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细胞外基质硬度影响骨髓基质干细胞的增殖活性
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作者 高丰 王纪亮 +3 位作者 王洪波 杨永胜 刘源 付苏 《中国组织工程研究》 北大核心 2026年第13期3226-3232,共7页
背景:组织工程支架的物理特性可直接影响种子细胞活性及修复效果,其中细胞外基质硬度是影响种子细胞增殖活性的关键因素,初级纤毛和YAP蛋白作为经典的力学感受器及下游转导因子,可能直接介导了这一机制。目的:探讨细胞外基质硬度对骨髓... 背景:组织工程支架的物理特性可直接影响种子细胞活性及修复效果,其中细胞外基质硬度是影响种子细胞增殖活性的关键因素,初级纤毛和YAP蛋白作为经典的力学感受器及下游转导因子,可能直接介导了这一机制。目的:探讨细胞外基质硬度对骨髓基质干细胞增殖活性的调控作用及相关机制。方法:骨髓基质干细胞传代后接种于不同硬度(软、中度、硬)的聚二甲基硅氧烷基底膜进行培养,CCK-8测定细胞增殖活性,qRT-PCR检测增殖基因c-myc和CCND1的转录活性,Western blot检测Wnt/β-catenin通路激活情况,通过乙酰化α-tubulin及YAP免疫荧光染色评估初级纤毛及YAP蛋白表达。骨髓基质干细胞传代后接种于不同硬度(软、硬)的聚二甲基硅氧烷基底膜进行培养,然后使用siRNA干扰YAP蛋白表达,Western blot检测YAP、磷酸化GSK-3β、β-catenin蛋白表达,qRT-PCR检测c-myc和CCND1的转录活性,乙酰化α-tubulin免疫荧光染色分析初级纤毛长度。结果与结论:硬性聚二甲基硅氧烷条件下的细胞增殖活性、c-myc和CCND1的转录活性显著高于软性、中等硬度聚二甲基硅氧烷,且Wnt/β-catenin通路激活程度强于软性、中等硬度聚二甲基硅氧烷;免疫荧光染色结果显示,硬性聚二甲基硅氧烷诱导了初级纤毛缩短和YAP蛋白阳性细胞增多。通过siRNA干扰YAP蛋白表达后,YAP、磷酸化GSK-3β、β-catenin蛋白表达以及c-myc和CCND1转录活性的组间差异性消失,伴随初级纤毛长度差异消失。结果表明,细胞外基质硬度通过YAP蛋白/初级纤毛新机制,直接调控骨髓基质干细胞的增殖活性。 展开更多
关键词 聚二甲基硅氧烷 硬度 骨髓基质干细胞 增殖 YAP蛋白 初级纤毛 Β-CATENIN WNT通路 细胞外基质
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基于脑肌电信号融合的下肢动作识别 被引量:1
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作者 周慧 李鹏飞 周松波 《中南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2025年第1期58-67,共10页
为识别踝背屈、踝跖屈两类下肢动作,采集了5名受试者的脑电信号和肌电信号.挑选9通道脑电信号和2通道肌电信号进行预处理及特征提取,脑电信号计算事件相关去同步化(Event Related Desynchronization,ERD)特征,肌电信号计算平均绝对值(Me... 为识别踝背屈、踝跖屈两类下肢动作,采集了5名受试者的脑电信号和肌电信号.挑选9通道脑电信号和2通道肌电信号进行预处理及特征提取,脑电信号计算事件相关去同步化(Event Related Desynchronization,ERD)特征,肌电信号计算平均绝对值(Mean Absolute Value,MAV)和斜率符号变换次数(Slope Sign Changes,SSC)特征,特征单独或组合后送入XGBoost(Extreme Gradient Boosting)和支持向量机(Support Vector Machine,SVM)分类器,对不同特征、分类器的识别效果进行比较,结果显示基于XGBoost分类器的脑肌电信号融合识别模式效果最优. 展开更多
关键词 肌电信号 脑电信号 特征提取 XGBoost算法 动作识别
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结核分枝杆菌Phage蛋白的抗原表位预测及生物信息学分析
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作者 黄和明 张娟 +1 位作者 李高驰 周海金 《医学理论与实践》 2025年第1期14-19,共6页
