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豌豆孟德尔性状表型决定基因的分子定位与功能解析
1
作者 郭嘉和 李绍军 《生物化学与生物物理进展》 北大核心 2025年第10期2447-2461,共15页
孟德尔着眼于豌豆的七对经典性状,通过杂交实验、统计学分析、测交验证,发现了遗传规律,建立了现代遗传学的根基,但这七对性状的分子遗传机制直到近年才逐步明晰。本文综合传统定位克隆、基因组靶向诱变筛选技术(TILLING)、长读长重测... 孟德尔着眼于豌豆的七对经典性状,通过杂交实验、统计学分析、测交验证,发现了遗传规律,建立了现代遗传学的根基,但这七对性状的分子遗传机制直到近年才逐步明晰。本文综合传统定位克隆、基因组靶向诱变筛选技术(TILLING)、长读长重测序、群体遗传学与全基因组关联分析(GWAS)等研究进展,总结了控制植株高度、籽粒形状、花色、籽粒颜色、豆荚颜色、豆荚形态及花位等7个性状的10个基因的身份、染色体定位与作用通路:Le编码赤霉素3β-羟化酶,突变致GA_(1)合成受阻产生矮秆;R基因则由于转座子插入导致支链淀粉合成受限而成皱粒;A与A2构成MYB-bHLHWD40(MBW)复合体,协同激活花青素通路决定花色;I编码镁脱螯合酶,功能缺失引起籽粒持绿;Gp功能丧失是由上游大片段缺失导致转录通读产生无功能的融合转录本,抑制叶绿素合成形成黄荚;P与V共同控制豆荚内壁纤维细胞的次生壁增厚,任一受损均可致皱缩荚;FA参与维持茎尖分生组织稳态,其突变促成顶生花,且受隐性修饰因子Mfa调控。综合证据显示,结构变异在经典表型形成中占据核心地位。展望豌豆品质改良与性状可设计化的前景,运用高质量参考基因组、泛基因组与精确基因编辑是下一代豆科作物遗传改良的高效路径。 展开更多
关键词 孟德尔性状 豌豆 分子遗传学 基因鉴定 基因功能 全基因组关联分析
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DNA甲基化在青光眼中的研究进展
2
作者 贾大东 胡昊 梁亮 《生命科学》 2025年第4期393-400,共8页
青光眼是一种以视神经进行性损伤为特征的致盲性眼病,其致病机制复杂,导致青光眼的相关细胞功能调节机制尚不完全明了。因此,青光眼的治疗仍面临巨大挑战。DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰方式,通过在DNA分子上添加甲基基团,可调... 青光眼是一种以视神经进行性损伤为特征的致盲性眼病,其致病机制复杂,导致青光眼的相关细胞功能调节机制尚不完全明了。因此,青光眼的治疗仍面临巨大挑战。DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰方式,通过在DNA分子上添加甲基基团,可调控青光眼相关基因的表达。近年来,针对单基因及全基因组甲基化的研究逐步揭示了DNA甲基化在青光眼病理进程中的关键作用。DNA甲基化通过调控基因表达,参与了视神经损伤、眼内压调节、视网膜神经节细胞衰老等多种生理病理过程。本文综述了目前青光眼相关的DNA甲基化研究,重点探讨了多个受DNA甲基化调控的基因在青光眼发病过程中的作用,旨在深入理解青光眼病理过程中的关键基因和分子信号通路,为青光眼的临床诊断与干预治疗提供理论依据。 展开更多
关键词 青光眼 DNA甲基化 去甲基化 表观遗传 基因编辑技术
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基于cytb和rag2基因探讨叶须鱼属分子系统进化关系 被引量：1
3
作者 陈鲆 曾如奎 +12 位作者 杨德英 哈西 罗文杰 徐丹 刘飞 秦云鑫 熊金鑫 丁文祥 黄俊杰 刘日 唐子婷 何智 严太明 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期140-148,共9页
