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甘肃省前3例猴痘病例流行病学特点和基因组序列特征分析 被引量:1
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作者 张慧 王彪 +7 位作者 张晓曙 董茂星 梁舒 赵哲 陈建华 魏孔福 魏欢 王淼 《病毒学报》 北大核心 2025年第2期354-360,共7页
了解甘肃省前3例猴痘病例流行病学特征和基因组特征及遗传变异情况,为甘肃省猴痘的防控提供科学依据。对甘肃省报告的前3例猴痘病例开展流行病学调查并采集相应样本,利用Illumina mini-seq二代测序仪完成猴痘病毒全基因组测序和数据处理... 了解甘肃省前3例猴痘病例流行病学特征和基因组特征及遗传变异情况,为甘肃省猴痘的防控提供科学依据。对甘肃省报告的前3例猴痘病例开展流行病学调查并采集相应样本,利用Illumina mini-seq二代测序仪完成猴痘病毒全基因组测序和数据处理,采用生物信息学软件对病毒全基因组序列进行遗传特征、谱系分型和进化树溯源分析。甘肃省报告的前3例猴痘病例均症状较轻,主要为疱疹伴瘙痒和神经疼痛,无发热等全身症状,主要传播途径为男男性行为密切接触,但使用安全套可能无法有效阻断传播;测序获得的全基因组序列全长分别为病例1(GanSu-JC)197199 bp;病例2(GanSu-LZ)197200 bp;病例3(GanSu-BY)197199 bp,基因组覆盖度分别为97.12%、99.37%、99.38%,与参考序列(NC_063383.1)相比3例病例猴痘病毒基因组序列分别存在78、88、87处核苷酸突变,分别有38、42、42个氨基酸发生突变,涉及宿主免疫调控、病毒致病性等生物特性发生改变;系统遗传进化分析显示,GanSu-JC序列与韩国提交的序列遗传进化亲缘关系较近;GanSu-LZ和GanSu-BY序列与中国深圳、云南提交的序列遗传进化亲缘关系较近,均属于Ⅱb C.1谱系。甘肃省报告的前3例猴痘病例均为西非亚型Ⅱb C.1谱系,兰州市2023年底之前很可能已存在猴痘病例,提示甘肃应加强猴痘防控宣教、鉴别诊断和防治工作。 展开更多
关键词 猴痘病毒 流行病学特点 基因序列特征
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2023年云南省手足口病病原谱及柯萨奇病毒A2型VP1区基因特征
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作者 寸建萍 姜黎黎 +6 位作者 李楠 曹亿会 周晓芳 杨溪 伏晓庆 张勇 田炳均 《华南预防医学》 2025年第12期1363-1366,共4页
目的了解云南省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原构成及柯萨奇病毒A2型(coxsackievirus A2,CVA2)的VP1基因特征。方法选取2023年云南省手足口病病例标本中经实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定为肠道病毒阳性的... 目的了解云南省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原构成及柯萨奇病毒A2型(coxsackievirus A2,CVA2)的VP1基因特征。方法选取2023年云南省手足口病病例标本中经实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定为肠道病毒阳性的标本进行病毒分离培养。通过RT-PCR对分离株肠道病毒结构蛋白VP4/VP2结合区和VP1区进行扩增并测序,并对其中7株CVA2毒株进行基因序列比较与进化分析。结果1488份粪便样本中共分离获得184株毒株,总分离率为12.71%(184/1448),其中A组肠道病毒占94.02%(173/184),涵盖6个血清型;B组肠道病毒占3.80%(7/184),涉及4个血清型;C组病毒4株占2.17%。基于完整的VP1序列系统进化分析显示:CVA2病毒可分为4个基因型(A~D),本研究分离的7株CVA2均属于基因型D分支2。序列分析显示,本研究7株CVA2分离株间VP1区核苷酸和氨基酸相似性分别为93.23%~99.89%和99.30%~100.00%。结论2023年云南省HFMD病原呈现多样性,以A组肠道病毒为主。2023年云南省HFMD病例分离的CVA2主要是基因型D。未来需进一步加强对肠道病毒的实验室监测及分子流行病学分析,为手足口病防控提供依据。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A组2型 VP1基因 基因特征分析
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柯萨奇病毒B组4型TaqMan探针一步法实时荧光定量PCR检测方法的建立及验证 被引量:1
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作者 郭伟 陈俊薇 +3 位作者 刘煜菡 张名 冯昌增 马绍辉 《中国生物制品学杂志》 2025年第2期167-171,共5页
