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黑线姬鼠睾丸不同时期的比较蛋白质组学分析
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作者 金志民 李强 +4 位作者 鲁思含 孙悦 李璐 宋小宁 贾修歧 《野生动物学报》 北大核心 2025年第3期573-581,共9页
黑线姬鼠(Apodemus agrarius)是我国常见的农田害鼠,控制其种群数量是鼠害防治的重点。雄性黑线姬鼠的睾丸在繁殖季节会发生下降现象,以此提高其雄性繁殖强度,睾丸下降会显著影响其基因表达和代谢物含量,而蛋白质作为基因表达的产物和... 黑线姬鼠(Apodemus agrarius)是我国常见的农田害鼠,控制其种群数量是鼠害防治的重点。雄性黑线姬鼠的睾丸在繁殖季节会发生下降现象,以此提高其雄性繁殖强度,睾丸下降会显著影响其基因表达和代谢物含量,而蛋白质作为基因表达的产物和新陈代谢的基础,主导着睾丸的生理功能,但以往的研究缺乏对黑线姬鼠睾丸下降期和睾丸正常期睾丸蛋白质种类及功能的比较分析。以处于睾丸下降期(9只)和睾丸正常期(9只)的黑线姬鼠为研究对象,对其睾丸进行蛋白质组学分析,鉴定睾丸蛋白质种类、测定含量并进行比较,分析功能注释与富集,筛选出与精子发生相关的蛋白质。结果表明:在睾丸下降期和睾丸正常期的黑线姬鼠睾丸中共鉴定到10533个蛋白质,其中,两个时期共有蛋白质9871个,特有蛋白质种类分别为239、423个,差异蛋白质1932个,两个时期蛋白质功能注释结果相似,但蛋白质的种类和含量差异较大,GO和KEGG共富集到剪接体、RNA剪接的调控和mRNA加工的调控等12条与精子发生相关的功能通路。研究结果揭示了黑线姬鼠睾丸在不同时期的蛋白质差异,为探究黑线姬鼠睾丸下降的内在作用机制提供了新的思路。 展开更多
关键词 黑线姬鼠 蛋白质组 睾丸下降 不同时期
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条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)线粒体全基因组测序及虾蛄科系统发育分析
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作者 张千钰 马家乐 +1 位作者 叶莹莹 李继姬 《海洋学报》 北大核心 2025年第9期129-144,共16页
条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)属于虾蛄科Squillidae(Latreille,1802)。在本研究中,通过二代测序技术得到了条尾近虾蛄的线粒体全基因组,对基因组基本结构特点做了分析,发现共含有37个基因,包含13个蛋白质编码基因(PCGs),2个rRNA,2... 条尾近虾蛄(Anchisquilla fasciata)属于虾蛄科Squillidae(Latreille,1802)。在本研究中,通过二代测序技术得到了条尾近虾蛄的线粒体全基因组,对基因组基本结构特点做了分析,发现共含有37个基因,包含13个蛋白质编码基因(PCGs),2个rRNA,22个tRNA。对碱基含量分析发现A碱基含量最高为35.42%,G碱基最低为12.83%,选择了虾蛄科11个物种的线粒体基因组进行选择压力分析发现所有PCGs都受到纯化选择。另外通过结合软甲纲下2个亚纲的线粒体基因组的13个PCGs构建了系统发育树,结果发现虾蛄科为单系群,科内物种能够形成一个独立的分支,与其他相关的掠虾亚纲动物(如琴虾蛄科等)有明显的分化。对软甲纲的线粒体基因重排进行比较发现口足目未表现出重排现象。从重建的掠虾亚纲的分歧时间的年代图谱,得到现存物种的分化最早发生在中生代白垩纪期,在新生代物种大量分化。这些结果将更好地帮助人们理解不同虾蛄科物种的亲缘关系,以及软甲纲内各亚纲之间的进化地位与关系。 展开更多
关键词 虾蛄科 掠虾亚纲 线粒体基因组 系统发育分析 分歧时间
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2种红鲂鮄属鱼类控制区结构及系统发育分析
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作者 李珂 廖贤晖 +3 位作者 王乙婷 赵宸枫 郭星乐 高天翔 《浙江海洋大学学报(自然科学版)》 2025年第1期1-9,共9页