【目的】探究叶须鱼属的分子系统进化关系,筛选种间鉴定分子标记。【方法】构建叶须鱼属的cytb(5个种)和rag2(修长叶须鱼和裸腹叶须鱼)基因序列的NJ及贝叶斯系统进化树,并结合核苷酸多态位点、单倍型、核酸多态性、遗传距离、遗传分化... 【目的】探究叶须鱼属的分子系统进化关系,筛选种间鉴定分子标记。【方法】构建叶须鱼属的cytb(5个种)和rag2(修长叶须鱼和裸腹叶须鱼)基因序列的NJ及贝叶斯系统进化树,并结合核苷酸多态位点、单倍型、核酸多态性、遗传距离、遗传分化系数和基因流等,分析种间进化关系和种内遗传多样性。【结果】叶须鱼属每个种的cytb序列单独聚为一支,表明cytb基因序列能将叶须鱼属5个种区分开;种间高度遗传分化(F_(st)>0.25),物种之间基因流较弱(Nm<1);修长叶须鱼遗传多样性水平最高,锥吻叶须鱼遗传多样性水平最低。基于rag2基因序列的分子系统发育进化树显示,修长叶须鱼和裸腹叶须鱼均单独聚为一支,为独立的种。【结论】cytb和rag2可作为叶须鱼属种间鉴定的分子标记基因,这为叶须鱼属物种的鉴定和系统分类奠定了基础,也为叶须鱼属鱼类保护措施的制定提供了遗传学依据。 展开更多
关键词 叶须鱼属 CYTB基因 rag2基因 系统发育关系 遗传多样性
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NAC转录因子在水稻遗传改良中的研究进展 被引量：3
4
作者 彭波 邱静 +7 位作者 彭静 张志国 刘岩 黄雅琴 汪全秀 赵金会 周伟 孙艳芳 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 2024年第4期540-550,共11页
NAC转录因子是植物最大的特异性转录因子,具有特殊的NAC结构域和C端结构域,它们在调节水稻生长发育过程中发挥着重要的作用。目前在水稻中已鉴定到多种NAC转录因子,发现它们广泛参与调控水稻的产量及其品质性状,在水稻的遗传改良中具有... NAC转录因子是植物最大的特异性转录因子,具有特殊的NAC结构域和C端结构域,它们在调节水稻生长发育过程中发挥着重要的作用。目前在水稻中已鉴定到多种NAC转录因子,发现它们广泛参与调控水稻的产量及其品质性状,在水稻的遗传改良中具有重要功能。综述了NAC转录因子的分类与定位、调控水稻产量和稻米品质以及参与水稻非生物胁迫应答反应等新进展,以期为优质高产多抗水稻新品种的分子设计育种提供新的基因资源。 展开更多
关键词 水稻 NAC转录因子 产量 品质 非生物胁迫
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斑马鱼tectb内耳基因敲除品系的构建及其作用机制
5
作者 刘玲 朱俊伟 +4 位作者 曾婷 谢缤灵 陶桂芳 朱贤宇 谢华平 《激光生物学报》 CAS 2024年第2期143-150,166,共9页
TECTB基因编码的β-盖膜蛋白(β-tectorin)在人类听觉功能中具有重要的调控作用,是内耳器官中覆盖膜的重要组成成分,在声音转导为神经信号的过程中发挥着关键作用。β-tectorin突变会导致人类非综合征性耳聋的发生,而目前关于听觉障碍... TECTB基因编码的β-盖膜蛋白(β-tectorin)在人类听觉功能中具有重要的调控作用,是内耳器官中覆盖膜的重要组成成分,在声音转导为神经信号的过程中发挥着关键作用。β-tectorin突变会导致人类非综合征性耳聋的发生,而目前关于听觉障碍发生的分子机制仍然有待研究。斑马鱼(Danio rerio)是一种常用的试验动物模型,能够对内耳发育和相关疾病的研究提供重要的价值。为了研究tectb基因在斑马鱼内耳发育中的作用,本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,成功构建tectb内耳基因缺失型斑马鱼模型,并对tectb基因缺失的斑马鱼表型进行初步分析。首先,在tectb基因的第三号外显子上设计靶位点以及基因型检测引物,经体外扩增得到向导DNA(sgDNA),再对其进行体外转录,得到向导RNA(sgRNA);然后,将sgRNA与Cas9酶通过显微注射的方式注射到野生型斑马鱼胚胎中,经基因型鉴定筛选出携带突变的嵌合体F0代鱼,培养至性成熟后与野生型斑马鱼杂交得到F1代突变体杂合子;在遗传稳定性鉴定及基因序列测序之后,保留突变类型为移码突变的F1代鱼,培养至成年后,经过自交得到F2代tectb突变体纯合子;最后,通过体式显微镜初步观察及毛细胞染色试验,发现突变体斑马鱼内耳组织结构正常,耳石形态和大小没有明显差异,毛细胞的发育也没有明显缺陷,但是体内器官与组织的发育是否发生变化,需要进行深入研究。这项研究为深入了解内耳发育的分子机制和耳聋等人类疾病提供了有价值的研究模型,借助tectb基因敲除斑马鱼模型,我们可以探究该基因在疾病发生中的具体作用,更好地研究内耳发育中的关键途径,有利于进一步深入研究听力的调控机制。 展开更多
关键词 斑马鱼 tectb CRISPR/Cas9 内耳发育 毛细胞
