行全基因组测序,利用SPAdes拼接序列,通过SISTR数... 目的分析2021年海南省沙门菌的病原学特征、耐药基因型及遗传进化规律,为沙门菌感染监测及防控策略制定提供科学依据。方法对海南省208株沙门菌(人源134株、食品源70株、未知来源4株)进行全基因组测序,利用SPAdes拼接序列,通过SISTR数据库鉴定血清型,ResFinder分析耐药基因,PubMLST确定序列型(ST),Parsnp构建基于核心基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)系统进化树,结合流行病学数据识别聚集性事件。结果2021年海南省208株沙门菌中检出31个血清型,主要优势血清型为单相鼠伤寒沙门菌(28.37%)、其次是肠炎沙门菌(12.02%)和韦太夫雷登沙门菌(12.02%)。人源菌株以单相鼠伤寒沙门菌(35.82%)、肠炎沙门菌(14.18%)及韦太夫雷登沙门菌(11.19%)为主,食品源以韦太夫雷登沙门菌(14.29%)、德尔卑沙门菌(12.86%)及单相鼠伤寒沙门菌(10.00%)为主。共鉴定出37个ST型,优势型为ST34(全为单相鼠伤寒沙门菌,45株,占21.63%)、ST11(全为肠炎沙门菌,25株,占12.02%)、ST365(全为韦太夫雷登沙门菌,25株,占12.02%)。11株菌携带3~13种多重耐药基因,以人源单相鼠伤寒沙门菌及鼠伤寒沙门菌为主。基因组分析发现7个聚集簇,其中2起为确认的食源性疾病暴发(韦太夫雷登沙门菌和肠炎沙门菌),4起为潜在暴发(单相鼠伤寒沙门菌3起、韦太夫雷登沙门菌1起),1起提示猪肉制品中纽波特沙门菌广泛污染。结论海南省2021年沙门菌流行以单相鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌及韦太夫雷登沙门菌血清型为主,多重耐药基因携带率低但存在传播风险,猪肉可能是海南沙门菌食源性疾病暴发的重要传染源。基因组监测可有效识别跨区域暴发和污染源,建议加强高风险食品特别是猪肉及其制品的卫生管理和耐药监测,重点关注韦太夫雷登沙门菌的防控。 展开更多
关键词 沙门菌 耐药基因 全基因组测序 序列型 暴发监测
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液质联用技术在大肠埃希菌鉴定和鞭毛抗原分型中的初步应用
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作者 郝佳豪 郭玉梅 +11 位作者 叶佳情 陈东科 高伟利 左惠芬 赵连春 徐向东 宋明慧 郑翠影 冯忠军 赵振军 CHENG Keding 张丽杰 《中国热带医学》 北大核心 2025年第5期533-540,共8页
目的探讨流程简化的液质联用技术(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)在大肠埃希菌(Escherichia coli)实现鉴定和鞭毛抗原分型同步联检分析中的应用潜力。方法基于全基因的蛋白质组学细菌鉴定数据库以及包含大... 目的探讨流程简化的液质联用技术(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)在大肠埃希菌(Escherichia coli)实现鉴定和鞭毛抗原分型同步联检分析中的应用潜力。方法基于全基因的蛋白质组学细菌鉴定数据库以及包含大肠埃希菌所有鞭毛抗原蛋白质的数据库,利用流程简化的LC-MS/MS技术对8株标准菌株以及来源于临床分离出的54株大肠埃希菌同时进行鉴定和鞭毛抗原分型分析;同时使用大肠埃希菌3株标准菌株评估流程简化的LC-MS/MS技术在分型鞭毛抗原时样品稀释倍数和获得的鞭毛抗原肽段数量之间的相关性。结果流程简化的LC-MS/MS技术对62株大肠埃希菌鉴定和鞭毛抗原分型同步联检分析的准确率均为100%;3株大肠埃希菌标准菌株样品系列稀释倍数和获得的鞭毛抗原肽段数量二者之间具有很好的线性关系,相关系数分别为0.99、0.97、0.98。结论流程简化的LC-MS/MS技术能够对大肠埃希菌鉴定和鞭毛抗原分型进行准确的同步联合检测分析,该项技术在大肠埃希菌鉴定和鞭毛抗原分型同步联检分析中优势显著,具有良好的应用前景,未来有望成为临床微生物学和公共卫生领域微生物鉴定、分型及微生态研究的重要工具。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 细菌鉴定 鞭毛抗原分型 质谱 液质联用技术