为研究红鲂鮄属鱼类的线粒体控制区结构特征与系统发育关系,对瑞氏红鲂鮄与魏氏红鲂鮄的线粒体控制区全序列进行测定分析,统计其碱基组成,识别控制区结构;以许氏平鲉、褐斑鲬为外群构建最大似然树和贝叶斯树。结果表明,2种红鲂鮄属鱼类... 为研究红鲂鮄属鱼类的线粒体控制区结构特征与系统发育关系,对瑞氏红鲂鮄与魏氏红鲂鮄的线粒体控制区全序列进行测定分析,统计其碱基组成,识别控制区结构;以许氏平鲉、褐斑鲬为外群构建最大似然树和贝叶斯树。结果表明,2种红鲂鮄属鱼类控制区全长分别为858 bp、857 bp,序列表现为反G偏移;控制区可分为终止序列区、中央保守区以及保守序列区3个区域,终止序列区的A含量最高,中央保守区的G含量最高。系统发育分析显示,黄鲂鮄科红鲂鮄属2种鱼类与叉吻鲂鮄属关系较近,黄鲂鮄科与鲂鮄科关系较近。研究结果表明控制区序列可用于红鲂鮄属鱼类系统发育分析,并为深入开展红鲂鮄属鱼类遗传多样性研究及其资源保护提供了基础资料。 展开更多
关键词 红魴鮄属 黄鲂鮄科 控制区 结构 系统发育
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硬骨鱼类基因组重复序列比较分析
4
作者 张耀仁 杨俊 +1 位作者 罗靖 徐胜勇 《浙江海洋大学学报(自然科学版)》 2025年第2期93-104,共12页
重复序列是动植物基因组的重要组成部分,对基因组进化具有显著的影响。鱼类作为最古老的脊椎动物类群,具有高度的物种多样性和基因组多样性,是开展脊椎动物基因组进化研究工作的理想类群。为探究重复序列对硬骨鱼类基因组大小差异及进... 重复序列是动植物基因组的重要组成部分,对基因组进化具有显著的影响。鱼类作为最古老的脊椎动物类群,具有高度的物种多样性和基因组多样性,是开展脊椎动物基因组进化研究工作的理想类群。为探究重复序列对硬骨鱼类基因组大小差异及进化的影响,收集了已报道的60种鱼类基因组数据及其重复序列比例信息并进行统计分析。统计结果显示硬骨鱼类基因组大小和重复序列比例存在较大的种间差异。相关性分析结果显示硬骨鱼类基因组大小与重复序列比例呈非线性的对数相关性,这与之前普遍认为的线性相关性存在差异。系统发育分析结果显示遗传关系较近的物种间具有相似的基因组大小及重复序列比例,表明硬骨鱼类基因组大小和重复序列比例呈现谱系特异性。然而在某些类群中也有例外,例如与近缘种相比,斑马鱼、多鳞白甲鱼和大腹海马的基因组较小,但重复序列比例较高,提示遗传关系较近的物种间重复序列比例也存在异质性。该研究整理了多种硬骨鱼类基因组大小、重复序列比例、转座子组成等信息,并初步统计分析了硬骨鱼类基因组大小的变化规律和进化模式,研究结果可为深入开展硬骨鱼类基因组进化研究提供参考资料。 展开更多
关键词 硬骨鱼类 重复序列 基因组 系统进化
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几何形态学方法及其在动物发育与系统进化研究中的应用 被引量:26
5
作者 葛德燕 夏霖 +3 位作者 吕雪霏 黄乘明 杨奇森 黄建华 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2012年第2期296-304,共9页
简要回顾了几何形态学的发展历史,介绍了30多年来该领域使用的主要方法及其在生物发育与进化研究中的实际应用。除目前应用最为广泛的标点法和轮廓线法外,基于三维数据的表面特征分析和有限元分析也在该领域得到推广。这些方法可运用于... 简要回顾了几何形态学的发展历史,介绍了30多年来该领域使用的主要方法及其在生物发育与进化研究中的实际应用。除目前应用最为广泛的标点法和轮廓线法外,基于三维数据的表面特征分析和有限元分析也在该领域得到推广。这些方法可运用于分析两性分化、异速生长、种群分化、种上进化以及复杂功能结构的形态集成等科学问题。几何形态学与生物信息学的综合运用还将有利于探讨表型变化与遗传物质变化的相关性。随着生物成像技术和海量数据计算技术的进步,几何形态学将由目前以二维数据为主的研究向三维重建和分析的方向发展。 展开更多
关键词 几何形态学 标点法 轮廓线法 个体发育 系统进化
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4种鲷科鱼类的线粒体细胞色素b基因序列及分子系统学分析 被引量:28
6
作者 江世贵 刘红艳 +1 位作者 苏天凤 龚世园 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期184-188,共5页