目的:应用生物信息学软件对结核分枝杆菌Rv1579c基因编码的Phage蛋白结构和功能进行预测分析。方法:从NCBI Gene数据库中获取Rv1579c编码的氨基酸序列;通过ProtParam、ProtScale、NetPhos、TMHMM、SOPMA、SWISS-MODEL在线网站分别对Phag... 目的:应用生物信息学软件对结核分枝杆菌Rv1579c基因编码的Phage蛋白结构和功能进行预测分析。方法:从NCBI Gene数据库中获取Rv1579c编码的氨基酸序列;通过ProtParam、ProtScale、NetPhos、TMHMM、SOPMA、SWISS-MODEL在线网站分别对Phage蛋白的理化性质、亲疏水性、磷酸化位点、跨膜螺旋结构、二级结构以及三级结构建模进行预测分析;利用IEDB、ABCpred、SYFPEITHI等软件预测Phage蛋白的细胞抗原表位;使用NCBI中BLAST数据库、UniProt数据库、MEGA-X软件分析Phage蛋白同源性及进化树的构建;STRING数据库预测其相互作用蛋白。结果:Phage蛋白共含有104个氨基酸,分子式为C_(480)H_(750)N_(140)O_(164)S_(4),原子总数1538,为亲水性蛋白,第22、23位氨基酸疏水性得分最高为-1.433;第94位氨基酸亲水性得分最高为-2.511。该蛋白不稳定指数42.81,为不稳定蛋白;无糖基化位点,含有12个磷酸化位点,无跨膜螺旋结构。另外,Phage蛋白共获得多个优势细胞抗原表位。结论:生物信息学分析Phage蛋白为结核分枝杆菌胞膜亲水性不稳定蛋白,介导结核分枝杆菌焦亡和耐药的发生。同时,该蛋白的多个优势细胞抗原表位,可成为未来结核诊断治疗的新靶标。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 焦亡 PHAGE 生物信息学
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基于形态与斜率特征的心电信号质量估计方法
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作者 张煜 许志 +4 位作者 余新明 宋晋忠 曹中平 熊凌浩 轩永 《航天医学与医学工程》 2025年第3期225-229,共5页
目的 较高的运动负荷强度与严重的噪声干扰容易导致心电信号质量变差。低质量信号容易引起误报警、监护不力、评估不准确甚至诊断错误。心电信号质量的定量评估是实现自动化的心电降噪与心脏疾病诊断的基础。方法 本研究分别对心拍形态... 目的 较高的运动负荷强度与严重的噪声干扰容易导致心电信号质量变差。低质量信号容易引起误报警、监护不力、评估不准确甚至诊断错误。心电信号质量的定量评估是实现自动化的心电降噪与心脏疾病诊断的基础。方法 本研究分别对心拍形态相似性、心电斜率特征进行统计分析,得到基于相似性的信号质量指数(rSQI)与基于斜率的信号质量指数(kSQI)。结果 经MIT-BIH噪声干扰数据库测试,rSQI与kSQI均随心电信噪比的降低而减小,均能够反映心电信号质量。心拍形态相似性基于心电波形的“准周期”特性,通过互相关方法计算,运算量大,但精度高,且为逐拍参数;斜率法不需要QRS波群检测,斜率计算简单且实时性高,但其灵敏性低于相似法,且为统计参数。结论 两种方法均适于心电信号质量的定量评估;斜率法的优势在于简单、计算方便,但相似法更准确、稳健。 展开更多
关键词 心电信号 信噪比 信号质量指数 心电信号质量估计 心拍波形相似性
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AI辅助压缩感知在颅内血管壁3D T1WI成像中的应用
5
作者 张月青 赵元宾 +8 位作者 张瑞 周鑫 苗成鹏 谭桂蓉 段云云 隋滨滨 董健 柴丽 丁金立 《北京生物医学工程》 2025年第5期496-502,共7页
目的探索人工智能辅助压缩感知(artificial intelligence-assisted compressed sensing,ACS)技术加速颅内血管壁高分辨率三维T1加权黑血成像(three-dimensional T1-weighted black blood imaging,3D T1_HRVWI)的可行性,并与临床常规采... 目的探索人工智能辅助压缩感知(artificial intelligence-assisted compressed sensing,ACS)技术加速颅内血管壁高分辨率三维T1加权黑血成像(three-dimensional T1-weighted black blood imaging,3D T1_HRVWI)的可行性,并与临床常规采用的并行采集技术(parallel imaging,PI)进行对比分析。方法前瞻性纳入47例脑血管疾病患者,行ACS加速(实验组)和PI加速(对照组)的3D T1_HRVWI扫描。客观比较ACS组和PI组的序列扫描时长、图像中血管壁的信噪比以及相对于血管腔的对比噪声比,主观评估两组图像总体质量、颅内血管显示情况及病灶诊断价值,并进行统计分析。结果相较于PI 3D T1_HRVWI,ACS 3D T1_HRVWI的扫描时长缩短43%;ACS 3D T1_HRVWI图像中颈内动脉、基底动脉、椎动脉、大脑前动脉、大脑中动脉、大脑后动脉血管壁的信噪比均显著升高(P<0.001);两组图像的总体质量评分和颅内血管的显示评分均未见显著差异(P>0.05);两组图像的病灶诊断价值相当(P>0.05)。结论ACS技术实现了3D T1_HRVWI序列更快的采集速度,同时保持了较好的成像质量,为开发兼顾扫描效率与诊断精度的脑血管影像扫描方案提供了循证依据,在脑血管疾病的精准诊断中展现出重要价值。 展开更多
