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植物乳植杆菌WCFS1胞外多糖生物合成基因簇鉴定及其转录组差异表达基因功能研究
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作者 孙娅西 王智浩 +5 位作者 刘莹莹 黄淑婷 赵芳 吕广萍 宦海琳 杨瑶 《食品工业科技》 北大核心 2026年第2期180-190,共11页
目的:本研究针对植物乳植杆菌WCFS1菌株,研究其不同胞外多糖合成基因簇(cps)的构效关系,为进一步研究乳酸菌胞外多糖(Exopolysaccharides,EPS)的菌株特异性奠定基础。方法:利用Cre-loxP同源重组和CRISPR/Cas9技术构建WCFS1菌株的突变株W... 目的:本研究针对植物乳植杆菌WCFS1菌株,研究其不同胞外多糖合成基因簇(cps)的构效关系,为进一步研究乳酸菌胞外多糖(Exopolysaccharides,EPS)的菌株特异性奠定基础。方法:利用Cre-loxP同源重组和CRISPR/Cas9技术构建WCFS1菌株的突变株WCFS1∆cps1-3和WCFS1∆cps4;以野生菌为对照,研究不同突变株生长、合成EPS产量及单糖组成等理化特性;利用转录组学分析WCFS1∆cps1-3突变株在3种培养条件下差异表达基因功能。结果:WCFS1∆cps4突变株菌体合成EPS产量下降更多,降至野生型的62.2%,菌体生长迟缓,到达稳定期的时间由12 h延迟至32 h,但生物量不变;WCFS1∆cps1-3突变株合成EPS单糖组成变化较大,甘露糖的组分显著上升至32.68%,半乳糖组分显著下降至3.83%,而鼠李糖组分则未检出;相比野生菌,改变不同培养条件,WCFS1∆cps1-3突变株显著性差异表达的基因数目仅占MRS培养条件下的5.1%(上调)和6.8%(下调),GO和KEGG分析显示功能也有较大变化。结论:WCFS1菌株不同cps簇构效关系不同,基因序列高度保守的cps4簇可能通过调控合成EPS的产量以保证菌体正常生长,而cps1-3簇可能通过调控EPS的单糖组成使菌株在环境适应性方面更具优势。 展开更多
关键词 植物乳植杆菌WCFS1 胞外多糖(EPS) cps基因簇 基因敲除 转录组分析
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线粒体复合物Ⅰ亚基NDUFS4在东亚三角涡虫再生中的功能解析
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作者 于萍 王金蕾 +9 位作者 孟宪鹏 张颖 张子怡 孙雪平 魏文硕 张永乐 马秀雪 高丽丽 庞秋香 李奥 《四川大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第2期308-315,共8页
本研究旨在探究线粒体复合物Ⅰ(ComplexⅠ,CⅠ)的核心结构蛋白NADH脱氢酶铁硫蛋白4(NADH Dehydrogenase(Ubiquinone)Fe S protein 4,NDUFS4)在涡虫成体干细胞功能维持与神经再生过程中的作用。通过克隆获得东亚三角涡虫(Dugesia sp.)ndu... 本研究旨在探究线粒体复合物Ⅰ(ComplexⅠ,CⅠ)的核心结构蛋白NADH脱氢酶铁硫蛋白4(NADH Dehydrogenase(Ubiquinone)Fe S protein 4,NDUFS4)在涡虫成体干细胞功能维持与神经再生过程中的作用。通过克隆获得东亚三角涡虫(Dugesia sp.)ndufs4基因并进行序列及结构预测分析,结果显示其编码蛋白在保守结构域和关键氨基酸位点高度保守。采用RNA干扰技术持续敲降ndufs4表达,测定再生涡虫胚基(blastema)生长速率,并结合原位杂交与免疫组织化学等实验技术检测成体干细胞(Neoblasts)的增殖与分化、神经再生情况。结果表明,ndufs4敲降导致涡虫再生速率显著减慢,神经再生明显受损;同时,干细胞标记基因表达水平下降,干细胞分化进程受阻。上述结果说明,NDUFS4是维持涡虫成体干细胞群体功能及促进神经再生的必需蛋白,在生物再生中发挥重要调控功能。 展开更多
关键词 东亚三角涡虫 NADH脱氢酶铁硫蛋白4 再生 干细胞增殖与分化
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半理性设计提升葡萄糖氧化酶活性与热稳定性
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作者 李荷月 郭煜辉 +6 位作者 裴雯雯 王倩 李娇 赵伟 秦慧民 孙媛霞 陈朋 《食品工业科技》 北大核心 2026年第4期59-68,共10页