目的建立柯萨奇病毒B组4型(Ccoxsackievirus B4,CVB4)Taq Man探针一步法实时荧光定量PCR(real-time fluo-rescence quantitative PCR,RT-q PCR)检测方法,并进行验证,以期为CVB4的快速定量检测提供可靠方法。方法选择CVB4的VP1序列中较... 目的建立柯萨奇病毒B组4型(Ccoxsackievirus B4,CVB4)Taq Man探针一步法实时荧光定量PCR(real-time fluo-rescence quantitative PCR,RT-q PCR)检测方法,并进行验证,以期为CVB4的快速定量检测提供可靠方法。方法选择CVB4的VP1序列中较保守部分,设计引物和探针;经体外转录获得阳性RNA标准品,绘制标准曲线,建立CVB4的Taq Man探针一步法RT-q PCR法。验证方法的灵敏度、线性范围、重复性、特异性。应用建立的方法检测16份临床样本。结果方法的检测灵敏度为10~3copies/μL;阳性RNA标准品在10^(3)~10^(10)copies/μL范围内,与荧光单位(relative fluorescence unit,RFU)具有良好的线性关系,线性方程为:y=-3.742 x+48.651,R^(2)为0.998;重复性验证CV<2%;与柯萨奇病毒B组其他血清型CVB2、CVB3、CVB5、CVB6,肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71),柯萨奇病毒A组(Coxsackie virus A,CVA)8、10、12型(CVA8、CVA10、CVA12),埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)均无交叉反应。16份临床样本中12份为CVB4阳性。结论建立的Taq Man探针一步法RT-q PCR检测方法具有较好的灵敏度、特异性和重复性,可用于CVB4临床样品的检测。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒B组4型 TAQMAN探针 实时荧光定量PCR
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柯萨奇病毒A组16型中国分离株(Cox.A16 SHZH00-1)全基因组序列测定及分析 被引量:61
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作者 李琳琳 何雅晴 +4 位作者 朱俊萍 薛颖 朱雅芳 徐星晔 金奇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期217-222,共6页
对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′U... 对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6582个核苷酸,编码一个含2193个氨基酸残基的多聚蛋白,3′端非编码区长为83bp。Cox.A16SHZH00-1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%。Cox.A16SHZH00-1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组16型 基因组 手足口病 同源性 序列分析 中国分离株 儿童
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中国柯萨奇病毒A组16型部分VP1区序列测定及系统进化分析 被引量:19
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作者 卫灿东 李琳琳 +3 位作者 何雅晴 徐星晔 薛颖 金奇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期223-227,共5页
利用1999~2004年连续6年从中国深圳及北京地区分离的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)毒株的部分VP1区基因序列进行分析和研究,试图找出中国Cox.A16的种系进化规律和分型依据.6株Cox.A16病毒部分VP1区核苷酸和氨基酸同... 利用1999~2004年连续6年从中国深圳及北京地区分离的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)毒株的部分VP1区基因序列进行分析和研究,试图找出中国Cox.A16的种系进化规律和分型依据.6株Cox.A16病毒部分VP1区核苷酸和氨基酸同源性均较高,相互间核苷酸同源性为94.5%~98.0%,氨基酸同源性为97.8%~100%.6株中国分离株与Cox.A16国际参考株相比,部分VP1区核苷酸同源性高于78.2%,氨基酸同源性高于为93.3%.基因系统进化分析表明,中国大陆分离的6株Cox.A16与中国台湾流行株Tainan-5079-98(AF177911),与4株日本分离株、瑞典株及美国株GA95-2095(AF081613)、PA94-5753(AF081628)的关系均较近,核苷酸同源性大于93.3%.了解我国Cox.A16流行株的遗传学背景和种系进化关系,对有效地预防和控制Cox.A16流行有重要意义. 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组16型 手足口病 系统进化分析 VP1区 序列测定 中国分离株 儿童