从鲷科鱼类中黄鳍鲷(Sparus latus)、黑鲷(S.macrocephalus)、真鲷(Pagrosomus major)和平鲷(Rhabdosargussarba)的线粒体DNA扩增出约430 bp的细胞色素b(Cytb)基因,经Clastal X同源排序后得408 bp序列,对该序列进行分析并结合GeneBank... 从鲷科鱼类中黄鳍鲷(Sparus latus)、黑鲷(S.macrocephalus)、真鲷(Pagrosomus major)和平鲷(Rhabdosargussarba)的线粒体DNA扩增出约430 bp的细胞色素b(Cytb)基因,经Clastal X同源排序后得408 bp序列,对该序列进行分析并结合GeneBank中黄鲷(Taius tumifrons)、灰鳍鲷(S.berda)、犁齿鲷(Evynnis japonica)和高背四长棘鲷(Argyrops spinifer)的该区段DNA序列比较,共发现126个核苷酸位点存在变异(30.7%),序列中的转换大于颠换,碱基替换多发生在密码子的第3位点。黑鲷和灰鳍鲷亲缘关系最近,序列差异为3.8%;而黄鲷和平鲷的亲缘关系最远,序列差异为21.7%。用MEGA2.1软件中的NJ法构建的分子系统树,将上述8种类分为4组,其中黄鲷属、平鲷属和鲷属分类的结果与形态分类学的观点一致;而传统分类上把犁齿鲷、真鲷和高背四长棘鲷归为3个不同属,在本研究分子系统树中,这3个属却聚成一支。本研究目的在于从分子水平上阐明鲷科鱼类的分类与系统进化关系。 展开更多
关键词 鲷科鱼类 细胞色素B 分子系统学
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新疆3种雅罗鱼线粒体DNA细胞色素b序列的差异与系统进化 被引量:10
7
作者 胡文革 段子渊 +1 位作者 王金富 盛金良 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期6-11,共6页
利用鲤科鱼类线粒体DNA细胞色素b通用引物对分布在新疆的准噶尔雅罗鱼(Leuciscusmerzbacheri)、贝加尔雅罗鱼(L .baicalensis)和高体雅罗鱼(L .idus) 3个鱼种共1 5尾个体的线粒体DNACytb部分核苷酸序列进行了测定,获得1 5条长度为41 3b... 利用鲤科鱼类线粒体DNA细胞色素b通用引物对分布在新疆的准噶尔雅罗鱼(Leuciscusmerzbacheri)、贝加尔雅罗鱼(L .baicalensis)和高体雅罗鱼(L .idus) 3个鱼种共1 5尾个体的线粒体DNACytb部分核苷酸序列进行了测定,获得1 5条长度为41 3bp的同源基因序列。同源基因序列分析显示,在3种雅罗鱼1 5条mtDNACytb基因片段中,A、T、C、G碱基的平均含量分别是:2 7 4%、2 6 7%、1 7 2 %、2 8 7% ,其中A+T含量(5 4 1 % )高于G +C含量(4 5 9% ) ;共检测到5 2个突变位点;转换比颠换发生频率高,转换颠换比值(R)是3 5。mtDNACytb的进化速率在3种雅罗鱼间表现出不一致性,贝加尔与高体雅罗鱼、贝加尔与准噶尔雅罗鱼种间遗传距离分别是0 1 2 5 1和0 1 2 61 ,保守性较低;高体与准噶尔雅罗鱼种间的遗传距离是0 0 0 0 7,高度保守。mtDNACytb分子系统树显示,在3种雅罗鱼中贝加尔雅罗鱼独立成一枝,高体雅罗鱼和准噶尔雅罗鱼聚成一类。提示了,在mtDNACytb分子水平上,高体雅罗鱼和准噶尔雅罗鱼的亲缘关系十分相近,贝加尔雅罗鱼与准噶尔雅罗鱼的亲缘关系相距较远。我们对准噶尔、贝加尔和高体雅罗鱼mtDNACytb方面的研究与陈星玉对其骨骼类型的研究结果相吻合。 展开更多
关键词 雅罗鱼 线粒体DNA CYT b 系统进化 亲缘关系
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柳珊瑚分子系统发育学的研究进展 被引量:8
8
作者 黄晖 何建国 +2 位作者 李秀保 张俊彬 邹仁林 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期63-71,78,共10页