本研究旨在通过半理性设计策略同时提高黑曲霉(Aspergillus niger)来源葡萄糖氧化酶(AnGOD)酶活性与热稳定性。基于FireProt在线工具与序列一致性分析设计突变位点,通过定点突变及两阶段组合突变筛选最优突变体,并利用分子动力学模拟解... 本研究旨在通过半理性设计策略同时提高黑曲霉(Aspergillus niger)来源葡萄糖氧化酶(AnGOD)酶活性与热稳定性。基于FireProt在线工具与序列一致性分析设计突变位点,通过定点突变及两阶段组合突变筛选最优突变体,并利用分子动力学模拟解析其性能提升机制。结果表明,从83个设计位点中筛选出12个单点优势突变体,经两阶段组合突变获得最优突变体M5(T276F/T34V/Q90R/S53F/S74T)。M5的比酶活较野生型(WT)提高4.2倍,k_(cat)值为755.0 s^(-1),催化效率(k_(cat)/k_(m))为34.52 L·mmol^(-1)·s^(-1),分别为WT的3.67、2.48倍。在65℃下,M5的半衰期为30 min,较WT(1 min)提高了30倍。分子动力学模拟表明,M5的RMSD均值与非催化区RMSF均值较WT分别降低了12.9%与12.4%,与底物及辅酶之间的氢键数量分别增加10.3%与8.8%,此外,S74T新增氢键网络,Q90R突变引入正电荷,增强表面静电互补,这些因素共同提升了AnGOD的热稳定性与催化活性。本研究通过半理性设计与组合突变策略,显著缓解了AnGOD酶改造中热稳定性与催化活性的权衡问题,为GOD的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 葡萄糖氧化酶 活性与稳定性权衡 半理性设计 一致性分析 分子动力学模拟
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端粒延长替代机制在端粒酶阴性肿瘤和衰老细胞中的作用与机制
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作者 贾同欣 熊梦婕 +4 位作者 侯凯龙 刘嘉华 张昊楠 贾舒婷 刘静 《生物化学与生物物理进展》 北大核心 2026年第1期92-104,共13页
端粒延长替代机制(alternative lengthening of telomeres,ALT)是一种高度依赖于同源重组的DNA损伤修复过程,其通过DNA修复机制介导端粒DNA的合成,因此该过程也伴随着一些独特的表型:比如复制压力累积、小分子泛素相关修饰物蛋白(small ... 端粒延长替代机制(alternative lengthening of telomeres,ALT)是一种高度依赖于同源重组的DNA损伤修复过程,其通过DNA修复机制介导端粒DNA的合成,因此该过程也伴随着一些独特的表型:比如复制压力累积、小分子泛素相关修饰物蛋白(small ubiquitin-related modifier protein,SUMO)依赖的ALT相关早幼粒细胞白血病(promyelocytic leukemia,PML)蛋白小体(ALT-associated PML bodies,APBs)上调以及染色质的动态重塑等。大部分的肿瘤细胞主要通过重新激活端粒酶延长端粒,而大约10%~15%的肿瘤细胞由于缺失端粒酶活性,则是通过启动ALT来维持端粒长度。与端粒酶阴性肿瘤类似,绝大多数体细胞由于端粒酶活性低或缺失导致细胞在分裂增殖过程中端粒逐渐缩短最终进入衰老状态。值得注意的是,有研究发现,在细胞衰老的进程中也伴随着复制压力积累和APBs的增加等类似“ALT激活”的现象,提示衰老细胞与端粒酶阴性肿瘤之间可能具有某些共同的调控机制。尽管这些“ALT激活”的衰老细胞中端粒长度并未有效延长,但ALT可能是衰老细胞逃逸衰老进而肿瘤化的途径之一。因此,本文针对端粒酶阴性肿瘤和衰老细胞典型特征的相关性进行较全面的综述,阐明ALT在调控细胞衰老和肿瘤发生过程中的潜在机制,为临床上端粒酶阴性肿瘤的治疗提供潜在的靶点和策略。 展开更多
关键词 端粒延长替代机制 端粒酶阴性肿瘤 衰老细胞 复制压力 染色质可及性
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缺氧协同幽门螺杆菌感染胃上皮细胞诱导缺氧诱导因子1α表达的调控机制和功能研究
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作者 何佳 王玲 +1 位作者 马瑛 吕一品 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2026年第1期76-84,共9页
幽门螺杆菌(helicobacter pylori,H.pylori)在介导胃黏膜损伤中发挥了极其重要的作用,同时研究表明,中高海拔与慢性胃炎也存在显著联系。本研究旨在探究缺氧协同H.pylori感染在调节胃上皮细胞病理性炎症损伤中的影响及其潜在的作用机制... 幽门螺杆菌(helicobacter pylori,H.pylori)在介导胃黏膜损伤中发挥了极其重要的作用,同时研究表明,中高海拔与慢性胃炎也存在显著联系。本研究旨在探究缺氧协同H.pylori感染在调节胃上皮细胞病理性炎症损伤中的影响及其潜在的作用机制。