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2010年浙江省部分地区急性出血性结膜炎暴发疫情病原学研究 被引量:13
6
作者 严菊英 陈寅 +3 位作者 李榛 龚黎明 卢亦愚 张严峻 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期421-426,共6页
为查明引起2010年浙江省急性出血性结膜炎(AHC)暴发疫情的病因,并对病原进行分子溯源。本研究采用荧光RT-PCR方法直接从患者眼拭子样本中检测肠道病毒(EV)和柯萨奇病毒A24变异株(CA24v)核酸;用Hep-2细胞分离病毒,对阳性分离物提取病毒... 为查明引起2010年浙江省急性出血性结膜炎(AHC)暴发疫情的病因,并对病原进行分子溯源。本研究采用荧光RT-PCR方法直接从患者眼拭子样本中检测肠道病毒(EV)和柯萨奇病毒A24变异株(CA24v)核酸;用Hep-2细胞分离病毒,对阳性分离物提取病毒核酸后进行VP1全基因和3C蛋白酶区(3C)扩增和测序,同源性与进化分析。结果13份眼拭子样本中EV和CA24v核酸均阳性8份,分离到CA24v6株。选取4株病毒测序,获得VP1全长均为915个核苷酸(nt),3C区全长495nt,VP1和3C区均没有nt插入和缺失。2010年浙江4株CA24v分离株之间在3C区和VP1区核苷酸和氨基酸(aa)高度同源,2010年浙江CA24v分离株与原型株EH24/70在3C区的nt和aa同源性分别为85.2%~85.8%和96.2%~96.7%,与2002~2008年浙江、云南和广东CA24v株的同源性分别为93.4%~96.2%和96.7%~99.3%;浙江2010年CA24v株在3C区进化树的GⅣ基因亚型C4分枝上(GⅣ-C4),在VP1基因进化树的人类肠道病毒C组(EV-C)CA24v分枝上。研究表明引起2010年浙江省急性出血性结膜炎暴发流行的病原为CA24v,GⅣ基因亚型,与引起2002~2008年浙江AHC流行的CA24v株(GⅣ)具有密切的亲缘关系,推测CA24v病毒自2002年以来一直在本地低强度循环,2010年又导致了浙江AHC的暴发。 展开更多
关键词 急性出血性结膜炎(AHC) 暴发 柯萨奇病毒A24变异株(CA24v) GIV 分子溯源
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黄芪皂甙对小鼠柯萨奇B_3病毒性心肌炎的治疗作用 被引量:49
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作者 丁继军 章同华 沈茜 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第9期666-668,共3页
目的:探讨黄芪皂甙对 B A L B/c 小鼠柯萨奇 B3 ( C V B3 )病毒性心肌炎的治疗作用。方法:雄性 B A L B/c 小鼠腹腔接种 C V B3 ,制成急性病毒性心肌炎模型,接种1 h 后腹腔内注入黄芪皂甙 5.64×... 目的:探讨黄芪皂甙对 B A L B/c 小鼠柯萨奇 B3 ( C V B3 )病毒性心肌炎的治疗作用。方法:雄性 B A L B/c 小鼠腹腔接种 C V B3 ,制成急性病毒性心肌炎模型,接种1 h 后腹腔内注入黄芪皂甙 5.64×10- 3 m g/g,1 次/d ×7 d,观测小鼠存活率、血浆乳酸脱氢酶( L D H)和谷草转氨酶( G O T)、体温、心肌病理变化和心肌病毒滴度的影响。结果:黄芪皂甙治疗组比病毒感染组存活率明显增高,血浆 L D H 和 G O T 明显降低,体温保持正常,心脏质量/体质量值显著降低,心肌病理变化减轻,心肌匀浆病毒滴度降低( P< 0.05)。结论:黄芪皂甙有治疗病毒性心肌炎的作用。 展开更多
关键词 黄芪皂甙 柯萨奇病毒B组 心肌炎 小鼠
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手足口病柯萨奇病毒A10和A6型的分子鉴定及其VP1区3′端序列分析 被引量:24
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作者 任倩 张乐海 +4 位作者 马丽霞 王世富 吕欣 张忠 于爱莲 《中国病原生物学杂志》 CSCD 2011年第8期561-564,570,共5页
