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随机对照试验Meta分析的统一报告格式:QUOROM声明 被引量：21
1
作者 刘玉秀 章丹 盛梅 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2003年第5期591-595,共5页
随机对照试验作为循证医学研究中最有力的证据得到公认 ,基于随机对照试验的系统评价 ,为探求当前最佳的医疗证据提供了有效途径。而Meta分析是系统评价的基本方法 ,如何规范Meta分析报告 ,能为临床医疗实践提供切实可行的防治决策依据 ... 随机对照试验作为循证医学研究中最有力的证据得到公认 ,基于随机对照试验的系统评价 ,为探求当前最佳的医疗证据提供了有效途径。而Meta分析是系统评价的基本方法 ,如何规范Meta分析报告 ,能为临床医疗实践提供切实可行的防治决策依据 ,是近年许多学者致力研究的方向。QUOROM小组在回顾既往报告的基础上 ,改进不足 ,充分研讨 ,提出了一种统一的报告格式 ,即QUOROM声明。该声明包括一份核查单和一幅流程图 ,对规范报告格式、提高报告质量具有指导作用 ,目前已得到许多国际著名医学期刊的认可 ,并作为Meta分析报告的作者、审稿人和编者撰写、评价和发表的重要指南。本文对QUOROM声明形成的背景、过程及其内容和要求进行介绍 ,展示了报告Meta分析结果的完整框架 ,期望对规范我国随机对照试验Meta分析报告工作有所裨益 。 展开更多
关键词 随机对照试验 META分析 QUOROM声明 循证医学
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基于GM-ANN模型的生态足迹时间序列预测分析——以甘肃省为例 被引量：7
2
作者 赵煜 李文龙 +1 位作者 李自珍 马智慧 《兰州大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期83-89,共7页
基于生态足迹、生态承载力及其变化时间动态特征的分析,应用灰色系统与神经网络理论与方法,组建了GM-ANN预测模型,以甘肃省为例进行了评价与预测分析.结果表明:1991-2009年期间,甘肃省的生态经济发展一直处于不可持续状态,人均生态足迹... 基于生态足迹、生态承载力及其变化时间动态特征的分析,应用灰色系统与神经网络理论与方法,组建了GM-ANN预测模型,以甘肃省为例进行了评价与预测分析.结果表明:1991-2009年期间,甘肃省的生态经济发展一直处于不可持续状态,人均生态足迹为1.517 hm^2/人,人均生态承载力为1.077 hm^2/人,人均生态冗余为-0.44hm^2/人.预测结果显示,到2015年和2020年,甘肃省人均生态足迹将分别达到2.503 hm^2/人和2.870 hm^2/人,而人均生态承载力将分别降至0.985 hm^2/人和0.930 hm^2/人,人均生态冗余则分别为-1.518hm^2/人和-1.940 hm^2/人.这说明未来该省生态经济仍处于不可持续状态,急需调整经济结构与消费模式,以降低其人均生态足迹和增加生态冗余值.另外,通过内插拟合能力检验分析证明,新建立的GM-ANN模型与常用的GM(1,1)模型相比,可使预测精度提高1.7%,在分析和预测不确定系统中有明显的优越性.因此,GM-ANN模型在研究生态足迹动态的过程中,有着较为广泛的应用前景. 展开更多
关键词 生态足迹 生态承载力 GM-ANN模型 评价 预测 甘肃省
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谷物胚乳性状QTL区间作图的贝叶斯方法 被引量：5
3
作者 王亚民 孙长森 +2 位作者 汤在祥 胡治球 徐辰武 《扬州大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期12-17,共6页
将贝叶斯统计原理和胚乳性状的数量遗传模型相结合,以分离群体中各植株的分子标记基因型以及植株上若干粒种子胚乳性状的单粒观测值为数据模式,提出胚乳性状QTL区间作图的贝叶斯方法。该方法通过Gibbs以及Metropolis-Hastings抽样实现... 将贝叶斯统计原理和胚乳性状的数量遗传模型相结合,以分离群体中各植株的分子标记基因型以及植株上若干粒种子胚乳性状的单粒观测值为数据模式,提出胚乳性状QTL区间作图的贝叶斯方法。该方法通过Gibbs以及Metropolis-Hastings抽样实现的马尔科夫链蒙特卡罗(MCMC)算法获得QTL效应和位置的估计。方法的有效性用染色体水平和基因组水平2套模拟方案进行验证,结果表明:贝叶斯方法能够准确地估计胚乳性状QTL的位置和效应,并同时区分2种显性效应。 展开更多