通过收集平原及高原地区未感染和感染H.pylori临床患者胃窦黏膜组织,并体外构建缺氧协同H.pylori感染胃上皮的细胞及人胃类器官模型,运用酶联免疫吸附实验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)、免疫组织化学染色、免疫荧光染色、实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)和Western印迹检测缺氧协同H.pylori感染对胃黏膜病理性炎症损伤,以及缺氧诱导因子1α(hypoxia-inducible factor-1α,HIF-1α)表达的影响,结果发现,在体内的人胃炎临床样本及体外胃上皮细胞及胃类器官模型中,缺氧协同H.pylori感染可诱导HIF-1α表达水平上调(P<0.05);经在体外细胞模型中进行信号通路筛查,探讨缺氧协同H.pylori感染诱导HIF-1α表达上调的机制发现,当PI3K/AKT信号通路被阻断时,缺氧协同H.pylori感染诱导的HIF-1α的表达受到显著抑制(P<0.05);最后利用生物信息学及转录物组测序对HIF-1α调控的下游靶基因进行初步验证,结果提示,溶质载体家族2成员1(solute carrier family 2 member 1,SLC2A1)是HIF-1α调控的下游重要靶分子之一(P<0.05)。综上结果表明,缺氧协同H.pylori感染可经PI3K/AKT通路诱导HIF-1α表达上调,后者可促进SLC2A1的表达上调,提示高原地区H.pylori感染患者其胃黏膜微环境中糖酵解水平可能更活跃,这为研究缺氧协同H.pylori感染胃上皮细胞病理性炎症损伤的作用机制提供了新的理论支撑,也为防治缺氧协同H.pylori感染相关性胃炎提供新思路。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 缺氧 高原 人胃类器官 缺氧诱导因子1Α
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核酸生物传感
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作者 姚林欣 宋璐 +1 位作者 李敏 左小磊 《合成生物学》 北大核心 2026年第1期66-92,共27页
脱氧核糖核酸(DNA)分子在生命体内发挥储存和传递遗传信息的生物学功能,在体外,它还可以作为一种可编程的分子自组装纳米材料。基于DNA双螺旋模型和碱基互补配对原则,研究人员开发了多种DNA自组装技术并以此构建了尺寸、形貌可控以及具... 脱氧核糖核酸(DNA)分子在生命体内发挥储存和传递遗传信息的生物学功能,在体外,它还可以作为一种可编程的分子自组装纳米材料。基于DNA双螺旋模型和碱基互补配对原则,研究人员开发了多种DNA自组装技术并以此构建了尺寸、形貌可控以及具有动态响应特性的二维和三维纳米结构。鉴于DNA纳米结构具有可控的尺寸、精确的寻址能力、可定制的生物功能、良好的生物相容性等特点,其已被广泛用于生物传感、生物成像、组织工程、药物递送等分子生物学研究领域。本文概述了利用DNA自组装技术构建的二维和三维DNA纳米结构,并分类讨论了DNA链置换驱动以及环境刺激驱动的DNA纳米结构动态变构,重点介绍了DNA纳米结构的生物传感应用,最后展望了基于DNA自组装技术构建的生物传感器的发展前景与面临挑战,包括提高DNA纳米结构的合成效率和稳定性、开发体内动态监测技术、建立多重检测与快速诊断方法以及探索与CRISPR技术联用的新发展方向。 展开更多
关键词 DNA自组装技术 2D DNA纳米结构 3D DNA纳米结构 动态DNA纳米结构 生物传感 生物标志物
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糖蛋白非转移性黑色素瘤蛋白B在呼吸系统疾病中的研究进展
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作者 徐一凡 魏婷婷 +1 位作者 罗玉巧 杨冬 《中国病理生理杂志》 北大核心 2026年第1期148-155,共8页
糖蛋白非转移性黑色素瘤蛋白B(glycoprotein non-metastatic melanoma protein B,GPNMB)是一种广泛表达于多种组织的I型跨膜糖蛋白,其在细胞黏附、迁移、免疫调节及基质重塑等过程中发挥关键作用。近年来,研究表明GPNMB可通过PI3K/Akt/m... 糖蛋白非转移性黑色素瘤蛋白B(glycoprotein non-metastatic melanoma protein B,GPNMB)是一种广泛表达于多种组织的I型跨膜糖蛋白,其在细胞黏附、迁移、免疫调节及基质重塑等过程中发挥关键作用。近年来,研究表明GPNMB可通过PI3K/Akt/mTOR、MAPK、CD44/整合素等信号通路参与肿瘤转移、纤维化进程、免疫耐受及神经保护等多种病理生理过程。虽然其在乳腺癌、黑色素瘤及肝纤维化等疾病中的作用已较为明确,但在呼吸系统疾病中的研究仍处于起步阶段。现有证据提示,GPNMB在非小细胞肺癌、特发性肺纤维化及慢性阻塞性肺疾病中高表达,并可能通过调控“肺泡上皮细胞-巨噬细胞-成纤维细胞”信号轴影响疾病发生与进展。本文旨在综述GPNMB的分子特性及其在多种疾病中的作用机制,重点归纳其在非小细胞肺癌、特发性肺纤维化及慢性阻塞性肺疾病等呼吸系统疾病中的研究现状。 展开更多
