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不同品种石斛根内生细菌和真菌群落多样性及功能分析

Diversity and functional analysis of endophytic bacterial and fungal communities in roots of different Dendrobium varieties
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摘要 为探索石斛内生菌群落多样性的差异和潜在功能,采用高通量测序技术研究4种不同品种石斛根内生细菌和真菌的群落结构和多样性,并进行功能预测。结果表明,铁皮石斛的多糖含量最高,金钗石斛总生物碱、石斛碱和总黄酮含量最高,霍山石斛的总多酚含量最高。铁皮石斛根内生细菌的Chao1指数和Shannon指数均显著高于其他品种(P<0.05),但其内生真菌的Chao1指数和Shannon指数均显著小于其他品种。在内生细菌和真菌门水平上,变形菌门、拟杆菌门、放线菌门、子囊菌门和黄藻门为优势菌门。金钗石斛和霍山石斛的变形菌门相对丰度最高,铁皮石斛的拟杆菌门、放线菌门和子囊菌门相对丰度最高。PCA分析结果表明,不同品种石斛根内生细菌和真菌群落结构有明显差异,其中霍山石斛和铁皮石斛根内生细菌群落结构相似,金钗石斛和霍山石斛根内生真菌群落结构相似,鼓槌石斛与其他品种根内生细菌和真菌的群落结构差异较大。PICRUSt分析表明,铁皮石斛中新陈代谢功能基因丰度最高,环境信息处理功能基因丰度最低。FUNGuild功能预测结果表明,病原-腐生-共生营养型、腐生营养型和腐生-共生营养型内生真菌为主要的营养型。病原-腐生-共生营养型丰度在金钗石斛和铁皮石斛中最高,腐生营养型丰度在铁皮石斛中最低,腐生-共生营养型丰度在霍山石斛和鼓槌石斛中最高。该研究有利于更好地理解石斛与内生菌之间的共生关系,也可为后续微生物功能的挖掘和生物肥料的研究提供科学依据。
出处 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第22期262-273,共12页 Jiangsu Agricultural Sciences
基金 铜仁市科技局项目(编号:铜市科研[2023]37号) 贵州省科技厅项目(编号:黔科合支撑-[20230]4Y069) 铜仁学院硕士研究生创新基金(编号:trxyyc-202315) 贵州省大学生创新创业训练项目(编号:2024106650758) 贵州省教育厅项目(编号:黔教技[2023045]、黔教哲[2023]07号)。
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