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一种特定合生元对Apc^(Min/+)小鼠结肠肿瘤发生的抑制作用
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作者 郑姣 吴辉霞 +3 位作者 仝谣 文泓 刘如石 廖旻晶 《中国病理生理杂志》 北大核心 2025年第7期1317-1324,共8页
目的:探讨一种由长双歧杆菌BB536和低聚果糖构成的特定合生元制剂能否调节自发性结肠肿瘤模型小鼠的肠道菌群结构,并抑制其肿瘤发生。方法:6周龄雄性Apc^(Min/+)小鼠随机分为对照组和合生元干预组,每组8只。根据体重,合生元干预组小鼠... 目的:探讨一种由长双歧杆菌BB536和低聚果糖构成的特定合生元制剂能否调节自发性结肠肿瘤模型小鼠的肠道菌群结构,并抑制其肿瘤发生。方法:6周龄雄性Apc^(Min/+)小鼠随机分为对照组和合生元干预组,每组8只。根据体重,合生元干预组小鼠每日通过灌胃补充长双歧杆菌BB536(1×10~9 CFU/kg)和低聚果糖(2 g/kg),而对照组小鼠每日灌胃灭菌水,持续10周。比较对照组和合生元干预组小鼠结肠肿瘤的数量和体积,通过苏木素-伊红染色、阿利新蓝染色及免疫组化方法观察分析结肠组织切片,通过16S rRNA测序分析结肠菌群结构,并通过有参转录组测序、定量聚合酶链式反应分析差异基因的表达情况。结果:合生元干预可显著增加小鼠结肠内菌群α多样性以及双歧杆菌的相对丰度(P<0.01),同时干预组小鼠结肠肿瘤数目和体积显著减少(P<0.01),Ki-67表达显著降低(P<0.01),结肠组织内杯状细胞的数量和上皮细胞间紧密连接蛋白(ZO-1和occludin)的表达显著升高(P<0.05)。结论:该合生元制剂对Apc^(Min/+)小鼠的肠道菌群结构具有一定调节作用,并对结肠肿瘤具有抑制作用。 展开更多
关键词 结直肠癌 肠道菌群 益生菌 益生元 合生元
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北京市某区腹泻患者感染小肠结肠炎耶尔森菌病原特征分析
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作者 刘雨薇 王海瑞 +6 位作者 张彦春 李首飞 王洛桐 王苗 闫爱霞 李颖 张茂俊 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第6期609-616,共8页
目的对北京市某区监测腹泻患者的粪便标本进行小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica,Ye)分离培养并对分离菌株进行病原特征分析,为Ye感染的防治提供基础数据。方法收集2019年1月至2024年6月期间北京市某区腹泻患者信息和粪便标... 目的对北京市某区监测腹泻患者的粪便标本进行小肠结肠炎耶尔森菌(Yersinia enterocolitica,Ye)分离培养并对分离菌株进行病原特征分析,为Ye感染的防治提供基础数据。方法收集2019年1月至2024年6月期间北京市某区腹泻患者信息和粪便标本。对粪便标本进行基于荧光PCR初筛下的增菌培养;对分离株完成菌种鉴定及抗生素敏感性检测。通过荧光PCR以及全基因组测序进行菌株的毒力基因分布及其它遗传特征分析。结果1439例腹泻患者共分离到Ye菌株11株,检出率为0.76%(11/1439)。加上既往1例阳性患者,12例Ye阳性患者年龄介于6~41岁;患者粪便性状构成比为水样便66.67%(8/12)、稀便33.33%(4/12);患者出现恶心、呕吐、发热的频率分别为41.67%(5/12)、41.67%(5/12)、8.33%(1/12)。12株Ye对TET、AMP和NAL三种抗生素的耐药率分别为50.00%(6/12)、33.33%(4/12)和25.00%(3/12),1株Ye菌为多重耐药菌株,耐药谱为ETP+MEM+TET+CIP+NAL+AMP。