关键词 糖蛋白非转移性黑色素瘤蛋白B 呼吸系统疾病 纤维化 免疫调节 信号通路
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RNA特异性腺苷脱氨酶在无脊椎动物中的功能研究进展
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作者 李红岩 张依 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第1期125-133,共9页
RNA特异性腺苷脱氨酶(Adenosine deaminases acting on RNA,ADAR)蛋白家族广泛分布于脊椎动物与无脊椎动物中。目前,脊椎动物ADAR的功能研究已较为系统和深入,诸多研究指出了其在免疫调控、病毒防御、癌症治疗以及神经发育等多个领域发... RNA特异性腺苷脱氨酶(Adenosine deaminases acting on RNA,ADAR)蛋白家族广泛分布于脊椎动物与无脊椎动物中。目前,脊椎动物ADAR的功能研究已较为系统和深入,诸多研究指出了其在免疫调控、病毒防御、癌症治疗以及神经发育等多个领域发挥的关键作用。本文归纳了无脊椎动物ADAR研究中的关键问题,重点聚焦于其结构特征、表达模式、RNA编辑情况,以及在免疫和神经发育方面的功能。分析表明,无脊椎动物ADAR与脊椎动物ADAR具有相似的功能,这充分体现了ADAR在无脊椎与脊椎动物之间功能的高度保守性。在此基础上,本文对无脊椎动物ADAR的系统演化规律及其在跨物种适应性中的分子机制研究前景进行了展望,以期为深入解析ADAR家族的进化保守性与功能多样性提供理论参考。 展开更多
关键词 RNA特异性腺苷脱氨酶蛋白 无脊椎动物 RNA编辑 先天免疫 神经系统
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CTP:磷酸胆碱胞苷酰转移酶α(CCTα)在膜脂生成和脂质代谢中的作用及调控研究进展 被引量:1
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作者 艾庆辉 战蕊 《水产学报》 北大核心 2025年第6期1-8,共8页
磷脂酰胆碱(PC)是细胞膜磷脂的主要成分,具有重要的生物学功能。PC的主要合成途径是CDP-胆碱途径,而CTP:磷酸胆碱胞苷酰转移酶(CCT)是该途径的关键限速酶,也是维持PC稳态的关键因素。CCTα是CCT家族主要亚型之一,广泛分布于哺乳动物各... 磷脂酰胆碱(PC)是细胞膜磷脂的主要成分,具有重要的生物学功能。PC的主要合成途径是CDP-胆碱途径,而CTP:磷酸胆碱胞苷酰转移酶(CCT)是该途径的关键限速酶,也是维持PC稳态的关键因素。CCTα是CCT家族主要亚型之一,广泛分布于哺乳动物各器官与组织中,且在膜脂生成与脂质代谢等过程中扮演重要角色。近年来的研究显示,CCTα同样存在于鱼类中,且在鱼类脂质代谢中具有关键调控作用。本文将对CCTα在哺乳动物和鱼类膜脂生成与脂质代谢中的功能和调控作用进行综述,探讨CCTα作为调控鱼类营养性代谢紊乱的靶点分子的潜力,以期为鱼类健康养殖提供理论依据。 展开更多
关键词 CTP:磷酸胆碱胞苷酰转移酶α(CCTα) 磷脂酰胆碱 膜脂生成 脂质代谢
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核盘菌致病机制研究进展 被引量:1
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作者 潘洪玉 李亚岚 +1 位作者 孙洪宇 肖坤钦 《吉林大学学报(理学版)》 北大核心 2025年第1期253-261,共9页
核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum(Lib.)de Bary)是世界性的死体营养型植物病原真菌,寄主范围极广,所引起的大豆和油菜等菌核病会导致农业生产的巨大经济损失.核盘菌致病机制复杂,不仅具有直接杀死细胞的典型死体营养阶段,也包含需抑制... 核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum(Lib.)de Bary)是世界性的死体营养型植物病原真菌,寄主范围极广,所引起的大豆和油菜等菌核病会导致农业生产的巨大经济损失.核盘菌致病机制复杂,不仅具有直接杀死细胞的典型死体营养阶段,也包含需抑制植物免疫的短暂活体营养期.核盘菌具有种类繁多的致病因子,包括介导侵染结构形成或抗逆能力的关键调控因子、降解植物细胞组分的水解酶、草酸、诱导植物细胞死亡或抑制植物免疫的效应蛋白等.综述核盘菌侵染模型,总结各种致病因子,尤其是效应蛋白在核盘菌致病中的作用,并结合最新研究结果对核盘菌致病新机制进行展望,为作物菌核病的防控提供理论依据. 展开更多
关键词 核盘菌 致病机制 致病因子 效应蛋白