珊瑚分子系统发育学研究始于90年代初,用于柳珊瑚分子系统学研究的主要分子标记是线粒体DNA和核糖体RNA。本文在重点介绍了柳珊瑚种群遗传多样性和柳珊瑚种上阶元系统发育学两方面的研究进展和所取得研究成果的同时,也讨论了珊瑚虫纲的... 珊瑚分子系统发育学研究始于90年代初,用于柳珊瑚分子系统学研究的主要分子标记是线粒体DNA和核糖体RNA。本文在重点介绍了柳珊瑚种群遗传多样性和柳珊瑚种上阶元系统发育学两方面的研究进展和所取得研究成果的同时,也讨论了珊瑚虫纲的系统发生关系。最后在简单引述了柳珊瑚分子系统发育学同传统形态分类学方法之间关系的同时,也对柳珊瑚分子系统发育学今后的重点研究方向做了预测。 展开更多
关键词 柳珊瑚 八放珊瑚亚纲 珊瑚虫纲 分子系统发育学 线粒体DNA 核糖体RNA
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基于RAG1基因的中国近海13种石首鱼科鱼类系统进化关系 被引量:8
9
作者 马春艳 马凌波 +2 位作者 倪勇 沈盎绿 张永 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期9-16,共8页
为探讨中国近海石首鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增和序列测定,获得了石首鱼类9属13个种类的RAG1基因序列。对序列变异进行分析,基于Kimura双参数法计算属间和种间的遗传距离,并结合GenBank中的同源序列,以攀鲈为外群构建分子系统进化... 为探讨中国近海石首鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增和序列测定,获得了石首鱼类9属13个种类的RAG1基因序列。对序列变异进行分析,基于Kimura双参数法计算属间和种间的遗传距离,并结合GenBank中的同源序列,以攀鲈为外群构建分子系统进化树。将所得的分子数据与形态学分类进行比较,推论如下:(1)中国近海石首鱼类分为两个类群。(2)叫姑鱼亚科与石首鱼亚科以极高的置信度(90%)聚类,并处于系统进化树的基部,支持了形态学上二者是原始种类的分类观点。(3)分子系统树显示黄姑鱼属比银姑鱼属更为原始,但二者在形态分类上归为一个亚科的观点有待进一步商榷。(4)支持尖头黄鳍牙与银牙置于同一牙亚科的不同属的观点。(5)支持了形态学上黄鱼亚科分化最晚的结论。 展开更多
关键词 石首鱼科 RAG1基因 系统进化
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雌性选择与雄鸟鸣唱的进化 被引量:12
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作者 王爱真 雷富民 贾志云 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期305-310,共6页
鸣唱是许多鸟类的重要的雄性第二性征之一。雄性鸣唱包含着丰富的信息 :物种、领域质量、遗传状态和生理状态。这些信息可被雌性用来判断潜在配偶的素质 ,而雌性对复杂鸣唱的偏爱反过来塑造了鸟类的鸣唱。一般认为雌性选择的调控基因位... 鸣唱是许多鸟类的重要的雄性第二性征之一。雄性鸣唱包含着丰富的信息 :物种、领域质量、遗传状态和生理状态。这些信息可被雌性用来判断潜在配偶的素质 ,而雌性对复杂鸣唱的偏爱反过来塑造了鸟类的鸣唱。一般认为雌性选择的调控基因位于决定性别的W染色体上。 展开更多
关键词 鸟类 雌性偏爱 性选择 鸣唱
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基于Cyt b基因序列的大叶蝉亚科部分种类分子系统学分析 被引量:6
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作者 孟泽洪 杨茂发 +2 位作者 周玉锋 吕召云 倪俊强 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2013年第7期1-5,共5页
为探讨吸汁类害虫大叶蝉亚科种类间的系统发生关系,选用线粒体Cyt b基因432bp片段进行扩增、测序,分析大叶蝉亚科9属21种昆虫的系统发育关系。结果表明:Cyt b基因的多序列中,有227个核甘酸变异位点,变异率为52.5%,简约信息位点206个,占... 为探讨吸汁类害虫大叶蝉亚科种类间的系统发生关系,选用线粒体Cyt b基因432bp片段进行扩增、测序,分析大叶蝉亚科9属21种昆虫的系统发育关系。结果表明:Cyt b基因的多序列中,有227个核甘酸变异位点,变异率为52.5%,简约信息位点206个,占总位点数的47.7%;T、C、A、G碱基平均含量分别为38.8%、17.4%、33.2%、10.6%,A+T平均含量为72.0%,明显高于G+C含量(28.0%)。T、C转换大于A、G,T、A颠换占主体。密码子第1、3位点转换已达到一定饱和。以横脊叶蝉亚科(Evacanthinae)的2种类(黑条脊额叶蝉、褐带横脊叶蝉)以及杆叶蝉(Hylicinae)作为外群,基于432bp编码的144个氨基酸序列构建了系统树,MP树和NJ树结构基本一致,均支持大叶蝉各属的单系性,构建的系统树和雄性外生殖器一些特征演化吻合。故Cyt b基因是大叶蝉亚科属种系统发育十分有效的基因。 展开更多