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乙酰化修饰及其在结直肠癌中的作用
6
作者 高萌 杜润蕾 《生物化工》 CAS 2024年第2期208-214,共7页
乙酰化是一种在癌症中发生较为常见的表观遗传修饰,在RNA和蛋白质上都存在,这种修饰在转录水平和蛋白水平均可发挥重要功能。已知高度保守的RNA修饰N4-乙酰基胞苷(ac4C)作为RNA的转录后化学修饰,有助于在翻译过程中正确阅读特定的核苷... 乙酰化是一种在癌症中发生较为常见的表观遗传修饰,在RNA和蛋白质上都存在,这种修饰在转录水平和蛋白水平均可发挥重要功能。已知高度保守的RNA修饰N4-乙酰基胞苷(ac4C)作为RNA的转录后化学修饰,有助于在翻译过程中正确阅读特定的核苷酸序列,稳定mRNA,提高转录效率。而蛋白质乙酰化是一种可逆的翻译后修饰(PTM),调节重要的细胞过程,如增殖、DNA损伤修复和细胞周期进展。当修饰平衡被打破时,这些过程就会受到影响,并可能导致癌症的发生。近些年,多项研究发现乙酰化修饰在结直肠癌的发生发展中起着关键的调控作用。因此,对乙酰化修饰在结直肠癌中发挥的作用进行探讨有助于深入了解癌症的发病机制,并为癌症治疗提供新的靶点和策略。本文将对乙酰化修饰已有研究以及结直肠癌中乙酰化修饰的相关研究进行综述。 展开更多
关键词 结直肠癌 乙酰化 药物治疗
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RETN基因与骨密度及骨折的因果关系研究
7
作者 罗海勇 庞伟伟 +2 位作者 卢璇 杨俊骁 谭丽君 《激光生物学报》 2024年第6期541-549,共9页
骨质疏松症是一种最常见的全身性、代谢性的骨骼疾病。血清抵抗素(RETN)的浓度与骨密度(BMD)相关联,但是RETN与BMD和骨折是否存在因果关系仍不清楚。本研究采用孟德尔随机化(MR)分析RETN基因表达与BMD和骨折的因果关系,然后在股骨颈骨折... 骨质疏松症是一种最常见的全身性、代谢性的骨骼疾病。血清抵抗素(RETN)的浓度与骨密度(BMD)相关联,但是RETN与BMD和骨折是否存在因果关系仍不清楚。本研究采用孟德尔随机化(MR)分析RETN基因表达与BMD和骨折的因果关系,然后在股骨颈骨折(FNF)和骨关节炎(OA)样本的单细胞RNA测序数据中分析RETN基因的差异表达。MR分析发现,RETN高表达会导致BMD降低和骨折风险增加。单细胞测序分析表明,RETN在FNF组中表达上调,主要由中性粒细胞表达,其相关的炎症趋化因子CXCL8在FNF组中显著高表达。本研究提示,RETN在骨质疏松发病过程中发挥了重要作用。这一结论为骨质疏松的诊断和治疗提供了基础。 展开更多
关键词 骨质疏松症 抵抗素 孟德尔随机化分析 单细胞RNA测序 骨密度
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转录起始位点预测方法的研究进展
8
作者 郝瑞杰 李星雨 +8 位作者 马子菡 李敏 邵燕瑞 晋朦朦 杨稚萱 杨柯华 丁依菲 李浩哲 魏雪锋 《信阳师范学院学报（自然科学版）》 CAS 2024年第1期127-134,共8页
详细介绍了计算定位法在转录起始位点(TSS)鉴定中的重要作用,并重点分析了不同计算方法的建模原理、DNA序列特征采集和运行效率等。最后,展望了预测工具的未来发展方向,为有效开展TSS定位及转录调控研究奠定了基础。
关键词 转录起始位点 预测工具 效果分析
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分子生物学技术应用于木材识别的研究进展 被引量：11
9
作者 伏建国 刘金良 +2 位作者 杨晓军 安榆林 骆嘉言 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期438-443,共6页