关键词 颅内血管壁成像 高分辨率3D T1加权黑血成像 脑血管疾病 人工智能辅助压缩感知技术 磁共振成像
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实时监测与反馈系统对血流限制下跑者下肢关节运动的影响
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作者 潘玮敏 王世林 +2 位作者 俞家乐 梁馨文 褚智威 《河南师范大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第2期148-156,I0010,I0011,共11页
[目的]探究实时姿势监测与反馈系统对血流限制(blood flow restriction,BFR)下跑者下肢运动学与肌电特征的变化.[方法]17名无BFR训练经验的新手健康跑者参与3次不同方案的跑步测试.第1次测试空白条件下单纯跑步(blank running,BR)状态;... [目的]探究实时姿势监测与反馈系统对血流限制(blood flow restriction,BFR)下跑者下肢运动学与肌电特征的变化.[方法]17名无BFR训练经验的新手健康跑者参与3次不同方案的跑步测试.第1次测试空白条件下单纯跑步(blank running,BR)状态;第2次测试BFR下跑步(BFR and running,BFRR)状态;第3次测试BFR并进行实时姿势监测与反馈(monitoring and feedback,MF)时的跑步状态.比较3次测试中跑者下肢髋、膝、踝关节峰值活动角度与下肢主要肌肉肌电参数变化.[结果]与BR方案相比,BFRR方案下跑者下肢关节峰值角度显著增加,肌肉激活程度与肌纤维募集频率范围也显著增加.使用实时姿势监测与反馈后,与BFRR方案相比,BFRR+MF方案下跑者下肢关节峰值活动角度与上述肌电参数显著下降.[结论]BFR训练将导致跑者初次应用时表现出过激运动表现,但实时监测与反馈系统将优化运动表现,降低运动损伤风险. 展开更多
关键词 实时反馈系统 血流限制训练 跑步 运动学 肌电
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基于多参数磁共振成像和深度学习的前列腺癌辅助诊断研究进展
7
作者 王蕾 孙榕 +1 位作者 贾守强 聂生东 《北京生物医学工程》 2025年第5期524-531,共8页
前列腺癌是男性生殖系统中一种常见的恶性肿瘤,前列腺的复杂结构导致前列腺癌的诊断极具挑战性。近年来,国内外学者进行了多项的基于深度学习的前列腺癌辅助诊断方法研究,旨在提高前列腺癌诊断的准确性和效率。为此,本文对相关研究进行... 前列腺癌是男性生殖系统中一种常见的恶性肿瘤,前列腺的复杂结构导致前列腺癌的诊断极具挑战性。近年来,国内外学者进行了多项的基于深度学习的前列腺癌辅助诊断方法研究,旨在提高前列腺癌诊断的准确性和效率。为此,本文对相关研究进行了综述,以便为深入展开前列腺癌辅助诊断研究提供参考和借鉴。首先,概述常见的多参数磁共振成像(multi-parametric magnetic resonance imaging,MP-MRI)序列,并探讨不同序列组合在前列腺癌辅助诊断中的应用价值;其次,重点介绍基于深度学习的前列腺癌辅助诊断算法,包括前列腺分割和前列腺癌的检测、分割、分级;最后,对相关文献中的深度学习模型进行总结,并对未来的研究方向进行展望。研究表明,深度学习在前列腺癌辅助诊断方面显示出较大优势,并具有一定的临床实用性,未来应继续深入研究更高阶的深度学习算法,充分挖掘其在前列腺癌辅助诊断中的潜力和临床应用价值,为实现一体化治疗提供依据。 展开更多
关键词 多参数磁共振成像 深度学习 前列腺癌辅助诊断 前列腺癌
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基于SE-UNET的脑白质高信号分割方法
8
作者 张新峰 梁玉清 +2 位作者 李相生 刘晓民 孟元 《北京生物医学工程》 2025年第4期365-372,共8页