目的鉴定手足口病患儿咽拭子病原体柯萨奇病毒A10(CVA10)和A6(CVA6),并对其VP1编码区3′端序列进行分析。方法合成对肠道病毒VP1区3′端序列具有较高特异性的兼并引物040-011,RT-PCR方法测定其VP1区3′端基因序列,通过BLAST程序比对... 目的鉴定手足口病患儿咽拭子病原体柯萨奇病毒A10(CVA10)和A6(CVA6),并对其VP1编码区3′端序列进行分析。方法合成对肠道病毒VP1区3′端序列具有较高特异性的兼并引物040-011,RT-PCR方法测定其VP1区3′端基因序列,通过BLAST程序比对,鉴定病毒的基因型;与GenBank中其他已知病毒基因型序列进行同源性分析,构建遗传进化树。结果 38例非EV71非CVA16引起的手足口病患儿咽拭子,5例检测到CVA10,1例检测到CVA6。在进化关系上CVA10与D基因型最为密切,核苷酸和氨基酸同源性分别为92.7%~94.2%、91.7%~100%;CVA6与2003~2009年报告的部分毒株核苷酸同源性为86.8%~90.2%,其中与2008年台湾EU908148的毒株同源性最高;氨基酸同源性为85.2%~89.0%。结论兼并引物040-011对CVA10和CVA6有良好的基因扩增特异性;引起手足口病的肠道病毒除EV71和CVA16外,CVA10和CVA6也是重要的病原;鉴于2008年芬兰和2009年山东省文登市CVA10引起的手足口病暴发,应加强对手足口病病原的检测和分型,以了解柯萨奇病毒在手足口病中的位置,掌握其遗传进化特征。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A10型 柯萨奇病毒A6型 VP1区域 基因序列分析
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2008~2009年青岛地区手足口病病原学的调查分析 被引量:21
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作者 汪照国 刘晓琳 +1 位作者 杨婷婷 弋英 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期438-441,共4页
本研究对2008~2009年青岛地区手足口病的病原学进行调查研究。首先对HFMD病例的咽拭子标本直接进行病毒核酸的提取,然后采用多重荧光逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法对总肠道病毒(Enterovirus,EV)、肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,... 本研究对2008~2009年青岛地区手足口病的病原学进行调查研究。首先对HFMD病例的咽拭子标本直接进行病毒核酸的提取,然后采用多重荧光逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法对总肠道病毒(Enterovirus,EV)、肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus Group A 16,CVA16)进行检测,对EV阳性而EV71和CVA16均阴性的标本采用半巢式反转录PCR进行肠道病毒VP1基因部分序列的扩增和序列分析以鉴定其血清型别。结果提示2008~2009年青岛地区手足口病的主要病原为EV71和CVA16,无论轻症和重症病例,EV71的比例都大于CVA16。2008年共获得5个(8株)其它血清型,分别是柯萨奇病毒(Cox-sackievirus,CV)的A5、A6、A10、A12及埃可病毒9(Echovirus 9,E9),血清型分布比较分散、均匀。2009年共获得3个其它血清型(13株),分别是CVA9、CVA12及CVB2,CVA12所占比例较大(11/13),分布比较集中。CVA12成为2009年青岛地区HFMD病原中除EV71和CVA16外,新的较为流行的病原。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒 病原学 血清型
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住院儿柯萨奇病毒B组感染状况的分析 被引量:8
10
作者 方凤 蒋瑾瑾 +3 位作者 陈若华 沈茜 方超萍 蒋玉淮 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期469-471,共3页
目的 :分析近 3年院内柯萨奇病毒 B组感染状况 ,认识柯萨奇病毒 B组与小儿疾病的内在关系。 方法 :观察了 796例病儿 ,其中上呼吸道感染 2 18例、肺炎 179例、哮喘 10 6例、心肌炎 15 5例、紫癜 19例、其他疾病 89例。采用 EL ISA方法... 目的 :分析近 3年院内柯萨奇病毒 B组感染状况 ,认识柯萨奇病毒 B组与小儿疾病的内在关系。 方法 :观察了 796例病儿 ,其中上呼吸道感染 2 18例、肺炎 179例、哮喘 10 6例、心肌炎 15 5例、紫癜 19例、其他疾病 89例。采用 EL ISA方法检测柯萨奇病毒 B组 (CVB)的抗原 (CVB- Ag)和抗体 Ig M(CVB- Ig M)。结果 :(1)上呼吸道感染组和肺炎组 CVB阳性率分别是47.2 5 %和 48.0 4% ,两组间无统计学差异 ;(2 )哮喘、心肌炎和紫癜儿 CVB阳性率分别是 6 2 .2 6 %、6 1.2 9%和 6 8.42 % ,三组间比较无统计学差异 ,但 CVB阳性率均高于上呼吸道感染组和肺炎组 (P<0 .0 5 ) ;(3)其他疾病组和健康儿 CV B感染发生率均低 (分别是 15 .73%和 3.33% ) ,两组间无差异。 结论 :CVB感染与小儿多种疾病相关 ,尤其应该重视研究 CVB感染与哮喘、病毒性心肌炎和过敏性紫癜发病的内在联系。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒B组 呼吸道感染 哮喘 心肌炎 紫癜 儿童