木材识别技术的进步对于木材科学的发展及保护森林资源意义重大。随着木材DNA提取方法的不断突破,分子生物学技术开始应用于木材及木制品的材种鉴定及来源地识别,这对于阻止木材的非法砍伐及贸易具有重要意义。对近年来研究者在木材分... 木材识别技术的进步对于木材科学的发展及保护森林资源意义重大。随着木材DNA提取方法的不断突破,分子生物学技术开始应用于木材及木制品的材种鉴定及来源地识别,这对于阻止木材的非法砍伐及贸易具有重要意义。对近年来研究者在木材分子识别技术领域取得的进展进行了概述,介绍了木材DNA提取常用的方法、存在的困难、改良的措施及不同提取方法获得的DNA质量;在木材树种鉴定方面,主要介绍了微卫星、单核苷酸多态性和DNA条形码技术的应用进展;列举了分子生物学技术在木材来源地的鉴定中的成功案例;最后,分析了木材分子识别技术仍存在的问题,并对其发展及应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 木材学 识别 DNA提取 微卫星标记 单核苷酸多态性 DNA条形码 综述
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进口黄檀属木材DNA提取与分子鉴定方法初步研究 被引量：11
10
作者 伏建国 刘金良 +2 位作者 杨晓军 安榆林 骆嘉言 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期627-632,共6页
由于黄檀属Dalbergia种类较多,很多种类通过形态学方法难以区分,给中国进口木材检验鉴定工作带来了很大困难。为了研究黄檀属木材的分子鉴定方法,选取进口木材中常见的7种黄檀属木材,通过比较不同的木材DNA提取和纯化方法,摸索出了适合... 由于黄檀属Dalbergia种类较多,很多种类通过形态学方法难以区分,给中国进口木材检验鉴定工作带来了很大困难。为了研究黄檀属木材的分子鉴定方法,选取进口木材中常见的7种黄檀属木材,通过比较不同的木材DNA提取和纯化方法,摸索出了适合于黄檀属木材的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)十二烷基硫酸钠(SDS)磁珠相结合的DNA提取和纯化体系,利用巢式聚合酶链式反应(PCR)扩增出433 bp的matK基因片段,共发现12个碱基位点差异,可以将7种进口黄檀属木材及我国的降香黄檀Dalbergia odorifera逐一区分开,为黄檀属木材分子识别鉴定研究工作奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 林业工程 黄檀属木材 DNA提取 纯化 巢式PCR MATK基因 鉴定
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怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析 被引量：13
11
作者 周延清 牛敬媛 +11 位作者 田苗苗 李振勇 崔天星 邵大晓 李丙亮 冯艳铭 李智涛 李争 王天亮 范喜梅 李敏 申远 《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期136-139,共4页
采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个... 采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低. 展开更多
关键词 怀地黄 RAPD ISSR 遗传多样性
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怀地黄SRAP分子标记体系的建立与DNA指纹图谱的构建 被引量：14
12
作者 谷凤平 周春娥 +4 位作者 路淑霞 姚换灵 王芳 段红英 周延清 《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期175-178,共4页
以怀地黄DNA为模板,进行SRAP反应条件的优化及DNA指纹图谱构建,优化的反应体系为:25μL的体积中,模板DNA 20 ng,Mg2+浓度2.5 mmol.L-1,上下游引物各0.36μmol.L-1,dNTPs 0.30 mmol.L-1,Taq DNA酶2.0 U.构建了怀地黄23个品种的DNA指纹图... 以怀地黄DNA为模板,进行SRAP反应条件的优化及DNA指纹图谱构建,优化的反应体系为:25μL的体积中,模板DNA 20 ng,Mg2+浓度2.5 mmol.L-1,上下游引物各0.36μmol.L-1,dNTPs 0.30 mmol.L-1,Taq DNA酶2.0 U.构建了怀地黄23个品种的DNA指纹图谱,为怀地黄品种鉴定、遗传多样性分析、分子标记辅助育种和质量综合评价等研究奠定了基础. 展开更多
关键词 怀地黄 SRAP扩增体系优化 SRAP DNA指纹图谱