目的为解决脑白质高信号初期病灶难检测的问题,提出一种基于SE-UNET的语义分割模型,通过优化网络结构实现对脑白质高信号初期的自动分割。方法因脑白质高信号病灶在医学影像具有以下特点:(1)脑白质高信号信号强度分布不均匀,病灶边界易... 目的为解决脑白质高信号初期病灶难检测的问题,提出一种基于SE-UNET的语义分割模型,通过优化网络结构实现对脑白质高信号初期的自动分割。方法因脑白质高信号病灶在医学影像具有以下特点:(1)脑白质高信号信号强度分布不均匀,病灶边界易与背景重合。(2)脑白质高信号前期颗粒度小,信号强度低,分布位置随机,检测难度大。本文采取以下方法:(1)针对脑白质高信号前期颗粒度小、难检测的问题,提出增强性空间位置卷积核,它可以聚合多个不同尺度的特征图,自适应校准特征区域病灶的分布权重。这种策略可以使网络聚焦于偏离中心位置的小区域病灶,同时减小背景的干扰。(2)针对脑白质高信号病灶强度分布不均匀和边缘难分割的问题,通过提出梯度信息引导注意力模块,这种方式可以让网络捕获到病灶边界的像素梯度变化,提高网络对边界梯度信息的学习能力,在输出层生成基于边界区域的概率高斯图,最后实现对边界的准确分割。结果在脑白质高信号检测任务中,SE-UNET的Dice系数、MIou、HD95分别达到78.3%,88.4%和2.62。同时使用公开数据进行对比,实验证明在评价指标上相较于Baseline三项指标分别提升15.94%、18.15%和1.76。结论实验结果证明本文所提出的网络模型在准确度和网络性能方面均显著优于主流网络。 展开更多
关键词 图像分割 医学影像 脑白质高信号 机器学习
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基于U^(2)-Net和CBAM融合注意力的双模态睡眠分期研究 被引量:1
9
作者 赵倩 李锦 +2 位作者 凤飞龙 强宁 胡静 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期1-11,共11页
针对当前自动睡眠分期方法存在的难点问题,提出了一种结合U^(2)-Net和CBAM融合注意力对EEG-ECG双模态信号进行自动睡眠分期的方法。首先,采用MIT-BIH公开数据集中的EEG-ECG信号进行预处理;然后,利用添加了多尺度特征提取模块的U^(2)-Ne... 针对当前自动睡眠分期方法存在的难点问题,提出了一种结合U^(2)-Net和CBAM融合注意力对EEG-ECG双模态信号进行自动睡眠分期的方法。首先,采用MIT-BIH公开数据集中的EEG-ECG信号进行预处理;然后,利用添加了多尺度特征提取模块的U^(2)-Net网络并行提取EEG和ECG中的波形特征;其次,利用CBAM融合注意力对全部特征进行权重分配;最后,使用Softmax激活函数对睡眠时期进行六分类。结果表明:基于U^(2)-Net和CBAM融合注意力模型进行睡眠分期时,使用ECG单模态信号的六分类总体准确率为80.2%,F1分数为75.3%;使用EEG单模态信号的六分类总体准确率为85.8%,F1分数为81.7%;使用EEG-ECG双模态信号的六分类总体准确率为90.4%,F1分数为85.6%。提出的双模态睡眠分期模型是可行有效的,并且为自动睡眠分期提供了一种新的思路。 展开更多
关键词 自动睡眠分期 EEG-ECG双模态信号 U^(2)-Net网络 CBAM融合注意力
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面向BraTS数据集的脑肿瘤分割深度学习方法研究进展 被引量:2
10
作者 李学辉 魏国辉 +2 位作者 贠恺 赵文华 马志庆 《北京生物医学工程》 2025年第1期96-103,共8页
脑肿瘤分割任务在医学图像分割领域备受关注,其复杂性和多样性迫切需要研究学者采用高效的深度学习技术进行精确处理。随着深度学习技术的快速发展,各种针对脑肿瘤数据集(如BraTS)的深度学习模型层出不穷。本文综述了3种面向BraTS数据... 脑肿瘤分割任务在医学图像分割领域备受关注,其复杂性和多样性迫切需要研究学者采用高效的深度学习技术进行精确处理。随着深度学习技术的快速发展,各种针对脑肿瘤数据集(如BraTS)的深度学习模型层出不穷。本文综述了3种面向BraTS数据集的脑肿瘤分割深度学习方法的研究进展。首先,本文详细介绍了BraTS数据集的背景和来源,深入剖析该多模态数据集的结构组成和各项性能评价指标,为后续深度模型分析提供理论基础;其次,针对3种不同的深度学习模型在BraTS数据集上的性能表现进行详细探讨,包括卷积神经网络(convolutional neural network,CNN)、U型卷积网络(U-Net convolutional networks,U-Net)和Transformer等网络模型在脑肿瘤分割领域中对其基础模型做出的优化和改进,并对此类模型在面临数据集类不平衡问题和模型的建模、特征提取和特征融合等方面的挑战时所采取的策略进行深入分析;最后,本文总结了目前模型的研究趋势,并对Transformer模型的未来方向进行展望,强调在模型性能提升的同时,自监督学习和轻量化的研究将会是未来研究的焦点。本文旨为初步涉足该领域的研究学者了解当前研究现状提供深入的理解和启发,为开发更高性能、更具泛化能力的脑肿瘤分割方法提供参考。 展开更多
关键词 脑肿瘤分割 深度学习 CNN U-Net TRANSFORMER
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深度学习在乳腺肿瘤病理图像分析中的应用 被引量:1
