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高粱GLR基因家族鉴定与表达分析

Identification and expression analysis of GLR gene family in sorghum
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摘要 植物谷氨酸受体基因(GLR)在植物的发育、信号传导途径以及对环境胁迫的响应中起着重要作用,为了解高粱GLR基因家族的特征和基本功能,通过生物信息学方法,开展GLR基因家族的鉴定,并进行理化性质、系统进化关系、基因结构、顺式作用元件分析和表达分析。结果表明,在高粱基因组中共鉴定出21个GLR基因,成员多为酸性蛋白,主要定位在质膜上,氨基酸数量介于685~1 012个之间,且理化性质具有显著差异;高粱GLR基因家族成员可分为4组,均由4~6个外显子组成,且不均匀地分布在高粱的4条染色体上;21个基因家族成员中有3个SbGLR形成2个片段重复的基因对,且和水稻共享10个线性基因;高粱GLR基因家族的启动子存在多个脱落酸、茉莉酸甲酯和低温响应等多种与非生物胁迫相关的顺式作用元件;表达分析显示,SbGLR3.4在叶片、花梗和根等营养组织中有很高的表达值,干旱胁迫处理后叶片表达量变化明显,转录组数据分析显示共有12个差异表达基因且显示出差异化的表达模式。本研究鉴定出21个GLR基因,其中SbGLR3.4、SbGLR1.3、SbGLR1.4和SbGLR1.6具有典型的GLR基因结构,且在干旱胁迫下差异性表达,可以作为候选基因进行深入的研究,为进一步研究高粱GLR基因家族的功能和高粱抵抗非生物胁迫的分子机制提供理论基础。
作者 王英琪 李景伟 刘福芳 姜超 Wang Yingqi
出处 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第22期47-58,共12页 Jiangsu Agricultural Sciences
基金 内蒙古自治区高等学校科学研究项目(编号:NJZY2122) 呼伦贝尔市科技计划(编号:NC2021002) 呼伦贝尔市“科技兴市”行动重点专项(成果转化)项目(编号:2022HZZX006)。
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二级参考文献34

  • 1Adams M,Swanson G.1996.Neurotoxins.Trends in Neurosciences,(Supplement):20–22.
  • 2Brenner E D,Martinez-Barboza N,Clark A P,Liang Q S,Stevenson D W,Coruzzi G M.2000.Arabidopsis mutants resistant to S(+)-beta-methyl-alpha,beta-diaminopropionic acid,a cycad-derived glutamate receptor agonist.Plant Physiology,124:1615–1624.
  • 3Chiu J C,Brenner E D,De S R,Nitabach M N,Holmes T C,Coruzzi G M.2002.Phylogenetic and expression analysis of the glutamate receptor-likegene family in Arabidopsis thaliana.Molecular Biology and Evolution,19(7):1066–1082.
  • 4Cho D,Kim S A,Murata Y,Lee S,Jae S K,Nam H G,Kwak J M.2009.De-regulated expression of the plant glutamate receptor homolog AtGLR3.1impairs long-term Ca2+-programmed stomatal closure.The Plant Journal,58(3):437–439.
  • 5Davenport R.2002.Glutamate receptors in plants.Annals of Botany,90:549–557.
  • 6Dingledine R,Borges K,Bowie D,Traynelis S F.1999.The glutamate receptor ion channels.Pharmacological Reviews,51:7–61.
  • 7Kang J M,Mehta S,Turano F J.2004.The putative glutamate receptor1.1(AtGLR1.1)in Arabidopsis thaliana regulates abscisic acid biosynthesisand signaling to control development and water loss.Plant and Cell Physiology,45(10):1380–1389.
  • 8Kang S,Kim H B,Lee H,Choi J Y,Heu S,Oh C J,Kwon S I,An C S.2006.Overexpression in Arabidopsis of a plasma membrane-targetingglutamate receptor from small radish increases glutamate-mediated Ca2+influx and delays fungal infection.Molecules and Cells,5:418–427.
  • 9Kato A,Rouach N,Nicoll R A,Bredt D S.2005.Activity-dependent NMDA receptor degradation mediated by retrotranslocation and ubiquitination.Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America,102:5600–5605.
  • 10Kim S A,Kwak J M,Jae S K,Wang M H,Nam H G.2001.Overexpression of the AtGluR2gene encoding an Arabidopsis homolog of mammalianglutamate receptors impairs calcium utilization and sensitivity to ionic stress in transgenic plants.Plant and Cell Physiology,42(1):74–84.

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