关键词 数量性状基因座位 贝叶斯统计 胚乳性状 MCMC算法 GIBBS抽样 Metropolis-Hastings算法
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一类具有不同发生率的双疾病随机SIS传染病模型的动力学研究 被引量：8
4
作者 张道祥 胡伟 +1 位作者 陶龙 周文 《山东大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期10-17,共8页
提出了一类新的具有不同发生率的双疾病随机SIS传染病模型。借助Lyapunov函数和伊藤公式,获得了模型中疾病的灭绝以及系统持久性的充分条件。结果表明不仅强噪声能够使得传染病灭绝,而且弱噪声在一定条件下也能使传染病灭绝。
关键词 随机传染病模型 阈值 持久性 灭绝性
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基于小波变换技术预测DNA序列的编码区 被引量：6
5
作者 王玉 饶妮妮 +1 位作者 匡斌 袁祚涌 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第1期141-144,共4页
三周期性是大多数基因组序列的编码区具有的主要特征.本文提出利用小波变换分析DNA序列编码区的三周期性,形成一种新的基于小波变换的DNA序列编码区预测方法,理论和实验研究证实了新方法的可行性,探测率和正确率分别达到81%和75%,特别... 三周期性是大多数基因组序列的编码区具有的主要特征.本文提出利用小波变换分析DNA序列编码区的三周期性,形成一种新的基于小波变换的DNA序列编码区预测方法,理论和实验研究证实了新方法的可行性,探测率和正确率分别达到81%和75%,特别是探测率较目前常用的其它一些方法有较大改善. 展开更多
关键词 DNA序列 编码区 小波变换 预测
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日本沼虾染色体倍性检测技术的研究 被引量：5
6
作者 汪财生 尹尚军 +1 位作者 钱国英 朱秋华 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期5-8,共4页
用流式细胞仪分别对日本沼虾(Macrobrachiumnipponense)正常二倍体的体细胞和四倍阶段体胚胎的DNA相对含量和细胞频率进行了测定,以研究日本沼虾染色体倍性检测技术。以日本沼虾正常二倍体的体细胞液进样所得直方图为标准,用对细胞松弛... 用流式细胞仪分别对日本沼虾(Macrobrachiumnipponense)正常二倍体的体细胞和四倍阶段体胚胎的DNA相对含量和细胞频率进行了测定,以研究日本沼虾染色体倍性检测技术。以日本沼虾正常二倍体的体细胞液进样所得直方图为标准,用对细胞松弛素B人工诱导的日本沼虾四倍体胚胎进行DNA相对含量和细胞频率的测定,测试结果以直方图表示,并用染色体涂片镜检结果进行倍性核对。结果表明,日本沼虾二倍体和四倍体的DNA相对含量有显著差异,四倍体日本沼虾的DNA相对含量是二倍体的2倍。用流式细胞仪法检测日本沼虾倍性,方法简单、测试速度快、结果可靠。 展开更多
关键词 流式细胞仪 日本沼虾(Macrobrachium nipponense) 染色体 倍性检测
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长湖短颌鲚耳石重量与年龄关系 被引量：7
7
作者 王旭歌 何勇凤 +2 位作者 李昊成 颜文斌 杨德国 《水生态学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第6期84-88,共5页
利用2014年采自湖北长湖的378尾短颌鲚(Coilia brachygnathus)样本,去除包膜和黏液的矢耳石于55℃烘箱中烘烤24 h,电子天平称重(精确至0.001 g),成对t检验结果表明,短颌鲚左右矢耳石重量之间无显著差异(P>0.05),数据分析以左右矢耳... 利用2014年采自湖北长湖的378尾短颌鲚(Coilia brachygnathus)样本,去除包膜和黏液的矢耳石于55℃烘箱中烘烤24 h,电子天平称重(精确至0.001 g),成对t检验结果表明,短颌鲚左右矢耳石重量之间无显著差异(P>0.05),数据分析以左右矢耳石重量的平均值计为矢耳石重量;采用直线、幂函数和多项式3种回归方程研究了其耳石重量与年龄的关系。结果显示,长湖短颌鲚的耳石和鳞片均可用于鉴定其年龄,且两者鉴定年龄的吻合度达到75.8%;根据222尾耳石与鳞片年龄一致的短颌鲚样本数据,发现耳石重量与个体的年龄呈显著相关(P<0.05);按年龄组以耳石重量与相应的体长作图,可以初步判断所观测年龄的可靠性;利用建立的耳石重量-年龄关系函数估算得到的个体年龄,与直接读取耳石磨片获得的年龄结果无显著差异(P>0.05),表明利用矢耳石重量直接推算其个体年龄,可以作为辅助短颌鲚年龄鉴定尤其快速鉴定的一种有效方法。 展开更多