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作者 李冠鹏 翟羽佳 +2 位作者 张晓丽 张魁星 薛丹 《北京生物医学工程》 2025年第1期81-89,共9页
乳腺癌作为女性最高发的恶性肿瘤之一,在全球范围内对女性健康构成严重威胁。其精确的病理诊断不仅关系到患者的治疗方案选择,也直接影响到治疗效果和患者生存质量。随着医学影像技术的不断进步,数字病理图像已逐渐成为临床诊断的标准手... 乳腺癌作为女性最高发的恶性肿瘤之一,在全球范围内对女性健康构成严重威胁。其精确的病理诊断不仅关系到患者的治疗方案选择,也直接影响到治疗效果和患者生存质量。随着医学影像技术的不断进步,数字病理图像已逐渐成为临床诊断的标准手段,由此也带来对大量数据进行处理和分析的挑战。深度学习,尤其是卷积神经网络(convolutional neural networks,CNN)在自动化分析乳腺肿瘤病理图像方面展现了显著的优势和潜力,为提升诊断的精确度和效率开辟了新的途径。本综述旨在系统性地探讨深度学习,特别是CNN在乳腺肿瘤病理图像分类、检测识别和分割等方面的最新研究进展和应用。本文深入分析了该领域当前所面临的技术挑战,如数据稀缺性、模型可解释性以及模型泛化的问题,并对这些问题提出了可能的解决策略。最后,本文展望了未来的研究方向,特别关注于如何融合多模态数据、增强模型的鲁棒性和解释性等方面,以期为乳腺癌病理图像分析领域的未来研究提供有益的参考和启示。通过本综述,希望能够引起更多研究者的关注,推动该领域的研究进展,进一步促进深度学习技术在临床实践中的应用,为乳腺癌的早期诊断以及预后预测提供更为精准的决策依据。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 深度学习 病理图像 辅助诊断
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鸽子MVL核团对视频迁移实物目标识别的神经表征
12
作者 李晓媛 任立庆 +2 位作者 刘登辉 李贺 程涵 《郑州大学学报(工学版)》 北大核心 2025年第4期1-7,共7页
为探究鸽子基于视频学习迁移实物目标识别的神经机制,设计了目标导向式训练系统。首先,通过行为学对比发现,经视频训练的鸽子在实物迁移测试中正确率显著高于对照组,验证了鸽子具有视觉认知迁移能力。其次,利用微电极记录鸽子MVL核团的... 为探究鸽子基于视频学习迁移实物目标识别的神经机制,设计了目标导向式训练系统。首先,通过行为学对比发现,经视频训练的鸽子在实物迁移测试中正确率显著高于对照组,验证了鸽子具有视觉认知迁移能力。其次,利用微电极记录鸽子MVL核团的神经信号,基于Welch功率谱分析得到视觉识别任务的特征响应频带,并通过锁相值构建脑功能网络。结果表明:在视频和实物识别中,目标与干扰状态下的脑网络平均节点度、聚类系数和全局效率均存在显著差异;但视频目标与实物目标,视频干扰与实物干扰的网络特征无差异,这表明MVL核团通过提取视频与实物的共有特征实现跨模式迁移,揭示了MVL脑区在视觉认知迁移学习中的关键作用。 展开更多
关键词 视频学习 视觉认知迁移学习 MVL核团 锁相值 脑功能网络
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TXN在泛癌中的表达特征及其对肿瘤免疫及预后的影响
13
作者 孙安男 孙璐娜 +1 位作者 吴昊 李圃 《细胞与分子免疫学杂志》 北大核心 2025年第8期706-716,共11页
目的 TXN是一种硫氧还蛋白(TXN),参与许多氧化还原反应,在多种信号通路中起着关键作用。然而,TXN在泛癌中的作用仍然不清楚。本研究旨在探讨及可视化TXN表达在泛癌中的诊断、预后和免疫学分析。方法 从癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库... 目的 TXN是一种硫氧还蛋白(TXN),参与许多氧化还原反应,在多种信号通路中起着关键作用。然而,TXN在泛癌中的作用仍然不清楚。本研究旨在探讨及可视化TXN表达在泛癌中的诊断、预后和免疫学分析。方法 从癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库下载临床数据,分析TXN在泛癌中的表达水平,并通过人类蛋白质图谱(HPA)(https://www.proteinatlas.org/)数据库初步验证。采用ESTIMATE和CIBERSORT算法评估TXN表达与免疫细胞浸润的相关性。同时,利用Spearman方法分析TXN与微卫星不稳定性(MSI)及肿瘤突变负荷(TMB)在肿瘤中的相关性。此外,通过基因集富集分析(GSEA)探讨TXN的生物学功能,并运用CellMiner数据库评估其与癌症治疗药物的敏感性关系。结果 TXN在大多数恶性肿瘤中表现出高水平表达。其高表达与多种癌症的生存存在显著相关性。此外,TXN表达水平也与TMB、MSI、肿瘤微环境和化疗敏感性等密切相关。结论 TXN有望作为泛癌中的潜在预后生物标志物。同时,黄酸(维甲酸)诱导基因蛋白I(RIG-I)样受体信号通路、Toll样受体(TLR)信号通路以及核苷酸寡聚化结构域(NOD)样受体信号通路可能在TXN对肿瘤免疫的调节中发挥关键作用。 展开更多