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玉米须、猴头菇和灵芝粗多糖复配物的协同作用、结构分析及抗氧化活性研究
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作者 宫春宇 王欣宇 +3 位作者 杨语涵 郑程远 孙长豹 王拓一 《天然产物研究与开发》 北大核心 2025年第11期2078-2089,共12页
基于DPPH自由基清除能力,采用Chou-Talalay法计算协同指数分析复配协同效果,研究玉米须粗多糖(corn silk polysaccharide,CSP)、猴头菇粗多糖(Hericium erinaceus polysaccharide,HEP)和灵芝粗多糖(Ganoderma lucidum polysaccharide,G... 基于DPPH自由基清除能力,采用Chou-Talalay法计算协同指数分析复配协同效果,研究玉米须粗多糖(corn silk polysaccharide,CSP)、猴头菇粗多糖(Hericium erinaceus polysaccharide,HEP)和灵芝粗多糖(Ganoderma lucidum polysaccharide,GLP)复配物的协同抗氧化作用。采用苯酚硫酸法和杜马斯燃烧法测定复配物的多糖与蛋白质含量,并结合高效液相色谱和红外光谱分析其相对分子质量、单糖组成及结构特征,并评估其体外抗氧化活性。基于斑马鱼胚胎氧化应激模型进一步研究复配物的体内抗氧化效果。研究结果表明,HEP和CSP质量比为1∶9、2∶8、3∶7时表现出协同作用;向两种多糖复配物HCSP-30(3∶7)中按比例添加GLP,考察3种多糖复配,发现当GLP占比为15%(TCSP-15)时协同效果最佳,该复配物具有良好的抗氧化活性,对DPPH自由基、羟基自由基和ABTS^(+)自由基的IC_(50)分别为138.73±2.43μg/mL、1.79±0.01 mg/mL和33.70±0.24μg/mL;该复配物多糖含量为47.08%±0.29%,蛋白含量17.96%±0.16%,多糖主成分分子量为1.39×10~4 Da,主要由甘露糖、鼠李糖、半乳糖醛酸、葡萄糖、半乳糖和阿拉伯糖组成,其中葡萄糖和半乳糖含量较高,具有典型的β构型和吡喃糖环特征;在体内实验中,该复配物能有效降低斑马鱼胚胎的死亡率、改善发育情况及氧化应激水平,并提高抗氧化酶活性,表明其对氧化应激模型斑马鱼具有保护作用。 展开更多
关键词 玉米须粗多糖 猴头菇粗多糖 灵芝粗多糖 协同作用 抗氧化活性
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林蛙残体多肽螯合硒的制备及其抗炎活性
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作者 徐萍 王君淑 +2 位作者 鞠凤霞 李深 张凤清 《吉林大学学报(理学版)》 北大核心 2025年第3期954-962,共9页
以林蛙(Rana dybowskii)残体为原材料,在酶解条件下获得林蛙残体多肽(RDRP),再与硒离子(Se4)螯合制备林蛙残体多肽螯合硒(RDRPCS),对合成的化合物进行表征,研究螯合反应的优化条件,并通过体外细胞模型对其抗炎活性进行研究.实验结果表明... 以林蛙(Rana dybowskii)残体为原材料,在酶解条件下获得林蛙残体多肽(RDRP),再与硒离子(Se4)螯合制备林蛙残体多肽螯合硒(RDRPCS),对合成的化合物进行表征,研究螯合反应的优化条件,并通过体外细胞模型对其抗炎活性进行研究.实验结果表明:Se4与RDRP作用生成螯合物;RDRPCS有足够的金属结合位点,螯合位点分别为氨基、羟基和C=O;螯合工艺优化结果为温度60℃,pH=6,时间65 min,质量比2.5:1,该条件下螯合反应的效率为70.7%;不同浓度的螯合物对RAW264.7炎症细胞模型的NO,TNF-α,IL-6和IL-1β的释放量均具有抑制效果. 展开更多
关键词 林蛙残体肽 螯合硒 抗炎 细胞模型
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黄精多糖螯合锌的制备工艺优化及对Caco-2细胞锌转运蛋白表达的影响
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作者 徐萍 李倩 +3 位作者 王君淑 鞠凤霞 马睿 张凤清 《吉林大学学报(理学版)》 北大核心 2025年第5期1523-1531,共9页
为开发一种新型有机补锌剂,将药食同源植物黄精(Polygonatum rhizoma)中的黄精多糖与硫酸锌进行螯合制备黄精多糖螯合锌,优化螯合工艺,并通过紫外-可见光谱、Fourier变换红外光谱、扫描电镜及体外Caco-2细胞吸收模型实验对螯合物进行表... 为开发一种新型有机补锌剂,将药食同源植物黄精(Polygonatum rhizoma)中的黄精多糖与硫酸锌进行螯合制备黄精多糖螯合锌,优化螯合工艺,并通过紫外-可见光谱、Fourier变换红外光谱、扫描电镜及体外Caco-2细胞吸收模型实验对螯合物进行表征和评估.实验结果表明:最优螯合工艺为温度60℃、pH=7、时间60 min、多糖锌比8∶1,该条件下螯合率可达58.7%;Zn^(2+) 与黄精多糖发生吸附作用并形成螯合物,螯合位点为羧基、羟基和羰基;Caco-2细胞中锌相关转运蛋白ZnT-4,ZnT-6和ZnT-8表达量升高.因此制备的黄精多糖螯合锌具有良好的螯合特性及促进锌吸收的潜力. 展开更多