5种Ye毒力基因荧光PCR检测结果显示2株Ye为ystA+/ystB-型(ystA+/ystB-/ail+/yadA+/virF+),10株Ye为ystA-/ystB+型(ystA-/ystB+/ail-/yadA-/virF-)。基于基因组序列的VFDB数据库比对分析发现12株YE共预测出106个毒力基因和12种毒力基因谱,所有菌株均普遍携带11个关键毒力基因,包括黏附、入侵、蛋白酶及鞭毛运动相关基因。仅在2株ystA+/ystB-Ye预测到含有与TTSS分泌系统、ABC转运蛋白功能紧密关联的遗传元件。结论腹泻病例粪便分离培养ystA-/ystB+型Ye存在漏检的可能,粪便增菌液荧光PCR筛查对ystA-/ystB+型Ye分离率提升具有重要意义;腹泻病例分离Ye呈现遗传特征多样性,且含有多种类型毒力基因。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 腹泻 耐药 全基因组测序
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Salmonella Java导致食源性疾病暴发事件的实验室检测
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作者 刘雨薇 丁伟 +7 位作者 张爽 赵宇 李首飞 闫爱霞 李颖 逄波 孙雪荣 李臻鹏 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第9期960-966,共7页
目的对食源性疾病暴发事件中分离的沙门菌进行鉴定和病原特征分析。方法收集流行病学资料并采集病例粪便、厨师粪便、餐厅食品及环境样本,采用荧光PCR检测、细菌分离培养、血清分型、四重荧光PCR鉴定、全基因组测序和抗生素敏感性检测... 目的对食源性疾病暴发事件中分离的沙门菌进行鉴定和病原特征分析。方法收集流行病学资料并采集病例粪便、厨师粪便、餐厅食品及环境样本,采用荧光PCR检测、细菌分离培养、血清分型、四重荧光PCR鉴定、全基因组测序和抗生素敏感性检测等方法进行研究。结果从2名暴发病例和2名散发监测病例的粪便样本增菌后检测到4株沙门菌,血清式为1,4,12:b:1,2,均为ST42型Salmonella Java。4株基因组特征相似,均携带9个毒力岛和98种毒力基因;耐药表型均为STR单重耐药,携带氨基糖苷类耐药基因aac(6')-Iy和aac(6')-Iaa。结论此次事件是国内首次报道由S.Java导致的食源性疾病暴发,提示该菌株在本地区可能存在一定流行水平。建议餐饮行业优化食品加工流程并加强高风险病原监测,同时需进一步研究S.Java与乙型副伤寒沙门菌的鉴别诊断及致病机制差异,为国内S.Java相关监测研究提供基础资料。 展开更多
关键词 沙门菌 食源性疾病 荧光PCR 毒力基因 耐药基因
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重庆城口地区家养山羊携带产志贺毒素大肠埃希菌情况及其分子特征分析
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作者 彭晶晶 胡彬 +8 位作者 杨茜 李轶 黄海 刘文双 孟宇 王礼君 熊衍文 袁毅 侯配斌 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第5期529-536,共8页
目的了解重庆城口地区家养山羊中产志贺毒素大肠埃希菌的携带情况、耐药情况及分子特征。方法2023年8月采集重庆城口辖区内不同村镇养殖户的羊粪便样本283份。经EC肉汤增菌后接种选择性培养基进行产志贺毒素大肠埃希菌菌株分离,对stx1/s... 目的了解重庆城口地区家养山羊中产志贺毒素大肠埃希菌的携带情况、耐药情况及分子特征。方法2023年8月采集重庆城口辖区内不同村镇养殖户的羊粪便样本283份。经EC肉汤增菌后接种选择性培养基进行产志贺毒素大肠埃希菌菌株分离,对stx1/stx2阳性菌株进行耐药性分析和全基因组测序。通过全基因组序列分析菌株stx基因亚型、血清型、多位点序列型、毒力基因和耐药基因携带情况并进行系统进化分析。结果从283份羊粪样本中检出46株产志贺毒素大肠埃希菌,检出率为16.25%。