关键词 半翅目 叶蝉科 大叶蝉亚科 分子系统发育 CYT b
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马鸡属鸟类的系统发育关系 被引量:6
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作者 吴爱平 丁炜 +1 位作者 张正旺 詹祥江 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第5期898-902,共5页
The phylogenetic relationships of the avian genus Crossoptilon were studied by comparing mitochondrial control region(D-loop)and cyt b gene nucleotide sequences,with the Lophophorus impejanus and Lophura swinhoii as t... The phylogenetic relationships of the avian genus Crossoptilon were studied by comparing mitochondrial control region(D-loop)and cyt b gene nucleotide sequences,with the Lophophorus impejanus and Lophura swinhoii as the outgroups.Using the synthesizing characters of morphology,ecology and biogeography to combine with Maximum parsimony(MP),Maximum Likelihood(ML)and Bayesin trees,we found that:① C.crossoptilon and C.harmani were closely related and C.harmani was relatively primitive;② C.auritum and C.mantchuricum had a close relationship and C.auritum was relatively primitive;③ the genus Crossoptilon could originate in the boundary region of Sichuan,Yunnan and Tibet.One branch remained near the center of origin and diverged into C.crossoptilon and C.harmani;the other branch spread towards north China and diverged into C.auritum and C.mantchuricum. 展开更多
关键词 马鸡属 线粒体 控制区 细胞色素B 系统发育
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西施舌群体遗传结构及分化的RAPD分析 被引量:5
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作者 孟学平 王帅 +3 位作者 高如承 申欣 程汉良 田美 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期6-9,43,共5页