关键词 黄精多糖锌螯合物 体外Caco-2细胞吸收模型 转运蛋白
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聚酮合酶模块中酮合成酶的研究进展
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作者 薛永常 亚克布江·艾尼娃尔 +2 位作者 许佳 黄琪康 刘长斌 《中国抗生素杂志》 北大核心 2025年第7期729-739,共11页
酮合成酶(ketosynthase,KS)是聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)复合酶重要一员,能催化酰基辅酶A衍生物加载到酰基载体蛋白(acyl carrier protein,ACP)的磷酸泛酰巯基乙炔(phosphopantetheine,Ppant)链上进行脱羧缩合反应,实现聚酮链... 酮合成酶(ketosynthase,KS)是聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)复合酶重要一员,能催化酰基辅酶A衍生物加载到酰基载体蛋白(acyl carrier protein,ACP)的磷酸泛酰巯基乙炔(phosphopantetheine,Ppant)链上进行脱羧缩合反应,实现聚酮链的延伸,在聚酮化合物生物合成起着重要的作用。本文通过对KS的结构功能、KS与其他结构域的相互作用及在抗生素生物合成的应用等进行了综述,为研究KS结构域的功能和调控机制、提高聚酮化合物产量和开发新型聚酮抗生素提供理论基础。 展开更多
关键词 酮合成酶 聚酮化合物 抗生素生物合成 结构域改造
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植物乳杆菌W1荚膜多糖结构、免疫及抗衰老活性的研究 被引量:3
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作者 高永娇 王坤 +1 位作者 赵婧 左锋 《食品工业科技》 北大核心 2025年第4期90-99,共10页
为了初步探究植物乳杆菌W1荚膜多糖(CPS)的结构及生物活性。本研究采用酶解法提取制备CPS,通过凝胶渗透色谱系统、傅里叶红外光谱和高效液相色谱法分析其绝对分子量、官能团和单糖组成,并利用RAW264.7细胞和秀丽隐杆线虫模型,评估CPS的... 为了初步探究植物乳杆菌W1荚膜多糖(CPS)的结构及生物活性。本研究采用酶解法提取制备CPS,通过凝胶渗透色谱系统、傅里叶红外光谱和高效液相色谱法分析其绝对分子量、官能团和单糖组成,并利用RAW264.7细胞和秀丽隐杆线虫模型,评估CPS的免疫和抗衰老活性。结果表明,CPS是一种平均分子量为5.49×10^(4) Da,由葡萄糖和半乳糖组成的杂多糖,其单糖摩尔比为3.12:1。CPS可以促进RAW264.7细胞的增殖和对中性红的吞噬作用,促进NO和细胞因子的分泌,从而发挥免疫调节作用;125μg/mL剂量下,RAW264.7细胞的TNF-α、IL-6、IL-1β的分泌水平达到最大值,分别为对照组的1.26倍、1.11倍、1.96倍。同时,CPS可显著提升线虫的抗氧化体系(P<0.05),延长其寿命,并提高其应激耐受性。正常、氧化应激和热休克环境下线虫的平均寿命均在125μg/mL处理剂量下达到最大值,寿命延长率分别为21.05%±0.21%、42.86%±0.27%和50.00%±0.27%。以上研究结果表明CPS具有良好的生物活性,具有开发为功能性辅料应用于食品中的潜力。 展开更多
关键词 荚膜多糖 巨噬细胞 免疫活性 秀丽隐杆线虫
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SWEET蛋白在植物与病原物互作中的功能研究进展 被引量:2
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作者 汪洋一舟 郭尽新 +5 位作者 乔凯彬 徐珣 刘翔宇 王凤婷 潘洪玉 刘金亮 《吉林大学学报(理学版)》 北大核心 2025年第1期241-252,共12页
SWEET蛋白是一类新型糖转运蛋白,负责介导细胞中糖类的双向跨膜运输,在植物生长发育过程中具有韧皮部装载,植物激素转运,花、果实和种子的发育,植物与病原物之间的互作以及植物和微生物之间共生等重要功能,是植物与病原物互作过程的重... SWEET蛋白是一类新型糖转运蛋白,负责介导细胞中糖类的双向跨膜运输,在植物生长发育过程中具有韧皮部装载,植物激素转运,花、果实和种子的发育,植物与病原物之间的互作以及植物和微生物之间共生等重要功能,是植物与病原物互作过程的重要参与者.总结SWEET蛋白在生物胁迫中的应答机制以及植物与病原物(细菌、真菌、线虫和病毒)互作中SWEET基因的代谢特征、调控途径及特异性防御反应,并讨论使用基因编辑工具编辑SWEET基因增强植物对病原物的抗性及其在农业领域中的应用.为深入研究SWEET蛋白参与植物-病原物互作的机制及利用SWEET基因进行抗病育种提供参考. 展开更多