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中国柯萨奇病毒B5的全基因组测序及其序列分析 被引量:12
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作者 胡永峰 赵丽娜 +4 位作者 董杰 吴志强 杜江 薛颖 杨帆 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期283-289,共7页
本文对我国首株与手足口病相关的柯萨奇病毒B5(01/CVB5/SD/CHN/09,CVB5/09)进行了基因组测序并与现有的相关序列进行了比较和进化分析。CVB5/09基因组长7399nt,共编码氨基酸2185aa,与现有的CVB5基因组核酸序列相似性在80.6%~85.3%之间... 本文对我国首株与手足口病相关的柯萨奇病毒B5(01/CVB5/SD/CHN/09,CVB5/09)进行了基因组测序并与现有的相关序列进行了比较和进化分析。CVB5/09基因组长7399nt,共编码氨基酸2185aa,与现有的CVB5基因组核酸序列相似性在80.6%~85.3%之间,氨基酸序列相似性在96.1%~96.9%。进化分析发现,利用不同的基因组片段P1、P2和P3区构建的进化树中,CVB5/09分别处在不同的进化分支上,不同基因组片段有着不同的进化速率。Simplot相似性分析没有发现基因组有明显的重组发生。本文完成了我国第1株柯萨奇病毒B5全基因组序列的测定,通过与其它相关病毒的比较分析深入了解其遗传特征,以期为手足口病的流行病学调查和预防控制提供有价值的信息。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒B5 基因组测序 序列分析
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2010年福建省手足口病患者中柯萨奇B5病毒的序列分析 被引量:12
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作者 翁育伟 周朝晖 +2 位作者 陈炜 郑奎城 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1086-1089,共4页
目的了解福建省手足口病患者中CVB5(Coxsackie virus B5)病毒的变异及进化特征。方法采集2010年福建省手足口病例呼吸道标本,经RD细胞分离肠道病毒。病毒分离上清用于RNA提取并经RT-PCR法鉴定病毒型别。对鉴定为其他肠道病毒(非EV71或CV... 目的了解福建省手足口病患者中CVB5(Coxsackie virus B5)病毒的变异及进化特征。方法采集2010年福建省手足口病例呼吸道标本,经RD细胞分离肠道病毒。病毒分离上清用于RNA提取并经RT-PCR法鉴定病毒型别。对鉴定为其他肠道病毒(非EV71或CVA16)的病毒,扩增病毒完整VP1区,扩增产物经克隆、筛选后测序。应用Mega软件对病毒VP1序列进行比较和种系进化分析。结果从2010年福建省手足口病患者中扩增得到6株完整的VP1区序列,序列比对证实有4株CVB5病毒,其他2株为Echo9病毒。序列差异比较表明,分离自福建省的CVB5病毒一致性程度较高,在种系进化上处于独立的进化分支,而与国内其他省份或其他国家的CVB5病毒分离株比较则有较大差异。结论 2010年福建省手足口病患者中存在CVB5病毒的感染,病毒与既往其它省份分离株有较大差异,提示CVB5病毒在福建省具有独特的传播链。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇B5 种系分析
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2002~2004年浙江省无菌性脑膜炎暴发疫情的病原学研究 被引量:7
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作者 严菊英 卢亦愚 +4 位作者 徐昌平 余昭 龚黎明 陈寅 张严峻 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期462-468,共7页
2002~2004年浙江省发生了无菌性脑膜炎暴发疫情,为了及时查明病因,分析病原的分子特征并进行病原溯源,我们采集患者脑脊液和粪便样本271份,用RD和Hep-2细胞同时分离病毒,对分离株VP1和VP4/VP2基因测序,进行同源性与进化分析。结果从27... 2002~2004年浙江省发生了无菌性脑膜炎暴发疫情,为了及时查明病因,分析病原的分子特征并进行病原溯源,我们采集患者脑脊液和粪便样本271份,用RD和Hep-2细胞同时分离病毒,对分离株VP1和VP4/VP2基因测序,进行同源性与进化分析。结果从271份样本中分离到埃柯病毒30型(E30)78株;对31株分离株VP1区核苷酸(nt)序列测定,其长度均为876nt,推导编码292个氨基酸(aa)。浙江E30株与原型株Bastianni在VP1区的nt和aa同源性分别为84.7%~86.3%和92.1%~94.2%;浙江E30株之间nt和aa的同源性分别为87.1%~99.4%和96.2%~100%。在VP1基因进化树上浙江E30株分别位于G和H基因亚型分支上,与浙江E30G亚型株亲缘关系最近的国内外毒株分别为2003年江苏、山东株和1999年乌克兰株;与浙江E30H亚型株亲缘关系最近的毒株为2008年韩国株。VP4/VP2区同源性与进化分析结果与VP1相似。结果表明2002~2004年浙江省无菌性脑膜炎暴发疫情由E30G和H二类不同基因亚型流行株引起;H基因亚型株推测为新的E30变异株,首先分离于2002年浙江省。 展开更多