关键词 肿瘤微环境 硫氧还蛋白(TXN) 泛癌 药物敏感性 生物信息学
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基于转录组学探讨TS模型大鼠关键miRNA-mRNA网络的构建及潜在中药干预
14
作者 李凡 张越晨 +5 位作者 周姗 谢静 王孟清 曾庆佳 周霞 张舒靖 《现代生物医学进展》 2025年第16期2577-2584,2597,共9页
目的:基于转录组学技术解析多发性抽动症(Tourette syndrome,TS)模型大鼠的miRNA-mRNA调控网络,筛选关键信号通路及具有调控作用的中药候选药物。方法:首先通过亚氨基二丙腈构建TS大鼠模型,再通过RNA测序筛选TS大鼠脑组织差异表达的miRN... 目的:基于转录组学技术解析多发性抽动症(Tourette syndrome,TS)模型大鼠的miRNA-mRNA调控网络,筛选关键信号通路及具有调控作用的中药候选药物。方法:首先通过亚氨基二丙腈构建TS大鼠模型,再通过RNA测序筛选TS大鼠脑组织差异表达的miRNA与mRNA,结合生物信息学分析构建互作网络,进一步通过网络药理学筛选潜在中药。结果:IDPN造模7天后,模型组出现运动行为及刻板改变,模型组行为学评分大于3分,HE染色可见部分神经元细胞核形态不规则,染色质分布不均匀,存在核固缩现象,胶质细胞数量增多。KEGG富集分析提示关键信号通路:钙离子信号通路、神经活性配体-受体相互作用、p53信号通路、ECM-受体相互作用、TGF-β信号通路,而miR-125a-3p、miR-106-3p以及miR-760-3p可能是关键的miRNA。潜在中药:筋骨草、五加皮、党参、千金藤、龙骨、羌活、罗汉果、两面针根、巴戟天以及延胡索。结论:miR-106-3p、miR-125a-3p、miR-760-3p等miRNA可能通过作用于钙信号通路、神经活性配体-受体相互作用及ECM-受体相互作用通路等关键信号网络的显著改变,引起神经免疫炎症、多巴胺能系统的紊乱从而介导TS的发生。延胡索以及筋骨草等中药可能通过多成分协同调控关键miRNA及其下游通路网络。 展开更多
关键词 抽动障碍 转录组学 微小RNA-信使RNA网络 信号通路 中药
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基于“认知—实训—动手”三层次的生物信息学课程教学改革实践
15
作者 沈丹宇 叶文武 董莎萌 《安徽农学通报》 2025年第14期118-121,共4页
为培养具有创新意识和实践动手能力的应用型人才,本文对植物保护专业生物信息学课程引入“认知—实训—动手”三层次教学模式的应用基础进行分析,并进行教学改革实践。应用基础包括3个层次,在认知层次,学生主要学习基础理论知识,培养学... 为培养具有创新意识和实践动手能力的应用型人才,本文对植物保护专业生物信息学课程引入“认知—实训—动手”三层次教学模式的应用基础进行分析,并进行教学改革实践。应用基础包括3个层次,在认知层次,学生主要学习基础理论知识,培养学习兴趣;在实训层次,通过案例分析、模拟数据操作等方式,培养实践能力;在动手层次,通过创新实验、科研项目等,培养解决问题的能力。教学改革实践方面,认知层次融合专业理论知识,构建跨学科知识体系,创新教学方法;实训层次强化实践技能,设计具有植保特色的实训项目,完善实训设施和师资队伍;动手层次推动跨学科创新实践,促进科研项目与实习相结合,组织参加跨学科竞赛活动。此外,采用多元化评价方式,强调结果性评价,引入学生自评和互评,建立综合评价档案。实践结果表明,该教学改革产生了良好的效果,90%的学生熟练掌握了该课程常用工具的实践操作技能,如序列比对、进化树构建和生物数据库的使用等;累计16个学生团队凭借课程学习成果申报并获批校级大学生创新训练项目。本文为培养更多高素质、信息化的智慧植保人才提供参考。 展开更多
关键词 植物保护 生物信息学 跨学科融合 病虫害鉴定
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基于力学参数的血管介入操作客观评估
16
作者 袁盼盼 梁世超 +4 位作者 李世龙 杨斌 李龙 王颖 陈端端 《北京生物医学工程》 2025年第5期441-448,456,共9页