采用55个随机引物对西施舌(Coelomactra antiquata)5个群体,即长乐(CL)、启东(QD)、连云港(LYG)、胶南(JN)和北海(BH)群体进行RAPD扩增。用PopGen(Version1.32)软件进行遗传多样性分析。结果共筛选出12个重复性好的引物,得到88条清晰稳... 采用55个随机引物对西施舌(Coelomactra antiquata)5个群体,即长乐(CL)、启东(QD)、连云港(LYG)、胶南(JN)和北海(BH)群体进行RAPD扩增。用PopGen(Version1.32)软件进行遗传多样性分析。结果共筛选出12个重复性好的引物,得到88条清晰稳定的条带,扩增片段在100 bp~3 000 bp之间,其中引物S299扩增的600 bp片段为长乐群体特有。多态位点比例为62.07%~78.26%(JN、LYG、BH、QD、CL群体分别为78.26%、77.05%、72.58%、70.05%、62.07%),Shannon指数为0.210 5~0.312 3。群体间遗传距离为0.068 3~0.223 9,其中长乐群体与其余4个群体间的遗传距离为0.182 7~0.223 9,4个非长乐群体的遗传距离为0.068 3~0.136 7。群体间遗传分化系数(Fst)为0.313 01(P<0.05),表明在整个遗传变异中群体间占31.30%。CL群体与QD,BH,JN,LYG群体间的遗传分化系数(Gst)分别为0.364 9,0.344 8,0.325 0,0.309 0;而非长乐群体之间的遗传分化系数为0.148 2~0.240 3;以上数据显示长乐群体遗传分化最大。聚类结果显示,启东和胶南群体首先聚为一支,然后与北海群体聚在一起,再和连云港群体相聚;而长乐群体则单独形成一支。 展开更多
关键词 西施舌(Coelomactra antiquata) 遗传结构 RAPD
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石斑鱼属鱼类线粒体基因组序列特征及系统发育信息评估 被引量:5
14
作者 黄小林 吕国敏 +4 位作者 刘付永忠 李涛 蔡云川 马志洲 黄忠 《生物学杂志》 CAS CSCD 2013年第3期9-13,共5页
通过生物信息学方法,比较分析了已登录到GenBank中的6条石斑鱼和1条豹纹鳃棘鲈的线粒体基因组序列,初步揭示了石斑鱼属线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因、差异位点、选择压力及系统发育等信息。结果表明:1)与大多数脊椎动物一样... 通过生物信息学方法,比较分析了已登录到GenBank中的6条石斑鱼和1条豹纹鳃棘鲈的线粒体基因组序列,初步揭示了石斑鱼属线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因、差异位点、选择压力及系统发育等信息。结果表明:1)与大多数脊椎动物一样,石斑鱼属鱼类线粒体基因组均编码37个基因,基因排列顺序与其它硬骨鱼类一致,其中,基因差异位点比例最大为ND6(33.9%),16SrRNA的差异位点比例最小(13.5%);2)6条石斑鱼线粒体基因组中,所有13个蛋白质编码基因的Tajima’s D检测均为不显著的负值,且Ka/Ks均远小于1,都显示出较强的净化选择作用;3)结合分子系统树的置信度和与序列的信息量,对石斑鱼线粒体13个蛋白质编码基因在属内种间的系统进化分析能力进行了评估,结果表明Cytb和ND2基因是理想的分子标记。 展开更多
关键词 石斑鱼属 线粒体基因组 系统发育信息 分子标记
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淡水涡虫眼点形态发生相关基因研究进展 被引量:4
15
作者 董自梅 李小艳 +2 位作者 陈静 程方方 陈广文 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期422-427,共6页
涡虫是动物界最早出现两侧对称、三胚层、营自由爬行生活的动物类群,在动物系统演化中占有重要地位。由于涡虫眼点结构简单,再生能力极强,因此成为研究视觉系统形成、进化及再生的理想模型。我们以日本三角涡虫(Dugesia japonica)为例,... 涡虫是动物界最早出现两侧对称、三胚层、营自由爬行生活的动物类群,在动物系统演化中占有重要地位。由于涡虫眼点结构简单,再生能力极强,因此成为研究视觉系统形成、进化及再生的理想模型。我们以日本三角涡虫(Dugesia japonica)为例,对淡水涡虫眼点的结构、形态发生过程及眼点再生相关基因进行概述,重点介绍眼点形态发生过程中与眼点前体细胞分化、视神经纤维生长、视觉系统功能恢复及眼点视杯形成相关基因的表达模式及功能分析,并对目前存在的问题及未来的发展进行总结和展望。为探索高等动物包括人类的视觉系统的形成机制提供参考。 展开更多