关键词 暴发 无菌性脑膜炎 埃柯病毒30型 序列分析 系统发生树
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柯萨奇病毒A组16型中和抗体检测方法的实验室评价 被引量:9
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作者 毛群颖 邵杰 +10 位作者 罗震 高帆 安文琪 郝春生 高强 杨二霞 韩金乐 李振平 王一平 梁争论 徐苗 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2014年第6期829-834,842,共7页
目的评价柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)中和抗体检测方法于不同实验室内和实验室间的可重复性。方法参照WHO脊髓灰质炎病毒中和抗体检测方法,建立CA16中和抗体检测方法和实验标准;收集22份血清样品,对CA16 A基因型毒株G10... 目的评价柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)中和抗体检测方法于不同实验室内和实验室间的可重复性。方法参照WHO脊髓灰质炎病毒中和抗体检测方法,建立CA16中和抗体检测方法和实验标准;收集22份血清样品,对CA16 A基因型毒株G10及B基因型毒株W190、33、203、P11和CS02毒株独立进行CA16中和抗体有效检测实验,评价所建立的检测方法于A^G实验室内和实验室间的可重复性;分别于A、B、C、D和E实验室比较G10毒株与W190、33、203、P11和CS02毒株对CA16中和抗体检测结果的影响。结果在各实验室内,有17/22份血清样品的变异系数(variable coefficient,CV)在0~11.4%之间,表明该检测方法在同一实验室内具有较好的可重复性;在实验室间,除3份低效价血清和1份效价过高血清外,其余血清样品的几何平均滴度(geometric mean titer,GMT)最大差异倍数均在3.0倍以内,实验室间检测差异在可接受范围内;W190、33、203、P11和CS02毒株与G10毒株检测结果趋势相近。在同一实验室内,W190和33毒株与G10毒株的检测结果差异无统计学意义;203、P11和CS02毒株的检测结果均低于G10毒株,差异有统计学意义,表明B基因型毒株与A基因型毒株生物学活性存在一定差异。结论以G10毒株检测CA16中和抗体的方法在各协作实验室可得到良好应用,有利于CA16中和抗体检测的标准化,但适用性需进一步评估和验证。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组16型 中和抗体 基因型
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柯萨奇病毒A6型VP1蛋白的生物信息学分析 被引量:15
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作者 刘洪波 阳广菲 +1 位作者 欧维琳 沈关心 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期536-541,共6页
目的:预测柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)的衣壳蛋白VP1的基本理化性质、结构功能及线性B细胞表位。方法:应用Bioedit软件、Sub Loc、Target P和生物信息学资源门户Ex PASy中的多种在线工具对CVA6 VP1的氨基酸序列进行... 目的:预测柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)的衣壳蛋白VP1的基本理化性质、结构功能及线性B细胞表位。方法:应用Bioedit软件、Sub Loc、Target P和生物信息学资源门户Ex PASy中的多种在线工具对CVA6 VP1的氨基酸序列进行分析。结果:CVA6 VP1为一亲水性蛋白,其相对分子量为33.6 k D,等电点为7.92,含有24个可能的磷酸化位点,没有信号肽、跨膜区和可能的脂酰化位点;其二级结构中以无规则卷曲居多,有48.52%的氨基酸残基暴露于溶液界面;该分子内存在多个潜在的线性B细胞表位,其中的155~165位氨基酸残基区域的抗原指数最高。结论:成功预测到CVA6 VP1的基本理化性质、结构功能特征及可能的线性B细胞表位,为该蛋白的进一步研究及疫苗和免疫诊断试剂的研制打下基础。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组6型 VP1蛋白 生物学信息 B细胞表位 理化性质