目的通过采集模拟介入过程中器械与模型的接触力,对操作者的技能进行客观评估。方法首先,构建一个介入手术操作训练平台,包括体外主动脉模型、体外仿生循环系统、视觉模块和力学模块以及实验控制终端,可采集模拟介入过程中器械与模型相... 目的通过采集模拟介入过程中器械与模型的接触力,对操作者的技能进行客观评估。方法首先,构建一个介入手术操作训练平台,包括体外主动脉模型、体外仿生循环系统、视觉模块和力学模块以及实验控制终端,可采集模拟介入过程中器械与模型相互作用产生的力学数据。其次,以6名医生和15名无经验者作为不同介入水平的实验对象完成医用导管输送到主动脉硅胶模型目标血管位置的任务。选取2名医生和4名无经验者作为测试组,其余参与人员为训练组。最后,从力学数据中提取13项数据特征,通过非参数检验和相关性分析选出有效特征,利用训练组有效特征数据训练评估模型,并对测试组分别进行基于支持向量机(support vector machine,SVM)的定性分类和基于马氏距离(Mahalanobis distance,MD)的定量分析。结果在任务完成时间和力学数据上医生与新手均存在显著性差异。测试组定性分类准确率为90%,定量分析医生得分明显高于新手(67.46±12.92 vs 29.26±16.50,P<0.001),实验人员定量得分随着介入次数增加呈现上升趋势。结论提出的基于力学参数的血管介入手术操作过程客观评估方法可以提供良好的定性分类与定量评估结果,可作为未来介入医生培训的有效辅助工具。 展开更多
关键词 手术技能评估 多参数物理传感 体外介入操作平台 支持向量机 马氏距离
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我国城市在生物医学工程领域的科学合作偏好分析
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作者 陈娟 龙俊羽 +1 位作者 欧阳昭连 和晓峰 《北京生物医学工程》 2025年第1期74-80,共7页
目的分析我国不同城市在生物医学工程领域的国际合作偏好,为政府和研究机构制定国际合作战略和政策提供参考。方法在Web of Science数据库中检索近3年发表的生物医学工程类期刊论文,基于论文署名的城市和机构分年份构建合作网络,计算各... 目的分析我国不同城市在生物医学工程领域的国际合作偏好,为政府和研究机构制定国际合作战略和政策提供参考。方法在Web of Science数据库中检索近3年发表的生物医学工程类期刊论文,基于论文署名的城市和机构分年份构建合作网络,计算各城市和机构在合作网络中的中介中心性和聚类系数,以这两个指标的数值大小来评估科学合作偏好,其中将中介中心性高而聚类系数低的节点视为第一类(偏好国际合作),将中介中心性和聚类系数中等的节点视为第二类(无明显偏好),将中介中心性低而聚类系数高的节点视为第三类(偏好国内合作)。结果城市层面的分析显示,上海、北京稳居第一类,深圳、广州、香港地区、杭州、南京稳居第二类,成都则于2023年从第三类变成第二类,天津、重庆、西安、台北、合肥、哈尔滨、武汉、苏州、沈阳和济南稳居第三类。机构层面的分析显示,上海交通大学稳居第一类,浙江大学、复旦大学稳居第二类,中山大学、四川大学、中国科学院和北京大学在个别年份进入第二类,清华大学、南方医科大学、北京航空航天大学、中国科学院大学、首都医科大学、天津大学、华南理工大学、东南大学、中国科学技术大学、苏州大学稳居第三类。结论北京和上海的科研机构在生物医学工程领域开展国际合作最为积极,以上海交通大学、中国科学院和北京大学为代表。位于长三角地区的杭州和南京以及位于粤港澳大湾区的深圳、广州、香港地区也表现出较强的国际合作积极性,代表性机构包括浙江大学、复旦大学和中山大学。位于西部地区的成都国际合作积极性明显增强,以四川大学最为突出。其他城市的科研机构更倾向于与国内机构开展合作。 展开更多
关键词 生物医学工程 科学研究 国际合作偏好 社会网络分析
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基于AR-SSVEP和YOLOv3的时敏目标识别方法
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作者 马留洋 胡争争 栗武华 《郑州大学学报(工学版)》 北大核心 2025年第4期32-39,共8页
针对目标跟踪过程中目标身份(ID)跳变而影响时敏目标识别的问题,提出了一种融合增强现实技术(AR)、稳态视觉诱发电位(SSVEP)和YOLOv3的人在回路的“检测-决策”时敏目标识别方法(AR-SSVEP-YOLOv3)。利用目标感知模块获取前端场景视频,... 针对目标跟踪过程中目标身份(ID)跳变而影响时敏目标识别的问题,提出了一种融合增强现实技术(AR)、稳态视觉诱发电位(SSVEP)和YOLOv3的人在回路的“检测-决策”时敏目标识别方法(AR-SSVEP-YOLOv3)。利用目标感知模块获取前端场景视频,并通过AR眼镜实时呈现,YOLOv3算法完成场景视频中敏感目标检测,AR-SSVEP脑电处理模块解析受试者的脑电数据,在ID变化过程中对时敏目标进行识别。对比分析时敏目标的识别率,结果表明:AR-SSVEP-YOLOv3时敏目标识别方法相比YOLOv3算法识别率平均提升了18.8%,相比YOLOv3-Sort算法平均提升了8.0%。AR-SSVEP-YOLOv3时敏目标识别方法可以降低目标ID跳变对时敏目标识别的影响,提升人机交互能力和时敏目标识别率。 展开更多
关键词 增强现实 人工智能 时敏目标 目标检测 稳态视觉诱发电位 目标识别
