目的:为探讨STYXL1基因在多形性胶质母细胞瘤(Glioblastoma Multiforme,GBM)中的表达及其对患者预后和免疫微环境的影响。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库获...目的:为探讨STYXL1基因在多形性胶质母细胞瘤(Glioblastoma Multiforme,GBM)中的表达及其对患者预后和免疫微环境的影响。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库获取GBM的转录组数据,使用DESeq2包和Wilcoxon秩和检验鉴定STYXL1在GBM中的表达;使用Kaplan-Meier生存曲线确定STYXL1表达与GBM患者的预后关系;运用基因本体(Gene Ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析以及基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)探索基因相关的生物学途径;最后,利用相关性分析探讨基因与免疫浸润的关系。结果:与正常对照组相比,STYXL1在GBM中表达上调(P<0.05);高表达的STYXL1与GBM患者的不良预后有关(P=0.006),并与上皮间质转化、炎症反应、IL6/JAK/STAT3信号转导和血管生成通路的富集相关(P<0.05)。此外,STYXL1高表达与多种免疫细胞的富集相关,包括活化的CD4和CD8 T细胞、巨噬细胞等。结论:本研究为STYXL1作为GBM的预后和免疫学生物标志物提供了新的证据,并为未来的治疗策略提供了潜在的靶点。展开更多
文摘目的:为探讨STYXL1基因在多形性胶质母细胞瘤(Glioblastoma Multiforme,GBM)中的表达及其对患者预后和免疫微环境的影响。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库获取GBM的转录组数据,使用DESeq2包和Wilcoxon秩和检验鉴定STYXL1在GBM中的表达;使用Kaplan-Meier生存曲线确定STYXL1表达与GBM患者的预后关系;运用基因本体(Gene Ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析以及基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)探索基因相关的生物学途径;最后,利用相关性分析探讨基因与免疫浸润的关系。结果:与正常对照组相比,STYXL1在GBM中表达上调(P<0.05);高表达的STYXL1与GBM患者的不良预后有关(P=0.006),并与上皮间质转化、炎症反应、IL6/JAK/STAT3信号转导和血管生成通路的富集相关(P<0.05)。此外,STYXL1高表达与多种免疫细胞的富集相关,包括活化的CD4和CD8 T细胞、巨噬细胞等。结论:本研究为STYXL1作为GBM的预后和免疫学生物标志物提供了新的证据,并为未来的治疗策略提供了潜在的靶点。