关键词 短颌鲚 矢耳石 年龄鉴定 长湖
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盐胁迫条件下酿酒酵母的代谢通量分析 被引量：5
8
作者 李明达 陈霞 +2 位作者 韩丹 莫新迎 赵长新 《吉林大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期699-703,共5页
用计算代谢通量的方法研究酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)在高盐胁迫条件下的生理代谢.结果表明,在盐胁迫条件下,胞外海藻糖、甘油、乙醇和乳酸的质量浓度分别较常规培养条件下提高了24.44%,60.89%,23.32%和26.76%,而柠檬酸、琥珀... 用计算代谢通量的方法研究酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)在高盐胁迫条件下的生理代谢.结果表明,在盐胁迫条件下,胞外海藻糖、甘油、乙醇和乳酸的质量浓度分别较常规培养条件下提高了24.44%,60.89%,23.32%和26.76%,而柠檬酸、琥珀酸和苹果酸的质量浓度分别较常规培养条件下降低了82.11%,50.37%和53.33%.代谢通量分析表明,在盐胁迫培养条件下糖酵解途径各支路的代谢产物通量均有所增加,而TCA循环中各代谢产物的通量均有所减少. 展开更多
关键词 酿酒酵母 盐胁迫 代谢流分析
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香根草根系与土壤接触特性及抗拔模型研究 被引量：4
9
作者 夏振尧 张伦 +2 位作者 陈毅 薛海龙 许文年 《水生态学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第4期36-41,共6页
为了探索草本根系与土壤的接触特性,并分析其单根抗拔模型,通过控制根系直径、埋置深度和土壤含水率在不同梯度下,采用施加拔出荷载的方式对香根草（Vetiveria zizanioides）进行单根抗拔实验。结果表明,香根草根系单根抗拔力随根系直... 为了探索草本根系与土壤的接触特性,并分析其单根抗拔模型,通过控制根系直径、埋置深度和土壤含水率在不同梯度下,采用施加拔出荷载的方式对香根草（Vetiveria zizanioides）进行单根抗拔实验。结果表明,香根草根系单根抗拔力随根系直径的增大而增大,粘滞强度随根系直径的增大而减小,两者均与根系直径呈幂函数关系;抗拔力随根系埋置深度的增加而增加,粘滞强度随根系埋置深度的增加而减小,两者与根系直径也均呈幂函数关系,但埋置深度的增加对抗拔力和粘滞强度的变化影响较小;根系单根抗拔力和粘滞强度,随土壤含水率的增加呈先增大、后减小的趋势,其中在最佳含水率时,单根抗拔力和粘滞强度均达到最大;通过对粘滞强度与根系直径关系拟合,得出幂函数（R2=0.898）拟合曲线比线性函数（R2=0.854）更优;抗拉力、粘滞强度与埋置深度拟合,随着埋置深度的增加,得出拟合函数分别为Y1=0.937H0.578,Y2=34.59H-0.470;香根草根系的抗拔力整体上随着土壤含水率的增加,呈先增大、后减小的趋势。在土壤含水率小于14%时,抗拔力增长幅度大;土壤含水率达到14%,抗拔力最大;含水率为17%~23%时,根系抗拔力下降幅度小,基本趋于稳定;含水率大于23%时,抗拔力迅速下降;在香根草根系单根抗拔力随埋置深度的拟合曲线中,得到该控制条件下根系临界长度公式：Lcr=582.67D1.7388,在土壤含水率为14%时,香根草单根根系的临界长度随根系直径的变化规律为幂函数增长。 展开更多
关键词 香根草 埋置深度 接触特性 抗拔力 粘滞强度
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生物统计学课程教学改革探索与尝试 被引量：16
10
作者 王永立 乔琳 樊淑华 《周口师范学院学报》 CAS 2011年第5期82-84,共3页
在剖析生物统计学课程特点与教学现状的基础上,对课程教学内容、教学方法、教学手段和考核办法等方面进行了探索和尝试,以期提高生物统计学的教学效果.