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基于机器学习的MRI影像组学在儿童室管膜瘤与髓母细胞瘤鉴别中的应用
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作者 李浩东 王远军 +2 位作者 魏嘉 管雯斌 王晓强 《北京生物医学工程》 2025年第2期128-133,164,共7页
目的近年机器学习的影像组学在肿瘤诊断及鉴别等领域表现出极大的潜力。本研究拟通过基于机器学习的儿童室管膜瘤(ependymoma,EP)与髓母细胞瘤(medulloblastoma,MB)的MRI影像组学特征提取,构建T2液体衰减反转恢复序列(T2Flair)特征模型... 目的近年机器学习的影像组学在肿瘤诊断及鉴别等领域表现出极大的潜力。本研究拟通过基于机器学习的儿童室管膜瘤(ependymoma,EP)与髓母细胞瘤(medulloblastoma,MB)的MRI影像组学特征提取,构建T2液体衰减反转恢复序列(T2Flair)特征模型(平扫特征模型)、对比增强T1加权(ceT1WI)特征模型(增强特征模型)、融合特征模型,比较这3种模型对EP和MB分类的准确率与AUC值。方法回顾性分析组织病理或临床诊断证实的50例EP以及60例MB。应用影像组学技术对EP与MB的T2Flair和ceT1WI磁共振图像进行特征提取和融合,采用最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)算法筛选出各特征集的最优特征集,并采用支持向量机(support vector machine,SVM)、随机森林(random forest,RF)、极端随机树(extra trees)和逻辑回归(logistic regression,LR)4种分类器进行分类。结果从T2Flair中提取特征构建的4个分类模型的准确率分别为:0.762、0.714、0.762、0.714,AUC值分别为:0.806、0.750、0.796、0.731。从ceT1WI中提取特征构建的4个分类模型准确率分别为:0.841、0.841、0.818、0.818,AUC值为0.929、0.908、0.904、0.923。融合特征模型的准确率分别为:0.864、0.909、0.909、0.909,AUC值分别为:0.958、0.975、0.983、0.992。结论增强特征模型的准确率和AUC值均高于平扫特征模型,融合特征模型的分类准确率和AUC值最高,且融合特征中的4个模型对EP与MB分类的准确率和AUC值均高于0.85。这表明基于机器学习的T2Flair和ceT1WI影像组学能够较好地分类EP与MB,且融合后的特征模型能进一步提高分类的准确率及AUC值。 展开更多
关键词 室管膜瘤 髓母细胞瘤 儿童 机器学习 影像组学
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血管内皮生长因子荧光共聚焦显微图像分析
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作者 黄妍 丁云鹤 +1 位作者 赵诣深 张璐 《北京生物医学工程》 2025年第1期1-8,共8页
目的建立一种血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)在视网膜内异常表达情况的可视化和定量评估方法,为糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的早期检测和治疗提供帮助。方法对大鼠视网膜铺片进行免疫荧光... 目的建立一种血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)在视网膜内异常表达情况的可视化和定量评估方法,为糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的早期检测和治疗提供帮助。方法对大鼠视网膜铺片进行免疫荧光染色和成像。对VEGF和微血管病变区域进行分割、提取与三维重建,采用VEGF阳性单位、微血管密度、分形维数等定量参数对结果进行评估,比较糖尿病视网膜病变8周模型组(n=10)与正常对照组(n=10)的差异。结果在DR病变模型中,VEGF探针高表达区域与血管异常区域存在共定位,VEGF聚集于视网膜微血管分叉或膨大的血管壁表面。DR组的微血管分形维数、密度和三维血管弯曲度明显高于正常对照组(P<0.05);VEGF阳性单位(positive unit,PU)值在DR组中明显高于对比组(P<0.05);微血管空隙度差异无统计学意义(P>0.05)。结论本研究提出的VEGF定量评估方法,能够定性和定量地反映VEGF在DR模型视网膜中的异常分布,为抗VEGF药物研究提供定量及可视化手段。 展开更多
关键词 糖尿病视网膜病变 血管 荧光成像 定量分析 图像重建
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