关键词 糖转运蛋白 SWEET蛋白 SWEET基因 植物-病原物互作 生物胁迫 寄主防御 抗病育种
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基于蛋白组学解析木芙蓉变色的蛋白调控机制 被引量:2
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作者 朱章顺 曾心美 +3 位作者 石小庆 马娇 李强 刘晓莉 《西南农业学报》 北大核心 2025年第2期240-249,共10页
【目的】为解析重要观赏植物木芙蓉变色的遗传机制,以品种‘醉芙蓉’为研究对象,通过蛋白组学用于测定醉芙蓉在白色、粉色、红色3个变色时期的蛋白质表达差异,揭示‘醉芙蓉’快速变色的遗传和生理机制。【方法】采集3个变色期的‘醉芙... 【目的】为解析重要观赏植物木芙蓉变色的遗传机制,以品种‘醉芙蓉’为研究对象,通过蛋白组学用于测定醉芙蓉在白色、粉色、红色3个变色时期的蛋白质表达差异,揭示‘醉芙蓉’快速变色的遗传和生理机制。【方法】采集3个变色期的‘醉芙蓉’花样本,用SDS-PAGE法和质谱方法对样品蛋白进行定量和定性分析。【结果】共有6127个蛋白质在白色及粉红色醉芙蓉花朵中表达,其中735个蛋白质在粉红色醉芙蓉花朵中上调表达,698个蛋白质下调表达。在醉芙蓉由粉变红过程中,共有6060个蛋白质发生表达,其中有760个蛋白上调表达,804个蛋白质下调表达。在醉芙蓉颜色不断加深过程中有66个蛋白质表达量不断显著提升(P<0.05,下同),包括精氨酸琥珀酸裂解酶(Argininosuccinate lyase)、丝氨酸羟甲基转移酶(Serine hydroxymethyltransferase)、Ras相关蛋白(Ras-related protein)、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(Phosphoenolpyruvate carboxylase)等蛋白质。此外有86个蛋白质随着醉芙蓉花颜色加深表达量不断显著降低,包括支链氨基酸氨基转移酶(Branched-chain-amino-acid aminotransferase)、紫色酸性磷酸酶(Purple acid phosphatase)、肉桂醇脱氢酶(Putative cinnamyl alcohol dehydrogenase)等。此外,205个蛋白质随着醉芙蓉由白色变粉色然后变红色先上调表达,后下调表达,而315个蛋白质随着醉芙蓉由白色变粉色然后变红色先下调表达,后上调表达。GO功能富集分析发现,在木芙蓉花颜色加深过程中,涉及到细胞过程、代谢过程、细胞质、催化活性、结合活性等生物学功能不断增强。KEGG代谢通路中的代谢、次生代谢产物合成等功能也在醉芙蓉颜色加深过程中不断增强。【结论】木芙蓉颜色快速变化是一个复杂的遗传调控过程,涉及到多个功能蛋白共同发挥调控作用。本研究解析的相关功能蛋白及代谢通路为观赏植物优良品种的选育提供了数据参考。 展开更多
关键词 木芙蓉 变色 遗传机制 蛋白组学
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m^(6)A及其调控蛋白质在感染性疾病发生发展中的作用及机制 被引量:1
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作者 张艳艳 吴敏 刘琳 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第5期632-644,共13页
N6-甲基腺苷(m^(6)A)是真核生物RNA中最普遍的转录后修饰之一,对RNA的结构、命运和功能具有深远的影响。调控RNA m^(6)A修饰的相关蛋白质主要包括三大类:甲基转移酶(writers)、去甲基化酶(erasers)以及阅读蛋白质(readers)。这些酶的发... N6-甲基腺苷(m^(6)A)是真核生物RNA中最普遍的转录后修饰之一,对RNA的结构、命运和功能具有深远的影响。调控RNA m^(6)A修饰的相关蛋白质主要包括三大类:甲基转移酶(writers)、去甲基化酶(erasers)以及阅读蛋白质(readers)。这些酶的发现表明,m^(6)A修饰是一个动态且可逆的过程,能够通过调节RNA的结构来影响其稳定性、翻译效率以及定位。RNA结构的改变直接决定了RNA的命运、功能和代谢,进而调控细胞的增殖、分化和凋亡,并参与多种代谢性疾病、癌症等疾病的发生和发展。近年来,越来越多的研究揭示了m^(6)A修饰在调节先天免疫系统稳态中的重要作用。免疫系统对于抵御细菌、病毒等病原体的感染至关重要,而m^(6)A修饰通过影响免疫相关基因的表达和功能,调节免疫细胞的活性和反应。