关键词 生物统计学 教学改革 探索 实践
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乌蒙山区城市人工湿地生态系统健康评价——以六盘水明湖国家湿地公园为例 被引量：19
11
作者 秦趣 代稳 刘兴荣 《水生态学杂志》 北大核心 2013年第5期43-46,共4页
湿地是世界上具有独特结构和功能的生态系统,其健康评价是当前学界研究的焦点和热点,目前尚没有统一的评价指标和方法。从明湖国家湿地公园的实际情况出发,根据压力、状态和响应3个方面选出19个指标,建立湿地生态系统健康评价指标体系,... 湿地是世界上具有独特结构和功能的生态系统,其健康评价是当前学界研究的焦点和热点,目前尚没有统一的评价指标和方法。从明湖国家湿地公园的实际情况出发,根据压力、状态和响应3个方面选出19个指标,建立湿地生态系统健康评价指标体系,健康评价标准分为很健康、健康、亚健康、不健康和疾病共计5个等级;采用熵值法得到各评价指标的权重,运用综合指数法计算出湿地生态系统的健康指数。结果显示,明湖国家湿地公园生态系统为亚健康等级;分析了湿地生态系统健康的影响因素,以期为明湖湿地生态系统的建设和规划提供科学参考。 展开更多
关键词 生态系统 评价指标 明湖国家湿地公园
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关联分析及其在水稻遗传研究中的应用 被引量：3
12
作者 张斐斐 杨雅云 +6 位作者 董超 汤翠凤 阿新祥 张恩来 陈丹 徐福荣 戴陆园 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期752-758,共7页
近年来,以连锁不平衡为理论基础的关联分析被越来越广泛地应用于解析植物的数量性状,以发掘优异等位基因。本文阐述了关联分析的理论基础连锁不平衡及其影响因素和关联分析的分析策略及统计方法等,并将其与传统的基于连锁分析的QTL作图... 近年来,以连锁不平衡为理论基础的关联分析被越来越广泛地应用于解析植物的数量性状,以发掘优异等位基因。本文阐述了关联分析的理论基础连锁不平衡及其影响因素和关联分析的分析策略及统计方法等,并将其与传统的基于连锁分析的QTL作图进行了比较分析,综述了其在水稻营养品质、形态与农艺性状、抗逆和抗病虫性等研究中的应用并对其今后的发展进行了展望。 展开更多
关键词 关联分析 连锁不平衡 水稻
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直榫榫眼形状的数学描述 被引量：4
13
作者 徐达丽 马岩 郭继峰 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期119-119,121,共2页
将包络加工法和开榫工艺结合起来 ,使传统工艺方法数学化 ,提出了圆头直榫榫眼和斜面直榫榫槽的数学模型 ,为直榫形状的视频再现提供了数学方法。
关键词 直榫 榫眼 数字 尺寸
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鲢鳙幼鱼临界游泳速度的比较研究 被引量：19
14
作者 刘慧杰 王从锋 +1 位作者 朱良康 陈明明 《水生态学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第4期63-69,共7页
通过比较不同鱼类的游泳能力,为鱼道建设和鱼类行为学研究提供基础资料。在(20±1)℃水温下,使用丹麦Loligo System公司的鱼类行为视频跟踪系统,采用Brett流速递增法,以鲢(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙(Aristichthys nobilis)... 通过比较不同鱼类的游泳能力,为鱼道建设和鱼类行为学研究提供基础资料。在(20±1)℃水温下,使用丹麦Loligo System公司的鱼类行为视频跟踪系统,采用Brett流速递增法,以鲢(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙(Aristichthys nobilis)为研究对象,体长作为划分依据,分别测定不同体长组鲢鳙临界游泳速度。