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陆地棉黄萎病抗性的分子标记辅助选择效果 被引量：18
13
作者 孔祥瑞 王红梅 +4 位作者 陈伟 赵云雷 李运海 龚海燕 桑晓慧 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2010年第6期527-532,共6页
采用分子标记辅助选择技术将与陆地棉黄萎病抗性相关的18个SSR标记用于大田辅助选择育种。结果表明,18个标记中的BNL1721、BNL2733和BNL3452标记在有/无标记基因型个体间病指差异显著,且选择效应能够在不同世代间稳定遗传。通过对单标... 采用分子标记辅助选择技术将与陆地棉黄萎病抗性相关的18个SSR标记用于大田辅助选择育种。结果表明,18个标记中的BNL1721、BNL2733和BNL3452标记在有/无标记基因型个体间病指差异显著,且选择效应能够在不同世代间稳定遗传。通过对单标记、多标记选择效应比较,发现不同标记间配制辅助选择最优组合可以实现选择效应的最大叠加。 展开更多
关键词 陆地棉 黄萎病 分子标记辅助选择 SSR
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应用21个微卫星标记监测马身猪遗传多样性变化趋势 被引量：9
14
作者 曹果清 李步高 +3 位作者 石建中 刘宏 薛尚军 周忠孝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期932-938,共7页
本研究旨在通过对不同年份马身猪群体遗传多样性变化趋势分析,评价马身猪保种效果,制定有效的保种措施。选用FAO-ISAG联合推荐的21个微卫星标记分析不同年份马身猪群体的遗传多样性。结果表明,在马身猪群体中,共检测到105个等位基因,平... 本研究旨在通过对不同年份马身猪群体遗传多样性变化趋势分析,评价马身猪保种效果,制定有效的保种措施。选用FAO-ISAG联合推荐的21个微卫星标记分析不同年份马身猪群体的遗传多样性。结果表明,在马身猪群体中,共检测到105个等位基因,平均等位基因数为5个,平均有效等位基因数为2.244 0,平均观察杂合度和PIC分别为0.317 6和0.391 9。从1999年到2007年,平均等位基因数从4.285 7下降到3.428 6,平均有效等位基因数从2.509 5下降到1.977 0,平均观察杂合度从0.311 6下降到0.298 1,平均多态信息含量从0.441下降到0.341。马身猪群体基因纯度较高,遗传多样性有逐年降低趋势,在今后的保种和利用工作中,应对马身猪群体的遗传多样性进行实时监测,在世代更替中注意低频率等位基因的保护。 展开更多
关键词 马身猪 遗传多样性 微卫星标记 遗传监测
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贵州栽培杜仲表型性状与SCoT分子标记的遗传多样性分析 被引量：10
15
作者 肖承鸿 周涛 +3 位作者 江维克 邓冬梅 赵丹 熊厚溪 《中药材》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1343-1349,共7页
目的:研究贵州栽培杜仲的表型特征及遗传多样性。方法:综合运用表型差异分析与SCoT分子标记方法对贵州栽培的40份杜仲进行遗传多样性分析。结果:贵州栽培杜仲表型多样性指数最高的是新生小枝上芽数,为2.0638,最低的是新生小枝上叶片数,... 目的:研究贵州栽培杜仲的表型特征及遗传多样性。方法:综合运用表型差异分析与SCoT分子标记方法对贵州栽培的40份杜仲进行遗传多样性分析。结果:贵州栽培杜仲表型多样性指数最高的是新生小枝上芽数,为2.0638,最低的是新生小枝上叶片数,为1.7084;基于各样本间的表型差异,40份杜仲样本可聚为4类。10条SCoT引物扩增出76条带,其中多态性条带50条,多态位点百分率为65.79%;Nei's遗传多样性指数(H)平均值0.1937,Shannon's多态性指数(I)平均值为0.2832,种群间遗传分化系数(Gst)为0.1733,种群间基因流(Nm)为2.3848;基于遗传一致度,4个种群可聚为2类。结论:贵州栽培杜仲不同种群的遗传多样性差异较小;种群间存在一定的遗传分化,但遗传分化主要存在于种群内;种群间基因交流频繁,有利于该物种的扩展;种群间表型差异聚类和SCoT聚类结果相似,均与地理位置有一定的相关性,为种质资源的鉴定打下良好基础。 展开更多