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新疆生产建设兵团手足口病柯萨奇病毒A6型的流行及其基因特征分析 被引量:8
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作者 郭景霞 李红叶 +2 位作者 刘玉霞 王建平 李凡卡 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第2期181-184,188,共5页
目的了解新疆生产建设兵团地区柯萨奇病毒A6(CVA6)的流行特点并对其基因特征进行分析。方法对2014-2016年新疆生产建设兵团地区收集的手足口病非肠道病毒71型(EV71)非柯萨奇病毒A16型(CVA16)阳性标本进行CVA6荧光定量PCR检测,采用RT-PC... 目的了解新疆生产建设兵团地区柯萨奇病毒A6(CVA6)的流行特点并对其基因特征进行分析。方法对2014-2016年新疆生产建设兵团地区收集的手足口病非肠道病毒71型(EV71)非柯萨奇病毒A16型(CVA16)阳性标本进行CVA6荧光定量PCR检测,采用RT-PCR扩增CVA6阳性标本中VP1编码区基因,并进行核苷酸序列测定与分析;利用MEGA6.06与GenBank代表株进行核苷酸同源性分析并构建系统进化树。结果2014-2016年采集的CVA6阳性标占在非EV71非CVA16阳性标本的82.39%,68株CVA6流行株之间VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为92.5%~100.0%和98.9%~100.0%,系统发育树显示97条CVA6序列共形成A-D 4个分支,其中D分支进一步分为D1-D3 3个亚分支。CVA6流行株中的5株处于D2亚分支,63株处于D3亚分支。结论新疆生产建设兵团地区2014-2016年手足口病非EV71非CVA16肠道病毒以CVA6为主,基于VP1系统发育分析分为A-D 4个分支,D分支中的D2和D3亚分支并存,其中D3亚分支是优势流行株。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A6型 VP1编码区 系统发育树
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柯萨奇病毒A组16型VP1蛋白的原核表达及其免疫原性 被引量:6
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作者 杨永娟 郝春生 +5 位作者 李懿 宋冬梅 刘宇 马淑花 田龙 李秀玲 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2013年第1期1-4,8,共5页
目的原核表达柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus group A type 16,CA16)VP1蛋白,并检测其免疫原性。方法通过RT-PCR法从CA16病毒青岛株中扩增VP1基因,克隆至原核表达载体pET43.1a(+)中,构建重组表达质粒pET43.1a-VP1,转化感受态E.coli R... 目的原核表达柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus group A type 16,CA16)VP1蛋白,并检测其免疫原性。方法通过RT-PCR法从CA16病毒青岛株中扩增VP1基因,克隆至原核表达载体pET43.1a(+)中,构建重组表达质粒pET43.1a-VP1,转化感受态E.coli Rossatte(DE3),IPTG诱导表达。表达的重组CA16 VP1蛋白通过Ni柱亲和层析纯化后,采用不同剂量(5、10、20、40μg)免疫BALB/c小鼠,ELISA法检测血清中特异性IgG、IgG1、IgG2a、IgG2b、IgG3抗体效价,微量细胞病变抑制法检测血清中和抗体效价。结果重组表达质粒pET43.1a-VP1经双酶切及测序证实构建正确;表达的重组CA16 VP1蛋白相对分子质量约为34 000,主要以包涵体形式存在,表达量占菌体总蛋白的15%;纯化的重组CA16 VP1蛋白纯度可达95%以上,可与猴CA16抗血清反应;不同剂量的重组CA16 VP1蛋白免疫BALB/c小鼠,可诱导产生CA16特异性抗体,血清中总IgG、IgG1、IgG2a、IgG2b、IgG3抗体效价均明显高于对照组,且抗体效价与免疫剂量存在一定的量效关系;各剂量CA16 VP1组免疫小鼠血清中和抗体效价均小于1∶8。结论已成功在大肠杆菌中表达了重组CA16 VP1蛋白,纯化的重组蛋白可诱导小鼠特异性体液免疫应答,为进一步研究CA16的结构、功能及相关疫苗的研制奠定了基础。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组16型 VP1蛋白 原核细胞 基因表达 免疫原性
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2009年中国云南昆明地区柯萨奇病毒A组16型遗传特性分析 被引量:7
