摘要
DNA标记技术对于确定家畜的遗传同一性和亲缘关系是一种有希望的方法。与其他类型的 DNA标记相比 ,单核苷酸多态性 ( SNPs)比较诱人 ,因为它们丰富的多态性和在遗传上的稳定性 ,可进行高通量的自动化分析。在牛的育种中 ,需要识别出具有足够检测能力的一组最少的SNPs来用于许多普通品种和杂种群体。此文描述了一组分布于 18条常染色体和 2条性染色体上的 32个有高度信息的 SNP标记。从 2类群体的等位基因和基因型频率的分布中估计了这些 SNPs在美国肉牛群体中的信息 :一类群体由代表 17个普通品种的 96头纯种公牛组成 ,另一类群体由 4个中西部州的 6个牛群的 15 4头美国纯种安格斯牛组成。以这些群体的频率数据为基础 ,随机选择的不相关的 2个个体在所有 32个座位具有相同基因型的估计概率 ,对多个品种的复合群体是 2 .0× 10 - 1 3,对纯种安格斯牛群体则是 1.9×10 - 1 0。随机挑选的一头候选公从父系中被排除的概率 ,对多个品种的复合群体是 99.9% ,对纯种安格斯牛群体则是 99.4 %。在多个品种群体的 96头公牛中 ,对紧密围绕 32个目标SNPs的 DNA进行了测序 ,发现含有额外的 183个多态位点。对这些额外位点以及 32个目标 SNPs的了解有利于在各种高通量的 SNP基因型分析平台上进行稳健 ( robust)设计和?
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
2004年第5期30-30,共1页
China Animal Husbandry & Veterinary Medicine
