目的本研究借助网络药理学与分子对接技术,旨在揭示白藜芦醇(resveratrol,RES)治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的潜在分子机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pha...目的本研究借助网络药理学与分子对接技术,旨在揭示白藜芦醇(resveratrol,RES)治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的潜在分子机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药分子机制生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)、公共化学数据库(public chemical database,PubChem)、瑞士靶点预测平台(SwissTargetPrediction)、人类基因综合数据库(genecards suite/human gene database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online Mendelian inheritance in man,OMIM),获取RES作用靶点以及PCOS相关靶点。利用Venny在线工具作图,将成分靶点与疾病靶点取交集,交集靶点投入STRING,设置参数,得到蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,将PPI导入Cytoscape中筛选核心靶点。通过注释、可视化与整合发现数据库(database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID),对关键靶点进行了基因本体论(gene ontology,GO)分类和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,运用AutoDockTools对关键靶点和RES进行分子对接。结果RES作用靶点283个,PCOS作用靶点1705个,化合物RES与疾病PCOS的共同靶点129个,其中RES治疗PCOS的核心基因为HIF1A、HSP90AA1、STAT3、MYC、MAPK1、SIRT1。富集分析结果获得64个GO条目和27条KEGG通路信号通路,包括癌症的途径、癌症中的蛋白多糖、急性骨髓性白血病、催乳素信号通路、HIF-1信号通路等。分子对接结果表明RES与HIF1A、HSP90AA1、STAT3、MYC、MAPK1、SIRT1均有较强的结合性。结论RES针对PCOS是通过多靶点、多通路的发挥治疗作用,为治疗PCOS的作用机制提供新思路。展开更多
文摘目的本研究借助网络药理学与分子对接技术,旨在揭示白藜芦醇(resveratrol,RES)治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的潜在分子机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、中医药分子机制生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)、公共化学数据库(public chemical database,PubChem)、瑞士靶点预测平台(SwissTargetPrediction)、人类基因综合数据库(genecards suite/human gene database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online Mendelian inheritance in man,OMIM),获取RES作用靶点以及PCOS相关靶点。利用Venny在线工具作图,将成分靶点与疾病靶点取交集,交集靶点投入STRING,设置参数,得到蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,将PPI导入Cytoscape中筛选核心靶点。通过注释、可视化与整合发现数据库(database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID),对关键靶点进行了基因本体论(gene ontology,GO)分类和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,运用AutoDockTools对关键靶点和RES进行分子对接。结果RES作用靶点283个,PCOS作用靶点1705个,化合物RES与疾病PCOS的共同靶点129个,其中RES治疗PCOS的核心基因为HIF1A、HSP90AA1、STAT3、MYC、MAPK1、SIRT1。富集分析结果获得64个GO条目和27条KEGG通路信号通路,包括癌症的途径、癌症中的蛋白多糖、急性骨髓性白血病、催乳素信号通路、HIF-1信号通路等。分子对接结果表明RES与HIF1A、HSP90AA1、STAT3、MYC、MAPK1、SIRT1均有较强的结合性。结论RES针对PCOS是通过多靶点、多通路的发挥治疗作用,为治疗PCOS的作用机制提供新思路。