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作者 马绍辉 陈俊英 +5 位作者 李华 杨卉娟 施海晶 潘玥 孙强明 李琦涵 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2012年第1期9-12,共4页
目的对2009年中国云南昆明地区柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CoxA16)毒株的部分VP1区进行分析,了解CoxA16的遗传特性。方法设计针对肠道病毒A群的通用引物,采用半巢式RT-PCR扩增目的片段,对PCR产物测序;使用Omiga和Mega4.1等... 目的对2009年中国云南昆明地区柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CoxA16)毒株的部分VP1区进行分析,了解CoxA16的遗传特性。方法设计针对肠道病毒A群的通用引物,采用半巢式RT-PCR扩增目的片段,对PCR产物测序;使用Omiga和Mega4.1等生物学软件进行核苷酸、氨基酸序列比对及病毒的系统进化分析。结果200份2009年昆明市儿童医院临床诊断为手足口病或并发脑炎疑似肠道病毒感染的患者粪便标本中有52份为CoxA16感染,其中15份来自脑炎患者。52株CoxA16病毒部分VP1区核苷酸和氨基酸序列同源性均较高,核苷酸序列同源性为98.5%~100%,氨基酸序列同源性为98.8%~100%;与shzh00-2、shzh99-48和107/Toyama/1990相比较,核苷酸序列同源性为92.3%~93.8%,氨基酸序列同源性为95.3%~96.8%;与国际标准株G10相比较,核苷酸序列同源性为78.5%~80.3%,氨基酸序列同源性为93.2%~94.5%;与其他13个参考株的核苷酸序列同源性为96.6%~99.5%,氨基酸序列同源性为98.3%~100%。基因系统进化分析显示,52株CoxA16均属于B基因型的一个分支。结论 2009年中国云南昆明地区CoxA16株属于B2亚型。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A组16型 VP1 序列分析
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代谢综合征各组分对无症状高尿酸血症发生痛风的影响 被引量:10
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作者 张琳 闫雅更 +2 位作者 董凤利 孙文广 郭晓微 《哈尔滨医科大学学报》 CAS 北大核心 2011年第6期587-589,共3页
目的比较痛风及无症状高尿酸血症者指标的差异,探讨痛风的危险因素。方法选取本院健康体检人群1 209例中34例痛风患者为病例组,63例无症状高尿酸血症者为对照组。采用单因素及多因素分析方法比较两组研究对象体质指数、腰围、血压、空... 目的比较痛风及无症状高尿酸血症者指标的差异,探讨痛风的危险因素。方法选取本院健康体检人群1 209例中34例痛风患者为病例组,63例无症状高尿酸血症者为对照组。采用单因素及多因素分析方法比较两组研究对象体质指数、腰围、血压、空腹血糖、血甘油三酯及胆固醇等代谢综合征各组分的差异,寻找痛风的危险因素。结果单因素分析结果显示,空腹血糖在痛风组和无症状高尿酸血症组间有统计学意义(P<0.05)。多因素分析结果显示,空腹血糖OR值为3.100,有统计学意义(P<0.05)。结论空腹血糖是无症状高尿酸血症人群发生痛风的危险因素。 展开更多
关键词 痛风 无症状高尿酸血症 代谢综合征 危险因素
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柯萨奇B3病毒VP1基因在大肠杆菌中的表达 被引量:7
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作者 刘哲伟 冯燕玲 +3 位作者 张霆 韩玉龙 马官福 张建成 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第1期35-41,共7页
本文通过融合柯萨奇B3病毒(CVB3))VP1基因与人凝血酌基因,仗CVB3的VP1在大肠杆菌中得到稳定的表达。经蛋白扫描仪等测定,表达的融合蛋白占菌体可溶性蛋白的11%左右。表达的VP1产物勺抗CVB3VP1单克隆... 本文通过融合柯萨奇B3病毒(CVB3))VP1基因与人凝血酌基因,仗CVB3的VP1在大肠杆菌中得到稳定的表达。经蛋白扫描仪等测定,表达的融合蛋白占菌体可溶性蛋白的11%左右。表达的VP1产物勺抗CVB3VP1单克隆抗体和小鼠抗CVB3血清产生较强的免疫反应,与天然的CVB3蛋白抗原性相同。应用无关单抗和载体质粒对照均呈现阴性反应。应用表达的VP1作为抗原,我们对临床部分急性病毒性心肌炎患者血清进行了特异性IgM免疫印迹法检测,其结果与组织培养的CVB3制备的蛋白抗原对患者血清的特异性IgM反应基本一致。采用基因上程方法制备CVB3抗原产最高,易纯化,免疫原性没有改变。故可以试用表达的VP1抗原代替目的有实验室感染危险的病毒培养及抗原制备方法,快速、特异地诊断CVB3感染。 展开更多
关键词 柯萨奇B3病毒 VP1基因 基因表达
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