结果表明:(1)鲢鳙绝对临界游泳速度随着体长的增加而增大,相对临界游泳速度随着体长的增大而减小,鲢体长与绝对临界游泳速度拟合方程为:Y1=0.10X21-0.11X1+55.86(R2=0.85),与相对临界游泳速度拟合方程为:y1=0.02x21-0.87x1+12.86(R2=0.94),鳙体长与绝对临界游泳速度拟合方程为:Y2=0.03X32-1.29X22+21.04X2-29.21(R2=0.85),与相对临界游泳速度拟合方程为:y2=0.02x22-0.87x2+14.81(R2=0.98);(2)相近体长组鲢(10.11±0.24)cm和鳙(10.78±1.34)cm临界游泳速度分别为(65.50±2.08)cm/s和(80.89±4.03)cm/s,可知鳙>鲢,且差异性显著(P<0.05);(16.90±0.55)cm鲢和(15.39±0.62)cm鳙的临界游泳速度为(83.92±3.03)cm/s和(91.62±3.54)cm/s,无显著性差异(P>0.05);(3)通过比较鲢鳙临界游泳速度与突进游泳速度能力,发现鲢的突进游泳速度大于鳙,而临界游泳速度小于后者,可知鲢鳙有氧运动和无氧运动能力之间存在权衡作用,临界游泳速度与突进游泳速度不一定呈现正相关关系。鱼类能否顺利完成上溯需求取决于鱼道内水力条件和自身游泳能力。 展开更多
关键词 鲢 鳙 临界游泳速度 过鱼设施
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一类分数阶SIR流行病模型的稳定性研究 被引量：8
15
作者 原三领 李小月 许超群 《生物数学学报》 2016年第1期71-82,共12页
本文讨论了一类分数阶SIR流行病模型的稳定性问题.对不考虑疾病治疗的情形,利用特征值分析的方法分析了其平衡点的稳定性,并在一定条件下证明了模型一致稳态正解的存在唯一性;在此基础上,进一步考虑了具有治疗的分数阶SIR流行病模型的... 本文讨论了一类分数阶SIR流行病模型的稳定性问题.对不考虑疾病治疗的情形,利用特征值分析的方法分析了其平衡点的稳定性,并在一定条件下证明了模型一致稳态正解的存在唯一性;在此基础上,进一步考虑了具有治疗的分数阶SIR流行病模型的平衡点的稳定性,得到了其后向分支发生的条件.最后通过数值仿真验证了所得结论的正确性. 展开更多
关键词 分数阶SIR模型 平衡点 一致稳态解 稳定性 后向分支
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基于自适应图正则化低秩表示的scRNA-seq数据分析方法
16
作者 冯思凡 王振友 金应华 《广东工业大学学报》 2025年第5期129-136,共8页
单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术可以用于研究单个细胞的基因表达情况,生成大量的单细胞基因表达数据。这类数据通常具有高维度和复杂的结构,需要进行降维和聚类分析来揭示细胞类型和状态之间的差异。本文提出了一种基于自适应图正则化低... 单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术可以用于研究单个细胞的基因表达情况,生成大量的单细胞基因表达数据。这类数据通常具有高维度和复杂的结构,需要进行降维和聚类分析来揭示细胞类型和状态之间的差异。本文提出了一种基于自适应图正则化低秩表示的scRNA-seq数据分析方法——scLRRAGR。该方法可以充分利用scRNA-seq数据的全局和局部信息进行图学习,并通过自适应图正则化和引入秩约束来捕捉细胞之间的相似性和相互作用,更好地反映细胞之间的聚类结构,帮助揭示不同细胞类型和状态之间的差异。在应用该方法时,可以将scRNA-seq数据转换为一个图结构,其中每个节点表示一个单细胞样本,边表示细胞之间的相似性或相互作用。然后使用该方法对图进行学习和优化,得到最优的图表示。最后,可以使用聚类算法将学习到的图表示应用于细胞类型和状态的识别。实验结果表明,本文方法应用在scRNA-seq数据集上能够显著提高聚类性能。 展开更多
关键词 scRNA-seq数据 细胞聚类 图正则化 低秩表示 秩约束
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运用统计学优化A型肉毒毒素的SDS-PAGE染脱色方法 被引量：2
17
作者 周易 陆俭 +3 位作者 张若晖 李小娟 魏子昊 张雪平 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2016年第12期1316-1320,1327,共6页