关键词 杜仲 表型性状 SCoT 遗传多样性
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耐高温巴氏杜氏藻突变株的诱变和鉴定 被引量：14
16
作者 黄瑞芳 刘广发 +1 位作者 周韬 高亚辉 《厦门大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期272-275,共4页
采用紫外线辐射的方法对巴氏杜氏藻（Dunaliella bardawil）进行诱变．经过夏日高温（42～52℃）筛选，得到一耐高温的突变株，命名为Dunaliella bardawil vat．H-42 Huang ＆ Liu（简称H-42）．研究结果表明，在每天42℃处理6h的条件下... 采用紫外线辐射的方法对巴氏杜氏藻（Dunaliella bardawil）进行诱变．经过夏日高温（42～52℃）筛选，得到一耐高温的突变株，命名为Dunaliella bardawil vat．H-42 Huang ＆ Liu（简称H-42）．研究结果表明，在每天42℃处理6h的条件下．H-42达到生长平衡期时藻细胞密度为初始密度的4．5倍．而对照在第5天时细胞密度几乎降为零．通过显微镜观察并测量。证明突变株的细胞体积为（0．65～1．27）×10^-15m^2,是原出发株的3．0～3．4倍,蛋白质SDS-PAGE电泳表明．H-42在大约24kD和30kD处分别比对照多出一条新的蛋白带．同时在大约26kD处缺失一条蛋白带．RAPD分析表明两者的遗传相似系数为0．726．由此我们认为H-42确为一耐高温的巴氏杜氏藻突变株． 展开更多
关键词 巴氏杜氏藻 诱变 耐高温 遗传相似系数
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EST分子标记在基因组学中应用的研究进展 被引量：12
17
作者 陈全求 詹先进 +2 位作者 蓝家样 黄云 符家平 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2010年第3期59-63,共5页
植物EST(expressed sequence tags)计划作为植物基因组计划的一个重要组成部分,概括介绍了几种主要EST标记(EST-SSR,EST-PCR,EST-SNP,EST-AFLP,EST-RFLP)在比较基因组学,系统发育学,基因功能研究等方面的应用情况,并对EST标记的应用前... 植物EST(expressed sequence tags)计划作为植物基因组计划的一个重要组成部分,概括介绍了几种主要EST标记(EST-SSR,EST-PCR,EST-SNP,EST-AFLP,EST-RFLP)在比较基因组学,系统发育学,基因功能研究等方面的应用情况,并对EST标记的应用前景作了展望。 展开更多
关键词 EST 分子标记 比较基因组学 系统发育学 基因功能
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鹅肌肉生长抑制素基因5′-调控区序列特征和组织表达分析 被引量：9
18
作者 顾志良 卢祥云 +1 位作者 朱大海 李辉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1606-1611,共6页
根据鸡的Myostatin基因序列设计引物,从鹅的基因组DNA中扩增到了Myostatin基因的5′-调控区,克隆并测序后获得了1.3 kb片段序列。与其他物种的序列比较发现,鹅Myostatin基因的该调控序列与鸭同源性为94.8%,与鸡同源性为69.2%,而与小鼠仅... 根据鸡的Myostatin基因序列设计引物,从鹅的基因组DNA中扩增到了Myostatin基因的5′-调控区,克隆并测序后获得了1.3 kb片段序列。与其他物种的序列比较发现,鹅Myostatin基因的该调控序列与鸭同源性为94.8%,与鸡同源性为69.2%,而与小鼠仅为14.3%。通过生物信息学方法,分析确定了其启动子和转录起始位点,发现在转录起始位点上游-34 bp处存在1个TATA盒,-77 bp处存在1个CAAT盒。还发现在该片段中包含5个E框、2个MEF2结合位点、1个MSX2盒和1个MTATA盒等肌肉特异性转录因子结合位点。采集鹅肝脏、胸肌、腿肌、心脏、肺、肠、肾和脑等8种组织并提取总RNA,用Northern blot方法检测了Myostatin基因mR-NA在8种组织中的表达情况,发现其只在胸肌和腿肌中表达,而在其他几种组织中没有检测到表达信号。 展开更多