关键词 眼点 形态发生 基因 淡水涡虫
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核糖体蛋白rpl15cDNA序列在真骨鱼类系统进化研究中的价值 被引量:5
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作者 向筑 张竞男 +2 位作者 宋平 胡珈瑞 钟扬 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期171-178,共8页
应用RTPCR,从真骨总目(Teleostei)5目15种鱼类中首次克隆了核糖体大亚基蛋白L15(rpl15,ribosomalproteinL15)的完整cDNA序列。以海鲢形亚组(Elopomorpha)的鳗鲡作为外类群,对这些真骨鱼类的核糖体蛋白L15cDNA序列进行了系统发育分析,结... 应用RTPCR,从真骨总目(Teleostei)5目15种鱼类中首次克隆了核糖体大亚基蛋白L15(rpl15,ribosomalproteinL15)的完整cDNA序列。以海鲢形亚组(Elopomorpha)的鳗鲡作为外类群,对这些真骨鱼类的核糖体蛋白L15cDNA序列进行了系统发育分析,结果表明:(1)rpl15基因在真骨鱼类等许多真核生物进化中高度保守;(2)系统树中各物种之间的关系与形态分类一致。rpl15编码区适合于真骨鱼类目以上分类阶元的分子系统学研究。 展开更多
关键词 核糖体蛋白L15(rpl15) 分子系统学 真骨鱼类
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不同品种金鱼和鲫鱼的分子系统发育关系研究 被引量:6
17
作者 庄远红 周毅 +3 位作者 牛艳东 邓学建 周蒲荣 李建中 《激光生物学报》 CAS CSCD 2009年第1期46-49,共4页
为探讨不同品种金鱼的系统进化关系,利用PCR技术扩增了金鱼的7个代表品种红龙睛(Red dragon goldfish)、红帽子(Red cap goldfish)、虎头(Tiger head goldfish)、琉金(Gold plating goldfish)、墨龙睛(Black dragon goldfish... 为探讨不同品种金鱼的系统进化关系,利用PCR技术扩增了金鱼的7个代表品种红龙睛(Red dragon goldfish)、红帽子(Red cap goldfish)、虎头(Tiger head goldfish)、琉金(Gold plating goldfish)、墨龙睛(Black dragon goldfish)、水泡眼(Water vesicle goldfish)、珍珠(Genuine pearl goldfish)的线粒体DNA上细胞色素b的部分核苷酸序列,长度为597bp。结合GenBank中红鲫、野鲫、日本白鲫、银鲫、鲤鱼的序列进行比较分析,结果显示,这7个金鱼品种之间的同源性都很高,在99.5%-100%之间;7种金鱼和红鲫的同源性也很高,为99.5%~99.8%,与野鲫的同源性在96.8%~97.2%,与日本白鲫、银鲫的同源性为93.1%~94.3%,与鲤鱼的同源性相对较低,为88.3%-88.6%。利用DNAstar软件构建了不同品种金鱼和鲫鱼的分子系统树,从分子水平进一步证实了金鱼起源于野鲫。 展开更多
关键词 金鱼 细胞色素B 野鲫 红鲫 分子系统发育
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麻蜥属Eremias的系统学研究进展 被引量:8
18
作者 郭宪光 陈达丽 +1 位作者 万宏富 王跃招 《四川动物》 CSCD 北大核心 2010年第4期665-672,共8页
由于各种原因,麻蜥属的分类仍较混乱。本文对麻蜥属的系统学研究历史做了系统回顾,从属、亚属、种等各级分类水平叙述了其研究历史,包括属的建立与订正、物种组成、地理分布特征,总结了通过外部形态和分子等研究手段,在分类、系统发育... 由于各种原因,麻蜥属的分类仍较混乱。本文对麻蜥属的系统学研究历史做了系统回顾,从属、亚属、种等各级分类水平叙述了其研究历史,包括属的建立与订正、物种组成、地理分布特征,总结了通过外部形态和分子等研究手段,在分类、系统发育、生物地理等研究层次上所取得的成果,在此基础上提出需要深入研究麻蜥属的系统发育、谱系地理和物种形成机制等,包括该属分布格局与青藏高原隆升、天山隆升及中亚荒漠化和第四纪冰期的关系。 展开更多