目的运用统计学优化A型肉毒毒素的SDS-PAGE染色和脱色方法,以便生产检定中实现数字化、标准化操作。方法以Photoshop软件对电泳凝胶扫描图采样的背景灰度值、强带灰度值和弱带灰度值作为评价指标,以不同的脱色液为实验因素,按配对设计... 目的运用统计学优化A型肉毒毒素的SDS-PAGE染色和脱色方法,以便生产检定中实现数字化、标准化操作。方法以Photoshop软件对电泳凝胶扫描图采样的背景灰度值、强带灰度值和弱带灰度值作为评价指标,以不同的脱色液为实验因素,按配对设计安排实验,对实验结果进行脱色方法的统计学分析,根据配对设计分析结果,按裂区设计安排第二步实验,对实验结果进行染色和脱色方法的以统计学为主的综合分析评价。结果综合分析显示,电泳凝胶直接由考马斯亮蓝R250-磷酸-乙醇染色液加热至60℃染色2 h,0.5 mol/L KCl结合冰醋酸-甲醇脱色可获得良好效果。结论得到一种具有一定创新性的A型肉毒毒素的SDS-PAGE染脱色方法,该方法具有背景脱色浅淡均匀,条带清晰,染色和脱色液不挥发因而重复性好的优点,能够满足A型肉毒毒素生产检定的需要。 展开更多
关键词 A型肉毒毒素 SDS-PAGE 配对设计的t检验 裂区设计的方差分析
原文传递
基于模糊AHP的长寿湖生态系统健康评价 被引量：9
18
作者 刘存东 何太蓉 苏维词 《水生态学杂志》 北大核心 2009年第6期57-61,共5页
生态系统健康评价是当前生态学研究领域的一个焦点和热点,目前尚没有统一的评价指标和方法。根据长寿湖区域自然人文特征和已有研究成果,建立了生态特征指标、功能作用指标和社会经济指标3个亚类、20个指标的生态系统健康评价体系,基于... 生态系统健康评价是当前生态学研究领域的一个焦点和热点,目前尚没有统一的评价指标和方法。根据长寿湖区域自然人文特征和已有研究成果,建立了生态特征指标、功能作用指标和社会经济指标3个亚类、20个指标的生态系统健康评价体系,基于模糊层次分析(FAHP)的生态系统健康指数,对其生态健康进行了初步评价,得出2006年长寿湖生态系统健康指数为0.471。表明长寿湖生态系统处于亚健康状态,其主要原因在于长期受到上游垫江县、梁平县排放的工业污水污染及湖区内网栏养鱼的影响。 展开更多
关键词 生态系统健康评价 模糊层次分析 长寿湖
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基于物理化学性质优化的蛋白质相互作用预测研究 被引量：2
19
作者 倪青山 王正志 +1 位作者 赵英杰 黎刚果 《生命科学研究》 CAS CSCD 2009年第3期204-208,共5页
蛋白质相互作用预测是生物信息学研究的重要问题之一.提出了一种基于物理化学性质优化的蛋白质相互作用预测方法,与现有方法的显著不同就是,并未使用已知的氨基酸残基的物理化学性质,而是通过粒子群算法优化得到有益于相互作用预测的物... 蛋白质相互作用预测是生物信息学研究的重要问题之一.提出了一种基于物理化学性质优化的蛋白质相互作用预测方法,与现有方法的显著不同就是,并未使用已知的氨基酸残基的物理化学性质,而是通过粒子群算法优化得到有益于相互作用预测的物理化学性质数值.对真实的数据集测试表明,优化得到的物理化学性质比现有的物理化学性质更有益于提高蛋白质相互作用的预测性能,与其它方法相比,也具有一定的优势,说明该方法是一种有效的蛋白质相互作用预测方法. 展开更多
关键词 蛋白质相互作用 物理化学性质 局部超平面分类算法 粒子群优化算法
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基于LHS方法NF-κB信号转导网络的多参数敏感性分析 被引量：3
20
作者 贾建芳 岳红 王宏 《应用基础与工程科学学报》 EI CSCD 2008年第4期605-615,共11页
细胞信号转导网络的复杂结构和动力学参数的不确定影响着系统的动态特性,如何定量确定参数变化对系统输出的影响,已经成为系统生物学研究的重要问题之一.以TNF-α诱导NF-κB信号转导网络为例,假定模型参数在其变化范围服从均匀分布,采... 细胞信号转导网络的复杂结构和动力学参数的不确定影响着系统的动态特性,如何定量确定参数变化对系统输出的影响,已经成为系统生物学研究的重要问题之一.以TNF-α诱导NF-κB信号转导网络为例,假定模型参数在其变化范围服从均匀分布,采用基于Latin超立方抽样的多参数敏感性分析方法,研究参数同时变化对系统输出NF-κBn的影响程度.仿真结果表明,系统输出NF-κBn对于参数k29、k28、k61、k36、k52、k31比较敏感,这些参数的变化显著影响着NF-κBn的振荡特性,说明它们是NF-κB信号转导网络的关键速率常数. 展开更多
关键词 NF-kB信号转导网络 多参数敏感性分析 Latin超立方抽样 系统生物学
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