关键词 鹅 肌肉生长抑制素 5'-调控区 E框 基因表达
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凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)微卫星多重PCR体系的建立及其在家系亲权鉴定中的应用 被引量：16
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作者 李东宇 孔杰 +4 位作者 孟宪红 栾生 罗坤 卢霞 曹宝祥 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2016年第3期58-67,共10页
为了在遗传分析研究中提高效率并节约成本,本研究从已报道的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)微卫星位点中选取多态性较高的位点,基于各位点的扩增片段大小及退火温度等因素进行微卫星位点的组合。通过不断优化位点组合、反应体系及反... 为了在遗传分析研究中提高效率并节约成本,本研究从已报道的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)微卫星位点中选取多态性较高的位点,基于各位点的扩增片段大小及退火温度等因素进行微卫星位点的组合。通过不断优化位点组合、反应体系及反应程序,成功建立了1个五重、2个四重和1个三重PCR反应体系,并将其应用于11个凡纳滨对虾家系的亲权鉴定。结果显示,四组多重PCR体系中的16个微卫星位点在11个凡纳滨对虾家系中的平均等位基因数(Na)为6,平均多态信息含量(PIC)为0.5813,平均观测杂合度(Ho)为0.513,平均期望杂合度(He)为0.636。利用Cervus3.0软件,对已知系谱关系的11个凡纳滨对虾家系进行亲权分析,其第一亲本累积排除率(CE-1P)、第二亲本累积排除率(CE-2P)和双亲累积排除率(CE-PP)分别为0.99525487、0.99990862和0.99999986。进一步分析表明,当同时使用四组多重PCR体系进行亲权分析时,其模拟配对率和亲权鉴定准确率均为100%,全同胞和半同胞家系鉴别效果良好,表现出准确的鉴别能力。本研究所建立的四组凡纳滨对虾微卫星多重PCR体系均可为后续的凡纳滨对虾遗传多样性分析和亲权鉴定提供高效、准确的检测手段。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 微卫星多重PCR 亲权鉴定
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草鱼MHCⅡα基因cDNA的克隆与组织表达分析 被引量：9
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作者 苏建明 肖调义 +2 位作者 张学文 陈韬 章怀云 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期673-679,共7页
采用快速扩增cDNA末端方法,获得1007bp草鱼MHCⅡα基因全长cDNA片段,序列包括717bp的开放阅读框、34bp的5′端非编码区以及256bp的3′端非编码区.氨基酸序列比对和同源性比较分析结果表明,草鱼MHCⅡα与鲤鱼MHCⅡα相似性最高,为79%,与... 采用快速扩增cDNA末端方法,获得1007bp草鱼MHCⅡα基因全长cDNA片段,序列包括717bp的开放阅读框、34bp的5′端非编码区以及256bp的3′端非编码区.氨基酸序列比对和同源性比较分析结果表明,草鱼MHCⅡα与鲤鱼MHCⅡα相似性最高,为79%,与斑马鱼的相似性为75%,与人的相似性最低,为34%.RT-PCR组织表达分析,MHCⅡα基因在正常草鱼组织中除了肌肉中没有扩增出MHCⅡα基因转录本外,在所检测的其他组织中都有不同程度的表达,其中脾脏、头肾有较强的表达,血液有中等程度的表达,肝脏、眼与肌肉相对表达较弱. 展开更多
关键词 草鱼 组织相容性复合体 克隆 组织特异性表达
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