关键词 麻蜥属 系统学 研究进展
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高鳍带鱼遗传变异及与近缘种间的系统进化关系 被引量:5
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作者 吴仁协 郭刘军 刘静 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2011年第3期648-655,共8页
高鳍带鱼Trichiurus lepturusLinnaeus,1758分布广泛、形态多变,与近缘种间辨别困难,在其种群鉴别、物种分类及系统进化上争议较大。本项研究通过测定采自海南三亚外海高鳍带鱼疑似种11个个体的线粒体16S rRNA基因部分序列,结合已报道... 高鳍带鱼Trichiurus lepturusLinnaeus,1758分布广泛、形态多变,与近缘种间辨别困难,在其种群鉴别、物种分类及系统进化上争议较大。本项研究通过测定采自海南三亚外海高鳍带鱼疑似种11个个体的线粒体16S rRNA基因部分序列,结合已报道的该物种其它地理种群及其近缘种的同源序列,采用生物软件对碱基组成和序列变异进行分析,计算Kimura双参数净遗传距离和分歧时间,进行分子变异分析(AMOVA)和分化固定指数(FST)计算,并以小带鱼Eupleurogrammus muticus为外群构建NJ、ML系统树,综合探讨世界范围内高鳍带鱼的遗传变异及与近缘种间的系统进化关系。根据所得分子数据并结合形态学研究结果得出如下结论:1)采自海南三亚外海的带鱼是高鳍带鱼T.lepturusLinnaeus,1758,该物种在中国南海和东海南部有分布;2)海南三亚外海、非洲西岸和大西洋西岸的高鳍带鱼是同一个物种的3个地理种群,彼此间遗传分化显著;3)高鳍带鱼是带鱼属中最新演化的种类,与日本带鱼T.japonicus、带鱼未定种Trichiurussp.2具有较近的亲缘关系;短带鱼T.brevis则是比它们原始的种类。 展开更多
关键词 高鳍带鱼 线粒体16S RRNA 遗传变异 系统进化
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雀科9种鸟类11个线粒体tRNA基因序列及二级结构比较研究 被引量:5
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作者 王翔 孙毅 +2 位作者 王黎 于业飞 李庆伟 《辽宁师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2004年第1期80-84,共5页
利用PCR方法对雀科9种鸟类11个线粒体基因组中3个主要的tRNA基因簇,即IQM(tRNAIle-tRNAGln-tRNAMet),WANCY(tRNATrp-tRNAAla-tRNAAsn-tRNACys-tRNATyr)和HSL(tRNAHis-tRNASer(AGY)-tRNALeu(CUN))进行扩增和序列测定,这些tRNA基因序列中... 利用PCR方法对雀科9种鸟类11个线粒体基因组中3个主要的tRNA基因簇,即IQM(tRNAIle-tRNAGln-tRNAMet),WANCY(tRNATrp-tRNAAla-tRNAAsn-tRNACys-tRNATyr)和HSL(tRNAHis-tRNASer(AGY)-tRNALeu(CUN))进行扩增和序列测定,这些tRNA基因序列中可变核苷酸位点占15%,其中59%出现在环区,且存在插入核苷酸;茎区相对保守,其中一些变异如双链的互补性碱基突变,G-U配对等对于维系tRNA二级结构的稳定性非常重要.利用11个线粒体tRNA基因全序列,以鹌鹑为外群构建了雀科9种鸟类的系统发育树,结果表明:黄雀与其它物种关系较远;亚科中灰头与雀亚科关系最近,而小与三道眉草比较特化,这与根据二级结构特征得出的结论相吻合.利用茎区序列构建的NJ树在亚科物种的分类地位上存在分歧,可能是由于核苷酸数目较少,信息量小,在解决近缘物种间的分类地位时受到限制.结合线粒体tRNA基因二级结构特征比较和系统发育分析,初步认为线粒体tRNA基因二级结构特征对于推断雀科属间的分类地位具有较高的置信度. 展开更多
关键词 线粒体基因 tRNA基因簇 二级结构 系统发育 雀科 二级结构 基因序列
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