本综述汇总了近些年的相关研究报道,介绍了m^(6)A修饰的生物学意义、主要调控蛋白质的功能以及它们如何协同作用以维持免疫系统的动态平衡。探讨m^(6)A修饰如何影响模式识别受体(PRRs)的表达和信号传导,以及它在抗病毒和抗菌免疫反应中的角色。分析m^(6)A修饰对T细胞和B细胞的分化、活化和功能的影响,特别是在疫苗接种和自身免疫性疾病中的作用。总结m^(6)A修饰在不同感染性疾病(例如病毒感染、细菌感染和寄生虫感染)中的调控机制,以及其作为潜在治疗靶点的可能性。提出当前研究中存在的问题和挑战,并展望未来的研究方向,包括开发新的技术手段和治疗方法,以便更好地理解和利用m^(6)A修饰在免疫调节中的作用。并结合我们自己的研究成果,详细阐述了m^(6)A及其调控蛋白质在调节免疫系统功能和感染性疾病免疫反应中的作用。通过综合现有文献和我们的研究结果,本综述旨在提供一个全面而详细的视角,帮助深入了解m^(6)A及其调控蛋白质在调节免疫系统功能和感染性疾病免疫反应中的最新进展,为进一步的研究和临床应用奠定基础。 展开更多
关键词 N6-甲基腺苷 甲基转移酶 去甲基化酶 阅读蛋白质 感染性疾病
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不同状态禽呼肠孤病毒的冷冻电镜结构研究
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作者 刘京路 高立 +6 位作者 王有望 祁小乐 张雪利 包珂岩 高玉龙 王笑梅 朱平 《电子显微学报》 北大核心 2025年第1期10-17,共8页
禽呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)是一种双链RNA病毒,对家禽养殖业构成严重威胁。本文利用冷冻电镜技术解析了ARV病毒的完整病毒颗粒(virion)以及处于转录状态的病毒核心颗粒(T⁃core)的高分辨率三维结构。对比分析表明,ARV病毒virion和... 禽呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)是一种双链RNA病毒,对家禽养殖业构成严重威胁。本文利用冷冻电镜技术解析了ARV病毒的完整病毒颗粒(virion)以及处于转录状态的病毒核心颗粒(T⁃core)的高分辨率三维结构。对比分析表明,ARV病毒virion和T⁃core颗粒的塔状突起蛋白λC存在明显结构差异,显示其在病毒转录过程中的重要作用。在病毒转录态核心颗粒中,作者发现σA蛋白与双链RNA存在较强结合,并确认了起关键作用的氨基酸残基。同时,分析了ARV病毒内部转录酶复合体RdRP以及基因组三维结构,获得了处于转录过程中ARV病毒核心颗粒内部基因组的三维分布. 展开更多
关键词 禽呼肠孤病毒 冷冻电镜 塔状突起 RDRP 双链RNA
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基于CRISPR/Cas9技术的植物乳植杆菌YZH81胞外多糖合成基因簇功能鉴定
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作者 黄淑婷 孙娅西 +4 位作者 宦海琳 贾思思 赵芳 吕广萍 杨瑶 《食品科学》 北大核心 2025年第6期133-141,共9页
胞外多糖(exopolysaccharides,EPS)合成基因簇是揭示乳酸菌EPS构效关系的基础。本研究前期发现一株高产EPS的植物乳植杆菌Lactiplantibacillus plantarum YZH81菌株含有可能的2个EPS合成基因簇cps1和cps2,构建的YZH81?cps1菌株EPS产量... 胞外多糖(exopolysaccharides,EPS)合成基因簇是揭示乳酸菌EPS构效关系的基础。本研究前期发现一株高产EPS的植物乳植杆菌Lactiplantibacillus plantarum YZH81菌株含有可能的2个EPS合成基因簇cps1和cps2,构建的YZH81?cps1菌株EPS产量下降。本研究首先利用CRISPR/Cas9技术敲除了YZH81菌株cps2基因簇。与YZH81相比,YZH81?cps1和YZH81?cps2的EPS产量分别下降了22.88%和35.42%,化学组成改变也较大,突变株均未检出鼠李糖单糖组分,而甘露糖和葡萄糖占比大幅提高。进一步利用蛋白质组学分析了不同发酵时间(10、32 h)两个不同cps簇的缺失相比于野生型YZH81菌株的差异蛋白29个和22个,京都基因与基因组百科全书和基因本体分析结果显示差异蛋白参与YZH81菌株的生物学过程、细胞组成的代谢与加工过程,但敲除cps2簇引起的差异蛋白功能更为丰富,包括脂质代谢、核苷酸代谢和肽聚糖的生物合成与代谢等。综上,本研究明确了YZH81菌株具有两个独立的不同cps簇,并分别承担了不同功能,为后期开展YZH81菌株的EPS益生功能构效关系的研究提供了理论支撑。 展开更多
关键词 植物乳植杆菌 胞外多糖 cps基因簇 蛋白功能
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