46株菌分为12种O∶H血清型,最常见的是O76∶H19和O8∶H7,各为9株;O157∶H7型5株。MLST型有11种,ST675、ST196为优势型别,均为9株菌,占比均为19.57%。菌株共分为7种不同stx亚型及组合,主要为stx1c亚型(26/46,56.52%),其次为stx2k亚型(9/46,19.57%),其中9株stx2k亚型菌株血清型和MLST型均为O8∶H7和ST196。在耐药表型检测实验中,46株菌中对氨苄西林耐药的有2株,对氨苄西林/舒巴坦、头孢唑啉及头孢西丁耐药的各1株。鉴定出的9株产2k亚型志贺毒素大肠埃希菌(Stx2k-STEC)菌株虽然均携带β-内酰胺类耐药相关基因blaEC-18,但药敏试验显示对检测的15种抗菌药物均敏感。系统进化分析显示9株Stx2k-STEC菌株高度相似,但与中国其他地区的Stx2k-STEC分离株的遗传差异较大。结论重庆城口地区家养山羊为STEC的重要动物宿主,并携带与国内其他地区不同克隆的Stx2k-STEC新菌型。 展开更多
关键词 产志贺毒素大肠埃希菌 志贺毒素2k亚型 血清分型 药物敏感性检测 全基因组测序
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基于GMrepo数据库的抑郁症患者肠道菌群特征及抑郁症与肠道菌群的关联性分析
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作者 孙晓 王旖旎 +2 位作者 高方胜 张莹 林平 《吉林大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期157-163,共7页
目的:基于肠道菌群GMrepo数据库,在排除性别、年龄、体质量指数(BMI)和国家等影响因素后探讨抑郁组与对照组研究对象的差异菌群,并进一步分层阐明不同年龄和性别抑郁症患者的差异肠道菌群特征。方法:从GMrepo数据库筛选研究对象,表现型... 目的:基于肠道菌群GMrepo数据库,在排除性别、年龄、体质量指数(BMI)和国家等影响因素后探讨抑郁组与对照组研究对象的差异菌群,并进一步分层阐明不同年龄和性别抑郁症患者的差异肠道菌群特征。方法:从GMrepo数据库筛选研究对象,表现型分别为“depression”和“health”,根据纳入标准和排除标准下载筛选后研究对象的相关菌群丰度数据集。通过SPSS 27.0统计软件的病例配对功能,根据性别(1∶1)、年龄(±5岁)、BMI(±1.5 kg·m^(-2))和国家(1∶1)匹配对照组及抑郁组研究对象各95例;采用非参数检验对肠道菌群进行单因素分析,筛选假设检验下P<0.05的差异菌群;采用Wald向前逐步选择法二元Logistic回归分析构建模型,根据性别(男性、女性)和年龄(≤65岁、>65岁)进行分层分析,根据比值比(OR)与显著性水平(P值)确定不同层次下对照组人群与抑郁症患者之间有关系有意义的差异菌群。结果:回归分析,与对照组比较,抑郁组患者普雷沃特菌(Paraprevotella)[OR=0.661,95%置信区间(CI)=0.489~0.893,P=0.007]和普氏菌(Prevotella)(OR=0.946,95%CI=0.903~0.992,P=0.022)丰度明显偏低,是抑郁症发生的保护因素。男性人群中Paraprevotella(OR=0.358,95%CI=0.146~0.883,P=0.026)为抑郁组与对照组之间的差异性菌群,女性人群中粪杆菌(Faecalibacterium)(OR=0.565,95%CI=0.322~0.990,P=0.046)和另枝菌属(Alistipes)(OR=0.513,95%CI=0.289~0.911,P=0.023)为抑郁组与对照组之间的差异性菌群,年龄≤65岁的人群中Prevotella(OR=0.654,95%CI=0.476~0.899,P=0.009)为差异性菌群。结论:Paraprevotella、Prevotella、Faecalibacterium和Alistipes为抑郁症的特征性肠道菌群,其丰度改变可能会对抑郁症的发生发展产生重要影响。 展开更多
关键词 抑郁症 肠道菌群 GMrepo数据库 差异菌群
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